合成生物学相关文章
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当前共找到 1142 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-10-11 |
A hierarchy of metabolite exchanges in metabolic models of microbial species and communities
2024-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012472
PMID:39325831
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研究论文 | 本文研究了微生物物种和群落代谢模型中的代谢物交换层次结构 | 提出了通过关注代谢子网络（如细胞间的代谢物交换和与环境的交换）来提高代谢网络分析的可扩展性 | 无偏方法由于组合爆炸问题，在大规模网络中扩展性较差 | 研究代谢网络中的代谢物交换层次结构，并探讨其在代谢工程和合成生物学领域的应用 | 微生物物种和群落的代谢模型 | 代谢工程 | NA | 代谢通量分析 | NA | 代谢网络模型 | 涉及从中心碳代谢到基因组规模的多种模型 |
| 442 | 2024-10-10 |
Modulating metabolism through synthetic biology: Opportunities for two-stage fermentation
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28791
PMID:38970785
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综述 | 本文综述了通过合成生物学工具调节细胞代谢以实现两阶段发酵的现状和最新成果 | 提出了通过合成生物学工具动态调节细胞代谢，以实现更高效的两阶段发酵过程 | NA | 探讨如何通过合成生物学工具提高生物基生产过程的效率 | 生物基燃料、化学品和材料的合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
| 443 | 2024-10-10 |
Enhancing cell-based therapies with synthetic gene circuits responsive to molecular stimuli
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28770
PMID:38867466
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综述 | 本文综述了基于分子刺激响应的合成基因开关在细胞疗法中的最新进展 | 介绍了合成基因开关在增强细胞疗法的安全性和时空可控性方面的创新应用 | 讨论了当前基于这些设备的细胞疗法在临床转化中面临的挑战 | 探讨合成生物学在开发下一代患者特异性细胞疗法中的作用 | 合成基因开关及其在细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA |
| 444 | 2024-10-10 |
Insights into yeast response to chemotherapeutic agent through time series genome-scale metabolic models
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28833
PMID:39199017
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法（TS-GSMM），将时间序列转录组学与基因组规模代谢模型（GSMM）相结合，以缩小所有可能的通量分布的可行解空间并获得时间序列通量样本 | 本文首次将时间序列转录组学数据与基因组规模代谢模型相结合，揭示了通路动态变化，无需进行动力学建模，并能检测到仅通过转录组学分析无法识别的通路 | NA | 研究酵母细胞对化疗药物多柔比星的时间序列响应 | 酵母细胞 | 代谢工程 | NA | 基因组规模代谢模型（GSMM） | 机器学习 | 转录组学数据 | 酵母细胞对多柔比星的时间序列响应数据 |
| 445 | 2024-10-10 |
Synthetic biology-based bioreactor and its application in biochemical analysis
2024, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2023.2180319
PMID:36803337
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综述 | 本文综述了基于合成生物学反应器和报告基因的生物传感器组件及其在重金属离子、核酸、抗生素等物质检测中的应用 | 介绍了基于细胞系统和无细胞系统的生物传感器在检测领域的应用 | 讨论了生物传感器面临的瓶颈和优化方向 | 综述合成生物学反应器及其在生物化学分析中的应用 | 合成生物学反应器和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 446 | 2024-10-10 |
Recent advances of CRISPR-based genome editing for enhancing staple crops
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1478398
PMID:39376239
|
综述 | 本文综述了CRISPR/Cas系统在增强主要粮食作物方面的最新进展 | 强调了CRISPR/Cas技术的变革潜力，特别是prime和base编辑以及新型CRISPR相关蛋白的开发，显著提高了基因编辑的特异性、效率和范围 | 尽管存在脱靶效应、更高效的递送方法需求以及伦理和监管问题等挑战 | 探讨CRISPR/Cas技术在应对全球粮食安全和可持续性挑战中的重要性 | 主要粮食作物如水稻和玉米 | NA | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA |
| 447 | 2024-10-09 |
Strategies for Improving Aptamer Screening Efficiency: Library Design, Awareness Innovation, and Instrument Assistance
2024-Oct-08, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2024.2411244
PMID:39378058
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综述 | 本文综述了提高适配体筛选效率的策略，包括库设计、筛选意识创新和仪器辅助 | 通过合理库设计、新型筛选意识和先进筛选设备，将适配体筛选周期显著减少至<8轮，有些方法甚至实现单轮筛选，整体筛选时间缩短至<3周，同时提高适配体性能 | 当前SELEX过程仍面临一些挑战，如初始库相对盲目、筛选过程繁琐耗时、通常需要9-20轮筛选，整个过程一般持续2-3个月，以及获得的适配体性能不佳 | 总结适配体筛选机制和SELEX的现有局限性，分析SELEX优化筛选策略的原理和技术要点，为设计合适的适配体筛选方法提供实用参考 | 适配体筛选方法及其优化策略 | NA | NA | SELEX | NA | NA | NA |
| 448 | 2024-10-09 |
Geometric deep learning of protein-DNA binding specificity
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02372-w
PMID:39103447
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepPBS的几何深度学习模型，用于预测蛋白质-DNA结合特异性 | 提出了DeepPBS模型，能够从蛋白质-DNA结构中预测结合特异性，并提取可解释的蛋白质重原子重要性分数 | NA | 旨在通过几何深度学习模型预测蛋白质-DNA结合特异性，以理解基因调控 | 蛋白质-DNA结合特异性 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 蛋白质-DNA结构 | NA |
| 449 | 2024-10-08 |
Advances in Metabolic Engineering for the Accumulation of Astaxanthin Biosynthesis
2024-Oct-07, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01289-1
PMID:39373956
|
综述 | 本文综述了代谢工程在虾青素生物合成中的最新进展 | 介绍了利用合成生物学和代谢工程技术通过微生物发酵大规模生产虾青素的新策略 | NA | 探讨虾青素生物合成的研究进展及未来研究方向 | 虾青素及其在不同工业领域的应用 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 450 | 2024-10-07 |
Incompatibility in cell adhesion constitutes a barrier to interspecies chimerism
2024-Oct-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.07.010
PMID:39181131
|
研究论文 | 研究揭示了细胞粘附不兼容性是跨物种嵌合体形成的主要障碍，并开发了一种合成生物学策略来增强跨物种细胞粘附 | 开发了一种利用纳米抗体-抗原相互作用增强跨物种细胞粘附的合成生物学策略 | 研究主要集中在体外实验和鼠胚胎中的嵌合体形成，尚未在更复杂的动物模型中验证 | 解决跨物种嵌合体形成中的细胞粘附问题，以促进人类器官在动物体内的生长 | 人类多能干细胞（PSCs）与动物PSCs之间的粘附 | 合成生物学 | NA | 纳米抗体-抗原相互作用 | NA | 细胞 | 人类多能干细胞和鼠胚胎 |
| 451 | 2024-10-06 |
Enhancement of tryptophan 2-monooxygenase thermostability by semi-rational enzyme engineering: a strategic design to minimize experimental investigation
2024-Oct-02, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d4cb00102h
PMID:39363964
|
研究论文 | 通过半理性酶工程策略提高色氨酸2-单加氧酶的热稳定性 | 结合计算工具的理性设计和位点饱和突变筛选出具有显著提高热稳定性和可溶性表达产量的色氨酸2-单加氧酶变体 | NA | 提高色氨酸2-单加氧酶的热稳定性和可溶性表达产量 | 色氨酸2-单加氧酶及其变体 | 生物工程 | NA | 位点饱和突变 | NA | 蛋白质结构 | 野生型酶及其两种变体（TMO-PWS和TMO-PWSNR） |
| 452 | 2024-10-05 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2024-Oct-04, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
|
review | 本文综述了Cupriavidus necator在合成生物学领域的技术进展及其在工业生物制造中的潜力 | 介绍了Cupriavidus necator作为新兴生物制造宿主的潜力，特别是在分子生物学工具、代谢工程和发酵策略方面的创新 | NA | 探讨Cupriavidus necator在可持续生物加工和生物产品开发中的关键作用 | Cupriavidus necator及其在分子生物学工具、代谢工程和发酵策略中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2024-10-05 |
Strategies for developing phages into novel antimicrobial tailocins
2024-Oct, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.03.003
PMID:38580606
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综述 | 本文综述了利用噬菌体开发新型抗菌尾丝蛋白的三种策略 | 提出利用噬菌体作为支架开发新型尾丝蛋白，以解锁其抗菌潜力 | 自然存在的尾丝蛋白多样性有限 | 探讨利用噬菌体开发新型抗菌尾丝蛋白的方法 | 噬菌体和尾丝蛋白 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 454 | 2024-10-05 |
Engineering bacterial theranostics: from logic gates to in vivo applications
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1437301
PMID:39359265
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综述 | 本文综述了合成生物学在设计细菌治疗诊断学方面的最新进展，从逻辑门到体内应用 | 探讨了设计能够感知和响应内源性疾病相关信号的细菌，以创建用于人类健康的工程化治疗诊断学系统 | 讨论了治疗诊断学临床转化中的主要挑战，并提出了克服这些问题的策略 | 综述细菌治疗诊断学的设计、传递和动力学，以实现安全、稳健和可遗传操作的治疗方法 | 细菌治疗诊断学系统及其在疾病治疗中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 455 | 2024-10-04 |
Engineered protein elastomeric materials
2024-Oct-03, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc02905d
PMID:39258457
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综述 | 本文综述了基于重组弹性蛋白、重组弹性蛋白样蛋白和其他重组折叠蛋白的弹性材料合成及其在生物医学和高科技领域的应用进展 | 利用合成生物学设计的重组蛋白可以模仿天然蛋白的优势结构，无需高温和细胞毒性试剂即可生物合成，为制备基于蛋白的弹性材料提供了新机会 | 设计和制造能够通过仿生策略在人类社会中发挥作用的基于蛋白的弹性材料仍然具有挑战性 | 探讨基于重组蛋白的弹性材料的设计、合成及其在生物医学和高科技领域的应用 | 基于重组弹性蛋白、重组弹性蛋白样蛋白和其他重组折叠蛋白的弹性材料 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 456 | 2024-10-04 |
RDBSB: a database for catalytic bioparts with experimental evidence
2024-Oct-03, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae844
PMID:39360609
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研究论文 | 开发了一个名为RDBSB的数据库，包含83,193个经过实验验证的催化生物部件，提供详细的定性和定量催化信息 | RDBSB整合了分散在多个数据库和文献来源中的催化生物部件信息，提供了一个全面的资源平台 | NA | 开发一个综合数据库，以支持合成生物学中的途径设计 | 催化生物部件及其在特定代谢途径中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 83,193个经过实验验证的催化生物部件 |
| 457 | 2024-10-04 |
Functionalized Protein Binders in Developmental Biology
2024-Oct, Annual review of cell and developmental biology
IF:11.4Q1
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研究论文 | 本文探讨了在发育生物学中使用功能化蛋白质结合剂直接解析蛋白质功能的方法 | 介绍了使用纳米体和其他合成支架衍生的蛋白质结合剂，以及计算设计的蛋白质结合剂在发育过程中研究蛋白质组的新方法 | NA | 研究蛋白质结合剂在发育生物学中的应用，以更好地理解发育过程中分子复杂性的形成 | 功能化蛋白质结合剂及其在发育过程中对蛋白质组的研究 | 发育生物学 | NA | 蛋白质结合剂的计算设计和支架工程 | NA | 蛋白质组数据 | NA |
| 458 | 2024-10-04 |
Trading acyls and swapping sugars: metabolic innovations in Solanum trichomes
2024-Oct-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae279
PMID:38748602
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研究论文 | 研究了茄科植物Solanum中特殊代谢产物acylsugar的多样性和进化 | 发现了八种含有肌醇或肌醇糖苷核心和羟基酰基链的不寻常结构，并鉴定了与已知acylsugar乙酰转移酶不同的SmASAT3-L1酶 | 仅分析了Solanum属中一小部分物种的acylsugar多样性 | 探讨Solanum属中acylsugar结构的多样性和进化，并为育种和合成生物学利用这种多样性提供基础 | Solanum属中的acylsugar代谢产物及其相关酶 | NA | NA | 液相色谱-质谱分析 | NA | 代谢产物 | 31个Solanum属物种 |
| 459 | 2024-10-04 |
Probing the orthogonality and robustness of the mammalian RNA-binding protein Musashi-1 in Escherichia coli
2024-Sep-30, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00448-x
PMID:39350178
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研究论文 | 研究探讨了哺乳动物RNA结合蛋白Musashi-1在Escherichia coli中的正交性和鲁棒性 | 首次将哺乳动物Musashi蛋白作为翻译调控因子在Escherichia coli中进行功能研究，并揭示了其在转录后调控中的作用 | 研究中发现合成电路在约40代后失去功能，表明其稳定性有限 | 探索RNA识别基序（RRMs）在原核生物中的功能及其在生物技术和医学应用中的潜力 | Musashi-1蛋白及其在Escherichia coli中的表达对转录组和翻译组的影响 | 生物技术 | NA | 高通量RNA测序 | NA | RNA序列 | 约40代Escherichia coli |
| 460 | 2024-10-04 |
Data-Driven Design of Triple-Targeted Protein Nanoprobes for Multiplexed Imaging of Cancer Lymphatic Metastasis
2024-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405877
PMID:38889909
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研究论文 | 本文介绍了一种基于数据驱动设计和合成生物学组装策略的三靶向蛋白质纳米探针，用于癌症淋巴转移的多重成像 | 本文创新性地设计了能够特异性结合三种靶点的蛋白质纳米探针，并通过数据驱动的方法和合成生物学策略实现了对癌症淋巴转移的多重成像 | 本文的研究主要集中在胃癌患者的淋巴结组织，未来需要进一步验证其在其他癌症类型中的适用性 | 开发一种有效的纳米探针，用于成像高度异质性的癌症淋巴转移 | 癌症淋巴转移的多重成像 | 生物医学工程 | 胃癌 | 合成生物学 | NA | 组织样本 | 19例新鲜切除的人类胃癌样本 |