合成生物学相关文章
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当前共找到 1126 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2024-09-14 |
Engineering oleaginous red yeasts as versatile chassis for the production of oleochemicals and valuable compounds: Current advances and perspectives
2024-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108432
PMID:39163921
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综述 | 本文综述了利用红酵母作为多功能底盘生产油脂化学品和其他有价值化合物的最新进展和未来方向 | 本文介绍了基因和代谢工程技术以及系统生物学分析在提高红酵母生产能力方面的进展，并探讨了利用红酵母作为生物制造平台在循环生物经济中的潜力 | NA | 探讨红酵母作为多功能生物制造平台在可持续化学品和燃料生产中的应用 | 红酵母及其在生产特种化学品如油脂化学品、有机酸、脂肪酸衍生物、萜类化合物和其他有价值化合物中的应用 | 生物工程 | NA | 基因工程、代谢工程、系统生物学分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 562 | 2024-09-14 |
Biotechnological advances in the production of unusual fatty acids in transgenic plants and recombinant microorganisms
2024-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108435
PMID:39214484
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综述 | 本文综述了转基因植物和重组微生物中不常见脂肪酸（UFAs）的生物技术进展 | 讨论了UFAs的生物合成、积累和异源生产方面的最新进展 | 转基因宿主中UFAs的含量通常远低于天然来源，且扩大UFAs种类生产的成功率较低 | 探讨提高工程化植物和微生物中UFAs含量的挑战和潜在策略 | 不常见脂肪酸（UFAs）及其在食品、饲料和油脂化工行业的应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 563 | 2024-09-14 |
The evolution of tropane alkaloids: Coca does it differently
2024-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2024.102606
PMID:39067083
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研究论文 | 本文探讨了托烷生物碱（TAs）在现代人类健康中的双重作用，并强调了理解其生物合成途径对于利用合成生物学进行药物生产的重要性 | 本文揭示了Erythroxylum coca中托烷生物碱合成的独特进化路径，与传统茄科植物中的合成途径存在显著差异 | 本文主要集中在Erythroxylum coca的托烷生物碱合成途径上，未涵盖其他植物的相关研究 | 研究托烷生物碱的生物合成途径，特别是Erythroxylum coca中的独特进化路径 | 托烷生物碱（TAs）及其在Erythroxylum coca中的生物合成途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 564 | 2024-09-14 |
How did plants evolve the prenylation of specialized phenolic metabolites by means of UbiA prenyltransferases?
2024-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2024.102601
PMID:38991464
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综述 | 本文综述了植物中UbiA类异戊二烯转移酶在特化酚类代谢物异戊二烯化过程中的酶学特征、分子进化及在合成生物学中的应用 | 本文首次系统综述了植物UbiA类异戊二烯转移酶在特化酚类代谢物异戊二烯化中的酶学特征和分子进化 | NA | 探讨植物如何通过UbiA类异戊二烯转移酶进化出特化酚类代谢物的异戊二烯化 | 植物UbiA类异戊二烯转移酶及其在特化酚类代谢物异戊二烯化中的作用 | 生物化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 565 | 2024-09-14 |
Biosynthesis of the triterpenoid withanolides in Withaniasomnifera
2024-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2024.102576
PMID:38878523
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研究论文 | 本文探讨了Ashwagandha（Withania somnifera）中三萜类化合物withanolides的生物合成途径 | 本文更新了关于withanolides形成和调控的研究进展，并强调了在W. somnifera中阐明withanolides生物合成的差距和方法 | NA | 理解withanolides的生物合成途径，以促进通过代谢工程或合成生物学方法提高withanolides的产量 | Ashwagandha（Withania somnifera）中的withanolides | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 566 | 2024-09-14 |
The multicellular compartmentation of plant specialized metabolism
2024-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2024.102616
PMID:39142253
|
研究论文 | 本文探讨了植物特化代谢中的多细胞区室化现象及其在生物合成途径中的作用 | 利用单细胞和空间多组学技术来解决植物特化代谢中多细胞区室化的未解问题 | 目前对植物特化代谢的多细胞区室化及其相关中间体转运蛋白的理解仍不完整 | 深入理解多细胞区室化机制，以改进通过代谢工程或合成生物学生产特化代谢物 | 植物特化代谢中的多细胞区室化现象及其相关中间体转运蛋白 | NA | NA | 单细胞和空间多组学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 567 | 2024-09-14 |
A precise and sustainable doxycycline-inducible cell line development platform for reliable mammalian cell engineering with gain-of-function mutations
2024-Sep-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.09.004
PMID:39242074
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9技术的Tet-On3G诱导性主细胞系开发平台，用于精确和可持续的哺乳动物细胞工程 | 开发了一种名为ROSE的新平台，通过CRISPR/Cas9介导的位点特异性整合，实现了基因表达的精确调控和长期稳定性 | NA | 建立一种精确和可持续的基因表达调控系统，用于哺乳动物细胞工程 | 哺乳动物细胞系 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 568 | 2024-09-14 |
Limiting the Broadcast Range of a Secreting Cell during Intercellular Signaling Using Protease-Mediated Degradation
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00042
PMID:38885472
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研究论文 | 研究如何通过蛋白酶介导的降解来限制分泌细胞在细胞间信号传递中的广播范围 | 提出了一种通过添加barrierpepsin来限制细胞在二维多细胞网络中α-因子信号响应范围的方法 | NA | 探索如何通过蛋白酶限制细胞间信号传递的广播范围，以实现更复杂的细胞网络功能 | 分泌细胞在细胞间信号传递中的广播范围 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 二维多细胞网络中的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 569 | 2024-09-14 |
Partial RNA design
2024-06-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae222
PMID:38940170
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研究论文 | 本文提出了一种新的RNA设计范式——部分RNA设计，通过分离设计空间和目标，实现了对RNA序列和结构约束的精确控制 | 提出了部分RNA设计这一新范式，解决了现有RNA设计方法在搜索空间定义上的局限性 | NA | 开发一种新的RNA设计方法，以实现对RNA序列和结构约束的精确控制 | RNA序列和结构 | 生物技术 | NA | RNA设计 | libLEARNA算法 | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 570 | 2024-09-14 |
RiboDiffusion: tertiary structure-based RNA inverse folding with generative diffusion models
2024-06-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae259
PMID:38940178
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研究论文 | 本文提出了一种基于生成扩散模型的RNA逆折叠方法RiboDiffusion，用于从3D结构生成RNA序列 | RiboDiffusion利用图神经网络和Transformer模型，能够从3D RNA骨架结构生成RNA序列，并在序列恢复和多样性之间进行权衡 | NA | 解决RNA逆折叠问题，即从给定的结构约束中找到功能性RNA序列 | RNA序列和其3D结构 | 生物信息学 | NA | 生成扩散模型 | 图神经网络、Transformer | RNA序列和3D结构 | 不同长度和类型的RNA | NA | NA | NA | NA |
| 571 | 2024-09-13 |
Microalgal metabolic engineering facilitates precision nutrition and dietary regulation
2024-Nov-15, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.175460
PMID:39137841
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综述 | 本文综述了利用系统代谢工程优化微藻以实现精准营养和可持续饮食的方法 | 创新性地应用系统代谢工程，通过多组学分析和先进的代谢工程策略（如ZFNs、TALENs和CRISPR/Cas系统）优化微藻，提高生物活性化合物的生产 | NA | 探讨微藻在精准营养和可持续饮食中的应用潜力 | 微藻及其代谢产物 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、多组学分析、CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 572 | 2024-09-13 |
Microbial biofilms as a platform for diverse biocatalytic applications
2024-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.131302
PMID:39173957
|
综述 | 本文综述了微生物生物膜在多种生物催化应用中的潜力，特别是人工工程生物膜的应用 | 本文填补了人工工程生物膜在生物催化系统中应用的空白，并探讨了生物膜工程的策略 | 本文主要集中在综述和理论探讨，缺乏具体实验数据和案例研究 | 探讨微生物生物膜在生物催化应用中的潜力，特别是人工工程生物膜的应用 | 微生物生物膜及其在生物催化系统中的应用 | NA | NA | 基因修饰、合成生物学方法、生物膜形成过程的靶向操作 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 573 | 2024-09-13 |
Challenges to rhizobial adaptability in a changing climate: Genetic engineering solutions for stress tolerance
2024-Nov, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127886
PMID:39232483
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综述 | 本文综述了根瘤菌在气候变化下的适应性挑战及其在农业中的重要性，并探讨了通过基因工程提高根瘤菌耐受性的最新方法 | 本文总结了当前关于根瘤菌耐受性相关基因和通路的知识，并介绍了最新的基因工程方法，如合成生物学，以提高根瘤菌对环境变化的适应性 | 根瘤菌耐受性的遗传基础仍然了解不足 | 探讨气候变化对根瘤菌-植物共生关系的影响，并提出通过基因工程提高根瘤菌适应性的方法 | 根瘤菌及其与豆科植物的共生关系 | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 574 | 2024-09-13 |
An expanded molecular and systems toolbox for imaging, mapping, and controlling local translation
2024-Oct, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2024.102523
PMID:39226865
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综述 | 本文综述了用于成像、映射和控制局部翻译的扩展分子和系统工具箱 | 本文介绍了用于可视化和映射生物分子组件及翻译过程的新技术，这些技术具有更好的空间和时间分辨率，且伪影更少 | NA | 探讨如何通过新技术更好地可视化和控制细胞内局部蛋白质翻译过程 | 细胞内局部蛋白质翻译过程及其相关生物分子组件 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 575 | 2024-09-13 |
PhysioFit: a software to quantify cell growth parameters and extracellular fluxes
2024-08-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae488
PMID:39073885
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研究论文 | 介绍了一种名为PhysioFit的开源软件，用于量化细胞生长参数和胞外通量 | PhysioFit可以与任何生长模型兼容，并且设计为可互操作，支持多种常见生长模型，并允许高级用户实现额外的模型 | NA | 开发一种能够量化生长参数和胞外通量的通用工具 | 细胞生长参数和胞外通量 | 生物信息学 | NA | Python编程 | NA | 时间序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 576 | 2024-09-13 |
Robustness and evolvability: Revisited, redefined and applied
2024-Aug-02, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105281
PMID:39098381
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研究论文 | 本文重新定义并应用了系统的鲁棒性和可进化性，提出了新的形式化定义和相应的度量方法，并使用进化算法在BNK模型系统中寻找不同类型的完美振荡器 | 本文提出了新的鲁棒性和可进化性的形式化定义和度量方法，比Wagner最初提出的度量方法更通用和更具代表性。此外，本文还提出了一种受NK系统启发的BNK数字建模方法，并应用于进化算法中 | NA | 重新定义和应用系统的鲁棒性和可进化性 | 系统的鲁棒性和可进化性，以及DNA合成噪声对DNA基生物传感器功能的影响和不同类型核酶的可进化性 | 合成生物学 | NA | 进化算法 | BNK模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 577 | 2024-09-11 |
Engineered transcription activator-like effector dimer proteins confer DNA loop-dependent gene repression comparable to Lac repressor
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae656
PMID:39077947
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研究论文 | 本文设计了基于目标序列可编程的转录激活因子样效应物二聚体（TALED）蛋白的抑制系统，并展示了其在DNA环依赖的细菌启动子抑制中的应用 | 本文首次展示了通过共价结合的TALED蛋白实现强效的DNA环依赖的细菌启动子抑制，并验证了DNA环结构显著增强启动子抑制效果 | 本文主要集中在E. coli中的实验验证，未来需进一步研究其在其他生物系统中的适用性 | 设计并验证一种新型的DNA环依赖的基因抑制系统，为合成生物学和治疗应用提供新工具 | 转录激活因子样效应物二聚体（TALED）蛋白及其在DNA环依赖的基因抑制中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA环结构分析 | NA | DNA序列 | E. coli菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 578 | 2024-09-11 |
Induction of bacterial expression at the mRNA level by light
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae678
PMID:39126322
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研究论文 | 本文利用光敏受体NmPAL在mRNA水平上诱导细菌表达，通过蓝光触发NmPAL结合破坏cis-抑制的mRNA状态，从而解除翻译起始的阻碍，上调基因表达 | 本文开发了一种名为riboptoregulator的光遗传学电路，能够在mRNA水平上进行基因表达调控，并能与现有基因调控电路结合，实现更精细和严格的基因表达控制 | NA | 开发一种在mRNA水平上进行光遗传学调控的新方法，以提高细菌基因表达的效率和精确性 | 细菌基因表达的调控机制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 579 | 2024-09-10 |
Advances in the Structures, Pharmacological Activities, and Biosynthesis of Plant Diterpenoids
2024-Aug-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02014
PMID:39081244
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综述 | 本文综述了植物二萜类化合物的结构、药理活性和生物合成途径 | 利用合成生物学将微生物工程化为“细胞工厂”以生产所需化合物 | NA | 探讨植物二萜类化合物的生物合成机制及其在微生物中的异源生产 | 植物二萜类化合物及其生物合成途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 580 | 2024-09-10 |
Hindered intermolecular stacking of anti-parallel telomeric G-quadruplexes
2024-Sep-14, The Journal of chemical physics
IF:3.1Q1
DOI:10.1063/5.0225371
PMID:39248241
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研究论文 | 研究了反平行端粒G四链体在自拥挤条件下的端到端堆叠行为 | 开发了一种高效的粗粒度拟合工具，成功描述了单体和二聚体G四链体的平衡混合物 | NA | 探讨G四链体拓扑结构对其相互作用的影响 | 反平行端粒G四链体的堆叠行为 | NA | NA | 小角X射线散射 | 粗粒度拟合工具 | G四链体结构数据 | 使用序列AG3(T2AG3)3形成的反平行端粒G四链体 | NA | NA | NA | NA |