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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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161 | 2024-11-23 |
The ABC transporter SmABCG1 mediates tanshinones export from the peridermic cells of Salvia miltiorrhiza root
2024-Nov-22, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13806
PMID:39575678
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研究论文 | 研究揭示了丹参根皮层细胞中丹参酮的转运机制,发现ABC转运蛋白SmABCG1介导丹参酮ⅡA和丹参酮Ⅰ的排出 | 首次发现并验证了ABC转运蛋白SmABCG1在丹参根皮层细胞中对丹参酮的转运作用 | 研究主要集中在丹参根皮层细胞中丹参酮的转运,未涉及其他植物或组织中的类似机制 | 探讨丹参根皮层细胞中丹参酮的转运机制 | 丹参根皮层细胞中的丹参酮及其转运蛋白SmABCG1 | NA | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | 基因表达数据 | 涉及丹参根皮层细胞和非洲爪蟾卵母细胞的异源表达实验 |
162 | 2024-11-23 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Phase-Separation Control, Cytomimetic Modelling and Emerging Biomedical Potential
2024-Nov-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418431
PMID:39575859
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综述 | 本文综述了合成生物分子凝聚体的相分离控制、细胞模拟建模及其新兴的生物医学潜力 | 合成凝聚体能够模拟生物分子凝聚体的生物物理原理和动态特征,提供对细胞过程和复杂生物途径调控的基本见解 | NA | 探讨合成生物分子凝聚体的设计与构建及其在细胞模拟建模和工程活性材料中的应用 | 合成凝聚体及其在生物医学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
163 | 2024-11-23 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2024-Nov-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 开发了一种名为合成膜内蛋白水解受体(SNIPR)的新型受体结构,能够响应可溶性配体并激活定制的细胞功能 | SNIPR受体通过内吞作用和pH依赖性切割机制,具有低基线活性和高倍激活能力,能够响应天然和合成可溶性配体 | NA | 解决当前缺乏能够响应可溶性配体的模块化合成受体的问题,并探索其在临床治疗中的潜力 | 开发新型合成受体,用于调节工程治疗细胞的活性,并扩展合成生物学的应用范围 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | 合成膜内蛋白水解受体(SNIPR) | NA | NA |
164 | 2024-11-23 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.05.622105
PMID:39574612
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研究论文 | 本文探讨了通过底物依赖的酶聚集来提高代谢效率的机制 | 提出了酶通过相分离自组织成近似最优大小和间隔的集群,并通过数学模型验证了其对代谢通量和毒性代谢物的显著改善 | 主要基于数学模型研究,缺乏实验验证 | 研究酶集群在细胞内的最优组织方式及其对代谢效率的影响 | 酶集群的形成机制及其对代谢通量和毒性代谢物的影响 | 代谢工程 | NA | 数学建模 | NA | NA | NA |
165 | 2024-11-23 |
Enzyme cascades for in vitro and in vivo FMN prenylation and UbiD (de)carboxylase activation under aerobic conditions
2024, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2024.10.015
PMID:39572138
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研究论文 | 本文介绍了在有氧条件下使用酶级联系统进行体外和体内FMN法尼基化和UbiD(脱)羧酶激活的两种方法 | 开发了在有氧条件下进行FMN法尼基化和UbiD激活的稳健方法,以促进异源活性UbiD酶的生产 | 目前对FMN法尼基化和UbiD激活的实验复杂性了解有限,导致重组UbiD酶的活性不足 | 开发高效的方法进行体外和体内FMN法尼基化和UbiD激活,以促进活性UbiD酶的异源生产 | UbiD(脱)羧酶及其辅因子FMN的法尼基化 | 生物催化 | NA | 酶级联系统 | NA | NA | 使用重组大肠杆菌细胞进行实验 |
166 | 2024-11-22 |
Superior Photostability of the Unnatural Base 6-Amino-5-nitropyridin-2-ol: A Case Study Using Ultrafast Broadband Fluorescence, Transient Absorption, and Theoretical Computation
2024-Nov-21, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.4c02751
PMID:39526600
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研究论文 | 研究了非天然碱基6-氨基-5-硝基吡啶-2-醇(Z)在不同溶剂中的激发态动力学 | 首次全面研究了Z的激发态动力学,发现其具有优越的光稳定性 | NA | 探讨非天然碱基Z的光稳定性及其在生物和环境应用中的潜力 | 非天然碱基6-氨基-5-硝基吡啶-2-醇(Z) | NA | NA | 超快宽带时间分辨荧光光谱和瞬态吸收光谱 | NA | 光谱数据 | NA |
167 | 2024-11-22 |
Balanced Training Sets Improve Deep Learning-Based Prediction of CRISPR sgRNA Activity
2024-Nov-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00542
PMID:39495623
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研究论文 | 本文研究了使用平衡和不平衡数据集训练卷积神经网络(CNN)和大语言模型(LLM)对CRISPR sgRNA活性的预测效果 | 通过在训练集中添加合成sgRNA,提高了在不平衡数据集上预测sgRNA活性的准确性 | 未提及 | 探讨平衡训练集对深度学习模型预测CRISPR sgRNA活性的影响 | CRISPR-Cas12a筛选数据生成的平衡和不平衡数据集 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas12a筛选 | 卷积神经网络(CNN)和大语言模型(LLM) | 文本 | 未提及具体数量 |
168 | 2024-11-22 |
Reconstructing Early Microbial Life
2024-Nov, Annual review of microbiology
IF:8.5Q1
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综述 | 本文综述了早期微生物生命的研究进展,重点介绍了古代代谢途径及其在生物创新重建中的应用 | 本文整合了微生物学、古生物学和进化合成生物学,形成了一个新兴的跨学科领域,用于重建古代生物创新 | 将分子遗传学、群体生物学和进化生物学方法应用于前寒武纪生物研究仍然是一个重大挑战 | 探讨早期微生物生命的进化及其对地球生态系统的影响 | 早期微生物生命及其代谢途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
169 | 2024-11-21 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2024-Nov-14, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
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研究论文 | 本文介绍了一种基于工程酵母的新技术,用于从工业废水中去除铅 | 开发了一种新的操作技术,基于工程酵母的机制理解和响应面优化方法,解决了大规模处理污染物的高操作成本和技术限制问题 | NA | 解决铅污染问题,降低操作成本,实现工程酵母在工业应用中的规模化 | 工程酵母、铅污染的工业废水 | 生物工程 | NA | 基因敲除、响应面优化 | NA | NA | NA |
170 | 2024-11-21 |
High-throughput development and characterization of new functional nanobodies for gene regulation and epigenetic control in human cells
2024-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.01.621523
PMID:39554150
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研究论文 | 开发并表征用于基因调控和表观遗传控制的新型功能性纳米抗体 | 开发了一种新方法,通过酵母展示和高通量筛选,生成针对人类染色质调节因子的小型纳米抗体,用于基因表达的抑制或激活 | NA | 开发新的纳米抗体用于基因表达和染色质状态的调控 | 人类细胞中的基因表达和染色质状态 | NA | NA | 酵母展示 | NA | NA | 数十个功能性纳米抗体 |
171 | 2024-11-20 |
The Enigma of Transcriptional Activation Domains
2024-Nov-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2024.168766
PMID:39214280
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review | 本文综述了真核基因激活域(ADs)的机制模型,提出了一种基于表面活性剂样近随机交互作用的新模型 | 提出了基于表面活性剂样近随机交互作用的新机制模型,与传统生物化学原理不同 | NA | 重新思考和解释真核基因激活域的功能机制 | 真核基因激活域及其与基因启动子核小体的交互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
172 | 2024-11-20 |
Ogataea polymorpha as a next-generation chassis for industrial biotechnology
2024-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.007
PMID:38622041
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综述 | 本文综述了Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘的潜力及其在合成生物学工具开发、化学品生产和系统生物学方面的进展 | Ogataea polymorpha具有快速生长、耐热性和广泛的底物谱等独特特性,通过合成生物学改造,可用于生产高附加值化学品 | NA | 探讨Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘的潜力及其在化学品生产和系统生物学方面的进展 | Ogataea polymorpha及其在化学品生产和系统生物学中的应用 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
173 | 2024-11-20 |
A new era of synthetic biology-microbial community design
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae011
PMID:39086602
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学在微生物群落设计中的最新进展,并提出了基于模块化建模的无机体方法 | 提出了将合成生物学与计算模型完全整合的新方法,强调模块化建模在设计多物种群落中的应用 | 尚未完全实现模型与合成设计过程的整合 | 探讨合成生物学在微生物群落设计中的应用,并提出新的设计方法 | 微生物群落及其功能模块 | 合成生物学 | NA | NA | 模块化计算模型 | NA | NA |
174 | 2024-11-20 |
Data hazards in synthetic biology
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae010
PMID:38973982
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研究论文 | 本文介绍了在合成生物学中数据科学应用的潜在风险,并提出了一个社区开发的框架来评估这些数据风险 | 提出了一个社区开发的框架来评估合成生物学中的数据风险,并应用于两个案例研究 | 未详细说明具体的案例研究细节和框架的具体实施步骤 | 探讨数据科学在合成生物学中的应用风险,并提出相应的评估框架 | 合成生物学中的数据风险 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据 | 两个合成生物学案例研究 |
175 | 2024-11-20 |
Navigating the 'moral hazard' argument in synthetic biology's application
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae008
PMID:38828013
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学应用中的'道德风险'问题,并提出了应对策略 | 本文提出了应对合成生物学应用中道德风险的具体方法 | 未提及具体的技术或模型,缺乏实证研究 | 探讨合成生物学应用中的道德风险问题,并提出解决方案 | 合成生物学技术及其应用中的道德风险 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
176 | 2024-08-07 |
A new Editor-in-chief for Synthetic Biology
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae006
PMID:38638609
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
177 | 2024-11-20 |
Preparing for the future of precision medicine: synthetic cell drug regulation
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae004
PMID:38327596
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研究论文 | 讨论了合成细胞药物在精准医学未来发展中的监管挑战 | 提出了合成细胞作为新型生物反应器的潜力,并探讨了其在合成生物学和生物医学中的应用前景 | 文章主要讨论了监管方面的挑战,未深入探讨技术实现的具体细节 | 探讨合成细胞药物在精准医学中的应用及监管挑战 | 合成细胞及其在生物医学中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成细胞技术 | NA | NA | NA |
178 | 2024-11-20 |
In vitro transcription-based biosensing of glycolate for prototyping of a complex enzyme cascade
2024, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysae013
PMID:39399720
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研究论文 | 开发了一种基于体外转录(IVT)的生物传感工作流程,用于复杂酶级联反应和代谢网络的定量和原型设计 | 提出了基于体外转录的生物传感方法,能够以较低成本和更快速度定量复杂代谢系统中的甘醇酸 | 研究主要集中在甘醇酸传感模块的开发和优化,未涉及其他代谢物的检测 | 开发一种新的生物传感方法,用于复杂代谢系统的定量分析和原型设计 | 甘醇酸传感模块及其在复杂代谢系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 体外转录(IVT) | NA | 代谢物 | 涉及13种共因子 |
179 | 2024-11-19 |
Advancements in sustainable production of biofuel by microalgae: Recent insights and future directions
2024-Dec-01, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2024.119902
PMID:39222730
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研究论文 | 本文综述了利用微藻可持续生产生物燃料的最新进展和未来方向 | 探讨了合成生物学、代谢工程工具、微藻生物炼制和优化藻类生长条件的最新进展 | NA | 探讨微藻作为可持续和可行的生物燃料原料的潜力及其生产过程中的生命周期、能量平衡和环境影响 | 微藻及其在生物燃料生产中的应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
180 | 2024-11-19 |
Calcium-Dependent Lipopeptide Antibiotics against Drug-Resistant Pathogens Discovered via Host-Dependent Heterologous Expression of a Cloned Biosynthetic Gene Cluster
2024-Nov-25, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202410286
PMID:39175099
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研究论文 | 通过宿主依赖的异源表达克隆的生物合成基因簇,发现了一种钙依赖性脂肽抗生素,用于对抗耐药性病原体 | 发现了一种新的钙依赖性脂肽抗生素ambocidin A,其通过与Lipid II的不同结合位点抑制细胞壁合成,且在肺表面活性剂存在下仍保持强大的抗菌活性 | 异源宿主的选择对生物活性化合物的产生至关重要,不当的选择会导致非活性衍生物的异常产生 | 通过基因组挖掘和合成生物学方法,发现新的抗耐药性病原体的抗生素 | 钙依赖性脂肽抗生素ambocidin A和B,以及其对耐药性革兰氏阳性病原体的活性 | 生物化学 | NA | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | 多个链霉菌宿主菌株 |