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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1101 | 2024-08-07 |
An orthogonalized PYR1-based CID module with reprogrammable ligand-binding specificity
2024-Jan, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01447-7
PMID:37872402
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研究论文 | 本文设计了一种基于PYR1的正交CID模块,具有可重编程的配体结合特异性,用于植物和真核生物合成生物学中的多通道CID系统。 | 本文设计的正交模块通过X射线晶体学、生化和体内分析证实其正交性,并能创建具有纳摩尔敏感性的PYR1*/HAB1*系统。 | NA | 扩展PYR1系统的功能,实现可重编程的配体结合特异性。 | 植物中的化学诱导二聚化(CID)模块,包括PYR1受体和HAB1磷酸酶。 | 合成生物学 | NA | X射线晶体学 | NA | 生物化学数据 | 在拟南芥和酿酒酵母中进行了实验 |
1102 | 2024-08-07 |
Identification of acidic stress-responsive genes and acid tolerance engineering in Synechococcus elongatus PCC 7942
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12984-5
PMID:38204133
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研究论文 | 本研究通过RNA测序的转录组分析,在模式蓝细菌Synechococcus elongatus PCC 7942中鉴定了长期酸性胁迫和酸性冲击处理下的差异表达基因,并通过基因敲除和表型分析验证了这些基因在酸耐受性中的作用。 | 成功鉴定了六个与酸性胁迫响应相关的基因,并通过单独过表达chlL和chlN基因成功提高了S. elongatus PCC 7942的酸耐受性。 | NA | 研究蓝细菌Synechococcus elongatus PCC 7942的酸耐受性机制,以提高其作为光合底盘的生产力。 | 蓝细菌Synechococcus elongatus PCC 7942中的酸性胁迫响应基因。 | 合成生物学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
1103 | 2024-08-07 |
Nucleoside modification-based flexizymes with versatile activity for tRNA aminoacylation
2024-Feb-06, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d3cc05673b
PMID:38230513
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研究论文 | 本文介绍了一种基于核苷酸修饰的柔性酶(flexizyme)策略,用于制备具有独特和多样化活性的tRNA氨基酸化酶变体 | 该策略通过2'-OMe、2'-F和2'-MOE修饰,实现了对tRNA广泛的底物充电能力 | NA | 探索基因密码重编程的新方法 | 柔性酶及其在tRNA氨基酸化中的应用 | 合成生物学 | NA | 核苷酸修饰 | NA | NA | NA |
1104 | 2024-08-07 |
Glycosylation of cellulase: a novel strategy for improving cellulase
2024-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2022.2144117
PMID:36592990
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研究论文 | 本文讨论了糖基化在纤维素酶的特性和功能中的潜在作用 | 提出了一种通过控制糖基化途径来合理调控纤维素酶糖基化的新策略 | NA | 探讨糖基化对纤维素酶特性和功能的影响,并探索其在合成生物学中的应用 | 纤维素酶的糖基化 | 生物技术 | NA | 糖基化工程 | NA | 蛋白质 | NA |
1105 | 2024-08-07 |
Engineering extracellular electron transfer pathways of electroactive microorganisms by synthetic biology for energy and chemicals production
2024-Feb-05, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d3cs00537b
PMID:38117181
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略改造电活性微生物的外部电子传递途径,以提高生物电化学系统中能源和化学品的生产效率 | 介绍了多种合成生物学策略,如基因编辑工具的进步、代谢途径的编程和生物电子电路的重构,以增强微生物的电子传递能力 | NA | 探讨如何通过合成生物学方法提高生物电化学系统中电活性微生物的电子传递速率,从而促进能源和化学品的可持续生产 | 电活性微生物及其在生物电化学系统中的应用 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1106 | 2024-08-07 |
Engineering Clinically Relevant Probiotics with Switchable "Nano-Promoter" and "Nano-Effector" for Precision Tumor Therapy
2024-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202304257
PMID:37788635
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研究论文 | 本文首次采用pH依赖性的类过氧化物酶人工酶作为可诱导的“纳米启动子”和“纳米效应器”,用于工程化临床相关的益生菌,实现益生菌疗法的可切换控制 | 本文创新性地利用pH依赖性的人工酶作为纳米启动子和纳米效应器,使益生菌能够动态响应肿瘤微环境的特性,提高治疗精度和效果 | 目前研究主要集中在体外和动物模型中,尚未在人体试验中验证其疗效和安全性 | 开发一种新型的益生菌疗法,通过可切换控制的纳米启动子和纳米效应器,提高肿瘤治疗的精确性和疗效 | 益生菌及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 生物工程 | 结直肠癌 | 人工酶 | NA | NA | NA |
1107 | 2024-08-07 |
Multienzymatic Cascades and Nanomaterial Scaffolding-A Potential Way Forward for the Efficient Biosynthesis of Novel Chemical Products
2024-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202309963
PMID:37944537
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research paper | 本文探讨了合成生物学在多酶级联反应和纳米材料支架方面的新进展,旨在提高新型化学产品的生物合成效率。 | 文章介绍了利用多酶级联反应和纳米材料支架技术,扩展酶访问的化学空间,以实现新型化学产品的合成。 | 目前主要依赖细胞外或极简格式进行,以克服非天然底物对活细胞的固有毒性。 | 探索合成生物学在绿色生物催化合成中的应用,以替代传统的工业有机化学。 | 研究对象包括新型化学产品及其类似物,以及用于这些合成的多酶级联反应和纳米材料。 | synthetic biology | NA | multienzymatic cascades, nanomaterial scaffolding | NA | NA | NA |
1108 | 2024-08-07 |
Accelerating the design of pili-enabled living materials using an integrative technological workflow
2024-Feb, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01489-x
PMID:38012344
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研究论文 | 本文介绍了一种综合技术工作流程,用于通过合理整合生物信息学、结构生物学和合成生物学技术来促进工程化活体材料(ELMs)的设计 | 开发了名为Bacteria Biopolymer Sniffer(BBSniffer)的生物信息学软件,用于快速挖掘感兴趣的生物聚合物和生物聚合物产生细菌,并成功在 Corynebacterium glutamicum 中识别出共价连接的菌毛(CLP)生物合成基因簇 | NA | 加速具有自我修复和可进化功能的工程化活体材料(ELMs)的设计 | 工程化活体材料(ELMs)及其可编程的内源性生物聚合物 | 合成生物学 | NA | 生物信息学、结构生物学和合成生物学技术 | NA | 基因簇 | NA |
1109 | 2024-08-07 |
Genetic Transformation of Plasmid DNA into Escherichia coli Using High Frequency Electromagnetic Energy
2024-Jan-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c03464
PMID:38194429
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研究论文 | 本文介绍了一种利用高频电磁能量介导的细菌细胞基因转化新技术 | 该技术通过高频电磁能量诱导质粒DNA转化,具有高效、成本低廉且生理条件友好的特点 | NA | 探索一种新型的基因转化技术,以应用于微生物治疗和合成生物学 | 质粒DNA pGLO和JM109细胞 | NA | NA | 高频电磁能量(HF EME) | NA | NA | 约90.7%的HF EME处理后的活细胞显示出pGLO质粒的摄取 |
1110 | 2024-08-07 |
Enabling neighbour labelling: using synthetic biology to explore how cells influence their neighbours
2024-Jan-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201955
PMID:38165174
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综述 | 本文综述了合成生物学和图像分析的最新进展,这些进展有助于解决细胞间相互作用研究中的技术挑战 | 介绍了合成生物学和图像分析在探索细胞如何影响其邻近细胞方面的应用 | 讨论了将这些技术应用于发育模型系统的机遇和局限性 | 探索细胞间相互作用及其在发育过程中的作用 | 细胞及其邻近细胞的相互影响 | NA | NA | 合成生物学 | NA | 图像 | NA |
1111 | 2024-08-07 |
Expanding the toolbox of probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for synthetic biology
2024-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300327
PMID:37800393
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研究论文 | 本研究系统地扩展了基于益生菌大肠杆菌Nissle 1917(EcN)的合成生物学工具箱 | 开发了两种EcN-based技术,包括用于DNA转移的接合策略和蛋白质表达能力的定量方法,并建立了EcN原生整合酶介导的遗传工程和体外细胞自由蛋白质合成(CFPS)系统 | NA | 开发EcN作为合成生物学应用的有力平台 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917(EcN)及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | NA | NA |
1112 | 2024-08-07 |
microRNAs: Key Regulators in Plant Responses to Abiotic and Biotic Stresses via Endogenous and Cross-Kingdom Mechanisms
2024-Jan-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021154
PMID:38256227
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综述 | 本文全面回顾了植物miRNAs的生物合成及其通过内源和跨界机制对植物生长、发育和抗逆性的影响 | 探讨了人工miRNAs的设计与修饰策略,以及通过外泌体样纳米囊泡保护和运输miRNAs的方法 | 目前利用植物miRNAs存在局限,提出利用合成生物学促进miRNAs的异源表达和大规模生产 | 探讨植物miRNAs在作物育种中的应用潜力及未来农业中的生物安全问题 | 植物miRNAs及其在植物、微生物和害虫中的跨界调控作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1113 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Tools for Engineering Aspergillus oryzae
2024-Jan-03, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof10010034
PMID:38248944
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综述 | 本文综述了用于工程化Aspergillus oryzae的合成生物学工具的最新进展 | 讨论了DNA组装技术、基因表达调控元件和基因组编辑系统等生物工具的进步 | 探讨了异源表达的挑战 | 旨在探讨Aspergillus oryzae合成生物学工具的发展及其在现代生物技术产业中的应用 | Aspergillus oryzae及其在食品发酵、酿造、调味和生物制品生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
1114 | 2024-08-07 |
Enzyme-Free Dynamic DNA Reaction Networks for On-Demand Bioanalysis and Bioimaging
2024-Jan-25, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.3c00676
PMID:38271669
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研究论文 | 本文总结了无酶动态DNA反应网络在生物分析和生物成像中的应用 | 开发了一系列无酶动态DNA反应网络,用于增强分子识别功能、提高信号转导能力和实现细胞内特异性激活 | NA | 探索高效率放大的DNA电路,用于操作复杂的动态反应网络,以实现多种生物应用 | DNA电路的功能扩展、放大能力提升和特异性激活系统 | 生物分析 | NA | DNA电路 | DNAzyme电路 | 生物分子 | NA |
1115 | 2024-08-07 |
Simple phenylpropanoids: recent advances in biological activities, biosynthetic pathways, and microbial production
2024-Jan-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00012e
PMID:37807808
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综述 | 本文综述了简单苯丙烷类化合物的生物活性、生物合成途径及微生物生产的研究进展 | 利用代谢工程和合成生物学技术,从廉价可再生的资源中进行微生物生产,为可持续供应提供了可行解决方案 | NA | 探讨简单苯丙烷类化合物的生物活性和生产方法,以满足日益增长的需求 | 简单苯丙烷类化合物及其在不同物种中的生物合成途径 | 生物技术 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA |
1116 | 2024-08-07 |
Genomics-driven derivatization of the bioactive fungal sesterterpenoid variecolin: Creation of an unnatural analogue with improved anticancer properties
2024-Jan, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.08.025
PMID:38261827
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研究论文 | 本研究通过基因组学驱动的方法,对生物活性真菌倍半萜烯化合物variecolin进行衍生化,创造出一种具有改进抗癌特性的非天然类似物 | 首次在动物中测试variecolin及其类似物,并展示了合成生物学在创造具有改进生物活性分子方面的实用性 | NA | 通过合成生物学方法创造具有改进生物活性的分子 | 真菌倍半萜烯化合物variecolin及其类似物的衍生化和抗癌活性 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | 化合物 | 涉及癌症携带小鼠 |
1117 | 2024-08-07 |
Current advances in the use of bioluminescence assays for drug discovery: an update of the last ten years
2024 Jan-Jun, Expert opinion on drug discovery
IF:6.0Q1
DOI:10.1080/17460441.2023.2266989
PMID:37814480
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综述 | 本文综述了生物发光系统在药物发现计划中作为工具集的最新进展,特别关注过去十年中用于药物筛选的最先进生物发光技术。 | 得益于合成生物学技术和深度学习的发展,现在有了一系列具有调谐发射波长、动力学和高稳定性的荧光素酶。 | 需要进一步结合机器学习和合成生物学研究,以获得新的可持续且高度预测的生物发光药物发现平台工具。 | 总结生物发光系统在药物发现中的应用进展。 | 生物发光技术在药物筛选中的应用,包括无细胞检测、基于遗传修饰细胞的细胞检测、生物发光共振能量转移和蛋白质互补检测。 | 生物技术 | NA | 生物发光检测技术 | 深度学习 | NA | NA |
1118 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Continues to Grow
2024-Jan-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00765
PMID:38239130
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1119 | 2024-08-07 |
Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design
2024-Jan-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi3621
PMID:38241375
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研究论文 | 本文提出了一种开放式的生物设计方法,强调设计的创新性至少与其实现目标的效果同等重要 | 本文提出了一种开放式的生物设计方法,鼓励在设计中注重创新,以超越当前工程生物学中性能提升的递减回报 | 文章未明确提及现有研究的局限性 | 探索持续创新生物设计的途径 | 合成生物学中的生物设计 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1120 | 2024-08-07 |
'Mother(Nature) knows best' - hijacking nature-designed transcriptional programs for enhancing stress resistance and protein production in Yarrowia lipolytica; presentation of YaliFunTome database
2024-Jan-18, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02285-x
PMID:38238843
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研究论文 | 本文通过筛选大量Yarrowia lipolytica菌株,利用高吞吐量培养协议,探索自然设计的转录程序在增强应激抵抗和蛋白质生产中的应用,并介绍了YaliFunTome数据库。 | 本文创新地利用自然进化的转录程序,通过筛选和数学建模,发现并验证了能够增强蛋白质合成和应激抵抗的转录因子。 | NA | 旨在通过利用自然设计的转录程序,实现对Yarrowia lipolytica菌株的合成生物学改造,以增强其工业应用中的应激抵抗和蛋白质生产能力。 | 研究对象为Yarrowia lipolytica菌株及其转录因子。 | 合成生物学 | NA | 高吞吐量培养协议 | 数学建模 | 数值数据 | 超过120株Yarrowia lipolytica菌株,72种变量组合 |