合成生物学相关文章
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当前共找到 1127 篇文献，本页显示第 961 - 980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2024-08-07 |
Exploiting synthetic biology platforms for enhanced biosynthesis of natural products in Yarrowia lipolytica
2024-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.130614
PMID:38513925
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综述 | 本文主要回顾了合成生物学技术在Yarrowia lipolytica中的发展，并总结了近期在Y. lipolytica中合成天然产品的研究进展 | 利用合成生物学平台设计、修改甚至从头合成微生物，赋予微生物非自然功能，促进功能产品的开发 | NA | 解决天然产品供应不足的关键问题，如低产量、长生产周期和繁琐的程序 | Yarrowia lipolytica中的合成生物学技术和天然产品合成 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 962 | 2024-08-07 |
Two Cytochrome P450 Enzymes Form the Tricyclic Nested Skeleton of Meroterpenoids by Sequential Oxidative Reactions
2024-Apr-11, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c01943
PMID:38602511
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研究论文 | 本文研究了两种细胞色素P450酶在形成三环嵌套骨架过程中的氧化反应作用 | 首次发现并证明了ClaR和ClaT两种酶在clavilactone生物合成中的关键作用，特别是ClaR作为大环酶催化非萜类部分的氧化环化 | NA | 探索并阐明在clavilactone生物合成中形成10/5/3三环嵌套骨架的自然酶机制 | clavilactone的生物合成机制及其在真菌中的基因簇 | NA | NA | 细胞色素P450单加氧酶 | NA | 基因簇 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 963 | 2024-08-07 |
Characterization of CYP82 genes involved in the biosynthesis of structurally diverse benzylisoquinoline alkaloids in Corydalis yanhusuo
2024-Mar-07, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-023-01397-7
PMID:38453737
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研究论文 | 本研究探讨了CYP82基因在Corydalis yanhusuo中苯并异喹啉生物碱（BIAs）生物合成中的催化功能 | 首次鉴定并表征了Corydalis yanhusuo中的CyCYP82基因，这些基因在BIAs的合成生物学中具有重要作用 | NA | 研究CYP82基因在苯并异喹啉生物碱生物合成中的作用 | Corydalis yanhusuo中的CYP82基因及其在BIAs生物合成中的功能 | 生物化学 | NA | 基因克隆 | NA | 基因序列 | 20个CyCYP82编码基因 | NA | NA | NA | NA |
| 964 | 2024-08-07 |
Design of a Biohybrid Materials Circuit with Binary Decoder Functionality
2024-Apr, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202308092
PMID:38118057
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研究论文 | 本文设计了一种基于蛋白酶的生物混合材料电路，具有二进制解码功能 | 开发了一组可通过诱导或抑制其生物活性来调控的蛋白酶基生物混合模块，并将其应用于材料中进行信息处理 | NA | 将合成生物学中的计算功能转移到材料系统中，实现高级信息处理电路的实现 | 蛋白酶基生物混合模块及其在材料中的应用 | 生物技术 | NA | 生物工程 | NA | 生物分子 | 2输入/4输出二进制解码器 | NA | NA | NA | NA |
| 965 | 2024-08-07 |
Multiplex Functional Characterization of Protein Variant Libraries in Mammalian Cells with Single-Copy Genomic Integration and High-Throughput DNA Sequencing
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_10
PMID:38441763
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研究论文 | 本文开发了一种利用Bxb1噬菌体DNA重组酶在细胞基因组中预设的“着陆垫”位点插入单个无启动子质粒的哺乳动物合成生物学平台，以实现大规模并行遗传分析 | 该平台通过基因组整合的启动子确保每个细胞只表达一个转基因，保持严格的基因型-表型联系，并能对选定的细胞进行测序以赋予每个变体表型评分 | NA | 开发一种新的方法来同时表征编码数千种独特蛋白质变体的库的基因型-表型关系 | 蛋白质变体库在哺乳动物细胞中的功能表征 | 合成生物学 | NA | 高通量DNA测序 | NA | DNA序列 | 数千种独特蛋白质变体 | NA | NA | NA | NA |
| 966 | 2024-08-07 |
CRISPRi-induced transcriptional regulation of IAH1 gene and its influence on volatile compounds profile in Kluyveromyces marxianus DU3
2024-Mar-05, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-023-03811-0
PMID:38441729
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研究论文 | 本研究利用CRISPR干扰技术下调Kluyveromyces marxianus DU3菌株中的IAH1基因表达，并分析其对挥发性化合物代谢谱的影响 | 首次在Kluyveromyces marxianus中应用CRISPRi技术进行基因表达的靶向调控，为代谢工程和合成生物学策略提供了新途径 | NA | 研究IAH1基因下调对Kluyveromyces marxianus中挥发性化合物代谢谱的影响 | Kluyveromyces marxianus DU3菌株中的IAH1基因及其编码的酯酶 | 代谢工程 | NA | CRISPR干扰技术 | NA | 基因表达数据 | Kluyveromyces marxianus DU3菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 967 | 2024-08-07 |
Fast-growing cyanobacterial chassis for synthetic biology application
2024-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2023.2166455
PMID:36842999
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综述 | 本文综述了快速生长的蓝细菌作为合成生物学应用底盘的研究进展 | 介绍了近年来快速生长的蓝细菌新品种及其在将二氧化碳转化为化学品中的应用，以及为这些新蓝细菌底盘开发的遗传工具箱 | 当前蓝细菌底盘的生长速度慢和生物量积累低，导致大多数产品的生产率仍低于大规模商业应用所需的阈值 | 探讨开发具有快速生长和/或更高生物量积累能力的高效蓝细菌底盘 | 快速生长的蓝细菌底盘 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 968 | 2024-08-07 |
The emerging tumor microbe microenvironment: From delineation to multidisciplinary approach-based interventions
2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.11.018
PMID:38572104
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综述 | 本文综述了肿瘤微环境中的微生物群落，探讨了其在肿瘤发生、转移、免疫监视和预后中的作用，以及多学科方法在肿瘤微生物组干预中的应用。 | 强调了肿瘤微环境中微生物群落的新角色及其对传统肿瘤微环境的多样化影响。 | NA | 深入理解癌症-免疫-微生物的相互作用，并促进基于微生物的肿瘤特异性治疗的发展。 | 肿瘤微环境中的微生物群落及其在不同类型肿瘤中的异质性。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 969 | 2024-08-07 |
BioNexusSentinel: a visual tool for bioregulatory network and cytohistological RNA-seq genetic expression profiling within the context of multicellular simulation research using ChatGPT-augmented software engineering
2024, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbae046
PMID:38571784
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研究论文 | 本文介绍了一个集成视觉平台BioNexusSentinel，用于高效探索细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | BioNexusSentinel是一个全新的系统，独特地结合了细胞组织学RNA-seq和生物调节网络探索功能，并利用ChatGPT增强的软件工程技术开发 | NA | 旨在参数化多细胞模拟研究，并开发一个集成视觉平台以提高研究效率 | 多细胞模拟研究中的细胞组织学RNA-seq和生物调节网络 | 计算生物学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | 基于人类蛋白质图谱数据 | NA | NA | NA | NA |
| 970 | 2024-08-07 |
Safely balancing a double-edged blade: identifying and mitigating emerging biosecurity risks in precision medicine
2024, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2024.1364703
PMID:38572161
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研究论文 | 本文探讨了精准医学中新兴生物安全风险的识别与缓解措施 | 提出了一个新兴学科——网络生物安全，旨在保护人类隐私、自主权和安全，与生物医学的科学和技术进步保持同步 | NA | 探讨精准医学中的双重用途风险，并提出相应的生物数据安全措施 | 精准医学中的工具和方法，以及相关的生物数据安全问题 | 精准医学 | NA | 机器学习、人工智能 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 971 | 2024-08-07 |
Siraitia grosvenorii As a Homologue of Food and Medicine: A Review of Biological Activity, Mechanisms of Action, Synthetic Biology, and Applications in Future Food
2024-Apr-03, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00018
PMID:38513114
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综述 | 本文综述了罗汉果（Siraitia grosvenorii）在食品和医药领域的历史角色、应用、植物化学成分及其生物活性，并探讨了其在合成生物学中的最新进展。 | 文章强调了合成生物学在提高罗汉果生物活性成分生产中的应用，为扩大其可用性提供了新机遇。 | NA | 旨在全面回顾罗汉果在食品和医药领域的历史、化学成分、生物功能、作用机制及合成生物学的应用。 | 罗汉果的植物化学成分、生物活性及其在食品和医药中的应用。 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 972 | 2024-08-07 |
Transcriptomics aids in uncovering the metabolic shifts and molecular machinery of Schizochytrium limacinum during biotransformation of hydrophobic substrates to docosahexaenoic acid
2024-Apr-01, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02381-6
PMID:38561811
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研究论文 | 研究了Schizochytrium limacinum SR21在将疏水性底物转化为二十二碳六烯酸（DHA）过程中的代谢转变和分子机制 | 揭示了SR21在利用疏水性底物进行DHA生物合成时的代谢途径和分子机制，特别是脂酶的上调和脂肪酸完全降解为乙酰辅酶A的过程 | 研究主要集中在实验室条件下，未来研究可以利用合成生物学工具进一步优化疏水性底物的转化 | 探索Schizochytrium limacinum SR21在将废油转化为高价值营养品过程中的代谢和分子机制 | Schizochytrium limacinum SR21及其在不同脂肪酸组成的商业油和废烹饪油中的表现 | 代谢生物学 | NA | 转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用SR21在72小时内处理不同脂肪酸组成的商业油和废烹饪油，产生约7.5 g/L的生物量 | NA | NA | NA | NA |
| 973 | 2024-08-07 |
What is the role of microbial biotechnology and genetic engineering in medicine?
2024-Apr, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.1406
PMID:38556942
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综述 | 本文综述了微生物生物技术和遗传工程在医学领域的应用，重点介绍了基于基因的技术在开发治疗剂中的作用 | 本文介绍了遗传工程技术、功能基因组学和合成生物学在揭示先前未知的天然产物中的应用 | NA | 探讨微生物生物技术和遗传工程在医学中的作用 | 微生物产品及其在治疗剂开发中的应用 | NA | NA | 遗传工程技术、功能基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 974 | 2024-08-07 |
A general model for predicting enzyme functions based on enzymatic reactions
2024-Mar-31, Journal of cheminformatics
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13321-024-00827-y
PMID:38556873
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研究论文 | 本文介绍了一种基于BERT的多分类模型BEC-Pred，用于预测与反应相关的酶委员会（EC）编号 | BEC-Pred模型利用迁移学习，通过分析底物和产物的SMILES序列，实现了对广泛酶委员会（EC）编号的精确预测 | NA | 开发一种高效准确的模型来预测酶的功能 | 酶的功能预测 | 机器学习 | NA | BERT | BERT | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 975 | 2024-08-07 |
Novel processing strategies to enhance the bioaccessibility and bioavailability of functional components in wheat bran
2024, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2022.2129582
PMID:36190261
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综述 | 本文综述了小麦麸皮中的功能性成分，分析了改性方法，并重点介绍了新型固态发酵（SSF）策略在释放功能性成分中的应用 | 利用传统发酵食品中的高效微生物资源，探索细胞群落间的物质交换规律，构建稳定的自调节共培养系统，以及结合新兴的物理场预处理技术 | NA | 探讨如何通过新型处理策略提高小麦麸皮中功能性成分的生物可及性和生物利用度 | 小麦麸皮中的功能性成分，如膳食纤维、多糖和酚类 | NA | NA | 固态发酵（SSF）、合成生物学、基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 976 | 2024-08-07 |
GraphKM: machine and deep learning for KM prediction of wildtype and mutant enzymes
2024-Mar-28, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05746-1
PMID:38549073
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习框架PaddlePaddle的机器和深度学习方法GraphKM，用于预测野生型和突变酶的Michaelis常数K | GraphKM结合了图神经网络（GNN）、全连接层和梯度提升框架，通过分子图和预训练的基于transformer的语言模型来表示底物和酶，以构建模型输入 | 现有的机器和深度学习模型仅限于特定酶，如少数酶或野生型酶 | 提高酶动力学研究的步伐，通过预测K值来替代耗时且困难的实验测量 | 野生型和突变酶的Michaelis常数K | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图神经网络（GNN）、全连接层、梯度提升框架 | 分子图、文本 | 独立K数据集HXKm | NA | NA | NA | NA |
| 977 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering of an industrial bacterium Zymomonas mobilis for anaerobic l-serine production
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.008
PMID:38549615
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和过程优化的结合，在工业细菌Zymomonas mobilis中进行了代谢工程改造，以实现厌氧条件下L-丝氨酸的生产 | 首次报道了利用非模式微生物生产L-丝氨酸的微生物细胞工厂，并通过阻断降解途径和引入出口蛋白EceamA等策略，显著提高了L-丝氨酸的产量 | NA | 构建L-丝氨酸生产菌株，并理解限制其在非模式微生物中生产的瓶颈，为未来改进提供指导 | 工业细菌Zymomonas mobilis | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 978 | 2024-08-07 |
Systemically functional characterization of regiospecific flavonoid O-methyltransferases from Glycine max
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.009
PMID:38549618
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研究论文 | 本文对大豆中特异性黄酮O-甲基转移酶进行了系统功能表征 | 首次对大豆中22个潜在的O-甲基转移酶编码基因进行了筛选和克隆，并成功异源表达，揭示了这些酶在黄酮类化合物甲基化中的作用 | NA | 研究大豆中黄酮类化合物O-甲基转移酶的功能及其在黄酮类化合物生物合成中的作用 | 大豆中的黄酮O-甲基转移酶及其编码基因 | 生物化学 | NA | O-甲基转移酶 | NA | 基因序列 | 22个潜在的O-甲基转移酶编码基因，其中19个成功克隆并异源表达 | NA | NA | NA | NA |
| 979 | 2024-08-07 |
Design and synthesis of synthetic promoters for consistency of gene expression across growth phases and scale in S. cerevisiae
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.004
PMID:38549617
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研究论文 | 本文通过混合启动子工程策略，设计并合成了在不同生长阶段和发酵规模下表现一致的新型合成启动子 | 本文提出了一种新的合成启动子设计策略，通过增加静止期启动子在指数生长阶段的活性，实现了在不同生长阶段和发酵规模下的一致表达 | NA | 开发在不同生长阶段和发酵规模下表现一致的合成启动子 | 酵母菌中的合成启动子 | 合成生物学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 980 | 2024-08-07 |
Mining Biosynthetic Gene Clusters of Pseudomonas vancouverensis Utilizing Whole Genome Sequencing
2024-Mar-09, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12030548
PMID:38543599
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研究论文 | 本文通过全基因组测序技术挖掘了Pseudomonas vancouverensis中的生物合成基因簇，以发现新的天然产物农药 | 利用antiSMASH 7.0、PRISM 4和BAGEL 4工具挖掘细菌基因组中的次级代谢物生物合成基因簇，预测了多种新型天然产物 | 需要进一步研究这些化合物在抗真菌活性方面的生物技术潜力 | 探索微生物来源的次级代谢物在农药开发中的应用 | Pseudomonas vancouverensis细菌及其生物合成基因簇 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 单一细菌菌株 | NA | NA | NA | NA |