合成生物学相关文章
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当前共找到 1127 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2024-08-07 |
Novel processing strategies to enhance the bioaccessibility and bioavailability of functional components in wheat bran
2024, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2022.2129582
PMID:36190261
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综述 | 本文综述了小麦麸皮中的功能性成分，分析了改性方法，并重点介绍了新型固态发酵（SSF）策略在释放功能性成分中的应用 | 利用传统发酵食品中的高效微生物资源，探索细胞群落间的物质交换规律，构建稳定的自调节共培养系统，以及结合新兴的物理场预处理技术 | NA | 探讨如何通过新型处理策略提高小麦麸皮中功能性成分的生物可及性和生物利用度 | 小麦麸皮中的功能性成分，如膳食纤维、多糖和酚类 | NA | NA | 固态发酵（SSF）、合成生物学、基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 982 | 2024-08-07 |
GraphKM: machine and deep learning for KM prediction of wildtype and mutant enzymes
2024-Mar-28, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05746-1
PMID:38549073
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习框架PaddlePaddle的机器和深度学习方法GraphKM，用于预测野生型和突变酶的Michaelis常数K | GraphKM结合了图神经网络（GNN）、全连接层和梯度提升框架，通过分子图和预训练的基于transformer的语言模型来表示底物和酶，以构建模型输入 | 现有的机器和深度学习模型仅限于特定酶，如少数酶或野生型酶 | 提高酶动力学研究的步伐，通过预测K值来替代耗时且困难的实验测量 | 野生型和突变酶的Michaelis常数K | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图神经网络（GNN）、全连接层、梯度提升框架 | 分子图、文本 | 独立K数据集HXKm | NA | NA | NA | NA |
| 983 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering of an industrial bacterium Zymomonas mobilis for anaerobic l-serine production
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.008
PMID:38549615
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和过程优化的结合，在工业细菌Zymomonas mobilis中进行了代谢工程改造，以实现厌氧条件下L-丝氨酸的生产 | 首次报道了利用非模式微生物生产L-丝氨酸的微生物细胞工厂，并通过阻断降解途径和引入出口蛋白EceamA等策略，显著提高了L-丝氨酸的产量 | NA | 构建L-丝氨酸生产菌株，并理解限制其在非模式微生物中生产的瓶颈，为未来改进提供指导 | 工业细菌Zymomonas mobilis | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 984 | 2024-08-07 |
Systemically functional characterization of regiospecific flavonoid O-methyltransferases from Glycine max
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.009
PMID:38549618
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研究论文 | 本文对大豆中特异性黄酮O-甲基转移酶进行了系统功能表征 | 首次对大豆中22个潜在的O-甲基转移酶编码基因进行了筛选和克隆，并成功异源表达，揭示了这些酶在黄酮类化合物甲基化中的作用 | NA | 研究大豆中黄酮类化合物O-甲基转移酶的功能及其在黄酮类化合物生物合成中的作用 | 大豆中的黄酮O-甲基转移酶及其编码基因 | 生物化学 | NA | O-甲基转移酶 | NA | 基因序列 | 22个潜在的O-甲基转移酶编码基因，其中19个成功克隆并异源表达 | NA | NA | NA | NA |
| 985 | 2024-08-07 |
Design and synthesis of synthetic promoters for consistency of gene expression across growth phases and scale in S. cerevisiae
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.004
PMID:38549617
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研究论文 | 本文通过混合启动子工程策略，设计并合成了在不同生长阶段和发酵规模下表现一致的新型合成启动子 | 本文提出了一种新的合成启动子设计策略，通过增加静止期启动子在指数生长阶段的活性，实现了在不同生长阶段和发酵规模下的一致表达 | NA | 开发在不同生长阶段和发酵规模下表现一致的合成启动子 | 酵母菌中的合成启动子 | 合成生物学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 986 | 2024-08-07 |
Mining Biosynthetic Gene Clusters of Pseudomonas vancouverensis Utilizing Whole Genome Sequencing
2024-Mar-09, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12030548
PMID:38543599
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研究论文 | 本文通过全基因组测序技术挖掘了Pseudomonas vancouverensis中的生物合成基因簇，以发现新的天然产物农药 | 利用antiSMASH 7.0、PRISM 4和BAGEL 4工具挖掘细菌基因组中的次级代谢物生物合成基因簇，预测了多种新型天然产物 | 需要进一步研究这些化合物在抗真菌活性方面的生物技术潜力 | 探索微生物来源的次级代谢物在农药开发中的应用 | Pseudomonas vancouverensis细菌及其生物合成基因簇 | 数字病理学 | NA | 全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 单一细菌菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 987 | 2024-08-07 |
Genomic Insights and Synthetic Biology Applications of Marine Actinomycete Streptomyces griseoincarnatus HNS054
2024-Mar-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25063127
PMID:38542100
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研究论文 | 本文研究了海洋放线菌Streptomyces griseoincarnatus HNS054的基因组特征及其在合成生物学中的应用 | 成功改造HNS054以提高aborycin和actinorhodin的产量 | NA | 开发新型海洋来源药物和其他有价值的化合物 | 海洋放线菌Streptomyces griseoincarnatus HNS054 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 基因组 | HNS054菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 988 | 2024-08-07 |
Engineering Terpene Production Pathways in Methylobacterium extorquens AM1
2024-Feb-29, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12030500
PMID:38543551
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研究论文 | 本文研究了在甲基杆菌AM1中通过代谢工程增强萜类化合物生产的可能性 | 通过操纵代谢途径，成功在甲基杆菌中增强了萜类化合物的生产，并展示了在植物叶际中工程菌株的定殖能力 | 使用中等强度的组成型启动子未能实现萜类化合物的生产 | 探索通过代谢工程在微生物中生产萜类化合物的方法 | 甲基杆菌AM1及其萜类化合物生产能力 | 微生物技术 | NA | 代谢工程 | NA | 微生物培养 | 涉及野生型、缺乏类胡萝卜素途径的甲基营养突变体和工程菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 989 | 2024-08-07 |
Intelligent computation in cancer gene therapy
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1252246
PMID:38549859
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综述 | 本文综述了利用合成基因调控网络实现人工神经网络在癌症基因治疗中的应用及其最新计算进展 | 提出通过合成生物学领域的合成基因电路来实时精细调控治疗基因表达的新方法 | NA | 探讨如何利用新兴的计算能力生成更安全有效的基因治疗方法 | 癌症基因治疗中的合成基因调控网络及人工神经网络的实现 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路 | 人工神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 990 | 2024-08-07 |
The roles of SARP family regulators involved in secondary metabolism in Streptomyces
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1368809
PMID:38550856
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综述 | 本文总结了SARP家族调控因子在次级代谢中的作用，特别是在次级代谢物生物合成中的调控机制及其在生物技术中的应用 | NA | NA | 帮助研究人员全面理解SARP家族调控因子在次级代谢物生物合成中的作用，为未来在合成生物学中的应用打下坚实基础 | SARP家族调控因子在次级代谢中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 991 | 2024-08-07 |
Structure of the intact tail machine of Anabaena myophage A-1(L)
2024-Mar-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47006-z
PMID:38531972
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研究论文 | 本文报道了Anabaena噬菌体A-1(L)完整尾部机器的高分辨率冷冻电镜结构，包括颈部、尾部及其附着的纤维。 | 首次揭示了A-1(L)噬菌体尾部机器的详细结构，包括其独特的颈部结构和尾部纤维的排列方式。 | NA | 解析Anabaena噬菌体A-1(L)的完整尾部机器结构，以促进其在合成生物学中的应用。 | Anabaena噬菌体A-1(L)的尾部机器结构。 | NA | NA | 冷冻电镜（cryo-EM） | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 992 | 2024-08-07 |
[Construction of synthetic microbial community and its application in polyhydroxyalkanoate biosynthesis]
2024-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230483
PMID:38545973
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综述 | 本文综述了合成微生物群落的设计原则、构建方法及其在聚羟基脂肪酸酯（PHA）生物合成中的应用 | 合成微生物群落是合成生态学的核心研究方向和合成生物学的新兴前沿，需要设计微生物相互作用、空间组织、鲁棒性维护和生物遏制等策略 | NA | 探讨合成微生物群落在PHA生物合成中的应用，旨在降低PHA生产成本 | 合成微生物群落及其在PHA生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 993 | 2024-08-07 |
[Advances in fermentative production of L-tryptophan: a review]
2024-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230404
PMID:38545968
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综述 | 本文综述了L-色氨酸的发酵生产及其生物合成代谢和调控机制的最新进展 | 介绍了通过实验室适应性进化等非理性设计方法改进L-色氨酸生产菌株性能的研究 | L-色氨酸在微生物细胞中的代谢途径长且调控机制复杂不明确，导致生产效率和菌株稳健性低 | 总结L-色氨酸生物合成代谢及其调控、生产菌株的构建与优化以及发酵生产的最新进展，并展望未来发展方向 | L-色氨酸及其生产菌株 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 994 | 2024-08-07 |
[Reflections on the safety regulation of commercialization of synthetic biology products]
2024-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230320
PMID:38545975
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评论 | 本文总结了合成生物产品在食品、医疗、农业、环境、能源和材料领域的应用情况，分析了其存在的安全风险，并梳理了欧美及中国在监管方面的现状，提出了加强安全监管的建议 | 提出了针对合成生物产品安全风险的全过程监管措施，包括分类审批、产品分类标识以及市场主体准入前的严格筛选和审批，以及入市后的安全监管和应急处理及事故责任调查 | NA | 探讨合成生物产品商业化过程中的安全监管问题 | 合成生物产品在多个领域的应用及其安全风险 | NA | NA | 合成生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 995 | 2024-08-07 |
Machine Learning to Predict Enzyme-Substrate Interactions in Elucidation of Synthesis Pathways: A Review
2024-Mar-07, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14030154
PMID:38535315
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综述 | 本文综述了利用机器学习方法预测酶-底物相互作用以阐明合成途径的研究进展 | 采用基于人工智能的方法，如支持向量机、神经网络和决策树，显著减少了计算时间并覆盖了广泛的搜索空间 | 这些方法在处理大规模搜索空间时仍存在计算速度较慢的问题 | 探讨机器学习在预测酶-底物相互作用中的应用，以加速合成途径的阐明 | 酶-底物相互作用及其在合成生物学中的应用 | 机器学习 | NA | 支持向量机、神经网络、决策树 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 996 | 2024-08-07 |
A systems framework for investigating the roles of multiple transporters and their impact on drug resistance
2024-Jan-23, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyae007
PMID:38537223
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研究论文 | 本文开发了一个系统框架，用于研究多种转运蛋白在药物抗性中的作用及其相互作用 | 创新性地创建了一个结构化的系统框架，用于评估多种转运蛋白对药物外排和药物抗性的影响 | NA | 旨在深入理解转运蛋白在药物抗性中的系统级功能和作用 | 多种转运蛋白及其与药物的相互作用和调控机制 | 生物医学工程 | NA | 计算和分析方法 | 系统框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 997 | 2024-08-07 |
Enhancing 2-Pyrone Synthase Efficiency by High-Throughput Mass-Spectrometric Quantification and In Vitro/In Vivo Catalytic Performance Correlation
2024-03-01, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202300849
PMID:38116888
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研究论文 | 本研究通过高通量质谱定量方法筛选2-吡喃酮合酶（2PS）的新突变体，以提高三乙酸内酯（TAL）的生物合成效率 | 发现了两个突变体，其产率分别比野生型2PS提高了46倍和44倍，这是文献中报道的最高改进 | NA | 提高生物催化剂的效率，以从可再生资源中生产有价值的生物产品 | 2-吡喃酮合酶（2PS）的突变体筛选及其在细胞内催化性能的优化 | 代谢工程 | NA | 质谱 | NA | 生物化学数据 | 大量突变体 | NA | NA | NA | NA |
| 998 | 2024-08-07 |
Sugarcane breeding: a fantastic past and promising future driven by technology and methods
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1375934
PMID:38525140
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review | 本文从技术和方法的角度回顾了甘蔗育种的主要历史，指出了当前的状况和挑战，并对智能育种的前景进行了合理展望 | 本文提出了利用现代生物技术（如全基因组选择、转基因、基因编辑和合成生物学）和信息技术（如遥感和深度学习）来实现甘蔗育种的跨越式发展 | 由于遗传基础狭窄、品种退化严重、缺乏突破性品种以及育种周期长和基因聚合概率低等问题，甘蔗育种面临挑战 | 探讨如何利用新技术和方法推动甘蔗育种的发展，以应对未来世界人口爆炸、可耕种土地减少和各种生物及非生物胁迫的威胁 | 甘蔗育种 | NA | NA | 全基因组选择、转基因、基因编辑、合成生物学、遥感、深度学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 999 | 2024-08-07 |
A universal molecular control for DNA, mRNA and protein expression
2024-Mar-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46456-9
PMID:38509097
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研究论文 | 本文利用合成生物学原理，开发了一种名为pREF的多组学控制标准，可作为下一代测序和质谱方法的通用分子标准 | pREF序列编码21个合成基因，可体外转录为插入mRNA控制，并体外翻译生成匹配的蛋白质控制，提供了DNA、RNA和肽检测的定性和定量准确性控制 | NA | 开发一种跨基因组学、转录组学和蛋白质组学方法的集成基因表达测量标准 | DNA、mRNA和蛋白质表达的控制标准 | 基因组学 | NA | 下一代测序、质谱 | NA | DNA、RNA、蛋白质 | 21个合成基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1000 | 2024-08-07 |
Engineered microorganisms: A new direction in kidney stone prevention and treatment
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.02.005
PMID:38510204
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造微生物在预防和治疗肾结石中的研究现状 | 利用合成生物学方法使益生菌获得新的表型或异源蛋白表达能力，通过直接降解促进结石生成的代谢物或间接调节菌群稳态来有效抑制肾结石的发展 | 目前存在的天然益生菌有局限性 | 提供预防和治疗肾结石的新有效思路 | 肠道和尿路中的微生物 | 合成生物学 | 肾结石 | 微生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |