合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
861	2024-08-07	The hope, hype and obstacles surrounding cell therapy 2024-May, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.18359 PMID:38770886	研究论文	本文探讨了细胞疗法在医学领域的希望与挑战	介绍了合成生物学在细胞疗法中的潜在解决方案	细胞疗法在治疗某些疾病如遗传性疾病和纤毛病方面的局限性	分析细胞疗法的潜力及其在不同疾病治疗中的应用	干细胞及其衍生品在疾病治疗中的应用	NA	糖尿病, 帕金森病, 镰状细胞病, 遗传性疾病, 纤毛病	细胞疗法, 合成生物学	NA	NA	NA
862	2024-08-07	Assessing the Quality of Cotranscriptional Folding Simulations 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3519-3_14 PMID:38780738	研究论文	本文介绍了BarMap-QA管道的开发，用于评估共转录折叠模拟的质量，并通过一个详细的例子展示了其应用。	开发了用户友好的BarMap-QA管道，用于克服原始BarMap软件在特定场景如共转录折叠中的使用难度。	原始的BarMap软件在特定场景如共转录折叠中使用困难。	验证设计构造的功能性，避免昂贵的实验室实验。	共转录RNA折叠模拟的质量评估。	NA	NA	BarMap方法	Markov过程	RNA二级结构	一个合成转录调控的riboswitch
863	2024-08-07	Bacterial cyclophane-containing RiPPs from radical SAM enzymes 2024-May-22, Natural product reports IF:10.2Q1 DOI:10.1039/d3np00030c PMID:38047390	research paper	本文聚焦于细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs，这些RiPPs由自由基SAM/SPASM酶产生，通过在 precursor peptide 的两个氨基酸残基的芳香环和侧链之间形成交联。	本文介绍了近年来含环状聚酰胺的RiPP天然产物及其生物合成途径的发现，并讨论了这些途径和产品的发现方法。	NA	探讨细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs及其生物合成酶，作为药物发现和合成生物学工具的未开发资源。	细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs及其生物合成酶。	NA	NA	自由基SAM/SPASM酶	NA	NA	NA
864	2024-08-07	Modern Approaches to de novo Synthesis of Extended DNA Fragments: Assembly of a Wide Repertoire of Sequences 2024 Jan-Mar, Acta naturae IF:2.0Q4 DOI:10.32607/actanaturae.27362 PMID:38738632	研究论文	本文提出了一种用于合成更广泛序列的DNA片段组装方法，并优化了组装条件	本文优化了DNA片段组装的条件，使其适用于更广泛的序列合成	NA	标准化合成生物学中DNA片段组装方法	DNA片段的合成与组装	合成生物学	NA	化学合成寡核苷酸	NA	DNA序列	NA
865	2024-08-07	A critical review of microplastics in aquatic ecosystems: Degradation mechanisms and removing strategies 2024-Sep, Environmental science and ecotechnology IF:14.0Q1 DOI:10.1016/j.ese.2024.100427 PMID:38765892	综述	本文综述了水生生态系统中微塑料的降解机制和去除策略	介绍了结合物理化学预处理和微生物降解的新策略，以及膜生物反应器、合成生物学、有机硅基技术、生物膜介导的修复和纳米材料增强策略等创新方法	NA	旨在促进微塑料有效去除方法的创新，提升环境和社交福祉	水生生态系统中的微塑料	环境科学	NA	纳米技术	NA	NA	NA
866	2024-08-07	Reverse engineering morphogenesis through Bayesian optimization of physics-based models 2024-May-07, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1 DOI:10.1038/s41540-024-00375-z PMID:38714708	研究论文	本文通过贝叶斯优化物理模型，逆向工程了形态发生过程，以匹配实验观察到的器官形状	开发了一种贝叶斯优化框架，利用高斯过程回归学习形态发生程序的映射函数，成功推断出模拟数据与实验数据匹配所需的核心参数变化	NA	解决物理模型参数校准的逆问题，优化细胞力分布以预测器官形状、大小和功能	果蝇翅膀的成虫盘，研究从发育到癌症的表皮过程	系统生物学	NA	贝叶斯优化	高斯过程回归	图像数据	果蝇翅膀成虫盘样本
867	2024-08-07	Synthetic microbiology in sustainability applications 2024-Jun, Nature reviews. Microbiology DOI:10.1038/s41579-023-01007-9 PMID:38253793	综述	本文综述了通过合成生物学解决社会可持续性挑战的研究工作，强调了基础微生物学研究问题的重要性	引入了一个组织框架，将这些努力分为工厂、农场和田地三个领域，这些领域由工程微生物与自然外部环境的交互程度定义	NA	通过合成生物学加速解决可持续性挑战的发展	微生物及其在不同环境中的代谢能力	合成生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
868	2024-08-07	Developing the E. coli platform for efficient production of UMP-derived chemicals 2024-May, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2024.03.004 PMID:38522576	研究论文	本文通过设计一个人工途径，首次在E. coli中实现了5-甲基尿苷（5-MU）的高效生产，并进一步开发了一个多功能且稳健的平台，用于生产多种UMP衍生化学品。	首次在E. coli中通过设计的人工途径高效生产5-MU，并开发了抗生素免费发酵策略，实现了5-MU的高产量。	NA	开发E. coli平台，用于高效生产UMP衍生化学品。	5-甲基尿苷（5-MU）及其衍生化学品。	合成生物学	NA	酶工程	NA	NA	E. coli MB229 (ΔthyA 菌株)
869	2024-08-07	Self-controlled in silico gene knockdown strategies to enhance the sustainable production of heterologous terpenoid by Saccharomyces cerevisiae 2024-May, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2024.04.005 PMID:38648878	研究论文	本研究利用合成生物学和计算生物学方法，通过基因敲除和负反馈回路设计，优化了酵母细胞中异源萜类化合物的生产	本研究创新性地结合了OptKnock模拟和合成生物学方法，通过负反馈回路动态调节基因表达，提高了目标产物的可持续生产	基因敲除在批量培养中效果显著，但在连续培养模式下效果减弱，表明基因敲除不支持目标产物的可持续生产	提高酵母细胞中异源萜类化合物的生产效率和可持续性	酵母细胞中的异源萜类化合物生产	合成生物学	NA	OptKnock模拟	基因敲除	基因组规模代谢模型	构建了多种酵母菌株进行实验
870	2024-08-07	Robust genetic codes enhance protein evolvability 2024-May, PLoS biology IF:7.8Q1 DOI:10.1371/journal.pbio.3002594 PMID:38754362	研究论文	本文通过大规模并行序列到功能测定数据，分析了数百种重构遗传密码下的6个经验适应性景观，探讨了遗传密码的鲁棒性对蛋白质可演化性的影响。	发现鲁棒的遗传密码通过呈现平滑的适应性景观，从而增强蛋白质的可演化性，并揭示了设计非标准遗传密码以增强或减弱可演化性的一般原则。	研究主要集中在遗传密码的鲁棒性对蛋白质可演化性的影响，未涉及其他可能影响蛋白质演化的因素。	探讨遗传密码的鲁棒性如何影响蛋白质的可演化性。	遗传密码的鲁棒性及其对蛋白质可演化性的影响。	合成生物学	NA	大规模并行序列到功能测定	NA	序列数据	超过1600万条mRNA序列
871	2024-08-07	Recent advances in CAR T-cell engineering using synthetic biology: Paving the way for next-generation cancer treatment 2024, Advances in protein chemistry and structural biology DOI:10.1016/bs.apcsb.2024.02.003 PMID:38762281	review	本章节全面探讨了癌症免疫治疗领域中的变革性创新，特别是合成生物学在提升CAR T细胞疗法安全性和有效性中的关键作用	强调了合成生物学在定制化CAR T细胞疗法中的应用，通过基因编辑、合成基因电路和分子工程等技术优化CAR T细胞功能	NA	探讨合成生物学在CAR T细胞疗法中的应用，以提高癌症治疗的安全性和效果	CAR T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用	NA	cancer	合成生物学	NA	NA	NA
872	2024-08-07	Eye Diseases: When the Solution Comes from Plant Alkaloids 2024-May, Planta medica IF:2.1Q2 DOI:10.1055/a-2283-2350 PMID:38452806	综述	本文综述了用于治疗眼病的植物生物碱，包括其历史概述、提取来源植物以及支持其治疗活性的临床和分子数据	探讨了生物技术在生物碱生产中的应用，如基因工程和合成生物学	需要进一步研究以完全满足制药需求	提供关于用于治疗眼病的植物生物碱的全面概述	植物生物碱及其在眼病治疗中的应用	NA	眼病	NA	NA	NA	NA
873	2024-08-07	Computational analysis into the potential of azo dyes as a feedstock for actinorhodin biosynthesis in Pseudomonas putida 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0299128 PMID:38437212	研究论文	研究探讨了利用偶氮染料作为原料在铜绿假单胞菌中合成阿特拉津的可能性	首次探索了偶氮染料作为非传统原料在合成生物学中用于生产高价值化学品的可能性，并发现偶氮染料在阿特拉津生物合成中比葡萄糖更具优势	NA	探索和优化铜绿假单胞菌利用偶氮染料作为原料进行阿特拉津生物合成的能力	铜绿假单胞菌KT2440对偶氮染料的利用及其在阿特拉津生物合成中的应用	合成生物学	NA	约束最小割集（cMCS）方法	NA	代谢通量分布	NA
874	2024-08-07	Metabolic engineering for enhanced terpenoid production: Leveraging new horizons with an old technique 2024-May, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108511 PMID:38593484	综述	本文综述了利用代谢工程增强萜类化合物生产的策略及其在药用植物中的应用前景	探讨了通过代谢工程在微生物和快速生长植物中生产有价值萜类化合物的新方法	需要进一步实施基因组编辑、代谢途径的阐明以及系统生物学和合成生物学策略	解决萜类化合物商业规模生产中的问题	萜类化合物及其在植物中的生物合成途径	植物生物技术	NA	代谢工程	NA	NA	NA
875	2024-08-07	Self-regulated efficient production of L-threonine via an artificial quorum sensing system in engineered Escherichia coli 2024-Jul, Microbiological research IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.micres.2024.127720 PMID:38640767	研究论文	设计人工群体感应系统，通过改变中心代谢途径的碳通量分布，在特定时期实现工程化大肠杆菌中L-苏氨酸的高效生产	利用群体感应系统自我调节碳通量分布，提高微生物天然产品的生产效率	NA	提高微生物代谢工程中高附加值天然产品的产量	L-苏氨酸的生产	微生物代谢工程	NA	群体感应系统	NA	NA	最终菌株TWF106/pST1011, pST1042pr能生产118.2 g/L L-苏氨酸
876	2024-08-07	Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for the biosynthesis of a fungal pigment from the phytopathogenic fungus Cladosporium phlei 2024-May-13, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13036-024-00429-0 PMID:38741106	研究论文	本研究通过合成生物学方法，将Cladosporium phlei中负责合成phleichrome色素的非还原聚酮合酶基因Cppks1及Aspergillus nidulans中的磷酸泛酰巯基乙胺转移酶基因导入Saccharomyces cerevisiae，实现了phleichrome色素在酵母中的生物合成	首次在Saccharomyces cerevisiae中通过代谢工程和多基因表达成功合成了phleichrome色素	Cppks1基因的表达对酵母细胞生长有显著不利影响，需要选择压力来维持Cppks1表达载体	探索通过代谢工程在Saccharomyces cerevisiae中合成phleichrome色素的可能性	Cladosporium phlei中的phleichrome色素及其在Saccharomyces cerevisiae中的生物合成	NA	NA	代谢工程	NA	NA	NA
877	2024-08-07	A pilot oral history of plant synthetic biology 2024-Apr-30, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiad585 PMID:38163646	review	本文通过采访8位植物合成生物学领域的创始人，记录并回顾了该领域的起源和发展	首次通过口述历史的方式，系统地记录了植物合成生物学的早期发展历程	由于植物合成生物学领域尚新，历史分析可能不够全面	捕捉植物合成生物学的起源和早期发展的本质	植物合成生物学的创始人和早期发展	合成生物学	NA	NA	NA	文本	8位领域的创始人
878	2024-08-07	Probiotic-fermented edible herbs as functional foods: A review of current status, challenges, and strategies 2024-03, Comprehensive reviews in food science and food safety IF:12.0Q1 DOI:10.1111/1541-4337.13305 PMID:38379388	综述	本文综述了益生菌发酵食用草药作为功能性食品的当前研究状态、挑战和策略	强调了益生菌发酵食用草药中活性成分的生物转化及其健康益处	NA	探讨益生菌发酵食用草药在功能性食品中的应用及其健康益处	益生菌发酵食用草药及其功能性食品的应用	NA	慢性疾病	NA	NA	NA	NA
879	2024-08-07	Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling 2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.04.25.591074 PMID:38712145	研究论文	本文通过工程化一种名为聚合酶链式回收（PSR）的等温信号放大电路，扩展了无细胞生物传感技术	利用T7 RNA聚合酶的非目标转录来在DNA链置换电路中回收核酸输入，设计了PSR电路组件的设计规则，并构建了可直接感知不同RNA目标的模块化生物传感器	NA	扩展无细胞电路的当前能力，通过整合PSR技术	无细胞生物传感系统中的信号放大电路	合成生物学	NA	聚合酶链式回收（PSR）	NA	核酸	NA
880	2024-08-07	Photosynthesis 2.0: Realizing New-to-Nature CO2-Fixation to Overcome the Limits of Natural Metabolism 2024-02-01, Cold Spring Harbor perspectives in biology IF:6.9Q1 DOI:10.1101/cshperspect.a041669 PMID:37848245	research paper	本文探讨了通过合成生物学实现新型自然界未有的二氧化碳固定代谢途径，以克服自然光合作用的限制	提出了两种不同的策略：一是通过工程化植物实现碳中和或碳负性光呼吸代谢，如tatronyl-CoA途径，以提高二氧化碳吸收率；二是完全替代自然光合作用，引入如CETCH循环等替代性二氧化碳固定代谢途径，有望显著提高二氧化碳吸收率	NA	旨在通过合成生物学方法扩展植物代谢能力，以应对未来气候变化的挑战	工程化植物及其代谢途径	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA