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当前共找到 1127 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2024-08-07 |
High-throughput prediction of enzyme promiscuity based on substrate-product pairs
2024-Jan-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae089
PMID:38487850
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研究论文 | 本文开发了一种基于底物-产物对的酶混杂性预测模型SPEPP，利用迁移学习和变换器架构进行预测 | SPEPP模型通过迁移学习和变换器架构，无需先验反应知识，允许用户自定义候选酶库，具有较强的外推能力 | NA | 解决现有基于底物和反应相似性的工具在代谢工程和合成生物学中应用的局限性 | 酶混杂性预测及其在代谢工程、从头途径设计和有害物质降解中的应用 | 代谢工程 | NA | 迁移学习 | 变换器架构 | 底物-产物对数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1002 | 2024-08-07 |
Deep generative design of RNA family sequences
2024-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-02148-8
PMID:38238559
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研究论文 | 提出了一种名为RfamGen的深度生成模型，用于高效地设计功能性RNA家族序列 | RfamGen通过整合对齐和共识二级结构信息，能够生成新颖且功能性的RNA家族序列 | NA | 开发一种自动化设计功能性RNA的平台 | RNA家族序列 | 机器学习 | NA | 深度生成模型 | 深度生成模型 | 序列数据 | 使用了多种RNA家族进行实验验证 | NA | NA | NA | NA |
| 1003 | 2024-08-07 |
Synthetic biological neural networks: From current implementations to future perspectives
2024-Mar, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105164
PMID:38402944
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综述 | 本文综述了合成生物神经网络（SYNBIONNs）的当前实现和模型，并探讨了其未来的发展前景和挑战 | SYNBIONNs在医学、生物传感器、生物技术等领域的应用显示出巨大潜力 | 目前SYNBIONN的实现较为稀少，且主要依赖于在硅中预训练的神经网络和大量人工输入 | 探讨如何成功实现一个可扩展的、能够在线学习的体内生物神经网络 | 合成生物神经网络（SYNBIONNs）及其在不同领域的应用 | 生物技术 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1004 | 2024-08-07 |
Towards overcoming obstacles of type II photodynamic therapy: Endogenous production of light, photosensitizer, and oxygen
2024-Mar, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.11.007
PMID:38486983
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综述 | 本文综述了通过内源性生产光、光敏剂和氧气来克服传统光动力疗法（PDT）障碍的方法 | 利用合成生物学的进展，通过基因工程细胞内源性生产光、光敏剂和氧气，以提高PDT的效果 | NA | 探讨如何通过内源性生产光、光敏剂和氧气来克服PDT的障碍 | 光动力疗法中的光渗透限制、肿瘤对光敏剂的低摄取以及肿瘤微环境中氧气的缺乏 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1005 | 2024-08-07 |
Multifunctional 5-hydroxyconiferaldehyde O-methyltransferases (CAldOMTs) in plant metabolism
2024-Mar-14, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erae011
PMID:38198655
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综述 | 本文综述了多功能5-羟基松柏醛O-甲基转移酶（CAldOMT）在植物代谢中的作用及其相关蛋白质，并讨论了其在生物炼制、农业和合成生物学中的进化、分子机制和作用。 | CAldOMTs在进化过程中发生了多次新功能化，产生了具有新颖催化活性和/或接受新底物的独特O-甲基转移酶（OMTs）。 | NA | 总结CAldOMTs及其相关蛋白质在植物代谢中的多方面作用，并探讨其在不同领域的应用。 | CAldOMT酶及其在植物代谢中的作用。 | 植物代谢 | NA | O-甲基转移酶（OMT） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1006 | 2024-08-07 |
Aggregation-Induced Emission Luminogens: A New Possibility for Efficient Visualization of RNA in Plants
2024-Mar-06, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13050743
PMID:38475589
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研究论文 | 本文探讨了利用聚集诱导发光分子（AIEgens）在植物中高效可视化RNA的新技术 | 首次将AIEgens技术应用于植物RNA成像，并结合点击化学和CRISPR/Cas13a系统进行精确RNA修饰 | 需要寻找一种特定的酶，该酶能以AIEgens为底物并通过点击化学反应将其修饰到目标RNA上 | 开发新的技术以提高植物RNA成像的效率和精确性 | 植物中的RNA | 生物技术 | NA | 聚集诱导发光（AIE） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1007 | 2024-08-07 |
Promoter screening and identification for metabolic regulation in Acremonium chrysogenum
2024-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300683
PMID:38479986
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研究论文 | 本研究通过分析转录组数据，筛选并验证了27个候选启动子，用于提高Acremonium chrysogenum中头孢菌素C的生产 | 开发了一种快速筛选潜在双向启动子的方法，并利用Golden Gate方法将启动子模块与目标基因结合，成功提高了头孢菌素C的产量 | NA | 提高Acremonium chrysogenum中头孢菌素C的生产效率 | Acremonium chrysogenum中的启动子筛选与代谢调控 | 合成生物学 | NA | Golden Gate方法 | NA | 转录组数据 | 27个候选启动子 | NA | NA | NA | NA |
| 1008 | 2024-08-07 |
Tuning capsid formation dynamics in recombinant adeno-associated virus producing synthetic cell lines to enhance full particle productivity
2024-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400051
PMID:38479988
|
研究论文 | 本文开发了一种合成生物学平台，用于构建整合了关键病毒基因的细胞系，这些细胞系可以被诱导产生重组腺相关病毒（rAAV），无需质粒转染或病毒转导 | 通过调节基因组扩增和衣壳蛋白合成的动态，显著提高了全颗粒含量，同时保持了高生产力 | NA | 提高重组腺相关病毒的生产效率和全颗粒含量 | 重组腺相关病毒的生产细胞系 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1009 | 2024-08-07 |
The whack-a-mole governance challenge for AI-enabled synthetic biology: literature review and emerging frameworks
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1359768
PMID:38481570
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综述 | 本文综述了AI驱动的合成生物学带来的治理挑战，并描述了新兴的治理框架 | 提出了‘打地鼠’治理模式，以应对AI驱动合成生物学带来的不断变化的挑战 | 文章主要基于文献综述，缺乏实证研究 | 探讨如何有效治理AI驱动的合成生物学，以平衡创新与生物安全 | AI驱动的合成生物学及其治理框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1010 | 2024-08-07 |
Efficient bioproduction of poly(3-hydroxypropionate) homopolymer using engineered Escherichia coli strains
2024-Apr, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.130469
PMID:38382722
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研究论文 | 本研究开发了一种可扩展的方法，利用代谢工程改造的Escherichia coli K12 (MG1655)菌株和外部供应的3-羟基丙酸生产具有显著物理机械性能的聚(3-羟基丙酸)均聚物 | 通过合成生物学技术，优化了聚合物的合成途径，实现了前所未有的生产量，达到了9.5 g/L的摇瓶培养和80 g/L的补料分批生物反应器 | NA | 开发可持续的大规模生产聚(3-羟基丙酸)生物聚合物的方法 | 聚(3-羟基丙酸)均聚物的生产 | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | Escherichia coli K12 (MG1655)菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 1011 | 2024-08-07 |
Self-driving laboratories to autonomously navigate the protein fitness landscape
2024-Jan, Nature chemical engineering
DOI:10.1038/s44286-023-00002-4
PMID:38468718
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研究论文 | 本文介绍了用于全自动蛋白质工程的自主驾驶机器平台SAMPLE，该平台通过智能代理学习蛋白质序列-功能关系，设计新蛋白质并通过自动化机器人系统进行实验测试 | 提出了SAMPLE平台，实现了蛋白质工程的自动化和加速，提高了蛋白质设计的效率 | NA | 旨在通过自主驾驶实验室平台加速蛋白质工程，特别是提高糖苷水解酶的热稳定性 | 糖苷水解酶酶 | 蛋白质工程 | NA | 自动化机器人系统 | 智能代理 | 蛋白质序列 | 四个SAMPLE代理 | NA | NA | NA | NA |
| 1012 | 2024-08-07 |
Applications of designer phage encoding recombinant gene payloads
2024-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.09.008
PMID:37833198
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研究论文 | 本文讨论了通过基因工程将重组基因有效载荷编码到噬菌体基因组中，以在细菌宿主中表达，从而影响噬菌体与细菌相互作用的潜在结果 | 本文探讨了在噬菌体疗法中使用合成生物学和DNA测序技术的新应用，特别是在多药耐药感染的治疗方面 | 文中指出，异源基因有效载荷的识别及其在转化相关应用中对细菌或人类细胞的影响仍未得到充分探索 | 研究目的是探索和分类重组基因有效载荷在噬菌体基因工程中的潜在应用 | 研究对象包括噬菌体、细菌以及通过基因工程引入的重组基因有效载荷 | 合成生物学 | NA | DNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1013 | 2024-08-07 |
Intellectual property and funding: fueling Chinese synbio
2024-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.012
PMID:37980185
|
研究论文 | 本文探讨了中国合成生物学领域中知识产权与资金支持的相互作用及其对创新和商业化的推动作用 | 强调知识产权与资金支持在中国合成生物学发展中的关键作用 | NA | 分析中国合成生物学领域的知识产权与资金支持的现状及其政策影响 | 中国合成生物学领域的知识产权与资金支持 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1014 | 2024-08-07 |
Developing Ganoderma lucidum as a next-generation cell factory for food and nutraceuticals
2024-02, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.07.008
PMID:37659953
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综述 | 本文探讨了利用现代合成生物学工具，通过分子策略解决Ganoderma lucidum中基因调控网络和同源重组频率低的瓶颈问题，以促进其作为食品和营养补充品的高效细胞工厂的开发 | 利用现代合成生物学技术，加速精确的多基因靶向和编辑，解开G. lucidum的生物合成机制 | Ganoderma lucidum中强大的调控网络和低频率的同源重组限制了分子工具和精确遗传标记的发展 | 将Ganoderma lucidum转化为高效的细胞工厂，用于食品和营养补充品的生产 | Ganoderma lucidum的生物合成机制和分子调控策略 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1015 | 2024-08-07 |
Plant Engineering to Enable Platforms for Sustainable Bioproduction of Terpenoids
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_1
PMID:38468079
|
综述 | 本文综述了利用植物工程技术开发可持续生产萜类化合物的平台，并强调了优化已知途径、细胞内途径的区室化以及为复杂生物合成途径工程开发的遗传工具等策略。 | 本文介绍了利用植物作为可持续生产平台，通过代谢工程和合成生物学技术，提高萜类化合物的产量和生产效率。 | NA | 开发可持续的解决方案，通过工程化宿主生物中的生物合成途径来生产萜类化合物。 | 萜类化合物及其在工业中的应用，如绿色溶剂、香料和香精、营养补充品、着色剂和治疗药物。 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1016 | 2024-08-07 |
Construction of Xylose-Utilizing Cyanobacterial Chassis for Bioproduction Under Photomixotrophic Conditions
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_4
PMID:38468082
|
研究论文 | 本文通过合成生物学方法，以快速生长的蓝细菌Synechococcus elongatus UTEX 2973为例，构建了一种新的能够利用木糖的蓝细菌底盘，以增加乙酰辅酶A用于生物生产 | 本文首次开发了一种合成生物学方法，用于构建能够利用木糖的蓝细菌底盘 | NA | 开发一种新的合成生物学方法，用于构建能够利用木糖的蓝细菌底盘 | 蓝细菌Synechococcus elongatus UTEX 2973 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1017 | 2024-08-07 |
Multiplex Marker-Less Genome Integration in Pichia pastoris Using CRISPR/Cas9
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_10
PMID:38468088
|
研究论文 | 本文利用CRISPR/Cas9系统在Pichia pastoris中实现多基因无标记整合，构建细胞工厂 | 首次在Pichia pastoris中应用CRISPR/Cas9系统进行多基因整合，为C1生物转化提供平台 | NA | 开发Pichia pastoris中的合成生物学工具，特别是多基因路径的操作 | Pichia pastoris细胞工厂的构建 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1018 | 2024-08-07 |
Genome Editing, Transcriptional Regulation, and Forward Genetic Screening Using CRISPR-Cas12a Systems in Yarrowia lipolytica
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_11
PMID:38468089
|
研究论文 | 本文介绍了在工业相关的油质酵母Yarrowia lipolytica中使用CRISPR-Cas12a系统进行基因编辑、转录调控和功能基因组筛选的方法 | 开发了一套CRISPR-Cas12a载体，用于简单多重基因敲除、抑制和激活，并构建了一个全基因组范围的引导库，用于功能基因组筛选 | NA | 扩展CRISPR-Cas12a系统在工业重要宿主中的合成生物学工具 | Yarrowia lipolytica中的基因编辑、转录调控和功能基因组筛选 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a | 机器学习算法 | 基因组数据 | 全基因组范围的引导库，每个基因有八倍覆盖 | NA | NA | NA | NA |
| 1019 | 2024-08-07 |
A Machine Learning Approach for Predicting Essentiality of Metabolic Genes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_20
PMID:38468098
|
研究论文 | 本文描述了一种使用二元分类算法预测代谢基因必需性的策略 | 该方法结合了基因组规模代谢模型、有向图和机器学习，形成了一个可以在小规模敲除数据上训练的预测模型 | NA | 识别必需基因，特别是在将原料转化为有价值产品的代谢途径工程中 | 代谢基因的必需性 | 机器学习 | NA | 二元分类算法 | NA | 基因组规模代谢模型数据 | 小规模敲除数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1020 | 2024-08-07 |
Programming Juxtacrine-Based Synthetic Signaling Networks in a Cellular Potts Framework
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_17
PMID:38468095
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research paper | 本文开发了一种计算框架，使用模拟细胞系（ISCL）来设计和测试合成信号网络，以促进组织形成和形态发生 | 提出了一个包含基本可修改特征（如粘附、运动、生长和分裂）的模拟细胞系（ISCL），并能在其中快速工程化定制遗传电路以测试和改进不同的信号网络设计 | NA | 旨在重新编程高等真核细胞以促进组织形成和形态发生 | 合成生物学领域的合成发展 | synthetic biology | NA | cellular Potts modeling | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |