合成生物学相关文章
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当前共找到 1151 篇文献，本页显示第 481 - 500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2024-09-14 |
RiboDiffusion: tertiary structure-based RNA inverse folding with generative diffusion models
2024-06-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae259
PMID:38940178
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研究论文 | 本文提出了一种基于生成扩散模型的RNA逆折叠方法RiboDiffusion，用于从3D结构生成RNA序列 | RiboDiffusion利用图神经网络和Transformer模型，能够从3D RNA骨架结构生成RNA序列，并在序列恢复和多样性之间进行权衡 | NA | 解决RNA逆折叠问题，即从给定的结构约束中找到功能性RNA序列 | RNA序列和其3D结构 | 生物信息学 | NA | 生成扩散模型 | 图神经网络、Transformer | RNA序列和3D结构 | 不同长度和类型的RNA |
| 482 | 2024-09-13 |
Microalgal metabolic engineering facilitates precision nutrition and dietary regulation
2024-Nov-15, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.175460
PMID:39137841
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综述 | 本文综述了利用系统代谢工程优化微藻以实现精准营养和可持续饮食的方法 | 创新性地应用系统代谢工程，通过多组学分析和先进的代谢工程策略（如ZFNs、TALENs和CRISPR/Cas系统）优化微藻，提高生物活性化合物的生产 | NA | 探讨微藻在精准营养和可持续饮食中的应用潜力 | 微藻及其代谢产物 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、多组学分析、CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA |
| 483 | 2024-09-13 |
Microbial biofilms as a platform for diverse biocatalytic applications
2024-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.131302
PMID:39173957
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综述 | 本文综述了微生物生物膜在多种生物催化应用中的潜力，特别是人工工程生物膜的应用 | 本文填补了人工工程生物膜在生物催化系统中应用的空白，并探讨了生物膜工程的策略 | 本文主要集中在综述和理论探讨，缺乏具体实验数据和案例研究 | 探讨微生物生物膜在生物催化应用中的潜力，特别是人工工程生物膜的应用 | 微生物生物膜及其在生物催化系统中的应用 | NA | NA | 基因修饰、合成生物学方法、生物膜形成过程的靶向操作 | NA | NA | NA |
| 484 | 2024-09-13 |
Challenges to rhizobial adaptability in a changing climate: Genetic engineering solutions for stress tolerance
2024-Nov, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127886
PMID:39232483
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综述 | 本文综述了根瘤菌在气候变化下的适应性挑战及其在农业中的重要性，并探讨了通过基因工程提高根瘤菌耐受性的最新方法 | 本文总结了当前关于根瘤菌耐受性相关基因和通路的知识，并介绍了最新的基因工程方法，如合成生物学，以提高根瘤菌对环境变化的适应性 | 根瘤菌耐受性的遗传基础仍然了解不足 | 探讨气候变化对根瘤菌-植物共生关系的影响，并提出通过基因工程提高根瘤菌适应性的方法 | 根瘤菌及其与豆科植物的共生关系 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 485 | 2024-09-13 |
An expanded molecular and systems toolbox for imaging, mapping, and controlling local translation
2024-Oct, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102523
PMID:39226865
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综述 | 本文综述了用于成像、映射和控制局部翻译的扩展分子和系统工具箱 | 本文介绍了用于可视化和映射生物分子组件及翻译过程的新技术，这些技术具有更好的空间和时间分辨率，且伪影更少 | NA | 探讨如何通过新技术更好地可视化和控制细胞内局部蛋白质翻译过程 | 细胞内局部蛋白质翻译过程及其相关生物分子组件 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 486 | 2024-09-13 |
PhysioFit: a software to quantify cell growth parameters and extracellular fluxes
2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae488
PMID:39073885
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研究论文 | 介绍了一种名为PhysioFit的开源软件，用于量化细胞生长参数和胞外通量 | PhysioFit可以与任何生长模型兼容，并且设计为可互操作，支持多种常见生长模型，并允许高级用户实现额外的模型 | NA | 开发一种能够量化生长参数和胞外通量的通用工具 | 细胞生长参数和胞外通量 | 生物信息学 | NA | Python编程 | NA | 时间序列数据 | NA |
| 487 | 2024-09-13 |
Robustness and evolvability: Revisited, redefined and applied
2024-Aug-02, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105281
PMID:39098381
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研究论文 | 本文重新定义并应用了系统的鲁棒性和可进化性，提出了新的形式化定义和相应的度量方法，并使用进化算法在BNK模型系统中寻找不同类型的完美振荡器 | 本文提出了新的鲁棒性和可进化性的形式化定义和度量方法，比Wagner最初提出的度量方法更通用和更具代表性。此外，本文还提出了一种受NK系统启发的BNK数字建模方法，并应用于进化算法中 | NA | 重新定义和应用系统的鲁棒性和可进化性 | 系统的鲁棒性和可进化性，以及DNA合成噪声对DNA基生物传感器功能的影响和不同类型核酶的可进化性 | 合成生物学 | NA | 进化算法 | BNK模型 | NA | NA |
| 488 | 2024-09-11 |
Engineered transcription activator-like effector dimer proteins confer DNA loop-dependent gene repression comparable to Lac repressor
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae656
PMID:39077947
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研究论文 | 本文设计了基于目标序列可编程的转录激活因子样效应物二聚体（TALED）蛋白的抑制系统，并展示了其在DNA环依赖的细菌启动子抑制中的应用 | 本文首次展示了通过共价结合的TALED蛋白实现强效的DNA环依赖的细菌启动子抑制，并验证了DNA环结构显著增强启动子抑制效果 | 本文主要集中在E. coli中的实验验证，未来需进一步研究其在其他生物系统中的适用性 | 设计并验证一种新型的DNA环依赖的基因抑制系统，为合成生物学和治疗应用提供新工具 | 转录激活因子样效应物二聚体（TALED）蛋白及其在DNA环依赖的基因抑制中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA环结构分析 | NA | DNA序列 | E. coli菌株 |
| 489 | 2024-09-11 |
Induction of bacterial expression at the mRNA level by light
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae678
PMID:39126322
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研究论文 | 本文利用光敏受体NmPAL在mRNA水平上诱导细菌表达，通过蓝光触发NmPAL结合破坏cis-抑制的mRNA状态，从而解除翻译起始的阻碍，上调基因表达 | 本文开发了一种名为riboptoregulator的光遗传学电路，能够在mRNA水平上进行基因表达调控，并能与现有基因调控电路结合，实现更精细和严格的基因表达控制 | NA | 开发一种在mRNA水平上进行光遗传学调控的新方法，以提高细菌基因表达的效率和精确性 | 细菌基因表达的调控机制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | mRNA | NA |
| 490 | 2024-09-10 |
Advances in the Structures, Pharmacological Activities, and Biosynthesis of Plant Diterpenoids
2024-Aug-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02014
PMID:39081244
|
综述 | 本文综述了植物二萜类化合物的结构、药理活性和生物合成途径 | 利用合成生物学将微生物工程化为“细胞工厂”以生产所需化合物 | NA | 探讨植物二萜类化合物的生物合成机制及其在微生物中的异源生产 | 植物二萜类化合物及其生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 491 | 2024-09-10 |
Hindered intermolecular stacking of anti-parallel telomeric G-quadruplexes
2024-Sep-14, The Journal of chemical physics
IF:3.1Q1
DOI:10.1063/5.0225371
PMID:39248241
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研究论文 | 研究了反平行端粒G四链体在自拥挤条件下的端到端堆叠行为 | 开发了一种高效的粗粒度拟合工具，成功描述了单体和二聚体G四链体的平衡混合物 | NA | 探讨G四链体拓扑结构对其相互作用的影响 | 反平行端粒G四链体的堆叠行为 | NA | NA | 小角X射线散射 | 粗粒度拟合工具 | G四链体结构数据 | 使用序列AG3(T2AG3)3形成的反平行端粒G四链体 |
| 492 | 2024-09-10 |
Transforming drug development with synthetic biology and AI
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.008
PMID:38383215
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学和人工智能在药物开发中的应用，特别是在COVID-19大流行背景下RNA平台药物开发的挑战和解决方案 | 结合合成生物学和人工智能模型，提出了一种新的药物开发方法 | NA | 探索合成生物学和人工智能在药物开发中的应用，解决药物候选物识别的难题 | 药物开发中的RNA平台和药物候选物 | 机器学习 | NA | 合成生物学 | 人工智能模型 | NA | NA |
| 493 | 2024-09-10 |
Synthetic biology in microalgae towards fucoxanthin production for pharmacy and nutraceuticals
2024-02, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2023.115958
PMID:38052271
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综述 | 本文综述了合成生物学在微藻中用于提高岩藻黄素生产的原理和应用 | 本文提出了使用CRISPR-Cas9基因编辑、转录激活因子样效应核酸酶以及模块化组装和底盘工程等合成生物学工具，精确修改微藻基因组以提高岩藻黄素生产 | 本文主要讨论了合成生物学在微藻中的应用，但未详细探讨实际工业化生产的具体挑战和解决方案 | 探讨合成生物学在微藻中提高岩藻黄素生产的应用 | 微藻和岩藻黄素 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | NA | NA |
| 494 | 2024-09-08 |
Genome-wide identification of the phenylalanine ammonia-lyase gene from Epimedium Pubescens Maxim. (Berberidaceae): novel insight into the evolution of the PAL gene family
2024-Sep-04, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-024-05480-z
PMID:39232677
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研究论文 | 本研究全面探索了Epimedium pubescens中的PAL基因家族，揭示了其进化历程和在黄酮醇糖苷、花青素和木质素生物合成中的潜在作用 | 首次全面分析了Epimedium pubescens中的PAL基因家族，揭示了其独特的进化起源和在不同组织中的功能 | 需要进一步实验验证EpPAL2和EpPAL3在花青素生物合成中的作用 | 研究Epimedium pubescens中PAL基因家族的进化及其在黄酮醇糖苷和花青素生物合成中的作用 | Epimedium pubescens中的PAL基因家族及其在植物代谢中的功能 | 分子生物学 | NA | 基因组分析 | NA | 基因序列 | 7个PAL基因（EpPAL1-EpPAL7） |
| 495 | 2024-09-08 |
Killer yeasts: expanding frontiers in the age of synthetic biology
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.003
PMID:38575438
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评论 | 本文探讨了合成生物学时代下杀伤性酵母的潜力及其在抗真菌耐药性和食品安全方面的应用 | 本文提出利用合成生物学技术解锁杀伤性酵母系统的全部潜力，并设想重新设计宿主双链RNA真菌病毒作为安全且无感染性的系统来生产设计RNA | 尽管经过数十年的研究，杀伤性酵母的广泛应用仍受到一些限制 | 探讨合成生物学技术在杀伤性酵母系统中的应用潜力 | 杀伤性酵母及其分泌的蛋白质毒素 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 496 | 2024-09-08 |
Measuring the economic efficiency of laboratory automation in biotechnology
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.02.001
PMID:38402137
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研究论文 | 本文提出了一种实验价格指数（EPI），用于量化比较实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的时间、成本和样本数量因素，以评估其经济效率 | 本文创新性地提出了实验价格指数（EPI），用于量化实验室自动化的经济效率 | NA | 评估实验室自动化在生物技术项目中的经济效率 | 实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的应用 | 生物技术 | NA | 实验室自动化 | NA | NA | NA |
| 497 | 2024-09-07 |
Mutagenesis techniques for evolutionary engineering of microbes - exploiting CRISPR-Cas, oligonucleotides, recombinases, and polymerases
2024-Sep, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.02.006
PMID:38493013
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综述 | 本文综述了利用CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶和聚合酶等技术进行微生物进化工程的诱变技术 | 本文总结了进化工程领域中模型微生物的最新发展和方法，特别强调了体内技术在精准发酵代谢途径优化中的应用 | NA | 探讨如何通过体内外方法增加宿主的遗传多样性，特别是体内技术在代谢途径优化中的应用 | 微生物及其在工业环境中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶、聚合酶 | NA | NA | NA |
| 498 | 2024-09-07 |
Integrating microfluidics and synthetic biology: advancements and diverse applications across organisms
2024-05-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc01090b
PMID:38712893
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综述 | 本文综述了微流控技术与合成生物学的结合及其在不同生物体中的应用 | 本文创新性地探讨了微流控平台在合成生物学中的作用，特别是其在自动化设计-构建-测试-学习循环中的应用 | 本文主要为综述性质，未涉及具体实验数据或技术细节 | 探讨微流控技术如何促进合成生物学在不同领域中的应用 | 细菌细胞、酵母、真菌、动物细胞及无细胞系统 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
| 499 | 2024-09-06 |
Optimizing Promoters and Subcellular Localization for Constitutive Transgene Expression in Marchantia polymorpha
2024-Sep-03, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcae063
PMID:38822700
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研究论文 | 研究优化了苔藓植物Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位，以实现持续的转基因表达 | 发现了新的启动子，这些启动子在所有组织中都能驱动高水平的基因表达，且不会对生长造成负担，并证明了细胞质是异源蛋白表达的最佳亚细胞定位 | NA | 优化Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位，以实现持续的转基因表达 | Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 500 | 2024-09-06 |
Zero-shot prediction of mutation effects with multimodal deep representation learning guides protein engineering
2024-Sep, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00989-2
PMID:38969803
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ProMEP的多模态深度表示学习方法，用于零样本预测蛋白质突变效应，并指导蛋白质工程 | ProMEP通过多模态深度学习模型，从约1.6亿个蛋白质中全面学习序列和结构上下文，实现了突变效应的零样本预测，显著提高了预测速度和准确性 | NA | 开发一种能够准确预测蛋白质突变效应并指导蛋白质工程的方法 | 蛋白质突变效应的预测和基因编辑酶TnpB和TadA的工程化 | 生物信息学 | NA | 多模态深度表示学习 | 多模态深度学习模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 约1.6亿个蛋白质 |