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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2024-08-07 |
Detection of MicroRNAs Using Synthetic Toehold Switch in Mammalian Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_16
PMID:38441769
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研究论文 | 本文设计了一种新型合成脚趾开关,用于检测CHO、HeLa、HEK 293和MDA-MB-231乳腺癌细胞中表达的外源和内源miRNAs | 首次设计和利用miRNA基的脚趾开关,特别是在真核翻译控制方面 | NA | 开发基于RNA的开关平台,用于报告细胞发展和疾病中的动态细胞机制 | miR-155和miR-21的检测 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 合成脚趾开关 | NA | RNA | CHO、HeLa、HEK 293和MDA-MB-231乳腺癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1042 | 2024-08-07 |
Advances in the Application of Single-Cell Transcriptomics in Plant Systems and Synthetic Biology
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0029
PMID:38435807
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序(scRNA-seq)在植物系统和合成生物学中的应用进展 | scRNA-seq技术能够揭示植物细胞层面上的高分辨率基因表达模式和细胞类型异质性,为植物系统设计和合成生物学提供新知识 | 目前scRNA-seq技术在植物中的应用仅限于少数物种,未来技术进步将降低成本并加速其在植物中的应用 | 探讨scRNA-seq在植物系统生物学和植物合成生物学研究中的应用,并讨论其挑战和机遇 | 植物系统和合成生物学 | 合成生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 已应用于有限数量的植物物种,包括模型植物、农作物和生物能源作物 | NA | NA | NA | NA |
| 1043 | 2024-08-07 |
Microbial production of N-acetyl-D-glucosamine (GlcNAc) for versatile applications: Biotechnological strategies for green process development
2024-Feb, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2024.109039
PMID:38277719
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综述 | 本文综述了利用微生物生产N-乙酰-D-氨基葡萄糖(GlcNAc)的生物技术策略,以及其在制药、食品、化妆品和生物燃料行业的广泛应用 | 介绍了利用代谢工程和合成生物学的新技术,如底物共利用策略、启动子工程和CRISPR干扰系统,来提高GlcNAc的产量和降低生产成本 | 需要进一步的过程优化、代谢通量优化和从培养基中高效回收GlcNAc,以实现高产品产量的目标 | 探讨微生物工程在生产重要药物中的潜在应用,并推动未来研究方向的发展 | N-乙酰-D-氨基葡萄糖(GlcNAc)的生产和应用 | 生物技术 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1044 | 2024-08-07 |
Highly-Adaptable Optothermal Nanotweezers for Trapping, Sorting, and Assembling across Diverse Nanoparticles
2024-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202309143
PMID:37944998
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研究论文 | 本文介绍了一种高度适应性的光热纳米镊子(HAONTs),通过精确调节扩散泳和热渗透流在光热响应金膜边界层中的流动,能够操纵小至亚10纳米的单个纳米粒子,并引入了一种新颖的光热环形涡旋(DSV)捕获策略,实现了细胞与纳米粒子之间的新型物理相互作用。 | 本文设计了高度适应性的光热纳米镊子(HAONTs),并引入了新颖的光热环形涡旋(DSV)捕获策略,实现了对多种纳米粒子的通用和生物相容性操纵。 | NA | 开发一种通用且生物相容的工具,用于操纵不同大小、电荷和材料的纳米粒子。 | 纳米粒子的捕获、分类和组装。 | 纳米光子学 | NA | 光热响应金膜 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1045 | 2024-08-07 |
Structure-function analysis of the cyclic β-1,2-glucan synthase from Agrobacterium tumefaciens
2024-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45415-8
PMID:38418509
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研究论文 | 研究了来自Agrobacterium tumefaciens的环状β-1,2-葡聚糖合酶(Cgs)的结构与功能 | 揭示了CβG合成的独特机制,使用酪氨酸连接的低聚糖中间体在葡聚糖链的聚合和加工循环中 | NA | 阐明CβG合成的机制并探索对抗依赖多糖毒力因子的病原体的可能性 | 环状β-1,2-葡聚糖合酶(Cgs)及其合成机制 | 微生物学 | NA | 冷冻电子显微镜(cryo-EM) | NA | 蛋白质结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1046 | 2024-08-07 |
Enzymatic Degradation of Deoxynivalenol with the Engineered Detoxification Enzyme Fhb7
2024-Feb-26, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.3c00696
PMID:38425922
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研究论文 | 本文报道了Fhb7酶的首次结构解析及其独特的催化机制,并通过工程化改造提高了其稳定性和DON降解性能。 | 首次解析了Fhb7酶的结构,并揭示了其在谷胱甘肽-S转移酶家族中的独特催化机制。通过工程化改造,显著提高了Fhb7酶的稳定性和DON降解性能。 | Fhb7酶的稳定性较差,且其催化机制的复杂性限制了其实际应用。 | 研究Fhb7酶的结构和催化机制,并通过工程化改造提高其在DON降解中的应用潜力。 | Fhb7酶及其在降解脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)中的应用。 | 生物技术 | NA | 谷胱甘肽-S转移酶(GST) | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1047 | 2024-08-07 |
Postamplifying Cas12a Activation through Hybridization Chain Reaction-Triggered Fluorescent Nanocluster Formation for Ultrasensitive Nucleic Acid Detection
2024-Feb-28, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c18732
PMID:38353672
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研究论文 | 本文开发了一种无需标记的系统,通过整合杂交链反应(HCR)和DNA-铜纳米簇(DNA-CuNCs)来后放大Cas12a的激活,实现超灵敏的核酸检测 | 首次利用HCR操纵DNA-CuNC的形成,以实现高度灵敏和成本效益的Cas12a报告 | NA | 开发一种新的生物传感平台,用于提高Cas12a激活的检测灵敏度和成本效益 | Cas12a激活的检测和猴痘病毒(MPXV)的检测 | 生物传感 | NA | CRISPR/Cas12a, 杂交链反应(HCR), DNA-铜纳米簇(DNA-CuNCs) | NA | DNA | 检测极限为5 fM的DNA,以及在人血清中检测到1份猴痘病毒(MPXV)质粒 | NA | NA | NA | NA |
| 1048 | 2024-08-07 |
Engineering status of protein for improving microbial cell factories
2024 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108282
PMID:37939975
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综述 | 本文综述了通过工程化蛋白质状态来提高微生物细胞工厂效率的策略 | 总结了代谢蛋白质状态的工程化策略,包括蛋白质工程提高微生物催化效率、蛋白质修饰调节微生物代谢能力及蛋白质组装增强微生物合成能力 | 未提及具体限制 | 探讨通过工程化蛋白质状态来提高微生物细胞工厂的效率 | 微生物细胞工厂中的蛋白质状态 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1049 | 2024-08-07 |
Artificial carbon assimilation: From unnatural reactions and pathways to synthetic autotrophic systems
2024 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108294
PMID:38013126
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综述 | 本文综述了人工碳同化途径设计和人工自养菌株构建的代表性工作,并提出了基于现有研究结果和模式的可行设计方案 | 介绍了人工碳同化途径从理论到实践的进展,并提出了新的设计方案 | 仍需探索途径多样性、操作效率和宿主适应性 | 推动人工自养的发展和应用 | 人工碳同化途径和人工自养菌株 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1050 | 2024-08-07 |
Utilization of gene manipulation system for advancing the biotechnological potential of halophiles: A review
2024 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108302
PMID:38101552
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综述 | 本文综述了利用基因操作技术提升嗜盐菌在工业生物技术中的应用潜力 | 介绍了当前基因操作技术在嗜盐菌工业应用中的积极影响,并探讨了其在合成生物学等创新研究领域的前景 | 文中指出,有效的基因操作系统和基因编辑工具对于加速嗜盐菌工程化过程至关重要 | 探讨嗜盐菌基因操作工具包的扩展如何促进生物技术的发展及其在生产改进中的应用 | 嗜盐菌及其在工业生物技术中的应用 | 工业生物技术 | NA | 基因操作技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1051 | 2024-08-07 |
Strategies for the biological production of ectoine by using different chassis strains
2024 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2023.108306
PMID:38157997
|
综述 | 本文综述了利用不同底盘菌株进行ectoine生物生产的策略 | 介绍了ectoine合成的代谢途径,并全面评估了野生型和基因改造菌株在ectoine生产中的应用 | NA | 提高ectoine生产的效率和简化生产过程 | ectoine的生物生产 | 合成生物学 | NA | 发酵工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1052 | 2024-08-07 |
Synthetic biology enables mushrooms to meet emerging sustainable challenges
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1337398
PMID:38414763
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研究论文 | 本文综述了合成生物学在蘑菇培育和发酵中的应用,旨在解决日益增长的可持续性挑战 | 利用合成生物学策略,蘑菇在循环经济、人类健康、制药以及新兴领域如素食肉类、蘑菇基材料和污染治理中的应用潜力 | NA | 探讨合成生物学在蘑菇技术中的应用,强调其在未来的重要性和必要性 | 蘑菇及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1053 | 2024-08-07 |
Engineering and transcriptome study of Saccharomyces cerevisiae to produce ginsenoside compound K by glycerol
2024-Feb, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300383
PMID:38403397
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法改造酵母菌Saccharomyces cerevisiae,以甘油为碳源生产人参皂苷化合物K | 工程菌株能够利用甘油作为唯一碳源,显著提高人参皂苷化合物K的产量,达到433.1 ± 8.3 mg/L,是葡萄糖培养基中的2.4倍 | NA | 探索甘油作为碳源在酵母菌中生产人参皂苷化合物K的效果 | 酵母菌Saccharomyces cerevisiae | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1054 | 2024-08-07 |
[Research progress on development and utilization of minor ginsenosides]
2024-Jan, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了次级人参皂苷的结构类型、药理活性、获取来源及转化途径,并提出了现有制备方法中存在的问题,探讨了未来的研究与利用前景 | 结合合成生物学方法,利用微生物作为宿主生产皂苷,为次级人参皂苷的工业化提供了新的可能性 | 目前研究主要集中在转化制备、工艺优化和药理活性,工业分析方面存在不足 | 总结次级人参皂苷的相关研究,提出存在的问题,并探讨未来的研究与利用前景,为提升其基础研究和推动工业化提供理论依据 | 次级人参皂苷的结构类型、药理活性、获取来源及转化途径 | NA | NA | 合成代谢工程方法 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1055 | 2024-08-07 |
Mesoplasma florum: a near-minimal model organism for systems and synthetic biology
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1346707
PMID:38404664
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研究论文 | 本文探讨了Mesoplasma florum作为一种近似最小模型生物在系统和合成生物学中的应用 | 首次发表Mesoplasma florum的基因组,并开发了多种分子工具和代谢模型,为未来的基因组工程和合成细胞设计提供了基础 | 由于技术限制和缺乏专用分子工具,该细菌的许多生物学特性长期未被研究 | 探索Mesoplasma florum在系统和合成生物学中的应用潜力 | Mesoplasma florum的基因组、调控元件、质粒开发、比较基因组学、转座子诱变等 | 系统和合成生物学 | NA | 基因组克隆、基因组移植、代谢模型开发 | NA | 基因组数据 | 单个细菌物种Mesoplasma florum | NA | NA | NA | NA |
| 1056 | 2024-08-07 |
Advancements in heparosan production through metabolic engineering and improved fermentation
2024-May-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2024.121881
PMID:38388039
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综述 | 本文综述了通过代谢工程和发酵优化提高肝素生产的研究进展 | 利用合成生物学技术,通过微生物工程生产肝素,提供了一种成本效益高且可扩展的替代传统从动物组织中提取的方法 | 讨论了未来的研究方向和领域内仍面临的挑战 | 分析微生物肝素生物合成中的关键模块和最新的代谢工程策略,以增强生产、调节分子量分布并优化肝素的发酵规模 | 肝素及其前体肝聚糖的生产 | NA | 炎症、癌症、微生物和病毒性疾病(包括COVID-19) | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1057 | 2024-08-07 |
Application of extremophile cell factories in industrial biotechnology
2024-Apr, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2024.110407
PMID:38341913
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综述 | 本文综述了极端微生物的鉴定与筛选技术及其在工业生物技术中的应用 | 基于工程化极端微生物的下一代工业生物技术有望简化生物制造过程,建立开放、非灭菌的连续发酵生产系统,并利用低成本基质 | NA | 总结极端微生物的鉴定与筛选技术,并探讨其在工业生物技术中的应用前景 | 极端微生物及其在工业生物技术中的应用 | 工业生物技术 | NA | 分子生物学、合成生物学和发酵技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1058 | 2024-08-07 |
DNA-Diffusion: Leveraging Generative Models for Controlling Chromatin Accessibility and Gene Expression via Synthetic Regulatory Elements
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.01.578352
PMID:38352499
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研究论文 | 本文利用扩散模型设计特定上下文的DNA调控序列,以实现精确的基因表达控制 | 本文首次利用扩散模型设计特定细胞类型的合成200 bp调控元件,这些元件具有精确调节基因表达的潜力 | NA | 开发一种新的方法来系统地修改和优化调控元件,以实现精确的基因表达控制 | DNA调控序列及其在不同细胞类型中的基因表达调控能力 | 合成生物学 | NA | 扩散模型 | 扩散模型 | DNA序列 | 合成200 bp调控元件 | NA | NA | NA | NA |
| 1059 | 2024-08-07 |
Nannochloropsis as an Emerging Algal Chassis for Light-Driven Synthesis of Lipids and High-Value Products
2024-Jan-24, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md22020054
PMID:38393025
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综述 | 本文综述了Nannochloropsis作为新兴微藻底盘在光驱动合成脂质和高价值产品方面的应用现状和潜力 | 介绍了基因工具和合成生物学领域的最新进展,将Nannochloropsis转化为强大的生物工厂 | NA | 探讨Nannochloropsis在生物燃料和高价值产品生产中的应用潜力 | Nannochloropsis的培养、利用及其代谢途径 | 生物技术 | NA | 基因操作技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1060 | 2024-08-07 |
Expression and Purification of Cp3GT: Structural Analysis and Modeling of a Key Plant Flavonol-3-O Glucosyltransferase from Citrus paradisi
2024-Feb-07, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech13010004
PMID:38390907
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研究论文 | 本研究聚焦于植物黄酮醇特异性3-O葡萄糖基转移酶(Cp3GT)的规模化表达、纯化及其结构分析与建模 | 通过优化培养条件和纯化过程,成功解决了重组蛋白生产中的蛋白酶降解问题,并实现了Cp3GT的高纯度制备 | NA | 研究Cp3GT的结构和功能机制,为合成生物学和酶工程在制药应用中的发展提供支持 | 植物黄酮醇特异性3-O葡萄糖基转移酶(Cp3GT) | 生物技术 | NA | 亲和层析、阴离子交换层析和尺寸排阻层析 | AlphaFold2 | 蛋白质结构 | NA | NA | NA | NA | NA |