合成生物学相关文章
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当前共找到 1142 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2024-08-07 |
Fast-growing cyanobacterial chassis for synthetic biology application
2024-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2166455
PMID:36842999
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综述 | 本文综述了快速生长的蓝细菌作为合成生物学应用底盘的研究进展 | 介绍了近年来快速生长的蓝细菌新品种及其在将二氧化碳转化为化学品中的应用，以及为这些新蓝细菌底盘开发的遗传工具箱 | 当前蓝细菌底盘的生长速度慢和生物量积累低，导致大多数产品的生产率仍低于大规模商业应用所需的阈值 | 探讨开发具有快速生长和/或更高生物量积累能力的高效蓝细菌底盘 | 快速生长的蓝细菌底盘 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 962 | 2024-08-07 |
The emerging tumor microbe microenvironment: From delineation to multidisciplinary approach-based interventions
2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.11.018
PMID:38572104
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境中的微生物群落，探讨了其在肿瘤发生、转移、免疫监视和预后中的作用，以及多学科方法在肿瘤微生物组干预中的应用。 | 强调了肿瘤微环境中微生物群落的新角色及其对传统肿瘤微环境的多样化影响。 | NA | 深入理解癌症-免疫-微生物的相互作用，并促进基于微生物的肿瘤特异性治疗的发展。 | 肿瘤微环境中的微生物群落及其在不同类型肿瘤中的异质性。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 963 | 2024-08-07 |
BioNexusSentinel: a visual tool for bioregulatory network and cytohistological RNA-seq genetic expression profiling within the context of multicellular simulation research using ChatGPT-augmented software engineering
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae046
PMID:38571784
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研究论文 | 本文介绍了一个集成视觉平台BioNexusSentinel，用于高效探索细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | BioNexusSentinel是一个全新的系统，独特地结合了细胞组织学RNA-seq和生物调节网络探索功能，并利用ChatGPT增强的软件工程技术开发 | NA | 旨在参数化多细胞模拟研究，并开发一个集成视觉平台以提高研究效率 | 多细胞模拟研究中的细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | 计算生物学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | 基于人类蛋白质图谱数据 |
| 964 | 2024-08-07 |
Safely balancing a double-edged blade: identifying and mitigating emerging biosecurity risks in precision medicine
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1364703
PMID:38572161
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研究论文 | 本文探讨了精准医学中新兴生物安全风险的识别与缓解措施 | 提出了一个新兴学科——网络生物安全，旨在保护人类隐私、自主权和安全，与生物医学的科学和技术进步保持同步 | NA | 探讨精准医学中的双重用途风险，并提出相应的生物数据安全措施 | 精准医学中的工具和方法，以及相关的生物数据安全问题 | 精准医学 | NA | 机器学习、人工智能 | NA | 生物数据 | NA |
| 965 | 2024-08-07 |
Siraitia grosvenorii As a Homologue of Food and Medicine: A Review of Biological Activity, Mechanisms of Action, Synthetic Biology, and Applications in Future Food
2024-Apr-03, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00018
PMID:38513114
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综述 | 本文综述了罗汉果（Siraitia grosvenorii）在食品和医药领域的历史角色、应用、植物化学成分及其生物活性，并探讨了其在合成生物学中的最新进展。 | 文章强调了合成生物学在提高罗汉果生物活性成分生产中的应用，为扩大其可用性提供了新机遇。 | NA | 旨在全面回顾罗汉果在食品和医药领域的历史、化学成分、生物功能、作用机制及合成生物学的应用。 | 罗汉果的植物化学成分、生物活性及其在食品和医药中的应用。 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 966 | 2024-08-07 |
Transcriptomics aids in uncovering the metabolic shifts and molecular machinery of Schizochytrium limacinum during biotransformation of hydrophobic substrates to docosahexaenoic acid
2024-Apr-01, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02381-6
PMID:38561811
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研究论文 | 研究了Schizochytrium limacinum SR21在将疏水性底物转化为二十二碳六烯酸（DHA）过程中的代谢转变和分子机制 | 揭示了SR21在利用疏水性底物进行DHA生物合成时的代谢途径和分子机制，特别是脂酶的上调和脂肪酸完全降解为乙酰辅酶A的过程 | 研究主要集中在实验室条件下，未来研究可以利用合成生物学工具进一步优化疏水性底物的转化 | 探索Schizochytrium limacinum SR21在将废油转化为高价值营养品过程中的代谢和分子机制 | Schizochytrium limacinum SR21及其在不同脂肪酸组成的商业油和废烹饪油中的表现 | 代谢生物学 | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用SR21在72小时内处理不同脂肪酸组成的商业油和废烹饪油，产生约7.5 g/L的生物量 |
| 967 | 2024-08-07 |
What is the role of microbial biotechnology and genetic engineering in medicine?
2024-Apr, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.1406
PMID:38556942
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综述 | 本文综述了微生物生物技术和遗传工程在医学领域的应用，重点介绍了基于基因的技术在开发治疗剂中的作用 | 本文介绍了遗传工程技术、功能基因组学和合成生物学在揭示先前未知的天然产物中的应用 | NA | 探讨微生物生物技术和遗传工程在医学中的作用 | 微生物产品及其在治疗剂开发中的应用 | NA | NA | 遗传工程技术、功能基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 968 | 2024-08-07 |
A general model for predicting enzyme functions based on enzymatic reactions
2024-Mar-31, Journal of cheminformatics
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13321-024-00827-y
PMID:38556873
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研究论文 | 本文介绍了一种基于BERT的多分类模型BEC-Pred，用于预测与反应相关的酶委员会（EC）编号 | BEC-Pred模型利用迁移学习，通过分析底物和产物的SMILES序列，实现了对广泛酶委员会（EC）编号的精确预测 | NA | 开发一种高效准确的模型来预测酶的功能 | 酶的功能预测 | 机器学习 | NA | BERT | BERT | 文本 | NA |
| 969 | 2024-08-07 |
Novel processing strategies to enhance the bioaccessibility and bioavailability of functional components in wheat bran
2024, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2022.2129582
PMID:36190261
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综述 | 本文综述了小麦麸皮中的功能性成分，分析了改性方法，并重点介绍了新型固态发酵（SSF）策略在释放功能性成分中的应用 | 利用传统发酵食品中的高效微生物资源，探索细胞群落间的物质交换规律，构建稳定的自调节共培养系统，以及结合新兴的物理场预处理技术 | NA | 探讨如何通过新型处理策略提高小麦麸皮中功能性成分的生物可及性和生物利用度 | 小麦麸皮中的功能性成分，如膳食纤维、多糖和酚类 | NA | NA | 固态发酵（SSF）、合成生物学、基因编辑 | NA | NA | NA |
| 970 | 2024-08-07 |
Design and assembly of the 117-kb Phaeodactylum tricornutum chloroplast genome
2024-Mar-29, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad670
PMID:38114089
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研究论文 | 本文展示了两种高效克隆117 kb的Phaeodactylum tricornutum叶绿体基因组的方法 | 开发了两种新的叶绿体基因组克隆方法，效率高达90%至100%，并可稳定维持和传播于大肠杆菌中 | 方法可能仅适用于具有相似叶绿体基因组大小和结构的物种 | 开发新的叶绿体基因组克隆技术，以扩展合成生物学底盘的选择 | Phaeodactylum tricornutum叶绿体基因组 | 合成生物学 | NA | PCR扩增、酵母重组 | NA | DNA | 至少10个酵母菌落 |
| 971 | 2024-08-07 |
GraphKM: machine and deep learning for KM prediction of wildtype and mutant enzymes
2024-Mar-28, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05746-1
PMID:38549073
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习框架PaddlePaddle的机器和深度学习方法GraphKM，用于预测野生型和突变酶的Michaelis常数K | GraphKM结合了图神经网络（GNN）、全连接层和梯度提升框架，通过分子图和预训练的基于transformer的语言模型来表示底物和酶，以构建模型输入 | 现有的机器和深度学习模型仅限于特定酶，如少数酶或野生型酶 | 提高酶动力学研究的步伐，通过预测K值来替代耗时且困难的实验测量 | 野生型和突变酶的Michaelis常数K | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图神经网络（GNN）、全连接层、梯度提升框架 | 分子图、文本 | 独立K数据集HXKm |
| 972 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering of an industrial bacterium Zymomonas mobilis for anaerobic l-serine production
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.008
PMID:38549615
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学和过程优化的结合，在工业细菌Zymomonas mobilis中进行了代谢工程改造，以实现厌氧条件下L-丝氨酸的生产 | 首次报道了利用非模式微生物生产L-丝氨酸的微生物细胞工厂，并通过阻断降解途径和引入出口蛋白EceamA等策略，显著提高了L-丝氨酸的产量 | NA | 构建L-丝氨酸生产菌株，并理解限制其在非模式微生物中生产的瓶颈，为未来改进提供指导 | 工业细菌Zymomonas mobilis | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 973 | 2024-08-07 |
Systemically functional characterization of regiospecific flavonoid O-methyltransferases from Glycine max
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.009
PMID:38549618
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研究论文 | 本文对大豆中特异性黄酮O-甲基转移酶进行了系统功能表征 | 首次对大豆中22个潜在的O-甲基转移酶编码基因进行了筛选和克隆，并成功异源表达，揭示了这些酶在黄酮类化合物甲基化中的作用 | NA | 研究大豆中黄酮类化合物O-甲基转移酶的功能及其在黄酮类化合物生物合成中的作用 | 大豆中的黄酮O-甲基转移酶及其编码基因 | 生物化学 | NA | O-甲基转移酶 | NA | 基因序列 | 22个潜在的O-甲基转移酶编码基因，其中19个成功克隆并异源表达 |
| 974 | 2024-08-07 |
Design and synthesis of synthetic promoters for consistency of gene expression across growth phases and scale in S. cerevisiae
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.004
PMID:38549617
|
研究论文 | 本文通过混合启动子工程策略，设计并合成了在不同生长阶段和发酵规模下表现一致的新型合成启动子 | 本文提出了一种新的合成启动子设计策略，通过增加静止期启动子在指数生长阶段的活性，实现了在不同生长阶段和发酵规模下的一致表达 | NA | 开发在不同生长阶段和发酵规模下表现一致的合成启动子 | 酵母菌中的合成启动子 | 合成生物学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据集 | NA |
| 975 | 2024-08-07 |
The AP2/ERF Transcription Factor PgERF120 Regulates Ginsenoside Biosynthesis in Ginseng
2024-Mar-13, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14030345
PMID:38540764
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研究论文 | 研究了AP2/ERF转录因子PgERF120在人参中对人参皂苷生物合成的影响 | 首次报道了AP2/ERF转录因子在调节药用植物主要活性成分合成及响应生物和非生物胁迫中的作用 | NA | 验证PgERF120基因在人参皂苷合成中的调控作用，为研究人参功能基因提供理论基础 | 人参中的AP2/ERF转录因子PgERF120及其对人参皂苷合成的影响 | NA | NA | 荧光定量PCR | NA | 基因表达数据 | 使用了人参发根中的七个AP2/ERF基因和三个关键酶基因进行实验 |
| 976 | 2024-08-07 |
Mining Biosynthetic Gene Clusters of Pseudomonas vancouverensis Utilizing Whole Genome Sequencing
2024-Mar-09, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12030548
PMID:38543599
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研究论文 | 本文通过全基因组测序技术挖掘了Pseudomonas vancouverensis中的生物合成基因簇，以发现新的天然产物农药 | 利用antiSMASH 7.0、PRISM 4和BAGEL 4工具挖掘细菌基因组中的次级代谢物生物合成基因簇，预测了多种新型天然产物 | 需要进一步研究这些化合物在抗真菌活性方面的生物技术潜力 | 探索微生物来源的次级代谢物在农药开发中的应用 | Pseudomonas vancouverensis细菌及其生物合成基因簇 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 单一细菌菌株 |
| 977 | 2024-08-07 |
Genomic Insights and Synthetic Biology Applications of Marine Actinomycete Streptomyces griseoincarnatus HNS054
2024-Mar-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25063127
PMID:38542100
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研究论文 | 本文研究了海洋放线菌Streptomyces griseoincarnatus HNS054的基因组特征及其在合成生物学中的应用 | 成功改造HNS054以提高aborycin和actinorhodin的产量 | NA | 开发新型海洋来源药物和其他有价值的化合物 | 海洋放线菌Streptomyces griseoincarnatus HNS054 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 基因组 | HNS054菌株 |
| 978 | 2024-08-07 |
Engineering Terpene Production Pathways in Methylobacterium extorquens AM1
2024-Feb-29, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12030500
PMID:38543551
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研究论文 | 本文研究了在甲基杆菌AM1中通过代谢工程增强萜类化合物生产的可能性 | 通过操纵代谢途径，成功在甲基杆菌中增强了萜类化合物的生产，并展示了在植物叶际中工程菌株的定殖能力 | 使用中等强度的组成型启动子未能实现萜类化合物的生产 | 探索通过代谢工程在微生物中生产萜类化合物的方法 | 甲基杆菌AM1及其萜类化合物生产能力 | 微生物技术 | NA | 代谢工程 | NA | 微生物培养 | 涉及野生型、缺乏类胡萝卜素途径的甲基营养突变体和工程菌株 |
| 979 | 2024-08-07 |
Next-Generation Probiotics as Novel Therapeutics for Improving Human Health: Current Trends and Future Perspectives
2024-Feb-20, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12030430
PMID:38543481
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综述 | 本文综述了下一代益生菌（NGPs）作为改善人类健康的新型治疗药物的当前趋势和未来展望 | NGPs不仅可用于传统食品或膳食补充剂，还适用于制药应用，并提供了个性化益生菌治疗、合成生物学和基因编辑、组合疗法、靶向递送方法和治疗应用的机会 | NA | 探讨NGPs的潜在治疗效果及其在人类健康关键方面的影响 | 下一代益生菌（NGPs）及其在治疗慢性疾病中的应用 | NA | 慢性疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 980 | 2024-08-07 |
Intelligent computation in cancer gene therapy
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1252246
PMID:38549859
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综述 | 本文综述了利用合成基因调控网络实现人工神经网络在癌症基因治疗中的应用及其最新计算进展 | 提出通过合成生物学领域的合成基因电路来实时精细调控治疗基因表达的新方法 | NA | 探讨如何利用新兴的计算能力生成更安全有效的基因治疗方法 | 癌症基因治疗中的合成基因调控网络及人工神经网络的实现 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路 | 人工神经网络 | NA | NA |