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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2024-08-07 |
Chalkophomycin Biosynthesis Revealing Unique Enzyme Architecture for a Hybrid Nonribosomal Peptide Synthetase and Polyketide Synthase
2024-Apr-25, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29091982
PMID:38731473
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研究论文 | 本文研究了来自sp. CB00271的chalkophomycin的生物合成机制,揭示了其独特的非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的酶结构 | 首次揭示了chalkophomycin生物合成中独特的酶结构,涉及非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的混合体系 | NA | 阐明chalkophomycin的生物合成机制,并为通过合成生物学方法工程化chalkophomycin类似物奠定基础 | chalkophomycin的生物合成基因簇及其编码的酶 | 生物化学 | NA | 基因替换 | NA | DNA序列 | 涉及约31 kb的DNA区域,包含19个开放阅读框 | NA | NA | NA | NA |
| 902 | 2024-08-07 |
Efficient biosynthesis of transglutaminase in Streptomyces mobaraensis via systematic engineering strategies
2024, Current research in food science
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.crfs.2024.100756
PMID:38736907
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研究论文 | 本研究通过系统工程策略在重组的smL2020菌株中高效合成转谷氨酰胺酶(TGase) | 通过多重工程策略,包括启动子工程、优化信号肽和重组位点以及增加表达盒的拷贝数,实现了TGase活性的显著提升,达到了迄今为止报道的最高水平 | NA | 提高转谷氨酰胺酶在食品工业中的应用范围 | 转谷氨酰胺酶的合成与应用 | 生物技术 | NA | 系统工程策略 | NA | 酶活性数据 | 1000升发酵罐 | NA | NA | NA | NA |
| 903 | 2024-08-07 |
Tailored UPRE2 variants for dynamic gene regulation in yeast
2024-May-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315729121
PMID:38687789
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研究论文 | 本文通过创建UPRE2突变体库,筛选出具有增强响应性和更宽动态范围的元素,并研究了其与转录因子Hac1的相互作用,以提高酵母中重组蛋白和天然产物合成的效率 | 开发了新的UPRE2突变体,增强了与Hac1的结合亲和力,提高了基因表达的动态调控能力 | NA | 研究如何通过合成生物学方法优化酵母中的基因调控,以提高化学品和重组蛋白的生产效率 | UPRE2突变体及其在酵母细胞中的基因调控作用 | 合成生物学 | NA | 分子建模,定点突变 | NA | 基因序列 | 多个UPRE2突变体元素 | NA | NA | NA | NA |
| 904 | 2024-08-07 |
OpenCell: A Low-cost, Open-Source, 3-in-1 device for DNA Extraction
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558349
PMID:37808818
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell,用于DNA提取 | OpenCell集成了珠磨机、微量离心机和涡旋混合器的功能,采用模块化附件和中央旋转无刷电机,设计紧凑且具有多种安全特性 | NA | 降低预算有限的实验室进行DNA提取的成本 | OpenCell设备的开发及其在DNA提取中的应用 | 合成生物学 | NA | 3D打印 | NA | NA | 使用OpenCell成功从菠菜中提取DNA,平均产量为2.3 μg | NA | NA | NA | NA |
| 905 | 2024-08-07 |
OpenCell: A low-cost, open-source, 3-in-1 device for DNA extraction
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0298857
PMID:38696375
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell,用于DNA提取 | OpenCell集成了珠磨机、微量离心机和涡旋混合器的功能,采用模块化附件和磁性连接,以及冗余安全特性 | NA | 解决预算有限的实验室进行高成本DNA提取的问题 | OpenCell设备及其在DNA提取中的应用 | 生物技术 | NA | DNA提取 | NA | DNA | 从Spinacia oleracea(菠菜)中成功分离DNA,平均产量为2.3 μg | NA | NA | NA | NA |
| 906 | 2024-08-07 |
Reversing the directionality of reactions between non-oxidative pentose phosphate pathway and glycolytic pathway boosts mycosporine-like amino acid production in Saccharomyces cerevisiae
2024-May-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02365-6
PMID:38725068
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研究论文 | 研究通过改变非氧化戊糖磷酸途径与糖酵解途径之间的反应方向性,提高酵母中类海藻氨基酸的生产 | 提出了一种新的代谢工程策略,通过逆转糖酵解与非氧化戊糖磷酸途径之间的通量方向,增强类海藻氨基酸的生产 | NA | 探索调控类海藻氨基酸生产的细胞因子 | 类海藻氨基酸在酵母中的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 907 | 2024-08-07 |
De novo production of bioactive sesterterpenoid ophiobolins in Saccharomyces cerevisiae cell factories
2024-May-06, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02406-0
PMID:38711040
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,在酵母细胞工厂中成功合成了具有生物活性的sesterterpenoid ophiobolins | 首次在酵母中实现了sesterterpenoid ophiobolins的异源生物合成,为新药开发提供了有价值的解决方案 | NA | 开发一种细胞工厂,用于ophiobolin的生物合成,以满足药物开发的需求 | sesterterpenoid ophiobolins及其氧化衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 908 | 2024-08-07 |
SemiSynBio: A new era for neuromorphic computing
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.04.013
PMID:38711551
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研究论文 | 本文概述了神经形态计算的原理,重点介绍了基于DNA计算的合成神经形态计算的进展,并总结了合成神经形态计算的主要挑战和前景 | 提出了一种新的半导体合成生物学(SemiSynBio)技术,利用DNA为基础的生物分子作为逻辑门来构建人工神经网络(ANNs),实现分子级别的神经形态计算 | NA | 探讨神经形态计算在生物计算、DNA存储、信息安全和国家防御中的应用潜力 | 神经形态计算及其在合成生物学中的应用 | 生物计算 | NA | DNA计算 | 人工神经网络(ANNs) | DNA分子 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 909 | 2024-08-07 |
Facilitating stable gene integration expression and copy number amplification in Bacillus subtilis through a reversible homologous recombination switch
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.04.010
PMID:38708056
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研究论文 | 本研究开发了一种稳定基因整合表达和拷贝数扩增系统,通过可逆同源重组开关在枯草芽孢杆菌中实现高水平的基因表达 | 利用抑制剂和非天然氨基酸依赖表达系统创建可逆开关,控制关键基因进行同源重组,实现基因扩增和稳定 | NA | 增强微生物细胞工厂中关键酶的持续表达,提高生物生产效率 | 枯草芽孢杆菌中的基因表达和拷贝数扩增 | 合成生物学 | NA | 同源重组 | NA | 基因表达数据 | 110代枯草芽孢杆菌 | NA | NA | NA | NA |
| 910 | 2024-08-07 |
Brief History of Placozoa
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_3
PMID:38668963
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研究论文 | 本文介绍了形态上最简单的自由生活动物——扁形动物门,并强调了其在理解动物组织起源和未来系统与合成生物学规则中的独特价值 | 扁形动物门为理解动物组织的起源和生命规则提供了独特的视角 | 尽管对扁形动物的研究已超过100年,但对其组织、自然栖息地和生活策略的了解仍然有限 | 介绍扁形动物门并强调其在拓宽生物医学科学前沿中的重要性 | 扁形动物的基因组基础、细胞身份、连接性、繁殖和行为的细胞基础 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 911 | 2024-08-07 |
Advanced computational predictive models of miRNA-mRNA interaction efficiency
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.015
PMID:38689718
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研究论文 | 本研究提出了一种改进的计算模型,用于预测miRNA-mRNA相互作用,特别关注了miRNA结合位点的分布及其对mRNA稳定性的调控作用 | 引入了新的特征集和miRNA结合位点相互作用模型(miBSIM),首次考虑了结合位点的分布及其强度,提高了预测模型的性能 | 模型需要针对特定细胞类型进行定制,以提高准确性 | 开发更精确的计算模型来预测miRNA-mRNA相互作用,以促进合成生物学和人类健康 | miRNA-mRNA相互作用及其在mRNA下调中的多方面影响 | 生物信息学 | NA | 计算模型 | miBSIM | miRNA和mRNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 912 | 2024-08-07 |
Engineering a non-model yeast Rhodotorula mucilaginosa for terpenoids synthesis
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.04.015
PMID:38690180
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,改造非模式酵母Rhodotorula mucilaginosa,以生产不同的萜类化合物 | 本研究展示了Rhodotorula mucilaginosa作为直接生物合成多种萜类化合物的平台宿主的潜力 | NA | 通过合成生物学方法,提高非模式酵母Rhodotorula mucilaginosa生产萜类化合物的能力 | Rhodotorula mucilaginosa酵母菌株及其生产萜类化合物的能力 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 生物数据 | 多个工程菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 913 | 2024-08-07 |
Molecular Transportation Conversion of Membrane Tension Using a Mechanosensitive Channel in Asymmetric Lipid-Protein Vesicles
2024-May-01, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c02370
PMID:38594642
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研究论文 | 研究通过改变不对称脂质-蛋白质囊泡的膜张力,评估了大型机械敏感通道(MscL)的分子运输能力 | 首次在不对称脂质-蛋白质囊泡中评估了MscL通道的分子运输能力,并揭示了MscL在囊泡内 leaflet 的插入方向 | NA | 评估不对称脂质-蛋白质囊泡中MscL通道的分子运输能力及其在复杂人工细胞模型中的应用潜力 | 不对称脂质-蛋白质囊泡中的MscL通道及其分子运输 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | MscL通道 | 囊泡 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 914 | 2024-08-07 |
Ribosome Pool Engineering Increases Protein Biosynthesis Yields
2024-Apr-24, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.3c01413
PMID:38680563
|
研究论文 | 研究通过改造细菌核糖体池来提高蛋白质生物合成产量的方法 | 首次系统地测量了来自不同rRNA操纵子的核糖体的蛋白质生产能力,并展示了通过单一rRNA操纵子表达的均质核糖体池在蛋白质生产中的优越性 | NA | 探索和利用序列优化的核糖体版本,以提高蛋白质生物合成产量 | 细菌核糖体及其rRNA操纵子序列的功能差异 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成和翻译平台 | NA | rRNA序列 | 七种不同的rRNA操纵子序列 | NA | NA | NA | NA |
| 915 | 2024-08-07 |
Engineering pluripotent stem cells with synthetic biology for regenerative medicine
2024-Apr, Medical review (2021)
DOI:10.1515/mr-2023-0050
PMID:38680679
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具在多能干细胞工程领域的进展、挑战及其在再生医学中的应用 | 介绍了合成受体和遗传电路在精确控制细胞命运决策和功能重建中的作用 | 该领域仍处于初级阶段,部分原因是缺乏稳健和精确控制干细胞行为的策略 | 探讨合成生物学在多能干细胞工程中的应用,以推动再生医学的发展 | 多能干细胞及其衍生的细胞和多细胞系统,特别是类器官 | 再生医学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 916 | 2024-08-07 |
Unravelling and reconstructing the biosynthetic pathway of bergenin
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47502-2
PMID:38670975
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研究论文 | 本文阐明了Ardisia japonica中bergenin的生物合成途径,并通过代谢工程在E. coli中重建了其前体的从头生物合成途径,提高了bergenin的产量 | 首次阐明了bergenin的生物合成途径,并通过合成生物学方法在E. coli中重建了其前体的从头生物合成途径,显著提高了bergenin的产量 | NA | 阐明bergenin的生物合成途径并提高其产量,以解决其资源短缺问题 | bergenin的生物合成途径及其前体的从头生物合成 | 合成生物学 | 慢性气管炎 | 代谢工程 | NA | NA | 3升生物反应器 | NA | NA | NA | NA |
| 917 | 2024-08-07 |
A Point Mutation in Cassette Relieves the Repression Regulation of CcpA Resulting in an Increase in the Degradation of 2,3-Butanediol in Lactococcus lactis
2024-Apr-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12040773
PMID:38674718
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸乳球菌中CcpA转录调控因子对2,3-丁二醇代谢的影响,发现一个点突变导致CcpA从应答元件解离,从而激活了2,3-丁二醇脱氢酶基因簇的表达 | 首次报道了乳酸菌中CcpA抑制效应的消除,改变了酶催化方向和碳代谢方向 | NA | 研究CcpA对乳酸乳球菌中2,3-丁二醇代谢的调控机制 | 乳酸乳球菌中的CcpA转录调控因子和2,3-丁二醇代谢 | NA | NA | 定量聚合酶链反应(Q-PCR),微量热泳动实验 | NA | 转录组数据 | N8-1和N8-2两种突变菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 918 | 2024-08-07 |
Modification of the endoplasmic reticulum morphology enables improved recombinant antibody expression in Saccharomyces cerevisiae
2024-May-20, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.03.009
PMID:38555020
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研究论文 | 研究通过改变酵母内质网形态来提高重组抗体表达 | 通过删除Rtn1p、Rtn2p和Yop1p编码基因的不同组合,创建了具有不同内质网形态的酵母菌株,实现了抗体滴度高达2.2倍的提升 | NA | 探究内质网结构对细胞生产力的影响 | 酵母细胞内质网形态及其对抗体表达的影响 | 生物工程 | NA | 基因编辑 | NA | 细胞 | 不同组合的酵母菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 919 | 2024-08-07 |
Biology System Description Language (BiSDL): a modeling language for the design of multicellular synthetic biological systems
2024-Apr-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05782-x
PMID:38664639
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研究论文 | 介绍了一种名为BiSDL的计算语言,用于设计和模拟多细胞合成生物系统 | BiSDL填补了现有技术中在表示多细胞设计中空间性和多层次细胞动态方面的空白 | NA | 开发一种易于使用的计算语言,用于设计和模拟多细胞合成生物系统 | 多细胞合成生物系统 | 合成生物学 | NA | NA | Nets-Within-Nets (NWNs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 920 | 2024-08-07 |
Utilizing 5' UTR Engineering Enables Fine-Tuning of Multiple Genes within Operons to Balance Metabolic Flux in Bacillus subtilis
2024-Apr-19, Biology
DOI:10.3390/biology13040277
PMID:38666889
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研究论文 | 本研究利用高通量筛选策略,从168基因组中识别出一种5' UTR序列,该序列能够显著提高EGFP的表达水平,并通过调控操纵子中的基因表达,优化了枯草芽孢杆菌中的代谢通量,从而增加了核黄素的产量。 | 本研究首次利用5' UTR序列进行基因表达的精细调控,构建了一个5' UTR库,实现了对操纵子中基因表达的广泛调控,显著提高了核黄素的产量。 | NA | 通过合成生物学工具精细调控基因表达,优化代谢通量,提高目标产品的产量。 | 枯草芽孢杆菌中的基因表达和代谢通量调控。 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选 | NA | 基因序列 | 涉及168基因组的5' UTR序列 | NA | NA | NA | NA |