合成生物学相关文章
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当前共找到 70 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
The "Duckweed Dip": Aquatic Spirodela polyrhiza Plants Can Efficiently Uptake Dissolved, DNA-Wrapped Carbon Nanotubes from Their Environment for Transient Gene Expression
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00620
PMID:38127817
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研究论文 | 研究报告了水生植物大浮萍（Spirodela polyrhiza）能够高效地从其生长介质中吸收包裹在DNA中的碳纳米管（DNA-CNTs），并实现转基因表达 | 提出了一种简化的转基因传递方法——“浮萍浸渍法”，无需大量纳米材料或直接渗透到植物组织中 | NA | 探索浮萍在植物生物技术中的应用潜力 | 水生植物大浮萍 | 植物生物技术 | NA | 碳纳米管（DNA-CNTs） | NA | DNA | NA |
| 22 | 2024-08-07 |
Special Issue on Artificial Intelligence for Synthetic Biology
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00760
PMID:38214972
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
Standardized Iterative Genome Editing Method for Escherichia coli Based on CRISPR-Cas9
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00585
PMID:38243901
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研究论文 | 本文开发了一种基于CRISPR-Cas9的标准化迭代基因编辑系统，用于在宿主染色体中高效插入多个基因 | 该系统利用CRISPR-Cas9和MetClo组装技术，实现了高达100%的单一位点基因插入效率，并通过使用强启动子表达tracrRNA，将多基因插入效率提高到7.3% | NA | 开发一种高效且标准化的基因编辑方法，用于在宿主染色体中插入复杂的生物合成途径 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | DNA | 成功整合了5-10个基因的底盘细胞，产生了14种无抗生素、无质粒的生产者 |
| 24 | 2024-08-07 |
DuBA.flow─A Low-Cost, Long-Read Amplicon Sequencing Workflow for the Validation of Synthetic DNA Constructs
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00522
PMID:38295293
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研究论文 | 本文介绍了一种低成本、长读长扩增子测序工作流程DuBA.flow，用于合成DNA构建体的验证 | 开发了一种高度可扩展的内部方法，使用长读长Nanopore测序快速验证扩增的DNA序列，并提供了自动分析管道 | NA | 验证合成DNA构建体的序列 | 合成DNA构建体，特别是质粒 | 合成生物学 | NA | Nanopore测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
The SARS-CoV-2 Mpro Dimer-Based Screening System: A Synthetic Biology Tool for Identifying Compounds with Dimerization Inhibitory Potential
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00446
PMID:38316139
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研究论文 | 本研究开发了一种基于SARS-CoV-2主蛋白酶（M）二聚体的筛选系统（DBSS），利用合成生物学在BL21(DE3)中进行，旨在识别具有二聚体抑制潜力的化合物。 | 本研究创新性地开发了一种可在较低生物安全级别的实验室中使用的筛选系统，用于初步筛选具有SARS-CoV-2 M二聚体抑制活性的药物候选物。 | NA | 开发一种新的SARS-CoV-2主蛋白酶二聚体筛选系统，以在较低生物安全级别下识别有效的抗病毒候选药物。 | SARS-CoV-2主蛋白酶二聚体及其抑制剂。 | 合成生物学 | COVID-19 | 蛋白质建模和分子对接 | NA | 蛋白质和细胞 | 浓度范围为4-10 μg/mL的saquinavir与未处理的控制组进行比较 |
| 26 | 2024-08-07 |
Exploration of the Native Sucrose Operon Enables the Development of an Inducible T7 Expression System in Paenibacillus polymyxa
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00689
PMID:38319655
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研究论文 | 本研究在Paenibacillus polymyxa中识别了天然蔗糖操纵子，并通过其结构和功能关系分析，建立了一个由蔗糖操纵子和T7启动子调控的级联T7表达系统，实现了可控的基因表达和表达效率的提高。 | 本研究首次在Paenibacillus polymyxa中建立了基于蔗糖操纵子的级联T7表达系统，实现了基因表达的可控性和效率的显著提升。 | NA | 开发适用于Paenibacillus polymyxa的合成生物学工具，提高其作为工业生产者的应用潜力。 | Paenibacillus polymyxa中的蔗糖操纵子及其在基因表达调控中的应用。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Progress in Gene Editing and Metabolic Regulation of Saccharomyces cerevisiae with CRISPR/Cas9 Tools
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00685
PMID:38326929
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综述 | 本文综述了CRISPR/Cas9系统在基因编辑和代谢工程中的应用，包括基本原理和实际应用 | CRISPR/Cas9系统通过减少时间和劳动力，加速了微生物工程的发展，并增强了分子遗传学的理解 | NA | 总结CRISPR/Cas9系统在基因编辑和代谢调控中的研究进展 | CRISPR/Cas9系统在酵母中的应用 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Biofoundry-Scale DNA Assembly Validation Using Cost-Effective High-Throughput Long-Read Sequencing
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00589
PMID:38329009
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研究论文 | 本文介绍了一种利用成本效益高的长读长测序技术在生物铸造厂规模上验证DNA组装的方法 | 采用了牛津纳米孔测序技术，并开发了配套的Nextflow管道和Python包，以进行深入分析并生成详细报告 | NA | 验证组装、克隆或编辑的质粒的准确性 | 工程化/合成DNA构建体（质粒） | 合成生物学 | NA | 牛津纳米孔测序技术 | NA | DNA序列 | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
Shared and more specific genetic determinants and pathways underlying yeast tolerance to acetic, butyric, and octanoic acids
2024-Feb-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02309-0
PMID:38419072
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研究论文 | 本研究通过化学基因组学分析和生理学研究，揭示了酵母对醋酸、丁酸和辛酸耐受性的共享遗传决定因素和途径 | 首次报告了丁酸和辛酸的耐受基因列表，并提供了对线性链单羧酸毒性和耐受性机制的新生物学知识 | NA | 指导基因组工程，开发更健壮的酵母菌株，以实现可持续的生物转化过程 | 酵母对醋酸、丁酸和辛酸的耐受性 | NA | NA | 化学基因组学分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Unlocking the potential of optogenetics in microbial applications
2024-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102404
PMID:38039932
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综述 | 本文综述了光遗传学在微生物应用中的关键特征及其在理解生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用 | 光遗传学通过光动态操纵细胞行为，实现了其他方法无法达到的高时空精度 | 光遗传学主要被用作传统化学诱导剂的替代品 | 探讨光遗传学在微生物应用中的潜力和应用 | 微生物及其在生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用 | NA | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
Exploring the transcriptional landscape of phage-host interactions using novel high-throughput approaches
2024-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102419
PMID:38271748
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研究论文 | 本文探讨了使用新型高通量方法研究噬菌体与宿主相互作用的转录组景观 | 本文首次将高通量测序技术应用于噬菌体等微生物病毒，以详细描绘感染过程中未充分探索的RNA生物学和分子过程 | NA | 研究噬菌体感染细菌时引发的应激和扰动对细菌代谢和基因调控的新基本机制 | 噬菌体与宿主细菌的相互作用 | NA | NA | 高通量测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Carbon recycling with synthetic CO2 fixation pathways
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103023
PMID:38007984
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综述 | 本文综述了构建合成CO2固定途径的最新进展，并讨论了设计原则及面临的挑战 | 结合自养生物和异养生物的优势，通过合成生物学和代谢工程在异养生物中实现合成碳固定 | NA | 探讨如何通过合成碳固定途径实现碳循环，以缓解全球气候变化并支持地球上的生命 | 合成CO2固定途径及其在不同CO浓度下的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学和代谢工程 | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Pseudomonas putida as a synthetic biology chassis and a metabolic engineering platform
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103025
PMID:38061264
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研究论文 | 本文探讨了土壤细菌Pseudomonas putida（特别是KT2440菌株）作为合成生物学底盘和代谢工程平台的应用 | 本文展示了Pseudomonas putida在生物转化中的应用，包括生产有价值的化学品和降解/增值环境污染物，推动了传统酶学向自然界未探索反应的边界扩展 | NA | 研究Pseudomonas putida作为合成生物学底盘和代谢工程平台的潜力 | Pseudomonas putida KT2440菌株及其在生物转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传编程 | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Recent advances in the biological depolymerization and upcycling of polyethylene terephthalate
2024-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.103053
PMID:38128200
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综述 | 本文综述了利用生物技术分解聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）并进行升级回收的最新进展 | 通过蛋白质工程策略提高PET水解酶的催化活性和效率，以及开发新型PET水解酶以实现大规模PET解聚 | 成本效益仍然是一个挑战，需要进一步研究以使PET升级回收在经济上可行 | 开发生物工具用于PET分解，并将其转化为有价值的平台化学品和材料 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）及其分解产物 | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Photosynthesis 2.0: Realizing New-to-Nature CO2-Fixation to Overcome the Limits of Natural Metabolism
2024-02-01, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041669
PMID:37848245
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research paper | 本文探讨了通过合成生物学实现新型自然界未有的二氧化碳固定代谢途径，以克服自然光合作用的限制 | 提出了两种不同的策略：一是通过工程化植物实现碳中和或碳负性光呼吸代谢，如tatronyl-CoA途径，以提高二氧化碳吸收率；二是完全替代自然光合作用，引入如CETCH循环等替代性二氧化碳固定代谢途径，有望显著提高二氧化碳吸收率 | NA | 旨在通过合成生物学方法扩展植物代谢能力，以应对未来气候变化的挑战 | 工程化植物及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
OpenCell: A Low-cost, Open-Source, 3-in-1 device for DNA Extraction
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.18.558349
PMID:37808818
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研究论文 | 介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell，用于DNA提取 | OpenCell集成了珠磨机、微量离心机和涡旋混合器的功能，采用模块化附件和中央旋转无刷电机，设计紧凑且具有多种安全特性 | NA | 降低预算有限的实验室进行DNA提取的成本 | OpenCell设备的开发及其在DNA提取中的应用 | 合成生物学 | NA | 3D打印 | NA | NA | 使用OpenCell成功从菠菜中提取DNA，平均产量为2.3 μg |
| 37 | 2024-08-07 |
Engineering Terpene Production Pathways in Methylobacterium extorquens AM1
2024-Feb-29, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12030500
PMID:38543551
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研究论文 | 本文研究了在甲基杆菌AM1中通过代谢工程增强萜类化合物生产的可能性 | 通过操纵代谢途径，成功在甲基杆菌中增强了萜类化合物的生产，并展示了在植物叶际中工程菌株的定殖能力 | 使用中等强度的组成型启动子未能实现萜类化合物的生产 | 探索通过代谢工程在微生物中生产萜类化合物的方法 | 甲基杆菌AM1及其萜类化合物生产能力 | 微生物技术 | NA | 代谢工程 | NA | 微生物培养 | 涉及野生型、缺乏类胡萝卜素途径的甲基营养突变体和工程菌株 |
| 38 | 2024-08-07 |
Next-Generation Probiotics as Novel Therapeutics for Improving Human Health: Current Trends and Future Perspectives
2024-Feb-20, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12030430
PMID:38543481
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综述 | 本文综述了下一代益生菌（NGPs）作为改善人类健康的新型治疗药物的当前趋势和未来展望 | NGPs不仅可用于传统食品或膳食补充剂，还适用于制药应用，并提供了个性化益生菌治疗、合成生物学和基因编辑、组合疗法、靶向递送方法和治疗应用的机会 | NA | 探讨NGPs的潜在治疗效果及其在人类健康关键方面的影响 | 下一代益生菌（NGPs）及其在治疗慢性疾病中的应用 | NA | 慢性疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Engineering stringent genetic biocontainment of yeast with a protein stability switch
2024-Feb-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44988-8
PMID:38316765
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研究论文 | 本文描述了一种基于条件性稳定必需蛋白质的遗传编码生物遏制系统 | 该系统基于条件性蛋白质稳定性，机制上与先前报道的遗传生物遏制系统正交 | NA | 开发一种遗传编码的生物遏制系统，以确保工程微生物在开放环境应用中的安全性 | 酵母菌的遗传生物遏制系统 | 合成生物学 | NA | 遗传编码生物遏制系统 | NA | 基因数据 | 775个必需基因 |
| 40 | 2024-08-07 |
Developing Ganoderma lucidum as a next-generation cell factory for food and nutraceuticals
2024-02, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.07.008
PMID:37659953
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综述 | 本文探讨了利用现代合成生物学工具，通过分子策略解决Ganoderma lucidum中基因调控网络和同源重组频率低的瓶颈问题，以促进其作为食品和营养补充品的高效细胞工厂的开发 | 利用现代合成生物学技术，加速精确的多基因靶向和编辑，解开G. lucidum的生物合成机制 | Ganoderma lucidum中强大的调控网络和低频率的同源重组限制了分子工具和精确遗传标记的发展 | 将Ganoderma lucidum转化为高效的细胞工厂，用于食品和营养补充品的生产 | Ganoderma lucidum的生物合成机制和分子调控策略 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |