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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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561 | 2024-08-08 |
Parsing patterns: Emerging roles of tissue self-organization in health and disease
2024-Jun-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.016
PMID:38906093
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综述 | 本文综述了组织自组织在胚胎和成体组织中的模式形成原理和机制,并探讨了其在健康和疾病中的作用。 | 提出基于组织自组织模式的设计,可以用于合成生物学和复杂模式器官的生成。 | NA | 探讨组织自组织在健康和疾病中的作用及其在生物学和医学中的应用潜力。 | 胚胎和成体组织中的自组织模式及其在健康和疾病中的作用。 | 生物学 | 炎症性皮肤病,肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
562 | 2024-08-08 |
Expanding the capabilities of MuGENT for large-scale genetic engineering of the fastest-replicating species, Vibrio natriegens
2024-Jun-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03964-23
PMID:38667341
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研究论文 | 本文扩展了多重基因组编辑自然转化技术(MuGENT)在快速复制细菌Vibrio natriegens中的应用 | 识别了中性插入位点,展示了两个选择标记在此位点的交换,开发了消除诱导自然转化所需质粒的稳健方法,并展示了MuGENT在细菌中创建大规模删除的能力 | NA | 扩展MuGENT技术在Vibrio natriegens中的应用,提高其作为合成生物学模型生物的实用性 | Vibrio natriegens细菌 | 合成生物学 | NA | 多重基因组编辑自然转化技术(MuGENT) | NA | NA | NA |
563 | 2024-08-07 |
Splittable systems in biomedical applications
2024-Aug-06, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d4bm00709c
PMID:39012216
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综述 | 本文综述了可分割系统在生物医学应用中的设计原则、策略和应用 | 介绍了通过融合其他模式引入的几种结合对和正交分割片段,以开发更复杂和稳健的设计 | 文章提到了面临的挑战,如脱靶效应和过度激活,但未详细说明具体的解决方法 | 探讨可分割系统在生物医学领域的应用 | 可分割系统的设计和其在不同生物医学领域的应用 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
564 | 2024-08-07 |
Microbial valorization of kraft black liquor for production of platform chemicals, biofuels, and value-added products: A critical review
2024-Aug, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2024.121631
PMID:38986370
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综述 | 本文综述了利用微生物技术将纸浆和造纸工业产生的硫酸盐黑液转化为平台化学品、生物燃料和其他高价值产品的潜力 | 介绍了利用合成生物学工具和分子技术,包括omics方法,来增强硫酸盐黑液的微生物增值 | 讨论了与毒性、杂质、低生产率和下游处理相关的挑战 | 探讨如何通过微生物增值技术实现纸浆和造纸工业的可持续发展,并贡献于联合国可持续发展目标 | 硫酸盐黑液的微生物增值及其在纸浆和造纸工业中的应用 | NA | NA | 合成生物学工具,分子技术,omics方法 | NA | NA | NA |
565 | 2024-08-07 |
Biodiversity as a firewall to engineered microbiomes for restoration and conservation
2024-Jun, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.231526
PMID:39100153
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研究论文 | 本文通过数学模型模拟了合成生物学干预对生态系统的影响,探讨了其对生物多样性和生态网络的潜在影响。 | 本文首次通过数学模型展示了合成生物学干预如何通过抑制共享资源的衰减来增加生物多样性,并成功地将合成生物融入生态网络。 | 本文主要基于数学模型进行模拟,实际应用中的效果和影响可能有所不同。 | 探讨合成生物学在生态恢复和保护中的应用及其对生物多样性的影响。 | 生态系统中的生物多样性和合成生物学干预的效果。 | 生态学 | NA | 数学模型 | NA | NA | NA |
566 | 2024-08-06 |
Re-Engineering Fungal Nonribosomal Peptide Synthetases by Module Dissection and Duplicated Thiolation Domains
2024-Aug-12, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202406360
PMID:38822735
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研究论文 | 本文提出了一种新的真菌非核糖体肽合成酶的工程策略 | 通过模块分解和复制的硫化酶结构域实现了真菌NRPS的工程化与异源生产 | 未提及具体限制因素 | 研究非核糖体肽合成酶的工程化和异源生产 | 真菌非核糖体肽合成酶 | 合成生物学 | NA | 组合生物合成 | NA | NA | NA |
567 | 2024-08-05 |
Directed evolution of material-producing microorganisms
2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2403585121
PMID:39042685
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研究论文 | 本文利用高通量定向进化平台增强微生物的物质生产能力 | 提出了一种新的高通量平台,通过选择压力促进微生物的进化,揭示了细胞纤维素生产能力与基因的关联 | 缺乏对其他微生物或材料生产的研究,可能限制了成果的广泛应用 | 研究微生物材料生产的能力,寻找基因型-表型的联系 | 以产纤维素的微生物为模型进行研究 | 合成生物学 | NA | 高通量定向进化 | NA | 基因组序列 | 40,000个随机突变体 |
568 | 2024-08-05 |
The Role of SF1 and SF2 Helicases in Biotechnological Applications
2024-Aug-02, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-05027-w
PMID:39093351
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综述 | 本文总结了SF1和SF2解旋酶的结构、功能和机制,着重介绍了其在生物技术中的应用潜力 | 重点讨论了SF1解旋酶中特有的1B和2B结构域及其对酶活性的影响 | 对UvrD解旋酶的活性形式及解旋后解离的争论尚未得出明确结论 | 探讨SF1和SF2解旋酶在生物技术中的潜在应用 | 主要研究SF1和SF2解旋酶的结构和功能 | 生物技术 | 癌症 | ATP水解 | NA | NA | NA |
569 | 2024-08-05 |
Functional and structural characterization of an IclR family transcription factor for the development of dicarboxylic acid biosensors
2024-Aug, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.17149
PMID:38696354
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研究论文 | 本文对属于IclR转录因子家族的PcaR转录因子进行了功能和结构特征分析 | 本研究首次提供了PcaR在结合不同配体时的晶体结构,并展示了其在合成生物学应用中的潜力 | 本研究主要集中在单一的模特真核生物Saccharomyces cerevisiae中进行实验,可能无法完全代表其他系统 | 研究PcaR转录因子的功能和结构特性,以便为二羧酸生物传感器的开发提供指导 | PcaR转录因子及其与二羧酸的相互作用 | 合成生物学 | NA | 结晶学 | NA | 结构数据 | NA |
570 | 2024-08-05 |
Debottlenecking the L-DOPA 4,5-dioxygenase step with enhanced tyrosine supply boosts betalain production in Nicotiana benthamiana
2024-Jun-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae166
PMID:38498597
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研究论文 | 本研究探讨了增强L-酪氨酸供应对烟草中甜菜素产生的影响 | 本研究首次揭示了L-DOPA 4,5-二氧化酶在甜菜素生物合成中扮演的关键限速角色 | 在共表达甜菜素途径基因时,甜菜素水平意外下降,未能高效转换为甜菜素 | 研究植物中如何通过增强前体供应来提高甜菜素的生产 | 研究对象为烟草植物(Nicotiana benthamiana)及其甜菜素生产 | 合成生物学 | NA | 基因表达 | NA | 化学成分 | 使用了烟草植物的叶子进行实验 |
571 | 2024-08-05 |
Advances in the development of synthetic biology tools for the bioproduction of natural product analogues
2024-07-01, Postepy biochemii
DOI:10.18388/pb.2021_531
PMID:39083471
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研究论文 | 本文介绍了自然产物及其衍生物在多个行业的应用以及合成生物学工具的进展 | 强调了合成生物学工具在生物生产生物活性二次代谢物方面的进展 | NA | 探讨合成生物学工具在自然产物生物生产中的应用 | 自然产物及其生物活性二次代谢物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 化学化合物 | NA |
572 | 2024-08-05 |
Removal of the large inverted repeat from the plastid genome reveals gene dosage effects and leads to increased genome copy number
2024-06, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01709-9
PMID:38802561
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研究论文 | 本研究揭示了去除叶绿体基因组中的大型倒置重复对基因剂量效应的影响及其导致基因组拷贝数增加的机制 | 本研究首次系统性地证明了叶绿体中的倒置重复区可以增强翻译能力,并探讨了基因组大小与拷贝数之间的关系 | 本研究主要基于烟草的叶绿体基因组,可能限制了结果的普遍适用性 | 探讨叶绿体基因组中倒置重复区的功能重要性及其对基因剂量效应的影响 | 烟草的叶绿体基因组及其功能特性 | 数字病理 | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | 生成了具有显著减少叶绿体基因组大小的植物 |
573 | 2024-08-05 |
Engineering a Self-Assembled Protein Cage for Targeted Dual Functionalization
2024-Jul-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c01693
PMID:39017718
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研究论文 | 本研究介绍了一种工程化的自组装蛋白质笼,能够独立招募两种不同的蛋白质。 | 该研究通过SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag化学反应,成功实现了对单一蛋白质笼的多种蛋白质的定向功能化。 | 研究集中于特定类型的蛋白质,可能无法广泛应用于所有POI的功能化。 | 旨在开发一种灵活的蛋白质笼平台,以实现双重功能化。 | 采用荧光蛋白作为模型,探索对两种不同POI的次序控制。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 荧光蛋白 | NA |
574 | 2024-08-05 |
An Enzymatic Prodrug-like Route to Thio and Selenoamides
2024-07-29, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202404243
PMID:38747847
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研究论文 | 本文揭示了一种酶促的前药样途径,用于硫和硒酰胺的合成 | 首次系统阐明了6-硫鸟嘌呤的生物合成机制和相关酶的功能,并发现了前药样的硫结合物中间体 | 未充分探索硫转移机制中的所有潜在中间体 | 研究细菌中稀有硫酰胺的形成机制 | 关注Erwinia amylovorans产生的6-硫鸟嘌呤及其生物合成途径 | 合成生物学 | 肿瘤 | 酶促反应重组 | NA | 化学物质 | 使用多种底物进行反应,样本数量未详细说明 |
575 | 2024-08-05 |
Direct α-Hydroxy Acid Loading onto a Bacterial Thiotemplate Assembly Line via a Multienzyme Gateway
2024-07-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202405165
PMID:38728443
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研究论文 | 本研究揭示了将α-羟基酸直接加载到细菌非核糖体肽合成酶模块的过程 | 首次报告了细菌中将α-羟基酸直接加载到非核糖体肽合成酶模块的专门通道,拓展了合成生物学工具箱 | 部分研究步骤依赖于突变分析和酶活性测定,可能限制了结果的普遍性 | 研究α-羟基酸在细菌非核糖体肽合成中作为构建块的加载机制 | 焦链酸的加载过程及相关酶的功能 | 合成生物学 | NA | 生物信息学,代谢组学,生化分析 | NA | 生物化学数据 | NA |
576 | 2024-08-05 |
Leveraging DNA-Encoded Cell-Mimics for Environment-Adaptive Transmembrane Channel Release-Induced Cell Death
2024-07-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202406186
PMID:38738850
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研究论文 | 本文介绍了一种创新的DNA编码的人工T细胞模型,能够模拟T细胞的行为并诱导细胞死亡 | 提出了一种基于DNA的人工T细胞模仿物,能够在肿瘤微环境下响应酸性条件,并选择性释放嵌入脂质和胆固醇的DNA链 | NA | 研究环境适应性细胞死亡的机制 | DNA编码的人工T细胞模仿物(ARTC) | 生物医学工程 | 肿瘤 | DNA编码 | NA | NA | NA |
577 | 2024-08-05 |
Structural Insights Into the Terpene Cyclization Domains of Two Fungal Sesterterpene Synthases and Enzymatic Engineering for Sesterterpene Diversification
2024-06-03, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202405140
PMID:38584136
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研究论文 | 本文报道了两种真菌sesterterpene合酶的萜烯环化结构与酶工程研究 | 首次揭示了sesterterpene合酶的晶体结构及其催化机制,从而推动了sesterterpene的结构多样性扩展 | 对sesterterpene合酶的研究仍不够全面,进一步的结构-功能研究仍然必要 | 探讨sesterterpene合酶的结构与催化机制以推进结构多样性的工程 | 两种真菌的sesterterpene合酶NfSS和PbSS | 数字病理学 | NA | 晶体学,理论与实验相结合的研究方法 | NA | 结构数据,催化机制信息 | 两个酶合酶的结构样本 |
578 | 2024-08-05 |
Gene synthesis design: a pythonic approach
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17750
PMID:39076781
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研究论文 | 本文提出了一种Python程序用于设计基因合成的DNA片段 | 提供了一种新的算法,通过Python程序设计DNA片段,且源代码可供所有用户免费使用 | 尚未提及具体的限制条件 | 旨在开发一种实用的基因合成片段设计工具 | DNA片段的合成和设计 | 合成生物学 | NA | PCR组装 | NA | NA | 通过实验验证算法的可行性 |
579 | 2024-08-05 |
Advances in stress-tolerance elements for microbial cell factories
2024-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.06.008
PMID:39072145
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review | 本文回顾了微生物细胞工厂中的抗压元素进展 | 探讨了多种抗压元素的挖掘和重新设计策略,优化细胞工厂在极端条件下的表现 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 旨在优化微生物细胞工厂在不同极端条件下的性能 | 针对微生物特别是极端微生物的抗压元素 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
580 | 2024-08-07 |
Cyanamide-inducible expression of homing nuclease I- SceI for selectable marker removal and promoter characterisation in Saccharomyces cerevisiae
2024-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.06.009
PMID:39072146
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研究论文 | 本文介绍了一种基于氰胺诱导的I-SceI同源核酸酶表达的方法,用于可选择性标记去除和启动子特征化。 | 创新性地结合了氰胺诱导的I-SceI介导的双链DNA断裂与麦芽糖诱导的MazF负选择,实现了无质粒的启动子替换。 | 可能受到特定诱导剂的限制,且文中涉及的启动子特性需要更多的验证。 | 探索新的基因组工程工具,以促进合成生物学和代谢工程的应用。 | 对不同强度的四环素诱导启动子以及其他几种诱导启动子的特征进行了研究。 | 合成生物学 | NA | 基因工程工具 | NA | DNA | 三种四环素诱导启动子及多对双向启动子 |