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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2024-08-07 |
[Development the agricultural synthesis biology course for postgraduates]
2024-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230539
PMID:38658161
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research paper | 本文介绍了为研究生开设的农业合成生物学课程的开发 | 该课程强调跨学科合作、创新和新技术实际应用,旨在培养学生解决生物育种领域关键科技问题的能力 | NA | 旨在培养研究生在生物育种领域的科技创新能力 | 研究生 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 922 | 2024-08-07 |
Engineering a synthetic gene circuit for high-performance inducible expression in mammalian systems
2024-Apr-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47592-y
PMID:38632224
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研究论文 | 本文介绍了一种用于哺乳动物系统中高表现诱导表达的合成基因电路CASwitch的设计与应用 | CASwitch结合了Coherent Feed-Forward Loop和Mutual Inhibition两种网络结构,以及CRISPR-Cas内切酶CasRx和Tet-On3G诱导基因系统,实现了在不修改转录因子或启动子的情况下,减少泄漏表达同时保持高表达 | NA | 设计并验证一种新的合成基因电路,用于在哺乳动物系统中实现高效诱导基因表达 | 合成基因电路CASwitch及其在不同生物技术应用中的性能 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas | 合成基因电路 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 923 | 2024-08-07 |
CRISPR-COPIES: an in silico platform for discovery of neutral integration sites for CRISPR/Cas-facilitated gene integration
2024-Apr-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae062
PMID:38346683
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研究论文 | 开发了一个名为CRISPR-COPIES的计算平台,用于发现CRISPR/Cas系统辅助基因整合的中性整合位点 | 利用ScaNN模型进行基于嵌入的最近邻搜索,快速准确地识别细菌和真菌基因组中的基因间位点 | NA | 解决CRISPR/Cas系统在基因整合中寻找最佳染色体位点的难题 | CRISPR/Cas系统的中性整合位点 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | ScaNN | 基因组数据 | 涉及三种不同物种:酿酒酵母、Cupriavidus necator和HEK293T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 924 | 2024-08-07 |
Peptide nucleic acid-assisted generation of targeted double-stranded DNA breaks with T7 endonuclease I
2024-Apr-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae148
PMID:38421613
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研究论文 | 本文利用γ-修饰的肽核酸(γPNAs)促进靶向特异性DNA入侵,并使用T7核酸内切酶I(T7EI)识别并切割γPNA入侵的DNA,实现双链DNA断裂(DSBs)的引入。 | 开发了一种新的PNA引导的T7EI(PG-T7EI)技术,该技术能够作为可编程核酸酶,在体外广泛条件下生成单个或多个特定的DSBs,并具有在大型基因组操作中应用的潜力。 | NA | 探索和扩展DNA操作技术,包括体外和体内的克隆、大片段DNA组装和基因编辑。 | γ-修饰的肽核酸(γPNAs)和T7核酸内切酶I(T7EI)在DNA操作中的应用。 | 生物技术 | NA | 肽核酸(PNA)和T7核酸内切酶I(T7EI) | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 925 | 2024-08-07 |
Revealing the grammar of small RNA secretion using interpretable machine learning
2024-Apr-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100522
PMID:38460515
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研究论文 | 本文介绍了ExoGRU机器学习模型,用于预测小RNA从初级RNA序列中的分泌概率,并通过实验验证了其性能 | 开发了ExoGRU模型和exoCLIP技术,揭示了小RNA分泌的cis和trans因子,包括已知和新发现的RNA结合蛋白 | NA | 揭示小RNA分泌的生物学机制,并探索其在治疗和合成生物学中的应用 | 小RNA的分泌机制及其相关的RNA结合蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习 | ExoGRU | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 926 | 2024-08-07 |
Self-assembly of stabilized droplets from liquid-liquid phase separation for higher-order structures and functions
2024-Apr-09, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-024-01168-5
PMID:38594355
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综述 | 本文综述了通过液-液相分离产生的动态微尺度液滴的稳定化策略及其在合成生物学和生物医学材料中的应用 | 探讨了如何通过自组装使稳定化的液滴形成更高阶结构,展示协同功能,以充分发挥其在自下而上合成生物学和生物医学应用中的潜力 | NA | 探讨液滴稳定化及其在合成生物学和生物医学材料中的应用 | 液-液相分离产生的动态微尺度液滴 | NA | NA | 液-液相分离 (LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 927 | 2024-08-07 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过不同颜色的光控制微升尺度水溶液pH值的系统 | 该系统利用两种光驱动质子泵——细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12,在脂质膜中方向相反地排列,将不同颜色的光转化为特定的pH变化 | NA | 开发一种在微升尺度上控制pH值的方法,适用于研究、医学和工业应用 | 工程化蛋白脂质体和光驱动质子泵 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵 | NA | 溶液pH值 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 928 | 2024-08-07 |
To be or not to be a cytochrome: electrical characterizations are inconsistent with Geobacter cytochrome 'nanowires'
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1397124
PMID:38633696
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研究论文 | 本文通过电学特性分析,对Geobacter细胞色素'纳米线'的身份进行了探讨 | 结合先前的结构计算和动力学分析,提出了至少需要约7条细胞色素'纳米线'来承载细胞的呼吸通量 | 文章指出先前的电学和光谱结构表征可能因实验伪影和样品杂质而不适用于已知的细胞色素纤维 | 阐明生理金属-微生物相互作用的机制,并推进合成生物学努力以优化这些相互作用 | Geobacter细胞色素的'纳米线' | 生物学 | NA | 低温电子显微镜 | NA | 电学和光谱数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 929 | 2024-08-07 |
Large DNA fragment knock-in and sequential gene editing in Plasmodium falciparum: a preliminary study using suicide-rescue-based CRISPR/Cas9 system
2024-Jan, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-023-04711-5
PMID:37004637
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研究论文 | 本文通过改进自杀-救援型CRISPR/Cas9系统,在恶性疟原虫中实现了大DNA片段的敲入和连续基因编辑 | 本文首次成功利用改进的自杀-救援型CRISPR/Cas9系统在恶性疟原虫中实现大DNA片段的敲入和连续基因编辑 | 连续基因插入的可行性需要进一步确认 | 提高恶性疟原虫基因编辑效率,深入理解基因功能,并促进基于活疟原虫的合成生物学策略和疫苗开发 | 恶性疟原虫 | 基因编辑 | 疟疾 | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 930 | 2024-08-07 |
Engineered bacteria in tumor immunotherapy
2024-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216817
PMID:38492769
|
综述 | 本文综述了工程化细菌在肿瘤免疫治疗中的应用及其与免疫系统的复杂相互作用 | 利用遗传和合成生物学技术,工程化细菌作为肿瘤靶向载体和原位制药工厂,为免疫治疗提供了新的策略 | NA | 探讨工程化细菌在肿瘤免疫治疗中的应用及其优化策略 | 工程化细菌及其在免疫治疗中的作用 | 生物技术 | 肿瘤 | 遗传和合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 931 | 2024-08-07 |
Modular assembly of an artificially concise biocatalytic cascade for the manufacture of phenethylisoquinoline alkaloids
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44420-7
PMID:38167860
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研究论文 | 本文建立了一个人工简化的四酶生物催化级联系统,用于合成苯乙基异喹啉生物碱(PEIAs),避免了植物来源的P450修饰 | 通过酶发现和酶工程,实现了从易得底物高效合成多样化的天然和非天然PEIAs,并通过插拔策略替代了限速步骤的O-甲基化,实现了高产量的秋水仙碱前体(S)-秋水仙碱的规模化制备 | NA | 解决生物碱合成挑战,通过合成生物学构建更多人工生物催化级联系统,用于多样化生物碱的制造 | 苯乙基异喹啉生物碱(PEIAs)的合成 | 生物技术 | NA | 生物催化级联 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 932 | 2024-08-07 |
Dipeptide coacervates as artificial membraneless organelles for bioorthogonal catalysis
2024-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44278-9
PMID:38169470
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研究论文 | 本文报道了二肽凝聚物作为人工无膜细胞器用于生物正交催化的设计 | 设计了具有增强稳定性、生物相容性和疏水微环境的二肽凝聚物,促进了疏水物种的包封,提高了其在水环境中的催化效率 | 二肽凝聚物作为人工细胞器的应用受限于其复杂的分子结构、对内部微环境属性的有限控制和固有的胶体不稳定性 | 开发具有疏水微环境的凝聚物,为仿生材料领域在催化与合成生物学中的应用开辟新途径 | 二肽凝聚物及其在细胞内作为活性人工细胞器的应用 | 仿生材料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 933 | 2024-08-07 |
Insights into the Impact of Trans-Zeatin Overproduction-Engineered Sinorhizobium meliloti on Alfalfa (Medicago sativa L.) Tolerance to Drought Stress
2024-Apr-17, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00115
PMID:38564678
|
研究论文 | 研究通过合成生物学方法改造根瘤菌,使其过量生产反式玉米素,以提高苜蓿对干旱胁迫的耐受性 | 首次通过基因工程改造植物促生长根瘤菌,增加细胞分裂素的产量,以增强苜蓿的干旱耐受性 | 在非干旱条件下,改造后的根瘤菌对苜蓿生物量和根瘤形成没有显著影响 | 研究如何通过基因工程提高苜蓿对干旱胁迫的耐受性 | 反式玉米素过量生产的根瘤菌和苜蓿 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 两株改造后的根瘤菌 | NA | NA | NA | NA |
| 934 | 2024-08-07 |
Rainbow screening: Chromoproteins enable visualized molecular cloning
2024-Apr, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400114
PMID:38622790
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Rainbow Screening的新方法,通过结合Gibson Assembly和chromoproteins,实现无需额外遗传操作或成本的分子克隆可视化筛选 | Rainbow Screening方法简化了分子克隆的可视化过程,无需额外遗传操作或成本,通过肉眼即可区分大肠杆菌菌落 | NA | 开发一种简化的分子克隆可视化筛选方法 | 大肠杆菌菌落和插入片段(E. coli 16s rRNA和sfGFP表达模块) | 生物技术 | NA | Gibson Assembly | NA | 菌落 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 935 | 2024-08-07 |
A toolbox for manipulating the genome of the major goat pathogen, Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae
2024-01, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001423
PMID:38193814
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于操作主要山羊病原体Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae基因组的工具箱 | 首次将合成生物学技术应用于Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae,实现了基因的同时克隆和工程化,以及基因敲除和Cre-lox重组系统的应用 | NA | 开发改进的疫苗以控制传染性山羊胸膜肺炎(CCPP) | Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae的基因组 | 合成生物学 | 传染性山羊胸膜肺炎 | CReasPy-Cloning, Cre-lox重组系统 | NA | 基因组序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 936 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Approaches to Posttranslational Regulation in Plants
2024-Jan, Biochemistry. Biokhimiia
DOI:10.1134/S0006297924140165
PMID:38621756
|
综述 | 本文综述了植物合成生物学在翻译后水平调控植物代谢的最新进展及其未来方向 | 重点介绍了在翻译后水平控制植物遗传机制的方法,减少了对植物基因组的非靶向干扰效应 | NA | 探讨植物合成生物学在翻译后水平调控植物代谢的进展 | 植物合成生物学方法及其在功能基因组学和农业作物产量增加中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 937 | 2024-08-07 |
Environment and synthetic biology
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.016
PMID:38616974
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 938 | 2024-08-07 |
Optogenetic and chemogenetic approaches for modeling neurological disorders in vivo
2024-Apr, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102600
PMID:38548126
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综述 | 本文综述了基于光遗传学和化学遗传学的动物模型在人类神经退行性疾病研究中的应用 | 光遗传学和化学遗传学技术为研究人类神经退行性疾病提供了新的机会,能够在细胞水平上模拟多种病理状态 | NA | 探讨光遗传学和化学遗传学在模拟人类神经退行性疾病中的应用及未来发展方向 | 人类神经退行性疾病,包括与年龄相关的痴呆、阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、癫痫和共济失调等 | NA | 神经退行性疾病 | 光遗传学和化学遗传学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 939 | 2024-08-07 |
XPORT ENTRAP: A droplet microfluidic platform for enhanced DNA transfer between microbial species
2024-Jul-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.02.003
PMID:38408724
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研究论文 | 本文介绍了一种基于液滴微流控平台的DNA增强转移系统(DNA ENTRAP),用于提高微生物间DNA转移的效率 | 利用液滴微流控技术,通过细胞封装的水-油乳液滴作为皮升体积的生物反应器,实现了XPORT介导的遗传转移效率的提升 | NA | 解决合成生物学中DNA高效引入微生物的挑战 | 微生物间的DNA转移效率 | 生物技术 | NA | 液滴微流控技术 | NA | 微生物细胞 | 使用了两种不同的枯草芽孢杆菌(供体和受体) | NA | NA | NA | NA |
| 940 | 2024-08-07 |
Multiomics unravels potential molecular switches in the C3 to CAM transition of Mesembryanthemum crystallinum
2024-May-15, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2024.105145
PMID:38431086
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研究论文 | 本研究利用转录组学、蛋白质组学和靶向代谢组学分析了Mesembryanthemum crystallinum从C到CAM光合作用的分子变化 | 发现了新的发现,如转录本的昼夜节律调控比蛋白质更强,氧化磷酸化和肌醇甲基化可能在转变中起重要作用,V型H-ATP酶在质子泵送中的作用,以及蛋白磷酸酶2C在ABA信号通路中的潜在触发作用 | NA | 揭示Mesembryanthemum crystallinum从C到CAM光合作用转变中的潜在分子开关 | Mesembryanthemum crystallinum的分子变化 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学、靶向代谢组学 | NA | 转录组、蛋白质组、代谢组 | NA | NA | NA | NA | NA |