合成生物学相关文章
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当前共找到 1142 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-09-13 |
Robustness and evolvability: Revisited, redefined and applied
2024-Aug-02, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105281
PMID:39098381
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研究论文 | 本文重新定义并应用了系统的鲁棒性和可进化性，提出了新的形式化定义和相应的度量方法，并使用进化算法在BNK模型系统中寻找不同类型的完美振荡器 | 本文提出了新的鲁棒性和可进化性的形式化定义和度量方法，比Wagner最初提出的度量方法更通用和更具代表性。此外，本文还提出了一种受NK系统启发的BNK数字建模方法，并应用于进化算法中 | NA | 重新定义和应用系统的鲁棒性和可进化性 | 系统的鲁棒性和可进化性，以及DNA合成噪声对DNA基生物传感器功能的影响和不同类型核酶的可进化性 | 合成生物学 | NA | 进化算法 | BNK模型 | NA | NA |
| 522 | 2024-09-11 |
Engineered transcription activator-like effector dimer proteins confer DNA loop-dependent gene repression comparable to Lac repressor
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae656
PMID:39077947
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研究论文 | 本文设计了基于目标序列可编程的转录激活因子样效应物二聚体（TALED）蛋白的抑制系统，并展示了其在DNA环依赖的细菌启动子抑制中的应用 | 本文首次展示了通过共价结合的TALED蛋白实现强效的DNA环依赖的细菌启动子抑制，并验证了DNA环结构显著增强启动子抑制效果 | 本文主要集中在E. coli中的实验验证，未来需进一步研究其在其他生物系统中的适用性 | 设计并验证一种新型的DNA环依赖的基因抑制系统，为合成生物学和治疗应用提供新工具 | 转录激活因子样效应物二聚体（TALED）蛋白及其在DNA环依赖的基因抑制中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA环结构分析 | NA | DNA序列 | E. coli菌株 |
| 523 | 2024-09-11 |
Induction of bacterial expression at the mRNA level by light
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae678
PMID:39126322
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研究论文 | 本文利用光敏受体NmPAL在mRNA水平上诱导细菌表达，通过蓝光触发NmPAL结合破坏cis-抑制的mRNA状态，从而解除翻译起始的阻碍，上调基因表达 | 本文开发了一种名为riboptoregulator的光遗传学电路，能够在mRNA水平上进行基因表达调控，并能与现有基因调控电路结合，实现更精细和严格的基因表达控制 | NA | 开发一种在mRNA水平上进行光遗传学调控的新方法，以提高细菌基因表达的效率和精确性 | 细菌基因表达的调控机制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | mRNA | NA |
| 524 | 2024-09-10 |
Advances in the Structures, Pharmacological Activities, and Biosynthesis of Plant Diterpenoids
2024-Aug-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02014
PMID:39081244
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综述 | 本文综述了植物二萜类化合物的结构、药理活性和生物合成途径 | 利用合成生物学将微生物工程化为“细胞工厂”以生产所需化合物 | NA | 探讨植物二萜类化合物的生物合成机制及其在微生物中的异源生产 | 植物二萜类化合物及其生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 525 | 2024-09-10 |
Hindered intermolecular stacking of anti-parallel telomeric G-quadruplexes
2024-Sep-14, The Journal of chemical physics
IF:3.1Q1
DOI:10.1063/5.0225371
PMID:39248241
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研究论文 | 研究了反平行端粒G四链体在自拥挤条件下的端到端堆叠行为 | 开发了一种高效的粗粒度拟合工具，成功描述了单体和二聚体G四链体的平衡混合物 | NA | 探讨G四链体拓扑结构对其相互作用的影响 | 反平行端粒G四链体的堆叠行为 | NA | NA | 小角X射线散射 | 粗粒度拟合工具 | G四链体结构数据 | 使用序列AG3(T2AG3)3形成的反平行端粒G四链体 |
| 526 | 2024-09-10 |
Transforming drug development with synthetic biology and AI
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.008
PMID:38383215
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学和人工智能在药物开发中的应用，特别是在COVID-19大流行背景下RNA平台药物开发的挑战和解决方案 | 结合合成生物学和人工智能模型，提出了一种新的药物开发方法 | NA | 探索合成生物学和人工智能在药物开发中的应用，解决药物候选物识别的难题 | 药物开发中的RNA平台和药物候选物 | 机器学习 | NA | 合成生物学 | 人工智能模型 | NA | NA |
| 527 | 2024-09-10 |
Synthetic biology in microalgae towards fucoxanthin production for pharmacy and nutraceuticals
2024-02, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2023.115958
PMID:38052271
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综述 | 本文综述了合成生物学在微藻中用于提高岩藻黄素生产的原理和应用 | 本文提出了使用CRISPR-Cas9基因编辑、转录激活因子样效应核酸酶以及模块化组装和底盘工程等合成生物学工具，精确修改微藻基因组以提高岩藻黄素生产 | 本文主要讨论了合成生物学在微藻中的应用，但未详细探讨实际工业化生产的具体挑战和解决方案 | 探讨合成生物学在微藻中提高岩藻黄素生产的应用 | 微藻和岩藻黄素 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | NA | NA |
| 528 | 2024-09-08 |
Genome-wide identification of the phenylalanine ammonia-lyase gene from Epimedium Pubescens Maxim. (Berberidaceae): novel insight into the evolution of the PAL gene family
2024-Sep-04, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-024-05480-z
PMID:39232677
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研究论文 | 本研究全面探索了Epimedium pubescens中的PAL基因家族，揭示了其进化历程和在黄酮醇糖苷、花青素和木质素生物合成中的潜在作用 | 首次全面分析了Epimedium pubescens中的PAL基因家族，揭示了其独特的进化起源和在不同组织中的功能 | 需要进一步实验验证EpPAL2和EpPAL3在花青素生物合成中的作用 | 研究Epimedium pubescens中PAL基因家族的进化及其在黄酮醇糖苷和花青素生物合成中的作用 | Epimedium pubescens中的PAL基因家族及其在植物代谢中的功能 | 分子生物学 | NA | 基因组分析 | NA | 基因序列 | 7个PAL基因（EpPAL1-EpPAL7） |
| 529 | 2024-09-08 |
Killer yeasts: expanding frontiers in the age of synthetic biology
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.003
PMID:38575438
|
评论 | 本文探讨了合成生物学时代下杀伤性酵母的潜力及其在抗真菌耐药性和食品安全方面的应用 | 本文提出利用合成生物学技术解锁杀伤性酵母系统的全部潜力，并设想重新设计宿主双链RNA真菌病毒作为安全且无感染性的系统来生产设计RNA | 尽管经过数十年的研究，杀伤性酵母的广泛应用仍受到一些限制 | 探讨合成生物学技术在杀伤性酵母系统中的应用潜力 | 杀伤性酵母及其分泌的蛋白质毒素 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 530 | 2024-09-08 |
Measuring the economic efficiency of laboratory automation in biotechnology
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.02.001
PMID:38402137
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研究论文 | 本文提出了一种实验价格指数（EPI），用于量化比较实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的时间、成本和样本数量因素，以评估其经济效率 | 本文创新性地提出了实验价格指数（EPI），用于量化实验室自动化的经济效率 | NA | 评估实验室自动化在生物技术项目中的经济效率 | 实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的应用 | 生物技术 | NA | 实验室自动化 | NA | NA | NA |
| 531 | 2024-09-07 |
Mutagenesis techniques for evolutionary engineering of microbes - exploiting CRISPR-Cas, oligonucleotides, recombinases, and polymerases
2024-Sep, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.02.006
PMID:38493013
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综述 | 本文综述了利用CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶和聚合酶等技术进行微生物进化工程的诱变技术 | 本文总结了进化工程领域中模型微生物的最新发展和方法，特别强调了体内技术在精准发酵代谢途径优化中的应用 | NA | 探讨如何通过体内外方法增加宿主的遗传多样性，特别是体内技术在代谢途径优化中的应用 | 微生物及其在工业环境中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶、聚合酶 | NA | NA | NA |
| 532 | 2024-09-07 |
Integrating microfluidics and synthetic biology: advancements and diverse applications across organisms
2024-05-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc01090b
PMID:38712893
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综述 | 本文综述了微流控技术与合成生物学的结合及其在不同生物体中的应用 | 本文创新性地探讨了微流控平台在合成生物学中的作用，特别是其在自动化设计-构建-测试-学习循环中的应用 | 本文主要为综述性质，未涉及具体实验数据或技术细节 | 探讨微流控技术如何促进合成生物学在不同领域中的应用 | 细菌细胞、酵母、真菌、动物细胞及无细胞系统 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
| 533 | 2024-09-06 |
Optimizing Promoters and Subcellular Localization for Constitutive Transgene Expression in Marchantia polymorpha
2024-Sep-03, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcae063
PMID:38822700
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研究论文 | 研究优化了苔藓植物Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位，以实现持续的转基因表达 | 发现了新的启动子，这些启动子在所有组织中都能驱动高水平的基因表达，且不会对生长造成负担，并证明了细胞质是异源蛋白表达的最佳亚细胞定位 | NA | 优化Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位，以实现持续的转基因表达 | Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2024-09-06 |
Zero-shot prediction of mutation effects with multimodal deep representation learning guides protein engineering
2024-Sep, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00989-2
PMID:38969803
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ProMEP的多模态深度表示学习方法，用于零样本预测蛋白质突变效应，并指导蛋白质工程 | ProMEP通过多模态深度学习模型，从约1.6亿个蛋白质中全面学习序列和结构上下文，实现了突变效应的零样本预测，显著提高了预测速度和准确性 | NA | 开发一种能够准确预测蛋白质突变效应并指导蛋白质工程的方法 | 蛋白质突变效应的预测和基因编辑酶TnpB和TadA的工程化 | 生物信息学 | NA | 多模态深度表示学习 | 多模态深度学习模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 约1.6亿个蛋白质 |
| 535 | 2024-09-06 |
Cell reprogramming design by transfer learning of functional transcriptional networks
2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2312942121
PMID:38437548
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研究论文 | 本文开发了一种基于转录组数据的迁移学习方法，用于控制细胞行为，并生成可转移到特定重编程目标的网络动力学模型 | 通过预训练的适应性模型，创新性地改进了现有方法，能够针对特定的重编程转换进行调整 | 需要进一步验证和优化以应对复杂的细胞网络和组合干预的挑战 | 利用合成生物学、下一代测序和机器学习的最新进展，合理设计基于基因扰动和药物反应的新疾病治疗方法 | 人类细胞命运相关的转录组数据，以及微阵列和RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 下一代测序 (NGS), RNA测序 (RNA-seq) | 迁移学习模型 | 转录组数据 | 超过9,000个微阵列数据和超过10,000个RNA测序数据，涵盖54种细胞类型和227种独特扰动 |
| 536 | 2024-09-05 |
Single-molecule force spectroscopy of toehold-mediated strand displacement
2024-Aug-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51813-9
PMID:39217165
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研究论文 | 本文利用单分子力谱技术结合微流控增强的光阱和粗粒度模拟，研究了基于脚手架介导的链置换（TMSD）的动态DNA纳米技术中的单分子水平动力学。 | 首次在单分子水平上实时观察和调控TMSD过程，并分析了DNA和RNA入侵的动力学差异。 | NA | 探索脚手架介导的链置换过程在单分子水平上的动力学特性。 | DNA和RNA的链置换过程。 | DNA纳米技术 | NA | 单分子力谱技术 | NA | NA | 数千次正反入侵事件 |
| 537 | 2024-09-05 |
Computational tools for plant genomics and breeding
2024-Aug, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2578-6
PMID:38676814
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研究论文 | 本文综述了植物基因组学和作物育种中计算工具的应用 | 文章介绍了基因组装、基因组注释、表观基因组分析和转录组分析等领域的最新进展 | NA | 探讨计算工具在植物基因组学和作物育种中的应用 | 植物基因组学和作物育种 | 生物信息学 | NA | 高通量测序、分子生物学、数据科学 | 深度学习 | 基因组数据 | NA |
| 538 | 2024-09-04 |
Wuhan Sequence-Based Recombinant Antigens Expressed in E. coli Elicit Antibodies Capable of Binding with Omicron S-Protein
2024-Aug-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25169016
PMID:39201702
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研究论文 | 本文研究了基于武汉序列的重组抗原在E. coli中表达，并能引发与Omicron S蛋白结合的抗体 | 首次证明这些重组抗原能诱导产生与Omicron变种S蛋白相互作用的抗体，并展示了合成生物学方法在开发高度交叉反应疫苗中的潜力 | NA | 开发交叉反应疫苗，以应对SARS-CoV-2的持续变异和新变种的出现 | 重组冠状病毒抗原及其免疫原性 | 疫苗学 | 冠状病毒感染 | 细菌表达系统 | NA | 蛋白质 | 小鼠 |
| 539 | 2024-09-04 |
Photosynthesis: Genetic Strategies Adopted to Gain Higher Efficiency
2024-Aug-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25168933
PMID:39201620
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综述 | 本文综述了通过遗传策略提高光合作用效率的方法 | 讨论了CRISPR-Cas9和合成生物学等基因编辑工具在精确调整光合作用途径中的最新成功案例 | 文章未明确指出具体的局限性 | 旨在识别光合作用的优化机会，讨论近期进展，并解决提高这一关键过程的挑战 | 光合作用的遗传方面及其在提高作物产量中的应用 | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 540 | 2024-09-04 |
Identification, Design, and Application of Noncoding Cis-Regulatory Elements
2024-Aug-05, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14080945
PMID:39199333
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研究论文 | 本文探讨了顺式调控元件（CREs）的识别、设计和应用，以及它们在生物学功能中的关键作用 | 本文利用深度学习算法和大语言模型来解析控制CRE功能的复杂核苷酸序列，并实现CRE活动的精确预测和从头设计 | NA | 深入理解CRE的操作动态，以利用其多样化的调控特性 | 顺式调控元件（CREs）及其在生物学功能中的作用 | 基因组学 | NA | 深度学习算法 | 大语言模型 | 功能基因组数据 | NA |