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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1081 | 2024-08-07 |
Artificial structural proteins: Synthesis, assembly and material applications
2024-Mar, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107162
PMID:38308999
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综述 | 本文综述了仿生结构蛋白的设计、生产及其化学修饰方法,以及其在多尺度组装中的应用 | 介绍了通过模块化蛋白质工程、多肽修饰和合成生物学开发的新型仿生结构蛋白 | 定制化结构蛋白及其组装的开发仍面临挑战,如生物合成的固有限制和复杂宏观组装的模仿难度 | 探讨仿生结构蛋白组装的功能定制和当前应用,并展望未来研究如何揭示序列和构象中的机械性能编码 | 仿生结构蛋白及其组装 | NA | NA | 模块化蛋白质工程、多肽修饰、合成生物学 | NA | NA | NA |
1082 | 2024-08-07 |
A genetic toolbox to empower Paracoccus pantotrophus DSM 2944 as a metabolically versatile SynBio chassis
2024-Feb-15, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02325-0
PMID:38360576
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研究论文 | 本研究旨在将Paracoccus pantotrophus DSM 2944转化为高效的合成生物学底盘,并开发了一套遗传工具箱以实现基因编辑和多种应用的可能性 | 成功开发了一套遗传工具箱,包括抗生素抗性分析、复制起点选择、基因转移方法评估、基因删除和整合技术,以及适应性实验室进化,以增强底盘的代谢多样性和应用潜力 | NA | 将Paracoccus pantotrophus DSM 2944发展为高效的合成生物学底盘 | Paracoccus pantotrophus DSM 2944的遗传改造和应用潜力 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 基因组数据 | 单个菌株Paracoccus pantotrophus DSM 2944 |
1083 | 2024-08-07 |
Cytokine signaling in chimeric antigen receptor T-cell therapy
2024-Feb-14, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad033
PMID:37591521
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综述 | 本文综述了通过基因工程调节细胞因子信号以增强嵌合抗原受体T细胞(CAR-T细胞)治疗效果的合成生物学方法 | 提出了通过基因工程调节CAR-T细胞中的细胞因子信号,包括外源表达细胞因子和细胞因子受体,以及通过转录和表观遗传修饰增强自分泌IL-2信号 | 文章未明确提及具体限制 | 旨在探讨如何通过调节细胞因子信号来增强CAR-T细胞的治疗效果并减轻相关毒性 | CAR-T细胞及其在治疗中的应用 | 免疫疗法 | 血液恶性肿瘤 | 基因工程 | NA | NA | NA |
1084 | 2024-08-07 |
Choreographing root architecture and rhizosphere interactions through synthetic biology
2024-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45272-5
PMID:38355570
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学技术调控植物根系结构及其与根际微生物相互作用,以应对气候变化对全球粮食安全和生物能源的威胁 | 利用合成遗传电路技术控制植物根系结构和功能及其相关微生物群落,为培育适应气候变化的作物提供新策略 | NA | 通过合成生物学技术改善植物根系及其与根际微生物的相互作用,以增强作物对气候变化的适应性 | 植物根系结构、根系分泌物及根表微生物活性 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路 | NA | NA | NA |
1085 | 2024-08-07 |
Use of Cas9 Targeting and Red Recombination for Designer Phage Engineering
2024-Jan, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.1007/s12275-024-00107-2
PMID:38300409
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研究论文 | 本文报道了一种直接的基因组工程方法,用于在模型细菌病原体铜绿假单胞菌中高效获得工程噬菌体 | 利用Streptococcus pyogenes Cas9和λRed重组系统开发了一种新的设计噬菌体工程方法 | NA | 开发一种高效的基因组工程方法,用于创建设计噬菌体 | 铜绿假单胞菌中的工程噬菌体 | 合成生物学 | NA | Cas9靶向和Red重组 | NA | 基因组数据 | 使用了铜绿假单胞菌PAO1菌株和温和噬菌体MP29 |
1086 | 2024-08-07 |
An open-source, 3D printed inkjet DNA synthesizer
2024-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53944-x
PMID:38355610
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研究论文 | 本文介绍了一种开源的3D打印喷墨DNA合成器(OpenIDS),该设备利用3D打印、Arduino和Raspberry Pi技术,实现了高密度寡核苷酸的合成,具有易于构建、快速部署和灵活扩展的特点。 | OpenIDS采用开源设计和3D打印技术,降低了生产成本,并允许用户根据研究需求自由修改结构和添加打印头。 | NA | 开发一种成本低廉、易于构建和操作的DNA合成设备,以支持生物学领域的研究。 | 开源喷墨DNA合成器的设计、构建和性能验证。 | 合成生物学 | NA | 3D打印, Arduino, Raspberry Pi | NA | 寡核苷酸 | 在15×25毫米的硅片上合成了144个点的寡核苷酸 |
1087 | 2024-08-07 |
Synthetic biology for combating leishmaniasis
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1338749
PMID:38362504
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research paper | 本文综述了合成生物学在开发针对利什曼病的疫苗、诊断工具和新疗法方面的最新进展 | 合成生物学作为一个快速发展的跨学科领域,为对抗利什曼病提供了新的有效策略 | NA | 探讨合成生物学在治疗利什曼病中的应用 | 利什曼病的疫苗、诊断工具和新疗法 | NA | neglected tropical disease | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1088 | 2024-08-07 |
Liquid-Liquid phase separation in bacteria
2024-Apr, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127627
PMID:38262205
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综述 | 本文综述了液体-液体相分离(LLPS)在细菌中的分子机制及其在合成生物学中的应用前景 | 发现细菌中的无膜细胞器通过液体-液体相分离(LLPS)机制进行组装,并在合成生物学中具有潜在应用 | NA | 探讨LLPS在细菌中的分子机制及其在合成生物学中的应用 | 细菌中的无膜细胞器及LLPS机制 | NA | NA | 液体-液体相分离(LLPS) | NA | NA | NA |
1089 | 2024-08-07 |
A robust yeast chassis: comprehensive characterization of a fast-growing Saccharomyces cerevisiae
2024-Feb-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03196-23
PMID:38214535
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研究论文 | 本研究全面描述了一种新型快速生长酵母菌株XP的特性,并通过基因组、转录组和代谢组分析揭示了其快速生长的机制 | 开发了一种遗传可塑性强的快速生长酵母菌株XP,并构建了用于遗传操作的工具箱,用于高效生产l-乳酸 | NA | 探索和优化用于合成生物学的稳健底盘 | 新型快速生长酵母菌株XP及其遗传操作工具箱 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、转录组分析、代谢组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | 一种新型酵母菌株XP |
1090 | 2024-08-07 |
Protein-Rich Rafts in Hybrid Polymer/Lipid Giant Unilamellar Vesicles
2024-Feb-12, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.3c00972
PMID:38190609
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研究论文 | 本文介绍了在混合聚合物/脂质巨型单层囊泡(GUVs)中共同重组质子泵氧化酶和质子消耗ATP合酶的方法 | 本文提出了一种新的重组方法,通过融合/电形成技术,允许定制重组协议和控制囊泡大小,并提供了蛋白质标记的合成机制,模拟自然界中的相分离和蛋白质隔离 | 目前该方法主要限于天然脂质,对复杂和敏感的膜蛋白的同时插入仍具有实验挑战性 | 研究脂质筏在细胞功能中的作用,并开发一种合成替代方法来模拟细胞行为 | 质子泵氧化酶和质子消耗ATP合酶在混合聚合物/脂质巨型单层囊泡中的重组 | NA | NA | 融合/电形成技术 | NA | NA | NA |
1091 | 2024-08-07 |
De novo design of modular protein hydrogels with programmable intra- and extracellular viscoelasticity
2024-Feb-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2309457121
PMID:38289949
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研究论文 | 本文利用计算设计方法,研究了蛋白质水凝胶的宏观粘弹性与其分子参数之间的关系 | 通过计算设计异二聚体可逆交联同寡聚体组件,实现了水凝胶在静止和低剪切下呈现流体特性,在高频率下呈现固体特性的独特行为 | NA | 探究蛋白质水凝胶的宏观粘弹性与其分子参数之间的关系 | 蛋白质水凝胶的分子参数及其宏观粘弹性 | 生物医学工程 | NA | 计算设计 | NA | 蛋白质水凝胶 | 涉及2、5、24或120个蛋白质组件的同寡聚体 |
1092 | 2024-08-07 |
Enhancing circuit stability under growth feedback with supplementary repressive regulation
2024-Feb-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1233
PMID:38164993
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research paper | 本文提出了一种通过在生长敏感的双稳态电路中加入抑制边来增强电路稳定性的策略 | 通过模拟和体外实验,展示了这种额外的抑制节点如何稳定蛋白质水平并增强双稳态电路对生长反馈的鲁棒性 | NA | 实现电路性能的稳健性,稳定和隔离电路行为以抵抗生长变化 | 生长敏感的双稳态电路及其在生长反馈下的稳定性 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
1093 | 2024-08-07 |
Efficient natural plasmid transformation of Vibrio natriegens enables zero-capital molecular biology
2024-Feb, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgad444
PMID:38352175
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研究论文 | 本文介绍了一种高效的自然转化方法,用于在Vibrio natriegens中进行质粒转化,无需额外设备,实现了零成本分子生物学操作 | 开发了一种新的最小化竞争媒体(MCM),使用乙酸盐作为能源,使得细胞在同一媒体中完成创建、转化和恢复,无需更换或添加新鲜媒体 | NA | 探索Vibrio natriegens作为低成本和高可扩展性合成生物学底盘的潜力 | Vibrio natriegens的自然转化能力及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 自然转化 | NA | DNA | 10 cfu/μg |
1094 | 2024-08-07 |
Molecular aspects of regeneration in insects
2024-Mar, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.12.011
PMID:38160963
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研究论文 | 本文探讨了昆虫再生过程中的分子机制,包括信号分子和表观遗传调控的作用 | 本文强调了表观遗传调控在再生过程中的关键作用,并探讨了其在再生医学和合成生物学领域的潜在应用 | NA | 探索和回顾再生分子基础,以促进再生医学的发展 | 昆虫的再生能力及其分子机制 | 再生医学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1095 | 2024-08-07 |
Minimizing endogenous cryptic plasmids to construct antibiotic-free expression systems for Escherichia coli Nissle 1917
2024-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.01.006
PMID:38348398
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研究论文 | 本研究通过工程化改造内源隐蔽性质粒pMUT1和pMUT2,构建了无需抗生素的表达系统,用于Nissle 1917大肠杆菌 | 本研究创新性地移除了非必需元素,并构建了合成启动子,实现了无需抗生素的表达系统 | NA | 解决Nissle 1917大肠杆菌依赖抗生素维持质粒基因的问题 | Nissle 1917大肠杆菌及其内源隐蔽性质粒pMUT1和pMUT2 | 合成生物学 | NA | 质粒工程化改造 | NA | NA | NA |
1096 | 2024-08-07 |
Transcriptomic and physiological analysis of the response of Spirodela polyrrhiza to sodium nitroprusside
2024-Feb-08, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-024-04766-6
PMID:38331719
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研究论文 | 研究了Spirodela polyrrhiza对硝普钠(SNP)的转录组和生理反应 | 揭示了SNP处理后S. polyrrhiza中代谢通量重新定向至淀粉合成和黄酮类化合物合成途径的机制 | NA | 探究SNP对S. polyrrhiza生长和代谢通量的影响及其分子机制 | Spirodela polyrrhiza对硝普钠的反应 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 2776个差异表达基因(1425个上调和1351个下调) |
1097 | 2024-08-07 |
Directed Evolution of 4-Hydroxyphenylpyruvate Biosensors Based on a Dual Selection System
2024-Jan-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25031533
PMID:38338812
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研究论文 | 本研究利用ADP1转录因子PobR开发了一种生物传感器,该传感器在结合其天然配体4-羟基苯甲酸(4HB)时激活P启动子。为了筛选对4-羟基苯丙酮酸(HPP)有反应的PobR突变体,我们开发了一种双重选择系统。 | 通过定向进化PobR库,我们获得了一种变体,其对4-羟基苯丙酮酸的反应性比原始PobR高5.1倍。 | NA | 开发一种有效的双重选择系统,用于生物传感器的定向进化。 | ADP1转录因子PobR及其对4-羟基苯甲酸和4-羟基苯丙酮酸的反应性。 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA |
1098 | 2024-08-07 |
Identification and Validation of Magnolol Biosynthesis Genes in Magnolia officinalis
2024-Jan-25, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29030587
PMID:38338333
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研究论文 | 本研究通过整合20个转录组数据,识别并验证了与厚朴酚生物合成相关的关键基因,特别是通过功能分析和体外实验确认了MoLAC14酶在厚朴酚合成中的重要作用,并通过突变提高了其热稳定性。 | 首次揭示了从查维醇到厚朴酚的一步转化过程,并通过突变提高了关键酶MoLAC14的热稳定性,显著提升了厚朴酚的产量。 | NA | 阐明厚朴酚的植物生物合成途径,并通过合成生物学方法优化其生产。 | 厚朴酚的生物合成基因及其关键酶MoLAC14。 | 合成生物学 | NA | 转录组分析,基因组信息整合,体外实验 | NA | 转录组数据 | 20个来自不同部位的转录组样本 |
1099 | 2024-08-07 |
Red blood cells in biology and translational medicine: natural vehicle inspires new biomedical applications
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.87425
PMID:38164142
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综述 | 本文综述了红细胞的组成、老化机制及其在药物输送和免疫治疗中的应用前景 | 利用红细胞的特性,如长循环时间,开发了通用红细胞、药物输送系统和细胞疗法 | NA | 探讨红细胞在生物学和转化医学中的新应用 | 红细胞及其在药物输送和免疫治疗中的应用 | 生物技术 | NA | 纳米生物技术和合成生物学 | NA | NA | NA |
1100 | 2024-08-07 |
Gut microbiota and its therapeutic implications in tumor microenvironment interactions
2024, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2024.1287077
PMID:38322318
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综述 | 本文综述了肠道微生物群在人类癌症中的作用及其与肿瘤微环境的相互作用,并探讨了其在癌症治疗中的潜在应用 | 本文总结了粪便微生物群移植、饮食调整和合成生物学等基于肠道微生物群的医疗技术在癌症治疗中的应用 | 目前针对肿瘤微环境及其特定成分的治疗临床疗效仍不足 | 探讨肠道微生物群与肿瘤微环境的相互作用及其在癌症治疗中的潜在应用 | 肠道微生物群及其与肿瘤微环境的相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |