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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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621 | 2024-08-07 |
Bacillus methanolicus: an emerging chassis for low-carbon biomanufacturing
2024-Jul-19, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.06.013
PMID:39033040
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研究论文 | 本文探讨了利用Bacillus methanolicus作为低碳生物制造平台的可能性 | 介绍了通过合成生物学方法如代谢建模和基因组编辑来重新编程B. methanolicus以提高其工业化效率 | 目前B. methanolicus的效率仍需提高以适应工业化需求 | 研究如何通过合成生物学方法提高B. methanolicus在低碳生物制造中的效率 | Bacillus methanolicus及其在生物制造中的应用 | NA | NA | 代谢建模和基因组编辑 | NA | NA | NA |
622 | 2024-08-07 |
Engineering bionanoreactor in bacteria for efficient hydrogen production
2024-Jul-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404958121
PMID:38985767
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研究论文 | 本研究开发了一种结合纳米材料工程和合成生物学的方法,构建了一种细菌生物纳米反应器系统,用于高效产氢 | 通过在电活性细菌MR-1的周质空间中构建生物纳米反应器,增强了电子和质子之间的相互作用,优化了电子传递和质子运输,显著提高了氢气生产效率 | NA | 开发一种高效的生物纳米反应器系统,用于通过水分解生产氢气,实现可再生和可持续的清洁能源 | 电活性细菌MR-1的周质空间 | 纳米材料 | NA | 纳米材料工程,合成生物学 | NA | NA | NA |
623 | 2024-08-07 |
Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening
2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.30.587094
PMID:38617214
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研究论文 | 本文通过高通量声学筛选技术,对声学报告基因进行定向进化,以增强其在非侵入性生物成像中的应用 | 开发了一种新的高通量、半自动声学筛选方法,用于筛选突变库,以增强非线性超声散射 | NA | 通过定向进化提高声学报告基因的非线性超声散射能力 | 声学报告基因及其在生物成像中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量声学筛选 | NA | 声学信号 | 两轮进化实验,涉及两种同源GV结构蛋白的扫描位点饱和库 |
624 | 2024-08-07 |
Living Synthelectronics: A New Era for Bioelectronics Powered by Synthetic Biology
2024-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202400110
PMID:38494761
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观点 | 本文综述了生物电子学领域中利用合成生物学改造的活细胞和病毒作为核心组件的新型混合电子设备——“活体合成电子学”的最新进展 | 引入合成生物学改造的活细胞和病毒作为生物电子设备的核心组件,增强了与人体组织在信息和物质交换层面的界面潜力 | 提出了活体合成电子学面临的挑战 | 探讨活体合成电子学如何促进生物电子学与人体组织的真正整合 | 活体合成电子学设备的设计和制造策略 | 生物电子学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
625 | 2024-08-07 |
Advances in block copolymer-phospholipid hybrid vesicles: from physical-chemical properties to applications
2024-Jul-17, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc01444h
PMID:39027291
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综述 | 本文综述了由脂质和两亲性嵌段共聚物制成的混合囊泡的设计及其物理化学性质,并探讨了其在合成生物学中的应用 | 混合囊泡因其多样的性质,能够构建模拟细胞结构的复杂膜,而受到越来越多的关注 | NA | 旨在提供设计指南,特别是关于组成,以实现这些混合囊泡的预期应用 | 混合囊泡的设计及其物理化学性质 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
626 | 2024-08-07 |
Genetically encoded Boolean logic operators to sense and integrate phenylpropanoid metabolite levels in plants
2024-Jul, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19823
PMID:38752334
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研究论文 | 本文利用细菌的别构转录因子(aTFs)在植物中精确调控代谢途径,设计了能够执行布尔逻辑运算的合成遗传电路,并展示了这些电路在检测和整合植物中苯丙烷类代谢物水平的能力。 | 首次在植物中实现基于苯丙烷类代谢物的布尔逻辑运算,展示了植物作为合成生物学平台的潜力。 | NA | 开发在植物中精确操控代谢途径的工具,促进生物产品的生产。 | 细菌别构转录因子及其在植物中的应用,以及基于这些因子的合成遗传电路。 | 合成生物学 | NA | 别构转录因子(aTFs) | NA | 代谢物 | 三种aTFs(CouR, FapR, TtgR)在植物中的应用 |
627 | 2024-08-07 |
Expression of microbial lipase in filamentous fungus Aspergillus niger: a review
2024-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-024-03998-5
PMID:38841267
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综述 | 本文综述了微生物脂酶在丝状真菌黑曲霉中的表达,并讨论了相关技术和策略。 | 介绍了合成生物学和系统生物学的发展如何为理解细胞工厂的高效运作机制以及创建和优化高效细胞工厂提供了新的技术体系。 | NA | 旨在提高脂酶在黑曲霉中的表达效率。 | 微生物脂酶酶源及其一般性质,以及影响脂酶表达的生物技术和因素。 | 生物技术 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
628 | 2024-08-07 |
Microbial Nanotechnology for Precision Nanobiosynthesis: Innovations, Current Opportunities and Future Perspectives for Industrial Sustainability
2024-Jul-01, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-03772-z
PMID:38954017
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综述 | 本文综述了微生物纳米技术在精准纳米生物合成中的应用,重点讨论了微生物合成的纳米颗粒及其在农业和植物科学中的应用 | 本文介绍了利用微生物进行纳米颗粒的绿色生产方法,并探讨了其在多个前沿技术领域的潜力 | NA | 探讨微生物纳米技术在工业可持续发展中的创新、当前机遇和未来展望 | 微生物合成的纳米颗粒及其在农业和植物科学中的应用 | 生物技术 | NA | 微生物纳米技术 | NA | NA | NA |
629 | 2024-08-07 |
Unlocking the formate utilization of wild-type Yarrowia lipolytica through adaptive laboratory evolution
2024-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400290
PMID:38900053
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研究论文 | 本研究通过使用碱基编辑工具促进适应性进化,成功提高了Yarrowia lipolytica对甲酸盐的耐受性和利用能力 | 本研究揭示了Yarrowia lipolytica中自然存在的甲酸盐代谢途径,并展示了其通过适应性进化增强甲酸盐利用的潜力 | NA | 探索和优化Yarrowia lipolytica对甲酸盐的利用,以促进全球净负碳经济的发展 | Yarrowia lipolytica的甲酸盐耐受性和利用能力 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | 转录组数据 | 两个突变株M25-70和M25-14 |
630 | 2024-08-07 |
Design and Characterization of a Generalist Biosensor for Indole Derivatives
2024-Jul-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00736
PMID:38875315
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研究论文 | 本文设计并表征了一种基于IclR家族抑制因子TtgV的吲哚衍生物生物传感器 | 发现了TtgV的新型生理相关配体,如粪臭素,并展示了其广泛的特异性,为定向进化和蛋白质工程提供了新的目标 | NA | 优化生物传感器的设计并扩展对TtgV的研究 | 基于TtgV的吲哚衍生物生物传感器及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
631 | 2024-08-07 |
Graded-CRISPRi, a Tool for Tuning the Strengths of CRISPRi-Mediated Knockdowns in Vibrio natriegens Using gRNA Libraries
2024-Jul-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00056
PMID:38916455
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研究论文 | 本文介绍了一种名为graded-CRISPRi的工具,用于在Vibrio natriegens中通过gRNA库调节CRISPRi介导的敲降强度 | 开发了一种新的graded-CRISPRi系统,利用gRNA变体实现不同程度的抑制强度 | NA | 开发一种有效的工具,逐步降低原生基因的表达水平 | Vibrio natriegens中的基因表达调控 | 合成生物学 | NA | CRISPRi | NA | 基因序列 | 涉及四个不同的报告基因 |
632 | 2024-08-07 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
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研究论文 | 本文通过定向内共生方法,在酵母细胞内引入碳同化能力,生成在光合条件下生长的酵母/蓝细菌嵌合体 | 开发了一种定向内共生方法,将碳同化和糖分泌的蓝细菌内共生体工程化到酵母细胞内,实现了酵母在光合条件下的生长 | NA | 研究将异养生物转化为部分或完全自养生物的方法,并探索其在可持续生物技术和合成生物学中的应用 | 酵母和蓝细菌嵌合体 | 合成生物学 | NA | 定向内共生 | NA | NA | NA |
633 | 2024-08-07 |
Engineering cyanobacteria as a new platform for producing taxol precursors directly from carbon dioxide
2024-Jul-16, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02555-9
PMID:39014505
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研究论文 | 本文通过工程化改造蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803,构建了模块化代谢途径,实现了从二氧化碳直接生产紫杉醇前体taxadiene-5α-ol | 首次在蓝细菌中通过光合作用生产taxadiene-5α-ol,展示了工程化蓝细菌作为生物太阳能电池工厂生产有价值萜类化合物的广阔前景 | NA | 开发一种新的平台,利用工程化蓝细菌直接从二氧化碳生产紫杉醇前体 | 蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803及其代谢途径 | 合成生物学 | 多种恶性肿瘤 | 代谢工程 | NA | 转录组数据 | 最佳菌株DIGT-P560生产了高达17.43 mg/L的氧化紫杉烷和4.32 mg/L的T5α-ol |
634 | 2024-08-07 |
Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence
2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603336
PMID:39026737
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法研究生物能量应激对抗生素疗效的直接影响 | 首次探讨了生物能量应激如何通过增强ROS产生、突变断裂修复和转录偶联修复来促进抗微生物耐药性的发展,并提出了一个统一模型解释抗生素诱导的抗微生物耐药性和持久性 | NA | 更好地理解抗微生物耐药性机制 | 生物能量应激对抗生素疗效的影响 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
635 | 2024-08-07 |
Bacteriophage-Based Bioanalysis
2024-Jul, Annual review of analytical chemistry (Palo Alto, Calif.)
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综述 | 本文综述了基于噬菌体的生物传感器的发展及其在噬菌体生物学和工程领域的最新进展 | 介绍了噬菌体生物传感器在合成生物学、机器学习和遗传工程等邻近领域的应用,以及采用自下而上的设计合成定制噬菌体的新方法 | NA | 探讨噬菌体生物传感器的发展及其在生物传感领域的应用潜力 | 噬菌体生物传感器及其在生物传感领域的应用 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA |
636 | 2024-08-07 |
Engineering Native Biological Complexity from the Inside-out and Outside-in
2024-Jan, Nature chemical engineering
DOI:10.1038/s44286-023-00013-1
PMID:39015819
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研究论文 | 本文探讨了在组织发育和再生中,通过'由外而内'和'由内而外'信号的平衡来控制细胞功能和命运的工程化方法 | 强调了新兴策略,如生物材料设计和合成生物学,以影响这一微妙的平衡并微调细胞反应 | NA | 研究如何通过工程化方法控制细胞功能和命运 | 细胞功能和命运的控制 | 合成生物学 | NA | 生物材料设计,合成生物学 | NA | NA | NA |
637 | 2024-08-07 |
Design Principles for Perfect Adaptation in Biological Networks with Nonlinear Dynamics
2024-Jul-03, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-024-01318-9
PMID:38958824
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研究论文 | 本文提出了一种基于非线性系统理论的框架,用于识别针对任意幅度外部扰动的完美适应的设计原则 | 本文通过非线性系统理论推导出完美适应的数学条件,并将其转化为网络结构的具体必要要求,提出了两种能够提供全局适应性的网络架构 | 本文的方法不假设任何关于底层速率动力学的明确知识,仅有一些最小的假设 | 建立生物网络结构与涌现生物特性之间的映射关系 | 生物网络中的完美适应性 | 系统生物学 | NA | 非线性系统理论 | NA | NA | NA |
638 | 2024-08-07 |
Light-Oxygen-Voltage (LOV)-sensing Domains: Activation Mechanism and Optogenetic Stimulation
2024-03-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2023.168356
PMID:37944792
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研究论文 | 本文探讨了光氧电压(LOV)传感域的激活机制及其在光遗传学刺激中的应用 | LOV域作为多功能的光感受器,能够非侵入性地感知和控制细胞内过程,具有高时空精度,适用于光遗传学领域 | NA | 研究LOV域的激活机制及其在光遗传学中的应用,推动生物系统研究和新型治疗策略的发展 | LOV域及其在光遗传学中的应用 | 生物技术 | NA | 结构生物学、光谱学、计算方法和合成生物学 | NA | NA | NA |
639 | 2024-08-07 |
Fungal-bacterial consortia: A promising strategy for the removal of petroleum hydrocarbons
2024-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116543
PMID:38833981
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综述 | 本文综述了利用真菌-细菌共生体系去除石油烃污染的研究进展 | 介绍了真菌和细菌混合微生物群落通过多种协同机制降解复杂烃类污染物的新策略 | 存在微生物竞争等拮抗作用以及抑制剂或毒素的产生,且需要优化环境因素以提高共生体系性能 | 探讨利用真菌-细菌共生体系进行生物修复的方法和挑战 | 石油烃污染物 | NA | NA | 合成生物学和基因编辑工具 | NA | NA | NA |
640 | 2024-08-07 |
Organ-Specific Gene Expression Control Using DNA Origami-Based Nanodevices
2024-Jul-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c02104
PMID:38920331
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研究论文 | 研究利用DNA折纸技术构建纳米装置,实现特定器官的基因表达控制 | 开发了坚韧的DNA折纸结构,并将其封装在脂质纳米颗粒(LNPs)中,以在恶劣条件下(低pH)实现器官特异性基因递送 | 目前仍面临DNA纳米结构的脆弱性和低靶向能力的挑战 | 探索利用DNA折纸纳米装置进行特定器官基因表达控制的可能性 | DNA折纸纳米装置及其在特定器官中的基因递送效果 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术,脂质纳米颗粒(LNPs),低温电子显微镜(Cryo-EM) | NA | 基因(mRNA和siRNA) | 小鼠器官 |