合成生物学相关文章
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当前共找到 1127 篇文献，本页显示第 901 - 920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2024-08-07 |
Regulatory microRNAs and phasiRNAs of paclitaxel biosynthesis in Taxus chinensis
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1403060
PMID:38779066
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研究论文 | 本文系统地鉴定了990个转录因子（TFs）、460个微小RNAs（miRNAs）和160个相位小干扰RNAs（phasiRNAs），并探讨了它们在紫杉醇合成中的相互作用和潜在调控作用。 | 本文通过共表达网络分析推断调控TFs，并构建了包括酶基因、TFs、miRNAs和phasiRNAs的调控网络，揭示了紫杉醇生产在转录后水平的层级调控。 | NA | 研究紫杉醇合成的转录和转录后调控机制，以促进通过组织/细胞培养方法提高紫杉醇产量。 | 紫杉醇的生物合成机制及其调控因子。 | NA | 抗癌活性 | NA | NA | 基因表达数据 | 990个转录因子，460个微小RNAs，160个相位小干扰RNAs | NA | NA | NA | NA |
| 902 | 2024-08-07 |
The hope, hype and obstacles surrounding cell therapy
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18359
PMID:38770886
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研究论文 | 本文探讨了细胞疗法在医学领域的希望与挑战 | 介绍了合成生物学在细胞疗法中的潜在解决方案 | 细胞疗法在治疗某些疾病如遗传性疾病和纤毛病方面的局限性 | 分析细胞疗法的潜力及其在不同疾病治疗中的应用 | 干细胞及其衍生品在疾病治疗中的应用 | NA | 糖尿病, 帕金森病, 镰状细胞病, 遗传性疾病, 纤毛病 | 细胞疗法, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 903 | 2024-08-07 |
Modern Approaches to de novo Synthesis of Extended DNA Fragments: Assembly of a Wide Repertoire of Sequences
2024 Jan-Mar, Acta naturae
IF:2.0Q4
DOI:10.32607/actanaturae.27362
PMID:38738632
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研究论文 | 本文提出了一种用于合成更广泛序列的DNA片段组装方法，并优化了组装条件 | 本文优化了DNA片段组装的条件，使其适用于更广泛的序列合成 | NA | 标准化合成生物学中DNA片段组装方法 | DNA片段的合成与组装 | 合成生物学 | NA | 化学合成寡核苷酸 | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 904 | 2024-08-07 |
A critical review of microplastics in aquatic ecosystems: Degradation mechanisms and removing strategies
2024-Sep, Environmental science and ecotechnology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.ese.2024.100427
PMID:38765892
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综述 | 本文综述了水生生态系统中微塑料的降解机制和去除策略 | 介绍了结合物理化学预处理和微生物降解的新策略，以及膜生物反应器、合成生物学、有机硅基技术、生物膜介导的修复和纳米材料增强策略等创新方法 | NA | 旨在促进微塑料有效去除方法的创新，提升环境和社交福祉 | 水生生态系统中的微塑料 | 环境科学 | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 905 | 2024-08-07 |
Reverse engineering morphogenesis through Bayesian optimization of physics-based models
2024-May-07, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00375-z
PMID:38714708
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研究论文 | 本文通过贝叶斯优化物理模型，逆向工程了形态发生过程，以匹配实验观察到的器官形状 | 开发了一种贝叶斯优化框架，利用高斯过程回归学习形态发生程序的映射函数，成功推断出模拟数据与实验数据匹配所需的核心参数变化 | NA | 解决物理模型参数校准的逆问题，优化细胞力分布以预测器官形状、大小和功能 | 果蝇翅膀的成虫盘，研究从发育到癌症的表皮过程 | 系统生物学 | NA | 贝叶斯优化 | 高斯过程回归 | 图像数据 | 果蝇翅膀成虫盘样本 | NA | NA | NA | NA |
| 906 | 2024-08-07 |
Synthetic microbiology in sustainability applications
2024-Jun, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-023-01007-9
PMID:38253793
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综述 | 本文综述了通过合成生物学解决社会可持续性挑战的研究工作，强调了基础微生物学研究问题的重要性 | 引入了一个组织框架，将这些努力分为工厂、农场和田地三个领域，这些领域由工程微生物与自然外部环境的交互程度定义 | NA | 通过合成生物学加速解决可持续性挑战的发展 | 微生物及其在不同环境中的代谢能力 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 907 | 2024-08-07 |
Developing the E. coli platform for efficient production of UMP-derived chemicals
2024-May, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.03.004
PMID:38522576
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研究论文 | 本文通过设计一个人工途径，首次在E. coli中实现了5-甲基尿苷（5-MU）的高效生产，并进一步开发了一个多功能且稳健的平台，用于生产多种UMP衍生化学品。 | 首次在E. coli中通过设计的人工途径高效生产5-MU，并开发了抗生素免费发酵策略，实现了5-MU的高产量。 | NA | 开发E. coli平台，用于高效生产UMP衍生化学品。 | 5-甲基尿苷（5-MU）及其衍生化学品。 | 合成生物学 | NA | 酶工程 | NA | NA | E. coli MB229 (ΔthyA 菌株) | NA | NA | NA | NA |
| 908 | 2024-08-07 |
Self-controlled in silico gene knockdown strategies to enhance the sustainable production of heterologous terpenoid by Saccharomyces cerevisiae
2024-May, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.04.005
PMID:38648878
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研究论文 | 本研究利用合成生物学和计算生物学方法，通过基因敲除和负反馈回路设计，优化了酵母细胞中异源萜类化合物的生产 | 本研究创新性地结合了OptKnock模拟和合成生物学方法，通过负反馈回路动态调节基因表达，提高了目标产物的可持续生产 | 基因敲除在批量培养中效果显著，但在连续培养模式下效果减弱，表明基因敲除不支持目标产物的可持续生产 | 提高酵母细胞中异源萜类化合物的生产效率和可持续性 | 酵母细胞中的异源萜类化合物生产 | 合成生物学 | NA | OptKnock模拟 | 基因敲除 | 基因组规模代谢模型 | 构建了多种酵母菌株进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 909 | 2024-08-07 |
Eye Diseases: When the Solution Comes from Plant Alkaloids
2024-May, Planta medica
IF:2.1Q2
DOI:10.1055/a-2283-2350
PMID:38452806
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综述 | 本文综述了用于治疗眼病的植物生物碱，包括其历史概述、提取来源植物以及支持其治疗活性的临床和分子数据 | 探讨了生物技术在生物碱生产中的应用，如基因工程和合成生物学 | 需要进一步研究以完全满足制药需求 | 提供关于用于治疗眼病的植物生物碱的全面概述 | 植物生物碱及其在眼病治疗中的应用 | NA | 眼病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 910 | 2024-08-07 |
Computational analysis into the potential of azo dyes as a feedstock for actinorhodin biosynthesis in Pseudomonas putida
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0299128
PMID:38437212
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研究论文 | 研究探讨了利用偶氮染料作为原料在铜绿假单胞菌中合成阿特拉津的可能性 | 首次探索了偶氮染料作为非传统原料在合成生物学中用于生产高价值化学品的可能性，并发现偶氮染料在阿特拉津生物合成中比葡萄糖更具优势 | NA | 探索和优化铜绿假单胞菌利用偶氮染料作为原料进行阿特拉津生物合成的能力 | 铜绿假单胞菌KT2440对偶氮染料的利用及其在阿特拉津生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 约束最小割集（cMCS）方法 | NA | 代谢通量分布 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 911 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering for enhanced terpenoid production: Leveraging new horizons with an old technique
2024-May, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108511
PMID:38593484
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综述 | 本文综述了利用代谢工程增强萜类化合物生产的策略及其在药用植物中的应用前景 | 探讨了通过代谢工程在微生物和快速生长植物中生产有价值萜类化合物的新方法 | 需要进一步实施基因组编辑、代谢途径的阐明以及系统生物学和合成生物学策略 | 解决萜类化合物商业规模生产中的问题 | 萜类化合物及其在植物中的生物合成途径 | 植物生物技术 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 912 | 2024-08-07 |
Self-regulated efficient production of L-threonine via an artificial quorum sensing system in engineered Escherichia coli
2024-Jul, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127720
PMID:38640767
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研究论文 | 设计人工群体感应系统，通过改变中心代谢途径的碳通量分布，在特定时期实现工程化大肠杆菌中L-苏氨酸的高效生产 | 利用群体感应系统自我调节碳通量分布，提高微生物天然产品的生产效率 | NA | 提高微生物代谢工程中高附加值天然产品的产量 | L-苏氨酸的生产 | 微生物代谢工程 | NA | 群体感应系统 | NA | NA | 最终菌株TWF106/pST1011, pST1042pr能生产118.2 g/L L-苏氨酸 | NA | NA | NA | NA |
| 913 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for the biosynthesis of a fungal pigment from the phytopathogenic fungus Cladosporium phlei
2024-May-13, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00429-0
PMID:38741106
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法，将Cladosporium phlei中负责合成phleichrome色素的非还原聚酮合酶基因Cppks1及Aspergillus nidulans中的磷酸泛酰巯基乙胺转移酶基因导入Saccharomyces cerevisiae，实现了phleichrome色素在酵母中的生物合成 | 首次在Saccharomyces cerevisiae中通过代谢工程和多基因表达成功合成了phleichrome色素 | Cppks1基因的表达对酵母细胞生长有显著不利影响，需要选择压力来维持Cppks1表达载体 | 探索通过代谢工程在Saccharomyces cerevisiae中合成phleichrome色素的可能性 | Cladosporium phlei中的phleichrome色素及其在Saccharomyces cerevisiae中的生物合成 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 914 | 2024-08-07 |
Probiotic-fermented edible herbs as functional foods: A review of current status, challenges, and strategies
2024-03, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.13305
PMID:38379388
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综述 | 本文综述了益生菌发酵食用草药作为功能性食品的当前研究状态、挑战和策略 | 强调了益生菌发酵食用草药中活性成分的生物转化及其健康益处 | NA | 探讨益生菌发酵食用草药在功能性食品中的应用及其健康益处 | 益生菌发酵食用草药及其功能性食品的应用 | NA | 慢性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 915 | 2024-08-07 |
Effect of Quorum Sensing Molecules on the Quality of Bacterial Nanocellulose Materials
2024-May-07, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.3c10053
PMID:38737048
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研究论文 | 研究了群体感应分子对细菌纳米纤维素材料质量的影响 | 通过使用多种表面表征方法，揭示了特定群体感应信号分子对细菌纳米纤维素生物膜形态特性的影响 | 细菌纳米纤维素生物膜的生产和转化为实际形式存在挑战，主要受细胞密度异质性的影响 | 探讨群体感应分子如何影响细菌纳米纤维素生物膜的形态特性 | 细菌纳米纤维素生物膜及其在不同浓度群体感应信号分子下的形态特性 | 生物材料 | NA | 扫描电子显微镜, 能量散射光谱, 漫反射红外傅里叶变换光谱, 原子力显微镜 | NA | 生物膜 | 不同浓度的特定群体感应信号分子 | NA | NA | NA | NA |
| 916 | 2024-08-07 |
Strategies, Achievements, and Potential Challenges of Plant and Microbial Chassis in the Biosynthesis of Plant Secondary Metabolites
2024-May-02, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29092106
PMID:38731602
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综述 | 本文综述了植物和微生物底盘在植物次生代谢物生物合成中的策略、成就及潜在挑战 | 随着合成生物学的发展，更多研究聚焦于利用微生物进行异源合成 | 大规模种植宿主植物消耗土地资源且易受病虫害影响，化学合成的多步骤和高要求增加了生产成本，限制了其广泛应用 | 评估植物和微生物底盘在合成各种类型次生代谢物方面的表现，并探讨其面临的挑战及未来努力方向 | 植物次生代谢物 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 917 | 2024-08-07 |
Chalkophomycin Biosynthesis Revealing Unique Enzyme Architecture for a Hybrid Nonribosomal Peptide Synthetase and Polyketide Synthase
2024-Apr-25, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29091982
PMID:38731473
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研究论文 | 本文研究了来自sp. CB00271的chalkophomycin的生物合成机制，揭示了其独特的非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的酶结构 | 首次揭示了chalkophomycin生物合成中独特的酶结构，涉及非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的混合体系 | NA | 阐明chalkophomycin的生物合成机制，并为通过合成生物学方法工程化chalkophomycin类似物奠定基础 | chalkophomycin的生物合成基因簇及其编码的酶 | 生物化学 | NA | 基因替换 | NA | DNA序列 | 涉及约31 kb的DNA区域，包含19个开放阅读框 | NA | NA | NA | NA |
| 918 | 2024-08-07 |
Efficient biosynthesis of transglutaminase in Streptomyces mobaraensis via systematic engineering strategies
2024, Current research in food science
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.crfs.2024.100756
PMID:38736907
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研究论文 | 本研究通过系统工程策略在重组的smL2020菌株中高效合成转谷氨酰胺酶(TGase) | 通过多重工程策略，包括启动子工程、优化信号肽和重组位点以及增加表达盒的拷贝数，实现了TGase活性的显著提升，达到了迄今为止报道的最高水平 | NA | 提高转谷氨酰胺酶在食品工业中的应用范围 | 转谷氨酰胺酶的合成与应用 | 生物技术 | NA | 系统工程策略 | NA | 酶活性数据 | 1000升发酵罐 | NA | NA | NA | NA |
| 919 | 2024-08-07 |
Tailored UPRE2 variants for dynamic gene regulation in yeast
2024-May-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315729121
PMID:38687789
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研究论文 | 本文通过创建UPRE2突变体库，筛选出具有增强响应性和更宽动态范围的元素，并研究了其与转录因子Hac1的相互作用，以提高酵母中重组蛋白和天然产物合成的效率 | 开发了新的UPRE2突变体，增强了与Hac1的结合亲和力，提高了基因表达的动态调控能力 | NA | 研究如何通过合成生物学方法优化酵母中的基因调控，以提高化学品和重组蛋白的生产效率 | UPRE2突变体及其在酵母细胞中的基因调控作用 | 合成生物学 | NA | 分子建模，定点突变 | NA | 基因序列 | 多个UPRE2突变体元素 | NA | NA | NA | NA |
| 920 | 2024-08-07 |
OpenCell: A Low-cost, Open-Source, 3-in-1 device for DNA Extraction
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558349
PMID:37808818
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell，用于DNA提取 | OpenCell集成了珠磨机、微量离心机和涡旋混合器的功能，采用模块化附件和中央旋转无刷电机，设计紧凑且具有多种安全特性 | NA | 降低预算有限的实验室进行DNA提取的成本 | OpenCell设备的开发及其在DNA提取中的应用 | 合成生物学 | NA | 3D打印 | NA | NA | 使用OpenCell成功从菠菜中提取DNA，平均产量为2.3 μg | NA | NA | NA | NA |