合成生物学相关文章
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当前共找到 69 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-11-17 |
Recent advances in the characterization of essential genes and development of a database of essential genes
2024-Feb, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.157
PMID:38868518
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综述 | 本文总结了必需基因的研究进展，概述了相关数据库，并讨论了它们的实际应用 | 建立了必需基因数据库（DEG），并提供了其主要应用的概述和最新版本的全面分析 | 必需基因是一个动态概念而非二元概念，这为未来的发展带来了机遇和挑战 | 促进必需基因的研究，支持药物和疫苗开发以及人工基因组设计与构建 | 必需基因及其相关数据库 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2024-11-09 |
Bioorthogonal Reactions in Bioimaging
2024-Feb-24, Topics in current chemistry (Cham)
DOI:10.1007/s41061-024-00452-1
PMID:38400853
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研究论文 | 本文讨论了生物正交化学工具在生物成像中的最新进展，特别是荧光探针设计和标记方案在细胞内/体内多色和/或超分辨率成像中的应用 | 本文介绍了生物正交化学工具与合成生物学方法的智能结合，以及新型探针设计在超分辨率显微镜中的应用 | NA | 探讨生物正交化学工具在生物成像中的应用，特别是荧光探针设计和标记方案的最新进展 | 生物分子在原生环境中的可视化以及更复杂的生物分子过程的成像辅助理解 | 生物化学 | NA | 生物正交化学 | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-10-29 |
The pAblo·pCasso self-curing vector toolset for unconstrained cytidine and adenine base-editing in Gram-negative bacteria
2024-Feb-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1236
PMID:38180826
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研究论文 | 开发了一种合成生物学工具包，利用CRISPR和改良的CRISPR相关蛋白（Cas）碱基编辑器，用于革兰氏阴性细菌的基因组工程 | 优化了胞嘧啶碱基编辑器（CBE）和腺嘌呤碱基编辑器（ABE），实现了对质粒和基因组目标的精确单核苷酸修饰，并开发了一系列诱导响应载体，简化了复杂的菌株工程程序 | NA | 开发用于革兰氏阴性细菌基因组工程的合成生物学工具包 | 革兰氏阴性细菌的基因组 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | 基因组数据 | Pseudomonas putida和其他革兰氏阴性细菌 |
| 4 | 2024-10-29 |
Synthetic Gene Circuits for Regulation of Next-Generation Cell-Based Therapeutics
2024-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309088
PMID:38126677
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综述 | 本文综述了合成基因电路在调控下一代细胞治疗中的应用 | 讨论了基于转录、翻译和翻译后控制机制的开关在体内调控治疗细胞活性的优势和局限性 | 尚未详细讨论合成基因电路在临床应用中的具体挑战和解决方案 | 探讨合成基因电路在细胞治疗中的应用及其对免疫反应的精确调控 | 合成基因电路、治疗细胞、慢性疾病 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-10-28 |
An efficient CRISPR/Cas9 genome editing system based on a multiple sgRNA processing platform in Trichoderma reesei for strain improvement and enzyme production
2024-Feb-11, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02468-7
PMID:38342915
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研究论文 | 开发了一种基于多sgRNA处理平台的CRISPR/Cas9基因编辑系统，用于提高Trichoderma reesei菌株的酶产量 | 提出了基于tRNA-sgRNA阵列的CRISPR-Cas9编辑系统，能够高效处理多个sgRNA，实现多基因编辑 | NA | 开发高效的基因编辑工具，提高Trichoderma reesei菌株的酶产量 | Trichoderma reesei菌株及其相关酶的生产 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | 基因序列 | NA |
| 6 | 2024-10-17 |
On the ever-growing functional versatility of the CRISPR-Cas13 system
2024-02, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14418
PMID:38381083
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研究论文 | 本文讨论了CRISPR-Cas13系统的功能多样性 | CRISPR-Cas13系统被重新用于解码和工程化基因表达程序，具有RNA沉默、RNA编辑、RNA追踪、核酸检测和翻译调控等多种功能 | NA | 探讨CRISPR-Cas13系统的功能多样性及其在系统生物学和合成生物学领域的应用 | CRISPR-Cas13系统及其功能 | NA | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-09-26 |
Measuring differential fitness costs and interactions between genetic cassettes using fluorescent spectrophotometry
2024-02-21, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01419-23
PMID:38299817
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研究论文 | 本文介绍了一种利用荧光分光光度法设计、执行和分析微生物竞争实验数据的方法 | 本文提出了一种新的方法来测量不同合成基因盒之间的差异适应性成本和相互作用，通过荧光报告基因标记不同的竞争菌株并使用荧光分光光度计解析个体生长曲线 | 本文提到了在荧光和密度校准以及荧光蛋白成熟速率不同方面的挑战 | 本文旨在开发一种方法来测量合成基因盒之间的差异适应性成本和相互作用 | 本文研究的对象是不同合成基因盒在微生物竞争实验中的表现 | 合成生物学 | NA | 荧光分光光度法 | NA | 荧光数据 | 10种不同的质粒和3种基因组整合的荧光标记的菌株 |
| 8 | 2024-09-10 |
Synthetic biology in microalgae towards fucoxanthin production for pharmacy and nutraceuticals
2024-02, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2023.115958
PMID:38052271
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综述 | 本文综述了合成生物学在微藻中用于提高岩藻黄素生产的原理和应用 | 本文提出了使用CRISPR-Cas9基因编辑、转录激活因子样效应核酸酶以及模块化组装和底盘工程等合成生物学工具，精确修改微藻基因组以提高岩藻黄素生产 | 本文主要讨论了合成生物学在微藻中的应用，但未详细探讨实际工业化生产的具体挑战和解决方案 | 探讨合成生物学在微藻中提高岩藻黄素生产的应用 | 微藻和岩藻黄素 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-24 |
From Farms to Pharma: A "Natural" History of Vaccine Production and Vaccine Skepticism
2024-02, American journal of public health
IF:9.6Q1
DOI:10.2105/AJPH.2023.307508
PMID:38175968
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研究论文 | 本文从历史角度探讨了疫苗与“自然”概念之间的关系，特别是通过分析19世纪中后期牛痘疫苗的生产过程及其对公众信任的影响。 | 文章通过历史案例展示了疫苗生产与公众信任建立的过程，强调了“自然”概念在公共卫生领域的多变性。 | NA | 探讨疫苗生产的历史背景及其与公众信任的关系。 | 疫苗生产的历史过程及其对公众信任的影响。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-10 |
A Survey of Recent Practice of Artificial Life in Visual Art
2024-Feb-01, Artificial life
IF:1.6Q2
DOI:10.1162/artl_a_00433
PMID:38393968
|
综述 | 本文综述了过去40年视觉艺术中人工生命的最新实践，特别是在计算和软件领域 | 提出了评价标准和分类法，并简要分析了不同类别的代表性艺术作品 | NA | 旨在提供一个系统性的概述，展示艺术家如何利用现代技术理解自然并创造新生命 | 视觉艺术中的人工生命作品 | 计算机视觉 | NA | 人工生命、人工智能、计算生物学和合成生物学 | NA | 艺术作品 | 过去40年的代表性艺术作品 |
| 11 | 2024-08-05 |
A synthetic microbial Daisyworld: planetary regulation in the test tube
2024-02, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2023.0585
PMID:38321922
|
研究论文 | 本文提出了一种微生物Daisyworld的合成实现，探讨行星调节的可能性 | 创新性地提出了使用基因工程和细胞工厂设计实现Lovelock模型的真实生物系统 | 目前的实现仍然只是理论和计算构建，缺乏实际的生物应用验证 | 探讨在合成生态系统中实现自我调节的可能性 | 研究对象是两个不同特性的微生物菌株的组合 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 理论和计算案例研究 | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Bacterial therapies at the interface of synthetic biology and nanomedicine
2024-Feb, Nature reviews bioengineering
DOI:10.1038/s44222-023-00119-4
PMID:38962719
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学和纳米医学技术改进细菌疗法的最新进展，重点讨论了其在提高安全性和疗效方面的潜力与挑战。 | 结合合成生物学和纳米医学技术，设计可控的细菌疗法系统，以实现空间和时间上的激活调控。 | 细菌疗法的复制和免疫刺激特性可能带来毒性风险。 | 探讨如何通过合成生物学和纳米医学的进步，解决细菌疗法的潜在毒性问题，并促进其临床应用。 | 细菌疗法在多种疾病治疗中的应用。 | 纳米医学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
POMBOX: A Fission Yeast Cloning Toolkit for Molecular and Synthetic Biology
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00529
PMID:37991801
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为POMBOX的裂殖酵母克隆工具包，用于分子和合成生物学中的遗传电路构建 | POMBOX工具包允许模块化组装多基因途径，并将可能的途径长度从6个转录单元增加到12个 | NA | 开发一种新的工具包，以解决裂殖酵母中缺乏用于生成多于一个转录单元的遗传电路的模块化工具的问题 | 裂殖酵母的遗传电路构建和代谢工程 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆 | NA | DNA序列 | 包括14个启动子和6个终止子，测试了4到24 kb的不同序列大小的基因组整合成功率 |
| 14 | 2024-08-07 |
The "Duckweed Dip": Aquatic Spirodela polyrhiza Plants Can Efficiently Uptake Dissolved, DNA-Wrapped Carbon Nanotubes from Their Environment for Transient Gene Expression
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00620
PMID:38127817
|
研究论文 | 研究报告了水生植物大浮萍（Spirodela polyrhiza）能够高效地从其生长介质中吸收包裹在DNA中的碳纳米管（DNA-CNTs），并实现转基因表达 | 提出了一种简化的转基因传递方法——“浮萍浸渍法”，无需大量纳米材料或直接渗透到植物组织中 | NA | 探索浮萍在植物生物技术中的应用潜力 | 水生植物大浮萍 | 植物生物技术 | NA | 碳纳米管（DNA-CNTs） | NA | DNA | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
Special Issue on Artificial Intelligence for Synthetic Biology
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00760
PMID:38214972
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Standardized Iterative Genome Editing Method for Escherichia coli Based on CRISPR-Cas9
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00585
PMID:38243901
|
研究论文 | 本文开发了一种基于CRISPR-Cas9的标准化迭代基因编辑系统，用于在宿主染色体中高效插入多个基因 | 该系统利用CRISPR-Cas9和MetClo组装技术，实现了高达100%的单一位点基因插入效率，并通过使用强启动子表达tracrRNA，将多基因插入效率提高到7.3% | NA | 开发一种高效且标准化的基因编辑方法，用于在宿主染色体中插入复杂的生物合成途径 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | DNA | 成功整合了5-10个基因的底盘细胞，产生了14种无抗生素、无质粒的生产者 |
| 17 | 2024-08-07 |
Synthetic Cell Lines for Inducible Packaging of Influenza A Virus
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00526
PMID:38259154
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研究论文 | 本文通过系统设计和合成生物学方法，开发了一种能够诱导产生流感A病毒（IAV）的合成细胞系 | 首次展示了创建用于生产细胞病变负链RNA病毒的包装细胞系的可能性 | RNA-Seq转录组分析显示，病毒RNA合成效率低下和宿主对病毒感染反应相关基因的上调表达可能是限制因素 | 开发一种新的方法用于制造病毒疫苗 | 流感A病毒（IAV）的合成细胞系 | 合成生物学 | 流感 | RNA-Seq | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 18 | 2024-08-07 |
DuBA.flow─A Low-Cost, Long-Read Amplicon Sequencing Workflow for the Validation of Synthetic DNA Constructs
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00522
PMID:38295293
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研究论文 | 本文介绍了一种低成本、长读长扩增子测序工作流程DuBA.flow，用于合成DNA构建体的验证 | 开发了一种高度可扩展的内部方法，使用长读长Nanopore测序快速验证扩增的DNA序列，并提供了自动分析管道 | NA | 验证合成DNA构建体的序列 | 合成DNA构建体，特别是质粒 | 合成生物学 | NA | Nanopore测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
The SARS-CoV-2 Mpro Dimer-Based Screening System: A Synthetic Biology Tool for Identifying Compounds with Dimerization Inhibitory Potential
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00446
PMID:38316139
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研究论文 | 本研究开发了一种基于SARS-CoV-2主蛋白酶（M）二聚体的筛选系统（DBSS），利用合成生物学在BL21(DE3)中进行，旨在识别具有二聚体抑制潜力的化合物。 | 本研究创新性地开发了一种可在较低生物安全级别的实验室中使用的筛选系统，用于初步筛选具有SARS-CoV-2 M二聚体抑制活性的药物候选物。 | NA | 开发一种新的SARS-CoV-2主蛋白酶二聚体筛选系统，以在较低生物安全级别下识别有效的抗病毒候选药物。 | SARS-CoV-2主蛋白酶二聚体及其抑制剂。 | 合成生物学 | COVID-19 | 蛋白质建模和分子对接 | NA | 蛋白质和细胞 | 浓度范围为4-10 μg/mL的saquinavir与未处理的控制组进行比较 |
| 20 | 2024-08-07 |
Exploration of the Native Sucrose Operon Enables the Development of an Inducible T7 Expression System in Paenibacillus polymyxa
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00689
PMID:38319655
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研究论文 | 本研究在Paenibacillus polymyxa中识别了天然蔗糖操纵子，并通过其结构和功能关系分析，建立了一个由蔗糖操纵子和T7启动子调控的级联T7表达系统，实现了可控的基因表达和表达效率的提高。 | 本研究首次在Paenibacillus polymyxa中建立了基于蔗糖操纵子的级联T7表达系统，实现了基因表达的可控性和效率的显著提升。 | NA | 开发适用于Paenibacillus polymyxa的合成生物学工具，提高其作为工业生产者的应用潜力。 | Paenibacillus polymyxa中的蔗糖操纵子及其在基因表达调控中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |