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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1121 | 2024-08-07 |
Genomic imprints of unparalleled growth
2024-Feb, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19444
PMID:38072860
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研究论文 | 本文比较了快速生长的绿藻Chlorella ohadii的基因组与其他绿藻的基因组,揭示了其快速生长和抗逆性的基因组印记 | 发现了Chlorella ohadii中与快速生长相关的多个核糖体编码基因、高内含子丰度、增加的密码子偏倚和独特的代谢灵活性及抗光损伤基因 | NA | 研究Chlorella ohadii的基因组适应性和快速生长的基因组特征 | Chlorella ohadii的基因组与其他绿藻的基因组 | NA | NA | 基因组比较 | NA | 基因组数据 | 包括Chlorella ohadii和其近缘种Chlorella sorokiniana UTEX 1663 |
1122 | 2024-08-07 |
Eco-friendly approaches to phytochemical production: elicitation and beyond
2024-Jan-10, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-023-00419-7
PMID:38195902
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综述 | 本文综述了植物次生代谢产物生产的生态友好方法,特别是激发子在提高植物细胞培养物中生物活性化合物合成和储存中的作用及现代代谢工程和合成生物学方法的应用 | 介绍了代谢工程和合成生物学等分子基础方法在植物次生代谢产物合成中的应用前景 | 需要深入了解植物细胞培养中对激发子的代谢响应,以实现生物活性化合物在商业水平上的合成突破 | 探讨可持续和生态友好的体外策略,以提高植物细胞培养物中次生代谢产物的产量 | 植物次生代谢产物及其在提高人类健康中的应用 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
1123 | 2024-08-07 |
Organization of an Artificial Multicellular System with a Tunable DNA Patch on a Membrane Surface
2024-Jan-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c04249
PMID:38112415
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研究论文 | 本文开发了一种基于DNA杂交链反应的膜表面DNA补丁策略,用于指导囊泡的互连,形成可调节的人工多细胞系统(AMS)。 | 通过调节DNA补丁产生异养粘附,实现了AMS的高阶结构直接且有效的生成,并成功构建了包含活细胞和囊泡的混合AMS。 | NA | 开发一种简便的策略,用于制造具有受控排列的人工多细胞系统。 | 人工多细胞系统(AMS)的构建和调控。 | 合成生物学 | NA | DNA杂交链反应 | NA | NA | NA |
1124 | 2024-08-07 |
Programmable synthetic receptors: the next-generation of cell and gene therapies
2024-01-03, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01680-5
PMID:38167329
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综述 | 本文综述了合成受体系统在重编程治疗细胞及其在生物医学研究中的广泛应用 | 合成受体作为一种合成生物学工具,能够精确控制治疗细胞和遗传模块的功能,为细胞和基因治疗提供了强大的解决方案 | 当前合成受体系统在临床转化中仍面临挑战 | 探讨合成受体系统的设计、构建和改进策略,以及其在治疗应用中的扩展前景 | 合成受体系统,包括嵌合抗原受体(CARs)和合成Notch(synNotch)受体 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1125 | 2024-08-07 |
Minimal aromatic aldehyde reduction (MARE) yeast platform for engineering vanillin production
2024-Jan-06, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-023-02454-5
PMID:38184607
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研究论文 | 本文报道了一种通过系统性删除氧化还原酶来改进香兰素积累的工业酵母菌株Saccharomyces cerevisiae的工程化方法 | 开发了最小芳香醛还原(MARE)酵母平台,用于从葡萄糖中从头合成香兰素,并通过多维工程优化辅因子供应和酵母中心代谢重构,提高了香兰素的生产效率 | NA | 展示合成生物学在创造适合工业需求的生物催化剂方面的巨大潜力 | 香兰素的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 生物代谢数据 | 最终的酵母菌株进行了24项遗传修改,在摇瓶中产生了365.55 ± 7.42 mg/L的香兰素 |
1126 | 2024-08-07 |
Tailored bacteria tackling with environmental mercury: Inspired by natural mercuric detoxification operons
2024-Jan-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2023.123016
PMID:38008253
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综述 | 本文综述了基于mer操纵子的细菌在检测、吸收、生物积累和解毒环境汞中的作用 | 利用mer操纵子的四个组成部分(MerR调节因子、mer启动子、解毒因子MerA和MerB)构建合成细菌,以处理污染物汞 | NA | 探讨基于mer操纵子的设计细菌在环境汞生物修复中的潜力 | 环境中的汞及其对生态系统和人类健康的影响 | NA | NA | 合成生物学、蛋白质工程和代谢工程 | NA | NA | NA |
1127 | 2024-08-07 |
Genetic Engineering and Rebooting of Bacteriophages in L-Form Bacteria
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_16
PMID:38066374
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研究论文 | 本文详细介绍了生产无细胞壁的L型细菌及其在激活感染革兰氏阳性宿主物种的合成噬菌体基因组中的应用 | 本文开发了新型无标记基因组编辑方法,用于改进治疗性噬菌体,并详细介绍了合成生物学在体外组装改良噬菌体基因组的应用 | 在难以转化的革兰氏阳性细菌中激活合成噬菌体基因组可能具有挑战性 | 研究替代抗菌剂,特别是噬菌体,以治疗抗生素耐药性病原体感染 | L型细菌和合成噬菌体基因组 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
1128 | 2024-08-07 |
Synthetic Biology to Engineer Bacteriophage Genomes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3523-0_17
PMID:38066375
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学技术开发新型分子生物学方法,以构建具有新功能的特化噬菌体 | 介绍了两种成功用于遗传工程噬菌体基因组的策略:噬菌体重组电穿孔DNA(BRED)和基于酵母的噬菌体工程平台 | NA | 开发新型分子生物学技术,以构建具有新功能的特化噬菌体 | 噬菌体及其在病原体控制、检测、靶向药物递送和新材料组装中的应用 | 合成生物学 | NA | 噬菌体重组电穿孔DNA(BRED)和基于酵母的噬菌体工程平台 | NA | NA | NA |
1129 | 2024-08-07 |
Characterization and optimization of 5´ untranslated region containing poly-adenine tracts in Kluyveromyces marxianus using machine-learning model
2024-Jan-03, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02271-3
PMID:38172836
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研究论文 | 本文研究了Kluyveromyces marxianus中含多聚腺苷酸(poly(A))的5´非翻译区(5´ UTR)对蛋白质生产的影响,并利用机器学习模型对其进行优化 | 首次构建了包含5´ UTR poly(A)特征的机器学习模型,用于预测蛋白质产量 | 删除或减少poly(A)对mRNA水平的影响不一致,表明其对蛋白质生产的抑制作用可能与mRNA水平无关 | 构建机器学习模型,研究5´ UTR poly(A)对蛋白质生产的影响并进行优化 | Kluyveromyces marxianus中的5´ UTR poly(A)及其对蛋白质生产的影响 | 机器学习 | NA | 机器学习模型 | 多层感知器神经网络(MLP-NN) | 序列数据 | 207个含poly(A)的5´ UTR和34个不含poly(A)的5´ UTR |
1130 | 2024-08-07 |
Heterologous production of 3-hydroxypropionic acid in Methylorubrum extorquens by introducing the mcr gene via a multi-round chromosomal integration system based on cre-lox71/lox66 and transposon
2024-Jan-03, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02275-z
PMID:38172868
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研究论文 | 本研究通过构建基于cre-lox71/lox66和转座子的多轮染色体整合系统,在Methylorubrum extorquens中异源生产3-羟基丙酸(3-HP)。 | 本研究开发了一种新的遗传工具,通过多轮染色体整合系统,实现了在M. extorquens中异源基因的高效表达。 | NA | 本研究旨在通过整合现有技术,如转座子介导的染色体整合和cre-lox介导的重组,实现目标基因在M. extorquens AM1中的多样化表达。 | Methylorubrum extorquens AM1 | 合成生物学 | NA | 转座子介导的染色体整合,cre-lox介导的重组 | NA | 基因表达 | 两个染色体整合拷贝 |
1131 | 2024-08-07 |
CO2-based production of phytase from highly stable expression plasmids in Cupriavidus necator H16
2024-Jan-03, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-023-02280-2
PMID:38172920
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研究论文 | 本研究介绍了一种新型表达质粒,通过电穿孔技术在Cupriavidus necator H16中高效生产源自大肠杆菌的AppA植酸酶。 | 该研究引入了一种新型表达质粒,包含分区系统以提高分离稳定性,无需选择压力,并成功在C. necator H16中生产了植酸酶。 | NA | 建立稳定的、高拷贝数质粒,支持利用C. necator从CO2生产单细胞蛋白,并探索其在饲料工业中利用CO2的潜力。 | Cupriavidus necator H16中的植酸酶生产。 | 合成生物学 | NA | 电穿孔技术 | NA | 蛋白质 | 在1升分批补料气体发酵系统中进行了放大实验。 |
1132 | 2024-08-07 |
Enhancing the production of recombinant adeno-associated virus in synthetic cell lines through systematic characterization
2024-01, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28562
PMID:37749931
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研究论文 | 本文通过系统性表征病毒生产动力学,优化了合成细胞系中重组腺相关病毒(rAAV)的生产 | 采用合成生物学方法生成稳定细胞系,通过条件表达基因和优化诱导条件,提高了rAAV的生产效率 | NA | 提高合成细胞系中rAAV的生产效率 | 重组腺相关病毒(rAAV)的生产 | 合成生物学 | NA | 定量蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | NA |
1133 | 2024-08-07 |
EMT transcription factors activated circuits: A novel tool to study EMT dynamics and its therapeutic implications
2024-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2023.11.010
PMID:38173810
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研究论文 | 本研究介绍了响应性的EMT传感电路,通过特定的启动子感知EMT过程,并构建了NOT门电路来区分和抑制EMT肿瘤细胞的增殖 | 首次引入响应性的EMT传感电路,通过特定的启动子感知EMT过程,并构建了NOT门电路来区分和抑制EMT肿瘤细胞的增殖 | NA | 开发新的工具来研究EMT动态过程及其在治疗上的应用 | EMT过程中的细胞命运和靶向治疗 | 生物技术 | 癌症 | 合成生物学电路 | NA | 细胞 | 涉及乳腺癌细胞和上皮癌细胞 |
1134 | 2024-08-07 |
Dual Engineering of Olivetolic Acid Cyclase and Tetraketide Synthase for the Formation of Longer Alkyl-Chain Olivetolic Acid Analogs and Their Antibacterial Activities
2024, Chemical & pharmaceutical bulletin
IF:1.5Q3
DOI:10.1248/cpb.c23-00692
PMID:38171898
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综述 | 本文综述了通过双工程化橄榄酸环化酶和四酮合成酶来形成更长烷基链的橄榄酸类似物及其抗菌活性的研究 | 通过混合不同生物合成途径的基因或工程化次级代谢酶以扩展底物和产物特异性,理论上可以生成新的非天然化合物 | NA | 探讨通过工程化酶来扩展非天然大麻素中C-3烷基部分的可能性,以开发具有治疗效益的大麻素 | 橄榄酸环化酶和四酮合成酶的结构基础双工程化及其对橄榄酸类似物抗菌活性的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
1135 | 2024-08-07 |
Selective induction of programmed cell death using synthetic biology tools
2024-03-15, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2023.07.012
PMID:37598045
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研究论文 | 本文讨论了利用合成生物学工具选择性诱导程序性细胞死亡的最新进展 | 开发了基于合成生物学的工具,允许使用化学遗传学或光遗传学方法靶向诱导程序性细胞死亡 | 由于程序性细胞死亡途径的互连性和多效性效应,单独研究这些途径具有挑战性 | 探讨合成生物学工具在细胞和动物中研究程序性细胞死亡的应用 | 程序性细胞死亡的不同形式及其诱导和执行的细胞信号传导途径 | 合成生物学 | NA | 化学遗传学,光遗传学 | NA | NA | NA |
1136 | 2024-08-07 |
The Calvin Benson cycle in bacteria: New insights from systems biology
2024-03-01, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2023.03.007
PMID:37002131
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综述 | 本文综述了光养和化能自养细菌中Calvin Benson循环的调控机制及其在生物技术中的应用 | 强调了光养和化能自养模型之间的差异,并探讨了通过蛋白质工程和合成生物学手段对Calvin Benson循环酶进行调控以增强CO2固定的可能性 | NA | 旨在深入理解细菌中Calvin Benson循环的调控机制,并探索其在生物技术中的应用潜力 | 光养和化能自养细菌中的Calvin Benson循环 | 系统生物学 | NA | 系统生物学研究方法 | NA | NA | NA |
1137 | 2024-08-07 |
A quantitative autonomous bioluminescence reporter system with a wide dynamic range for Plant Synthetic Biology
2024-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14146
PMID:37882352
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研究论文 | 本文介绍了一种基于自主生物发光的新型低成本、高通量的植物基因表达定量报告系统 | 该系统利用Neonothopanus nambi真菌的完整生物发光循环途径构建了一个自维持的报告系统,无需外源性提供荧光素酶底物,并通过HispS基因作为报告系统的转录入口点,显著提高了输出的动态范围 | NA | 旨在为植物合成生物学中的合成基因电路优化提供快速、丰富的数据集 | 植物基因表达的定量测量 | 合成生物学 | NA | 生物发光 | NA | 基因表达数据 | 涉及N. benthamiana等植物样本 |
1138 | 2024-08-07 |
Fruit development and ripening orchestrating the biosynthesis and regulation of Lycium barbarum polysaccharides in goji berry
2024-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2023.127970
PMID:37944729
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研究论文 | 本研究探讨了枸杞果实发育和成熟过程中枸杞多糖的生物合成与调控机制 | 首次通过生理指标监测、蛋白质组和转录组分析以及基因共表达网络分析,揭示了枸杞多糖的生物合成途径和调控因子 | NA | 揭示枸杞果实中枸杞多糖的生物合成与调控机制 | 枸杞果实中的枸杞多糖 | NA | NA | 蛋白质组学、转录组学、基因共表达网络分析 | NA | 生物分子数据 | 6410个差异表达基因和2052个差异表达蛋白质 |
1139 | 2024-08-07 |
Engineering the next generation of theranostic biomaterials with synthetic biology
2024-Feb, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2023.10.018
PMID:38026437
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综述 | 本文综述了合成生物学在治疗诊断学中的应用,强调了其在推动先进生物材料发展中的关键作用 | 合成生物学通过基因重编程生物系统,为生物材料的发展提供了新的范式 | 生物材料的进步受到化学和机械方法的限制 | 探索合成生物学与生物材料的交叉应用,推动可编程复杂功能的生物材料工程 | 合成生物学在治疗诊断学中的应用及其对生物材料的影响 | 生物材料 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
1140 | 2024-08-07 |
Recent advances in microalgal production, harvesting, prediction, optimization, and control strategies
2024-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2023.129924
PMID:37925082
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综述 | 本文综述了微藻生产、收获、预测、优化和控制策略的最新进展 | 探讨了合成生物学、气泡生成、光生物反应器设计、电/磁/生物絮凝以及人工智能集成等策略在微藻生产中的应用 | 现有微藻生物加工方法面临低生物量和生物产品产量、监测效率低下及收获成本高等挑战 | 旨在分析现有微藻生物加工方法的挑战并指出未来研究方向 | 微藻及其在医药、营养保健品、化妆品和水产/动物饲料行业的应用 | NA | NA | 合成生物学、光生物反应器设计、电/磁/生物絮凝、人工智能 | NA | NA | NA |