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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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481 | 2024-09-26 |
Harnessing the endogenous Type I-C CRISPR-Cas system for genome editing in Bifidobacterium breve
2024-03-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02074-23
PMID:38319094
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研究论文 | 本文研究了利用内源性I-C型CRISPR-Cas系统在双歧杆菌中进行基因编辑的可行性 | 首次利用内源性I-C型CRISPR-Cas系统在双歧杆菌中实现了基因删除、单碱基替换、基因插入和连续基因编辑 | 研究仅限于特定的双歧杆菌菌株,未涵盖所有双歧杆菌种类 | 开发新的基因编辑工具,以促进双歧杆菌的功能基因组编辑和分析 | 双歧杆菌中的I-C型CRISPR-Cas系统及其在基因编辑中的应用 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因序列 | 五种双歧杆菌菌株 |
482 | 2024-09-26 |
Measuring differential fitness costs and interactions between genetic cassettes using fluorescent spectrophotometry
2024-02-21, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01419-23
PMID:38299817
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研究论文 | 本文介绍了一种利用荧光分光光度法设计、执行和分析微生物竞争实验数据的方法 | 本文提出了一种新的方法来测量不同合成基因盒之间的差异适应性成本和相互作用,通过荧光报告基因标记不同的竞争菌株并使用荧光分光光度计解析个体生长曲线 | 本文提到了在荧光和密度校准以及荧光蛋白成熟速率不同方面的挑战 | 本文旨在开发一种方法来测量合成基因盒之间的差异适应性成本和相互作用 | 本文研究的对象是不同合成基因盒在微生物竞争实验中的表现 | 合成生物学 | NA | 荧光分光光度法 | NA | 荧光数据 | 10种不同的质粒和3种基因组整合的荧光标记的菌株 |
483 | 2024-09-25 |
Blue valorization of lignin-derived monomers via reprogramming marine bacterium Roseovarius nubinhibens
2024-07-24, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00890-24
PMID:38940564
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研究论文 | 研究通过重新编程海洋细菌Roseovarius nubinhibens,将木质素衍生的芳香碳转化为高附加值化学品 | 首次在海洋细菌中应用基于CRISPR的调控系统,实现了对目标基因的精确高效抑制 | NA | 探索利用海洋细菌进行木质素生物转化,实现碳和水的双重节约 | 木质素衍生的单体4-羟基苯甲酸和海洋细菌Roseovarius nubinhibens | 生物技术 | NA | CRISPR干扰系统 | CRISPRi | NA | NA |
484 | 2024-09-24 |
[Biological and chemical synthesis of high-value active ingredients in traditional Chinese medicine]
2024-Aug, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了中药中高价值活性成分的生物和化学合成研究进展 | 提出了结合生物和化学合成的研究范式,包括化学酶介导的结构修饰、生物合成半合成生产以及仿生合成 | 未提及具体实验数据或结果,仅综述了现有研究进展 | 探讨中药中高价值活性成分的合成策略 | 中药中的高价值活性成分,如青蒿素、紫杉醇、长春碱和长春新碱 | NA | NA | 生物合成、化学合成 | NA | NA | NA |
485 | 2024-09-23 |
A frugal CRISPR kit for equitable and accessible education in gene editing and synthetic biology
2024-Aug-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50767-2
PMID:39095367
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研究论文 | 开发了一种名为CRISPRkit的经济实惠工具包,用于高中基因编辑和合成生物学教育 | CRISPRkit消除了对专业设备的需求,优先考虑生物安全,并使用成本效益高的试剂,提供了一种廉价且用户友好的CRISPR实验方法 | NA | 促进生命科学、生物工程和合成生物学领域的公平和可及教育 | 高中生在课堂环境中进行基因编辑和调控实验 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
486 | 2024-09-22 |
ReCARving the future: bridging CAR T-cell therapy gaps with synthetic biology, engineering, and economic insights
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1432799
PMID:39301026
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综述 | 本文综述了CAR T细胞疗法在血液恶性肿瘤治疗中的革命性进展,并探讨了其在更广泛肿瘤应用中面临的挑战和最新解决方案 | 本文介绍了CAR T细胞工程、新型抗原靶向策略、递送和肿瘤微环境持久性改进等方面的创新,以及异基因CAR T细胞作为现成疗法的开发 | 本文未提供具体的技术细节或实验数据,主要集中在综述和讨论现有研究进展 | 探讨CAR T细胞疗法在癌症治疗中的未来发展方向,并提出增强其安全性、有效性和可及性的策略 | CAR T细胞疗法在血液恶性肿瘤和实体瘤中的应用及其面临的挑战 | NA | 血液恶性肿瘤 | CAR T细胞疗法 | NA | NA | NA |
487 | 2024-09-22 |
Dynamic Gene Expression Mitigates Mutational Escape in Lysis-Driven Bacteria Cancer Therapy
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0049
PMID:39301524
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研究论文 | 研究了工程细菌在肿瘤治疗中的应用,特别是通过动态基因表达策略优化治疗效果 | 提出了动态基因表达策略,通过短时间重复诱导基因表达,减轻突变逃逸的影响,从而提高治疗细菌的持久性和治疗效果 | 研究主要集中在实验室条件下,尚未在临床环境中验证 | 优化工程细菌在肿瘤治疗中的应用,提高治疗效果和持久性 | 非致病性细菌表达的Perfringolysin O毒素及其动态表达策略 | 生物工程 | 癌症 | 分子动力学 | 数学模型 | 基因序列数据 | NA |
488 | 2024-09-20 |
Pangenomic landscapes shape performances of a synthetic genetic circuit across Stutzerimonas species
2024-Sep-17, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00849-24
PMID:39166875
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研究论文 | 研究探讨了基因电路在不同Stutzerimonas物种中的性能差异,揭示了基因组结构和功能对底盘效应的影响 | 通过泛基因组分析和基因表达定量测量,揭示了核心基因组的差异表达是影响基因电路性能的主要因素 | 研究仅限于六个密切相关的非模式细菌宿主,可能无法完全代表所有微生物的情况 | 研究基因组和生理环境如何影响基因电路在不同微生物中的性能,以改进跨多样微生物的生物设计策略 | 六个密切相关的Stutzerimonas物种中的基因电路性能 | 合成生物学 | NA | 泛基因组分析 | NA | 基因表达数据 | 六个密切相关的Stutzerimonas物种 |
489 | 2024-09-20 |
CRISPR/Cas9-based genome engineering in the filamentous fungus Rhizopus oryzae and its application to L-lactic acid production
2024-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400309
PMID:39295562
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研究论文 | 开发了一种适用于丝状真菌Rhizopus oryzae的高效CRISPR-Cas9基因编辑系统,并应用于L-乳酸生产 | 首次开发了适用于Rhizopus oryzae的CRISPR-Cas9基因编辑系统,并成功应用于代谢工程调控和合成生物学改造 | NA | 开发适用于Rhizopus oryzae的基因编辑工具,并应用于提高L-乳酸产量 | 丝状真菌Rhizopus oryzae及其基因组编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
490 | 2024-09-19 |
Intracellular Construction of Organelle-like Compartments Facilitates Metabolic Flux in Escherichia coli
2024-Sep-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06895
PMID:39230507
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研究论文 | 本文利用Wnt信号通路中的DIX结构域构建了细菌内的合成隔室,以增强代谢通量 | 首次使用DIX结构域及其相互作用基序构建了细菌内的合成隔室,显著增强了代谢通量 | NA | 研究在细菌内构建稳定的合成隔室以增强代谢通量的方法 | 大肠杆菌内的合成隔室及其对代谢通量的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
491 | 2024-09-19 |
Engineering Yarrowia lipolytica for Efficient Synthesis of Geranylgeraniol
2024-Sep-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06749
PMID:39241196
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法改造Yarrowia lipolytica,高效合成Geranylgeraniol | 通过表达异源磷酸酶基因、增强前体供应和下调角鲨烯合成途径,实现了Geranylgeraniol的高效合成,创下了摇瓶中Geranylgeraniol产量的新纪录 | NA | 提高Geranylgeraniol的合成效率 | Yarrowia lipolytica | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
492 | 2024-09-19 |
RNA exon editing: Splicing the way to treat human diseases
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102311
PMID:39281698
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综述 | 本文综述了RNA外显子编辑作为一种治疗策略,通过诱导合成RNA分子与内源性前mRNA目标之间的剪接,纠正致病突变,恢复功能性mRNA和蛋白质 | 本文介绍了RNA外显子编辑的新进展,包括在临床试验中的首次应用,以及如何利用现代合成生物学、下一代测序和生物信息学的进步,开发新的RNA外显子编辑分子 | NA | 探讨RNA外显子编辑在治疗人类疾病中的应用及其发展历程 | RNA外显子编辑技术及其在治疗遗传性疾病中的应用 | 基因治疗 | 遗传性疾病 | RNA剪接 | NA | NA | NA |
493 | 2024-09-19 |
Laws of thought in living cells
2024-Sep-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.08.005
PMID:39241745
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研究论文 | 本文介绍了一种基于三态逻辑的生物计算平台TriLoS,旨在提高生物计算的复杂性 | TriLoS平台提供了一种扩展生物计算复杂性的解决方案,超越了原理验证阶段 | NA | 开发一种能够扩展生物计算复杂性的新型平台 | TriLoS三态逻辑合成平台 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
494 | 2024-09-19 |
Temporal epigenome modulation enables efficient bacteriophage engineering and functional analysis of phage DNA modifications
2024-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011384
PMID:39231196
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研究论文 | 研究利用NgTET酶暂时减少噬菌体DNA修饰,提高CRISPR-Cas系统介导的突变效率,并分析了这些修饰对噬菌体感染的影响 | 首次利用NgTET酶暂时减少噬菌体DNA修饰,提高CRISPR-Cas系统介导的突变效率,并揭示了这些修饰对噬菌体感染的影响 | NA | 探索噬菌体感染机制,提高CRISPR-Cas系统介导的突变效率 | 噬菌体DNA修饰及其对感染机制的影响 | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | DNA | NA |
495 | 2024-09-19 |
Progresses and challenges of engineering thermophilic acetogenic cell factories
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1476253
PMID:39282569
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综述 | 本文综述了嗜热乙酸菌作为微生物细胞工厂的进展和挑战 | 介绍了嗜热乙酸菌在可持续生物技术过程中的独特代谢能力 | 讨论了在嗜热乙酸菌中实施高效和复杂菌株工程策略的剩余挑战 | 总结嗜热乙酸菌在代谢工程和合成生物学方面的最新进展,并探讨其在工业相关化合物可持续生物生产中的潜力 | 嗜热乙酸菌及其在工业废弃气体转化为乙酸和生物量中的应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
496 | 2024-09-17 |
Development of a tightly regulated copper-inducible transient gene expression system in Nicotiana benthamiana incorporating a suicide exon and Cre recombinase
2024-Oct, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.20021
PMID:39081031
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研究论文 | 开发了一种在Nicotiana benthamiana中紧密调控的铜诱导瞬时基因表达系统,结合了自杀外显子和Cre重组酶 | 引入自杀外显子HyP5SM/OsL5和Cre/LoxP作为额外的调控元件,增强了铜诱导系统的紧密性 | 铜诱导系统在调控某些测试的超敏细胞死亡反应时不够紧密 | 开发一种在Nicotiana benthamiana中紧密调控的瞬时基因表达系统 | Nicotiana benthamiana中的瞬时基因表达调控 | 植物功能基因组学 | NA | Agrobacterium介导的瞬时表达 | NA | 基因表达 | 涉及多种富含亮氨酸重复序列的蛋白质及其匹配的无毒因子 |
497 | 2024-09-17 |
Mining unique cysteine synthetases and computational study on thoroughly eliminating feedback inhibition through tunnel engineering
2024-Oct, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.5160
PMID:39275998
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研究论文 | 通过数据库挖掘和计算研究,开发了一种新的代谢途径,用于高效生产L-半胱氨酸,并通过隧道工程彻底消除反馈抑制 | 通过半理性设计和隧道分析策略,成功消除了L-半胱氨酸对酶的反馈抑制,并提高了酶的催化效率 | NA | 开发新的代谢途径,用于高效生产L-半胱氨酸,并消除反馈抑制 | L-半胱氨酸的生产酶O-磷酸丝氨酸硫氢酶(OPSS) | 合成生物学 | NA | 分子对接、分子动力学模拟、随机加速分子动力学模拟、伞形采样模拟 | NA | 蛋白质结构 | 一种来自Acetobacterium sp.的O-磷酸丝氨酸硫氢酶(AsOPSS)及其变体 |
498 | 2024-09-17 |
Plants against cancer: towards green Taxol production through pathway discovery and metabolic engineering
2024-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-024-00170-8
PMID:39279861
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综述 | 本文综述了通过途径发现和代谢工程实现绿色紫杉醇生产的进展 | 利用高通量测序、基因组装配、基因合成、分析技术和合成生物学方法,高效识别和工程化酶及代谢途径,生产天然和新颖的药物候选物 | 植物来源药物开发的挑战包括获取和培育源物种、代谢物结构复杂性和普遍低丰度 | 加速药物发现并解决紧迫的人类健康问题 | 植物天然产物及其在抗癌药物紫杉醇生物合成中的应用 | 代谢工程 | 癌症 | 高通量测序、基因组装配、基因合成、分析技术、合成生物学 | NA | 基因组数据 | NA |
499 | 2024-09-17 |
Genome Mining and Biological Engineering of Type III Borosins from Bacteria
2024-Aug-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25179350
PMID:39273298
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研究论文 | 本文研究了细菌中III型硼素的基因挖掘和生物工程 | 首次在细菌中发现III型硼素,并验证了KchMA的自甲基化活性,展示了其在合成生物学中的巨大潜力 | NA | 探索III型硼素的来源和潜力 | III型硼素及其在细菌中的生物合成途径 | 生物工程 | NA | 基因挖掘、生物化学实验、商业蛋白酶和AI辅助的合理设计 | NA | NA | NA |
500 | 2024-09-17 |
Foods of the Future: Challenges, Opportunities, Trends, and Expectations
2024-Aug-23, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods13172663
PMID:39272427
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综述 | 本文综述了未来食品的挑战、机遇、趋势和期望 | 本文提出了未来食品安全的策略,并讨论了功能性食品、新型食品、合成生物学和3D食品打印等有前景的食品系统 | 本文主要基于现有科学证据和数据进行综述,未涉及具体实验或模型 | 探讨未来食品系统的可持续性,提出解决食品安全、健康和环境问题的策略 | 未来可持续食品、替代蛋白质来源和新型高效的食品系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |