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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2024-08-07 |
Sourcing DNA parts for synthetic biology applications in plants
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103140
PMID:38723389
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综述 | 本文综述了在植物合成生物学应用中选择和优化DNA部件的当前方法和基本构建设计建议 | 介绍了新的实验和计算工具的开发 | NA | 旨在为选择和优化DNA部件提供信息和基本构建设计建议 | DNA部件的选择和优化 | 合成生物学 | NA | DNA合成和组装 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 842 | 2024-08-07 |
Biocomputing in plants, from proof of concept to application
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103146
PMID:38781700
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综述 | 本文综述了在植物中实现生物计算的工具和设计方法,并强调了这些电路在理解和工程化植物与环境、发育和代谢途径相互作用中的最新和潜在应用 | 介绍了在植物合成电路中集成多信号以实现可调节植物表型的创新方法 | NA | 探讨合成生物学在应对气候变化和可持续发展挑战中的应用 | 植物合成生物学中的逻辑电路 | 合成生物学 | NA | 生物计算 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 843 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas tools for simultaneous transcription & translation control in bacteria
2024-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae275
PMID:38613390
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研究论文 | 本文利用CRISPR-dCas13系统在细菌中实现对基因转录和翻译的同时控制 | 通过结合dCas9的转录激活和dCas13的翻译抑制,实现了在多基因操纵子中选择性激活单个基因,并减少了极性效应 | NA | 开发能够在微生物合成生物学中精确控制基因翻译的工具 | 大肠杆菌中的基因转录和翻译控制 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 844 | 2024-08-07 |
Engineering a carbon source-responsive promoter for improved biosynthesis in the non-conventional yeast Kluyveromyces marxianus
2024-Jun, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00238
PMID:38845682
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研究论文 | 本文开发了一种新型合成碳源响应启动子,用于提高非传统酵母Kluyveromyces marxianus的生物合成能力 | 通过融合碳源响应元件和强启动子核心,实现了在不同碳源条件下的启动子强度调节,从而优化了有毒代谢物的生产 | NA | 开发碳源响应启动子,以提高有毒代谢物的生产效率 | Kluyveromyces marxianus酵母中的生物合成过程 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 845 | 2024-08-07 |
Identification and characterization of two O-methyltransferases involved in biosynthesis of methylated 2-(2-phenethyl)chromones in agarwood
2024-Jun-07, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae130
PMID:38497815
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了两种O-甲基转移酶,这些酶参与了沉香木中甲基化2-(2-苯乙基)色酮的生物合成 | 首次在沉香木中鉴定出29个O-甲基转移酶基因,并通过体外酶活性和功能分析证实了AsOMT11和AsOMT16在甲基化2-(2-苯乙基)色酮生物合成中的作用 | NA | 旨在鉴定和表征参与沉香木中甲基化2-(2-苯乙基)色酮生物合成的O-甲基转移酶 | 沉香木中的O-甲基转移酶及其在甲基化2-(2-苯乙基)色酮生物合成中的作用 | NA | NA | 基因表达分析、体外酶活性测定、功能分析 | NA | 基因组数据 | 29个O-甲基转移酶基因 | NA | NA | NA | NA |
| 846 | 2024-08-07 |
Structural Basis for the Interaction of Redβ Single-Strand Annealing Protein with Escherichia coli Single-Stranded DNA-Binding Protein
2024-Jun-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168590
PMID:38663547
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研究论文 | 研究了Redβ单链连接蛋白与大肠杆菌单链DNA结合蛋白之间的相互作用结构基础 | 确定了Redβ CTD与SSB末端九个残基肽段的晶体结构,揭示了两者间的主要相互作用机制 | NA | 阐明Redβ与大肠杆菌单链DNA结合蛋白的相互作用机制,以扩展其在合成生物学中的应用 | Redβ蛋白与大肠杆菌单链DNA结合蛋白的相互作用 | 分子生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 847 | 2024-08-07 |
Simulation and experimental study of a cold atmospheric pressure plasma and comparison of efficiency in boosting recombinant Endoglucanase II production in Pichia pastoris
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0303795
PMID:38771745
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研究论文 | 本研究探讨了冷大气压等离子体(CAP)处理对Pichia pastoris中重组内切葡聚糖酶II(EgII)生产效率的影响 | 本研究首次比较了两种不同点火模式(正弦交流电AC和脉冲直流电DC)对蛋白分泌效率的影响,并使用COMSOL软件模拟了等离子体功能 | 细胞工程改善分泌通常是一种试错方法,且改进至少部分特定于所生产的蛋白质 | 研究冷大气压等离子体处理对重组内切葡聚糖酶II生产效率的影响 | 重组内切葡聚糖酶II(EgII)在Pichia pastoris中的生产效率 | 生物工程 | NA | 冷大气压等离子体(CAP) | NA | 光学光谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 848 | 2024-08-07 |
Triazole-linked Nucleic Acids: Synthesis, Therapeutics and Synthetic Biology Applications
2024, Current organic synthesis
IF:1.7Q3
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研究论文 | 本文探讨了三氮唑连接的核酸,其中三氮唑连接(TL)取代了天然的磷酸骨架,并详细讨论了两种三氮唑连接(TL1和TL2)及其在治疗和合成生物学中的广泛应用。 | 介绍了三氮唑连接的核酸在治疗和合成生物学中的新应用,如在反义寡核苷酸(ASO)、小干扰RNA(siRNA)和CRISPR-Cas9技术中的应用。 | NA | 探索三氮唑连接的核酸在治疗和合成生物学中的应用潜力。 | 三氮唑连接的核酸及其在治疗和合成生物学中的应用。 | 合成生物学 | NA | 三氮唑连接技术 | NA | 核酸 | 功能性300-mer DNA和335碱基对基因的变体 | NA | NA | NA | NA |
| 849 | 2024-08-07 |
Manipulation of encapsulated artificial phospholipid membranes using sub-micellar lysolipid concentrations
2024-Jun-01, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-024-01209-z
PMID:38824266
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研究论文 | 本文研究了通过亚微米级溶血磷脂浓度操纵封装的人工磷脂膜,特别是通过暴露于不同浓度的溶血磷脂酰胆碱(LPC)来研究其对三维DIB网络的结构影响。 | 首次展示了在亚毫米级水凝胶封装的液滴界面双层(eDIBs)中进行原位双层操纵,并研究了溶血磷脂与三维DIB网络的相互作用。 | 实验主要集中在溶血磷脂酰胆碱(LPC)对封装液滴网络的影响,可能需要进一步研究其他因素的影响。 | 探索通过化学介导的操纵封装的三维协调膜模拟物,以研究易于访问的隔室化人工细胞机制。 | 研究对象包括封装的人工磷脂膜和溶血磷脂酰胆碱(LPC)对其结构的影响。 | 合成生物学 | NA | 高阶乳化 | NA | 微流控设备 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 850 | 2024-08-07 |
A new era of cancer immunotherapy: combining revolutionary technologies for enhanced CAR-M therapy
2024-Jun-01, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02032-9
PMID:38824567
|
研究论文 | 本文详细探讨了CAR-M疗法的最新进展,包括基础科学研究和临床试验,并提出了克服其发展障碍的可能策略 | 结合革命性技术如原位遗传修饰、合成生物学技术和生物材料支持的基因转移,以提高CAR-M疗法的效能、安全性和可及性 | CAR-M疗法在实现其全部潜力方面仍面临主要障碍 | 探索和优化针对实体瘤的CAR-M免疫疗法 | CAR-M疗法在实体瘤治疗中的应用 | 生物技术 | 实体瘤 | CAR-M疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 851 | 2024-08-07 |
Nudix hydrolase WvNUDX24 is involved in borneol biosynthesis in Wurfbainia villosa
2024-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16669
PMID:38323895
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研究论文 | 本文研究了Nudix水解酶WvNUDX24在Wurfbainia villosa中参与龙脑生物合成的作用 | 首次报道了负责将龙脑二磷酸(BPP)水解生成龙脑的酶 | NA | 鉴定并功能性表征参与龙脑生物合成的Nudix水解酶WvNUDX24 | Nudix水解酶WvNUDX24及其在龙脑生物合成中的作用 | NA | NA | 定点突变实验 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 852 | 2024-08-07 |
Unlocking the potential of optogenetics in microbial applications
2024-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102404
PMID:38039932
|
综述 | 本文综述了光遗传学在微生物应用中的关键特征及其在理解生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用 | 光遗传学通过光动态操纵细胞行为,实现了其他方法无法达到的高时空精度 | 光遗传学主要被用作传统化学诱导剂的替代品 | 探讨光遗传学在微生物应用中的潜力和应用 | 微生物及其在生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用 | NA | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 853 | 2024-08-07 |
Exploring the transcriptional landscape of phage-host interactions using novel high-throughput approaches
2024-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102419
PMID:38271748
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研究论文 | 本文探讨了使用新型高通量方法研究噬菌体与宿主相互作用的转录组景观 | 本文首次将高通量测序技术应用于噬菌体等微生物病毒,以详细描绘感染过程中未充分探索的RNA生物学和分子过程 | NA | 研究噬菌体感染细菌时引发的应激和扰动对细菌代谢和基因调控的新基本机制 | 噬菌体与宿主细菌的相互作用 | NA | NA | 高通量测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 854 | 2024-08-07 |
Developed and emerging 1,4-butanediol commercial production strategies: forecasting the current status and future possibility
2024-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2176740
PMID:37286203
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研究论文 | 本文讨论了1,4-丁二醇(1,4-BDO)的商业生产策略,包括化学和生物技术方法的现状及未来发展前景 | 文章介绍了通过微生物利用重组菌株、代谢工程、合成生物学等技术进行可持续生物生产的新方法 | 文章指出环境友好和生物基商业生产策略面临的困难 | 探讨1,4-BDO的当前生产技术和未来可能的发展方向 | 1,4-BDO及其在化学反应中的应用,如聚氨酯、斯潘德克斯中间体和聚乙烯吡咯烷酮(PVP) | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、生物信息学、人工智能引导算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 855 | 2024-08-07 |
Bacterial genome reduction for optimal chassis of synthetic biology: a review
2024-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2208285
PMID:37380345
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综述 | 本文综述了通过细菌基因组简化构建合成生物学最优底盘的进展 | 介绍了通过识别必需基因集和多种基因组删除技术来促进细菌基因组简化的方法 | 一些基因组简化菌株的生长减少和生理表型扰动可能限制其作为优化细胞工厂的应用 | 评估细菌基因组简化在构建合成生物学最优底盘方面的进展 | 细菌基因组简化的方法、特性及其在工业应用中的潜力 | 合成生物学 | NA | 基因组删除技术 | NA | 基因组数据 | 多种细菌 | NA | NA | NA | NA |
| 856 | 2024-08-07 |
Circular single-stranded DNA as a programmable vector for gene regulation in cell-free protein expression systems
2024-May-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49021-6
PMID:38821953
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研究论文 | 本文介绍了一种可编程的载体——环状单链DNA(CssDNA),用于在基于酵母的无细胞蛋白表达系统中进行基因表达调控 | CssDNA不仅可用于通过正义CssDNA和反义CssDNA的不同途径进行基因调控,还可构建为无细胞蛋白表达系统中的几种基因调控逻辑门 | NA | 探索CssDNA在基因表达和基因调控中的应用,丰富合成生物学工具箱 | 环状单链DNA(CssDNA)在无细胞蛋白表达系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 857 | 2024-08-07 |
ORBIT for E. coli: kilobase-scale oligonucleotide recombineering at high throughput and high efficiency
2024-May-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae227
PMID:38587185
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ORBIT的高效高通量方法,用于在E. coli中进行千碱基规模的基因组修饰 | ORBIT方法使用DNA寡核苷酸指导非复制性质粒的整合,显著提高了效率并支持高吞吐量操作 | NA | 开发一种新的基因组修饰方法,以克服现有方法的低效率和难以规模化的问题 | E. coli的基因组 | 合成生物学 | NA | DNA寡核苷酸重组技术 | NA | 基因组数据 | 数千个独特的基因组条码(>30k) | NA | NA | NA | NA |
| 858 | 2024-08-07 |
Computation-guided transcription factor biosensor specificity engineering for adipic acid detection
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.05.002
PMID:38817964
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研究论文 | 本研究通过计算方法改进了转录因子(TF)的特异性,使其能够检测己二酸 | 首次应用生物分子建模方法改变BenM的特异性,并分析突变如何影响其结构动力学 | NA | 开发一种计算引导的方法来工程化转录因子的特异性,以检测特定的分子 | 转录因子BenM及其对己二酸的特异性 | 合成生物学 | NA | 分子对接,分子动力学 | NA | 蛋白质结构 | 单个氨基酸替换 | NA | NA | NA | NA |
| 859 | 2024-08-07 |
Recent advancements in mogrosides: A review on biological activities, synthetic biology, and applications in the food industry
2024-Aug-15, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2024.139277
PMID:38608607
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综述 | 本文综述了魔芋甘的生物活性、合成生物学进展及其在食品工业中的应用 | 探讨了合成生物学在降低魔芋甘生产成本方面的潜力,并介绍了最新的魔芋甘生物合成途径 | 主要挑战在于魔芋醇转化为多种魔芋甘的过程中,由于当前UDP-葡萄糖基转移酶(UGTs)的底物选择性差、产物特异性和催化效率低 | 综述魔芋甘的生物活性、合成生物学进展及其在食品工业中的应用 | 魔芋甘及其在食品工业中的应用 | NA | 糖尿病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 860 | 2024-08-07 |
Understanding and computational design of genetic circuits of metabolic networks
2024-Apr-30, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20230045
PMID:38662439
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综述 | 本文综述了通过遗传电路设计实现代谢网络优化控制的方法 | 提出了一种新的方法来推断和设计遗传电路,以在动态条件下实现代谢网络的最大通量 | NA | 探讨如何通过遗传电路设计实现代谢网络的优化控制,并为合成生物学提供设计标准 | 遗传电路在代谢网络中的作用及其设计方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |