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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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821 | 2024-08-07 |
Manipulation of encapsulated artificial phospholipid membranes using sub-micellar lysolipid concentrations
2024-Jun-01, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-024-01209-z
PMID:38824266
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研究论文 | 本文研究了通过亚微米级溶血磷脂浓度操纵封装的人工磷脂膜,特别是通过暴露于不同浓度的溶血磷脂酰胆碱(LPC)来研究其对三维DIB网络的结构影响。 | 首次展示了在亚毫米级水凝胶封装的液滴界面双层(eDIBs)中进行原位双层操纵,并研究了溶血磷脂与三维DIB网络的相互作用。 | 实验主要集中在溶血磷脂酰胆碱(LPC)对封装液滴网络的影响,可能需要进一步研究其他因素的影响。 | 探索通过化学介导的操纵封装的三维协调膜模拟物,以研究易于访问的隔室化人工细胞机制。 | 研究对象包括封装的人工磷脂膜和溶血磷脂酰胆碱(LPC)对其结构的影响。 | 合成生物学 | NA | 高阶乳化 | NA | 微流控设备 | NA |
822 | 2024-08-07 |
A new era of cancer immunotherapy: combining revolutionary technologies for enhanced CAR-M therapy
2024-Jun-01, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02032-9
PMID:38824567
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研究论文 | 本文详细探讨了CAR-M疗法的最新进展,包括基础科学研究和临床试验,并提出了克服其发展障碍的可能策略 | 结合革命性技术如原位遗传修饰、合成生物学技术和生物材料支持的基因转移,以提高CAR-M疗法的效能、安全性和可及性 | CAR-M疗法在实现其全部潜力方面仍面临主要障碍 | 探索和优化针对实体瘤的CAR-M免疫疗法 | CAR-M疗法在实体瘤治疗中的应用 | 生物技术 | 实体瘤 | CAR-M疗法 | NA | NA | NA |
823 | 2024-08-07 |
Nudix hydrolase WvNUDX24 is involved in borneol biosynthesis in Wurfbainia villosa
2024-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16669
PMID:38323895
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研究论文 | 本文研究了Nudix水解酶WvNUDX24在Wurfbainia villosa中参与龙脑生物合成的作用 | 首次报道了负责将龙脑二磷酸(BPP)水解生成龙脑的酶 | NA | 鉴定并功能性表征参与龙脑生物合成的Nudix水解酶WvNUDX24 | Nudix水解酶WvNUDX24及其在龙脑生物合成中的作用 | NA | NA | 定点突变实验 | NA | NA | NA |
824 | 2024-08-07 |
Unlocking the potential of optogenetics in microbial applications
2024-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102404
PMID:38039932
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综述 | 本文综述了光遗传学在微生物应用中的关键特征及其在理解生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用 | 光遗传学通过光动态操纵细胞行为,实现了其他方法无法达到的高时空精度 | 光遗传学主要被用作传统化学诱导剂的替代品 | 探讨光遗传学在微生物应用中的潜力和应用 | 微生物及其在生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用 | NA | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
825 | 2024-08-07 |
Exploring the transcriptional landscape of phage-host interactions using novel high-throughput approaches
2024-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102419
PMID:38271748
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研究论文 | 本文探讨了使用新型高通量方法研究噬菌体与宿主相互作用的转录组景观 | 本文首次将高通量测序技术应用于噬菌体等微生物病毒,以详细描绘感染过程中未充分探索的RNA生物学和分子过程 | NA | 研究噬菌体感染细菌时引发的应激和扰动对细菌代谢和基因调控的新基本机制 | 噬菌体与宿主细菌的相互作用 | NA | NA | 高通量测序 | NA | 转录组数据 | NA |
826 | 2024-08-07 |
Developed and emerging 1,4-butanediol commercial production strategies: forecasting the current status and future possibility
2024-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2176740
PMID:37286203
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研究论文 | 本文讨论了1,4-丁二醇(1,4-BDO)的商业生产策略,包括化学和生物技术方法的现状及未来发展前景 | 文章介绍了通过微生物利用重组菌株、代谢工程、合成生物学等技术进行可持续生物生产的新方法 | 文章指出环境友好和生物基商业生产策略面临的困难 | 探讨1,4-BDO的当前生产技术和未来可能的发展方向 | 1,4-BDO及其在化学反应中的应用,如聚氨酯、斯潘德克斯中间体和聚乙烯吡咯烷酮(PVP) | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、生物信息学、人工智能引导算法 | NA | NA | NA |
827 | 2024-08-07 |
Bacterial genome reduction for optimal chassis of synthetic biology: a review
2024-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2208285
PMID:37380345
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综述 | 本文综述了通过细菌基因组简化构建合成生物学最优底盘的进展 | 介绍了通过识别必需基因集和多种基因组删除技术来促进细菌基因组简化的方法 | 一些基因组简化菌株的生长减少和生理表型扰动可能限制其作为优化细胞工厂的应用 | 评估细菌基因组简化在构建合成生物学最优底盘方面的进展 | 细菌基因组简化的方法、特性及其在工业应用中的潜力 | 合成生物学 | NA | 基因组删除技术 | NA | 基因组数据 | 多种细菌 |
828 | 2024-08-07 |
Circular single-stranded DNA as a programmable vector for gene regulation in cell-free protein expression systems
2024-May-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49021-6
PMID:38821953
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研究论文 | 本文介绍了一种可编程的载体——环状单链DNA(CssDNA),用于在基于酵母的无细胞蛋白表达系统中进行基因表达调控 | CssDNA不仅可用于通过正义CssDNA和反义CssDNA的不同途径进行基因调控,还可构建为无细胞蛋白表达系统中的几种基因调控逻辑门 | NA | 探索CssDNA在基因表达和基因调控中的应用,丰富合成生物学工具箱 | 环状单链DNA(CssDNA)在无细胞蛋白表达系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
829 | 2024-08-07 |
A new mRNA structure prediction based approach to identifying improved signal peptides for bone morphogenetic protein 2
2024-May-23, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00858-1
PMID:38783306
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研究论文 | 本文提出了一种基于mRNA结构预测的新方法,用于系统筛选候选信号肽序列,以改进骨形态发生蛋白2(BMP2)的生产 | 首次将mRNA结构预测应用于信号肽选择,结合多种计算工具进行信号肽活性、定位目标和mRNA结构的预测 | mRNA结构预测的准确性有待提高,且实验结果显示在不同细胞系中信号肽活性的表现不一 | 开发一种系统筛选候选信号肽序列的方法,以提高BMP2的生产效率和降低成本 | 骨形态发生蛋白2(BMP2)的信号肽 | 生物信息学 | NA | 计算工具(SignalP, DeepLoc, MXFold2) | NA | 氨基酸序列, mRNA结构 | 2,611个来自TGF-β超家族的信号肽序列 |
830 | 2024-08-07 |
ORBIT for E. coli: kilobase-scale oligonucleotide recombineering at high throughput and high efficiency
2024-May-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae227
PMID:38587185
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ORBIT的高效高通量方法,用于在E. coli中进行千碱基规模的基因组修饰 | ORBIT方法使用DNA寡核苷酸指导非复制性质粒的整合,显著提高了效率并支持高吞吐量操作 | NA | 开发一种新的基因组修饰方法,以克服现有方法的低效率和难以规模化的问题 | E. coli的基因组 | 合成生物学 | NA | DNA寡核苷酸重组技术 | NA | 基因组数据 | 数千个独特的基因组条码(>30k) |
831 | 2024-08-07 |
Computation-guided transcription factor biosensor specificity engineering for adipic acid detection
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.05.002
PMID:38817964
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研究论文 | 本研究通过计算方法改进了转录因子(TF)的特异性,使其能够检测己二酸 | 首次应用生物分子建模方法改变BenM的特异性,并分析突变如何影响其结构动力学 | NA | 开发一种计算引导的方法来工程化转录因子的特异性,以检测特定的分子 | 转录因子BenM及其对己二酸的特异性 | 合成生物学 | NA | 分子对接,分子动力学 | NA | 蛋白质结构 | 单个氨基酸替换 |
832 | 2024-08-07 |
Recent advancements in mogrosides: A review on biological activities, synthetic biology, and applications in the food industry
2024-Aug-15, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2024.139277
PMID:38608607
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综述 | 本文综述了魔芋甘的生物活性、合成生物学进展及其在食品工业中的应用 | 探讨了合成生物学在降低魔芋甘生产成本方面的潜力,并介绍了最新的魔芋甘生物合成途径 | 主要挑战在于魔芋醇转化为多种魔芋甘的过程中,由于当前UDP-葡萄糖基转移酶(UGTs)的底物选择性差、产物特异性和催化效率低 | 综述魔芋甘的生物活性、合成生物学进展及其在食品工业中的应用 | 魔芋甘及其在食品工业中的应用 | NA | 糖尿病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
833 | 2024-08-07 |
Synthetic biology approaches for improving the specificity and efficacy of cancer immunotherapy
2024-May, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01153-x
PMID:38605087
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综述 | 本文综述了合成生物学在提高癌症免疫治疗特异性、可控性和疗效方面的应用和未来展望 | 合成生物学为克服免疫治疗中的挑战提供了创新工具,特别是通过工程化免疫细胞和基因电路来增强治疗的特异性和可控性 | 文章未明确提及当前研究的局限性 | 探讨合成生物学在癌症免疫治疗中的应用,以提高治疗的特异性和疗效 | 癌症免疫治疗中的挑战,包括靶向非肿瘤毒性、系统性毒性和治疗效果的持续性 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
834 | 2024-08-07 |
Understanding and computational design of genetic circuits of metabolic networks
2024-Apr-30, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20230045
PMID:38662439
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综述 | 本文综述了通过遗传电路设计实现代谢网络优化控制的方法 | 提出了一种新的方法来推断和设计遗传电路,以在动态条件下实现代谢网络的最大通量 | NA | 探讨如何通过遗传电路设计实现代谢网络的优化控制,并为合成生物学提供设计标准 | 遗传电路在代谢网络中的作用及其设计方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
835 | 2024-08-07 |
On the pursuit to reconstitute the Escherichia coli ribosome from purified components
2024-Apr-29, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvad121
PMID:38236695
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评论 | 本文讨论了从纯化组件中体外重建大肠杆菌核糖体的历史和最新进展 | Aoyama等人最近报道了使用33种重组核糖体蛋白重建50S核糖体,这是向使用重组蛋白和体外转录rRNA完全重建全核糖体复合体迈出的新一步 | 本文未提及具体限制 | 探讨体外重建核糖体的意义及其在生物技术和合成生物学中的潜在应用 | 大肠杆菌的核糖体 | NA | NA | 重组核糖体蛋白和体外转录rRNA | NA | NA | 33种重组核糖体蛋白 |
836 | 2024-08-07 |
Cell envelope and stress-responsive pathways underlie an evolved oleaginous Rhodotorula toruloides strain multi-stress tolerance
2024-May-28, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02518-0
PMID:38807231
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研究论文 | 本研究通过适应性实验室进化方法,从三倍体变为二倍体,产生了对多种抑制化合物和甲醇具有耐受性的红油酵母Rhodotorula toruloides菌株,并进行了基因组和转录组分析 | 本研究通过适应性实验室进化方法,成功提高了Rhodotorula toruloides菌株对多种压力的耐受性,并揭示了相关的基因和通路 | NA | 研究Rhodotorula toruloides菌株对多种压力的耐受性机制 | 红油酵母Rhodotorula toruloides菌株 | NA | NA | 适应性实验室进化、基因组分析、转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 21,489个突变和242个基因显示拷贝数变异 |
837 | 2024-08-07 |
The effect of pseudoknot base pairing on cotranscriptional structural switching of the fluoride riboswitch
2024-May-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae231
PMID:38567721
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研究论文 | 研究了伪结碱基配对对转录过程中氟化物核开关结构转换的影响 | 发现了单个摆动碱基对在伪结功能中的关键作用,并通过分子动力学模拟支持了实验结果 | NA | 探讨RNA序列变化如何影响转录过程中动态构象变化 | 氟化物核开关,一种通过伪结适配子域和下游内在终止子表达平台协调折叠和重排的非编码RNA | 生物学 | NA | 体外转录和细胞基因表达分析 | NA | RNA序列 | 涉及中温和高温氟化物核开关变体 |
838 | 2024-08-07 |
Compartmentalized Terpenoid Production in Plants Using Agrobacterium-Mediated Transient Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_2
PMID:38468080
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研究论文 | 本文介绍了利用农杆菌介导的瞬时表达技术在烟草中快速开发萜类化合物合成途径并将其生物合成过程分隔在叶绿体、细胞质或脂滴表面的方法 | 本文采用农杆菌介导的瞬时表达技术,实现了重组和修饰酶的多重表达,并通过合成生物学方法在亚细胞水平上分隔萜类化合物的生物合成 | NA | 探索和工程化更复杂的途径以生产具有商业价值的化学品,如萜类化合物 | 植物中的萜类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达 | NA | NA | NA |
839 | 2024-08-07 |
Towards consolidated bioprocessing of biomass and plastic substrates for semi-synthetic production of bio-poly(ethylene furanoate) (PEF) polymer using omics-guided construction of artificial microbial consortia
2024-Jun, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2024.110429
PMID:38537325
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综述 | 本文综述了利用整合废物生物精炼策略进行半生物合成生产聚乙烯呋喃酸酯(PEF)单体的最新进展,特别强调了使用组学驱动的系统生物学方法在酶发现和途径构建中的应用。 | 本文提出了使用人工生物工程微生物群落来提供流线型系统和合成生物学策略,以利用植物生物质和塑料衍生基质进行生物基PEF单体生产。 | 目前尚未提及具体的限制。 | 探讨半生物合成生产PEF单体的技术挑战和生物技术兴趣,以及如何通过微生物群落和系统生物学方法优化这一过程。 | 聚乙烯呋喃酸酯(PEF)单体的合成及其在生物基塑料生产中的应用。 | 生物技术 | NA | 组学技术 | 微生物群落 | 生物质和塑料废物 | NA |
840 | 2024-08-07 |
Harnessing iron‑sulfur enzymes for synthetic biology
2024-Jun, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119718
PMID:38574823
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review | 本文综述了利用铁硫酶在合成生物学中的应用,并探讨了克服其活性限制的策略 | 强调了蛋白质结构预测和设计在解决铁硫酶应用挑战中的潜力 | 铁硫酶在工程代谢途径中的生产指标尚未达到工业应用要求 | 加速开发适用于工业的铁硫酶依赖性生物合成途径 | 铁硫酶及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结构预测和设计 | NA | NA | NA |