本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新,已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价5元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
901 | 2024-08-07 |
Brief History of Placozoa
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_3
PMID:38668963
|
研究论文 | 本文介绍了形态上最简单的自由生活动物——扁形动物门,并强调了其在理解动物组织起源和未来系统与合成生物学规则中的独特价值 | 扁形动物门为理解动物组织的起源和生命规则提供了独特的视角 | 尽管对扁形动物的研究已超过100年,但对其组织、自然栖息地和生活策略的了解仍然有限 | 介绍扁形动物门并强调其在拓宽生物医学科学前沿中的重要性 | 扁形动物的基因组基础、细胞身份、连接性、繁殖和行为的细胞基础 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
902 | 2024-08-07 |
Advanced computational predictive models of miRNA-mRNA interaction efficiency
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.015
PMID:38689718
|
研究论文 | 本研究提出了一种改进的计算模型,用于预测miRNA-mRNA相互作用,特别关注了miRNA结合位点的分布及其对mRNA稳定性的调控作用 | 引入了新的特征集和miRNA结合位点相互作用模型(miBSIM),首次考虑了结合位点的分布及其强度,提高了预测模型的性能 | 模型需要针对特定细胞类型进行定制,以提高准确性 | 开发更精确的计算模型来预测miRNA-mRNA相互作用,以促进合成生物学和人类健康 | miRNA-mRNA相互作用及其在mRNA下调中的多方面影响 | 生物信息学 | NA | 计算模型 | miBSIM | miRNA和mRNA数据 | NA |
903 | 2024-08-07 |
Engineering a non-model yeast Rhodotorula mucilaginosa for terpenoids synthesis
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.04.015
PMID:38690180
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,改造非模式酵母Rhodotorula mucilaginosa,以生产不同的萜类化合物 | 本研究展示了Rhodotorula mucilaginosa作为直接生物合成多种萜类化合物的平台宿主的潜力 | NA | 通过合成生物学方法,提高非模式酵母Rhodotorula mucilaginosa生产萜类化合物的能力 | Rhodotorula mucilaginosa酵母菌株及其生产萜类化合物的能力 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 生物数据 | 多个工程菌株 |
904 | 2024-08-07 |
Molecular Transportation Conversion of Membrane Tension Using a Mechanosensitive Channel in Asymmetric Lipid-Protein Vesicles
2024-May-01, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c02370
PMID:38594642
|
研究论文 | 研究通过改变不对称脂质-蛋白质囊泡的膜张力,评估了大型机械敏感通道(MscL)的分子运输能力 | 首次在不对称脂质-蛋白质囊泡中评估了MscL通道的分子运输能力,并揭示了MscL在囊泡内 leaflet 的插入方向 | NA | 评估不对称脂质-蛋白质囊泡中MscL通道的分子运输能力及其在复杂人工细胞模型中的应用潜力 | 不对称脂质-蛋白质囊泡中的MscL通道及其分子运输 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | MscL通道 | 囊泡 | NA |
905 | 2024-08-07 |
Ribosome Pool Engineering Increases Protein Biosynthesis Yields
2024-Apr-24, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.3c01413
PMID:38680563
|
研究论文 | 研究通过改造细菌核糖体池来提高蛋白质生物合成产量的方法 | 首次系统地测量了来自不同rRNA操纵子的核糖体的蛋白质生产能力,并展示了通过单一rRNA操纵子表达的均质核糖体池在蛋白质生产中的优越性 | NA | 探索和利用序列优化的核糖体版本,以提高蛋白质生物合成产量 | 细菌核糖体及其rRNA操纵子序列的功能差异 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成和翻译平台 | NA | rRNA序列 | 七种不同的rRNA操纵子序列 |
906 | 2024-08-07 |
Engineering pluripotent stem cells with synthetic biology for regenerative medicine
2024-Apr, Medical review (2021)
DOI:10.1515/mr-2023-0050
PMID:38680679
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学工具在多能干细胞工程领域的进展、挑战及其在再生医学中的应用 | 介绍了合成受体和遗传电路在精确控制细胞命运决策和功能重建中的作用 | 该领域仍处于初级阶段,部分原因是缺乏稳健和精确控制干细胞行为的策略 | 探讨合成生物学在多能干细胞工程中的应用,以推动再生医学的发展 | 多能干细胞及其衍生的细胞和多细胞系统,特别是类器官 | 再生医学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
907 | 2024-08-07 |
Unravelling and reconstructing the biosynthetic pathway of bergenin
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47502-2
PMID:38670975
|
研究论文 | 本文阐明了Ardisia japonica中bergenin的生物合成途径,并通过代谢工程在E. coli中重建了其前体的从头生物合成途径,提高了bergenin的产量 | 首次阐明了bergenin的生物合成途径,并通过合成生物学方法在E. coli中重建了其前体的从头生物合成途径,显著提高了bergenin的产量 | NA | 阐明bergenin的生物合成途径并提高其产量,以解决其资源短缺问题 | bergenin的生物合成途径及其前体的从头生物合成 | 合成生物学 | 慢性气管炎 | 代谢工程 | NA | NA | 3升生物反应器 |
908 | 2024-08-07 |
A Point Mutation in Cassette Relieves the Repression Regulation of CcpA Resulting in an Increase in the Degradation of 2,3-Butanediol in Lactococcus lactis
2024-Apr-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12040773
PMID:38674718
|
研究论文 | 本研究探讨了乳酸乳球菌中CcpA转录调控因子对2,3-丁二醇代谢的影响,发现一个点突变导致CcpA从应答元件解离,从而激活了2,3-丁二醇脱氢酶基因簇的表达 | 首次报道了乳酸菌中CcpA抑制效应的消除,改变了酶催化方向和碳代谢方向 | NA | 研究CcpA对乳酸乳球菌中2,3-丁二醇代谢的调控机制 | 乳酸乳球菌中的CcpA转录调控因子和2,3-丁二醇代谢 | NA | NA | 定量聚合酶链反应(Q-PCR),微量热泳动实验 | NA | 转录组数据 | N8-1和N8-2两种突变菌株 |
909 | 2024-08-07 |
Modification of the endoplasmic reticulum morphology enables improved recombinant antibody expression in Saccharomyces cerevisiae
2024-May-20, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.03.009
PMID:38555020
|
研究论文 | 研究通过改变酵母内质网形态来提高重组抗体表达 | 通过删除Rtn1p、Rtn2p和Yop1p编码基因的不同组合,创建了具有不同内质网形态的酵母菌株,实现了抗体滴度高达2.2倍的提升 | NA | 探究内质网结构对细胞生产力的影响 | 酵母细胞内质网形态及其对抗体表达的影响 | 生物工程 | NA | 基因编辑 | NA | 细胞 | 不同组合的酵母菌株 |
910 | 2024-08-07 |
Biology System Description Language (BiSDL): a modeling language for the design of multicellular synthetic biological systems
2024-Apr-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05782-x
PMID:38664639
|
研究论文 | 介绍了一种名为BiSDL的计算语言,用于设计和模拟多细胞合成生物系统 | BiSDL填补了现有技术中在表示多细胞设计中空间性和多层次细胞动态方面的空白 | NA | 开发一种易于使用的计算语言,用于设计和模拟多细胞合成生物系统 | 多细胞合成生物系统 | 合成生物学 | NA | NA | Nets-Within-Nets (NWNs) | NA | NA |
911 | 2024-08-07 |
Utilizing 5' UTR Engineering Enables Fine-Tuning of Multiple Genes within Operons to Balance Metabolic Flux in Bacillus subtilis
2024-Apr-19, Biology
DOI:10.3390/biology13040277
PMID:38666889
|
研究论文 | 本研究利用高通量筛选策略,从168基因组中识别出一种5' UTR序列,该序列能够显著提高EGFP的表达水平,并通过调控操纵子中的基因表达,优化了枯草芽孢杆菌中的代谢通量,从而增加了核黄素的产量。 | 本研究首次利用5' UTR序列进行基因表达的精细调控,构建了一个5' UTR库,实现了对操纵子中基因表达的广泛调控,显著提高了核黄素的产量。 | NA | 通过合成生物学工具精细调控基因表达,优化代谢通量,提高目标产品的产量。 | 枯草芽孢杆菌中的基因表达和代谢通量调控。 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选 | NA | 基因序列 | 涉及168基因组的5' UTR序列 |
912 | 2024-08-07 |
Aspergillus oryzae as a Cell Factory: Research and Applications in Industrial Production
2024-Mar-26, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof10040248
PMID:38667919
|
综述 | 本文综述了利用Aspergillus oryzae作为细胞工厂在工业生产中的研究与应用进展 | 通过合成生物学和新型遗传工程技术,Aspergillus oryzae被认为是构建细胞工厂的理想候选 | 其复杂的分泌系统和蛋白质表达调控机制对表达多种异源产品构成挑战 | 探讨Aspergillus oryzae在工业生产中作为细胞工厂的应用 | Aspergillus oryzae的酶分泌系统及其在合成次级代谢物中的应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学,遗传工程 | NA | NA | NA |
913 | 2024-08-07 |
High-throughput visualization mutation screening technology to enhance the specificity of CadR based whole-cell cadmium biosensor
2024-Jul-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116266
PMID:38636122
|
研究论文 | 本研究通过设计邻位饱和突变策略,提高了基于转录因子CadR的全细胞镉生物传感器的特异性 | 采用邻位饱和突变策略构建特定饱和库,并通过两轮高通量可视化筛选,获得对镉响应良好且显著减弱汞干扰的全细胞生物传感器 | NA | 提高全细胞镉生物传感器的特异性 | 全细胞镉生物传感器的特异性 | 合成生物学 | NA | 邻位饱和突变 | 全细胞生物传感器 | NA | NA |
914 | 2024-08-07 |
The biosynthetic logic and enzymatic machinery of approved fungi-derived pharmaceuticals and agricultural biopesticides
2024-Apr-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00040k
PMID:37990930
|
研究论文 | 本文探讨了真菌来源的药物和农业生物农药的生物合成逻辑和酶机制 | 介绍了通过合成生物学对现有药物进行合理设计和系统生产新化学结构的方法 | 开发新药物的时间和成本仍然很高 | 最大化现有药物的利用率,通过合成生物学设计新的化学结构 | 真菌来源的天然产物及其生物合成基因簇 | NA | NA | 代谢工程,途径重编程,细胞工厂开发 | NA | 基因组数据 | NA |
915 | 2024-08-07 |
Multiplex genetic manipulations in Clostridium butyricum and Clostridium sporogenes to secrete recombinant antigen proteins for oral-spore vaccination
2024-Apr-24, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02389-y
PMID:38659027
|
研究论文 | 本文通过基因工程手段改造梭状芽孢杆菌,使其能够分泌重组抗原蛋白,用于口服疫苗的研发 | 利用非典型翻译起始密码子AUU,成功克服了在E. coli中克隆困难蛋白的挑战,并实现了在梭状芽孢杆菌中的重组蛋白分泌 | NA | 探索利用梭状芽孢杆菌作为口服疫苗载体的可能性 | 梭状芽孢杆菌C. butyricum和C. sporogenes | 生物技术 | 癌症, 病毒性疾病 | 基因工程 | NA | 蛋白质 | 涉及多种梭状芽孢杆菌菌株和重组抗原蛋白 |
916 | 2024-08-07 |
A model-driven approach to upcycling recalcitrant feedstocks in Pseudomonas putida by decoupling PHA production from nutrient limitation
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113979
PMID:38517887
|
研究论文 | 本研究通过模型驱动的方法,利用合成生物学技术重新引导碳流并解除调控限制,实现了在营养非限制条件下提高Pseudomonas putida中PHA产量 | 成功在生长阶段实现PHA生产,达到高达46%的PHA/细胞干重,并验证了使用酶解聚乙烯对苯二甲酸酯作为原料的上循环场景 | NA | 克服传统PHA生产生物过程的复杂性,推动PHA生产技术的发展 | Pseudomonas putida菌株及PHA生产 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
917 | 2024-08-07 |
Chromosome-level Alstonia scholaris genome unveils evolutionary insights into biosynthesis of monoterpenoid indole alkaloids
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109599
PMID:38646178
|
研究论文 | 本研究通过使用纳米孔和Hi-C数据组装了高质量的染色体水平Alstonia scholaris基因组,旨在深入了解单萜吲哚生物碱(MIAs)的生物合成 | 首次组装了Alstonia scholaris的高质量染色体水平基因组,并发现了与MIAs生物合成途径相关的基因簇 | NA | 探索Alstonia scholaris中单萜吲哚生物碱的生物合成及其进化起源 | Alstonia scholaris植物及其基因组 | 数字病理学 | 癌症 | 纳米孔测序,Hi-C | NA | 基因组数据 | 一个Alstonia scholaris样本 |
918 | 2024-08-07 |
Metal-Organic Framework-Mediated Delivery of Nucleic Acid across Intact Plant Cells
2024-Apr-17, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c19571
PMID:38564422
|
research paper | 本研究探讨了利用金属有机框架(MOFs)通过渗透方式将核酸递送至完整植物细胞的方法 | 本研究采用了小尺寸的ZIF-8纳米颗粒(小于20 nm),有效实现了DNA/RNA向叶片和根部的递送,并展示了其在保护RNA免受RNase降解和通过递送siRNA沉默内源基因方面的应用 | NA | 解决植物细胞壁和完整细胞膜对基因递送的挑战 | 植物细胞和核酸递送 | NA | NA | 金属有机框架(MOFs) | NA | DNA/RNA | 叶片和根部 |
919 | 2024-08-07 |
Strategies for the efficient biosynthesis of β-carotene through microbial fermentation
2024-Apr-12, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-03955-7
PMID:38607448
|
综述 | 本文综述了通过微生物发酵高效合成β-胡萝卜素的研究进展和策略 | 介绍了利用廉价碳源合成β-胡萝卜素以及提出进一步提高β-胡萝卜素产量的新策略 | NA | 总结天然类胡萝卜素产生菌和代谢工程策略在工程微生物异源合成β-胡萝卜素中的应用 | β-胡萝卜素的微生物发酵合成 | NA | 心血管疾病 | 微生物发酵 | NA | NA | NA |
920 | 2024-08-07 |
Machine learning-aided design and screening of an emergent protein function in synthetic cells
2024-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46203-0
PMID:38443351
|
研究论文 | 本文探讨了利用机器学习辅助设计和筛选合成细胞中新兴蛋白质功能的方法 | 本文首次描述了如何通过计算和体外实验筛选机器学习生成的蛋白质变体,这些变体能够在细胞内形成时空模式 | 本文仅展示了原理验证,尚未广泛应用于实际工业和生物医学应用 | 研究如何利用机器学习设计合成蛋白质,以工程化细胞功能 | 新兴蛋白质功能,如细胞内时空自组织能力 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 条件生成模型 | 蛋白质结构数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |