合成生物学相关文章
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当前共找到 1126 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Regulation of daptomycin biosynthesis in Streptomyces roseosporus: new insights from genomic analysis and synthetic biology to accelerate lipopeptide discovery and commercial production
2024-12-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00024b
PMID:39279757
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综述 | 本文通过基因组分析和合成生物学方法研究玫瑰孢链霉菌中达托霉素生物合成的调控机制 | 发现高产菌株在达托霉素生物合成基因簇的大启动子区域存在两个突变，并鉴定出十个可用于代谢工程调控的正负调控基因 | NA | 通过基因组分析和合成生物学方法加速脂肽类抗生素的发现和商业化生产 | 玫瑰孢链霉菌及其达托霉素生物合成基因簇 | 合成生物学 | 革兰氏阳性菌感染 | 基因组测序、代谢工程、合成生物学、诱变育种 | NA | 基因组序列数据 | 两种菌株（野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株） | 代谢工程,合成生物学,定向诱变 | 玫瑰孢链霉菌 | 达托霉素生物合成基因簇，包含九个翻译偶联基因 | 医药 |
| 62 | 2025-10-05 |
Strategies for developing phages into novel antimicrobial tailocins
2024-10, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.03.003
PMID:38580606
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综述 | 本文综述了利用噬菌体作为支架开发新型尾蛋白抗生素的策略 | 提出通过合成生物学方法以具有收缩尾的噬菌体为支架开发尾蛋白，释放其抗菌潜力 | NA | 开发新型尾蛋白抗生素以解决天然尾蛋白多样性有限的问题 | 噬菌体尾部和尾蛋白的结构与功能 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 尾蛋白生物合成途径 | 医药 |
| 63 | 2025-10-05 |
Mutagenesis techniques for evolutionary engineering of microbes - exploiting CRISPR-Cas, oligonucleotides, recombinases, and polymerases
2024-09, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.02.006
PMID:38493013
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综述 | 本文总结了微生物进化工程领域的最新进展，重点介绍了利用CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶和聚合酶等技术增强微生物遗传多样性的方法 | 系统比较了多种现代诱变技术，特别强调通过合成生物学和CRISPR-Cas技术实现突变类型和位置的可控性 | 主要聚焦于模式微生物，未全面涵盖非模式工业微生物的应用 | 开发高效微生物进化工程技术以优化工业微生物性能 | 工业微生物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 寡核苷酸介导诱变, 重组酶技术, 聚合酶工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 模式微生物 | 代谢途径优化 | 工业生物技术 |
| 64 | 2025-10-05 |
Unveiling Amaryllidaceae alkaloids: from biosynthesis to antiviral potential - a review
2024-05-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00044c
PMID:38131392
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综述 | 本文综述了石蒜科生物碱从生物合成到抗病毒潜力的研究进展 | 整合了2017-2023年最新研究成果，强调合成和对映选择性研究在验证生物合成结论中的关键作用，并确立其作为抗病毒先导化合物的潜力 | 生物合成途径尚未完全阐明，需要进一步跨学科研究来理解结构-活性关系 | 系统梳理石蒜科生物碱的生物合成途径及其抗病毒应用潜力 | 石蒜科生物碱及其生物合成途径 | 天然产物化学与合成生物学 | 病毒性疾病 | 天然产物化学、合成有机化学、生物化学、系统生物学、合成生物学 | NA | 文献资料与实验数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 65 | 2025-10-05 |
Bacterial cyclophane-containing RiPPs from radical SAM enzymes
2024-05-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00030c
PMID:38047390
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综述 | 本文重点介绍由自由基SAM/SPASM酶催化的细菌单芳基环烷结构RiPPs天然产物的生物合成途径、发现方法和应用前景 | 系统总结了2016-2023年间细菌环烷结构RiPPs的研究进展，重点关注其独特的生物合成机制和药物开发潜力 | 仅聚焦于细菌来源的单芳基环烷RiPPs，未涵盖其他类型环烷结构或真核生物来源的RiPPs | 探讨含环烷结构的核糖体合成后修饰肽（RiPPs）的生物合成途径、酶学机制和应用价值 | 细菌来源的环烷结构RiPPs天然产物及其生物合成酶 | 天然产物化学 | 细菌感染 | 自由基SAM/SPASM酶催化 | NA | 文献综述 | NA | NA | 细菌 | NA | 药物发现, 合成生物学 |
| 66 | 2025-10-05 |
The biosynthetic logic and enzymatic machinery of approved fungi-derived pharmaceuticals and agricultural biopesticides
2024-04-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00040k
PMID:37990930
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综述 | 系统阐述真菌来源天然产物的生物合成逻辑与酶学机制及其在药物和农用生物农药开发中的应用 | 整合基因组挖掘与合成生物学策略，提出通过理性设计扩展真菌天然产物化学多样性的新途径 | 未明确说明具体技术实施的技术瓶颈与转化应用的时间周期 | 解析已批准真菌源药物和生物农药的生物合成机制并探索其合成生物学改造策略 | 真菌来源的天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、异源重建、代谢工程 | NA | 基因组数据、酶学数据 | NA | 异源表达宿主 | 真菌 | 聚酮合酶(PKS)、非核糖体肽合成酶(NRPS)、PKS/NRPS杂合系统、萜类、吲哚生物碱的生物合成途径 | 医药, 农业 |
| 67 | 2025-10-05 |
Simple phenylpropanoids: recent advances in biological activities, biosynthetic pathways, and microbial production
2024-01-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00012e
PMID:37807808
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综述 | 概述简单苯丙素类化合物的生物活性、不同物种的生物合成途径及微生物生产工程策略 | 系统比较植物/细菌/真菌的生物合成路径差异，总结近十年微生物生产的关键工程策略 | 基于文献综述未涉及原始实验数据 | 探讨简单苯丙素类化合物的可持续微生物生产方案 | 简单苯丙素类化合物（C6-C3骨架天然产物） | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径工程 | 香料,营养品,生物材料,制药 |
| 68 | 2025-10-05 |
Research Progress on the Assembly of Large DNA Fragments
2024-04-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400054
PMID:38477700
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综述 | 本文综述了合成生物学中大片段DNA组装技术的研究进展，重点关注在不同宿主中的组装方法和挑战 | 聚焦于大片段DNA组装这一技术难点，系统比较了在大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母等不同宿主中的组装方法 | NA | 总结DNA组装技术的发展现状，特别是大片段DNA组装的研究进展 | DNA组装技术，特别是大片段DNA组装方法 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 酿酒酵母 | NA | 生物医学, 生物燃料, 新材料 |
| 69 | 2025-10-05 |
A new mRNA structure prediction based approach to identifying improved signal peptides for bone morphogenetic protein 2
2024-05-23, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00858-1
PMID:38783306
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研究论文 | 开发了一种基于mRNA结构预测的信号肽筛选方法，用于改进骨形态发生蛋白2的生产 | 首次结合氨基酸序列和mRNA二级结构预测来系统筛选信号肽，将MXFold2等计算工具应用于信号肽工程 | mRNA结构预测工具在此应用中可靠性不足，筛选的信号肽在C2C12细胞中活性均不如天然序列 | 开发基于计算预测的信号肽筛选方法，提高BMP2蛋白的生产效率 | 骨形态发生蛋白2（BMP2）及其信号肽 | 合成生物学 | 骨科疾病 | mRNA结构预测，信号肽活性预测，细胞培养实验 | SignalP，DeepLoc，MXFold2 | 氨基酸序列，核苷酸序列 | 2,611个TGF-β超家族信号肽，7个选定序列进行体外测试 | NA | HEK293T细胞，C2C12细胞 | NA | 医学 |
| 70 | 2025-10-05 |
Engineering a Self-Assembled Protein Cage for Targeted Dual Functionalization
2024-07-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c01693
PMID:39017718
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研究论文 | 本研究开发了一种能够独立招募两种不同目标蛋白的自组装蛋白笼Mi3，实现了在体外和活细胞内的双重功能化 | 首次将SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag两种化学方法整合到单一蛋白笼中，实现了两种不同目标蛋白的独立可控定位 | NA | 开发能够同时负载多种功能蛋白的自组装蛋白笼平台 | 自组装蛋白笼Mi3及其双重功能化系统 | 合成生物学 | NA | SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag蛋白质连接技术 | NA | 蛋白质组装数据、荧光成像数据、酶活性数据 | NA | 蛋白质工程 | 活细胞 | 双重功能化蛋白笼系统，可同时负载膜靶向肽和酶蛋白 | 医学, 合成生物学 |
| 71 | 2025-10-05 |
Unpaired cysteine insertions favor transmembrane dimerization and induce ligand-independent constitutive cytokine receptor signaling
2024-07-26, Biological chemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1515/hsz-2023-0344
PMID:38695485
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研究论文 | 本研究揭示了跨膜区PPCL插入突变如何诱导细胞因子受体发生配体非依赖性二聚化和组成性激活 | 发现PPCL跨膜区插入可作为通用策略生成配体非依赖性组成性活性细胞因子受体 | 研究主要基于Ba/F3前B细胞系，尚未在更复杂的生理环境中验证 | 探究跨膜区半胱氨酸插入对细胞因子受体激活机制的影响 | IL-7Rα及其PPCL突变体，以及IL-6、IL-12和干扰素家族的细胞因子受体 | 合成生物学 | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞信号转导分析，磷酸化检测 | NA | 细胞增殖数据，信号通路激活数据 | Ba/F3前B细胞系 | 基因改造 | 哺乳动物细胞 | 组成性活性细胞因子受体设计 | 医学 |
| 72 | 2025-10-05 |
TeaTFactor: A Prediction Tool for Tea Plant Transcription Factors Based on BERT
2024 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3444466
PMID:39150804
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研究论文 | 开发基于BERT的茶树转录因子预测工具TeaTFactor | 首次将BERT预训练策略应用于茶树转录因子预测，并开发了在线网络服务器 | NA | 开发准确识别茶树转录因子的计算方法 | 茶树转录因子 | 自然语言处理 | NA | BERT预训练 | BERT | 蛋白质序列数据 | NA | NA | 茶树 | NA | 农业 |
| 73 | 2025-10-05 |
Single-Cell Synchro-Subtractive-Additive Nanoscale Surgery with Femtosecond Lasers
2024-07-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c00970
PMID:38989671
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研究论文 | 提出一种飞秒激光单细胞手术的同步减材-增材技术，实现单细胞结构的精确修改 | 首次实现同步纳米级三维减材与增材制造，通过非热消融和双光聚合实现单细胞结构的精确移除与修饰 | 术后存活率为70%，仍有提升空间 | 开发新型单细胞操作技术以克服现有方法的不足 | 单细胞结构 | 生物工程 | NA | 飞秒激光手术、双光聚合、非热消融 | NA | NA | NA | 飞秒激光 | 单细胞 | NA | 合成生物学、医学 |
| 74 | 2025-10-05 |
Organ-Specific Gene Expression Control Using DNA Origami-Based Nanodevices
2024-07-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c02104
PMID:38920331
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研究论文 | 本研究开发了基于DNA折纸的纳米器件，通过脂质纳米颗粒实现器官特异性基因表达调控 | 构建了坚固的DNA折纸结构，可在低pH等恶劣条件下封装于脂质纳米颗粒中，实现器官特异性基因递送 | 未明确说明实验样本数量及具体器官靶向效率的量化数据 | 开发器官特异性基因表达控制的纳米递送系统 | DNA折纸纳米器件、脂质纳米颗粒、mRNA和siRNA | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术、低温电子显微镜 | NA | 显微镜图像、基因表达数据 | 小鼠器官（未明确具体数量） | DNA折纸 | 小鼠 | 基因递送纳米器件 | 医学 |
| 75 | 2025-10-05 |
Chemical Communication between Giant Vesicles and Gated Nanoparticles for Strip-Based Sensing
2024-11-06, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c04022
PMID:39442006
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研究论文 | 本文开发了一种基于巨型囊泡和门控纳米粒子化学通讯的传感系统，用于条带检测 | 首次将巨型囊泡作为发送器与门控介孔纳米粒子作为接收器结合，实现化学通讯并应用于传感系统 | 实际应用验证仍需进一步开展 | 开发基于微纳粒子化学通讯的传感系统 | 巨型单层囊泡和门控介孔纳米粒子 | 纳米技术,合成生物学 | NA | 条带传感,智能手机检测 | NA | 化学信号 | 以细菌毒素α-溶血素为目标分析物进行实际样品测试 | NA | NA | 化学通讯系统,信号放大系统 | 医学检测,环境监测 |
| 76 | 2025-10-05 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
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综述 | 探讨如何利用系统生物学和合成生物学方法协调植物激素信号传导以优化植物生长、发育与环境响应 | 整合系统生物学、单细胞测序与合成生物学方法解析基因多效性现象 | NA | 开发协调植物生长、发育与环境响应的基因工程策略 | 植物激素信号传导网络与基因多效性现象 | 合成生物学 | NA | 单细胞测序, CRISPR基因编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR | 植物 | 激素信号传导通路模块 | 农业 |
| 77 | 2025-10-05 |
Biocatalytic enantioselective C(sp3)-H fluorination enabled by directed evolution of non-haem iron enzymes
2024-Aug, Nature synthesis
DOI:10.1038/s44160-024-00536-2
PMID:39925872
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研究论文 | 通过定向进化改造非血红素铁酶实现生物催化的对映选择性C(sp3)-H氟化反应 | 首次成功将植物来源的非血红素酶ACCO重新设计为氟化酶，实现了天然酶不具备的C-F键形成功能 | NA | 开发新型生物催化氟化反应，解决不对称C-H氟化的合成难题 | 非血红素铁酶ACCO及其突变体 | 合成生物学 | NA | 定向进化，计算研究 | NA | 酶活性数据，计算化学数据 | NA | 定向进化 | NA | NA | 医药，工业生物技术 |
| 78 | 2025-10-05 |
Inteins: A Swiss army knife for synthetic biology
2024 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108349
PMID:38552727
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综述 | 本文综述了内含肽在合成生物学中的多功能应用及其解决复杂生物挑战的潜力 | 系统阐述分裂内含肽的独特优势（紧凑性、可靠性、正交性等）及其在逻辑运算和遗传电路构建中的创新应用 | NA | 探讨内含肽在合成生物学领域的应用潜力及解决方案 | 内含肽（特别是分裂内含肽）及其蛋白质剪接机制 | 合成生物学 | 癌症 | 蛋白质剪接技术 | NA | NA | NA | 内含肽工程 | NA | 逻辑运算电路、遗传计算电路、反馈控制电路 | 医学, 生物技术, 生物医学 |
| 79 | 2025-10-05 |
Rational construction of synthetic consortia: Key considerations and model-based methods for guiding the development of a novel biosynthesis platform
2024 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108348
PMID:38531490
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综述 | 本文系统比较了单培养系统与合成菌群的优缺点，总结了构建合成菌群的关键考量因素，并讨论了指导合成菌群发展的模拟与计算工具 | 提出了结合人工智能和机器学习等新兴技术开发更高效、更具成本效益的合成菌群的新方向 | 合成菌群研究仍处于起步阶段，在稳定合成菌群的设计和构建方面存在诸多挑战 | 指导新型生物合成平台的开发 | 合成菌群（由两个或多个具有互补功能的微生物物种或菌株组成） | 合成生物学 | NA | 代谢工程、人工智能、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 微生物物种或菌株 | 合成菌群系统 | 工业生物技术 |
| 80 | 2025-10-05 |
Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity
2024-Apr, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00934-3
PMID:38332200
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas9的单倍体化方法HAnDy，用于高效组装和传递大片段DNA，并成功构建了1.024 Mb的合成辅助染色体 | 开发了绕过自然减数分裂过程的CRISPR/Cas9介导单倍体化方法，建立了无需体外操作的大片段DNA组装传递技术 | NA | 解决大尺度遗传信息重建的挑战，扩展宿主的生物合成能力 | 酵母菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 六种系统发育多样的酵母菌 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 合成辅助染色体，编码542个外源基因的代谢网络 | 工业生物技术 |