合成生物学相关文章
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当前共找到 1152 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2024-08-07 |
Model-guided metabolic rewiring to bypass pyruvate oxidation for pyruvate derivative synthesis by minimizing carbon loss
2024-Mar-19, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00839-23
PMID:38315666
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研究论文 | 本文通过基因组规模的代谢模型和约束基流平衡分析、几何流平衡分析及流变量分析，设计了一种微生物宿主，通过引入双歧分流途径，绕过丙酮酸氧化，从而提高丙酮酸衍生物的合成效率。 | 本研究通过动态控制流分布和适应性实验室进化，建立了一种新的葡萄糖培养细菌的代谢模式，以在有氧条件下最小化碳损失，并为生产丙酮酸衍生物的细胞设计提供了有价值的见解。 | NA | 旨在通过代谢重编程，提高微生物宿主合成丙酮酸衍生物的效率，同时最小化碳损失。 | 微生物宿主的代谢途径和基因表达调控。 | 合成生物学 | NA | 基因组规模代谢模型、约束基流平衡分析、几何流平衡分析、流变量分析 | NA | 代谢数据 | 约3,000个基因编码库 |
| 1002 | 2024-08-07 |
EcoGenoRisk: Developing a computational ecological risk assessment tool for synthetic biology
2024-Apr-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2024.123647
PMID:38402941
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研究论文 | 本文介绍了EcoGenoRisk，一个用于合成生物学生物入侵风险评估的新型计算工具 | EcoGenoRisk通过筛选与合成生物微生物基因相似的微生物栖息地，预测合成生物微生物可能建立种群的位置 | NA | 开发一个计算工具，用于评估合成生物学中修改微生物对非预期环境的潜在风险 | 合成生物学中的修改微生物及其对环境的潜在影响 | 合成生物学 | NA | 生物信息学 | NA | 基因组数据 | 520个古菌和32,828个细菌的完整基因组 |
| 1003 | 2024-08-07 |
Automated high-throughput DNA synthesis and assembly
2024-Mar-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26967
PMID:38500977
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综述 | 本文综述了DNA合成与组装技术的最新进展，重点介绍了自动化和高通量技术的发展及其在合成生物学中的应用 | 介绍了自动化液体处理工作站和集成实验设备的使用，提高了合成生物学领域的效率 | NA | 探讨DNA合成与组装技术的创新和改进 | DNA合成与组装技术 | 合成生物学 | NA | 自动化液体处理 | NA | DNA序列 | NA |
| 1004 | 2024-08-07 |
Engineered mRNA-ribosome fusions for facile biosynthesis of selenoproteins
2024-Mar-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2321700121
PMID:38442159
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研究论文 | 本研究通过将核糖体RNA（rRNA）与信使RNA（mRNA）进行功能性融合，开发了一种新型策略来改进核糖体工程，以促进硒蛋白的生物合成 | 本研究首次提出了一种基于mRNA-rRNA融合的新型核糖体工程策略，即RiboU，通过将16S rRNA与硒半胱氨酸插入序列（SECIS）共价结合，实现了硒半胱氨酸（Sec）在蛋白质中的特定位点插入 | NA | 开发一种新型核糖体工程策略，以促进硒蛋白的生物合成 | 核糖体RNA（rRNA）与信使RNA（mRNA）的功能性融合 | 合成生物学 | NA | mRNA-rRNA融合技术 | NA | RNA | 三种功能性目标硒蛋白 |
| 1005 | 2024-08-07 |
Design and optimization of ε-poly-l-lysine with specific functions for diverse applications
2024-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.129513
PMID:38262828
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综述 | 本文综述了ε-聚-L-赖氨酸（ε-PL）的生产及其分子结构修饰的最新进展，重点讨论了提高ε-PL生产效率和多样性的挑战与解决方案 | 强调了ε-PL在食品保鲜和生物医学领域的应用潜力，并展望了通过合成生物学定制ε-PL分子结构的可能性 | 目前微生物合成ε-PL的效率受限于遗传工程和分子结构修饰的低效性 | 探讨ε-PL的生产优化及其在多领域应用中的分子结构修饰 | ε-聚-L-赖氨酸及其衍生物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1006 | 2024-08-07 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
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研究论文 | 本文研究了通过重组DNA甲基化酶来抑制IIS型限制酶活性的方法 | 开发了可用于合成生物学和DNA组装技术的重组DNA甲基化酶 | NA | 生产能够体外抑制IIS型限制酶的重组DNA甲基化酶 | DNA甲基化酶及其在抑制IIS型限制酶活性中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA甲基化 | NA | DNA | 十种甲基化酶 |
| 1007 | 2024-08-07 |
Bioelectricity and CO2-to-butyrate production using photobioelectrochemical cells with bio-hydrogel
2024-Apr, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.130530
PMID:38447619
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研究论文 | 本文介绍了一种利用光生物电化学电池（BPEC）通过生物水凝胶将太阳能转化为电能或化学物质的新技术 | 使用电活性细菌（Shewanella loihica PV-4）减少氧化石墨烯（rGO）纳米片并生产共装配的rGO/Shewanella生物水凝胶作为基本电极，结合合成生物学和纳米技术，提高了电子交换效率 | NA | 探索光生物电化学电池中高效生物电能和有价值化学物质的生产 | 光生物电化学电池中的生物水凝胶电极及其在CO2还原为丁酸中的应用 | 生物技术 | NA | 光生物电化学技术 | NA | 生物水凝胶 | 使用Shewanella loihica PV-4和基因编辑的Clostridium ljungdahlii进行共培养系统 |
| 1008 | 2024-08-07 |
Advancing the scale of synthetic biology via cross-species transfer of cellular functions enabled by iModulon engraftment
2024-Mar-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46486-3
PMID:38490991
|
研究论文 | 本研究通过机器学习分析大量转录组数据，识别出独立调节的基因集（iModulons），并展示了通过iModulon移植实现跨物种细胞功能的转移 | 首次通过iModulon移植实现了跨物种细胞功能的精确转移，包括生物转化和抗菌抵抗等复杂功能 | NA | 探索通过iModulon移植实现跨物种细胞功能转移的方法，并优化合成生物学中的菌株设计 | 细菌转录组数据和细胞功能转移 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 转录组数据 | 涉及多种Pseudomonas物种和Escherichia coli |
| 1009 | 2024-08-07 |
Creating new-to-nature carbon fixation: A guide
2024-Mar, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2023.12.012
PMID:38160747
|
综述 | 本文提供了一种关于设计和实现新型自然碳固定途径的实用指南 | 介绍了合成CO固定途径，这些途径比自然途径（如CBB循环）更有效地捕获和转化CO | NA | 旨在设计新的生物功能并扩展自然解决方案空间 | 新型自然碳固定途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1010 | 2024-08-07 |
Engineering mammalian cell growth dynamics for biomanufacturing
2024-Mar, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.01.006
PMID:38325641
|
研究论文 | 本文介绍了一种多层次的细胞工程策略，用于可调节的哺乳动物细胞生长阶段的控制 | 开发了一种结合“油门”和“刹车”系统的双可控系统，实现了哺乳动物细胞生长动态的动态和精确协调 | NA | 精确控制哺乳动物细胞生长动态，以提高生物制药制造 | 哺乳动物细胞 | 生物工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
| 1011 | 2024-08-07 |
Transitions in development - an interview with Nika Shakiba
2024-Mar-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202748
PMID:38421607
|
访谈 | 本文是对加拿大不列颠哥伦比亚大学Nika Shakiba的采访，她运用合成生物学技术研究干细胞竞争的基础 | NA | NA | 探讨Nika Shakiba的职业生涯及其如何将工程背景应用于干细胞研究 | 干细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 1012 | 2024-08-07 |
'Seeing' the electromagnetic spectrum: spotlight on the cryptochrome photocycle
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1340304
PMID:38495372
|
review | 本文综述了植物隐花色素如何获得光感应功能的机制 | 讨论了隐花色素光循环中产生的反应性氧物种（ROS）及其在生物应激反应中的作用，以及隐花色素对电磁场的响应和在光遗传学中的应用 | NA | 探讨植物隐花色素如何获得光感应功能及其在生物学和医学中的潜在应用 | 植物隐花色素及其光循环机制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1013 | 2024-08-07 |
Edible mycelium bioengineered for enhanced nutritional value and sensory appeal using a modular synthetic biology toolkit
2024-Mar-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46314-8
PMID:38485948
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研究论文 | 开发了一种用于Aspergillus oryzae的可食用真菌的模块化合成生物学工具包，以提高其营养价值和感官吸引力 | 首次开发了用于可食用真菌Aspergillus oryzae的模块化合成生物学工具包，并成功提高了其内部营养素和风味分子的含量 | NA | 通过合成生物学技术增强真菌食品的营养价值和感官吸引力 | Aspergillus oryzae真菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | NA | NA |
| 1014 | 2024-08-07 |
High-throughput prediction of enzyme promiscuity based on substrate-product pairs
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae089
PMID:38487850
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研究论文 | 本文开发了一种基于底物-产物对的酶混杂性预测模型SPEPP，利用迁移学习和变换器架构进行预测 | SPEPP模型通过迁移学习和变换器架构，无需先验反应知识，允许用户自定义候选酶库，具有较强的外推能力 | NA | 解决现有基于底物和反应相似性的工具在代谢工程和合成生物学中应用的局限性 | 酶混杂性预测及其在代谢工程、从头途径设计和有害物质降解中的应用 | 代谢工程 | NA | 迁移学习 | 变换器架构 | 底物-产物对数据 | NA |
| 1015 | 2024-08-07 |
Deep generative design of RNA family sequences
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02148-8
PMID:38238559
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研究论文 | 提出了一种名为RfamGen的深度生成模型，用于高效地设计功能性RNA家族序列 | RfamGen通过整合对齐和共识二级结构信息，能够生成新颖且功能性的RNA家族序列 | NA | 开发一种自动化设计功能性RNA的平台 | RNA家族序列 | 机器学习 | NA | 深度生成模型 | 深度生成模型 | 序列数据 | 使用了多种RNA家族进行实验验证 |
| 1016 | 2024-08-07 |
Synthetic biological neural networks: From current implementations to future perspectives
2024-Mar, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105164
PMID:38402944
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综述 | 本文综述了合成生物神经网络（SYNBIONNs）的当前实现和模型，并探讨了其未来的发展前景和挑战 | SYNBIONNs在医学、生物传感器、生物技术等领域的应用显示出巨大潜力 | 目前SYNBIONN的实现较为稀少，且主要依赖于在硅中预训练的神经网络和大量人工输入 | 探讨如何成功实现一个可扩展的、能够在线学习的体内生物神经网络 | 合成生物神经网络（SYNBIONNs）及其在不同领域的应用 | 生物技术 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA |
| 1017 | 2024-08-07 |
Towards overcoming obstacles of type II photodynamic therapy: Endogenous production of light, photosensitizer, and oxygen
2024-Mar, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.11.007
PMID:38486983
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综述 | 本文综述了通过内源性生产光、光敏剂和氧气来克服传统光动力疗法（PDT）障碍的方法 | 利用合成生物学的进展，通过基因工程细胞内源性生产光、光敏剂和氧气，以提高PDT的效果 | NA | 探讨如何通过内源性生产光、光敏剂和氧气来克服PDT的障碍 | 光动力疗法中的光渗透限制、肿瘤对光敏剂的低摄取以及肿瘤微环境中氧气的缺乏 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 1018 | 2024-08-07 |
Multifunctional 5-hydroxyconiferaldehyde O-methyltransferases (CAldOMTs) in plant metabolism
2024-Mar-14, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae011
PMID:38198655
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综述 | 本文综述了多功能5-羟基松柏醛O-甲基转移酶（CAldOMT）在植物代谢中的作用及其相关蛋白质，并讨论了其在生物炼制、农业和合成生物学中的进化、分子机制和作用。 | CAldOMTs在进化过程中发生了多次新功能化，产生了具有新颖催化活性和/或接受新底物的独特O-甲基转移酶（OMTs）。 | NA | 总结CAldOMTs及其相关蛋白质在植物代谢中的多方面作用，并探讨其在不同领域的应用。 | CAldOMT酶及其在植物代谢中的作用。 | 植物代谢 | NA | O-甲基转移酶（OMT） | NA | NA | NA |
| 1019 | 2024-08-07 |
Aggregation-Induced Emission Luminogens: A New Possibility for Efficient Visualization of RNA in Plants
2024-Mar-06, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13050743
PMID:38475589
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研究论文 | 本文探讨了利用聚集诱导发光分子（AIEgens）在植物中高效可视化RNA的新技术 | 首次将AIEgens技术应用于植物RNA成像，并结合点击化学和CRISPR/Cas13a系统进行精确RNA修饰 | 需要寻找一种特定的酶，该酶能以AIEgens为底物并通过点击化学反应将其修饰到目标RNA上 | 开发新的技术以提高植物RNA成像的效率和精确性 | 植物中的RNA | 生物技术 | NA | 聚集诱导发光（AIE） | NA | NA | NA |
| 1020 | 2024-08-07 |
Promoter screening and identification for metabolic regulation in Acremonium chrysogenum
2024-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300683
PMID:38479986
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研究论文 | 本研究通过分析转录组数据，筛选并验证了27个候选启动子，用于提高Acremonium chrysogenum中头孢菌素C的生产 | 开发了一种快速筛选潜在双向启动子的方法，并利用Golden Gate方法将启动子模块与目标基因结合，成功提高了头孢菌素C的产量 | NA | 提高Acremonium chrysogenum中头孢菌素C的生产效率 | Acremonium chrysogenum中的启动子筛选与代谢调控 | 合成生物学 | NA | Golden Gate方法 | NA | 转录组数据 | 27个候选启动子 |