合成生物学相关文章
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当前共找到 1142 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2024-08-07 |
Pseudomonas putida as a synthetic biology chassis and a metabolic engineering platform
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103025
PMID:38061264
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研究论文 | 本文探讨了土壤细菌Pseudomonas putida（特别是KT2440菌株）作为合成生物学底盘和代谢工程平台的应用 | 本文展示了Pseudomonas putida在生物转化中的应用，包括生产有价值的化学品和降解/增值环境污染物，推动了传统酶学向自然界未探索反应的边界扩展 | NA | 研究Pseudomonas putida作为合成生物学底盘和代谢工程平台的潜力 | Pseudomonas putida KT2440菌株及其在生物转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编程 | NA | NA | NA |
| 862 | 2024-08-07 |
Recent advances in the biological depolymerization and upcycling of polyethylene terephthalate
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103053
PMID:38128200
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综述 | 本文综述了利用生物技术分解聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）并进行升级回收的最新进展 | 通过蛋白质工程策略提高PET水解酶的催化活性和效率，以及开发新型PET水解酶以实现大规模PET解聚 | 成本效益仍然是一个挑战，需要进一步研究以使PET升级回收在经济上可行 | 开发生物工具用于PET分解，并将其转化为有价值的平台化学品和材料 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）及其分解产物 | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA |
| 863 | 2024-08-07 |
Repeated Decision Stumping Distils Simple Rules from Single-Cell Data
2024-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0613
PMID:38170180
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为重复决策树桩（ReDX）的方法，用于从单细胞数据中提取简单模型 | 提出了一种新的方法重复决策树桩（ReDX），通过构建深度为一的决策树来识别驱动细胞命运转换的基因产物，无需先验知识 | NA | 开发一种方法从单细胞数据中提取简单模型，以识别关键的基因产物 | 单细胞数据中的基因产物 | 机器学习 | NA | 决策树 | 决策树桩 | 单细胞数据 | 不同子样本的实验数据 |
| 864 | 2024-08-07 |
Coupling protein scaffold and biosilicification: A sustainable and recyclable approach for d-mannitol production via one-step purification and immobilization of multienzymes
2024-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.132196
PMID:38723818
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研究论文 | 本文介绍了一种结合蛋白质支架和生物硅化的系统，用于一步法纯化和固定化多酶，以生产d-甘露醇。 | 引入了一种新的蛋白质支架和生物硅化结合系统，实现了多酶的一步法纯化和固定化，提高了d-甘露醇的产量和酶的稳定性。 | 文章未明确提及该方法的局限性。 | 开发一种可持续且可回收的方法，用于通过一步法纯化和固定化多酶来生产d-甘露醇。 | 研究对象包括蛋白质支架、生物硅化过程以及d-甘露醇的酶法合成。 | NA | NA | 蛋白质支架和生物硅化技术 | NA | NA | 酶与支架的比例为1:8，进行了6个周期的反应。 |
| 865 | 2024-08-07 |
Advancing Engineered Plant Living Materials through Tobacco BY-2 Cell Growth and Transfection within Tailored Granular Hydrogel Scaffolds
2024-May-22, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c00338
PMID:38799669
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研究论文 | 本研究介绍了一种创新的方法，利用合成生物学和工程学的复杂相互作用，在定制的颗粒水凝胶支架内精确空间图案化和遗传转化烟草BY-2细胞系 | 本研究开发了一种3D生物打印技术，能够在定制的颗粒水凝胶支架内同时促进烟草BY-2细胞的生长和遗传转化，展示了EPLMs的独特结构和功能特性 | NA | 推动工程化植物活体材料的发展 | 烟草BY-2细胞系及其在定制水凝胶支架内的生长和转化 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印技术 | NA | 细胞 | NA |
| 866 | 2024-08-07 |
Enzyme-assisted high throughput sequencing of an expanded genetic alphabet at single base resolution
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48408-9
PMID:38744910
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研究论文 | 本文报道了一种酶辅助的扩展遗传字母序列（ESEGA）方法，用于在单碱基分辨率下测序六字母的AEGIS DNA | 开发了一种新的酶辅助序列方法ESEGA，用于测序扩展的遗传字母DNA，并展示了其在优化条件下的六核苷酸PCR中的应用 | NA | 开发适用于扩展DNA的分析工具，以支持其在生物技术中的进一步应用 | 扩展的遗传字母DNA（AEGIS DNA）及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 酶辅助序列方法（ESEGA） | NA | DNA序列 | 涉及六核苷酸PCR的优化条件及多种DNA聚合酶的保真性评估 |
| 867 | 2024-08-07 |
N-Terminal Amino Acid Affects the Translation Efficiency at Lower Temperatures in a Reconstituted Protein Synthesis System
2024-May-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105264
PMID:38791303
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研究论文 | 研究了N端氨基酸序列对基于PURE系统的蛋白质合成效率的影响，特别是在低温条件下 | 发现N端单个氨基酸替换显著改变了PURE系统中的翻译效率，尤其是在低温条件下 | NA | 探讨N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | 合成生物学 | NA | 细胞自由蛋白质合成系统 | NA | 氨基酸序列 | NA |
| 868 | 2024-08-07 |
Is Life Binary or Gradual?
2024-Apr-27, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life14050564
PMID:38792586
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研究论文 | 本文探讨了生命本质的二元性和非二元性概念，特别是在微生物学、病毒学、合成生物学和系统化学等领域中，中间实体对生命与非生命简单分类的挑战 | 提出生命可能是一个渐进的光谱，而非简单的二元区分 | 目前科学状态下，是否存在一个明确的界限仍未确定 | 探索生命的定义及其在生命起源研究和天体生物学中的应用 | 生命的本质及其分类 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 869 | 2024-08-07 |
An integrative database and its application for plant synthetic biology research
2024-May-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100827
PMID:38297840
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研究论文 | 构建了一个基于网络的植物合成生物学数据库（PSBD），用于分类和提供植物合成生物学研究中的生物部件和化学物质信息 | PSBD数据库整合了1677个催化生物部件和384个调控元件，并提供了在线生物信息学工具，以辅助植物基因表达的合理设计 | NA | 开发一个集成且用户为中心的平台，为植物合成生物学研究提供一站式服务 | 植物合成生物学中的生物部件和化学物质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 1677个催化生物部件，384个调控元件，309个物种，850种化学物质 |
| 870 | 2024-08-07 |
Advances and perspectives in genetic expression and operation for the oleaginous yeast Yarrowia lipolytica
2024-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.05.003
PMID:38784195
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综述 | 本文综述了油脂酵母Yarrowia lipolytica在遗传表达和操作方面的最新进展，特别是基因表达、染色体操作、基于CRISPR的工具和动态生物传感器 | 介绍了合成生物学在开发新型细胞工厂方面的新机遇 | NA | 为开发微生物工厂提供有价值的参考 | 油脂酵母Yarrowia lipolytica的遗传表达和操作 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 871 | 2024-08-07 |
Special issue: Manipulation/regulation of secondary metabolites in medicinal plants
2024-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108549
PMID:38538457
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特刊 | 本特刊汇集了多篇原创研究文章和综述，旨在揭示药用植物中次生代谢物生物合成的复杂调控机制 | 利用基因组学、代谢组学和微生物组表征等尖端技术，探索药用植物中次生代谢物的生物合成、调控和操纵 | NA | 揭示药用植物中次生代谢物生物合成的调控机制，并探索优化其生产的方法 | 药用植物中的次生代谢物 | NA | NA | 基因组学、代谢组学、微生物组表征 | NA | NA | NA |
| 872 | 2024-08-07 |
Unveiling Amaryllidaceae alkaloids: from biosynthesis to antiviral potential - a review
2024-May-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00044c
PMID:38131392
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综述 | 本文综述了Amaryllidaceae生物碱（AAs）的结构多样性、生物合成途径及其在抗病毒药物发现中的潜在应用 | 本文强调了合成和手性选择性研究在验证生物合成结论中的关键作用，并探讨了AAs作为抗病毒药物先导化合物的潜力 | AAs的生物合成过程尚未完全定义，需要进一步的跨学科努力以完全理解其生物合成途径及其结构-活性关系 | 探讨Amaryllidaceae生物碱的生物合成途径及其在抗病毒药物发现中的应用 | Amaryllidaceae生物碱及其生物合成途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 873 | 2024-08-07 |
Ethics and engagement: steering China's synbio future
2024-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.013
PMID:37968158
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研究论文 | 本文探讨了公众参与和伦理指导在塑造中国合成生物学未来发展轨迹中的关键作用 | NA | NA | 探讨公众参与和伦理指导在合成生物学领域中的重要性 | 合成生物学在中国的发展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 874 | 2024-08-07 |
Regulatory microRNAs and phasiRNAs of paclitaxel biosynthesis in Taxus chinensis
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1403060
PMID:38779066
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研究论文 | 本文系统地鉴定了990个转录因子（TFs）、460个微小RNAs（miRNAs）和160个相位小干扰RNAs（phasiRNAs），并探讨了它们在紫杉醇合成中的相互作用和潜在调控作用。 | 本文通过共表达网络分析推断调控TFs，并构建了包括酶基因、TFs、miRNAs和phasiRNAs的调控网络，揭示了紫杉醇生产在转录后水平的层级调控。 | NA | 研究紫杉醇合成的转录和转录后调控机制，以促进通过组织/细胞培养方法提高紫杉醇产量。 | 紫杉醇的生物合成机制及其调控因子。 | NA | 抗癌活性 | NA | NA | 基因表达数据 | 990个转录因子，460个微小RNAs，160个相位小干扰RNAs |
| 875 | 2024-08-07 |
The hope, hype and obstacles surrounding cell therapy
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18359
PMID:38770886
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研究论文 | 本文探讨了细胞疗法在医学领域的希望与挑战 | 介绍了合成生物学在细胞疗法中的潜在解决方案 | 细胞疗法在治疗某些疾病如遗传性疾病和纤毛病方面的局限性 | 分析细胞疗法的潜力及其在不同疾病治疗中的应用 | 干细胞及其衍生品在疾病治疗中的应用 | NA | 糖尿病, 帕金森病, 镰状细胞病, 遗传性疾病, 纤毛病 | 细胞疗法, 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 876 | 2024-08-07 |
Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14
PMID:38780738
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研究论文 | 本文介绍了BarMap-QA管道的开发，用于评估共转录折叠模拟的质量，并通过一个详细的例子展示了其应用。 | 开发了用户友好的BarMap-QA管道，用于克服原始BarMap软件在特定场景如共转录折叠中的使用难度。 | 原始的BarMap软件在特定场景如共转录折叠中使用困难。 | 验证设计构造的功能性，避免昂贵的实验室实验。 | 共转录RNA折叠模拟的质量评估。 | NA | NA | BarMap方法 | Markov过程 | RNA二级结构 | 一个合成转录调控的riboswitch |
| 877 | 2024-08-07 |
Bacterial cyclophane-containing RiPPs from radical SAM enzymes
2024-May-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00030c
PMID:38047390
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research paper | 本文聚焦于细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs，这些RiPPs由自由基SAM/SPASM酶产生，通过在 precursor peptide 的两个氨基酸残基的芳香环和侧链之间形成交联。 | 本文介绍了近年来含环状聚酰胺的RiPP天然产物及其生物合成途径的发现，并讨论了这些途径和产品的发现方法。 | NA | 探讨细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs及其生物合成酶，作为药物发现和合成生物学工具的未开发资源。 | 细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs及其生物合成酶。 | NA | NA | 自由基SAM/SPASM酶 | NA | NA | NA |
| 878 | 2024-08-07 |
Modern Approaches to de novo Synthesis of Extended DNA Fragments: Assembly of a Wide Repertoire of Sequences
2024 Jan-Mar, Acta naturae
IF:2.0Q4
DOI:10.32607/actanaturae.27362
PMID:38738632
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研究论文 | 本文提出了一种用于合成更广泛序列的DNA片段组装方法，并优化了组装条件 | 本文优化了DNA片段组装的条件，使其适用于更广泛的序列合成 | NA | 标准化合成生物学中DNA片段组装方法 | DNA片段的合成与组装 | 合成生物学 | NA | 化学合成寡核苷酸 | NA | DNA序列 | NA |
| 879 | 2024-08-07 |
A critical review of microplastics in aquatic ecosystems: Degradation mechanisms and removing strategies
2024-Sep, Environmental science and ecotechnology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.ese.2024.100427
PMID:38765892
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综述 | 本文综述了水生生态系统中微塑料的降解机制和去除策略 | 介绍了结合物理化学预处理和微生物降解的新策略，以及膜生物反应器、合成生物学、有机硅基技术、生物膜介导的修复和纳米材料增强策略等创新方法 | NA | 旨在促进微塑料有效去除方法的创新，提升环境和社交福祉 | 水生生态系统中的微塑料 | 环境科学 | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA |
| 880 | 2024-08-07 |
Reverse engineering morphogenesis through Bayesian optimization of physics-based models
2024-May-07, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00375-z
PMID:38714708
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研究论文 | 本文通过贝叶斯优化物理模型，逆向工程了形态发生过程，以匹配实验观察到的器官形状 | 开发了一种贝叶斯优化框架，利用高斯过程回归学习形态发生程序的映射函数，成功推断出模拟数据与实验数据匹配所需的核心参数变化 | NA | 解决物理模型参数校准的逆问题，优化细胞力分布以预测器官形状、大小和功能 | 果蝇翅膀的成虫盘，研究从发育到癌症的表皮过程 | 系统生物学 | NA | 贝叶斯优化 | 高斯过程回归 | 图像数据 | 果蝇翅膀成虫盘样本 |