合成生物学相关文章
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当前共找到 1126 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-05 |
Dual-Plasmid Mini-Tn5 System to Stably Integrate Multicopy of Target Genes in Escherichia coli
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00140
PMID:39418641
|
研究论文 | 开发了一种使用双质粒mini-Tn5系统在大肠杆菌中稳定整合多拷贝目标基因的方法 | 首次采用双质粒mini-Tn5系统实现目标基因的多拷贝稳定整合，并设计了可移除抗生素抗性基因的标记系统 | 在不同菌株中整合拷贝数存在差异（RecA+菌株19拷贝，RecA-菌株5拷贝） | 开发稳定高效的多拷贝基因整合方法以提高工程微生物代谢产物产量 | 大肠杆菌菌株（MG1655和XL1-Blue MRF'） | 合成生物学 | NA | 基因整合技术 | NA | 分子生物学数据 | 多种大肠杆菌菌株 | mini-Tn5转座子系统, 双质粒系统 | 大肠杆菌 | 多拷贝基因整合系统，包含可移除抗生素抗性基因标记 | 工业生物技术 |
| 162 | 2025-10-05 |
Engineering Yarrowia lipolytica to Produce l-Malic Acid from Glycerol
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00445
PMID:39444231
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和实验室进化改造耶氏酵母，使其能够利用甘油高效生产L-苹果酸 | 首次在耶氏酵母中实现L-苹果酸生产，通过过表达内源基因和异源转运蛋白，结合适应性实验室进化提高产量和耐酸性 | NA | 开发耶氏酵母作为L-苹果酸生产的微生物细胞工厂 | 耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | 合成生物学 | NA | 代谢工程，适应性实验室进化 | NA | NA | NA | 基因过表达，适应性进化 | 耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | L-苹果酸生物合成途径，包括乙醛酸循环途径(异柠檬酸裂解酶、苹果酸合酶、苹果酸脱氢酶)和苹果酸转运蛋白 | 食品工业，化学工业，制药工业 |
| 163 | 2025-10-05 |
Application of a Cell-Free Synthetic Biology Platform for the Reconstitution of Teleocidin B and UK-2A Precursor Biosynthetic Pathways
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00560
PMID:39469830
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研究论文 | 本研究利用植物细胞无蛋白合成系统成功重构了teleocidin B和UK-2A前体两种天然产物的生物合成途径 | 首次在无细胞系统中成功重构了结构复杂程度不同的两种天然产物生物合成途径，并发现TleA与MbtH的直接相互作用 | 未明确说明系统产量与体内系统的比较优势以及规模化应用的可行性 | 开发植物细胞无蛋白合成平台用于天然产物生物合成途径的重构与优化 | teleocidin B-3和UK-2二醇两种天然产物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 细胞无蛋白合成系统 | NA | NA | NA | BY-2系统, 小麦胚芽CFPS系统 | 烟草BY-2细胞, 小麦胚芽 | teleocidin生物合成途径, UK-2A前体生物合成途径（包含10个蛋白质的复杂途径） | 工业生物技术 |
| 164 | 2025-10-05 |
Balanced Training Sets Improve Deep Learning-Based Prediction of CRISPR sgRNA Activity
2024-11-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00542
PMID:39495623
|
研究论文 | 本研究探讨平衡训练集对基于深度学习的CRISPR sgRNA活性预测性能的影响 | 首次系统比较平衡与不平衡数据集对CRISPR sgRNA活性预测模型性能的影响，并验证通过添加合成sgRNA改善不平衡数据集能提升预测准确度 | 研究主要基于特定CRISPR-Cas系统（Cas12a和Cas9）的数据，可能不适用于其他CRISPR系统 | 提高CRISPR sgRNA活性预测的准确性 | CRISPR系统的sgRNA序列 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas筛选 | CNN, LLM | 序列数据 | 来自酵母和人类细胞的CRISPR筛选数据 | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a | 酵母, 人类细胞 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 165 | 2025-10-05 |
Enhancers: A Focus on Synthetic Biology and Correlated Gene Expression
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00244
PMID:39276360
|
综述 | 本文聚焦合成生物学方法研究增强子功能及其与基因表达相关性的机制 | 系统阐述合成生物学方法在解析增强子功能机制中的应用，提出局部环境中多基因与增强子相互作用导致基因表达相关性的新观点 | 主要关注合成报告基因研究方法，未深入讨论天然基因组环境的完整复杂性 | 探讨增强子在基因调控中的作用机制及其与基因表达相关性的关系 | 增强子及其调控的基因表达 | 合成生物学 | NA | 合成报告基因分析，高通量报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成报告基因构建 | 后生动物细胞 | 基因表达调控系统，增强子-报告基因回路 | 基础生物学研究 |
| 166 | 2025-10-05 |
Rational Design of High-Efficiency Synthetic Small Regulatory RNAs and Their Application in Robust Genetic Circuit Performance Through Tight Control of Leaky Gene Expression
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00323
PMID:39294875
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研究论文 | 本研究开发了高效合成小RNA的理性设计策略，并通过其在遗传电路中的应用解决了基因表达泄漏问题 | 通过优化sRNA支架、mRNA结合亲和力、Hfq蛋白表达水平和mRNA二级结构等多个参数，显著提高了合成sRNA的效率 | NA | 开发高效合成小RNA的理性设计策略并应用于遗传电路性能优化 | 合成小RNA和细菌遗传电路 | 合成生物学 | NA | 合成sRNA设计 | 正反馈电路 | NA | NA | 合成sRNA | 细菌 | 正反馈电路，用于控制基因表达泄漏 | 工业生物技术, 代谢工程 |
| 167 | 2025-10-05 |
Modular Cloning Tools for Streptomyces spp. and Application to the De Novo Biosynthesis of Flavokermesic Acid
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00412
PMID:39307986
|
研究论文 | 本研究开发了适用于链霉菌的模块化克隆工具，并成功应用于黄酮红酸的全新生物合成 | 开发了首个针对链霉菌的模块化克隆系统，包含适配载体和遗传元件，能够构建完整遗传回路 | NA | 开发适用于链霉菌的合成生物学工具，实现多组分基因簇的从头组装 | 链霉菌及其天然产物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆系统、β-葡萄糖醛酸苷酶报告系统 | NA | NA | NA | MoClo | 链霉菌 | 黄酮红酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 168 | 2025-10-05 |
Efficient Simulation of Viral Transduction and Propagation for Biomanufacturing
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00227
PMID:39315883
|
研究论文 | 开发了用于优化病毒转导和扩增生物制造平台的vitraPro软件工具包 | 提出了包含多尺度模型和高效数值技术的软件工具包，可同时模拟两种病毒的感染传播过程 | 模型验证仅限于杆状病毒表达载体系统和甲型流感悬浮培养案例 | 优化基于病毒转导的生物制造平台和病毒扩增过程 | 病毒转导和传播过程 | 合成生物学 | NA | 多尺度建模、数值模拟 | 多尺度模型 | NA | NA | NA | 悬浮培养细胞 | 病毒转导系统、病毒扩增过程 | 工业生物技术 |
| 169 | 2025-10-05 |
An Automated Cell-Free Workflow for Transcription Factor Engineering
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00471
PMID:39373325
|
研究论文 | 开发了一种自动化无细胞工作流程用于转录因子工程 | 创建了基于Echo声波液体处理器的通用化无细胞基因表达工作流程，可在48小时内完成数千种转录因子变体的高通量筛选 | NA | 优化自动化无细胞基因表达工作流程以加速合成生物学设计周期 | MerR和CadR转录因子变体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达(CFE) | NA | 生物传感器响应数据 | 127个MerR变体和134个CadR变体，共3682个无细胞反应 | Echo Acoustic Liquid Handler | 无细胞系统 | 转录因子生物传感器，用于汞和镉检测 | 环境监测 |
| 170 | 2025-10-05 |
Characterizing and Engineering Rhamnose-Inducible Regulatory Systems for Dynamic Control of Metabolic Pathways in Streptomyces
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00626
PMID:39377938
|
研究论文 | 本研究表征并构建了鼠李糖诱导型调控系统，用于在链霉菌中实现代谢途径的动态控制 | 通过生物信息学分析发现鼠李糖代谢途径，构建了无泄漏表达的鼠李糖诱导型调控系统RhaREG1和RhaREG2 | NA | 开发有效的基因诱导系统用于合成生物技术应用 | 链霉菌属及其天然产物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析，电泳迁移率变动分析(EMSA)，多序列比对 | NA | 基因组序列，蛋白质序列，启动子活性数据 | NA | 合成生物学策略 | 链霉菌 | 鼠李糖诱导型调控系统，通过将阻遏蛋白/操作子对RhaR/RhaO与组成型启动子组装构建 | 工业生物技术 |
| 171 | 2025-10-05 |
A Synthetic Biology Approach to Transgene Expression in Insects
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00250
PMID:39198266
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研究论文 | 开发了一种系统方法来表征转基因翻译起始序列和3'非翻译区的修饰，创建了用于蚊子和昆虫基因表达调控的工具箱 | 通过系统表征TIS和3'UTR修饰，实现了跨细胞系和5'调控序列的高度可预测基因表达变化 | 主要针对蚊子和非模式昆虫物种，在其他昆虫中的应用潜力尚未完全验证 | 开发合成生物学方法调控昆虫中转基因表达水平 | 蚊子和非模式昆虫物种 | 合成生物学 | NA | 转基因技术，基因表达调控 | NA | 基因表达数据 | 多种细胞系 | 转基因方法 | 蚊子，昆虫 | 基因表达调控工具箱，包含翻译起始序列和3'非翻译区修饰 | 农业，环境 |
| 172 | 2025-10-05 |
Computational Synthetic Biology Enabled through JAX: A Showcase
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00307
PMID:39230510
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研究论文 | 本文展示了JAX计算框架在计算合成生物学中的应用价值 | 首次系统展示JAX在计算合成生物学中的多功能应用，包括灵活的GPU扩展、快速运行时间和自动微分等数学增强功能 | JAX在计算生物学领域仍处于探索不足的状态，应用案例有限 | 促进数学建模在合成生物学中的更广泛应用，展示现代计算框架的潜力 | 合成生物学和定向进化中的计算建模问题 | 计算生物学 | NA | 数学建模，GPU加速计算，自动微分 | 机制模型，随机模型，数据驱动模型，AI模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | 基因网络优化，细胞内动力学模拟 | 工业生物技术 |
| 173 | 2025-10-05 |
SeqImprove: Machine-Learning-Assisted Curation of Genetic Circuit Sequence Information
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00392
PMID:39230953
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研究论文 | 开发了一种名为SeqImprove的机器学习辅助工具，用于改进遗传电路序列信息的整理过程 | 结合命名实体识别、实体规范化和序列匹配技术，创建了作者可审查编辑的机器可访问序列数据和元数据注释系统 | NA | 解决合成生物学中文献研究和复制记录不完整工作时面临的困难 | 遗传电路序列信息 | 机器学习 | NA | 命名实体识别, 实体规范化, 序列匹配 | NA | 序列数据, 元数据 | NA | NA | NA | 遗传电路 | 工业生物技术 |
| 174 | 2025-10-05 |
Orthogonal Serine Integrases Enable Scalable Gene Storage Cascades in Bacterial Genome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00505
PMID:39238421
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研究论文 | 开发基于正交丝氨酸整合酶的迭代基因组整合方法，实现细菌染色体中多基因的稳定存储 | 首次利用正交丝氨酸整合酶系统实现可扩展的基因存储级联，支持长达13 kb DNA片段的标记自由高效整合 | 未明确说明整合效率的具体量化数据和系统在不同宿主中的普适性验证 | 开发可扩展的基因组整合工具用于合成生物学应用 | 大肠杆菌MG1655菌株 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的基因组整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 工程化整合载体 | 大肠杆菌 | 基因存储级联系统，多基因表达通路 | 工业生物技术, 医学 |
| 175 | 2025-10-05 |
Technologies for the discovery of G protein-coupled receptor-targeting biologics
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103138
PMID:38728825
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综述 | 本文综述了靶向G蛋白偶联受体的生物制剂发现技术及其发展前景 | 系统总结了最先进的GPCR靶向生物制剂工程技术，并前瞻性地指出DNA合成和合成生物学技术将推动该领域发展 | NA | 回顾GPCR靶向生物制剂发现的技术现状并展望未来发展方向 | G蛋白偶联受体及其靶向生物制剂 | 生物医药技术 | 代谢性疾病、神经系统疾病、心血管疾病 | DNA合成、展示技术、功能筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 176 | 2025-10-05 |
Engineering Whole-Cell Biosensors for Enhanced Detection of Environmental Antibiotics Using a Synthetic Biology Approach
2024-Jun, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-024-01259-w
PMID:39010990
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造双组分系统开发生物传感器用于环境抗生素检测 | 探索基于EMeRALD的生物传感器，通过合成生物学方法重新利用微生物双组分系统的传感模块 | NA | 开发用于环境抗生素检测的合成生物学工具 | 细菌双组分系统和EMeRALD生物传感器 | 合成生物学 | 抗生素耐药性 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | EMeRALD | 细菌 | 双组分调控系统合成调控回路 | 环境监测 |
| 177 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-based bacterial extracellular vesicles displaying BMP-2 and CXCR4 to ameliorate osteoporosis
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12429
PMID:38576241
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术构建了展示BMP-2和CXCR4的细菌胞外囊泡，用于改善骨质疏松症 | 首次将骨形态发生蛋白BMP-2和趋化因子受体CXCR4与细菌胞外囊泡表面蛋白ClyA融合表达，实现一步法构建兼具骨靶向和骨形成功能的治疗系统 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未进行临床前安全性和有效性评估 | 开发基于合成生物学的骨质疏松症治疗新策略 | 骨质疏松症小鼠模型和骨髓间充质干细胞BMSCs | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 细菌胞外囊泡工程、蛋白融合表达 | NA | 体内外实验数据 | 卵巢切除小鼠模型 | PET28a载体系统 | 大肠杆菌Nissle 1917 | ClyA-BMP-2-CXCR4融合蛋白表达系统，用于细菌胞外囊泡表面展示 | 医药 |
| 178 | 2025-10-05 |
Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938
2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13379-w
PMID:39731599
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研究论文 | 本研究通过转录组学数据开发了红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous的合成生物学元件库 | 首次将系统生物学与合成生物学结合，创建了从组学到元件的流程，为非常规微生物快速开发遗传工具 | 许多推定的调控型启动子在合成遗传背景下表现出组成型活性 | 开发Xanthophyllomyces dendrorhous的合成生物学工具并研究其光生物学特性 | 红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 | 合成生物学 | NA | 转录组学, 差异基因表达分析, 基因本体分析, 荧光素酶检测 | NA | 转录组数据, 基因组数据 | 在不同波长光照和氧化应激条件下的X. dendrorhous样本 | 模块化克隆系统 | Xanthophyllomyces dendrorhous | 组成型和光调控启动子, 整合位点, 终止子, 选择标记, 报告基因 | 工业生物技术 |
| 179 | 2025-10-05 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
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研究论文 | 本研究开发了一种木糖诱导且葡萄糖不敏感的基因表达系统IExyl*，并应用于提高Parageobacillus thermoglucosidasius的核黄素产量 | 通过组合xylA5p启动子和XylR调节因子，优化XylR表达强度并降低葡萄糖对木糖摄取的代谢物阻遏，创建了葡萄糖不敏感的木糖诱导表达系统 | NA | 开发适用于Parageobacillus thermoglucosidasius的诱导表达系统 | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542菌株 | 合成生物学 | NA | 启动子工程，代谢工程 | NA | NA | NA | 启动子工程，代谢通路重定向 | Parageobacillus thermoglucosidasius | 木糖诱导表达系统，包含xylA5p启动子和XylR转录调节因子 | 工业生物技术 |
| 180 | 2025-10-05 |
In vivo thrombin activity in the diatom Phaeodactylum tricornutum: biotechnological insights
2024-Oct-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13322-z
PMID:39377797
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研究论文 | 本研究在三角褐指藻中鉴定并验证了具有凝血酶样活性的蛋白酶，推进了硅藻在生物技术中的应用 | 首次在三角褐指藻中发现具有凝血酶样活性的新型蛋白酶，并通过体内实验验证其切割效率 | NA | 探索三角褐指藻中凝血酶样蛋白的存在及其在生物工程中的应用潜力 | 三角褐指藻中的凝血酶样蛋白序列及其功能特性 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟分析、蛋白质结构预测、分子对接、Western blot | NA | 基因组序列、蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | 三角褐指藻 | 凝血酶识别序列LVPRGS的融合蛋白构建 | 工业生物技术 |