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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2024-08-07 |
Bacteriophage-Based Bioanalysis
2024-Jul, Annual review of analytical chemistry (Palo Alto, Calif.)
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综述 | 本文综述了基于噬菌体的生物传感器的发展及其在噬菌体生物学和工程领域的最新进展 | 介绍了噬菌体生物传感器在合成生物学、机器学习和遗传工程等邻近领域的应用,以及采用自下而上的设计合成定制噬菌体的新方法 | NA | 探讨噬菌体生物传感器的发展及其在生物传感领域的应用潜力 | 噬菌体生物传感器及其在生物传感领域的应用 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 682 | 2024-08-07 |
Engineering Native Biological Complexity from the Inside-out and Outside-in
2024-Jan, Nature chemical engineering
DOI:10.1038/s44286-023-00013-1
PMID:39015819
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研究论文 | 本文探讨了在组织发育和再生中,通过'由外而内'和'由内而外'信号的平衡来控制细胞功能和命运的工程化方法 | 强调了新兴策略,如生物材料设计和合成生物学,以影响这一微妙的平衡并微调细胞反应 | NA | 研究如何通过工程化方法控制细胞功能和命运 | 细胞功能和命运的控制 | 合成生物学 | NA | 生物材料设计,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 683 | 2024-08-07 |
Design Principles for Perfect Adaptation in Biological Networks with Nonlinear Dynamics
2024-Jul-03, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-024-01318-9
PMID:38958824
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研究论文 | 本文提出了一种基于非线性系统理论的框架,用于识别针对任意幅度外部扰动的完美适应的设计原则 | 本文通过非线性系统理论推导出完美适应的数学条件,并将其转化为网络结构的具体必要要求,提出了两种能够提供全局适应性的网络架构 | 本文的方法不假设任何关于底层速率动力学的明确知识,仅有一些最小的假设 | 建立生物网络结构与涌现生物特性之间的映射关系 | 生物网络中的完美适应性 | 系统生物学 | NA | 非线性系统理论 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 684 | 2024-08-07 |
Light-Oxygen-Voltage (LOV)-sensing Domains: Activation Mechanism and Optogenetic Stimulation
2024-03-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2023.168356
PMID:37944792
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研究论文 | 本文探讨了光氧电压(LOV)传感域的激活机制及其在光遗传学刺激中的应用 | LOV域作为多功能的光感受器,能够非侵入性地感知和控制细胞内过程,具有高时空精度,适用于光遗传学领域 | NA | 研究LOV域的激活机制及其在光遗传学中的应用,推动生物系统研究和新型治疗策略的发展 | LOV域及其在光遗传学中的应用 | 生物技术 | NA | 结构生物学、光谱学、计算方法和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 685 | 2024-08-07 |
Fungal-bacterial consortia: A promising strategy for the removal of petroleum hydrocarbons
2024-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116543
PMID:38833981
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综述 | 本文综述了利用真菌-细菌共生体系去除石油烃污染的研究进展 | 介绍了真菌和细菌混合微生物群落通过多种协同机制降解复杂烃类污染物的新策略 | 存在微生物竞争等拮抗作用以及抑制剂或毒素的产生,且需要优化环境因素以提高共生体系性能 | 探讨利用真菌-细菌共生体系进行生物修复的方法和挑战 | 石油烃污染物 | NA | NA | 合成生物学和基因编辑工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 686 | 2024-08-07 |
Engineering Microorganisms for Cancer Immunotherapy
2024-Jul, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202304649
PMID:38598792
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综述 | 本文综述了利用工程化微生物进行癌症免疫治疗的方法,包括通过合成生物学和遗传工程技术设计改造细菌和病毒,以靶向癌细胞并调节免疫系统 | 工程化微生物作为一种新兴的癌症免疫治疗策略,具有提供个性化创新治疗方案的巨大潜力 | NA | 探讨基于微生物的癌症免疫治疗方法,同时考虑安全性和伦理问题 | 工程化微生物在癌症免疫治疗中的应用 | NA | 癌症 | 合成生物学和遗传工程技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 687 | 2024-08-07 |
Systematic engineering for production of anti-aging sunscreen compound in Pseudomonas putida
2024-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.06.001
PMID:38839037
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研究论文 | 本研究旨在通过系统工程方法提高Pseudomonas putida生产具有抗衰老特性的防晒化合物shinorine的效率 | 本研究结合了代谢通量分析的元分析、基因组规模代谢模型、合成生物学、CRISPRi介导的基因下调和组学分析,以提高shinorine的生产效率 | NA | 建立一个高效的微生物平台,用于生产具有抗衰老特性的UV光吸收化合物shinorine | shinorine的生产效率和其生物合成途径的优化 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, 组学分析 | 基因组规模代谢模型 | 代谢通量分布数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 688 | 2024-08-07 |
Synthetic biology for Monascus: From strain breeding to industrial production
2024-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400180
PMID:39014924
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研究论文 | 本文综述了合成生物学技术在Monascus菌株改良和工业化生产中的应用及其挑战 | 结合合成生物学和过程强化,探讨了自动化固态发酵制造的前景,以推动Monascus在多个行业的应用 | 目前缺乏先进的Monascus制造技术,限制了其规模化生产 | 探讨如何利用合成生物学技术实现Monascus的工业化生产 | Monascus菌株及其代谢产物 | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 689 | 2024-08-07 |
Toward biomanufacturing of next-generation bacterial nanocellulose (BNC)-based materials with tailored properties: A review on genetic engineering approaches
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108390
PMID:38823654
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综述 | 本文综述了通过遗传工程方法制造具有定制特性的下一代细菌纳米纤维素(BNC)基材料的进展 | 介绍了通过基因过表达、敲除以及合成生物学和CRISPR/Cas技术调控BNC生物合成的创新方法 | BNC的大规模生产受限于其低产率、微生物菌株的不稳定性及成本问题 | 探讨如何通过遗传工程提高BNC的生产效率和定制其材料特性 | 细菌纳米纤维素(BNC)及其基材料 | 生物技术 | NA | 遗传工程、合成生物学、CRISPR/Cas技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 690 | 2024-08-07 |
The bioproduction of astaxanthin: A comprehensive review on the microbial synthesis and downstream extraction
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108392
PMID:38825214
|
综述 | 本文全面综述了虾青素的微生物合成及其下游提取方法 | 介绍了通过合成生物学构建的多种重组微生物宿主用于虾青素生产,以及近年来报道的高效绿色提取方法 | NA | 旨在全面介绍虾青素生产和提取的进展 | 虾青素的微生物合成及提取方法 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 691 | 2024-08-07 |
Cordyceps militaris: A novel mushroom platform for metabolic engineering
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108396
PMID:38906495
|
综述 | 本文综述了利用冬虫夏草作为细胞工厂生产高价值化学品和营养素的潜力 | 探讨了冬虫夏草作为新型底盘细胞的深入研究和开发的具体和有前景的机会 | 讨论了在计算生物学、现有DNA元件和基因组编辑方法等领域进一步研究冬虫夏草的挑战和障碍 | 探索冬虫夏草作为细胞工厂生产高价值化学品和营养素的潜力 | 冬虫夏草及其生物活性化合物 | NA | NA | 基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 692 | 2024-08-07 |
Advancing microbial production through artificial intelligence-aided biology
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108399
PMID:38925317
|
综述 | 本文综述了人工智能辅助微生物生产的主要组成部分和最新进展 | 利用人工智能处理、学习和预测大量生物数据,将传统的DBT循环转变为多维的DBTLP工作流程 | 讨论了将新型人工智能技术整合到生物学中的挑战 | 探讨人工智能在微生物生产中的应用及其对合成生物学的影响 | 微生物细胞工厂和合成生物学中的遗传装置 | 机器学习 | NA | 人工智能 | 大型语言模型 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 693 | 2024-08-07 |
Machine learning for the advancement of genome-scale metabolic modeling
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108400
PMID:38944218
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综述 | 本文综述了机器学习(ML)和深度学习(DL)在基因组尺度代谢模型(GEM)构建中的应用及其对生物医学和生物工程领域的潜在影响 | 探讨了多学科工具和策略(如合成生物学、约束基模型、多组学和机器学习)的集成潜力,以超越传统生物学教条探索生化现象 | 多学科方法框架的发展主要独立进行,限制了不同领域生物知识的串联 | 展示如何通过整合实验和计算策略,利用特定条件下的细胞信息推动生物系统知识的扩展,并提升机器学习基础的约束基模型在生物医学和生物工程领域的应用 | 基因组尺度代谢模型(GEM)的构建及其在生物医学和生物工程中的应用 | 系统生物学 | NA | 机器学习(ML),深度学习(DL) | NA | 多组学数据(转录组学、蛋白质组学等) | NA | NA | NA | NA | NA |
| 694 | 2024-08-07 |
Correction: Zhantlessova et al. Advanced "Green" Prebiotic Composite of Bacterial Cellulose/Pullulan Based on Synthetic Biology-Powered Microbial Coculture Strategy. Polymers 2022, 14, 3224
2024-Jun-26, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym16131802
PMID:39000809
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 695 | 2024-08-07 |
Racial/Ethnic Disparities and Immunotherapeutic Advances in the Treatment of Hepatocellular Carcinoma
2024-Jul-03, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16132446
PMID:39001508
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综述 | 本文综述了肝细胞癌(HCC)的治疗现状,特别是种族/民族差异及其对治疗结果的影响,并探讨了基于基因工程和分子合成生物学的新兴治疗策略。 | 介绍了基于基因工程和分子合成生物学的新兴治疗策略,这些策略显示出潜在的治疗效果。 | NA | 总结过去治疗策略,探讨当前治疗方式的形成,并展望未来可能更有效的HCC治疗策略。 | 肝细胞癌及其在不同种族/民族群体中的治疗差异。 | NA | 肝细胞癌 | 基因工程,分子和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 696 | 2024-08-07 |
Editorial: Advanced microfluidics for synthetic biology and/or biomedical applications
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1440206
PMID:39007054
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 697 | 2024-08-07 |
Reversible Control of Gene Expression by Guest-Modified Adenosines in a Cell-Free System via Host-Guest Interaction
2024-Jul-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c04262
PMID:38941287
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研究论文 | 本研究展示了通过葫芦[7]脲(CB[7])与客体修饰的腺苷之间的宿主-客体相互作用,实现了无细胞基因表达(CFE)系统的可逆控制 | 首次利用宿主-客体相互作用在CFE系统中控制基因表达,为基于DNA的技术开发开辟了新途径 | NA | 探索无细胞基因表达系统的可逆和可编程控制,以扩展其在合成生物学和医学中的应用 | 无细胞基因表达系统中的基因表达控制 | 生物技术 | NA | 宿主-客体相互作用 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 698 | 2024-08-07 |
Morphological Engineering of Filamentous Fungi: Research Progress and Perspectives
2024-Jun-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02007
PMID:38693049
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综述 | 本文综述了丝状真菌形态工程的研究进展和前景 | 介绍了真菌形态发生的机制以及当前形态调控方法和策略的发展,包括物理化学和代谢工程方法 | NA | 探讨丝状真菌形态工程的未来发展 | 丝状真菌的形态调控 | 生物工程 | NA | 合成生物学和遗传操作工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 699 | 2024-08-07 |
A library of reporters of the global regulators of gene expression in Escherichia coli
2024-Jun-18, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00065-24
PMID:38687030
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research paper | 本文开发了一个包含16种全局调节因子(GR)的荧光报告基因库,用于追踪大肠杆菌中基因表达的全局调节因子的生产速率 | 该报告基因库由单拷贝质粒组成,编码与天然启动子全长的绿色荧光蛋白(GFP)融合,能够高灵敏度和特异性地检测各种应激条件下的转录活性,并揭示单细胞转录速率的变异性 | NA | 旨在开发一种工具,用于追踪和分析大肠杆菌中全局调节因子的活性,以深入理解其对转录因子网络(TFN)的影响 | 大肠杆菌中的全局调节因子(GR)及其在不同生长阶段和应激条件下的活性 | molecular biology | NA | 荧光报告基因技术 | NA | 荧光信号 | 16种全局调节因子的报告基因库 | NA | NA | NA | NA |
| 700 | 2024-08-07 |
The evolution of developmental biology through conceptual and technological revolutions
2024-Jul-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.053
PMID:38906136
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review | 本文总结了革命性技术如何推动动物发育理解方面的显著进步,并描述了基因调控、模式形成、形态发生、器官发生和干细胞生物学等经典问题的重新审视。 | 文章探讨了发育生物学与进化、自组织、代谢、时间和生态的联系,并推测在合成生物学、人工智能和人类工程时代发育生物学的可能发展。 | NA | 总结革命性技术在发育生物学领域的应用及其对理解动物发育的贡献。 | 细胞、组织和生物体的发育过程,以及基因调控、模式形成、形态发生、器官发生和干细胞生物学等问题。 | NA | NA | 基因组学、成像、工程和计算生物学等技术。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |