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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1061 | 2024-08-07 |
Advanced probiotics: bioengineering and their therapeutic application
2024-Feb-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09309-8
PMID:38403783
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术改造乳酸菌(LAB)以增强其治疗应用的方法和科学原理 | 介绍了下一代设计型益生菌的创建,这些益生菌具有增强的耐受性和特殊能力,有助于深入了解益生菌生理影响的分子机制及其与宿主和微生物群的相互作用 | NA | 旨在提供关于创建改良益生菌的方法及其在治疗炎症性肠病、癌症、细菌感染和各种代谢疾病中的应用的简要概述 | 乳酸菌(LAB)及其在医学领域的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病, 癌症, 细菌感染, 代谢疾病 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
1062 | 2024-08-07 |
Engineering and transcriptome study of Saccharomyces cerevisiae to produce ginsenoside compound K by glycerol
2024-Feb, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300383
PMID:38403397
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法改造酵母菌Saccharomyces cerevisiae,以甘油为碳源生产人参皂苷化合物K | 工程菌株能够利用甘油作为唯一碳源,显著提高人参皂苷化合物K的产量,达到433.1 ± 8.3 mg/L,是葡萄糖培养基中的2.4倍 | NA | 探索甘油作为碳源在酵母菌中生产人参皂苷化合物K的效果 | 酵母菌Saccharomyces cerevisiae | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
1063 | 2024-08-07 |
[Research progress on development and utilization of minor ginsenosides]
2024-Jan, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了次级人参皂苷的结构类型、药理活性、获取来源及转化途径,并提出了现有制备方法中存在的问题,探讨了未来的研究与利用前景 | 结合合成生物学方法,利用微生物作为宿主生产皂苷,为次级人参皂苷的工业化提供了新的可能性 | 目前研究主要集中在转化制备、工艺优化和药理活性,工业分析方面存在不足 | 总结次级人参皂苷的相关研究,提出存在的问题,并探讨未来的研究与利用前景,为提升其基础研究和推动工业化提供理论依据 | 次级人参皂苷的结构类型、药理活性、获取来源及转化途径 | NA | NA | 合成代谢工程方法 | NA | 文献综述 | NA |
1064 | 2024-08-07 |
Mesoplasma florum: a near-minimal model organism for systems and synthetic biology
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1346707
PMID:38404664
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研究论文 | 本文探讨了Mesoplasma florum作为一种近似最小模型生物在系统和合成生物学中的应用 | 首次发表Mesoplasma florum的基因组,并开发了多种分子工具和代谢模型,为未来的基因组工程和合成细胞设计提供了基础 | 由于技术限制和缺乏专用分子工具,该细菌的许多生物学特性长期未被研究 | 探索Mesoplasma florum在系统和合成生物学中的应用潜力 | Mesoplasma florum的基因组、调控元件、质粒开发、比较基因组学、转座子诱变等 | 系统和合成生物学 | NA | 基因组克隆、基因组移植、代谢模型开发 | NA | 基因组数据 | 单个细菌物种Mesoplasma florum |
1065 | 2024-08-07 |
Advancements in heparosan production through metabolic engineering and improved fermentation
2024-May-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2024.121881
PMID:38388039
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综述 | 本文综述了通过代谢工程和发酵优化提高肝素生产的研究进展 | 利用合成生物学技术,通过微生物工程生产肝素,提供了一种成本效益高且可扩展的替代传统从动物组织中提取的方法 | 讨论了未来的研究方向和领域内仍面临的挑战 | 分析微生物肝素生物合成中的关键模块和最新的代谢工程策略,以增强生产、调节分子量分布并优化肝素的发酵规模 | 肝素及其前体肝聚糖的生产 | NA | 炎症、癌症、微生物和病毒性疾病(包括COVID-19) | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1066 | 2024-08-07 |
Application of extremophile cell factories in industrial biotechnology
2024-Apr, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2024.110407
PMID:38341913
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综述 | 本文综述了极端微生物的鉴定与筛选技术及其在工业生物技术中的应用 | 基于工程化极端微生物的下一代工业生物技术有望简化生物制造过程,建立开放、非灭菌的连续发酵生产系统,并利用低成本基质 | NA | 总结极端微生物的鉴定与筛选技术,并探讨其在工业生物技术中的应用前景 | 极端微生物及其在工业生物技术中的应用 | 工业生物技术 | NA | 分子生物学、合成生物学和发酵技术 | NA | NA | NA |
1067 | 2024-08-07 |
Enhancing the safety of CAR-T cell therapy: Synthetic genetic switch for spatiotemporal control
2024-Feb-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj6251
PMID:38394207
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法增强CAR-T细胞疗法的安全性和可控性,特别是在时间和空间维度上的控制方法。 | 介绍了基于遗传工程技术的合成生物学方法,用于构建人工细胞或生物体,以实现CAR-T细胞疗法的可控性。 | NA | 探讨如何通过合成生物学方法提高CAR-T细胞疗法的安全性和可控性。 | CAR-T细胞疗法的安全性和可控性。 | 生物技术 | 癌症 | 遗传工程技术 | NA | NA | NA |
1068 | 2024-08-07 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.579278
PMID:38370680
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meta-analysis | 本研究通过多队列分析炎症性肠病(IBD)患者和健康对照者的肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇(BGCs),发现与IBD显著相关的Clostridia来源的BGCs,并利用合成生物学方法鉴定了六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物。 | 首次通过多队列分析和合成生物学方法,鉴定了与IBD相关的肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇及其产物,并展示了这些小分子在动物模型中加剧肠道炎症的作用。 | NA | 探索肠道微生物组与炎症性肠病之间的分子和功能联系。 | 炎症性肠病患者和健康对照者的肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇。 | NA | 炎症性肠病 | 合成生物学 | NA | metagenomic | 5,306个肠道微生物组样本,包括2,033名IBD患者和833名健康对照者 |
1069 | 2024-08-07 |
A versatile in situ cofactor enhancing system for meeting cellular demands for engineered metabolic pathways
2024-Feb, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105598
PMID:38159859
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研究论文 | 本文介绍了一种利用木糖还原酶和乳糖(XR/lactose)系统提高大肠杆菌中糖磷酸盐池水平的方法,该池与NAD(P)H、FAD、FMN和ATP的生物合成相关 | 开发了一种新的系统XR/lactose,能够增加代谢工程细胞中辅因子的前体量,从而提高细胞的生产力 | 文章未明确指出具体的局限性 | 旨在解决代谢工程细胞中辅因子不平衡问题,提高细胞的生产力 | 研究对象包括脂肪酸醇生物合成、生物发光光产生和烷烃生物合成等不同的代谢工程细胞系统 | 合成生物学 | NA | 代谢组学分析、转录组学分析 | NA | 代谢物数据、转录数据 | 涉及三种不同的代谢工程细胞系统 |
1070 | 2024-08-07 |
DNA-Diffusion: Leveraging Generative Models for Controlling Chromatin Accessibility and Gene Expression via Synthetic Regulatory Elements
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.01.578352
PMID:38352499
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研究论文 | 本文利用扩散模型设计特定上下文的DNA调控序列,以实现精确的基因表达控制 | 本文首次利用扩散模型设计特定细胞类型的合成200 bp调控元件,这些元件具有精确调节基因表达的潜力 | NA | 开发一种新的方法来系统地修改和优化调控元件,以实现精确的基因表达控制 | DNA调控序列及其在不同细胞类型中的基因表达调控能力 | 合成生物学 | NA | 扩散模型 | 扩散模型 | DNA序列 | 合成200 bp调控元件 |
1071 | 2024-08-07 |
Nannochloropsis as an Emerging Algal Chassis for Light-Driven Synthesis of Lipids and High-Value Products
2024-Jan-24, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md22020054
PMID:38393025
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综述 | 本文综述了Nannochloropsis作为新兴微藻底盘在光驱动合成脂质和高价值产品方面的应用现状和潜力 | 介绍了基因工具和合成生物学领域的最新进展,将Nannochloropsis转化为强大的生物工厂 | NA | 探讨Nannochloropsis在生物燃料和高价值产品生产中的应用潜力 | Nannochloropsis的培养、利用及其代谢途径 | 生物技术 | NA | 基因操作技术 | NA | NA | NA |
1072 | 2024-08-07 |
Expression and Purification of Cp3GT: Structural Analysis and Modeling of a Key Plant Flavonol-3-O Glucosyltransferase from Citrus paradisi
2024-Feb-07, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech13010004
PMID:38390907
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研究论文 | 本研究聚焦于植物黄酮醇特异性3-O葡萄糖基转移酶(Cp3GT)的规模化表达、纯化及其结构分析与建模 | 通过优化培养条件和纯化过程,成功解决了重组蛋白生产中的蛋白酶降解问题,并实现了Cp3GT的高纯度制备 | NA | 研究Cp3GT的结构和功能机制,为合成生物学和酶工程在制药应用中的发展提供支持 | 植物黄酮醇特异性3-O葡萄糖基转移酶(Cp3GT) | 生物技术 | NA | 亲和层析、阴离子交换层析和尺寸排阻层析 | AlphaFold2 | 蛋白质结构 | NA |
1073 | 2024-08-07 |
The dynamic-process characterization and prediction of synthetic gene circuits by dynamic delay model
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109142
PMID:38384832
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研究论文 | 本文提出了一种动态延迟模型(DDM),用于描述和预测合成基因电路的动态过程 | 首次提供了动态确定函数的详细公式,并提出了一种通过微流控系统测量合成元件参数的方法 | NA | 旨在通过动态延迟模型提高合成基因电路预测的准确性 | 合成基因电路的动态行为及其参数测量 | 合成生物学 | NA | 微流控系统 | 动态延迟模型 | NA | 包括8个激活子和5个抑制子 |
1074 | 2024-08-07 |
A MoClo-Compatible Toolbox of ECF Sigma Factor-Based Regulatory Switches for Proteobacterial Chassis
2024, Biodesign research
DOI:10.34133/bdr.0025
PMID:38384496
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研究论文 | 本文展示了alpha变形菌作为植物相关合成生物学底盘的潜力,并识别了一组可在两种细菌宿主中使用的正交ECF基调控因子,用于创建2步延迟电路。 | 本文首次在alpha变形菌中应用ECF sigma因子作为正交调控元件,并提供了一个与Golden Gate (MoClo)克隆标准兼容的工具箱,以促进ECF基电路在不同物种中的构建。 | NA | 构建一个上下文无关且跨物种的ECF基工具箱,用于合成生物学应用。 | alpha变形菌和gamma变形菌中的ECF sigma因子调控元件。 | 合成生物学 | NA | Golden Gate (MoClo)克隆 | NA | 基因电路 | NA |
1075 | 2024-08-07 |
A non-equilibrium dissipation system with tunable molecular fuel flux
2024-Feb-22, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d3nr06136a
PMID:38334944
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研究论文 | 本文报道了一种基于动态DNA纳米技术的仿生耗散系统,该系统具有可调节的分子燃料通量 | 通过调节链置换和酶反应速率,控制燃料通量并进一步调节非平衡瞬态状态的强度,实现了对金纳米粒子动态组装和解组的调控 | NA | 展示一种具有可调节分子燃料通量的耗散系统,并探讨其在生物仿生学、合成生物学、智能材料、生物传感及人工细胞等领域的应用潜力 | 仿生耗散系统及其在金纳米粒子组装和解组中的应用 | 合成生物学 | NA | 动态DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
1076 | 2024-08-07 |
Efficient assembly of a synthetic attenuated SARS-CoV-2 genome in Saccharomyces cerevisiae using multi-copy yeast vectors
2024, Journal of genetics
IF:1.4Q4
PMID:38379228
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研究论文 | 本文研究了在多拷贝酵母载体中高效组装合成减毒SARS-CoV-2基因组的方法 | 首次尝试在多拷贝载体中进行大型多片段组装,并开发了一套工具包,使研究人员能够在单拷贝和多拷贝载体之间无缝过渡 | NA | 评估在单拷贝和多拷贝载体系统中组装28 kb减毒SARS-CoV-2基因组的效率 | SARS-CoV-2减毒基因组的组装 | 合成生物学 | NA | 同源重组 | NA | DNA | 10个片段 |
1077 | 2024-08-07 |
All-in-one IQ toggle switches with high versatilities for fine-tuning of transgene expression in mammalian cells and tissues
2024-Mar-14, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2024.101202
PMID:38374964
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研究论文 | 本文介绍了一种新型转基因开关SIQ,该开关将所有基因切换元素集成到一个单一载体中,具有高效率和避免转基因泄漏的特点 | SIQ开关具有高效率和避免转基因泄漏的特点,并且可以通过单一构建体进行瞬时转染、建立稳定细胞系以及同时生产用于细胞和哺乳动物组织转导的腺病毒 | NA | 开发一种新型的转基因开关,用于基因和细胞基础的生物学研究和精准医学 | 转基因表达在哺乳动物细胞和组织中的精细调控 | 基因工程 | NA | 转基因技术 | NA | NA | NA |
1078 | 2024-08-07 |
Strategies on biosynthesis and production of bioactive compounds in medicinal plants
2024-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2023.01.007
PMID:38375043
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综述 | 本文总结了药用植物中天然产物生物合成和生产的策略与方法 | 介绍了基于多种“OMICS”技术的遗传工程、植物细胞培养工程、代谢工程和合成生物学在药用植物天然产物生物合成中的应用 | NA | 促进药用植物的保护和可持续利用 | 药用植物中的天然产物 | NA | NA | 遗传工程、植物细胞培养工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
1079 | 2024-08-07 |
Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in Escherichia coli
2024-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28628
PMID:38116710
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研究论文 | 本文展示了通过使用蓝光响应的EL222和绿/红光响应的CcaSR在Escherichia coli中通过多色光照控制糖酵解途径的通量比 | 利用多色光调控技术,实现了对三种糖酵解途径(EMP、PP和ED)通量比的具体控制 | NA | 探索通过光遗传学技术控制代谢通量分布的方法 | Escherichia coli中的糖酵解途径 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
1080 | 2024-08-07 |
Precise integration of large DNA sequences in plant genomes using PrimeRoot editors
2024-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01769-w
PMID:37095350
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PrimeRoot的基因编辑方法,用于在植物基因组中精确插入大型DNA片段 | PrimeRoot编辑器采用了优化的引导RNA设计、增强的植物编辑器和先进的重组酶,能够实现高达11.1千碱基的精确DNA插入 | NA | 开发一种技术,用于在植物基因组中精确插入大型DNA片段,以促进农业特性和信号及代谢途径的引入 | 植物基因组和基因调控元件 | 基因编辑 | NA | PrimeRoot编辑器 | NA | DNA序列 | 在Kitaake水稻中进行了基因盒的整合,获得了含有预期插入的编辑植物,效率为6.3% |