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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-08-22 |
Therapeutic applications of synthetic gene/genetic circuits: a patent review
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1425529
PMID:39161351
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综述 | 本文综述了合成基因/遗传电路在治疗应用中的专利情况,展示了其在精确控制基因表达和细胞行为方面的潜力 | 合成基因电路能够定制精确控制治疗干预,实现个性化治疗,提高治疗效果并减少副作用 | 该技术面临商业盈利挑战,设计需针对特定应用调整,可能存在多重调控的毒性、同源重组、上下文依赖性、资源过度使用和环境变异性等缺点 | 探讨合成基因/遗传电路在治疗应用中的潜力和挑战 | 合成基因/遗传电路及其在治疗领域的应用 | 合成生物学 | NA | 合成基因/遗传电路 | NA | 专利 | 38项专利,15个最频繁的国际分类 | NA | NA | NA | NA |
| 602 | 2024-08-21 |
Production of pyrimidine nucleosides in microbial systems via metabolic engineering: Theoretical analysis research and prospects
2024-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108419
PMID:39053562
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研究论文 | 本研究探讨通过代谢工程和合成生物学策略在微生物系统中生产嘧啶核苷的方法 | 利用微生物发酵合成嘧啶核苷,提供了一种更可持续的生产替代方案 | 微生物生产嘧啶核苷的复杂且严格调控的生物合成途径是一个重大挑战 | 旨在通过代谢工程和合成生物学策略提高嘧啶核苷的生产效率 | 嘧啶核苷的生产 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 603 | 2024-08-21 |
Blue light-mediated gene expression as a promising strategy to reduce antibiotic resistance in Escherichia coli
2024-May, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400023
PMID:38719589
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研究论文 | 本文研究了利用蓝光调控基因表达系统来减少大肠杆菌对抗生素的耐药性 | 首次成功应用蓝光调控基因表达系统,有效降低了工程化大肠杆菌对氨苄西林和链霉素的耐药性 | NA | 开发新兴的非传统技术以应对抗生素耐药性的挑战 | 大肠杆菌的抗生素耐药性 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | 工程化大肠杆菌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 604 | 2024-08-21 |
Re-considering and designing microbiomes for future waste biorefinery
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14395
PMID:38206186
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评论 | 本文重新考虑并设计微生物组,以支持未来废物生物精炼厂的可持续发展需求 | 提出了'可持续合成微生物组'的概念,结合自下而上和自上而下的微生物组构建方法,以从低价值废物中提供人类所需产品 | 目前微生物组设计在处理复杂废物方面面临困境 | 探讨如何将科学原理与技术和工程相结合,以实现未来废物生物精炼厂的目标导向设计 | 微生物组的设计及其在废物生物精炼厂中的应用 | 环境工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 605 | 2024-08-21 |
Expanding the genetic programmability of Lactiplantibacillus plantarum
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14335
PMID:37638848
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综述 | 本文综述了增强和控制乳酸菌能力的方法,特别是通过工程化遗传模块和电路来提升Lactiplantibacillus plantarum的应用性。 | 提出了针对L. plantarum的遗传工具包的改进策略,包括实时调控基因表达和增强生物安全性的方法。 | 目前用于提升L. plantarum应用性的遗传工具包仍然不足。 | 探讨如何通过遗传工程增强乳酸菌的功能,特别是在食品工业和医疗保健领域的应用。 | 主要研究对象是Lactiplantibacillus plantarum,一种广泛用于合成生物学应用的微生物底盘。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 遗传数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 606 | 2024-08-21 |
Bacterial tolerance and detoxification of cyanide, arsenic and heavy metals: Holistic approaches applied to bioremediation of industrial complex wastes
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14399
PMID:38206076
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研究论文 | 本文总结了细菌减轻氰化物、砷和重金属影响的策略,并分析了这些有毒化学物质之间的相互作用 | 本文探讨了系统生物学和合成生物学在复杂工业废物和共污染场地生物修复策略开发中的作用,并强调了元基因组学研究的重要性和进展 | 本文主要集中在微生物对每种环境危害的单独响应的表征上,对共污染废物对微生物代谢的影响讨论较少 | 开发针对工业复杂废物生物修复的策略 | 氰化物、砷和重金属的代谢过程及其对微生物的影响 | 环境科学 | NA | 系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 607 | 2024-08-20 |
Screening of broad-host expression promoters for shuttle expression vectors in non-conventional yeasts and bacteria
2024-Aug-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02506-x
PMID:39152436
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研究论文 | 本研究选择了五种Yarrowia lipolytica和五种Kluyveromyces marxianus的组成型启动子,构建了启动子-报告载体,并在多种微生物宿主中系统地表征了这些启动子的强度 | 发现五种K. marxianus启动子能在Y. lipolytica中表达基因,五种Y. lipolytica启动子也能在K. marxianus中表达基因,且yl.TEF1和km.TEF1启动子在多种微生物宿主中表现出适应性 | NA | 开发具有广泛宿主适用性的非传统酵母启动子,以增强目标生物产品的合成 | Yarrowia lipolytica和Kluyveromyces marxianus的组成型启动子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达 | 涉及Y. lipolytica、K. marxianus、Pichia pastoris、Escherichia coli和Corynebacterium glutamicum等多种微生物宿主 | NA | NA | NA | NA |
| 608 | 2024-08-17 |
Synthetic microbial communities: A gateway to understanding resistance, resilience, and functionality in spontaneously fermented food microbiomes
2024-Sep, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2024.114780
PMID:39147468
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综述 | 本文综述了自发发酵食品微生物群落的复杂特性,这些特性有助于抵抗性、恢复力和功能性驱动因素 | 合成微生物群落(SMCs)作为机制洞察和微生物群落战略性重编程的门户,为发酵食品微生物群落提供了细致的理解和控制 | 在实现SMCs的稳定性和可重复性方面存在挑战,主要源于非标准化方法 | 探讨合成微生物群落在自发发酵食品微生物群落中的应用及其优化食品加工的潜力 | 自发发酵食品的微生物群落及其在食品加工中的应用 | 微生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 微生物群落数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 609 | 2024-08-17 |
Identification of the cytochrome P450s responsible for the biosynthesis of two types of aporphine alkaloids and their de novo biosynthesis in yeast
2024-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13724
PMID:38953746
|
研究论文 | 本研究识别了两种细胞色素P450酶(CYP80G6和CYP80Q5),它们分别作用于(S)-配置和(R)-配置的底物,揭示了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征。此外,还鉴定了两种CYP719C酶(CYP719C3和CYP719C4),它们催化形成甲基二氧桥,这是阿朴啡生物碱中的关键药效团。利用这些关键酶的功能特性,我们在酵母中重建了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成途径,实现了如(R)-glaziovine、(S)-glaziovine和magnoflorine等化合物的从头合成。 | 本研究首次识别了特定细胞色素P450酶在阿朴啡生物碱生物合成中的作用,并成功在酵母中重建了这些生物碱的生物合成途径,为通过合成生物学生产这些有价值的化合物奠定了基础。 | NA | 揭示阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征,并在酵母中实现这些生物碱的从头合成。 | 阿朴啡生物碱的生物合成途径和相关酶的功能特性。 | NA | NA | 细胞色素P450酶的功能鉴定 | NA | 酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2024-08-17 |
Editorial: Plant chassis for synthetic biology and its application in biomanufacturing
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1460378
PMID:39148620
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 611 | 2024-08-15 |
Expanding the synthetic biology repertoire of a fast-growing cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 11801
2024-Sep, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28740
PMID:38773863
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研究论文 | 研究通过全局转录组分析,鉴定了Synechococcus elongatus PCC 11801中的48个高转录数基因的天然启动子,并利用荧光报告系统对其进行了特性分析。同时,通过基因组数据和蛋白质组分析,识别了534个操纵子,并系统地鉴定了15个表现出下游基因高蛋白表达的基因间区域,用于识别核糖体结合位点(RBSs)。 | 本研究扩展了Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱,包括启动子元件和核糖体结合位点,为加速PCC 11801的生物工程提供了多样化的启动子和RBS序列库。 | NA | 扩展Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱,以促进其作为潜在细胞工厂的应用。 | Synechococcus elongatus PCC 11801的天然启动子和核糖体结合位点。 | 合成生物学 | NA | 全局转录组分析,荧光报告系统 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据 | 48个天然启动子,534个操纵子,15个基因间区域 | NA | NA | NA | NA |
| 612 | 2024-08-15 |
Transcriptional upregulation of the myo-inositol biosynthesis pathway is enhanced by NFAT5 in hyperosmotically stressed tilapia cells
2024-Sep-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00187.2024
PMID:38946247
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研究论文 | 本文研究了莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下肌醇生物合成途径的上调,并探讨了NFAT5在此过程中的作用 | 首次证明了NFAT5作为罗非鱼转录因子,参与高渗应激下肌醇生物合成途径的激活 | 除了NFAT5外,还需要其他强渗透应激信号机制来完全激活罗非鱼基因 | 探讨NFAT5在罗非鱼细胞高渗应激下肌醇生物合成途径中的作用 | 莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下的生理调整 | NA | NA | NA | NA | mRNA | 使用OmB细胞系进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 613 | 2024-08-15 |
Engineered Bacteria for Visualization and Localization of Gastrointestinal Bleeding: A Promising Application
2024-Aug-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01699
PMID:39141424
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研究论文 | 本文开发了一种利用合成生物技术智能工程化的细菌,用于体内定位检测胃肠道出血 | 通过构建三个基因电路模块,实现了对血红素的特异性感应和实时光学信号的体内生成,克服了现有诊断方法的局限 | NA | 提高胃肠道出血的诊断准确性和治疗效果 | 胃肠道出血,特别是隐匿性胃肠道出血 | 合成生物学 | 胃肠道疾病 | 合成生物技术 | 基因电路模块 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 614 | 2024-08-14 |
Advances in functional studies of plant MYC transcription factors
2024-Aug-05, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-024-04697-8
PMID:39103657
|
综述 | 本文综述了植物MYC转录因子在调控多种生理过程中的功能研究进展 | 通过基因克隆和利用全基因组'omics'及蛋白质-蛋白质相互作用技术,深入理解了MYC的多方面调控功能 | NA | 探讨MYC作为分子开关在调控植物激素和光敏色素介导的信号转导途径中的作用 | 植物MYC转录因子及其在植物生长、发育、逆境适应和次生代谢中的作用 | NA | NA | 全基因组'omics'技术,蛋白质-蛋白质相互作用技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 615 | 2024-08-07 |
Editorial overview: Systems and synthetic biology of microbial cells and communities
2024-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2024.102517
PMID:39029444
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 616 | 2024-08-14 |
Biofunctional coacervate-based artificial protocells with membrane-like and cytoplasm-like structures for the treatment of persistent hyperuricemia
2024-01, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2023.11.030
PMID:37992873
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研究论文 | 本文研究了基于生物功能化凝聚层滴的人工原细胞,用于治疗持续性高尿酸血症 | 开发了具有生理稳定性的聚赖氨酸-多核苷酸复合凝聚层滴,并通过PEG化磷脂膜改善其生物相容性,形成具有膜样和细胞质样结构的人工原细胞 | NA | 研究人工原细胞在治疗持续性高尿酸血症中的应用 | 人工原细胞的制备及其在降尿酸和预防肾脏损伤中的效果 | 生物技术 | 高尿酸血症 | 凝聚层滴技术 | NA | 生物分子 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 617 | 2024-08-14 |
Towards a Yersinia pestis lipid A recreated in an Escherichia coli scaffold genome
2024, Access microbiology
DOI:10.1099/acmi.0.000723.v3
PMID:39130741
|
研究论文 | 本文利用CRISPR/Cas9重组技术将脂多糖A生物合成基因插入到表达脂多糖IV亚单位的菌株基因组中 | 成功插入三个基因并通过RT-PCR验证其表达,但通过MALDI-TOF质谱分析发现脂多糖A结构未在背景中重现 | 尽管基因表达,但脂多糖A结构未能在背景中重现 | 探索在Escherichia coli基因组中重现Yersinia pestis脂多糖A的可能性 | 脂多糖A生物合成基因及其在Escherichia coli中的表达 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9重组技术,MALDI-TOF质谱分析 | NA | 基因组 | 一个菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 618 | 2024-08-13 |
AFP: Finding pathways accounting for stoichiometry along with atom group tracking in metabolic network
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.004
PMID:39009230
|
研究论文 | 本文提出了一种名为AFP的新方法,通过将原子组追踪融入反应化学计量学,利用混合整数线性规划(MILP)来寻找代谢途径 | AFP方法结合了原子组追踪与反应化学计量学,构建MILP模型以搜索包含原子组交换的反应途径,并能从任意或给定的化合物搜索到目标化合物 | NA | 旨在自动发现合成生物学和代谢工程中代谢途径的初始设计中的新途径 | 代谢途径的自动发现方法 | 代谢工程 | NA | 混合整数线性规划(MILP) | MILP模型 | 代谢途径数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 619 | 2024-08-13 |
A new synthetic biology system for investigating the biosynthesis of antibiotics and other secondary metabolites in streptomycetes
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.007
PMID:39004405
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研究论文 | 本文介绍了一种新的合成生物学表达系统,用于研究链霉菌中抗生素和其他次级代谢产物的生物合成 | 该系统允许将生物合成基因簇(BGCs)重构为单顺反子转录单元,并基于含有强kasOp*启动子、RBS和终止子的质粒 | NA | 开发一种新的合成生物学系统,用于研究链霉菌中次级代谢产物的生物合成 | 链霉菌中的生物合成基因簇(BGCs) | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 基因序列 | 涉及两种已知的生物合成基因簇,用于芳香聚酮类抗生素landomycin和mithramycin的合成 | NA | NA | NA | NA |
| 620 | 2024-08-13 |
Enhancing Withanolide Production in the Withania Species: Advances in In Vitro Culture and Synthetic Biology Approaches
2024-Aug-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13152171
PMID:39124289
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研究论文 | 本文探讨了通过体外培养技术和合成生物学方法提高茄科植物中甾体内酯类化合物生产的最新进展 | 利用合成生物学和机器学习技术,通过异源系统和代谢工程改造甾体内酯的生物合成途径 | 甾体内酯的生物合成途径复杂,是提高生产的主要障碍 | 提高甾体内酯的生产以满足现代医学的需求 | 茄科植物中的甾体内酯类化合物 | 合成生物学 | NA | CRISPR | 机器学习 | 生物过程数据 | NA | NA | NA | NA | NA |