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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-07-24 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-09-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科植物在基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学方面的研究进展,并探讨了基因组学在药用植物研究中的应用前景 | 将新兴的“药用植物基因组学”学科引入罂粟科研究,系统整合多组学数据揭示药用植物遗传基础和次生代谢途径,并探讨CRISPR/Cas9等现代基因操作技术的应用潜力 | 仅简要概述了组学视角在制药和农业生物技术领域的潜在应用,未深入讨论具体技术实现细节或案例研究 | 综合回顾罂粟科植物在基因组、转录组、蛋白质组和代谢组学方面的研究进展,并探索药用植物组学研究在制药工业和农业生物技术中的应用机会 | 罂粟科植物,特别是罂粟和白屈菜等产胶植物 | 药用植物基因组学 | NA | 高通量测序, CRISPR/Cas9, RNA干扰 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组, 代谢组数据 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 制药工业, 农业生物技术 |
| 62 | 2026-07-23 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-12-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 利用合成生物学方法,工程化细菌自组装生物玻璃聚硅酸盐包壳,并展示增强的光聚焦能力 | 首次利用合成生物学将海绵硅酸酶表达于细菌表面,实现微生物自组装聚硅酸盐“生物玻璃”外壳,并将细菌转化为可产生强纳米射流的活体微透镜,显著提升光聚焦性能 | 未明确讨论聚硅酸盐包壳的长期稳定性和大规模生产成本,且仅基于单一酶(硅酸酶)表达,可能限制光学性能调控的灵活性 | 开发廉价、耐用、可调控环境响应性的生物光子组件 | 表达硅酸酶的大肠杆菌 | 合成生物学、光子学 | NA | 合成生物学、生物矿化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 硅酸酶表达回路 | 光子学、材料科学、环境传感 |
| 63 | 2026-07-23 |
Engineered bacteria that self-assemble "bioglass" polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597164
PMID:38895271
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研究论文 | 利用工程化细菌自组装聚硅酸盐“生物玻璃”涂层,实现增强的光聚焦功能 | 首次利用合成生物学方法,使细菌表达海绵来源的硅酸盐酶(silicatein),自组装形成聚硅酸盐“生物玻璃”外壳,并发现该涂层能显著增强细菌的光聚焦能力,产生比未修饰细菌亮近一个数量级的纳米射流 | 未提及长期稳定性和在实际光学器件中的集成应用挑战 | 开发环境友好、可调控的光学材料,通过工程化细菌实现活体微透镜的构建 | 表达硅酸盐酶(silicatein)的工程化细菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 自组装聚硅酸盐“生物玻璃”涂层 | 光学、光子学 |
| 64 | 2026-07-22 |
Engineering bacteria for cancer immunotherapy by inhibiting IDO activity and reprogramming CD8+ T cell response
2024-12-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412070121
PMID:39693352
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研究论文 | 通过基因工程改造细菌,抑制IDO活性并重编程CD8+ T细胞反应,增强肿瘤免疫治疗 | 工程化高色氨酸表达细菌菌株L-Trp CB,通过丁酸抑制IDO活性并释放色氨酸激活CD8+ T细胞,实现肿瘤靶向免疫治疗 | 研究仅在小鼠和兔模型中进行,需进一步验证临床安全性和有效性 | 开发合成生物学策略用于肿瘤免疫治疗 | 工程化细菌菌株L-Trp CB及其对肿瘤微环境中IDO活性和CD8+ T细胞的影响 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因工程 | NA | NA | 小鼠和兔多种肿瘤模型 | 基因工程 | 细菌 | 高色氨酸表达回路 | 医学 |
| 65 | 2026-07-19 |
Biosynthetic pathway of prescription cucurbitacin IIa and high-level production of key triterpenoid intermediates in engineered yeast and tobacco
2024-06-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100835
PMID:38425040
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研究论文 | 本研究表征了雪胆中葫芦素IIa生物合成途径的关键基因,并在工程酵母和烟草中实现了关键三萜中间体的高产 | 首次揭示了处方药葫芦素IIa完整的生物合成途径,并通过模块化工程和P450表达优化,在酵母中实现了迄今最高产量的三萜中间体 | 未提及葫芦素IIa的最终完整合成,且烟草中产量相对较低(1.28 mg/g干重) | 解析葫芦素IIa的生物合成途径并实现关键三萜中间体的异源高产 | 雪胆属植物中的葫芦素IIa生物合成相关基因(HcSE1-2、HcOSC1-6、HcCYP87D20、HcCYP81Q59和HcAT1) | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢工程 | NA | 基因序列、代谢物产量数据 | 多个基因在酵母和烟草中的表达系统 | NA | 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae), 本氏烟草 (Nicotiana benthamiana) | 甲羟戊酸途径的模块化工程和P450表达优化,以生产11-羰基-20β-羟基-葫芦醇 | 医药 |
| 66 | 2026-07-19 |
An integrative database and its application for plant synthetic biology research
2024-05-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100827
PMID:38297840
|
研究论文 | 构建了一个植物合成生物数据库并提供在线工具,用于支撑植物合成生物学研究 | 首次整合了1677个催化生物元件和384个调控元件,提供本地BLAST、化学相似性、系统发育分析和可视强度等在线工具,并验证了数据库在烟草中量化调控紫杉二烯合酶2及表达黄病毒非结构蛋白1的应用 | 数据库的元件数量和物种覆盖有限,未涵盖所有已知植物元件 | 开发一个综合性平台,为植物合成生物学研究提供一站式服务 | 植物合成生物学中的生物元件(催化元件和调控元件)及烟草叶片 | 数字生物学 | NA | NA | NA | 生物数据 | 包含1677个催化元件、384个调控元件、309个物种和850种化学品的信息 | NA | 烟草 | 基因表达定量调控回路、转录信号放大装置 | 农业、医药 |
| 67 | 2026-07-19 |
Bringing CAM photosynthesis to the table: Paving the way for resilient and productive agricultural systems in a changing climate
2024-03-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100772
PMID:37990498
|
评论文章 | 探讨将景天酸代谢光合作用引入农作物,以应对气候变化和水资源短缺挑战的研究路线 | 提出通过多组学、合成生物学和计算生物学方法,系统揭示引入CAM路径的最小遗传工具包,为培育抗旱作物提供新思路 | 未提供实际实验验证或成功引入CAM路径的案例报告 | 开发能够适应气候变化和水资源短缺的韧性农作物系统 | 景天酸代谢植物(CAM植物)的基因组、转录组和代谢机制 | 机器学习和系统生物学 | NA | 基因组学、单细胞组学、高通量数据生成与挖掘、功能基因组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学工具 | 农作物 | CAM路径工程化引入 | 农业 |
| 68 | 2026-07-14 |
Combining culture optimization and synthetic biology to improve production and detection of secondary metabolites in Myxococcus xanthus: application to myxoprincomide
2024-12-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01740-24
PMID:39431896
|
研究论文 | 通过结合培养优化和合成生物学,提高黄色粘球菌中次生代谢物(如myxoprincomide)的产量与检测能力 | 提出名为2PRIM-BOOST的新策略,结合底盘菌株工程与两步生长培养基优化,增强非核糖体肽合成酶(NRPS)/聚酮合酶(PKS)次生代谢物的生产,并促进医学相关生物活性筛选 | 该方法目前仅针对myxoprincomide进行验证,尚需应用于更多隐性代谢物以全面验证其有效性 | 提高粘细菌次生代谢物的实验室产量,以发现新药物前体 | 黄色粘球菌DZ2菌株及其产生的次生代谢物myxoprincomide | 合成生物学 | NA | 合成生物学、启动子工程、培养基优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9或相关基因组工程工具(未明确指定) | 黄色粘球菌(Myxococcus xanthus) | 组成型强启动子插入至生物合成基因簇上游 | 医学 |
| 69 | 2026-07-13 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-12-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
|
研究论文 | 研究Methanosarcina acetivorans在抑制能量保守性甲烷苯并蒽醌:CoM-CoB异二硫化物还原酶HdrED时的转录响应 | 揭示细胞通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性将甲烷生成与基因调控耦合的未知机制,并发现甲基营养型甲烷生成调节因子MsrC参与异二硫化物感应 | NA | 了解产甲烷古菌如何感知和响应末端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans | 机器学习 | NA | 转录组分析 | NA | 转录本丰度数据 | NA | NA | Methanosarcina acetivorans | NA | 可再生能源生产, 可持续化学品生产, 工业生物技术 |
| 70 | 2026-07-10 |
Neonatal bioethics, AI, and genomics
2024-11, Early human development
IF:2.2Q2
DOI:10.1016/j.earlhumdev.2024.106130
PMID:39405800
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评论文章 | 探讨人工智能与合成生物学对医学实践、人类技能以及人性本质的深远影响 | 提出AI和合成生物学将迫使人类重新审视人文技能的本质、医生工作的价值评估以及何为人类独特价值 | 仅限于推测性讨论,缺乏具体数据或实验支持,未深入技术实现细节 | 探讨AI、基因组学和合成生物学在医学中的伦理与哲学影响 | 医学AI技术、基因组学与合成生物学的发展及其对医学实践的潜在影响 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 71 | 2026-07-10 |
The fusion of physics and biology in early mammalian embryogenesis
2024, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2024.05.001
PMID:38937030
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综述 | 本文综述了生物力学在哺乳动物早期胚胎发生中的作用,探讨了物理力与生物学过程的融合 | 系统整合了生物物理机制在囊胚形成、胚胎着床和早期原肠胚形成中的关键功能,并强调了合成生物学与先进生物材料相结合的潜力 | 未详细讨论具体实验数据或量化结果,可能缺乏对特定机制的深入验证 | 探索哺乳动物早期胚胎发生中生物物理机制的作用,并展望利用这些见解推动再生医学发展 | 哺乳动物胚胎(如小鼠和人类胚胎),以及体外模型(如blastoids、gastruloids等类胚胎结构) | NA | NA | CRISPR介导的基因组扰动、活体成像 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 小鼠、人类 | NA | 医学、再生医学 |
| 72 | 2026-07-05 |
YF17D-based vaccines - standing on the shoulders of a giant
2024-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250133
PMID:38571392
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综述 | 综述基于YF17D的黄热病疫苗平台的研究进展及其在预防和治疗多种疾病中的应用 | 系统总结了YF17D作为疫苗平台的独特免疫原性机制,并展示了其在开发新型重组活疫苗(包括已获批的日本脑炎和登革热疫苗)以及针对新兴病毒感染、寄生虫病、慢性感染和癌症的临床前候选疫苗中的广泛应用 | 历史安全担忧和制造挑战仍需克服,且YF17D疫苗的广泛使用仍需进一步研究 | 综述YF17D作为疫苗平台的最新见解,并探讨其在满足未满足的医疗需求和应对大流行准备中的作用 | 基于YF17D的疫苗及其在预防和治疗疾病中的应用 | NA | 黄热病、日本脑炎、登革热、拉沙热、寨卡病毒病、COVID-19、疟疾、HIV、慢性肝炎、癌症 | 分子病毒学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 73 | 2026-07-03 |
Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century
2024-12-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121654
PMID:39766921
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综述 | 系统回顾21世纪中国在植物病毒抗病毒剂方面的化学与生物学研究进展 | 整合化学、化学生物学、合成生物学等多学科方法,深入分析植物病毒靶标生物学特征及药物-靶标互作机制 | 未明确指出具体研究局限,可能缺乏对现有药剂抗性问题的讨论 | 综述植物病毒抗病毒剂研发的生物学基础、靶标特性及未来药物开发方向 | 植物病毒及其抗病毒剂 | 植物病毒学 | 植物病毒病 | 化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 农作物 | NA | 农业 |
| 74 | 2026-07-03 |
pLxIS-containing domains are biochemically flexible regulators of interferons and metabolism
2024-07-11, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.05.030
PMID:38925114
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研究论文 | 揭示含pLxIS基序的蛋白在干扰素信号传导和代谢调控中的多功能性 | 通过合成生物学平台鉴定出两个孤儿pLxIS蛋白,发现其通过独立于已知模式识别受体途径激活干扰素反应,并揭示pLxIS基序作为多基序信号实体的一部分,具有激活IRF3、TRAF6、IκB激酶、MAPK及代谢活动的灵活功能 | 未提及具体局限性 | 探索pLxIS基序在干扰素信号传导和代谢中的新功能及调控机制 | 含pLxIS基序的蛋白质 | 合成生物学 | 病毒感染 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学平台 | 人细胞 | pLxIS基序信号调控回路 | 医学, 免疫学 |
| 75 | 2026-07-03 |
A high-throughput synthetic biology approach for studying combinatorial chromatin-based transcriptional regulation
2024-06-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.05.025
PMID:38906116
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research paper | 开发了一个高通量筛选平台,用于研究酵母中染色质调控因子对转录活性的影响 | 构建了包含1900多对染色质调控因子的组合文库,并结合低维氨基酸嵌入的机器学习模型预测共招募对转录活性的影响 | NA | 研究染色质调控因子对转录活性的组合影响 | 酵母细胞中的染色质调控因子对 | 机器学习 | NA | 高通量筛选 | 监督机器学习模型 | 基因表达数据 | 1900多对染色质调控因子 | NA | S. cerevisiae | 组合染色质调控回路 | 合成生物学 |
| 76 | 2026-07-03 |
A Directed Evolution Protocol for Engineering Minimal Transcription Factors, Based on CIS Display
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_1
PMID:38441754
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研究论文 | 提出一种基于CIS展示的定向进化方法,用于工程化最小转录因子 | 首次将CIS展示技术应用于DNA结合蛋白的选择,突破了传统质粒克隆方法在库容量上的限制,实现大于10^10变体的库规模 | 仅以Cro转录因子为例验证方法,其他DNA结合蛋白的适用性尚未充分证明 | 开发一种高效定向进化DNA结合蛋白的体外展示方法 | 最小转录因子Cro | 合成生物学 | NA | CIS展示 | NA | NA | 从10^6的起始频率中富集1个Cro蛋白 | CIS展示系统 | NA | NA | 合成生物学、医学 |
| 77 | 2026-07-01 |
Modifications of Prenyl Side Chains in Natural Product Biosynthesis
2024-12-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202415279
PMID:39363683
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综述 | 本综述总结了天然产物生物合成中异戊二烯侧链的修饰机制及其对结构和功能多样性的贡献 | 揭示了环氧化、脱氢、甲基氧化为羧基、非常规C-C键断裂和氧化环化等新型生物合成机制 | 未具体说明局限性 | 指导异戊二烯侧链修饰的发现、表征和应用 | 天然产物生物合成中的异戊二烯侧链修饰 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 合成生物学 |
| 78 | 2026-06-30 |
Expanding the capabilities of MuGENT for large-scale genetic engineering of the fastest-replicating species, Vibrio natriegens
2024-06-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03964-23
PMID:38667341
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研究论文 | 扩展MuGENT技术在快速复制物种Vibrio natriegens大规模基因工程中的应用 | 鉴定中性插入位点并展示两次选择性标记交换方法,首次实现MuGENT用于异位染色体位点的基因插入,开发可靠质粒消除方法,构建280 kb大规模缺失 | 未讨论缺失对细胞生理的影响或长期稳定性 | 提升Vibrio natriegens的基因工程能力,推动其作为合成生物学模型生物的应用 | Vibrio natriegens细菌 | 合成生物学 | NA | MuGENT, 自然转化, 靶向诱变 | NA | NA | NA | MuGENT | Vibrio natriegens | 基因插入回路, 大规模缺失回路 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 79 | 2026-06-26 |
Choreographing root architecture and rhizosphere interactions through synthetic biology
2024-02-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45272-5
PMID:38355570
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综述 | 通过合成生物学方法调控根系结构及其与根际微生物的互作,以应对气候变化对农业的挑战 | 首次系统阐述将合成遗传电路从微生物扩展到多细胞植物,用于调控根系形态、分泌物及根际微生物活动的创新策略 | NA | 探索利用合成生物学工具设计气候适应型作物的根系功能及根际互作 | 植物根系及其相关微生物群落 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路 | NA | NA | NA | NA | 植物(多细胞物种) | 用于调控根系结构、分泌作用和根表面微生物活动的合成遗传电路 | 农业, 环境 |
| 80 | 2026-06-20 |
A Survey of Recent Practice of Artificial Life in Visual Art
2024-02-01, Artificial life
IF:1.6Q2
DOI:10.1162/artl_a_00433
PMID:38393968
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综述 | 对过去40年视觉艺术中人工生命实践的文献综述,提出分类标准与分类体系 | 首次系统梳理视觉艺术领域中人工生命作品,建立分类标准与术语体系 | 仅关注计算与软件领域,未涵盖硬件艺术实现形式 | 系统性概述艺术家如何理解自然并用现代技术创造新生命 | 视觉艺术中的人工生命作品 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 艺术 |