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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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441 | 2024-10-17 |
On the ever-growing functional versatility of the CRISPR-Cas13 system
2024-02, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14418
PMID:38381083
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研究论文 | 本文讨论了CRISPR-Cas13系统的功能多样性 | CRISPR-Cas13系统被重新用于解码和工程化基因表达程序,具有RNA沉默、RNA编辑、RNA追踪、核酸检测和翻译调控等多种功能 | NA | 探讨CRISPR-Cas13系统的功能多样性及其在系统生物学和合成生物学领域的应用 | CRISPR-Cas13系统及其功能 | NA | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | NA |
442 | 2024-10-16 |
Flanking Sequence Cotranscriptionally Regulates Twister Ribozyme Activity
2024-01-02, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00506
PMID:38134329
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研究论文 | 研究了侧翼序列对Twister核酶活性的共转录调控 | 首次展示了侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制,并提出了“ribozymogens”的概念 | 研究仅限于水稻中的Twister核酶,且样本数量有限 | 探讨侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制 | 水稻中的Twister核酶及其侧翼序列 | NA | NA | RNA-seq、结构探针、共转录切割实验 | NA | RNA序列 | 选择了几种水稻中的Twister核酶进行研究 |
443 | 2024-10-15 |
Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology
2024-Sep-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.3c00938
PMID:39207844
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综述 | 本文综述了在合成生物学中通过遗传密码扩展(GCE)方法将非经典氨基酸(ncAAs)定点引入细胞的技术进展及其主要应用 | 本文探讨了通过非经典密码子添加扩展遗传密码、创建半自主和自主生物体、设计调控元件以及操纵和扩展肽天然产物生物合成途径等创新方法 | 本文未具体提及研究中的局限性 | 探讨遗传密码扩展(GCE)方法在合成生物学中定点引入非经典氨基酸(ncAAs)的技术进展及其未来发展前景 | 非经典氨基酸(ncAAs)的定点细胞引入及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展(GCE) | NA | NA | NA |
444 | 2024-10-15 |
Toward the bioactive potential of myricitrin in food production: state-of-the-art green extraction and trends in biosynthesis
2024, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2023.2227262
PMID:37395263
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综述 | 本文综述了蜜柑素在食品生产中的生物活性潜力,包括其绿色提取技术和生物合成趋势 | 本文介绍了创新的绿色提取技术和基于合成生物学的生物合成方法,为蜜柑素的大规模生产提供了新视角 | 蜜柑素的低产量、高成本以及从植物资源中提取带来的环境破坏限制了其实际应用 | 探讨蜜柑素的健康益处及其作用机制,为其应用提供理论基础 | 蜜柑素的生物活性、提取技术和生物合成方法 | NA | NA | 绿色提取技术、合成生物学 | NA | NA | NA |
445 | 2024-10-14 |
Enhancing fatty acid and omega-3 production in Schizochytrium sp. using developed safe-harboring expression system
2024-Oct-10, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00447-y
PMID:39390586
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研究论文 | 开发了一种安全的转基因表达系统,用于增强Schizochytrium sp.中的脂肪酸和omega-3的生产 | 成功建立了一种稳健的同源重组系统,并确定了可靠的安全港基因整合位点,显著提高了DHA的生产 | NA | 开发和应用基因工程工具以增强脂质生产,促进工业生产 | Schizochytrium sp.中的脂肪酸和omega-3的生产 | 合成生物学 | NA | 同源重组 | NA | NA | NA |
446 | 2024-10-14 |
Achievements and perspectives of synthetic biology in botanical insecticides
2024-Oct, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30888
PMID:36183373
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物源杀虫剂异源生产中的最新进展、挑战和可行策略 | 探讨了通过合成生物学解决植物源杀虫剂生产中当前问题的潜力 | 许多植物源杀虫剂的生物合成途径尚未完全阐明,且这些生物合成酶在新宿主中的低效性和细胞毒性问题仍待解决 | 总结植物源杀虫剂异源生产的最新进展,分析当前挑战,并讨论可行生产策略 | 植物源杀虫剂的生物合成途径、酶工程、宿主工程和细胞毒性工程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
447 | 2024-10-14 |
Phylogenetic analysis and functional characterization of norcoclaurine synthase involved in benzylisoquinoline alkaloids biosynthesis in Stephania tetrandra
2024-Oct, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.31065
PMID:37357496
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研究论文 | 本文对Stephania tetrandra中的norcoclaurine synthase(NCS)进行了系统发育分析和功能表征,该酶参与苯基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成 | 首次在Menispermaceae科植物中鉴定并功能表征了NCS基因,并将其整合到工程酵母中以生产norcoclaurine | NA | 研究NCS基因在苯基异喹啉生物碱生物合成中的作用及其系统发育关系 | Stephania tetrandra中的NCS基因及其功能 | 生物化学 | NA | 酶学分析 | NA | 基因序列 | 两个功能性StNCS基因 |
448 | 2024-10-12 |
Bacterial microcompartments as a next-generation metabolic engineering tool: utilizing nature's solution for confining challenging catabolic pathways
2024-06-26, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20230229
PMID:38813858
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研究论文 | 本文探讨了细菌微区室作为下一代代谢工程工具的潜力,通过利用自然界提供的解决方案来限制具有挑战性的分解代谢途径 | 本文介绍了细菌微区室(BMCs)作为一种自主催化模块,能够克服异源生产途径中的低通量、酶的杂乱性、有毒中间体的形成或中间体流失到竞争反应中的问题 | NA | 研究细菌微区室在代谢工程中的应用,以提高生物产品的合成效率 | 细菌微区室及其在异源代谢途径中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
449 | 2024-10-09 |
Perspectives on Synthetic Protein Circuits in Mammalian Cells
2024-Dec, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100555
PMID:39372446
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综述 | 本文综述了在哺乳动物细胞中合成蛋白质电路的最新进展及其在生物医学中的应用前景 | 本文介绍了利用可编程的蛋白质结合、蛋白酶解或磷酸化来调节蛋白质相互作用和细胞功能的合成蛋白质电路,这些电路具有性能稳定、功能快速和设计紧凑的优点 | NA | 探讨合成蛋白质电路在哺乳动物细胞中的应用及其在生物医学中的潜在价值 | 合成蛋白质电路及其在哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结合、蛋白酶解、磷酸化 | NA | NA | NA |
450 | 2024-10-11 |
Every road leads to Rome: diverse biosynthetic regulation of plant cell wall-degrading enzymes in filamentous fungi Penicillium oxalicum and Trichoderma reesei
2024-Nov, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2280810
PMID:38035670
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综述 | 本文综述了青霉菌和木霉菌中植物细胞壁降解酶的生物合成调控机制 | 本文首次深入比较了青霉菌和木霉菌在植物细胞壁降解酶生物合成调控方面的差异 | NA | 探讨不同丝状真菌中植物细胞壁降解酶的生物合成调控机制 | 青霉菌和木霉菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
451 | 2024-10-11 |
Microfluidic technologies for lipid vesicle generation
2024-Oct-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00380b
PMID:39323383
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综述 | 本文综述了用于脂质囊泡生成的微流控技术,重点关注了最新的进展和最先进的技术 | 微流控方法相比传统批量方法提供了精确的尺寸控制、更高的生产吞吐量、高封装效率以及用户定义的膜特性等优势 | 每种方法的优缺点进行了评估,并提出了微流控工程脂质囊泡面临的挑战和机遇 | 探讨微流控技术在脂质囊泡生成中的应用,为新一代治疗药物、疫苗、传感器和仿生技术奠定基础 | 脂质囊泡的生成及其在纳米医学、生物技术和合成生物学中的应用 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
452 | 2024-10-11 |
From lignocellulosic biomass to single cell oil for sustainable biomanufacturing: Current advances and prospects
2024-Oct-07, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108460
PMID:39383979
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综述 | 本文综述了从木质纤维素生物质到单细胞油的可持续生物制造的当前进展和前景 | 本文首次全面总结了木质纤维素预处理的研究进展,并描述了如何通过基因工程赋予细胞利用木质纤维素的能力 | 目前从秸秆生产单细胞油面临的主要限制是产量低 | 探讨从木质纤维素生物质生产单细胞油的可持续生物制造方法 | 木质纤维素生物质和单细胞油的生产 | 生物工程 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
453 | 2024-10-11 |
Universal CRISPR-Cas12a and Toehold RNA Cascade Reaction on Paper Substrate for Visual Salmonella Genome Detection
2024-Sep, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202400508
PMID:38683016
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研究论文 | 本文介绍了一种在纸基底上使用CRISPR-Cas12a和重组酶聚合酶扩增(RPA)的合成生物学级联反应,用于可视化检测沙门氏菌基因组 | 该方法通过设计一个标准的toehold RNA开关,能够区分两种不同的沙门氏菌血清型,无需重新设计toehold RNA开关,具有高灵敏度和广泛适用性 | NA | 开发一种快速、准确且适用于现场检测沙门氏菌基因组的方法 | 沙门氏菌的基因组检测 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a, 重组酶聚合酶扩增 (RPA) | NA | 基因组 | 在纸基底上检测到最少100个沙门氏菌基因组拷贝,并在受污染的牛奶和生菜样本中成功应用 |
454 | 2024-10-11 |
A hierarchy of metabolite exchanges in metabolic models of microbial species and communities
2024-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012472
PMID:39325831
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研究论文 | 本文研究了微生物物种和群落代谢模型中的代谢物交换层次结构 | 提出了通过关注代谢子网络(如细胞间的代谢物交换和与环境的交换)来提高代谢网络分析的可扩展性 | 无偏方法由于组合爆炸问题,在大规模网络中扩展性较差 | 研究代谢网络中的代谢物交换层次结构,并探讨其在代谢工程和合成生物学领域的应用 | 微生物物种和群落的代谢模型 | 代谢工程 | NA | 代谢通量分析 | NA | 代谢网络模型 | 涉及从中心碳代谢到基因组规模的多种模型 |
455 | 2024-10-10 |
Modulating metabolism through synthetic biology: Opportunities for two-stage fermentation
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28791
PMID:38970785
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综述 | 本文综述了通过合成生物学工具调节细胞代谢以实现两阶段发酵的现状和最新成果 | 提出了通过合成生物学工具动态调节细胞代谢,以实现更高效的两阶段发酵过程 | NA | 探讨如何通过合成生物学工具提高生物基生产过程的效率 | 生物基燃料、化学品和材料的合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA |
456 | 2024-10-10 |
Enhancing cell-based therapies with synthetic gene circuits responsive to molecular stimuli
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28770
PMID:38867466
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综述 | 本文综述了基于分子刺激响应的合成基因开关在细胞疗法中的最新进展 | 介绍了合成基因开关在增强细胞疗法的安全性和时空可控性方面的创新应用 | 讨论了当前基于这些设备的细胞疗法在临床转化中面临的挑战 | 探讨合成生物学在开发下一代患者特异性细胞疗法中的作用 | 合成基因开关及其在细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA |
457 | 2024-10-10 |
Insights into yeast response to chemotherapeutic agent through time series genome-scale metabolic models
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28833
PMID:39199017
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法(TS-GSMM),将时间序列转录组学与基因组规模代谢模型(GSMM)相结合,以缩小所有可能的通量分布的可行解空间并获得时间序列通量样本 | 本文首次将时间序列转录组学数据与基因组规模代谢模型相结合,揭示了通路动态变化,无需进行动力学建模,并能检测到仅通过转录组学分析无法识别的通路 | NA | 研究酵母细胞对化疗药物多柔比星的时间序列响应 | 酵母细胞 | 代谢工程 | NA | 基因组规模代谢模型(GSMM) | 机器学习 | 转录组学数据 | 酵母细胞对多柔比星的时间序列响应数据 |
458 | 2024-10-10 |
Synthetic biology-based bioreactor and its application in biochemical analysis
2024, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2023.2180319
PMID:36803337
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综述 | 本文综述了基于合成生物学反应器和报告基因的生物传感器组件及其在重金属离子、核酸、抗生素等物质检测中的应用 | 介绍了基于细胞系统和无细胞系统的生物传感器在检测领域的应用 | 讨论了生物传感器面临的瓶颈和优化方向 | 综述合成生物学反应器及其在生物化学分析中的应用 | 合成生物学反应器和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
459 | 2024-10-10 |
Recent advances of CRISPR-based genome editing for enhancing staple crops
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1478398
PMID:39376239
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综述 | 本文综述了CRISPR/Cas系统在增强主要粮食作物方面的最新进展 | 强调了CRISPR/Cas技术的变革潜力,特别是prime和base编辑以及新型CRISPR相关蛋白的开发,显著提高了基因编辑的特异性、效率和范围 | 尽管存在脱靶效应、更高效的递送方法需求以及伦理和监管问题等挑战 | 探讨CRISPR/Cas技术在应对全球粮食安全和可持续性挑战中的重要性 | 主要粮食作物如水稻和玉米 | NA | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA |
460 | 2024-10-09 |
Strategies for Improving Aptamer Screening Efficiency: Library Design, Awareness Innovation, and Instrument Assistance
2024-Oct-08, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2024.2411244
PMID:39378058
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综述 | 本文综述了提高适配体筛选效率的策略,包括库设计、筛选意识创新和仪器辅助 | 通过合理库设计、新型筛选意识和先进筛选设备,将适配体筛选周期显著减少至<8轮,有些方法甚至实现单轮筛选,整体筛选时间缩短至<3周,同时提高适配体性能 | 当前SELEX过程仍面临一些挑战,如初始库相对盲目、筛选过程繁琐耗时、通常需要9-20轮筛选,整个过程一般持续2-3个月,以及获得的适配体性能不佳 | 总结适配体筛选机制和SELEX的现有局限性,分析SELEX优化筛选策略的原理和技术要点,为设计合适的适配体筛选方法提供实用参考 | 适配体筛选方法及其优化策略 | NA | NA | SELEX | NA | NA | NA |