合成生物学相关文章
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当前共找到 1142 篇文献，本页显示第 981 - 1000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2024-08-07 |
The roles of SARP family regulators involved in secondary metabolism in Streptomyces
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1368809
PMID:38550856
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综述 | 本文总结了SARP家族调控因子在次级代谢中的作用，特别是在次级代谢物生物合成中的调控机制及其在生物技术中的应用 | NA | NA | 帮助研究人员全面理解SARP家族调控因子在次级代谢物生物合成中的作用，为未来在合成生物学中的应用打下坚实基础 | SARP家族调控因子在次级代谢中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 982 | 2024-08-07 |
Structure of the intact tail machine of Anabaena myophage A-1(L)
2024-Mar-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47006-z
PMID:38531972
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研究论文 | 本文报道了Anabaena噬菌体A-1(L)完整尾部机器的高分辨率冷冻电镜结构，包括颈部、尾部及其附着的纤维。 | 首次揭示了A-1(L)噬菌体尾部机器的详细结构，包括其独特的颈部结构和尾部纤维的排列方式。 | NA | 解析Anabaena噬菌体A-1(L)的完整尾部机器结构，以促进其在合成生物学中的应用。 | Anabaena噬菌体A-1(L)的尾部机器结构。 | NA | NA | 冷冻电镜（cryo-EM） | NA | 结构数据 | NA |
| 983 | 2024-08-07 |
[Construction of synthetic microbial community and its application in polyhydroxyalkanoate biosynthesis]
2024-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230483
PMID:38545973
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综述 | 本文综述了合成微生物群落的设计原则、构建方法及其在聚羟基脂肪酸酯（PHA）生物合成中的应用 | 合成微生物群落是合成生态学的核心研究方向和合成生物学的新兴前沿，需要设计微生物相互作用、空间组织、鲁棒性维护和生物遏制等策略 | NA | 探讨合成微生物群落在PHA生物合成中的应用，旨在降低PHA生产成本 | 合成微生物群落及其在PHA生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 984 | 2024-08-07 |
[Advances in fermentative production of L-tryptophan: a review]
2024-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230404
PMID:38545968
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综述 | 本文综述了L-色氨酸的发酵生产及其生物合成代谢和调控机制的最新进展 | 介绍了通过实验室适应性进化等非理性设计方法改进L-色氨酸生产菌株性能的研究 | L-色氨酸在微生物细胞中的代谢途径长且调控机制复杂不明确，导致生产效率和菌株稳健性低 | 总结L-色氨酸生物合成代谢及其调控、生产菌株的构建与优化以及发酵生产的最新进展，并展望未来发展方向 | L-色氨酸及其生产菌株 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 985 | 2024-08-07 |
[Reflections on the safety regulation of commercialization of synthetic biology products]
2024-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230320
PMID:38545975
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评论 | 本文总结了合成生物产品在食品、医疗、农业、环境、能源和材料领域的应用情况，分析了其存在的安全风险，并梳理了欧美及中国在监管方面的现状，提出了加强安全监管的建议 | 提出了针对合成生物产品安全风险的全过程监管措施，包括分类审批、产品分类标识以及市场主体准入前的严格筛选和审批，以及入市后的安全监管和应急处理及事故责任调查 | NA | 探讨合成生物产品商业化过程中的安全监管问题 | 合成生物产品在多个领域的应用及其安全风险 | NA | NA | 合成生物技术 | NA | NA | NA |
| 986 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Meets Ca2+ Release-Activated Ca2+ Channel-Dependent Immunomodulation
2024-Mar-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13060468
PMID:38534312
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综述 | 本文综述了合成生物学工具如何精确控制CRAC通道途径及其对免疫反应下游信号事件的影响 | 介绍了合成生物学在精确控制分子接近度和下游信号过程中的应用 | NA | 总结合成生物学工具在控制CRAC通道途径及其对免疫反应影响方面的应用 | CRAC通道及其在免疫反应中的作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 987 | 2024-08-07 |
Machine Learning to Predict Enzyme-Substrate Interactions in Elucidation of Synthesis Pathways: A Review
2024-Mar-07, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo14030154
PMID:38535315
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综述 | 本文综述了利用机器学习方法预测酶-底物相互作用以阐明合成途径的研究进展 | 采用基于人工智能的方法，如支持向量机、神经网络和决策树，显著减少了计算时间并覆盖了广泛的搜索空间 | 这些方法在处理大规模搜索空间时仍存在计算速度较慢的问题 | 探讨机器学习在预测酶-底物相互作用中的应用，以加速合成途径的阐明 | 酶-底物相互作用及其在合成生物学中的应用 | 机器学习 | NA | 支持向量机、神经网络、决策树 | NA | NA | NA |
| 988 | 2024-08-07 |
A systems framework for investigating the roles of multiple transporters and their impact on drug resistance
2024-Jan-23, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyae007
PMID:38537223
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研究论文 | 本文开发了一个系统框架，用于研究多种转运蛋白在药物抗性中的作用及其相互作用 | 创新性地创建了一个结构化的系统框架，用于评估多种转运蛋白对药物外排和药物抗性的影响 | NA | 旨在深入理解转运蛋白在药物抗性中的系统级功能和作用 | 多种转运蛋白及其与药物的相互作用和调控机制 | 生物医学工程 | NA | 计算和分析方法 | 系统框架 | NA | NA |
| 989 | 2024-08-07 |
Enhancing 2-Pyrone Synthase Efficiency by High-Throughput Mass-Spectrometric Quantification and In Vitro/In Vivo Catalytic Performance Correlation
2024-03-01, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202300849
PMID:38116888
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研究论文 | 本研究通过高通量质谱定量方法筛选2-吡喃酮合酶（2PS）的新突变体，以提高三乙酸内酯（TAL）的生物合成效率 | 发现了两个突变体，其产率分别比野生型2PS提高了46倍和44倍，这是文献中报道的最高改进 | NA | 提高生物催化剂的效率，以从可再生资源中生产有价值的生物产品 | 2-吡喃酮合酶（2PS）的突变体筛选及其在细胞内催化性能的优化 | 代谢工程 | NA | 质谱 | NA | 生物化学数据 | 大量突变体 |
| 990 | 2024-08-07 |
Reconstitution of the Bacterial Glutamate Receptor Channel by Encapsulation of a Cell-Free Expression System
2024-Mar-08, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66595
PMID:38526087
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研究论文 | 本文展示了一种在巨型单层脂质囊泡（GUVs）中重建细菌谷氨酸受体（GluR0）的方法，通过将无细胞表达系统封装并孵育在合成细胞内 | 本文创新性地利用无细胞表达系统，通过替换GluR0的N端信号肽为蛋白紫红质信号肽，成功实现了GluR0在混合GUVs膜中的共翻译转运 | 该方法目前仅限于模型膜蛋白GluR0的重建，未来需要验证其在其他膜蛋白重建中的适用性 | 旨在开发一种在合成细胞中重建膜蛋白的稳健方法 | 细菌谷氨酸受体（GluR0）及其在合成细胞膜中的重建 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA |
| 991 | 2024-08-07 |
Sugarcane breeding: a fantastic past and promising future driven by technology and methods
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1375934
PMID:38525140
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review | 本文从技术和方法的角度回顾了甘蔗育种的主要历史，指出了当前的状况和挑战，并对智能育种的前景进行了合理展望 | 本文提出了利用现代生物技术（如全基因组选择、转基因、基因编辑和合成生物学）和信息技术（如遥感和深度学习）来实现甘蔗育种的跨越式发展 | 由于遗传基础狭窄、品种退化严重、缺乏突破性品种以及育种周期长和基因聚合概率低等问题，甘蔗育种面临挑战 | 探讨如何利用新技术和方法推动甘蔗育种的发展，以应对未来世界人口爆炸、可耕种土地减少和各种生物及非生物胁迫的威胁 | 甘蔗育种 | NA | NA | 全基因组选择、转基因、基因编辑、合成生物学、遥感、深度学习 | NA | NA | NA |
| 992 | 2024-08-07 |
A universal molecular control for DNA, mRNA and protein expression
2024-Mar-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46456-9
PMID:38509097
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研究论文 | 本文利用合成生物学原理，开发了一种名为pREF的多组学控制标准，可作为下一代测序和质谱方法的通用分子标准 | pREF序列编码21个合成基因，可体外转录为插入mRNA控制，并体外翻译生成匹配的蛋白质控制，提供了DNA、RNA和肽检测的定性和定量准确性控制 | NA | 开发一种跨基因组学、转录组学和蛋白质组学方法的集成基因表达测量标准 | DNA、mRNA和蛋白质表达的控制标准 | 基因组学 | NA | 下一代测序、质谱 | NA | DNA、RNA、蛋白质 | 21个合成基因 |
| 993 | 2024-08-07 |
Engineered microorganisms: A new direction in kidney stone prevention and treatment
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.02.005
PMID:38510204
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造微生物在预防和治疗肾结石中的研究现状 | 利用合成生物学方法使益生菌获得新的表型或异源蛋白表达能力，通过直接降解促进结石生成的代谢物或间接调节菌群稳态来有效抑制肾结石的发展 | 目前存在的天然益生菌有局限性 | 提供预防和治疗肾结石的新有效思路 | 肠道和尿路中的微生物 | 合成生物学 | 肾结石 | 微生物工程 | NA | NA | NA |
| 994 | 2024-08-07 |
Empowering Protein Engineering through Recombination of Beneficial Substitutions
2024-Mar-15, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202303889
PMID:38288640
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综述 | 本文综述了通过重组有益替换来增强蛋白质工程潜力的实验和计算机辅助方法 | 强调了集成和机器学习引导策略在生成具有更好多样性、覆盖范围和大小的筛选库中的作用 | NA | 探讨如何通过重组方法实现单个有益替换的潜在增强 | 蛋白质工程中的重组方法 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 995 | 2024-08-07 |
teemi: An open-source literate programming approach for iterative design-build-test-learn cycles in bioengineering
2024-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011929
PMID:38457467
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研究论文 | 本文介绍了一个名为teemi的开源计算机辅助设计和分析平台，该平台采用文学编程用户界面，支持生物工程中的迭代设计-构建-测试-学习循环。 | teemi平台遵循FAIR原则，支持用户友好的模拟、组织和指导，以及机器学习在代谢途径设计中的应用。 | NA | 开发一个支持生物工程迭代设计-构建-测试-学习循环的开源平台。 | 生物工程中的设计、模拟、数据集成和分析，以及代谢途径的机器学习设计。 | 生物工程 | NA | 机器学习 | NA | 多变量数据集 | NA |
| 996 | 2024-08-07 |
Engineering stringent genetic biocontainment of yeast with a protein stability switch
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44988-8
PMID:38316765
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研究论文 | 本文描述了一种基于条件性稳定必需蛋白质的遗传编码生物遏制系统 | 该系统基于条件性蛋白质稳定性，机制上与先前报道的遗传生物遏制系统正交 | NA | 开发一种遗传编码的生物遏制系统，以确保工程微生物在开放环境应用中的安全性 | 酵母菌的遗传生物遏制系统 | 合成生物学 | NA | 遗传编码生物遏制系统 | NA | 基因数据 | 775个必需基因 |
| 997 | 2024-08-07 |
Flapjack: Data Management and Analysis for Genetic Circuit Characterization
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_23
PMID:38468101
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research paper | Flapjack平台为合成基因电路工程的DBTL循环中的设计、构建、测试和学习阶段提供了一个全面的数据管理和分析解决方案 | Flapjack平台通过其用户友好的界面和与外部软件的兼容性，为合成生物学研究提供了一个实用的工具 | NA | 解决合成基因电路工程DBTL循环中的挑战，促进基因电路的表征和优化 | 合成基因电路的表征和优化 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据和相关元数据 | NA |
| 998 | 2024-08-07 |
Mid-Long Chain Dicarboxylic Acid Production via Systems Metabolic Engineering: Progress and Prospects
2024-Mar-20, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00002
PMID:38442481
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研究论文 | 本文探讨了通过系统代谢工程策略在不同底盘中合成中长链二羧酸的方法 | 利用系统生物学、合成生物学和进化工程的新工具，实现能源密集型生物燃料的可持续生产 | NA | 探索中长链二羧酸的可持续生产方法，并讨论该领域的未来挑战 | 中长链二羧酸的生产 | 合成生物学 | NA | 系统代谢工程 | NA | NA | NA |
| 999 | 2024-08-07 |
Model-guided metabolic rewiring to bypass pyruvate oxidation for pyruvate derivative synthesis by minimizing carbon loss
2024-Mar-19, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00839-23
PMID:38315666
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研究论文 | 本文通过基因组规模的代谢模型和约束基流平衡分析、几何流平衡分析及流变量分析，设计了一种微生物宿主，通过引入双歧分流途径，绕过丙酮酸氧化，从而提高丙酮酸衍生物的合成效率。 | 本研究通过动态控制流分布和适应性实验室进化，建立了一种新的葡萄糖培养细菌的代谢模式，以在有氧条件下最小化碳损失，并为生产丙酮酸衍生物的细胞设计提供了有价值的见解。 | NA | 旨在通过代谢重编程，提高微生物宿主合成丙酮酸衍生物的效率，同时最小化碳损失。 | 微生物宿主的代谢途径和基因表达调控。 | 合成生物学 | NA | 基因组规模代谢模型、约束基流平衡分析、几何流平衡分析、流变量分析 | NA | 代谢数据 | 约3,000个基因编码库 |
| 1000 | 2024-08-07 |
EcoGenoRisk: Developing a computational ecological risk assessment tool for synthetic biology
2024-Apr-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123647
PMID:38402941
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研究论文 | 本文介绍了EcoGenoRisk，一个用于合成生物学生物入侵风险评估的新型计算工具 | EcoGenoRisk通过筛选与合成生物微生物基因相似的微生物栖息地，预测合成生物微生物可能建立种群的位置 | NA | 开发一个计算工具，用于评估合成生物学中修改微生物对非预期环境的潜在风险 | 合成生物学中的修改微生物及其对环境的潜在影响 | 合成生物学 | NA | 生物信息学 | NA | 基因组数据 | 520个古菌和32,828个细菌的完整基因组 |