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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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741 | 2024-08-07 |
IWBDA 2022: Toward a Modular Future of Synthetic Biology Driven by Bio-Design Automation
2024-Jun-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00340
PMID:38903006
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
742 | 2024-08-07 |
Characterization of unique EDTA-insensitive methylthioalkylmalate synthase from Eutrema japonicum and its potential application in synthetic biology
2024-Jul, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2024.02.009
PMID:38614832
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研究论文 | 本研究主要对来自Eutrema japonicum(日本山葵)的两个甲基硫代烷基苹果酸合酶(MAM1-1和MAM1-2)进行了表征,并探讨了它们在合成生物学中的潜在应用 | EjMAM1-2在无二价金属辅因子或高浓度EDTA条件下仍能保持20%的最大活性,显示出独特的金属酶特性,并且在体内将l-甲硫氨酸转化为2-(2-甲基硫代)乙基苹果酸(2-(2-MT)EM)的转化率最高 | NA | 研究甲基硫代烷基苹果酸合酶的特性及其在合成生物学中的应用潜力 | Eutrema japonicum中的甲基硫代烷基苹果酸合酶(MAM1-1和MAM1-2) | 合成生物学 | NA | AlphaFold2结构同源模型生成、体内外酶活性测定、突变研究 | 金属酶家族 | 酶活性数据、结构模型 | NA |
743 | 2024-08-07 |
Mitochondrial transplantation: A promising therapy for mitochondrial disorders
2024-Jun-10, International journal of pharmaceutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.ijpharm.2024.124194
PMID:38703929
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综述 | 本文综述了线粒体移植疗法(MTT)的机制、策略及其在多种线粒体疾病中的应用,并讨论了MTT临床应用的潜在挑战 | MTT作为一种创新的治疗方法,通过将健康线粒体移植到受损细胞中,以替换缺陷线粒体并恢复其功能 | MTT的临床应用仍面临挑战,需要进一步的研究和验证 | 展示MTT在临床治疗中的良好前景 | 线粒体移植疗法及其在多种致命性疾病中的应用 | NA | 心血管疾病、中枢神经系统疾病、炎症、癌症、肾脏损伤、肺损伤 | 线粒体移植 | NA | NA | NA |
744 | 2024-08-07 |
Diverse Combinatorial Biosynthesis Strategies for C-H Functionalization of Anthracyclinones
2024-05-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00043
PMID:38662967
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研究论文 | 本文扩展了生物合成平台,通过两种关键策略生成氧化修饰的类化合物,包括替换酮还原酶和第一环环化酶酶以及工程化多加氧酶盒,以催化特定位置的羟基化和其他修饰。 | 本文开发了改进的质粒载体和M1152Δ表达宿主,为使用重组宿主的组合生物合成定制蒽环类化合物奠定了基础。 | NA | 扩展生物合成平台,生成氧化修饰的类化合物。 | 酮还原酶、第一环环化酶酶、多加氧酶盒等酶的工程化。 | 生物技术 | NA | 生物合成技术 | NA | NA | NA |
745 | 2024-08-07 |
Red-Light-Induced Genetic System for Control of Extracellular Electron Transfer
2024-05-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00684
PMID:38696739
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研究论文 | 本文开发并适应了一种红光诱导的转录因子,用于控制基因表达和外源电子传递 | 通过添加抑制因子反转遗传电路,实现了红光照射下基因表达的激活,并展示了同时使用红光和蓝光诱导的光遗传学电路的能力 | NA | 开发和适应红光诱导的转录因子,以控制基因表达和外源电子传递 | 光遗传学系统及其在细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | 转录因子 | NA | NA |
746 | 2024-08-07 |
Cell-Free Protein Expression in Polymer Materials
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00628
PMID:38467017
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研究论文 | 本文展示了在聚合物材料中使用无细胞蛋白合成技术(CFPS)的可能性,并验证了其在高温和有机溶剂环境下的耐受性 | 首次证明了干燥的CFPS反应在聚合物材料制备过程中对热和有机溶剂的高耐受性,并展示了其在塑料中实现空间模式化的遗传功能、现场产生抗菌剂和进行传感反应的应用 | NA | 探索在固体材料中实现生物系统功能的可能性 | 无细胞蛋白合成技术在聚合物材料中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成(CFPS) | NA | 聚合物材料 | NA |
747 | 2024-08-07 |
Ensemble Detection of DNA Engineering Signatures
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00398
PMID:38468602
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研究论文 | 开发了一个名为GUARDIAN的系统,用于自动检测DNA测序数据中的工程痕迹,并通过盲测验证其有效性 | 采用集成方法,通过组合多种检测策略提高检测准确性,无需专家审查 | NA | 解决合成生物学中基因工程生物的潜在滥用或意外释放问题 | 检测DNA测序数据中的工程痕迹 | 生物技术 | NA | DNA测序 | 集成方法 | DNA序列数据 | 13个目标生物 |
748 | 2024-08-07 |
Engineering Plant Cell Fates and Functions for Agriculture and Industry
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00047
PMID:38573786
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观点 | 本文讨论了通过细胞基因组学和合成生物学工具,如生物传感器和DNA记录设备,来优化植物细胞特异性程序和细胞命运,以改善植物形态、环境响应和有价值化合物的生产 | 结合细胞基因组学和合成生物学工具,探讨了细胞特异性工程的新兴机会 | 对许多植物发育程序和细胞类型特异性功能的理解仍不完整 | 探讨如何利用合成生物学方法优化植物形态和提高有价值化合物的生产 | 植物细胞命运和功能 | NA | NA | 细胞基因组学,合成生物学 | NA | NA | NA |
749 | 2024-08-07 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
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研究论文 | 本文从自然界筛选具有几丁质酶活性的微生物,并通过基因工程手段在异源宿主中实现持续的几丁质酶活性 | 开发了一种新的方法来筛选具有几丁质酶活性的微生物,并通过优化核糖体结合位点和发现有益的启动子,实现了在异源宿主中持续几丁质酶活性的表达 | 文章未明确提及具体的局限性 | 实现几丁质酶在异源宿主中的持续活性,以应用于工业生产 | 几丁质酶及其在异源宿主中的表达 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序 | NA | 基因 | 海洋水样 |
750 | 2024-08-07 |
Investigating the Effect of RNA Scaffolds on the Multicolor Fluorogenic Aptamer Pepper in Different Bacterial Species
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00009
PMID:38593047
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研究论文 | 研究RNA支架对多色荧光适配体Pepper在不同细菌种类中的影响 | 发现了一种名为DF30-tRNA的RNA支架,其荧光强度比单独的Pepper适配体高199倍,并允许在活细胞中进行双色同时成像 | 未提及 | 评估多色荧光适配体Pepper在革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌中的应用 | 多色荧光适配体Pepper及其在不同细菌种类中的表现 | NA | NA | NA | NA | NA | 未提及 |
751 | 2024-08-07 |
LanTERN: A Fluorescent Sensor That Specifically Responds to Lanthanides
2024-03-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00600
PMID:38377571
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研究论文 | 介绍了一种名为LanTERN的镧系元素响应型荧光蛋白,该蛋白能够特异性地响应镧系元素 | LanTERN是基于GCaMP设计的,通过基因工程改造使其从对钙的特异性转变为对镧系元素的特异性,能够直接将镧系元素的结合转化为显著增加的荧光 | NA | 开发新的合成生物学方法来测量镧系元素的结合 | 镧系元素响应型荧光蛋白LanTERN | 合成生物学 | NA | 基因工程 | 荧光蛋白 | 蛋白质 | 10种镧系元素 |
752 | 2024-08-07 |
Development of the Static and Dynamic Gene Expression Regulation Toolkit in Pseudomonas chlororaphis
2024-03-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00714
PMID:38377538
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研究论文 | 本研究构建了108个启动子-5'-UTR(PUTR)库,并通过荧光蛋白检测进行特征化,进而开发了静态和动态基因表达调控系统 | 本研究首次为非模式微生物Pseudomonas chlororaphis开发了静态和动态基因表达调控工具包,有助于精细调控基因表达和重编程代谢通量 | NA | 开发适用于Pseudomonas chlororaphis的基因表达精确调控工具包 | Pseudomonas chlororaphis的基因表达调控 | 合成生物学 | NA | 荧光蛋白检测 | NA | 基因表达数据 | 108个启动子-5'-UTR(PUTR) |
753 | 2024-08-07 |
Subunits of an E3 Ligase Complex as Degrons for Efficient Degradation of Cytosolic, Nuclear, and Membrane Proteins
2024-03-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00588
PMID:38404221
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研究论文 | 本文系统分析了多蛋白E3泛素连接酶复合体的四个蛋白亚基作为设计降解子支架的功能,并展示了它们在不同细胞区室中对蛋白质降解的有效性。 | 本文创新性地利用E3泛素连接酶复合体的亚基作为设计降解子,实现了对细胞质、细胞核和膜蛋白的有效降解,并展示了其在合成生物学中的应用潜力。 | 文章中提到的E3连接酶亚基对膜和细胞质及细胞核蛋白的降解效率存在差异,需要进一步优化以提高一致性。 | 研究旨在探索和优化E3泛素连接酶复合体亚基作为设计降解子的应用,以实现对特定蛋白质的有效降解。 | 研究对象包括E3泛素连接酶复合体的四个蛋白亚基及其在不同细胞区室中对蛋白质降解的影响。 | 细胞生物学 | NA | E3泛素连接酶 | NA | 蛋白质 | 不同细胞系中的多种蛋白质目标 |
754 | 2024-08-07 |
Comprehensive Parameter Space Mapping of Cell Cycle Dynamics under Network Perturbations
2024-03-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00631
PMID:38420905
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研究论文 | 本文开发了一种基于液滴的合成细胞系统,用于在多维度上连续调节单细胞水平的参数,并系统性地扰动以细胞周期依赖性激酶(Cdk1)为中心的细胞周期振荡器,从而全面映射网络扰动下的周期景观。 | 本文提供了一个实验框架,用于全局参数空间扫描,并挑战现有模型,提出一个与观察到的响应相匹配的新模型。 | NA | 研究细胞周期动力学在网络扰动下的参数空间映射。 | 细胞周期振荡器及其在网络扰动下的响应。 | 合成生物学 | NA | 液滴为基础的合成细胞系统 | 细胞周期振荡器模型 | 细胞周期动力学数据 | 多个维度和全动态范围的单细胞参数调节 |
755 | 2024-08-07 |
An Efficient Method for the Production of High-Purity Bioinspired Large Unilamellar Vesicles
2024-03-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00540
PMID:38423534
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研究论文 | 本文介绍了一种高效且简单的方法,用于生产高纯度的大型单层囊泡(LUVs),其直径范围在450-550 nm之间 | 本文优化了一种简单且高效的协议,用于生产高纯度的大型单层囊泡(LUVs),并详细研究了不同实验参数对囊泡浓度和大小的影响 | NA | 为了重现复杂的真核细胞区室化,合成生物学旨在从底层重建细胞膜包被的区室 | 大型单层囊泡(LUVs)的生产和特性 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
756 | 2024-08-07 |
Genetic Parts and Enabling Tools for Biocircuit Design
2024-03-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00691
PMID:38427821
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综述 | 本文综述了用于设计生物电路的现有部件库及其在转录、翻译和翻译后水平的基因表达调控范式,并讨论了将这些部件整合到复杂设备和系统中的必要方面,以及当前对目录和标准化测量数据的努力。 | 建立了biopartsDB,一个经过精心策划的、具有详细定量数据的遗传部件和设备库数据库,这些数据已通过已发表文献验证。 | NA | 旨在综述当前用于设计生物电路的部件库及其基因表达调控范式,并讨论如何将这些部件整合到复杂设备和系统中。 | 遗传部件库及其在生物电路设计中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | NA |
757 | 2024-08-07 |
Enzymatic Assembly of Small Synthetic Genes with Repetitive Elements
2024-03-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00665
PMID:38437525
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研究论文 | 本文介绍了一种用于组装含有重复元素的小型合成基因的方法 | 该方法通过将目标基因分割成带有Golden-Gate兼容末端的小片段,然后通过oligo延伸和Golden Gate Assembly组装成合成基因,解决了重复序列合成效率低的问题 | 该方法主要针对含有重复元素的基因,对于其他类型的基因可能不适用 | 开发一种有效的方法来组装含有重复元素的合成基因,以促进合成生物学的发展 | 含有重复元素的合成基因 | 合成生物学 | NA | Golden Gate Assembly | NA | DNA序列 | 八个含有重复元素的挑战性基因,大小从133到456个碱基对 |
758 | 2024-08-07 |
RNAi-based Boolean gates in the yeast Saccharomyces cerevisiae
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1392967
PMID:38895554
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研究论文 | 本研究设计并构建了基于RNA干扰途径的布尔逻辑门,主要在酵母细胞中进行实验 | 首次在天然缺乏RNAi途径的酵母细胞中构建基于RNAi的布尔逻辑门 | RNAi基逻辑门对启动子泄漏高度敏感,实施难度较大 | 设计并构建布尔逻辑门以促进合成生物学中的生物传感器和生物计算 | 酵母细胞中的RNA干扰途径 | 合成生物学 | NA | RNA干扰 | 布尔逻辑门 | DNA片段 | 不同表达盒的siRNA前体 |
759 | 2024-08-07 |
A rapid and scalable approach to build synthetic repetitive hormone-responsive promoters
2024-Jul, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14313
PMID:38379432
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研究论文 | 本文开发了一种简单、单管反应方法,用于生成包含多个重复元素的DNA序列,并利用GoldenBraid分子克隆技术去除填充序列,重新连接重复序列,并在载体中亚克隆串联序列。 | 该方法比以往的解决方案更简单、更通用和高效,能够快速且可扩展地构建合成重复激素反应性启动子。 | NA | 开发一种新的方法来克服高复杂度DNA序列合成中的限制,特别是包含短重复序列的DNA。 | 合成重复激素反应性启动子及其在植物中的应用。 | 合成生物学 | NA | PCR扩增,GoldenBraid分子克隆技术 | NA | DNA序列 | 两个不同的植物激素反应性合成重复近端启动子在植物中进行了测试。 |
760 | 2024-08-07 |
Development and assessment of a multiepitope synthetic antigen for the diagnosis of Dengue virus infection
2024 May-Jun, The Brazilian journal of infectious diseases : an official publication of the Brazilian Society of Infectious Diseases
DOI:10.1016/j.bjid.2024.103746
PMID:38703788
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研究论文 | 本文研究开发了一种用于登革病毒感染诊断的多表位合成抗原,并通过实验评估了其性能 | 设计了两种基于不同来源表位序列的合成多表位抗原,rDME-C和rDME-BR,这些抗原在结构和功能上具有独特性,能够有效检测登革病毒感染中的IgM和IgG抗体 | 研究中未观察到与寨卡病毒感染小鼠血清的交叉反应,但与COVID-19血清样本存在交叉反应,这可能是未来研究中需要解决的问题 | 开发一种新型的合成多表位抗原,用于提高登革病毒感染诊断的准确性和特异性 | 登革病毒感染的诊断和监测 | NA | 登革热 | 合成生物学 | NA | 蛋白质 | 使用了登革病毒感染的血清样本进行测试 |