合成生物学相关文章
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当前共找到 1127 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2024-12-20 |
Advancing microbiota therapeutics: the role of synthetic biology in engineering microbial communities for precision medicine
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1511149
PMID:39698189
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综述 | 本文综述了合成生物学在推进微生物组研究和治疗中的变革潜力，探讨了其在精准医学中的应用 | 本文整合了计算机科学、工程学和生物学，利用CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程和合成寡核苷酸合成等前沿技术，为个性化益生菌和工程微生物等靶向治疗铺平道路 | 本文讨论了遗传稳定性、环境安全性和健全的监管框架等挑战，强调了持续研究以确保安全有效的微生物组干预的重要性 | 探讨合成生物学在推进微生物组研究和治疗中的作用，特别是其在精准医学中的应用 | 微生物组、合成生物学技术、肠道微生物在疾病中的作用 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、代谢工程、合成寡核苷酸合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 442 | 2024-12-19 |
Discovery and Functional Identification of 2,3-Oxidosqualene Cyclases and Cytochrome P450s in Triterpenoid Metabolic Pathways of Actinidia eriantha
2024-Dec-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06937
PMID:39648448
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研究论文 | 本研究通过转录组测序分析结合合成生物学方法，在酵母中异源表达，鉴定了参与猕猴桃三萜代谢途径的关键酶基因 | 首次鉴定了两个2,3-氧化角鲨烯环化酶（AeOSC2和AeOSC3）和两个细胞色素P450（AeCYP716A8和AeCYP716A9），并成功重建了猕猴桃中乌索烷型和齐墩果烷型三萜的生物合成途径 | NA | 探索猕猴桃中三萜代谢途径的关键酶基因及其功能 | 猕猴桃中的三萜化合物及其生物合成途径 | 代谢组学 | NA | 转录组测序分析，合成生物学 | NA | 基因序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 443 | 2024-12-19 |
Accurate RNA 3D structure prediction using a language model-based deep learning approach
2024-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02487-0
PMID:39572716
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研究论文 | 本文提出了一种基于语言模型的深度学习方法RhoFold+，用于准确预测RNA的三维结构 | RhoFold+通过集成预训练的RNA语言模型和解决数据稀缺问题，提供了一个全自动的端到端RNA三维结构预测管道，并在多个评估中表现优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确预测RNA三维结构的方法，以促进RNA功能研究和RNA靶向药物开发 | 单链RNA的三维结构 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 语言模型 | 序列 | 约2370万条RNA序列 | NA | NA | NA | NA |
| 444 | 2024-12-19 |
Efficient and markerless gene integration with SlugCas9-HF in Kluyveromyces marxianus
2024-07-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06487-w
PMID:38956406
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR-Cas9的多位点基因整合方法，用于在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中组装多个外源基因 | 使用高保真Cas9核酸酶SlugCas9-HF提高了基因编辑的精确度，并开发了一种CRISPR-based的生物合成工具包，能够实现大基因模块的基因组整合和多位点同时整合 | NA | 开发一种高效的基因整合方法，促进Kluyveromyces marxianus在工业生产中的应用 | 非传统酵母Kluyveromyces marxianus | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 445 | 2024-12-18 |
Exploring the Promoter Generation and Prediction of Halomonas spp. Based on GAN and Multi-Model Fusion Methods
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313137
PMID:39684846
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研究论文 | 本文提出了基于生成对抗网络（GAN）和多模型融合方法的极端微生物Halomonas spp.启动子生成与预测方法 | 首次为极端微生物Halomonas spp.构建了启动子强度数据库，并提出了基于GAN和多模型融合的启动子设计与预测方法 | 需要进一步验证该方法在其他极端微生物中的适用性 | 探索极端微生物Halomonas spp.的启动子生成与预测方法，推动工业生物技术的发展 | 极端微生物Halomonas spp.的启动子序列及其强度预测 | 合成生物学 | NA | 生成对抗网络（GAN），多模型融合 | 生成对抗网络（GAN），双向长短期记忆网络（BiLSTM），卷积神经网络（CNN） | 序列数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 446 | 2024-12-18 |
Cutting-edge developments in plastic biodegradation and upcycling via engineering approaches
2024-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00256
PMID:39687771
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综述 | 本文综述了通过工程方法促进塑料降解和升级回收的最新进展 | 本文介绍了通过合成生物学和代谢工程构建高性能微生物和酶用于塑料去除和生物升级回收的创新方法 | 本文主要集中在工程方法的综述，未提供具体的实验数据或案例研究 | 探讨通过工程方法促进塑料降解和升级回收的潜力，并展望可持续循环塑料经济的发展 | 塑料降解和升级回收的微生物、酶及其应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 447 | 2024-12-18 |
Positions of cysteine residues reveal local clusters and hidden relationships to Sequons and Transmembrane domains in Human proteins
2024-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77056-8
PMID:39468182
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研究论文 | 本文研究了人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 发现了半胱氨酸残基在蛋白质中的频率与长度相关，并且CC间隙的频率可以作为区分具有特殊结构和功能的蛋白质的分类器 | 讨论了计算预测中缺乏的蛋白质结构动力学，但未提供具体的改进方法 | 研究人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 人类蛋白质中的半胱氨酸残基、N-糖基化位点和跨膜结构域 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质序列 | 整个人类蛋白质组 | NA | NA | NA | NA |
| 448 | 2024-12-18 |
In vitro generation of genetic diversity for directed evolution by error-prone artificial DNA synthesis
2024-05-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06340-0
PMID:38789612
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研究论文 | 本文介绍了一种通过易错人工DNA合成（epADS）在体外生成遗传多样性的方法，用于定向进化的应用 | 提出了通过易错人工DNA合成（epADS）生成遗传多样性的新方法，丰富了定向进化的工具箱 | NA | 探索在合成生物学中用于定向进化的遗传多样性生成方法 | 基因编码的荧光蛋白、调控遗传元件、合成基因回路以及微生物对卡贝西林的耐受性 | 合成生物学 | NA | 易错人工DNA合成（epADS） | NA | DNA序列 | 基因编码的荧光蛋白、调控遗传元件、合成基因回路以及微生物样本 | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2024-12-17 |
Perspectives of cyanobacterial cell factories
2024-Dec, Photosynthesis research
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s11120-023-01056-4
PMID:37966575
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综述 | 本文综述了蓝藻作为细胞工厂在生产异戊二烯和高价值蛋白质方面的潜力及放大生产方法 | 强调了蓝藻在特殊化学品和蛋白质生产中的挑战与前景，特别是异戊二烯产品和生物制药蛋白质 | 未提及具体的技术限制或实验挑战 | 探讨蓝藻在生产有用化学品和蛋白质方面的潜力及放大生产方法 | 蓝藻、异戊二烯、高价值蛋白质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2024-12-16 |
Chemically Driven Division of Protocells by Membrane Budding
2024-Dec-11, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c08226
PMID:39603809
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研究论文 | 本研究探讨了通过化学能量驱动的膜出芽机制实现原细胞分裂的过程 | 本研究首次展示了通过化学燃料驱动简单脂肪酸基囊泡出芽分裂的机制，类似于现有生命的分裂方式，为原细胞自主复制提供了新的可能性 | 本研究主要集中在实验室条件下的小规模实验，尚未在大规模或自然环境中验证其可行性 | 探索原细胞分裂的机制，并为合成细胞的发展提供基础 | 脂肪酸基囊泡及其在化学能量驱动下的分裂行为 | NA | NA | NA | NA | NA | 不同脂肪酸基囊泡的多种样本 | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2024-12-16 |
Reconstitution of the Mevalonate Pathway for Improvement of Isoprenoid Production and Industrial Applicability in Escherichia coli
2024-Nov-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2408.08053
PMID:39467704
|
研究论文 | 本文通过在Escherichia coli中重构甲羟戊酸（MVA）途径，提高了异戊二烯类化合物的生产及其工业应用性 | 引入了来自生物安全等级1（BSL 1）生物体的新基因组合，重构了MVA途径，并显著提高了类胡萝卜素和番茄红素的产量及细胞特异性生产力 | 未提及具体的局限性 | 通过代谢工程和合成生物学策略，提高微生物生产高附加值异戊二烯类化合物的能力 | Escherichia coli中的异戊二烯类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2024-12-16 |
Landscape of human organoids: Ideal model in clinics and research
2024-May-06, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2024.100620
PMID:38706954
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综述 | 本文综述了人类类器官领域的现状和未来发展趋势，涵盖了其在临床和研究中的应用 | 本文首次提供了对类器官领域全面且准确的概述，结合了学术研究、工业应用和临床实践的经验 | 本文主要为综述性质，未涉及具体的实验数据或技术细节 | 旨在填补类器官领域缺乏全面概述的空白，并为研究人员、临床医生和患者提供有价值的见解 | 类器官技术及其在个性化医疗、肿瘤学、药物发现等领域的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2024-12-15 |
Unlocking the potential of Cupriavidus necator H16 as a platform for bioproducts production from carbon dioxide
2024-Nov-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04200-x
PMID:39572451
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综述 | 探讨了Cupriavidus necator H16作为将二氧化碳转化为多种产品的宿主平台的潜力 | 综述了合成生物学工具包、气体发酵技术和工程方法的进展，并提出了提高C. necator H16二氧化碳固定能力的建议 | 讨论了C. necator H16在转化效率和产品种类范围方面的局限性 | 探索如何利用C. necator H16将二氧化碳转化为有价值的产品，以应对气候变化 | 研究对象为Cupriavidus necator H16及其代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 454 | 2024-12-15 |
Incorporation of photosynthetically active algal chloroplasts in cultured mammalian cells towards photosynthesis in animals
2024-Nov-11, Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences
DOI:10.2183/pjab.100.035
PMID:39477444
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研究论文 | 本研究将来自原始红藻Cyanidioschyzon merolae的光合活性叶绿体引入培养的哺乳动物细胞中，并验证了其在细胞内的光合作用活性 | 首次成功将光合活性叶绿体引入哺乳动物细胞并维持其光系统II的电子传递活性 | 仅在体外培养的哺乳动物细胞中进行了短期实验，未验证在完整动物体内的长期效果 | 探索在哺乳动物细胞中实现人工光合作用的可能性 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | 共培养技术 | NA | 细胞 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 455 | 2024-12-15 |
Advances and challenges in synthetic biology for mosquito control
2024-01, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2023.11.001
PMID:38000957
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综述 | 本文综述了利用合成生物学控制蚊媒疾病的现状、未来目标以及基因编辑在全球健康防御中的重要性 | 探讨了利用合成生物学增强蚊子对病原体的抵抗力或消除蚊媒的创新方法 | 未具体讨论合成生物学方法的实际应用效果或局限性 | 探讨利用合成生物学控制蚊媒疾病的创新方法及其在全球健康防御中的重要性 | 蚊媒疾病及其传播媒介蚊子 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 456 | 2024-12-14 |
Genetically Engineered Liposwitch-Based Nanomaterials
2024-Dec-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c01388
PMID:39495202
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研究论文 | 本文探讨了使用基因工程脂开关调控无序蛋白驱动的纳米组装 | 提出了“脂开关”概念，通过结合别构效应和翻译后修饰来调控融合蛋白的组装 | NA | 开发一种新的策略来控制无序蛋白驱动的纳米组装 | 无序蛋白和球状蛋白的融合纳米材料 | 合成生物学 | NA | 动态光散射、冷冻透射电子显微镜 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 457 | 2024-12-14 |
Towards AI-designed genomes using a variational autoencoder
2024-Dec, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2024.1457
PMID:39657811
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研究论文 | 本文开发了一个概念验证框架，利用变分自编码器训练机器学习算法来建模细菌基因组组成 | 提出了DeepGenomeVector模型，能够有效捕捉基因组网络中的复杂依赖关系，并通过定性和定量指标验证了其性能 | 本文仅展示了概念验证，尚未实现AI设计完整基因组的能力 | 探索机器学习在合成生物学中的应用，展示AI设计基因组的可能性 | 细菌基因组及其编码的基因网络 | 机器学习 | NA | 变分自编码器 | 变分自编码器 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 458 | 2024-12-13 |
Multiplex Expression Cassette Assembly: A flexible and versatile method for building complex genetic circuits in conventional vectors
2024-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14454
PMID:39175411
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Multiplex Expression Cassette Assembly (MECA)的方法，用于在常规载体中构建复杂的遗传电路 | MECA方法通过修改与Golden Gate Assembly兼容的载体，使用嵌入连接语法的引物放大功能元件，能够在不需要专用载体和标准化模块库的情况下，通过两轮Golden Gate组装反应构建复杂结构 | NA | 开发一种灵活且通用的方法来构建复杂的遗传电路，以在合成生物学中实现多种功能，并在作物育种中提高生产力和整体性能 | 复杂的遗传电路构建，以及在烟草和番茄中的基因编辑和代谢产物生产 | 合成生物学 | NA | Golden Gate Assembly | NA | NA | 涉及烟草、番茄和Escherichia coli等多种植物和微生物样本 | NA | NA | NA | NA |
| 459 | 2024-12-13 |
Securing Commercial Nucleic Acid Synthesis
2024-Dec, Rand health quarterly
PMID:39664983
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综述 | 本文综述了商业核酸合成的安全问题，评估了当前的筛查状态，并提出了加强筛查的建议 | 本文提出了加强商业核酸合成筛查的建议，扩展并强化了政府沟通、行业联盟规则和最佳实践 | 本文主要基于现有文献和政策建议，缺乏实证研究 | 评估当前商业基因合成筛查的现状，并提出加强筛查的建议 | 商业核酸合成的安全问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 460 | 2024-12-13 |
Harnessing regulatory networks in Actinobacteria for natural product discovery
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae011
PMID:38569653
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综述 | 本文综述了放线菌中调控网络在天然产物发现中的应用 | 提出了基于调控指导的基因组挖掘方法，以激活生物合成基因簇（BGCs）的表达，并优先选择特定BGCs进行表达 | 当前随机筛选生物活性化合物的投资回报率低，且难以预测哪些BGCs应优先考虑 | 探讨如何优先选择和激活放线菌中的生物合成基因簇，以促进天然产物的发现 | 放线菌中的生物合成基因簇及其调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |