合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
781	2024-08-07	Exploration of the Native Sucrose Operon Enables the Development of an Inducible T7 Expression System in Paenibacillus polymyxa 2024-02-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00689 PMID:38319655	研究论文	本研究在Paenibacillus polymyxa中识别了天然蔗糖操纵子，并通过其结构和功能关系分析，建立了一个由蔗糖操纵子和T7启动子调控的级联T7表达系统，实现了可控的基因表达和表达效率的提高。	本研究首次在Paenibacillus polymyxa中建立了基于蔗糖操纵子的级联T7表达系统，实现了基因表达的可控性和效率的显著提升。	NA	开发适用于Paenibacillus polymyxa的合成生物学工具，提高其作为工业生产者的应用潜力。	Paenibacillus polymyxa中的蔗糖操纵子及其在基因表达调控中的应用。	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
782	2024-08-07	Progress in Gene Editing and Metabolic Regulation of Saccharomyces cerevisiae with CRISPR/Cas9 Tools 2024-02-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00685 PMID:38326929	综述	本文综述了CRISPR/Cas9系统在基因编辑和代谢工程中的应用，包括基本原理和实际应用	CRISPR/Cas9系统通过减少时间和劳动力，加速了微生物工程的发展，并增强了分子遗传学的理解	NA	总结CRISPR/Cas9系统在基因编辑和代谢调控中的研究进展	CRISPR/Cas9系统在酵母中的应用	基因工程	NA	CRISPR/Cas9	NA	NA	NA
783	2024-08-07	Biofoundry-Scale DNA Assembly Validation Using Cost-Effective High-Throughput Long-Read Sequencing 2024-02-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00589 PMID:38329009	研究论文	本文介绍了一种利用成本效益高的长读长测序技术在生物铸造厂规模上验证DNA组装的方法	采用了牛津纳米孔测序技术，并开发了配套的Nextflow管道和Python包，以进行深入分析并生成详细报告	NA	验证组装、克隆或编辑的质粒的准确性	工程化/合成DNA构建体（质粒）	合成生物学	NA	牛津纳米孔测序技术	NA	DNA序列	NA
784	2024-08-07	Beyond the Organism versus Machine Dichotomy: A Review of Ethical Concerns in Synthetic Biology 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00456 PMID:38070167	综述	本文对合成生物学领域的伦理和社会问题进行了系统性回顾和主题分析	探讨了合成生物学中的伦理问题，特别是关于生命操作和生物安全与生物安全的义务论和后果论问题	缺乏对实验室日常工作中合成生物学研究人员面临的伦理问题的系统研究	分析合成生物学中的伦理和社会问题	合成生物学领域的伦理和社会问题	NA	NA	NA	NA	NA	NA
785	2024-08-07	RNA Aptamer-Mediated Gene Activation Systems for Inducible Transgene Expression in Animal Cells 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00472 PMID:38073086	研究论文	本文开发了一种基于RNA适配体的基因激活系统RAMGA，用于在动物细胞中诱导RNA触发的基因表达激活	该系统利用合成生物学策略，通过目标RNA连接DNA结合域和转录激活因子，实现对目标mRNA水平的检测和报告基因表达的调控，不影响原始mRNA编码基因的表达	NA	开发新的RNA触发基因表达系统，用于建立基因电路、评估内源基因表达和开发新型RNA检测器	动物细胞中的RNA表达分析	合成生物学	NA	合成生物学	NA	RNA	重组CHO细胞
786	2024-08-07	A Sirtuin-Dependent T7 RNA Polymerase Variant 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00607 PMID:38117980	研究论文	本文通过遗传密码扩展技术，将T7 RNA聚合酶催化核心中的赖氨酸（K631）替换为N-乙酰-L-赖氨酸（AcK），设计了一种依赖于NAD依赖性去乙酰化酶（sirtuins）的T7 RNA聚合酶变体。	该变体需要sirtuins的去乙酰化酶活性来恢复其酶活性，从而在活细胞（包括细菌和哺乳动物细胞）以及体外系统中维持sirtuin依赖的基因转录。	NA	探索通过转录调控控制合成生物学和生物工程中的生物过程的新方法。	T7 RNA聚合酶变体及其在细胞中的转录调控作用。	生物工程	NA	遗传密码扩展	NA	NA	包括细菌和哺乳动物细胞以及体外系统
787	2024-08-07	A Novel RNA Aptamer as Synthetic Inducer of DasR Controlled Transcription 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00553 PMID:38127784	研究论文	本文研究了一种新型RNA适配体作为合成诱导DasR控制转录的工具	本文通过结合选择和后续筛选，成功选出了一种能够结合细菌抑制因子DasR的RNA适配体，从而激活DasR控制的转录，为合成生物学工具箱增加了新的调控层次	NA	开发新的合成电路工程工具，扩展合成生物学领域的应用	RNA适配体及其在细菌抑制因子DasR控制转录中的应用	合成生物学	NA	下一代测序	NA	RNA	NA
788	2024-08-07	Cell-Penetrating Peptide Delivery of Nucleic Acid Cargo to Emiliania huxleyi, a Calcifying Marine Coccolithophore 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00670 PMID:38147049	研究论文	本文研究了使用细胞穿透肽（CPP）将核酸货物递送到一种钙化的海洋颗石藻（Emiliania huxleyi）中	设计了一种包含高脯氨酸含量的CPP，并评估了其对颗石藻细胞的递送性能	NA	探索合成生物学在颗石藻生物矿化中的应用	海洋颗石藻（Emiliania huxleyi）	NA	NA	细胞穿透肽（CPP）	NA	合成肽核酸（PNA）	NA
789	2024-08-07	Fine-Tuned Gene Expression Elements from Hybrid Promoter Libraries in Pichia pastoris 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00534 PMID:38150419	研究论文	本文构建了一个梯度强度启动子库，通过随机杂交和高通量筛选，优化了Pichia pastoris中的基因表达组件。	通过构建和筛选新型杂交启动子，实现了基因表达水平的精细调控，并在生物技术生产中验证了其广泛应用性。	NA	优化Pichia pastoris中的基因表达组件，扩展其在代谢工程中的应用潜力。	Pichia pastoris中的启动子和上游调控序列。	合成生物学	NA	高通量筛选	NA	基因表达数据	涉及多个启动子和调控序列的变体。
790	2024-08-07	Plant Artificial Chromosomes: Construction and Transformation 2024-01-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00555 PMID:38163256	综述	本文综述了植物人工染色体的结构、构建方法及其在作物改良中的应用潜力	介绍了植物人工染色体技术在作物改良和基因功能研究中的进展	目前人工染色体技术在合成重复序列和转化大DNA片段方面仍存在局限	探讨如何通过人工染色体技术提高作物产量、品质和抗病性	植物人工染色体及其在农业革命中的应用	合成生物学	NA	人工染色体技术	NA	NA	NA
791	2024-08-07	Cloning and sequencing analysis of whole Spiroplasma genome in yeast 2024, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fmicb.2024.1411609 PMID:38881660	研究论文	本文通过合成生物学技术，成功在酵母中克隆并测序了螺旋体细菌的全基因组	首次在酵母中成功克隆了与昆虫相关的螺旋体细菌的全基因组，并验证了克隆效率高且突变率低	文中未明确提及具体的局限性	探索在酵母中进行全基因组克隆和移植的可行性，以及其在合成生物学中的应用	螺旋体细菌的全基因组	合成生物学	NA	Illumina测序	NA	DNA序列	1.12 Mbp的全基因组
792	2024-08-07	Robust soybean leaf agroinfiltration 2024-Jun-05, Plant cell reports IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s00299-024-03245-4 PMID:38837057	研究论文	开发了一种基于农杆菌渗透的稳定基因瞬时表达方法，用于大豆叶片	创新了一种在大豆中更为稳定的农杆菌渗透方法，适用于全球广泛种植的豆科植物	NA	旨在开发一种在大豆中稳定进行农杆菌渗透的方法，以直接在作物物种中测试转基因构建体的性能	大豆叶片	植物生物技术	NA	农杆菌渗透	NA	NA	两个大豆品系（V17-0799DT和TN16-5004）的年轻叶片
793	2024-08-07	Decoding the photoprotection strategies and manipulating cyanobacterial photoprotective metabolites, mycosporine-like amino acids, for next-generation sunscreens 2024-Jul, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108744 PMID:38781638	综述	本文综述了利用蓝细菌合成的光保护代谢物——类海藻氨基酸（MAAs）作为下一代防晒剂的潜力和策略	探讨了通过基因组挖掘、异源表达和合成生物学等工具开发下一代防晒剂的新方法，并提出了生物纳米共轭结构的概念	NA	探索和开发有效的光保护策略，特别是利用蓝细菌产生的类海藻氨基酸（MAAs）作为商业防晒剂的替代品	蓝细菌合成的类海藻氨基酸（MAAs）及其在防晒剂中的应用	生物技术	NA	基因组挖掘, 异源表达, 合成生物学	NA	NA	NA
794	2024-08-07	[Closed-loop synthetic gene circuits for cell-based therapies] 2024-May, Medecine sciences : M/S DOI:10.1051/medsci/2024054 PMID:38819279	研究论文	本文探讨了利用闭环合成基因电路的细胞疗法，这些细胞能够自主治疗慢性疾病	最新一代的合成电路通过先进的生物工程策略来解决安全性和可行性问题	这些疗法在临床上仍面临安全性和体内实施可行性的挑战	旨在开发新的细胞疗法，用于自主治疗慢性疾病	闭环合成基因电路的细胞	合成生物学	慢性疾病	NA	NA	NA	NA
795	2024-08-07	Shared and more specific genetic determinants and pathways underlying yeast tolerance to acetic, butyric, and octanoic acids 2024-Feb-29, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-024-02309-0 PMID:38419072	研究论文	本研究通过化学基因组学分析和生理学研究，揭示了酵母对醋酸、丁酸和辛酸耐受性的共享遗传决定因素和途径	首次报告了丁酸和辛酸的耐受基因列表，并提供了对线性链单羧酸毒性和耐受性机制的新生物学知识	NA	指导基因组工程，开发更健壮的酵母菌株，以实现可持续的生物转化过程	酵母对醋酸、丁酸和辛酸的耐受性	NA	NA	化学基因组学分析	NA	基因组数据	NA
796	2024-08-07	Polymersomes with micellar patches 2024-Oct, Journal of colloid and interface science IF:9.4Q1 DOI:10.1016/j.jcis.2024.05.177 PMID:38815380	研究论文	本文介绍了两种利用静电作用将聚合物囊泡和模型胶体（胶束）组装成混合簇的新方法	提出了两种新的静电驱动方法来组装聚合物囊泡和胶束，一种通过pH调节静电相互作用，另一种通过酸触发剂的酸解来实现时间控制	NA	探索聚合物囊泡作为胶体构建块用于创建更高阶簇结构的新方法	聚合物囊泡和胶束的组装	材料科学	NA	NA	NA	NA	NA
797	2024-08-07	Metabolic Investigation and Auxiliary Enzyme Modelization of the Pyrrocidine Pathway Allow Rationalization of Paracyclophane-Decahydrofluorene Formation 2024-04-19, ACS chemical biology IF:3.5Q2 DOI:10.1021/acschembio.3c00684 PMID:38576157	研究论文	研究了真菌中含paracyclophane-decahydrofluorene的天然产物的生物合成途径，通过基因失活、代谢分析和分子建模来阐明关键酶的作用	揭示了pyrrocidine生物合成基因簇的非凡可塑性，并通过分子对接实验和模型化提出了新的生物合成机制	NA	研究pyrrocidine类化合物的生物合成途径及其关键酶的作用机制	pyrrocidine类化合物的生物合成途径及其关键酶	NA	NA	基因失活、代谢分析、分子建模	NA	代谢物	九种pyrrocidine及其类似物，以及多种突变体中积累的代谢物
798	2024-08-07	Characterization and engineering of peroxisome targeting sequences for compartmentalization engineering in Pichia pastoris 2024-Jul, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2 DOI:10.1002/bit.28706 PMID:38568751	研究论文	本研究通过建立基于β-胡萝卜素生物合成途径的高通量筛选方法，评估了Pichia pastoris中PTS1s（过氧化物酶体靶向信号类型1）的靶向效率，并进行了定向进化，以增强过氧化物酶体靶向效率，最终应用于香叶醇生物合成途径的过氧化物酶体区室化。	本研究首次在Pichia pastoris中系统地表征了25个假定的内源性PTS1s，并通过定向进化方法构建了两个PTS1突变库，识别出51个具有更高过氧化物酶体靶向效率的PTS1s。	研究中过氧化物酶体的丰度和蛋白质组成在特定碳源诱导下高度可变，这可能影响PTS1s的靶向效率和应用。	研究旨在通过表征和工程化过氧化物酶体靶向序列，推进Pichia pastoris中的过氧化物酶体区室化工程。	研究对象包括过氧化物酶体靶向信号类型1（PTS1s）及其在Pichia pastoris中的靶向效率。	合成生物学	NA	高通量筛选方法	NA	图像	25个假定的内源性PTS1s，51个PTS1s（29个经典和22个非典型PTS1s）
799	2024-08-07	Leveraging the histidine kinase-phosphatase duality to sculpt two-component signaling 2024-Jun-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49251-8 PMID:38858359	研究论文	本文研究了细菌双组分系统（TCS）中传感组氨酸激酶（SHK）的激酶-磷酸酶双重活性如何影响信号响应	通过改变激酶-磷酸酶平衡，提高了系统的红光敏感性，并展示了如何通过故意扰动激酶-磷酸酶双重活性来解锁新的信号响应机制	NA	探究细菌双组分系统中激酶-磷酸酶双重活性对信号响应的影响	细菌双组分系统中的传感组氨酸激酶	生物技术	NA	NA	NA	NA	NA
800	2024-08-07	Thermostable in vitro transcription-translation compatible with microfluidic droplets 2024-Jun-10, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-024-02440-y PMID:38858677	研究论文	本文开发了一种能在高温下操作的体外表达系统，该系统与酶学检测和微流控水油滴技术兼容，适用于超高通量蛋白质表达。	首次实现了在微流控水油滴中进行高温下的体外表达，使用来自Thermus thermophilus的细胞提取物，包括热稳定酶级联和中等热稳定的RNA聚合酶。	RNA聚合酶的热稳定性限制了蛋白质合成的温度。	开发一种能在高温下操作的体外表达系统，以筛选大量天然或人工遗传多样性中的高度热稳定酶或酶变体。	Thermus thermophilus的细胞提取物及其在高温下进行体外表达的能力。	合成生物学	NA	微流控水油滴技术	NA	NA	NA