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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1041 | 2024-08-07 |
Macroalgal microbiomes unveil a valuable genetic resource for halogen metabolism
2024-Mar-07, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01740-6
PMID:38454513
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研究论文 | 本研究通过分析红藻和褐藻的微生物组,揭示了与卤素代谢相关的遗传资源 | 发现了多种与脱卤作用相关的基因,特别是具有水解功能的基因,以及一些以前未与有机卤素代谢联系的细菌群,如Caulobacterales, Geminicoccales, Granulosicoccales和Microtrichales | NA | 探索与藻类相关的原核生物群落的遗传信息如何影响有机卤化合物的命运 | 红藻和褐藻的微生物组 | 生物技术 | NA | 宏基因组学 | NA | 基因数据 | 2种红藻(Sphaerococcus coronopifolius和Asparagopsis taxiformis)和1种褐藻(Halopteris scoparia)的微生物组 |
1042 | 2024-08-07 |
Affinity-assisted covalent self-assembly of PduQ-SpyTag and Nox-SpyCatcher to construct multi-enzyme complexes on the surface of magnetic microsphere modified with chelated Ni2
2024-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.129365
PMID:38218263
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research paper | 研究了PduQ-SpyTag和Nox-SpyCatcher在磁性微球表面通过亲和力和共价键自组装形成多酶复合体的特性 | 提出了一种在磁性珠表面自组装SpyTag/SpyCatcher融合蛋白的简单有效策略,为体外快速构建固定化多酶复合体提供了新方法 | NA | 设计并构建用于体外合成生物学的固定化多酶复合体系统 | PduQ-SpyTag和Nox-SpyCatcher在磁性微球表面的自组装特性及多酶复合体的共催化特性 | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher共价结合 | NA | 磁性微球 | NA |
1043 | 2024-08-07 |
Noncanonical Streptococcus sanguinis ComCDE circuitry integrates environmental cues in transformation outcome decision
2024-Feb-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2023.09.007
PMID:37832551
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研究论文 | 本文介绍了链球菌属血链球菌中一种新的竞争-捕食协调机制,该机制通过非典型的ComCDE电路整合环境信号,影响转化结果的决策 | 发现了血链球菌中不同于其他链球菌的ComCDE电路,并揭示了其独特的竞争刺激肽(CSP)切割和出口机制 | NA | 研究血链球菌中竞争-捕食协调机制的新类型 | 血链球菌的ComCDE电路及其在环境信号整合中的作用 | 微生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1044 | 2024-08-07 |
Enhancing l-Malic Acid Production in Aspergillus niger via Natural Activation of sthA Gene Expression
2024-Mar-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.3c09321
PMID:38407053
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研究论文 | 本研究通过激活sthA基因表达,提高了Aspergillus niger中l-苹果酸的生产效率 | 利用PmfsA启动子在发酵阶段特异表达sthA基因,显著提升了l-苹果酸的生产效率并减少了副产物 | 激活sthA基因表达导致孢子形成缺陷,限制了工业应用的可行性 | 提高l-苹果酸的合成效率并减少副产物积累 | Aspergillus niger中的l-苹果酸生产 | NA | NA | 生物发酵 | NA | NA | 5 L发酵罐中的表现 |
1045 | 2024-08-07 |
A synthetic biology approach to assemble and reboot clinically relevant Pseudomonas aeruginosa tailed phages
2024-Mar-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02897-23
PMID:38294230
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研究论文 | 本研究采用合成生物学方法构建并重启针对临床相关假单胞菌的尾状噬菌体 | 开发了一种合成生物学方法,能够构建和重启自然界中无法感染特定菌株的噬菌体 | 噬菌体重启效率受噬菌体种类和细菌菌株中抗病毒防御系统的影响 | 构建临床相关的工程噬菌体,以解决抗生素耐药性问题 | 假单胞菌的尾状噬菌体 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 涉及两种噬菌体(JG024和DMS3)和两种不同的假单胞菌菌株 |
1046 | 2024-08-07 |
Bacterial host adaptation through sequence and structural variations of a single type III effector gene
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109224
PMID:38439954
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研究论文 | 本研究揭示了单一III型效应基因序列和结构变异在细菌宿主适应中的分子机制 | 发现了XopJ6效应蛋白的自然变异体,该变异体通过单个残基替换破坏了与WRKY蛋白的相互作用,从而逃避免疫感知并保留部分毒力功能 | NA | 探讨病原体致病性数量变异的分子机制 | XopJ6效应蛋白及其在宿主适应中的作用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | 基因序列 | NA |
1047 | 2024-08-07 |
Logic "AND Gate Circuit"-Based Gasdermin Protein Expressing Nanoplatform Induces Tumor-Specific Pyroptosis to Enhance Cancer Immunotherapy
2024-Mar-05, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c09405
PMID:38377037
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研究论文 | 本文设计了一种基于逻辑“与门电路”的纳米平台M-CNP/Mn@pPHS,用于诱导肿瘤特异性焦亡,增强癌症免疫治疗 | 通过合成生物学策略构建了肿瘤特异性焦亡诱导纳米平台,利用逻辑“与门电路”策略设计pPHS,实现肿瘤细胞中gasdermin D的特异性表达 | NA | 开发一种新的纳米平台,用于诱导肿瘤特异性焦亡,增强癌症免疫治疗效果 | 肿瘤细胞和免疫系统 | 生物技术 | 癌症 | 合成生物学 | NA | 纳米粒子 | 79.8%肿瘤消退率 |
1048 | 2024-08-07 |
Glucose 6-phosphate dehydrogenase variants increase NADPH pools for yeast isoprenoid production
2024-Mar, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13755
PMID:38124687
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研究论文 | 本研究通过改进葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)的效率来增加NADPH水平,从而提高酵母中异戊二烯类化合物的产量 | 本研究采用基因融合和理性突变的方法,提高了G6PD的活性,从而增加了NADPH的产量,进而提高了异戊二烯类化合物的产量 | NA | 提高酵母中异戊二烯类化合物的产量 | 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)及其在异戊二烯生物合成中的作用 | 合成生物学 | NA | 基因融合,理性突变 | NA | NA | NA |
1049 | 2024-08-07 |
Coiled-Coil Interaction Toolbox for Engineering Mammalian Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_3
PMID:38441756
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研究论文 | 本文介绍了用于哺乳动物细胞工程的卷曲螺旋(CC)肽设计工具箱及其在构建哺乳动物细胞中CC介导的逻辑电路的协议 | 卷曲螺旋肽作为调节蛋白质-蛋白质相互作用的独特有效工具,其结合特异性和亲和力可以被设计和控制 | NA | 开发用于合成生物学工具的卷曲螺旋肽,以调节蛋白质相互作用 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 卷曲螺旋肽设计 | NA | NA | NA |
1050 | 2024-08-07 |
Mechanistic Model-Driven Biodesign in Mammalian Synthetic Biology
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_6
PMID:38441759
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综述 | 本文综述了数学模型在哺乳动物合成生物学中的应用,包括设计优化电路和工程生物过程,预测行为,以及指导实验设计 | 讨论了基因组规模模型、机器学习和网络遗传学在扩展模型驱动哺乳动物细胞生物设计能力中的机会 | NA | 探讨数学模型在哺乳动物合成生物学中的应用及其未来发展 | 哺乳动物合成生物学中的数学模型 | 合成生物学 | NA | NA | 数学模型 | NA | NA |
1051 | 2024-08-07 |
A Directed Evolution Protocol for Engineering Minimal Transcription Factors, Based on CIS Display
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_1
PMID:38441754
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CIS展示的定向进化方法,用于从非结合蛋白池中高效筛选功能性DNA结合蛋白 | 首次使用CIS展示技术筛选DNA结合蛋白,该技术避免了传统的克隆步骤,允许更大的文库规模 | 目前仅在筛选最小转录因子Cro中进行了验证,尚未广泛应用于其他DNA结合蛋白或转录因子的工程化 | 开发一种新的定向进化方法,用于高效筛选和工程化DNA结合蛋白 | DNA结合蛋白和转录因子 | 生物技术 | NA | CIS展示技术 | NA | DNA | 从低起始频率(1 in 10)中筛选最小转录因子Cro |
1052 | 2024-08-07 |
A Computational Modeling Approach for the Design of Genetic Control Systems that Respond to Transcriptional Activity
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_8
PMID:38441761
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研究论文 | 本文介绍了一种基于预测数学模型的系统方法,用于指导基于基因活性的传感器的设计和构建 | 该方法通过敏感性分析和参数扫描的迭代,实现用户驱动的电路优化,提供了一种通用的工程化方法来制造感应和响应细胞 | NA | 设计并优化能够响应转录活性的遗传控制系统 | 遗传电路在哺乳动物细胞中的实现 | 合成生物学 | NA | 预测数学建模 | NA | NA | NA |
1053 | 2024-08-07 |
A Mammalian-Based Synthetic Biology Toolbox to Engineer Membrane-Membrane Interfaces
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_4
PMID:38441757
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研究论文 | 本文介绍了一种基于哺乳动物的合成生物学平台,用于在细胞间区域工程化功能性膜-膜界面 | 开发了一种新的合成生物学平台,利用一对二聚化蛋白在无细胞和细胞环境中工程化功能性膜-膜界面 | NA | 旨在为合成生物学家提供一个工具,用于工程化新的细胞间信号传导和通信系统 | 细胞间膜-膜界面及其在细胞过程中的功能 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | 二聚化蛋白 | NA | NA |
1054 | 2024-08-07 |
RNA Switches Using Cas Proteins
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_12
PMID:38441765
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研究论文 | 本文探讨了利用CRISPR-Cas系统中的Cas蛋白作为RNA结合蛋白(RBPs),通过在mRNA的5'UTR插入crRNA/sgRNA序列,实现基因翻译的可调控性 | 利用Cas蛋白的多样性作为触发蛋白,极大地扩展了合成生物学中的可用工具 | NA | 扩展哺乳动物细胞中可用的RNA结合蛋白数量,建立转录后调控电路 | CRISPR-Cas系统中的Cas蛋白及其在mRNA调控中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | RNA | 使用HEK293FT细胞作为示例 |
1055 | 2024-08-07 |
Detection of MicroRNAs Using Synthetic Toehold Switch in Mammalian Cells
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_16
PMID:38441769
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研究论文 | 本文设计了一种新型合成脚趾开关,用于检测CHO、HeLa、HEK 293和MDA-MB-231乳腺癌细胞中表达的外源和内源miRNAs | 首次设计和利用miRNA基的脚趾开关,特别是在真核翻译控制方面 | NA | 开发基于RNA的开关平台,用于报告细胞发展和疾病中的动态细胞机制 | miR-155和miR-21的检测 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 合成脚趾开关 | NA | RNA | CHO、HeLa、HEK 293和MDA-MB-231乳腺癌细胞 |
1056 | 2024-08-07 |
Advances in the Application of Single-Cell Transcriptomics in Plant Systems and Synthetic Biology
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0029
PMID:38435807
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序(scRNA-seq)在植物系统和合成生物学中的应用进展 | scRNA-seq技术能够揭示植物细胞层面上的高分辨率基因表达模式和细胞类型异质性,为植物系统设计和合成生物学提供新知识 | 目前scRNA-seq技术在植物中的应用仅限于少数物种,未来技术进步将降低成本并加速其在植物中的应用 | 探讨scRNA-seq在植物系统生物学和植物合成生物学研究中的应用,并讨论其挑战和机遇 | 植物系统和合成生物学 | 合成生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 已应用于有限数量的植物物种,包括模型植物、农作物和生物能源作物 |
1057 | 2024-08-07 |
Microbial production of N-acetyl-D-glucosamine (GlcNAc) for versatile applications: Biotechnological strategies for green process development
2024-Feb, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2024.109039
PMID:38277719
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综述 | 本文综述了利用微生物生产N-乙酰-D-氨基葡萄糖(GlcNAc)的生物技术策略,以及其在制药、食品、化妆品和生物燃料行业的广泛应用 | 介绍了利用代谢工程和合成生物学的新技术,如底物共利用策略、启动子工程和CRISPR干扰系统,来提高GlcNAc的产量和降低生产成本 | 需要进一步的过程优化、代谢通量优化和从培养基中高效回收GlcNAc,以实现高产品产量的目标 | 探讨微生物工程在生产重要药物中的潜在应用,并推动未来研究方向的发展 | N-乙酰-D-氨基葡萄糖(GlcNAc)的生产和应用 | 生物技术 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA |
1058 | 2024-08-07 |
Highly-Adaptable Optothermal Nanotweezers for Trapping, Sorting, and Assembling across Diverse Nanoparticles
2024-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202309143
PMID:37944998
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研究论文 | 本文介绍了一种高度适应性的光热纳米镊子(HAONTs),通过精确调节扩散泳和热渗透流在光热响应金膜边界层中的流动,能够操纵小至亚10纳米的单个纳米粒子,并引入了一种新颖的光热环形涡旋(DSV)捕获策略,实现了细胞与纳米粒子之间的新型物理相互作用。 | 本文设计了高度适应性的光热纳米镊子(HAONTs),并引入了新颖的光热环形涡旋(DSV)捕获策略,实现了对多种纳米粒子的通用和生物相容性操纵。 | NA | 开发一种通用且生物相容的工具,用于操纵不同大小、电荷和材料的纳米粒子。 | 纳米粒子的捕获、分类和组装。 | 纳米光子学 | NA | 光热响应金膜 | NA | NA | NA |
1059 | 2024-08-07 |
Structure-function analysis of the cyclic β-1,2-glucan synthase from Agrobacterium tumefaciens
2024-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45415-8
PMID:38418509
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研究论文 | 研究了来自Agrobacterium tumefaciens的环状β-1,2-葡聚糖合酶(Cgs)的结构与功能 | 揭示了CβG合成的独特机制,使用酪氨酸连接的低聚糖中间体在葡聚糖链的聚合和加工循环中 | NA | 阐明CβG合成的机制并探索对抗依赖多糖毒力因子的病原体的可能性 | 环状β-1,2-葡聚糖合酶(Cgs)及其合成机制 | 微生物学 | NA | 冷冻电子显微镜(cryo-EM) | NA | 蛋白质结构 | NA |
1060 | 2024-08-07 |
Enzymatic Degradation of Deoxynivalenol with the Engineered Detoxification Enzyme Fhb7
2024-Feb-26, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.3c00696
PMID:38425922
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研究论文 | 本文报道了Fhb7酶的首次结构解析及其独特的催化机制,并通过工程化改造提高了其稳定性和DON降解性能。 | 首次解析了Fhb7酶的结构,并揭示了其在谷胱甘肽-S转移酶家族中的独特催化机制。通过工程化改造,显著提高了Fhb7酶的稳定性和DON降解性能。 | Fhb7酶的稳定性较差,且其催化机制的复杂性限制了其实际应用。 | 研究Fhb7酶的结构和催化机制,并通过工程化改造提高其在DON降解中的应用潜力。 | Fhb7酶及其在降解脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)中的应用。 | 生物技术 | NA | 谷胱甘肽-S转移酶(GST) | NA | 结构数据 | NA |