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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1101 | 2024-08-07 |
Multienzymatic Cascades and Nanomaterial Scaffolding-A Potential Way Forward for the Efficient Biosynthesis of Novel Chemical Products
2024-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202309963
PMID:37944537
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research paper | 本文探讨了合成生物学在多酶级联反应和纳米材料支架方面的新进展,旨在提高新型化学产品的生物合成效率。 | 文章介绍了利用多酶级联反应和纳米材料支架技术,扩展酶访问的化学空间,以实现新型化学产品的合成。 | 目前主要依赖细胞外或极简格式进行,以克服非天然底物对活细胞的固有毒性。 | 探索合成生物学在绿色生物催化合成中的应用,以替代传统的工业有机化学。 | 研究对象包括新型化学产品及其类似物,以及用于这些合成的多酶级联反应和纳米材料。 | synthetic biology | NA | multienzymatic cascades, nanomaterial scaffolding | NA | NA | NA |
1102 | 2024-08-07 |
Accelerating the design of pili-enabled living materials using an integrative technological workflow
2024-Feb, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-023-01489-x
PMID:38012344
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研究论文 | 本文介绍了一种综合技术工作流程,用于通过合理整合生物信息学、结构生物学和合成生物学技术来促进工程化活体材料(ELMs)的设计 | 开发了名为Bacteria Biopolymer Sniffer(BBSniffer)的生物信息学软件,用于快速挖掘感兴趣的生物聚合物和生物聚合物产生细菌,并成功在 Corynebacterium glutamicum 中识别出共价连接的菌毛(CLP)生物合成基因簇 | NA | 加速具有自我修复和可进化功能的工程化活体材料(ELMs)的设计 | 工程化活体材料(ELMs)及其可编程的内源性生物聚合物 | 合成生物学 | NA | 生物信息学、结构生物学和合成生物学技术 | NA | 基因簇 | NA |
1103 | 2024-08-07 |
Genetic Transformation of Plasmid DNA into Escherichia coli Using High Frequency Electromagnetic Energy
2024-Jan-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c03464
PMID:38194429
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研究论文 | 本文介绍了一种利用高频电磁能量介导的细菌细胞基因转化新技术 | 该技术通过高频电磁能量诱导质粒DNA转化,具有高效、成本低廉且生理条件友好的特点 | NA | 探索一种新型的基因转化技术,以应用于微生物治疗和合成生物学 | 质粒DNA pGLO和JM109细胞 | NA | NA | 高频电磁能量(HF EME) | NA | NA | 约90.7%的HF EME处理后的活细胞显示出pGLO质粒的摄取 |
1104 | 2024-08-07 |
Enabling neighbour labelling: using synthetic biology to explore how cells influence their neighbours
2024-Jan-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201955
PMID:38165174
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综述 | 本文综述了合成生物学和图像分析的最新进展,这些进展有助于解决细胞间相互作用研究中的技术挑战 | 介绍了合成生物学和图像分析在探索细胞如何影响其邻近细胞方面的应用 | 讨论了将这些技术应用于发育模型系统的机遇和局限性 | 探索细胞间相互作用及其在发育过程中的作用 | 细胞及其邻近细胞的相互影响 | NA | NA | 合成生物学 | NA | 图像 | NA |
1105 | 2024-08-07 |
Expanding the toolbox of probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for synthetic biology
2024-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300327
PMID:37800393
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研究论文 | 本研究系统地扩展了基于益生菌大肠杆菌Nissle 1917(EcN)的合成生物学工具箱 | 开发了两种EcN-based技术,包括用于DNA转移的接合策略和蛋白质表达能力的定量方法,并建立了EcN原生整合酶介导的遗传工程和体外细胞自由蛋白质合成(CFPS)系统 | NA | 开发EcN作为合成生物学应用的有力平台 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917(EcN)及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传工程 | NA | NA | NA |
1106 | 2024-08-07 |
microRNAs: Key Regulators in Plant Responses to Abiotic and Biotic Stresses via Endogenous and Cross-Kingdom Mechanisms
2024-Jan-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25021154
PMID:38256227
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综述 | 本文全面回顾了植物miRNAs的生物合成及其通过内源和跨界机制对植物生长、发育和抗逆性的影响 | 探讨了人工miRNAs的设计与修饰策略,以及通过外泌体样纳米囊泡保护和运输miRNAs的方法 | 目前利用植物miRNAs存在局限,提出利用合成生物学促进miRNAs的异源表达和大规模生产 | 探讨植物miRNAs在作物育种中的应用潜力及未来农业中的生物安全问题 | 植物miRNAs及其在植物、微生物和害虫中的跨界调控作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1107 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Tools for Engineering Aspergillus oryzae
2024-Jan-03, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof10010034
PMID:38248944
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综述 | 本文综述了用于工程化Aspergillus oryzae的合成生物学工具的最新进展 | 讨论了DNA组装技术、基因表达调控元件和基因组编辑系统等生物工具的进步 | 探讨了异源表达的挑战 | 旨在探讨Aspergillus oryzae合成生物学工具的发展及其在现代生物技术产业中的应用 | Aspergillus oryzae及其在食品发酵、酿造、调味和生物制品生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
1108 | 2024-08-07 |
Enzyme-Free Dynamic DNA Reaction Networks for On-Demand Bioanalysis and Bioimaging
2024-Jan-25, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.3c00676
PMID:38271669
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研究论文 | 本文总结了无酶动态DNA反应网络在生物分析和生物成像中的应用 | 开发了一系列无酶动态DNA反应网络,用于增强分子识别功能、提高信号转导能力和实现细胞内特异性激活 | NA | 探索高效率放大的DNA电路,用于操作复杂的动态反应网络,以实现多种生物应用 | DNA电路的功能扩展、放大能力提升和特异性激活系统 | 生物分析 | NA | DNA电路 | DNAzyme电路 | 生物分子 | NA |
1109 | 2024-08-07 |
Simple phenylpropanoids: recent advances in biological activities, biosynthetic pathways, and microbial production
2024-Jan-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00012e
PMID:37807808
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综述 | 本文综述了简单苯丙烷类化合物的生物活性、生物合成途径及微生物生产的研究进展 | 利用代谢工程和合成生物学技术,从廉价可再生的资源中进行微生物生产,为可持续供应提供了可行解决方案 | NA | 探讨简单苯丙烷类化合物的生物活性和生产方法,以满足日益增长的需求 | 简单苯丙烷类化合物及其在不同物种中的生物合成途径 | 生物技术 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA |
1110 | 2024-08-07 |
Genomics-driven derivatization of the bioactive fungal sesterterpenoid variecolin: Creation of an unnatural analogue with improved anticancer properties
2024-Jan, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2023.08.025
PMID:38261827
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研究论文 | 本研究通过基因组学驱动的方法,对生物活性真菌倍半萜烯化合物variecolin进行衍生化,创造出一种具有改进抗癌特性的非天然类似物 | 首次在动物中测试variecolin及其类似物,并展示了合成生物学在创造具有改进生物活性分子方面的实用性 | NA | 通过合成生物学方法创造具有改进生物活性的分子 | 真菌倍半萜烯化合物variecolin及其类似物的衍生化和抗癌活性 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | 化合物 | 涉及癌症携带小鼠 |
1111 | 2024-08-07 |
Current advances in the use of bioluminescence assays for drug discovery: an update of the last ten years
2024 Jan-Jun, Expert opinion on drug discovery
IF:6.0Q1
DOI:10.1080/17460441.2023.2266989
PMID:37814480
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综述 | 本文综述了生物发光系统在药物发现计划中作为工具集的最新进展,特别关注过去十年中用于药物筛选的最先进生物发光技术。 | 得益于合成生物学技术和深度学习的发展,现在有了一系列具有调谐发射波长、动力学和高稳定性的荧光素酶。 | 需要进一步结合机器学习和合成生物学研究,以获得新的可持续且高度预测的生物发光药物发现平台工具。 | 总结生物发光系统在药物发现中的应用进展。 | 生物发光技术在药物筛选中的应用,包括无细胞检测、基于遗传修饰细胞的细胞检测、生物发光共振能量转移和蛋白质互补检测。 | 生物技术 | NA | 生物发光检测技术 | 深度学习 | NA | NA |
1112 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology Continues to Grow
2024-Jan-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00765
PMID:38239130
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1113 | 2024-08-07 |
'Mother(Nature) knows best' - hijacking nature-designed transcriptional programs for enhancing stress resistance and protein production in Yarrowia lipolytica; presentation of YaliFunTome database
2024-Jan-18, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02285-x
PMID:38238843
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研究论文 | 本文通过筛选大量Yarrowia lipolytica菌株,利用高吞吐量培养协议,探索自然设计的转录程序在增强应激抵抗和蛋白质生产中的应用,并介绍了YaliFunTome数据库。 | 本文创新地利用自然进化的转录程序,通过筛选和数学建模,发现并验证了能够增强蛋白质合成和应激抵抗的转录因子。 | NA | 旨在通过利用自然设计的转录程序,实现对Yarrowia lipolytica菌株的合成生物学改造,以增强其工业应用中的应激抵抗和蛋白质生产能力。 | 研究对象为Yarrowia lipolytica菌株及其转录因子。 | 合成生物学 | NA | 高吞吐量培养协议 | 数学建模 | 数值数据 | 超过120株Yarrowia lipolytica菌株,72种变量组合 |
1114 | 2024-08-07 |
Towards a hybrid model-driven platform based on flux balance analysis and a machine learning pipeline for biosystem design
2024-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.12.004
PMID:38234412
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研究论文 | 本研究提出并严格评估了一种基于通量平衡分析和机器学习管道的混合模型驱动的生物系统设计平台 | 首次全面探索了代谢模型与机器学习框架的集成,并充分利用了通量组数据 | NA | 旨在揭示基因型、表型与环境之间复杂关系的下一代系统与合成生物学工具 | 代谢模型与机器学习技术的集成及其在生物系统设计中的应用 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | 混合模型 | 通量组数据 | 涉及六个目标基因的过表达和七个目标基因的敲除实验 |
1115 | 2024-08-07 |
IMP: bridging the gap for medicinal plant genomics
2024-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad898
PMID:37870445
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研究论文 | 开发了一个名为IMP的综合平台,用于整合和分析药用植物的基因组和转录组数据 | IMP平台整合了大量药用植物的基因组和转录组数据,并提供了10个分析模块,便于用户一站式查询基因注释、序列、功能、分布和表达 | NA | 旨在解决药用植物基因组和转录组数据利用不足的问题,推动合成生物学和药物发现领域的发展 | 药用植物的基因组和转录组数据 | 基因组学 | NA | 基因组测序,转录组测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 84个高质量基因组,2156个转录组测序样本 |
1116 | 2024-08-07 |
Heterologous expression of Arabidopsis laccase2, laccase4 and peroxidase52 driven under developing xylem specific promoter DX15 improves saccharification in populus
2024-Jan-13, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-023-02452-7
PMID:38218877
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研究论文 | 本研究通过异源表达拟南芥的Laccase2、Laccase4和Peroxidase52基因,并使用DX15启动子驱动其在杨树中的表达,以提高杨树的糖化效率。 | 首次在杨树中异源表达拟南芥的Laccase和Peroxidase基因,以优化木质纤维素生物质的糖化效率,为生物燃料生产提供可持续解决方案。 | NA | 研究特定Laccase和Peroxidase基因在杨树木材形成中的作用,并探讨其表达变化如何影响生物质抗性和植物生长。 | 拟南芥的Laccase2、Laccase4和Peroxidase52基因在杨树中的表达及其对生物质糖化效率的影响。 | 植物生物技术 | NA | 异源表达 | NA | 基因表达数据 | 转基因杨树株系 |
1117 | 2024-08-07 |
Engineering a Plant Polyketide Synthase for the Biosynthesis of Methylated Flavonoids
2024-Jan-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.3c06785
PMID:38109879
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研究论文 | 本研究通过工程化植物聚酮合酶,提高了O-甲基化黄酮类化合物的生物合成效率 | 通过构建突变体变异,成功提高了homoeriodictyol和hesperetin的产量,分别为之前的2倍和10倍 | NA | 提高O-甲基化黄酮类化合物的生物合成效率 | 植物聚酮合酶及其在微生物中的应用 | 生物工程 | NA | 晶体结构分析 | NA | 蛋白质结构 | 涉及多种酶和突变体变异 |
1118 | 2024-08-07 |
Recent progress in engineering Clostridium autoethanogenum to synthesize the biochemicals and biocommodities
2024-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.12.001
PMID:38205027
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具改进Clostridium autoethanogenum代谢能力,以通过气体发酵可持续生产生物化学品和生物燃料的最新进展 | 介绍了合成生物学工具在改进Clostridium autoethanogenum代谢能力方面的应用 | NA | 总结Clostridium autoethanogenum的生理机制和菌株工程的最新进展,并展望其基础生物学和工程生物学的未来发展 | Clostridium autoethanogenum的生理机制和菌株工程 | 生物工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1119 | 2024-08-07 |
Construction and characterization of a temperature-sensitive pRC4 replicon for Rhodococcus and Gordonia
2024-Feb-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.147990
PMID:37977321
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研究论文 | 本文报道了在Rhodococcus和Gordonia中构建并表征了一种温度敏感的pRC4复制子 | 首次在Gordonia中构建了温度敏感的pRC4复制子,并通过分子模拟验证了其温度敏感性 | NA | 开发适用于Rhodococcus和Gordonia的温度敏感质粒,用于基因组工程和合成生物学应用 | Rhodococcus和Gordonia的温度敏感pRC4复制子 | 合成生物学 | NA | 分子模拟 | NA | DNA | Gordonia sp. IITR100和Rhodococcus erythropolis |
1120 | 2024-08-07 |
Applications of synthetic yeast consortia for the production of native and non-native chemicals
2024-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2022.2118569
PMID:36130800
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review | 本文综述了合成酵母共生体系在生产天然和非天然化学品中的应用 | 合成酵母共生体系通过成员间的合作和交叉喂养,实现了稳定的微生物交流,能够消耗多种底物,执行更复杂的功能,并以高滴度、速率和产量生产代谢物 | 由于合成共生体系的新研究背景,用于构建这些共生体系的酵母种类较少 | 探讨合成酵母共生体系在有效和稳健生产有价值代谢物方面的优势和瓶颈 | 合成酵母共生体系及其在生产如纤维素、木糖、甘油等生物资源中有价值代谢物的应用 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |