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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2024-12-15 |
Fabrication of cyborg bacterial cells as living cell-material hybrids using intracellular hydrogelation
2024-Dec, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01035-6
PMID:39174659
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研究论文 | 本文描述了一种在细菌细胞内组装合成聚合物网络的协议,使其失去细胞分裂能力并抵抗环境压力 | 提出了将细菌转化为单生命周期设备的新方法,结合了合成材料的工程简单性和天然细胞的功能性 | 实施该协议需要微生物学技术、水凝胶化学、荧光显微镜和流式细胞术的专业知识 | 开发一种新的细胞底盘,结合合成材料的工程简单性和天然细胞的功能性 | 细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 水凝胶化 | NA | NA | NA |
62 | 2024-12-15 |
Unlocking the potential of Cupriavidus necator H16 as a platform for bioproducts production from carbon dioxide
2024-Nov-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04200-x
PMID:39572451
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综述 | 探讨了Cupriavidus necator H16作为将二氧化碳转化为多种产品的宿主平台的潜力 | 综述了合成生物学工具包、气体发酵技术和工程方法的进展,并提出了提高C. necator H16二氧化碳固定能力的建议 | 讨论了C. necator H16在转化效率和产品种类范围方面的局限性 | 探索如何利用C. necator H16将二氧化碳转化为有价值的产品,以应对气候变化 | 研究对象为Cupriavidus necator H16及其代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
63 | 2024-12-15 |
Incorporation of photosynthetically active algal chloroplasts in cultured mammalian cells towards photosynthesis in animals
2024-Nov-11, Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences
DOI:10.2183/pjab.100.035
PMID:39477444
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研究论文 | 本研究将来自原始红藻Cyanidioschyzon merolae的光合活性叶绿体引入培养的哺乳动物细胞中,并验证了其在细胞内的光合作用活性 | 首次成功将光合活性叶绿体引入哺乳动物细胞并维持其光系统II的电子传递活性 | 仅在体外培养的哺乳动物细胞中进行了短期实验,未验证在完整动物体内的长期效果 | 探索在哺乳动物细胞中实现人工光合作用的可能性 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | 共培养技术 | NA | 细胞 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 |
64 | 2024-12-15 |
Advances and challenges in synthetic biology for mosquito control
2024-01, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2023.11.001
PMID:38000957
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综述 | 本文综述了利用合成生物学控制蚊媒疾病的现状、未来目标以及基因编辑在全球健康防御中的重要性 | 探讨了利用合成生物学增强蚊子对病原体的抵抗力或消除蚊媒的创新方法 | 未具体讨论合成生物学方法的实际应用效果或局限性 | 探讨利用合成生物学控制蚊媒疾病的创新方法及其在全球健康防御中的重要性 | 蚊媒疾病及其传播媒介蚊子 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
65 | 2024-12-14 |
Herbal Multiomics Provide Insights into Gene Discovery and Bioproduction of Triterpenoids by Engineered Microbes
2024-Dec-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08372
PMID:39666531
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综述 | 本文综述了通过多组学技术揭示三萜类化合物生物合成途径及其在工程微生物中的异源生产的研究进展 | 本文介绍了通过多组学技术在药用植物中识别新的三萜类化合物生物合成途径,并讨论了代谢工程策略以提高底盘细胞中三萜类化合物的生产水平 | NA | 探讨三萜类化合物生物合成途径及其在工程微生物中的生产 | 三萜类化合物及其生物合成途径 | 代谢工程 | NA | 多组学技术 | NA | NA | NA |
66 | 2024-12-14 |
Suppression of amber stop codons impairs pathogenicity in Salmonella
2024-Dec-12, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15075
PMID:39666825
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研究论文 | 研究展示了UAG终止密码子的抑制对沙门氏菌致病性的影响 | 首次揭示了UAG终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的选择性影响 | 仅研究了UAG终止密码子的抑制作用,未探讨其他终止密码子的影响 | 探讨终止密码子抑制对细菌致病性的影响 | 沙门氏菌的致病性及SPI-1基因的表达 | NA | NA | 遗传分析和生化分析 | NA | NA | NA |
67 | 2024-12-14 |
Principles for introducing new genes and species for conservation
2024-Dec-11, Trends in ecology & evolution
IF:16.7Q1
DOI:10.1016/j.tree.2024.11.011
PMID:39667987
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研究论文 | 本文提出了将新基因和新物种引入生态系统的原则,以帮助保护生物学家和公众应对复杂的决策 | 本文结合了生物学、法律、社会、文化和伦理考虑,提出了一套综合原则,旨在帮助管理者应对高风险的保护决策 | 本文未详细讨论具体的技术实施细节或案例研究 | 提出一套综合原则,帮助保护管理者应对新兴技术带来的复杂决策 | 新基因和新物种的引入对生态系统的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
68 | 2024-12-14 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2024-Dec-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
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综述 | 本文综述了合成生物学和人工智能在作物改良中的应用 | 提出了通过AI赋能的合成生物技术开发自监测、适应和响应技术(SMART)作物的概念 | 缺乏对AI驱动的合成生物学途径在植物工程中的系统性综述 | 探讨合成生物学在作物改良中的基本工程原理及其应用 | 作物改良中的合成生物学和人工智能应用 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、合成核酸和蛋白质技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程和人工智能 | NA | NA | NA |
69 | 2024-12-14 |
Genetically Engineered Liposwitch-Based Nanomaterials
2024-Dec-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c01388
PMID:39495202
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研究论文 | 本文探讨了使用基因工程脂开关调控无序蛋白驱动的纳米组装 | 提出了“脂开关”概念,通过结合别构效应和翻译后修饰来调控融合蛋白的组装 | NA | 开发一种新的策略来控制无序蛋白驱动的纳米组装 | 无序蛋白和球状蛋白的融合纳米材料 | 合成生物学 | NA | 动态光散射、冷冻透射电子显微镜 | NA | 蛋白质 | NA |
70 | 2024-12-14 |
Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila
2024-Dec-03, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.11.021
PMID:39667935
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研究论文 | 本文研究了果蝇中通过染色体间接触在不同世代间传递表观遗传信息的过程 | 首次展示了pleiohomeotic和GAGA因子在建立和维持跨代表观遗传继承中的作用,并证明了染色质接触本身可以建立跨代表观遗传继承 | NA | 探讨跨代表观遗传继承的机制 | 果蝇中的Fab-7调控元件和H3K27me3组蛋白标记 | 表观遗传学 | NA | 合成生物学系统 | NA | 染色质接触 | NA |
71 | 2024-12-14 |
Towards AI-designed genomes using a variational autoencoder
2024-Dec, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2024.1457
PMID:39657811
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研究论文 | 本文开发了一个概念验证框架,利用变分自编码器训练机器学习算法来建模细菌基因组组成 | 提出了DeepGenomeVector模型,能够有效捕捉基因组网络中的复杂依赖关系,并通过定性和定量指标验证了其性能 | 本文仅展示了概念验证,尚未实现AI设计完整基因组的能力 | 探索机器学习在合成生物学中的应用,展示AI设计基因组的可能性 | 细菌基因组及其编码的基因网络 | 机器学习 | NA | 变分自编码器 | 变分自编码器 | 基因组数据 | NA |
72 | 2024-12-14 |
Deciphering substrate promiscuity and specificity of indolethylamine N-methyltransferase family enzymes from amphibian toads
2024-Dec, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107950
PMID:39522428
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研究论文 | 研究从蟾蜍中鉴定出的七种吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶的底物多样性和特异性 | 通过分子对接和关键氨基酸突变,解释了这些酶的底物多样性和特异性机制 | NA | 探讨蟾蜍中吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶的催化机制 | 蟾蜍中的七种吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶 | 生物化学 | NA | 分子对接,氨基酸突变 | NA | 蛋白质 | 七种酶 |
73 | 2024-12-14 |
A directed enolization strategy enables by-product-free construction of contiguous stereocentres en route to complex amino acids
2024-Jul, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01473-5
PMID:38565976
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研究论文 | 本文展示了一种铱催化策略,通过直接上转换简单烯烃和甘氨酸衍生物,合成具有β-立体中心的α-氨基酸 | 该方法利用甘氨酸衍生的N-H单元的天然导向能力,促进铱催化的邻近羰基的烯醇化,从而实现高水平的区域和立体控制,且具有完全的原子经济性 | NA | 开发一种高效的合成方法,用于合成具有β-立体中心的α-氨基酸 | 具有β-立体中心的α-氨基酸 | NA | NA | 铱催化 | NA | NA | NA |
74 | 2024-12-13 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2024-Dec-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本文开发了位点特异性交联探针,用于约束和解析载体蛋白与其酶域之间的相互作用,揭示了非核糖体肽生物合成中的模块间凝聚现象 | 首次应用四嗪点击化学捕获了酪胺酸生物合成中两个载体蛋白在缩合域活性位点的凝聚过程,并报告了该复合物的高分辨率冷冻电镜结构 | NA | 揭示非核糖体肽合成酶的分子细节,并为未来合成生物学设计提供关键信息 | 非核糖体肽合成酶中的载体蛋白与酶域之间的相互作用 | NA | NA | 四嗪点击化学,冷冻电镜(cryo-EM),X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA |
75 | 2024-12-13 |
Dynamic processes of fate decision in inducible bistable systems
2024-Dec-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.10.015
PMID:39478343
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研究论文 | 本文研究了诱导型双稳态系统中命运决定的动态过程 | 本文提出了稳态参数决定命运决定景观的观点,并强调了动态过程在命运决定中的重要性 | 本文主要关注理论模型,未涉及实验验证 | 探讨基因调控网络中命运决定的动态过程 | 诱导型双稳态系统中的命运决定过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
76 | 2024-12-13 |
Multiplex Expression Cassette Assembly: A flexible and versatile method for building complex genetic circuits in conventional vectors
2024-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14454
PMID:39175411
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Multiplex Expression Cassette Assembly (MECA)的方法,用于在常规载体中构建复杂的遗传电路 | MECA方法通过修改与Golden Gate Assembly兼容的载体,使用嵌入连接语法的引物放大功能元件,能够在不需要专用载体和标准化模块库的情况下,通过两轮Golden Gate组装反应构建复杂结构 | NA | 开发一种灵活且通用的方法来构建复杂的遗传电路,以在合成生物学中实现多种功能,并在作物育种中提高生产力和整体性能 | 复杂的遗传电路构建,以及在烟草和番茄中的基因编辑和代谢产物生产 | 合成生物学 | NA | Golden Gate Assembly | NA | NA | 涉及烟草、番茄和Escherichia coli等多种植物和微生物样本 |
77 | 2024-12-13 |
Securing Commercial Nucleic Acid Synthesis
2024-Dec, Rand health quarterly
PMID:39664983
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综述 | 本文综述了商业核酸合成的安全问题,评估了当前的筛查状态,并提出了加强筛查的建议 | 本文提出了加强商业核酸合成筛查的建议,扩展并强化了政府沟通、行业联盟规则和最佳实践 | 本文主要基于现有文献和政策建议,缺乏实证研究 | 评估当前商业基因合成筛查的现状,并提出加强筛查的建议 | 商业核酸合成的安全问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
78 | 2024-12-13 |
Harnessing regulatory networks in Actinobacteria for natural product discovery
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae011
PMID:38569653
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综述 | 本文综述了放线菌中调控网络在天然产物发现中的应用 | 提出了基于调控指导的基因组挖掘方法,以激活生物合成基因簇(BGCs)的表达,并优先选择特定BGCs进行表达 | 当前随机筛选生物活性化合物的投资回报率低,且难以预测哪些BGCs应优先考虑 | 探讨如何优先选择和激活放线菌中的生物合成基因簇,以促进天然产物的发现 | 放线菌中的生物合成基因簇及其调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
79 | 2024-12-13 |
Expanding the synthetic biology toolbox of Cupriavidus necator for establishing fatty acid production
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae008
PMID:38366943
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研究论文 | 本文开发并优化了Cupriavidus necator的基因表达和基因组工程工具箱,以促进脂肪酸生产 | 验证并表征了一组诱导性和组成性启动子,设计并测试了RBS库,研究了密码子优化对基因表达的影响 | 仍需克服一些障碍,使C. necator广泛用于生物合成过程 | 开发和优化Cupriavidus necator的基因表达和基因组工程工具箱 | Cupriavidus necator中的启动子、RBS和密码子优化 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 基因表达数据 | 一组诱导性和组成性启动子,一个RBS库,gfp和mCherry基因的密码子优化变体 |
80 | 2024-12-13 |
Using Euf1 transcription factor as a titrator of erythritol-inducible promoters in Yarrowia lipolytica; insight into the structure, splicing, and regulation mechanism
2024-Jan-09, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foae027
PMID:39169472
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研究论文 | 本研究使用Euf1转录因子作为调节因子,探索其在Yarrowia lipolytica中对赤藓糖醇诱导型启动子的调控机制 | 通过使用Euf1转录因子作为启动子调节因子,扩展了合成启动子的可调性,并提出了Euf1调控启动子作用的新机制 | 研究中Euf1的过表达导致启动子的赤藓糖醇诱导特性丧失 | 探索合成生物学中可控调节元件的调控机制 | Euf1转录因子及其在Yarrowia lipolytica中的调控作用 | 合成生物学 | NA | 转录因子调控 | NA | 转录组数据 | NA |