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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2024-08-11 |
Insights into the synthesis, engineering, and functions of microbial pigments in Deinococcus bacteria
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1447785
PMID:39119139
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综述 | 本文综述了Deinococcus细菌中微生物色素的合成、工程化及其功能 | 探讨了通过代谢工程和合成生物学提高色素产量和扩展其应用前景的策略 | NA | 探讨微生物色素的生产优化及其在多个领域的应用前景 | Deinococcus细菌中的微生物色素及其相关酶和基因 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 702 | 2024-08-11 |
Some remarks on the argument appealing to nature against synthetic biology
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1428832
PMID:39119275
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评论 | 本文主要分析了以自然为名反对合成生物学的论点,并通过展示自然概念的模糊性、否认自然与非自然之间道德上显著的界限,以及反驳该论点对合成生物学的指控,提出了反驳 | 本文通过分析自然概念的模糊性和否认自然与非自然之间的道德界限,提出了对以自然为名反对合成生物学论点的反驳 | NA | 分析并反驳以自然为名反对合成生物学的论点 | 合成生物学及其相关论点 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 703 | 2024-08-10 |
Biomedical engineering utilizing living photosynthetic cyanobacteria and microalgae: Current status and future prospects
2024-Aug, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101154
PMID:39113912
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综述 | 本文综述了利用光合蓝细菌和微藻进行生物医学工程的现状与未来展望 | 探讨了合成生物技术在利用活体/工程蓝细菌进行生物医学应用中的潜力 | NA | 旨在讨论基于蓝细菌的生物医学工程的现状与未来展望 | 蓝细菌及其在生物医学应用中的特性 | 生物医学工程 | NA | 合成生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 704 | 2024-08-10 |
A synthetic microbial consortium protects against obesity by regulating vitamin B6 metabolism
2024 Jan-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2024.2304901
PMID:38269591
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研究论文 | 本文通过构建合成微生物群落,研究其对肥胖的保护作用及对维生素B6代谢的调控 | 利用微流控技术分离出能利用工程菌BsS-RS06551代谢物的细菌,并发现其与JJ3菌株的共培养能显著缓解肥胖及相关疾病 | NA | 探索合成微生物群落在肥胖治疗中的应用 | 合成微生物群落、肥胖及相关疾病 | 合成生物学 | 肥胖 | 微流控技术 | NA | 微生物数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 705 | 2024-08-07 |
Splittable systems in biomedical applications
2024-Aug-06, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d4bm00709c
PMID:39012216
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综述 | 本文综述了可分割系统在生物医学应用中的设计原则、策略和应用 | 介绍了通过融合其他模式引入的几种结合对和正交分割片段,以开发更复杂和稳健的设计 | 文章提到了面临的挑战,如脱靶效应和过度激活,但未详细说明具体的解决方法 | 探讨可分割系统在生物医学领域的应用 | 可分割系统的设计和其在不同生物医学领域的应用 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 706 | 2024-08-07 |
Microbial valorization of kraft black liquor for production of platform chemicals, biofuels, and value-added products: A critical review
2024-Aug, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2024.121631
PMID:38986370
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综述 | 本文综述了利用微生物技术将纸浆和造纸工业产生的硫酸盐黑液转化为平台化学品、生物燃料和其他高价值产品的潜力 | 介绍了利用合成生物学工具和分子技术,包括omics方法,来增强硫酸盐黑液的微生物增值 | 讨论了与毒性、杂质、低生产率和下游处理相关的挑战 | 探讨如何通过微生物增值技术实现纸浆和造纸工业的可持续发展,并贡献于联合国可持续发展目标 | 硫酸盐黑液的微生物增值及其在纸浆和造纸工业中的应用 | NA | NA | 合成生物学工具,分子技术,omics方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 707 | 2024-08-07 |
Biodiversity as a firewall to engineered microbiomes for restoration and conservation
2024-Jun, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.231526
PMID:39100153
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研究论文 | 本文通过数学模型模拟了合成生物学干预对生态系统的影响,探讨了其对生物多样性和生态网络的潜在影响。 | 本文首次通过数学模型展示了合成生物学干预如何通过抑制共享资源的衰减来增加生物多样性,并成功地将合成生物融入生态网络。 | 本文主要基于数学模型进行模拟,实际应用中的效果和影响可能有所不同。 | 探讨合成生物学在生态恢复和保护中的应用及其对生物多样性的影响。 | 生态系统中的生物多样性和合成生物学干预的效果。 | 生态学 | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 708 | 2024-08-06 |
Re-Engineering Fungal Nonribosomal Peptide Synthetases by Module Dissection and Duplicated Thiolation Domains
2024-Aug-12, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202406360
PMID:38822735
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研究论文 | 本文提出了一种新的真菌非核糖体肽合成酶的工程策略 | 通过模块分解和复制的硫化酶结构域实现了真菌NRPS的工程化与异源生产 | 未提及具体限制因素 | 研究非核糖体肽合成酶的工程化和异源生产 | 真菌非核糖体肽合成酶 | 合成生物学 | NA | 组合生物合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 709 | 2024-08-05 |
Advances in the development of synthetic biology tools for the bioproduction of natural product analogues
2024-07-01, Postepy biochemii
DOI:10.18388/pb.2021_531
PMID:39083471
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研究论文 | 本文介绍了自然产物及其衍生物在多个行业的应用以及合成生物学工具的进展 | 强调了合成生物学工具在生物生产生物活性二次代谢物方面的进展 | NA | 探讨合成生物学工具在自然产物生物生产中的应用 | 自然产物及其生物活性二次代谢物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 化学化合物 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 710 | 2024-08-05 |
Removal of the large inverted repeat from the plastid genome reveals gene dosage effects and leads to increased genome copy number
2024-06, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01709-9
PMID:38802561
|
研究论文 | 本研究揭示了去除叶绿体基因组中的大型倒置重复对基因剂量效应的影响及其导致基因组拷贝数增加的机制 | 本研究首次系统性地证明了叶绿体中的倒置重复区可以增强翻译能力,并探讨了基因组大小与拷贝数之间的关系 | 本研究主要基于烟草的叶绿体基因组,可能限制了结果的普遍适用性 | 探讨叶绿体基因组中倒置重复区的功能重要性及其对基因剂量效应的影响 | 烟草的叶绿体基因组及其功能特性 | 数字病理 | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | 生成了具有显著减少叶绿体基因组大小的植物 | NA | NA | NA | NA |
| 711 | 2024-08-05 |
An Enzymatic Prodrug-like Route to Thio and Selenoamides
2024-07-29, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202404243
PMID:38747847
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研究论文 | 本文揭示了一种酶促的前药样途径,用于硫和硒酰胺的合成 | 首次系统阐明了6-硫鸟嘌呤的生物合成机制和相关酶的功能,并发现了前药样的硫结合物中间体 | 未充分探索硫转移机制中的所有潜在中间体 | 研究细菌中稀有硫酰胺的形成机制 | 关注Erwinia amylovorans产生的6-硫鸟嘌呤及其生物合成途径 | 合成生物学 | 肿瘤 | 酶促反应重组 | NA | 化学物质 | 使用多种底物进行反应,样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 712 | 2024-08-05 |
Direct α-Hydroxy Acid Loading onto a Bacterial Thiotemplate Assembly Line via a Multienzyme Gateway
2024-07-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202405165
PMID:38728443
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研究论文 | 本研究揭示了将α-羟基酸直接加载到细菌非核糖体肽合成酶模块的过程 | 首次报告了细菌中将α-羟基酸直接加载到非核糖体肽合成酶模块的专门通道,拓展了合成生物学工具箱 | 部分研究步骤依赖于突变分析和酶活性测定,可能限制了结果的普遍性 | 研究α-羟基酸在细菌非核糖体肽合成中作为构建块的加载机制 | 焦链酸的加载过程及相关酶的功能 | 合成生物学 | NA | 生物信息学,代谢组学,生化分析 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 713 | 2024-08-05 |
Leveraging DNA-Encoded Cell-Mimics for Environment-Adaptive Transmembrane Channel Release-Induced Cell Death
2024-07-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202406186
PMID:38738850
|
研究论文 | 本文介绍了一种创新的DNA编码的人工T细胞模型,能够模拟T细胞的行为并诱导细胞死亡 | 提出了一种基于DNA的人工T细胞模仿物,能够在肿瘤微环境下响应酸性条件,并选择性释放嵌入脂质和胆固醇的DNA链 | NA | 研究环境适应性细胞死亡的机制 | DNA编码的人工T细胞模仿物(ARTC) | 生物医学工程 | 肿瘤 | DNA编码 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 714 | 2024-08-05 |
Structural Insights Into the Terpene Cyclization Domains of Two Fungal Sesterterpene Synthases and Enzymatic Engineering for Sesterterpene Diversification
2024-06-03, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202405140
PMID:38584136
|
研究论文 | 本文报道了两种真菌sesterterpene合酶的萜烯环化结构与酶工程研究 | 首次揭示了sesterterpene合酶的晶体结构及其催化机制,从而推动了sesterterpene的结构多样性扩展 | 对sesterterpene合酶的研究仍不够全面,进一步的结构-功能研究仍然必要 | 探讨sesterterpene合酶的结构与催化机制以推进结构多样性的工程 | 两种真菌的sesterterpene合酶NfSS和PbSS | 数字病理学 | NA | 晶体学,理论与实验相结合的研究方法 | NA | 结构数据,催化机制信息 | 两个酶合酶的结构样本 | NA | NA | NA | NA |
| 715 | 2024-08-05 |
Gene synthesis design: a pythonic approach
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17750
PMID:39076781
|
研究论文 | 本文提出了一种Python程序用于设计基因合成的DNA片段 | 提供了一种新的算法,通过Python程序设计DNA片段,且源代码可供所有用户免费使用 | 尚未提及具体的限制条件 | 旨在开发一种实用的基因合成片段设计工具 | DNA片段的合成和设计 | 合成生物学 | NA | PCR组装 | NA | NA | 通过实验验证算法的可行性 | NA | NA | NA | NA |
| 716 | 2024-08-05 |
Advances in stress-tolerance elements for microbial cell factories
2024-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.06.008
PMID:39072145
|
review | 本文回顾了微生物细胞工厂中的抗压元素进展 | 探讨了多种抗压元素的挖掘和重新设计策略,优化细胞工厂在极端条件下的表现 | 未提及具体实验数据或案例研究 | 旨在优化微生物细胞工厂在不同极端条件下的性能 | 针对微生物特别是极端微生物的抗压元素 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 717 | 2024-08-07 |
Cyanamide-inducible expression of homing nuclease I- SceI for selectable marker removal and promoter characterisation in Saccharomyces cerevisiae
2024-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.06.009
PMID:39072146
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于氰胺诱导的I-SceI同源核酸酶表达的方法,用于可选择性标记去除和启动子特征化。 | 创新性地结合了氰胺诱导的I-SceI介导的双链DNA断裂与麦芽糖诱导的MazF负选择,实现了无质粒的启动子替换。 | 可能受到特定诱导剂的限制,且文中涉及的启动子特性需要更多的验证。 | 探索新的基因组工程工具,以促进合成生物学和代谢工程的应用。 | 对不同强度的四环素诱导启动子以及其他几种诱导启动子的特征进行了研究。 | 合成生物学 | NA | 基因工程工具 | NA | DNA | 三种四环素诱导启动子及多对双向启动子 | NA | NA | NA | NA |
| 718 | 2024-08-05 |
Toward a nomenclature consensus for diverse intelligent systems: Call for collaboration
2024-Sep-09, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2024.100658
PMID:39071220
|
评论 | 本文探讨了在多学科合作中,对于智能系统命名法的一致性开发的重要性 | 提出了一种社区参与的方法,以达成多样智能系统相关术语的一致性 | 未具体提供在命名法达成一致中可能面临的挑战 | 旨在促进智能系统领域的多学科合作和命名法一致性 | 智能系统的术语和命名法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 719 | 2024-08-05 |
Measuring the burden of hundreds of BioBricks defines an evolutionary limit on constructability in synthetic biology
2024-Jul-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50639-9
PMID:39048554
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研究论文 | 本文测量了301种BioBrick质粒对大肠杆菌生长的影响 | 本文首次系统地表征了生物零件对宿主细胞的负担,确立了合成生物学中构建的进化限制 | 只研究了301种BioBrick质粒,样本数量相对较少 | 研究合成生物学中生物零件对宿主细胞生长的影响 | 301种BioBrick质粒和大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | NA | 种群遗传模型 | NA | 301种BioBrick质粒 | NA | NA | NA | NA |
| 720 | 2024-08-05 |
Design and Thermodynamics Principles to Program the Cooperativity of Molecular Assemblies
2024-03-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202313944
PMID:37975629
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研究论文 | 本研究探讨了合成DNA组装体的热力学基础,以编程分子组装的协作性 | 提出了通过融合相互作用域和优化其紧凑性来有效构建可编程的分子组装体 | 关于如何在所需浓度下和适当灵敏度下编程其组装动态的知识仍然有限 | 研究分子组装的设计和热力学原理 | 合成DNA组装体 | 合成生物学 | NA | 合成DNA组装 | 双突变循环分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |