合成生物学相关文章
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当前共找到 1159 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-08-17 |
ShuffleAnalyzer: A Comprehensive Tool to Visualize DNA Shuffling
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00251
PMID:38991172
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research paper | 介绍了一种名为ShuffleAnalyzer的综合性工具，用于可视化DNA重排过程 | ShuffleAnalyzer提供直接的图形输出，使得分析过程更加用户友好且高效 | NA | 开发一种工具以提高DNA重排分析的效率和可视化 | DNA重排过程及其在合成生物学中的应用 | synthetic biology | NA | DNA shuffling | NA | DNA序列 | NA |
| 522 | 2024-08-17 |
Designing a Novel Temperature- and Noncanonical Amino Acid-Controlled Biological Logic Gate in Escherichia coli
2024-Aug-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00423
PMID:39110782
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研究论文 | 本研究探讨了外源性氨基酸tRNA合成酶（aaRS）和琥珀抑制tRNA对基因表达的影响，并利用这些效应在Escherichia coli中设计了一种新型生物逻辑门。 | 本研究发现了外源性aaRS/tRNA对细胞内腺苷三磷酸的高消耗率在高温下引起的温度敏感性，并利用这一特性构建了一种新型生物AND门。 | 本研究主要集中在DH10β Δ中F1RP/F2P双杂交系统的转化细胞，可能需要进一步研究在其他系统和条件下的适用性。 | 探索外源性aaRS/tRNA对基因表达的影响，并开发新型生物逻辑门。 | 外源性氨基酸tRNA合成酶和琥珀抑制tRNA对基因表达的影响。 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展（GCE） | NA | NA | NA |
| 523 | 2024-08-17 |
Identification of the cytochrome P450s responsible for the biosynthesis of two types of aporphine alkaloids and their de novo biosynthesis in yeast
2024-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13724
PMID:38953746
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研究论文 | 本研究识别了两种细胞色素P450酶（CYP80G6和CYP80Q5），它们分别作用于(S)-配置和(R)-配置的底物，揭示了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征。此外，还鉴定了两种CYP719C酶（CYP719C3和CYP719C4），它们催化形成甲基二氧桥，这是阿朴啡生物碱中的关键药效团。利用这些关键酶的功能特性，我们在酵母中重建了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成途径，实现了如(R)-glaziovine、(S)-glaziovine和magnoflorine等化合物的从头合成。 | 本研究首次识别了特定细胞色素P450酶在阿朴啡生物碱生物合成中的作用，并成功在酵母中重建了这些生物碱的生物合成途径，为通过合成生物学生产这些有价值的化合物奠定了基础。 | NA | 揭示阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征，并在酵母中实现这些生物碱的从头合成。 | 阿朴啡生物碱的生物合成途径和相关酶的功能特性。 | NA | NA | 细胞色素P450酶的功能鉴定 | NA | 酶活性数据 | NA |
| 524 | 2024-08-17 |
Synthetic Cells from Droplet-Based Microfluidics for Biosensing and Biomedical Applications
2024-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202400086
PMID:38563581
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综述 | 本文综述了通过基于液滴的微流控技术制备合成细胞的最新研究进展 | 微流控技术能够替代传统的劳动密集型、昂贵且复杂的技术，实现合成细胞的微型化和批量生产 | NA | 探讨合成细胞在生物传感器和其他生物医学应用中的潜力 | 不同类型的合成细胞，包括脂质囊泡、聚合物囊泡、共沉淀微滴和胶体囊泡 | 生物医学工程 | NA | 基于液滴的微流控技术 | NA | NA | NA |
| 525 | 2024-08-17 |
Enhancing Gene Synthesis Security: An Updated Framework for Synthetic Nucleic Acid Screening and the Responsible Use of Synthetic Biological Materials
2024-Jun, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2023.0036
PMID:39144102
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研究论文 | 本文介绍了2023年更新的合成核酸筛选框架及其对生命科学研究社区的影响 | 更新了2010年的合成双链DNA筛选框架，扩展了其范围和适用实体 | NA | 旨在增强基因合成安全性，推动合成生物材料的责任使用 | 合成核酸的筛选框架及其在生命科学研究中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物技术 | NA | 文本 | 2020年收到15份回复共220页，2022年收到26份回复共79页 |
| 526 | 2024-08-17 |
Editorial: Plant chassis for synthetic biology and its application in biomanufacturing
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1460378
PMID:39148620
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 527 | 2024-08-16 |
Engineered Bacteria as Living Biosensors in Dermal Tattoos
2024-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309509
PMID:38884139
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研究论文 | 本文展示了将工程化细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中，用于实时监测生物标志物 | 利用合成生物学技术，将工程化细菌作为活体分析工具，具有更广泛的生物标志物检测范围和先进的处理及感应/响应功能 | NA | 探索将工程化细菌作为活体分析工具集成到皮肤纹身中，用于实时监测生物标志物 | 工程化细菌、皮肤纹身、生物标志物监测 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | RNA温度计 | 荧光读数 | NA |
| 528 | 2024-08-15 |
Expanding the synthetic biology repertoire of a fast-growing cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 11801
2024-Sep, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28740
PMID:38773863
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研究论文 | 研究通过全局转录组分析，鉴定了Synechococcus elongatus PCC 11801中的48个高转录数基因的天然启动子，并利用荧光报告系统对其进行了特性分析。同时，通过基因组数据和蛋白质组分析，识别了534个操纵子，并系统地鉴定了15个表现出下游基因高蛋白表达的基因间区域，用于识别核糖体结合位点（RBSs）。 | 本研究扩展了Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱，包括启动子元件和核糖体结合位点，为加速PCC 11801的生物工程提供了多样化的启动子和RBS序列库。 | NA | 扩展Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱，以促进其作为潜在细胞工厂的应用。 | Synechococcus elongatus PCC 11801的天然启动子和核糖体结合位点。 | 合成生物学 | NA | 全局转录组分析，荧光报告系统 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 48个天然启动子，534个操纵子，15个基因间区域 |
| 529 | 2024-08-15 |
Transcriptional upregulation of the myo-inositol biosynthesis pathway is enhanced by NFAT5 in hyperosmotically stressed tilapia cells
2024-Sep-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00187.2024
PMID:38946247
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研究论文 | 本文研究了莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下肌醇生物合成途径的上调，并探讨了NFAT5在此过程中的作用 | 首次证明了NFAT5作为罗非鱼转录因子，参与高渗应激下肌醇生物合成途径的激活 | 除了NFAT5外，还需要其他强渗透应激信号机制来完全激活罗非鱼基因 | 探讨NFAT5在罗非鱼细胞高渗应激下肌醇生物合成途径中的作用 | 莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下的生理调整 | NA | NA | NA | NA | mRNA | 使用OmB细胞系进行实验 |
| 530 | 2024-08-15 |
Engineered Bacteria for Visualization and Localization of Gastrointestinal Bleeding: A Promising Application
2024-Aug-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01699
PMID:39141424
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研究论文 | 本文开发了一种利用合成生物技术智能工程化的细菌，用于体内定位检测胃肠道出血 | 通过构建三个基因电路模块，实现了对血红素的特异性感应和实时光学信号的体内生成，克服了现有诊断方法的局限 | NA | 提高胃肠道出血的诊断准确性和治疗效果 | 胃肠道出血，特别是隐匿性胃肠道出血 | 合成生物学 | 胃肠道疾病 | 合成生物技术 | 基因电路模块 | NA | NA |
| 531 | 2024-08-14 |
Logical regulation of endogenous gene expression using programmable, multi-input processing CRISPR guide RNAs
2024-Aug-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae549
PMID:38943344
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化条件性gRNA的dCas9调节器，用于精确控制内源基因表达 | 本研究首次实现了基于多输入逻辑处理的条件性gRNA，能够高效调节内源代谢过程 | NA | 开发一种新的方法来精确控制CRISPR-Cas系统，以调节内源基因表达 | Escherichia coli中的内源代谢基因和细胞骨架基因 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | RNA | 涉及Escherichia coli中的多个基因，包括lacZ, malT, poxB, ftsZ和mreB |
| 532 | 2024-08-14 |
Advances in functional studies of plant MYC transcription factors
2024-Aug-05, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-024-04697-8
PMID:39103657
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综述 | 本文综述了植物MYC转录因子在调控多种生理过程中的功能研究进展 | 通过基因克隆和利用全基因组'omics'及蛋白质-蛋白质相互作用技术，深入理解了MYC的多方面调控功能 | NA | 探讨MYC作为分子开关在调控植物激素和光敏色素介导的信号转导途径中的作用 | 植物MYC转录因子及其在植物生长、发育、逆境适应和次生代谢中的作用 | NA | NA | 全基因组'omics'技术，蛋白质-蛋白质相互作用技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 533 | 2024-08-07 |
Editorial overview: Systems and synthetic biology of microbial cells and communities
2024-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102517
PMID:39029444
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2024-08-14 |
Biosecurity Risk Assessment for the Use of Artificial Intelligence in Synthetic Biology
2024-Jun, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2023.0031
PMID:39131181
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研究论文 | 本文提出了一种专门针对合成生物学中人工智能应用的生物安全风险评估流程 | 首次在文献中提供了生物安全风险评估工具和方法，有助于负责任地整合人工智能于合成生物学 | NA | 解决人工智能与合成生物学整合带来的复杂生物安全挑战 | 人工智能在合成生物学中的应用及其生物安全风险 | 合成生物学 | NA | 人工智能 | 语言模型 | NA | 以大型语言模型“ChatGPT 4.0”为例进行风险评估 |
| 535 | 2024-08-14 |
Developing a Common Global Baseline for Nucleic Acid Synthesis Screening
2024-Jun, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2023.0034
PMID:39131178
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研究论文 | 本文介绍了开发用于核酸合成筛选的全球通用基准机制的过程和目的 | 提出了一个全球通用的核酸合成筛选机制，旨在解决当前的障碍并促进国际间的筛选实践 | 文章提到了在开发筛选实践中仍存在的挑战 | 确保合成核酸的安全和负责任使用，防止其滥用 | 核酸合成筛选的国际标准和机制 | 生物安全 | NA | 核酸合成筛选技术 | NA | NA | NA |
| 536 | 2024-08-14 |
Biofunctional coacervate-based artificial protocells with membrane-like and cytoplasm-like structures for the treatment of persistent hyperuricemia
2024-01, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2023.11.030
PMID:37992873
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研究论文 | 本文研究了基于生物功能化凝聚层滴的人工原细胞，用于治疗持续性高尿酸血症 | 开发了具有生理稳定性的聚赖氨酸-多核苷酸复合凝聚层滴，并通过PEG化磷脂膜改善其生物相容性，形成具有膜样和细胞质样结构的人工原细胞 | NA | 研究人工原细胞在治疗持续性高尿酸血症中的应用 | 人工原细胞的制备及其在降尿酸和预防肾脏损伤中的效果 | 生物技术 | 高尿酸血症 | 凝聚层滴技术 | NA | 生物分子 | 小鼠模型 |
| 537 | 2024-08-14 |
Towards a Yersinia pestis lipid A recreated in an Escherichia coli scaffold genome
2024, Access microbiology
DOI:10.1099/acmi.0.000723.v3
PMID:39130741
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研究论文 | 本文利用CRISPR/Cas9重组技术将脂多糖A生物合成基因插入到表达脂多糖IV亚单位的菌株基因组中 | 成功插入三个基因并通过RT-PCR验证其表达，但通过MALDI-TOF质谱分析发现脂多糖A结构未在背景中重现 | 尽管基因表达，但脂多糖A结构未能在背景中重现 | 探索在Escherichia coli基因组中重现Yersinia pestis脂多糖A的可能性 | 脂多糖A生物合成基因及其在Escherichia coli中的表达 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9重组技术，MALDI-TOF质谱分析 | NA | 基因组 | 一个菌株 |
| 538 | 2024-08-13 |
AFP: Finding pathways accounting for stoichiometry along with atom group tracking in metabolic network
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.004
PMID:39009230
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研究论文 | 本文提出了一种名为AFP的新方法，通过将原子组追踪融入反应化学计量学，利用混合整数线性规划（MILP）来寻找代谢途径 | AFP方法结合了原子组追踪与反应化学计量学，构建MILP模型以搜索包含原子组交换的反应途径，并能从任意或给定的化合物搜索到目标化合物 | NA | 旨在自动发现合成生物学和代谢工程中代谢途径的初始设计中的新途径 | 代谢途径的自动发现方法 | 代谢工程 | NA | 混合整数线性规划（MILP） | MILP模型 | 代谢途径数据 | NA |
| 539 | 2024-08-13 |
A new synthetic biology system for investigating the biosynthesis of antibiotics and other secondary metabolites in streptomycetes
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.007
PMID:39004405
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研究论文 | 本文介绍了一种新的合成生物学表达系统，用于研究链霉菌中抗生素和其他次级代谢产物的生物合成 | 该系统允许将生物合成基因簇（BGCs）重构为单顺反子转录单元，并基于含有强kasOp*启动子、RBS和终止子的质粒 | NA | 开发一种新的合成生物学系统，用于研究链霉菌中次级代谢产物的生物合成 | 链霉菌中的生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 基因序列 | 涉及两种已知的生物合成基因簇，用于芳香聚酮类抗生素landomycin和mithramycin的合成 |
| 540 | 2024-08-13 |
Enhancing Withanolide Production in the Withania Species: Advances in In Vitro Culture and Synthetic Biology Approaches
2024-Aug-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13152171
PMID:39124289
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研究论文 | 本文探讨了通过体外培养技术和合成生物学方法提高茄科植物中甾体内酯类化合物生产的最新进展 | 利用合成生物学和机器学习技术，通过异源系统和代谢工程改造甾体内酯的生物合成途径 | 甾体内酯的生物合成途径复杂，是提高生产的主要障碍 | 提高甾体内酯的生产以满足现代医学的需求 | 茄科植物中的甾体内酯类化合物 | 合成生物学 | NA | CRISPR | 机器学习 | 生物过程数据 | NA |