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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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841 | 2024-08-07 |
A Gene-Switch Platform Interfacing with Reactive Oxygen Species Enables Transcription Fine-Tuning by Soluble and Volatile Pharmacologics and Food Additives
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306333
PMID:38526196
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研究论文 | 本研究开发了一种基于活性氧物种(ROS)的哺乳动物基因开关平台,能够通过多种分子精细调控治疗基因的表达 | 该系统利用KEAP1作为ROS传感器,通过NRF2的核转位激活目标基因表达,扩展了可驱动治疗基因开关的小分子诱导剂种类 | NA | 旨在通过合成生物学方法,精确控制基于细胞的基因治疗中的治疗蛋白质表达 | 开发一种能够通过多种分子生成低毒性ROS来控制治疗基因表达的基因开关平台 | 合成生物学 | 糖尿病 | NA | NA | NA | 实验使用了患有1型糖尿病的小鼠模型 |
842 | 2024-08-07 |
Green horizons: how plant synthetic biology can enable space exploration and drive on Earth sustainability
2024-04, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103069
PMID:38341984
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研究论文 | 本文探讨了利用植物合成生物学技术在太空探索中实现资源高效利用和自给自足的可能性,并强调这些技术在地球可持续发展中的应用价值 | 利用合成生物学技术,将微生物系统的经验应用于碳效率更高的光合作用生物,以满足从燃料到材料和药物的各种需求 | NA | 探讨植物合成生物学在太空探索和地球可持续发展中的应用 | 植物合成生物学技术及其在太空和地球环境中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
843 | 2024-08-07 |
Carbon recycling with synthetic CO2 fixation pathways
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103023
PMID:38007984
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综述 | 本文综述了构建合成CO2固定途径的最新进展,并讨论了设计原则及面临的挑战 | 结合自养生物和异养生物的优势,通过合成生物学和代谢工程在异养生物中实现合成碳固定 | NA | 探讨如何通过合成碳固定途径实现碳循环,以缓解全球气候变化并支持地球上的生命 | 合成CO2固定途径及其在不同CO浓度下的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学和代谢工程 | NA | NA | NA |
844 | 2024-08-07 |
Pseudomonas putida as a synthetic biology chassis and a metabolic engineering platform
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103025
PMID:38061264
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研究论文 | 本文探讨了土壤细菌Pseudomonas putida(特别是KT2440菌株)作为合成生物学底盘和代谢工程平台的应用 | 本文展示了Pseudomonas putida在生物转化中的应用,包括生产有价值的化学品和降解/增值环境污染物,推动了传统酶学向自然界未探索反应的边界扩展 | NA | 研究Pseudomonas putida作为合成生物学底盘和代谢工程平台的潜力 | Pseudomonas putida KT2440菌株及其在生物转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编程 | NA | NA | NA |
845 | 2024-08-07 |
Recent advances in the biological depolymerization and upcycling of polyethylene terephthalate
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103053
PMID:38128200
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综述 | 本文综述了利用生物技术分解聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)并进行升级回收的最新进展 | 通过蛋白质工程策略提高PET水解酶的催化活性和效率,以及开发新型PET水解酶以实现大规模PET解聚 | 成本效益仍然是一个挑战,需要进一步研究以使PET升级回收在经济上可行 | 开发生物工具用于PET分解,并将其转化为有价值的平台化学品和材料 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)及其分解产物 | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA |
846 | 2024-08-07 |
Repeated Decision Stumping Distils Simple Rules from Single-Cell Data
2024-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0613
PMID:38170180
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为重复决策树桩(ReDX)的方法,用于从单细胞数据中提取简单模型 | 提出了一种新的方法重复决策树桩(ReDX),通过构建深度为一的决策树来识别驱动细胞命运转换的基因产物,无需先验知识 | NA | 开发一种方法从单细胞数据中提取简单模型,以识别关键的基因产物 | 单细胞数据中的基因产物 | 机器学习 | NA | 决策树 | 决策树桩 | 单细胞数据 | 不同子样本的实验数据 |
847 | 2024-08-07 |
Coupling protein scaffold and biosilicification: A sustainable and recyclable approach for d-mannitol production via one-step purification and immobilization of multienzymes
2024-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.132196
PMID:38723818
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研究论文 | 本文介绍了一种结合蛋白质支架和生物硅化的系统,用于一步法纯化和固定化多酶,以生产d-甘露醇。 | 引入了一种新的蛋白质支架和生物硅化结合系统,实现了多酶的一步法纯化和固定化,提高了d-甘露醇的产量和酶的稳定性。 | 文章未明确提及该方法的局限性。 | 开发一种可持续且可回收的方法,用于通过一步法纯化和固定化多酶来生产d-甘露醇。 | 研究对象包括蛋白质支架、生物硅化过程以及d-甘露醇的酶法合成。 | NA | NA | 蛋白质支架和生物硅化技术 | NA | NA | 酶与支架的比例为1:8,进行了6个周期的反应。 |
848 | 2024-08-07 |
Concepts of a synthetic minimal cell: Information molecules, metabolic pathways, and vesicle reproduction
2024, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v21.0002
PMID:38803330
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综述 | 本文探讨了如何从非生命分子组装中产生生命系统,并通过人工重构最小合成细胞系统展示了递归生长和分裂周期 | 作者开发了基于囊泡系统的合成最小细胞,避免了使用生物细胞复杂的分子机制,并尝试以最简单的形式重新设计细胞 | NA | 探讨生物细胞与合成最小细胞在细胞概念上的异同,为合成生物学、人工细胞和原细胞研究领域的读者提供分子组装的见解 | 生物细胞与合成最小细胞的比较 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
849 | 2024-08-07 |
Advancing Engineered Plant Living Materials through Tobacco BY-2 Cell Growth and Transfection within Tailored Granular Hydrogel Scaffolds
2024-May-22, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c00338
PMID:38799669
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研究论文 | 本研究介绍了一种创新的方法,利用合成生物学和工程学的复杂相互作用,在定制的颗粒水凝胶支架内精确空间图案化和遗传转化烟草BY-2细胞系 | 本研究开发了一种3D生物打印技术,能够在定制的颗粒水凝胶支架内同时促进烟草BY-2细胞的生长和遗传转化,展示了EPLMs的独特结构和功能特性 | NA | 推动工程化植物活体材料的发展 | 烟草BY-2细胞系及其在定制水凝胶支架内的生长和转化 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印技术 | NA | 细胞 | NA |
850 | 2024-08-07 |
New strategies to study in depth the metabolic mechanism of astaxanthin biosynthesis in Phaffia rhodozyma
2024-May-26, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2344578
PMID:38797672
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综述 | 本文综述了虾青素生物合成代谢途径、调控机制及提高产量的初步策略 | 提出了利用组学、基因组编辑、蛋白质结构-活性分析和合成生物学等前沿方法深入研究虾青素合成机制的新策略 | 需要进一步研究关键基因的具体功能、双功能酶的作用机制和代谢通量的调控,以完全揭示虾青素合成的完整途径 | 深入研究虾青素生物合成的代谢机制并提高其产量 | 虾青素在Phaffia rhodozyma中的生物合成 | NA | NA | 组学、基因组编辑、蛋白质结构-活性分析、合成生物学 | NA | NA | NA |
851 | 2024-08-07 |
Enzyme-assisted high throughput sequencing of an expanded genetic alphabet at single base resolution
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48408-9
PMID:38744910
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研究论文 | 本文报道了一种酶辅助的扩展遗传字母序列(ESEGA)方法,用于在单碱基分辨率下测序六字母的AEGIS DNA | 开发了一种新的酶辅助序列方法ESEGA,用于测序扩展的遗传字母DNA,并展示了其在优化条件下的六核苷酸PCR中的应用 | NA | 开发适用于扩展DNA的分析工具,以支持其在生物技术中的进一步应用 | 扩展的遗传字母DNA(AEGIS DNA)及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 酶辅助序列方法(ESEGA) | NA | DNA序列 | 涉及六核苷酸PCR的优化条件及多种DNA聚合酶的保真性评估 |
852 | 2024-08-07 |
N-Terminal Amino Acid Affects the Translation Efficiency at Lower Temperatures in a Reconstituted Protein Synthesis System
2024-May-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105264
PMID:38791303
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研究论文 | 研究了N端氨基酸序列对基于PURE系统的蛋白质合成效率的影响,特别是在低温条件下 | 发现N端单个氨基酸替换显著改变了PURE系统中的翻译效率,尤其是在低温条件下 | NA | 探讨N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | 合成生物学 | NA | 细胞自由蛋白质合成系统 | NA | 氨基酸序列 | NA |
853 | 2024-08-07 |
Is Life Binary or Gradual?
2024-Apr-27, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life14050564
PMID:38792586
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研究论文 | 本文探讨了生命本质的二元性和非二元性概念,特别是在微生物学、病毒学、合成生物学和系统化学等领域中,中间实体对生命与非生命简单分类的挑战 | 提出生命可能是一个渐进的光谱,而非简单的二元区分 | 目前科学状态下,是否存在一个明确的界限仍未确定 | 探索生命的定义及其在生命起源研究和天体生物学中的应用 | 生命的本质及其分类 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
854 | 2024-08-07 |
An integrative database and its application for plant synthetic biology research
2024-May-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100827
PMID:38297840
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研究论文 | 构建了一个基于网络的植物合成生物学数据库(PSBD),用于分类和提供植物合成生物学研究中的生物部件和化学物质信息 | PSBD数据库整合了1677个催化生物部件和384个调控元件,并提供了在线生物信息学工具,以辅助植物基因表达的合理设计 | NA | 开发一个集成且用户为中心的平台,为植物合成生物学研究提供一站式服务 | 植物合成生物学中的生物部件和化学物质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 1677个催化生物部件,384个调控元件,309个物种,850种化学物质 |
855 | 2024-08-07 |
Toward the Exploitation of Sustainable Green Factory: Biotechnology Use of Nannochloropsis spp
2024-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology13050292
PMID:38785776
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综述 | 本文综述了利用Nannochloropsis spp.作为绿色生物工厂生产高价值产品的现状和前景 | 探讨了合成生物学和遗传工具在Nannochloropsis spp.中的应用,为其实际工业应用提供了可能性 | 目前Nannochloropsis spp.的工业应用尚未实现 | 探索如何利用Nannochloropsis spp.作为可持续的绿色工厂,生产食品、能源和原材料 | Nannochloropsis spp.及其在生物技术中的应用 | 生物技术 | NA | 遗传操作技术 | NA | NA | NA |
856 | 2024-08-07 |
Advances and perspectives in genetic expression and operation for the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica
2024-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.05.003
PMID:38784195
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综述 | 本文综述了油脂酵母Yarrowia lipolytica在遗传表达和操作方面的最新进展,特别是基因表达、染色体操作、基于CRISPR的工具和动态生物传感器 | 介绍了合成生物学在开发新型细胞工厂方面的新机遇 | NA | 为开发微生物工厂提供有价值的参考 | 油脂酵母Yarrowia lipolytica的遗传表达和操作 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
857 | 2024-08-07 |
Special issue: Manipulation/regulation of secondary metabolites in medicinal plants
2024-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108549
PMID:38538457
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特刊 | 本特刊汇集了多篇原创研究文章和综述,旨在揭示药用植物中次生代谢物生物合成的复杂调控机制 | 利用基因组学、代谢组学和微生物组表征等尖端技术,探索药用植物中次生代谢物的生物合成、调控和操纵 | NA | 揭示药用植物中次生代谢物生物合成的调控机制,并探索优化其生产的方法 | 药用植物中的次生代谢物 | NA | NA | 基因组学、代谢组学、微生物组表征 | NA | NA | NA |
858 | 2024-08-07 |
Unveiling Amaryllidaceae alkaloids: from biosynthesis to antiviral potential - a review
2024-May-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00044c
PMID:38131392
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综述 | 本文综述了Amaryllidaceae生物碱(AAs)的结构多样性、生物合成途径及其在抗病毒药物发现中的潜在应用 | 本文强调了合成和手性选择性研究在验证生物合成结论中的关键作用,并探讨了AAs作为抗病毒药物先导化合物的潜力 | AAs的生物合成过程尚未完全定义,需要进一步的跨学科努力以完全理解其生物合成途径及其结构-活性关系 | 探讨Amaryllidaceae生物碱的生物合成途径及其在抗病毒药物发现中的应用 | Amaryllidaceae生物碱及其生物合成途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
859 | 2024-08-07 |
Ethics and engagement: steering China's synbio future
2024-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.013
PMID:37968158
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研究论文 | 本文探讨了公众参与和伦理指导在塑造中国合成生物学未来发展轨迹中的关键作用 | NA | NA | 探讨公众参与和伦理指导在合成生物学领域中的重要性 | 合成生物学在中国的发展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
860 | 2024-08-07 |
Regulatory microRNAs and phasiRNAs of paclitaxel biosynthesis in Taxus chinensis
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1403060
PMID:38779066
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研究论文 | 本文系统地鉴定了990个转录因子(TFs)、460个微小RNAs(miRNAs)和160个相位小干扰RNAs(phasiRNAs),并探讨了它们在紫杉醇合成中的相互作用和潜在调控作用。 | 本文通过共表达网络分析推断调控TFs,并构建了包括酶基因、TFs、miRNAs和phasiRNAs的调控网络,揭示了紫杉醇生产在转录后水平的层级调控。 | NA | 研究紫杉醇合成的转录和转录后调控机制,以促进通过组织/细胞培养方法提高紫杉醇产量。 | 紫杉醇的生物合成机制及其调控因子。 | NA | 抗癌活性 | NA | NA | 基因表达数据 | 990个转录因子,460个微小RNAs,160个相位小干扰RNAs |