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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Robust genetic codes enhance protein evolvability
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002594
PMID:38754362
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研究论文 | 通过大规模并行实验分析数百种重编程遗传密码对蛋白质进化能力的影响 | 首次系统证明稳健遗传密码通过创造平滑的适应性景观来增强蛋白质进化能力,并发现标准遗传密码在进化能力方面并非最优 | 进化能力最优化的遗传密码在一定程度上取决于氨基酸序列与蛋白质功能的具体关系 | 探究遗传密码的稳健性对蛋白质进化能力的影响机制 | mRNA序列和蛋白质功能关系 | 合成生物学 | NA | 大规模并行序列到功能分析 | 适应性景观模型 | 序列数据 | 每个景观包含超过1600万条mRNA序列 | 遗传密码重编程 | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 |
| 62 | 2025-10-05 |
Deconstructing synthetic biology across scales: a conceptual approach for training synthetic biologists
2024-Jun-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49626-x
PMID:38926339
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研究论文 | 提出一个跨尺度的合成生物学培训框架,用于培养合成生物学人才 | 开发了从分子到社会层面的多尺度解构方法,提供跨学科概念整合工具 | NA | 建立合成生物学教育培训框架 | 合成生物学学生和教育工作者 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 63 | 2025-10-05 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明水通道蛋白Aqp1可作为安全的遗传报告基因,在多种细胞类型中产生磁共振信号且不影响细胞生理功能 | 首次系统证明Aqp1过表达不会引起内质网应激,且不影响多种天然生物活性,解决了其作为深层组织报告基因的安全性问题 | 研究仅限于小鼠和人类细胞系,尚未在活体动物模型中进行验证 | 评估Aqp1作为遗传报告基因在磁共振成像中的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 成像数据 | 多种小鼠和人类细胞系 | 遗传编码 | 小鼠细胞, 人类细胞 | 水通道蛋白生物传感器 | 医学 |
| 64 | 2025-10-05 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
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研究论文 | 本研究开发了从天然微生物筛选到异源宿主中实现持续几丁质酶活性的完整流程 | 建立了从天然微生物发现到异源宿主稳定表达的系统性方法,并发现了在胶体几丁质存在时能上调表达的感应响应型启动子 | 未明确说明在非标准宿主中实现长期活性的具体挑战和解决方案细节 | 实现异源宿主中持续几丁质酶活性的稳定表达 | 海洋微生物来源的几丁质酶基因及异源宿主系统 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序、异源表达、核糖体结合位点优化 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 海洋水样筛选的微生物 | Gibson Assembly, iGEM | 标准宿主, 非标准宿主 | 感应响应型生物传感器、代谢通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 65 | 2025-10-05 |
Characterization of intracellular membrane structures derived from a massive expansion of endoplasmic reticulum (ER) membrane due to synthetic ER-membrane-resident polyproteins
2024-01-01, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erad364
PMID:37715992
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研究论文 | 本研究通过合成内质网膜驻留多蛋白诱导内质网大规模扩张,系统表征了由此形成的膜结构及其特性 | 首次详细表征了由合成多蛋白诱导的内质网衍生膜区室,揭示了胞质面寡聚化结构域的关键作用及区室与内质网间的扩散屏障 | 研究主要局限于烟草和拟南芥两种模式植物,尚未在其他植物物种中验证 | 探索合成生物学方法改造植物内质网膜结构的可行性及其应用潜力 | 烟草和拟南芥植物细胞中的内质网衍生膜区室 | 合成生物学 | NA | 荧光漂白恢复技术、定量图像分析 | NA | 荧光显微镜图像 | 转基因烟草和拟南芥植株 | 重组蛋白表达 | 烟草, 拟南芥 | 内质网膜驻留多蛋白系统,包含胞质面寡聚化结构域 | 农业, 工业生物技术 |
| 66 | 2025-10-05 |
Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599076
PMID:38915713
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研究论文 | 本研究应用迭代深度学习设计在两种人类细胞系间具有强差异活性的合成增强子 | 首次将迭代深度学习应用于合成增强子设计,通过实验验证与模型重新优化的循环策略实现细胞类型特异性 | 仅针对两种人类细胞系进行验证,尚未在更广泛的细胞类型中测试 | 解决合成生物学中基因表达细胞类型特异性靶向的重要问题 | 人类合成增强子序列 | 机器学习 | NA | 深度学习,染色质可及性分析,转录因子结合位点分析,单细胞水平表达分析 | 深度学习模型 | 基因组序列数据,增强子活性数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 人类细胞系 | 合成增强子设计,包含浓缩序列语法和选择性转录因子结合位点词汇 | 医学,合成生物学 |
| 67 | 2025-10-05 |
Robust soybean leaf agroinfiltration
2024-Jun-05, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-024-03245-4
PMID:38837057
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研究论文 | 开发了一种适用于大豆叶片的稳健农杆菌浸润介导的瞬时基因表达方法 | 建立了首个针对大豆叶片的优化农杆菌浸润方法,确定了影响成功的关键参数 | 方法仅针对大豆特定品种和生长阶段进行验证,未在其他作物中广泛测试 | 开发适用于大豆的瞬时基因表达技术平台 | 大豆叶片(品种V17-0799DT和TN16-5004) | 植物生物技术 | NA | 农杆菌浸润法 | NA | 基因表达数据 | 两个大豆品系 | 农杆菌介导转化 | 大豆(Glycine max) | 报告基因表达系统(GUS、荧光蛋白、RUBY报告系统) | 农业 |
| 68 | 2025-10-05 |
Systematic review on marine carbon source-mannitol: Applications in synthetic biology
2024-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127881
PMID:39241502
|
综述 | 系统综述海洋碳源甘露醇在合成生物学中的应用现状与前景 | 首次系统总结甘露醇作为海洋碳源在合成生物学中的双重应用:既作为遗传回路诱导剂又作为高价值化学品生物制造的碳源 | NA | 提升甘露醇在合成生物学中应用的竞争力,改善生物合成过程的效率 | 甘露醇作为海洋碳源及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 多种微生物宿主 | 遗传回路控制、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 69 | 2025-10-05 |
pLxIS-containing domains are biochemically flexible regulators of interferons and metabolism
2024-Jul-11, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.05.030
PMID:38925114
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研究论文 | 本研究通过合成生物学平台发现含pLxIS基序的信号传导蛋白具有调控干扰素反应和代谢活动的多样化功能机制 | 首次发现两个孤儿pLxIS蛋白能独立于已知模式识别受体通路激活干扰素反应,并揭示pLxIS作为多基序信号实体的功能多样性 | NA | 探索pLxIS基序在干扰素反应和代谢调控中的新功能机制 | 含pLxIS基序的信号传导蛋白及其调控通路 | 合成生物学 | 病毒感染 | 合成生物学平台 | NA | 生化数据 | NA | NA | 人类细胞 | 多基序信号实体 | 医学 |
| 70 | 2025-10-05 |
Advancements in the Application of Ribosomally Synthesized and Post-Translationally Modified Peptides (RiPPs)
2024-Apr-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040479
PMID:38672495
|
综述 | 本文综述了核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)在治疗应用中的最新进展 | 结合传统生物化学与当代合成生物学方法,开发新型RiPP类似物和高效筛选技术 | NA | 探讨RiPPs的治疗应用潜力及生产技术发展 | 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs) | 合成生物学 | NA | 异源表达、遗传重构、mRNA展示、表面展示、双杂交系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 71 | 2025-10-05 |
Antibacterial activity and biosynthetic potential of Streptomyces sp. PBR19, isolated from forest rhizosphere soil of Assam
2024-Dec, Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology]
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s42770-024-01454-3
PMID:38985434
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研究论文 | 从印度阿萨姆森林根际土壤中分离的链霉菌PBR19具有抗菌活性和生物合成潜力 | 发现可能为新分类单元的链霉菌PBR19,其含有与抗生素合成相关的II型聚酮合酶基因,对ESKAPE病原体表现出显著抗菌活性 | NA | 探索森林根际土壤来源的链霉菌的抗菌活性和生物合成潜力 | 链霉菌PBR19及其代谢产物 | 微生物学 | 细菌感染 | 扫描电子显微镜(SEM)、基因测序、最小抑菌浓度(MIC)测定 | NA | 基因序列数据、显微镜图像、化学分析数据 | 1个链霉菌分离株(PBR19) | NA | 链霉菌(Streptomyces sp.) | NA | 医药 |
| 72 | 2025-10-05 |
Engineering Synthetic Erythrocytes as Next-Generation Blood Substitutes
2024-Jul-10, Advanced functional materials
IF:18.5Q1
DOI:10.1002/adfm.202315879
PMID:39386164
|
综述 | 本文综述了人造红细胞作为下一代血液替代品的研究进展,重点介绍了合成工程红细胞的开发策略 | 从材料工程角度重新定义红细胞,结合合成生物学和纳米技术构建功能完整的合成红细胞 | NA | 解决全球血液短缺问题,开发安全可扩展的血液替代品 | 工程化红细胞和血液替代品 | NA | NA | 合成生物学、纳米技术、粒子制造 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、制药 |
| 73 | 2025-10-05 |
Synthetic biology of metabolic cycles for Enhanced CO2 capture and Sequestration
2024-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107774
PMID:39260160
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研究论文 | 本文描述了一种名为THETA循环的改良三羧酸循环系统在大肠杆菌中用于碳固定和氨基酸合成 | 开发了名为THETA循环的新型代谢循环系统,将传统单向TCA循环改造为可用于碳固定的双向循环 | NA | 开发合成生物学代谢循环系统以增强二氧化碳捕获和封存能力 | 大肠杆菌代谢系统和THETA循环模块 | 合成生物学 | NA | 酶优化、路径重新设计、异源表达 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | THETA代谢循环,包含三个模块:丙酮酸到琥珀酸转化、琥珀酸到巴豆酰辅酶A转化、巴豆酰辅酶A到乙酰辅酶A和丙酮酸转化 | 环境, 能源 |
| 74 | 2025-10-05 |
Recent progress in stimuli-responsive DNA-based logic gates: Design, working principles and biological applications
2024-Mar, Smart molecules : open access
DOI:10.1002/smo.20230023
PMID:40625523
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综述 | 本文综述了刺激响应型DNA逻辑门的设计原理、工作机制及生物应用的最新进展 | 系统总结了由金属离子、pH、寡核苷酸、小分子、蛋白质和光等多种刺激触发的DNA逻辑门设计 | NA | 探讨刺激响应型DNA逻辑门在合成生物学和纳米技术领域的应用前景 | 基于DNA分子的刺激响应型逻辑门 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | 逻辑门 | NA | NA | NA | NA | 刺激响应型逻辑门(包括与门、或门、非门等逻辑运算单元) | 医学, 合成生物学, 纳米技术 |
| 75 | 2025-10-05 |
Expression of microbial lipase in filamentous fungus Aspergillus niger: a review
2024-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-024-03998-5
PMID:38841267
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综述 | 综述了微生物脂肪酶在丝状真菌黑曲霉中表达的相关研究进展 | 整合了微生物脂肪酶的最新数据,重点讨论了通过CRISPR/Cas9基因编辑技术提高脂肪酶表达效率的策略 | NA | 提高微生物脂肪酶在黑曲霉中的表达效率 | 微生物脂肪酶及其在黑曲霉中的表达系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 黑曲霉 | 脂肪酶表达系统 | 能源,食品,日化,制药,工业生物技术 |
| 76 | 2025-10-05 |
Context-dependent redesign of robust synthetic gene circuits
2024-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.003
PMID:38320912
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综述 | 本文概述了合成基因回路与宿主细胞间环境依赖性相互作用及其对回路性能的影响,并总结了减轻这些不良效应的控制策略 | 系统总结了宿主感知和资源感知的合成基因回路设计最新进展,特别关注生长反馈和资源竞争等新兴回路-宿主相互作用机制 | NA | 理解合成基因回路与宿主细胞间的复杂关系及其对合成生物工程流程的影响 | 合成基因回路与宿主细胞的相互作用机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞 | 合成基因回路 | 工业生物技术 |
| 77 | 2025-10-05 |
TidyTron: Reducing lab waste using validated wash-and-reuse protocols for common plasticware in Opentrons OT-2 lab robots
2024-Apr, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.08.007
PMID:37696493
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研究论文 | 开发并验证了用于Opentrons OT-2实验室机器人清洗常见塑料器件的开源协议库TidyTron,以减少实验室塑料废物 | 首次开发了使用低成本实验室机器人自动化清洗单次使用塑料器件的开源验证协议,实现了对DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的有效去污 | 仅验证了特定类型的塑料器件(微量移液器吸头和微孔板)和特定污染物(DNA、E. coli、S. cerevisiae) | 通过自动化清洗和重复使用单次使用塑料器件,提高生物技术实验室的可持续性并降低重复成本 | 被DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的微量移液器吸头和微孔板 | 合成生物学 | NA | qPCR, 流式细胞术, 菌落形成单位测定 | NA | 实验数据 | NA | Opentrons OT-2 | E. coli, S. cerevisiae | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 78 | 2025-10-05 |
Reconfigurable nanomaterials folded from multicomponent chains of DNA origami voxels
2024-11-27, Science robotics
IF:26.1Q1
DOI:10.1126/scirobotics.adp2309
PMID:39602517
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研究论文 | 开发了一种基于DNA折纸体素的可重构纳米材料系统,通过可编程三维连接实现多种结构的快速重构 | 提出了模块化DNA折纸体素系统,实现了局部连接在柔性和刚性状态间的可编程切换,以及通过柔性链中间体组装提高产率的新方法 | 当前合成系统在分层组装中产率较低,在不同结构间快速高效重构仍面临挑战 | 开发可重构的DNA纳米材料组装系统 | DNA折纸体素及其组装结构 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | 12种独特体素原型构建50种结构 | DNA折纸 | NA | 可编程三维连接系统,柔性链中间体组装路径 | 合成生物学, 无机材料组装, 纳米医学 |
| 79 | 2025-10-05 |
The specificity of intermodular recognition in a prototypical nonribosomal peptide synthetase depends on an adaptor domain
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9404
PMID:38896613
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研究论文 | 本研究通过核磁共振和质谱技术揭示了tomaymycin非核糖体肽合成酶中模块间识别与载体蛋白特异性偶联的机制 | 发现了一个适配器结构域可直接将负载的载体蛋白从起始模块招募至延伸模块,并揭示了其作用机制 | NA | 探索非核糖体肽合成酶中模块间识别的生物物理原理 | tomaymycin非核糖体肽合成酶 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱, 质谱 | NA | 光谱数据 | NA | NA | NA | 非核糖体肽合成酶工程化设计 | 医药 |
| 80 | 2025-10-05 |
Beyond the Organism versus Machine Dichotomy: A Review of Ethical Concerns in Synthetic Biology
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00456
PMID:38070167
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综述 | 本文系统回顾并分析了合成生物学引发的伦理问题,重点关注生命干预的道德考量与生物安全风险 | 突破传统有机体与机器的二元对立框架,首次系统梳理合成生物学伦理研究的关注点分布与缺失 | 缺乏对实验室日常研究中实际伦理问题的系统性调查 | 探讨合成生物学的伦理与社会影响 | 合成生物学伦理研究文献 | NA | NA | 系统综述、主题分析 | NA | 文本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |