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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-10-17 |
A comprehensive risk assessment of microplastics in soil, water, and atmosphere: Implications for human health and environmental safety
2024-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.117154
PMID:39378647
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研究论文 | 本文对土壤、水和大气中的微塑料进行了全面的风险评估,并探讨了其对人类健康和环境安全的影响 | 提出了基于相关研究进展的微塑料风险评估方法,并建议开发新的评估模型 | 现有的风险评估模型无法很好地评估微塑料的风险 | 评估微塑料在土壤、水和大气中的风险,并提出改进的风险评估方法 | 土壤、水和大气中的微塑料 | 环境科学 | NA | 数据可视化和分析 | NA | 数据集 | 在中国收集了135组土壤、水和大气中的相关数据 | NA | NA | NA | NA |
| 502 | 2024-10-17 |
Modulating bacterial function utilizing A knowledge base of transcriptional regulatory modules
2024-Oct-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae742
PMID:39193902
|
研究论文 | 本研究介绍了一种基于iModulon的工程方法,利用机器学习定义的共调控基因组(iModulons)作为设计部件,用于调节细菌功能 | 本研究提出了一种基于iModulon的工程方法,通过识别不同背景下遗传电路所需的组件,增强了基因组工程,提高了目标选择和模块行为预测的准确性 | NA | 研究旨在通过基于iModulon的方法,系统且可预测地重新编程细胞功能,提供对复杂调控网络的精细和可适应控制 | 细菌细胞功能 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 503 | 2024-10-17 |
Artificial intelligence-based prediction of pathogen emergence and evolution in the world of synthetic biology
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70014
PMID:39364593
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综述 | 本文探讨了人工智能在预测病原体出现和进化中的应用,特别是在合成生物学领域 | 提出了将生成式AI作为溯因推理的资源,以识别新技术(如合成生物学)带来的关键问题 | 本文仅限于动物病原体,未涵盖所有病原体类型 | 探讨人工智能在监测和控制病原体进化中的潜力 | 病原体的出现和进化,特别是由合成生物学引起的新技术 | 人工智能 | NA | 生成式AI | 生成式AI | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 504 | 2024-10-17 |
Escherichia coli on colorectal cancer: A two-edged sword
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70029
PMID:39400440
|
综述 | 本文创新性地提出了大肠杆菌在结直肠癌中的双刃剑理论,探讨了如何利用大肠杆菌的矛盾性质进行结直肠癌的筛查和治疗 | 提出了大肠杆菌在结直肠癌中的双刃剑理论,并探讨了其在筛查和治疗中的潜在应用 | 肠道微生物群与结直肠癌之间的关系仍不明确,应用大肠杆菌时应考虑其与其他微生物、宿主和环境因素的相互作用及其自身的变化 | 探讨大肠杆菌在结直肠癌筛查和治疗中的潜在应用 | 大肠杆菌及其在结直肠癌中的作用 | NA | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 505 | 2024-10-17 |
Precision and efficacy of RNA-guided DNA integration in high-expressing muscle loci
2024-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.18.582796
PMID:38562818
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研究论文 | 研究评估了在骨骼肌中使用CRISPR-Cas9和同源独立靶向整合(HITI)技术将报告基因或治疗基因整合到高表达位点的精度和效果 | 利用骨骼肌中的内源性启动子,通过HITI技术将基因整合到高表达位点,为基因替换疗法提供了新的方法 | 研究主要在老鼠肌细胞中进行,尚未在人体中验证 | 开发一种在骨骼肌中实现高表达治疗基因的基因替换技术 | 骨骼肌中的肌酸激酶(Ckm)和肌红蛋白(Mb)启动子 | 基因治疗 | NA | CRISPR-Cas9, 同源独立靶向整合(HITI) | NA | 基因组, 转录组 | 老鼠肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 506 | 2024-10-17 |
Pseudomonas putida as a platform for medium-chain length α,ω-diol production: Opportunities and challenges
2024-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14423
PMID:38528784
|
综述 | 本文综述了利用Pseudomonas putida生产中链长度α,ω-二醇的进展,并提出了可持续生产二醇的四模块方法 | 提出了利用Pseudomonas putida作为微生物平台生产中链长度α,ω-二醇的四模块方法 | 尽管取得了进展,但仍存在挑战,如中间产物的毒性等问题 | 探讨利用Pseudomonas putida作为微生物细胞工厂生产中链长度α,ω-二醇的机会和挑战 | Pseudomonas putida和中链长度α,ω-二醇的生产 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 507 | 2024-10-17 |
Microbial biotechnology and beyond: A roadmap for sustainable development and climate mitigation in the transition from fossil fuels to green chemistry
2024-03, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14434
PMID:38465780
|
研究论文 | 本文探讨了微生物技术在从化石燃料向绿色化学转型中的作用,以及其在可持续发展和气候缓解中的重要性 | 强调了微生物在维持生物循环和合成生物学工具在生产非化石燃料和化学品中的创新应用 | 面临非食品残渣和废物的可用性、成本效益的生物处理厂建设、发酵液中产品回收以及剩余木质素利用等挑战 | 推动从化石燃料向绿色化学的转型,实现可持续发展和气候缓解 | 微生物技术、合成生物学工具、非化石燃料和化学品生产 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 508 | 2024-10-17 |
On the ever-growing functional versatility of the CRISPR-Cas13 system
2024-02, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14418
PMID:38381083
|
研究论文 | 本文讨论了CRISPR-Cas13系统的功能多样性 | CRISPR-Cas13系统被重新用于解码和工程化基因表达程序,具有RNA沉默、RNA编辑、RNA追踪、核酸检测和翻译调控等多种功能 | NA | 探讨CRISPR-Cas13系统的功能多样性及其在系统生物学和合成生物学领域的应用 | CRISPR-Cas13系统及其功能 | NA | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 509 | 2024-10-16 |
Flanking Sequence Cotranscriptionally Regulates Twister Ribozyme Activity
2024-01-02, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.3c00506
PMID:38134329
|
研究论文 | 研究了侧翼序列对Twister核酶活性的共转录调控 | 首次展示了侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制,并提出了“ribozymogens”的概念 | 研究仅限于水稻中的Twister核酶,且样本数量有限 | 探讨侧翼序列对Twister核酶活性的调控机制 | 水稻中的Twister核酶及其侧翼序列 | NA | NA | RNA-seq、结构探针、共转录切割实验 | NA | RNA序列 | 选择了几种水稻中的Twister核酶进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 510 | 2024-10-15 |
Toward the bioactive potential of myricitrin in food production: state-of-the-art green extraction and trends in biosynthesis
2024, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2023.2227262
PMID:37395263
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综述 | 本文综述了蜜柑素在食品生产中的生物活性潜力,包括其绿色提取技术和生物合成趋势 | 本文介绍了创新的绿色提取技术和基于合成生物学的生物合成方法,为蜜柑素的大规模生产提供了新视角 | 蜜柑素的低产量、高成本以及从植物资源中提取带来的环境破坏限制了其实际应用 | 探讨蜜柑素的健康益处及其作用机制,为其应用提供理论基础 | 蜜柑素的生物活性、提取技术和生物合成方法 | NA | NA | 绿色提取技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 511 | 2024-10-14 |
Enhancing fatty acid and omega-3 production in Schizochytrium sp. using developed safe-harboring expression system
2024-Oct-10, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00447-y
PMID:39390586
|
研究论文 | 开发了一种安全的转基因表达系统,用于增强Schizochytrium sp.中的脂肪酸和omega-3的生产 | 成功建立了一种稳健的同源重组系统,并确定了可靠的安全港基因整合位点,显著提高了DHA的生产 | NA | 开发和应用基因工程工具以增强脂质生产,促进工业生产 | Schizochytrium sp.中的脂肪酸和omega-3的生产 | 合成生物学 | NA | 同源重组 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 512 | 2024-10-12 |
Bacterial microcompartments as a next-generation metabolic engineering tool: utilizing nature's solution for confining challenging catabolic pathways
2024-06-26, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20230229
PMID:38813858
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研究论文 | 本文探讨了细菌微区室作为下一代代谢工程工具的潜力,通过利用自然界提供的解决方案来限制具有挑战性的分解代谢途径 | 本文介绍了细菌微区室(BMCs)作为一种自主催化模块,能够克服异源生产途径中的低通量、酶的杂乱性、有毒中间体的形成或中间体流失到竞争反应中的问题 | NA | 研究细菌微区室在代谢工程中的应用,以提高生物产品的合成效率 | 细菌微区室及其在异源代谢途径中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 513 | 2024-10-11 |
Every road leads to Rome: diverse biosynthetic regulation of plant cell wall-degrading enzymes in filamentous fungi Penicillium oxalicum and Trichoderma reesei
2024-Nov, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2280810
PMID:38035670
|
综述 | 本文综述了青霉菌和木霉菌中植物细胞壁降解酶的生物合成调控机制 | 本文首次深入比较了青霉菌和木霉菌在植物细胞壁降解酶生物合成调控方面的差异 | NA | 探讨不同丝状真菌中植物细胞壁降解酶的生物合成调控机制 | 青霉菌和木霉菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 514 | 2024-10-11 |
Microfluidic technologies for lipid vesicle generation
2024-Oct-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00380b
PMID:39323383
|
综述 | 本文综述了用于脂质囊泡生成的微流控技术,重点关注了最新的进展和最先进的技术 | 微流控方法相比传统批量方法提供了精确的尺寸控制、更高的生产吞吐量、高封装效率以及用户定义的膜特性等优势 | 每种方法的优缺点进行了评估,并提出了微流控工程脂质囊泡面临的挑战和机遇 | 探讨微流控技术在脂质囊泡生成中的应用,为新一代治疗药物、疫苗、传感器和仿生技术奠定基础 | 脂质囊泡的生成及其在纳米医学、生物技术和合成生物学中的应用 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 515 | 2024-10-11 |
From lignocellulosic biomass to single cell oil for sustainable biomanufacturing: Current advances and prospects
2024-Oct-07, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108460
PMID:39383979
|
综述 | 本文综述了从木质纤维素生物质到单细胞油的可持续生物制造的当前进展和前景 | 本文首次全面总结了木质纤维素预处理的研究进展,并描述了如何通过基因工程赋予细胞利用木质纤维素的能力 | 目前从秸秆生产单细胞油面临的主要限制是产量低 | 探讨从木质纤维素生物质生产单细胞油的可持续生物制造方法 | 木质纤维素生物质和单细胞油的生产 | 生物工程 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 516 | 2024-10-11 |
A hierarchy of metabolite exchanges in metabolic models of microbial species and communities
2024-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012472
PMID:39325831
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研究论文 | 本文研究了微生物物种和群落代谢模型中的代谢物交换层次结构 | 提出了通过关注代谢子网络(如细胞间的代谢物交换和与环境的交换)来提高代谢网络分析的可扩展性 | 无偏方法由于组合爆炸问题,在大规模网络中扩展性较差 | 研究代谢网络中的代谢物交换层次结构,并探讨其在代谢工程和合成生物学领域的应用 | 微生物物种和群落的代谢模型 | 代谢工程 | NA | 代谢通量分析 | NA | 代谢网络模型 | 涉及从中心碳代谢到基因组规模的多种模型 | NA | NA | NA | NA |
| 517 | 2024-10-10 |
Modulating metabolism through synthetic biology: Opportunities for two-stage fermentation
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28791
PMID:38970785
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学工具调节细胞代谢以实现两阶段发酵的现状和最新成果 | 提出了通过合成生物学工具动态调节细胞代谢,以实现更高效的两阶段发酵过程 | NA | 探讨如何通过合成生物学工具提高生物基生产过程的效率 | 生物基燃料、化学品和材料的合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 518 | 2024-10-10 |
Enhancing cell-based therapies with synthetic gene circuits responsive to molecular stimuli
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28770
PMID:38867466
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综述 | 本文综述了基于分子刺激响应的合成基因开关在细胞疗法中的最新进展 | 介绍了合成基因开关在增强细胞疗法的安全性和时空可控性方面的创新应用 | 讨论了当前基于这些设备的细胞疗法在临床转化中面临的挑战 | 探讨合成生物学在开发下一代患者特异性细胞疗法中的作用 | 合成基因开关及其在细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 519 | 2024-10-10 |
Insights into yeast response to chemotherapeutic agent through time series genome-scale metabolic models
2024-Oct, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28833
PMID:39199017
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法(TS-GSMM),将时间序列转录组学与基因组规模代谢模型(GSMM)相结合,以缩小所有可能的通量分布的可行解空间并获得时间序列通量样本 | 本文首次将时间序列转录组学数据与基因组规模代谢模型相结合,揭示了通路动态变化,无需进行动力学建模,并能检测到仅通过转录组学分析无法识别的通路 | NA | 研究酵母细胞对化疗药物多柔比星的时间序列响应 | 酵母细胞 | 代谢工程 | NA | 基因组规模代谢模型(GSMM) | 机器学习 | 转录组学数据 | 酵母细胞对多柔比星的时间序列响应数据 | NA | NA | NA | NA |
| 520 | 2024-10-10 |
Synthetic biology-based bioreactor and its application in biochemical analysis
2024, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2023.2180319
PMID:36803337
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综述 | 本文综述了基于合成生物学反应器和报告基因的生物传感器组件及其在重金属离子、核酸、抗生素等物质检测中的应用 | 介绍了基于细胞系统和无细胞系统的生物传感器在检测领域的应用 | 讨论了生物传感器面临的瓶颈和优化方向 | 综述合成生物学反应器及其在生物化学分析中的应用 | 合成生物学反应器和生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |