合成生物学相关文章
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当前共找到 1126 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-08-26 |
Design of a self-regulating mRNA gene circuit
2024-08-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-70363-0
PMID:39169208
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研究论文 | 本文设计了一种基于噬菌体MS2的自我调节mRNA基因电路，通过计算工具模拟核糖体动力学和mRNA共翻译折叠，优化了下游基因的翻译和抑制效率 | 提出了一种新的自我调节mRNA设计方法，可用于疫苗和其他合成生物学应用，实现细胞内蛋白质水平的精确控制 | NA | 探索设计自我调节mRNA基因电路的可能性，以实现细胞内蛋白质合成的自我调节 | 自我调节mRNA的设计及其在蛋白质表达控制中的应用 | 合成生物学 | NA | 计算模拟 | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 602 | 2024-08-24 |
[Biomanufacturing of propionic acid]
2024-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240097
PMID:39174476
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综述 | 本文综述了丙酸的生物制造过程，包括代谢工程和途径重构在异源宿主中的研究，以及通过合成生物学设计改良途径从L-苏氨酸或生物基1,2-丙二醇合成高纯度丙酸的最新进展 | 利用微生物转化可再生资源生产丙酸，减少环境污染并提高可持续性 | NA | 探讨丙酸的生物制造方法及其在食品、医药和化工领域的应用 | 丙酸的生物制造过程及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 603 | 2024-08-24 |
[Construction of microbial cell factories for synthesizing value-added chemicals with xylose]
2024-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240161
PMID:39174477
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研究论文 | 本文介绍了利用木糖合成高价值化学品的微生物细胞工厂的构建策略 | 深入理解微生物代谢机制和合成生物学的进步提高了微生物代谢木糖的效率并扩展了木糖衍生产品的范围 | 木糖的代谢效率低于葡萄糖，限制了其在大多数微生物中的应用 | 实现对木质纤维素的全利用，构建能高效代谢木糖的微生物细胞工厂 | 木质纤维素中的木糖 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 604 | 2024-08-24 |
The art of designed coiled-coils for the regulation of mammalian cells
2024-Aug-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.06.001
PMID:38971158
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综述 | 本文综述了卷曲螺旋（CC）二聚体形成模块在哺乳动物细胞调控中的应用及其设计规则 | 卷曲螺旋模块提供了高度特异性和正交的蛋白质-蛋白质相互作用，设计规则使其能够精确控制和调节这些相互作用 | NA | 探讨卷曲螺旋在哺乳动物细胞中的多样化应用及其在推进细胞过程理解和调控中的作用 | 卷曲螺旋模块在哺乳动物细胞中的应用，包括合成生物电路设计、转录和变构调控、细胞组装、嵌合抗原受体（CAR）T细胞调控和基因组编辑 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 605 | 2024-08-24 |
Design, modeling and in silico simulation of bacterial biosensors for detecting heavy metals in irrigation water for precision agriculture
2024-Aug-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e35050
PMID:39170417
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研究论文 | 本文提出了一种新的工作流程，用于设计、建模和模拟可重编程微生物，作为检测灌溉水中重金属的生物传感器 | 该工作流程基于合成生物学的两种技术：合成遗传电路设计和合成工程，允许使用软件和硬件开发理论模型，预测复杂生物系统的行为 | NA | 设计新型生物设备以替代目前用于精准农业中检测灌溉水重金属的传感器 | 设计、建模和模拟用于检测灌溉水中重金属（砷、汞和铅）的微生物生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路设计、合成工程 | NA | 基因组数据（SBOL、GenBank和FASTA格式） | 三种全细胞重金属生物传感器 | NA | NA | NA | NA |
| 606 | 2024-08-24 |
Biophysical characterization of synthetic adhesins for predicting and tuning engineered living material properties
2024-Jun-05, Matter
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.matt.2024.03.019
PMID:39165662
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研究论文 | 本文通过多种生物物理方法对细菌合成粘附工具箱进行了定量表征 | 本文展示了通过关键参数对工程活体材料（ELM）宏观性质（拉伸强度）的预测和定量调节 | 合成粘附蛋白的表征和控制仍有待进一步发展 | 研究细菌合成多细胞系统的粘附特性，以优化工程活体材料的应用 | 细菌合成粘附工具箱及其在工程活体材料中的应用 | 生物工程 | NA | 生物物理方法 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 607 | 2024-08-23 |
Construction of a high-efficiency GjCCD4a mutant and its application for de novo biosynthesis of five crocins in Escherichia coli
2024-Oct, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.133985
PMID:39033887
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研究论文 | 本文通过突变构建了一个高效GjCCD4a突变体（N212m），并将其应用于大肠杆菌中五种藏红素的从头生物合成 | 构建的N212m突变体催化效率比野生型高25.08倍，实现了在大肠杆菌中五种藏红素的从头生物合成 | NA | 研究藏红素的生物合成，以降低成本并促进其应用 | 藏红素及其在大肠杆菌中的生物合成 | 合成生物学 | NA | 突变技术 | NA | NA | 大肠杆菌E57和E579菌株用于藏红素的合成 | NA | NA | NA | NA |
| 608 | 2024-08-23 |
Deciphering GB1's Single Mutational Landscape: Insights from MuMi Analysis
2024-Aug-22, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c04916
PMID:39115184
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研究论文 | 本研究通过计算机模拟突变扫描和分子动力学模拟，探讨了GB1与IgG-Fc结合的分子基础 | 本研究展示了MuMi作为一种可靠且计算高效的工具，用于预测蛋白质适应性景观，相较于传统方法具有显著优势 | NA | 研究GB1与IgG-Fc结合的分子机制，并评估MuMi在预测蛋白质适应性景观中的应用 | GB1蛋白与IgG-Fc的结合 | 生物信息学 | NA | 深度突变扫描（DMS），分子动力学（MD） | NA | 蛋白质结构 | 所有可能的单突变 | NA | NA | NA | NA |
| 609 | 2024-08-22 |
Single-round QuikChange PCR for engineering multiple site-directed mutations in plasmid DNA
2024-Nov, Analytical biochemistry
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.ab.2024.115621
PMID:39019205
|
研究论文 | 本研究开发了一种简单且节省时间的方法，通过使用质粒作为模板和兼容的寡核苷酸引物，按照QuikChange策略，在一次聚合酶链反应中引入多个核苷酸插入、删除和替换 | 该方法能够在一次聚合酶链反应中实现多个位点的突变，提高了基因工程的效率 | 通常需要筛选5个克隆才能找到所有期望突变的成功克隆 | 开发一种新的突变研究方法，以促进蛋白质生物化学、正向遗传学和合成生物学的研究 | 质粒DNA中的多个位点定向突变 | 生物化学 | NA | 聚合酶链反应 | NA | DNA | 通常筛选5个克隆 | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2024-08-22 |
Therapeutic applications of synthetic gene/genetic circuits: a patent review
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1425529
PMID:39161351
|
综述 | 本文综述了合成基因/遗传电路在治疗应用中的专利情况，展示了其在精确控制基因表达和细胞行为方面的潜力 | 合成基因电路能够定制精确控制治疗干预，实现个性化治疗，提高治疗效果并减少副作用 | 该技术面临商业盈利挑战，设计需针对特定应用调整，可能存在多重调控的毒性、同源重组、上下文依赖性、资源过度使用和环境变异性等缺点 | 探讨合成基因/遗传电路在治疗应用中的潜力和挑战 | 合成基因/遗传电路及其在治疗领域的应用 | 合成生物学 | NA | 合成基因/遗传电路 | NA | 专利 | 38项专利，15个最频繁的国际分类 | NA | NA | NA | NA |
| 611 | 2024-08-21 |
Production of pyrimidine nucleosides in microbial systems via metabolic engineering: Theoretical analysis research and prospects
2024-Oct, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108419
PMID:39053562
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研究论文 | 本研究探讨通过代谢工程和合成生物学策略在微生物系统中生产嘧啶核苷的方法 | 利用微生物发酵合成嘧啶核苷，提供了一种更可持续的生产替代方案 | 微生物生产嘧啶核苷的复杂且严格调控的生物合成途径是一个重大挑战 | 旨在通过代谢工程和合成生物学策略提高嘧啶核苷的生产效率 | 嘧啶核苷的生产 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 612 | 2024-08-21 |
Blue light-mediated gene expression as a promising strategy to reduce antibiotic resistance in Escherichia coli
2024-May, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400023
PMID:38719589
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研究论文 | 本文研究了利用蓝光调控基因表达系统来减少大肠杆菌对抗生素的耐药性 | 首次成功应用蓝光调控基因表达系统，有效降低了工程化大肠杆菌对氨苄西林和链霉素的耐药性 | NA | 开发新兴的非传统技术以应对抗生素耐药性的挑战 | 大肠杆菌的抗生素耐药性 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | 工程化大肠杆菌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 613 | 2024-08-21 |
Re-considering and designing microbiomes for future waste biorefinery
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14395
PMID:38206186
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评论 | 本文重新考虑并设计微生物组，以支持未来废物生物精炼厂的可持续发展需求 | 提出了'可持续合成微生物组'的概念，结合自下而上和自上而下的微生物组构建方法，以从低价值废物中提供人类所需产品 | 目前微生物组设计在处理复杂废物方面面临困境 | 探讨如何将科学原理与技术和工程相结合，以实现未来废物生物精炼厂的目标导向设计 | 微生物组的设计及其在废物生物精炼厂中的应用 | 环境工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 614 | 2024-08-21 |
Expanding the genetic programmability of Lactiplantibacillus plantarum
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14335
PMID:37638848
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综述 | 本文综述了增强和控制乳酸菌能力的方法，特别是通过工程化遗传模块和电路来提升Lactiplantibacillus plantarum的应用性。 | 提出了针对L. plantarum的遗传工具包的改进策略，包括实时调控基因表达和增强生物安全性的方法。 | 目前用于提升L. plantarum应用性的遗传工具包仍然不足。 | 探讨如何通过遗传工程增强乳酸菌的功能，特别是在食品工业和医疗保健领域的应用。 | 主要研究对象是Lactiplantibacillus plantarum，一种广泛用于合成生物学应用的微生物底盘。 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | 遗传数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 615 | 2024-08-21 |
Bacterial tolerance and detoxification of cyanide, arsenic and heavy metals: Holistic approaches applied to bioremediation of industrial complex wastes
2024-01, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14399
PMID:38206076
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研究论文 | 本文总结了细菌减轻氰化物、砷和重金属影响的策略，并分析了这些有毒化学物质之间的相互作用 | 本文探讨了系统生物学和合成生物学在复杂工业废物和共污染场地生物修复策略开发中的作用，并强调了元基因组学研究的重要性和进展 | 本文主要集中在微生物对每种环境危害的单独响应的表征上，对共污染废物对微生物代谢的影响讨论较少 | 开发针对工业复杂废物生物修复的策略 | 氰化物、砷和重金属的代谢过程及其对微生物的影响 | 环境科学 | NA | 系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 616 | 2024-08-20 |
Screening of broad-host expression promoters for shuttle expression vectors in non-conventional yeasts and bacteria
2024-Aug-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02506-x
PMID:39152436
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研究论文 | 本研究选择了五种Yarrowia lipolytica和五种Kluyveromyces marxianus的组成型启动子，构建了启动子-报告载体，并在多种微生物宿主中系统地表征了这些启动子的强度 | 发现五种K. marxianus启动子能在Y. lipolytica中表达基因，五种Y. lipolytica启动子也能在K. marxianus中表达基因，且yl.TEF1和km.TEF1启动子在多种微生物宿主中表现出适应性 | NA | 开发具有广泛宿主适用性的非传统酵母启动子，以增强目标生物产品的合成 | Yarrowia lipolytica和Kluyveromyces marxianus的组成型启动子 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达 | 涉及Y. lipolytica、K. marxianus、Pichia pastoris、Escherichia coli和Corynebacterium glutamicum等多种微生物宿主 | NA | NA | NA | NA |
| 617 | 2024-08-17 |
Synthetic microbial communities: A gateway to understanding resistance, resilience, and functionality in spontaneously fermented food microbiomes
2024-Sep, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2024.114780
PMID:39147468
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综述 | 本文综述了自发发酵食品微生物群落的复杂特性，这些特性有助于抵抗性、恢复力和功能性驱动因素 | 合成微生物群落（SMCs）作为机制洞察和微生物群落战略性重编程的门户，为发酵食品微生物群落提供了细致的理解和控制 | 在实现SMCs的稳定性和可重复性方面存在挑战，主要源于非标准化方法 | 探讨合成微生物群落在自发发酵食品微生物群落中的应用及其优化食品加工的潜力 | 自发发酵食品的微生物群落及其在食品加工中的应用 | 微生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 微生物群落数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 618 | 2024-08-17 |
Identification of the cytochrome P450s responsible for the biosynthesis of two types of aporphine alkaloids and their de novo biosynthesis in yeast
2024-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13724
PMID:38953746
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研究论文 | 本研究识别了两种细胞色素P450酶（CYP80G6和CYP80Q5），它们分别作用于(S)-配置和(R)-配置的底物，揭示了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征。此外，还鉴定了两种CYP719C酶（CYP719C3和CYP719C4），它们催化形成甲基二氧桥，这是阿朴啡生物碱中的关键药效团。利用这些关键酶的功能特性，我们在酵母中重建了两种类型阿朴啡生物碱的生物合成途径，实现了如(R)-glaziovine、(S)-glaziovine和magnoflorine等化合物的从头合成。 | 本研究首次识别了特定细胞色素P450酶在阿朴啡生物碱生物合成中的作用，并成功在酵母中重建了这些生物碱的生物合成途径，为通过合成生物学生产这些有价值的化合物奠定了基础。 | NA | 揭示阿朴啡生物碱的生物合成机制和立体化学特征，并在酵母中实现这些生物碱的从头合成。 | 阿朴啡生物碱的生物合成途径和相关酶的功能特性。 | NA | NA | 细胞色素P450酶的功能鉴定 | NA | 酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 619 | 2024-08-17 |
Editorial: Plant chassis for synthetic biology and its application in biomanufacturing
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1460378
PMID:39148620
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 620 | 2024-08-15 |
Expanding the synthetic biology repertoire of a fast-growing cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 11801
2024-Sep, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28740
PMID:38773863
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研究论文 | 研究通过全局转录组分析，鉴定了Synechococcus elongatus PCC 11801中的48个高转录数基因的天然启动子，并利用荧光报告系统对其进行了特性分析。同时，通过基因组数据和蛋白质组分析，识别了534个操纵子，并系统地鉴定了15个表现出下游基因高蛋白表达的基因间区域，用于识别核糖体结合位点（RBSs）。 | 本研究扩展了Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱，包括启动子元件和核糖体结合位点，为加速PCC 11801的生物工程提供了多样化的启动子和RBS序列库。 | NA | 扩展Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱，以促进其作为潜在细胞工厂的应用。 | Synechococcus elongatus PCC 11801的天然启动子和核糖体结合位点。 | 合成生物学 | NA | 全局转录组分析，荧光报告系统 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 48个天然启动子，534个操纵子，15个基因间区域 | NA | NA | NA | NA |