合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2024-08-07	Progress in Gene Editing and Metabolic Regulation of Saccharomyces cerevisiae with CRISPR/Cas9 Tools 2024-02-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00685 PMID:38326929	综述	本文综述了CRISPR/Cas9系统在基因编辑和代谢工程中的应用，包括基本原理和实际应用	CRISPR/Cas9系统通过减少时间和劳动力，加速了微生物工程的发展，并增强了分子遗传学的理解	NA	总结CRISPR/Cas9系统在基因编辑和代谢调控中的研究进展	CRISPR/Cas9系统在酵母中的应用	基因工程	NA	CRISPR/Cas9	NA	NA	NA
22	2024-08-07	Biofoundry-Scale DNA Assembly Validation Using Cost-Effective High-Throughput Long-Read Sequencing 2024-02-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00589 PMID:38329009	研究论文	本文介绍了一种利用成本效益高的长读长测序技术在生物铸造厂规模上验证DNA组装的方法	采用了牛津纳米孔测序技术，并开发了配套的Nextflow管道和Python包，以进行深入分析并生成详细报告	NA	验证组装、克隆或编辑的质粒的准确性	工程化/合成DNA构建体（质粒）	合成生物学	NA	牛津纳米孔测序技术	NA	DNA序列	NA
23	2024-08-07	Shared and more specific genetic determinants and pathways underlying yeast tolerance to acetic, butyric, and octanoic acids 2024-Feb-29, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-024-02309-0 PMID:38419072	研究论文	本研究通过化学基因组学分析和生理学研究，揭示了酵母对醋酸、丁酸和辛酸耐受性的共享遗传决定因素和途径	首次报告了丁酸和辛酸的耐受基因列表，并提供了对线性链单羧酸毒性和耐受性机制的新生物学知识	NA	指导基因组工程，开发更健壮的酵母菌株，以实现可持续的生物转化过程	酵母对醋酸、丁酸和辛酸的耐受性	NA	NA	化学基因组学分析	NA	基因组数据	NA
24	2024-08-07	Unlocking the potential of optogenetics in microbial applications 2024-02, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.mib.2023.102404 PMID:38039932	综述	本文综述了光遗传学在微生物应用中的关键特征及其在理解生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用	光遗传学通过光动态操纵细胞行为，实现了其他方法无法达到的高时空精度	光遗传学主要被用作传统化学诱导剂的替代品	探讨光遗传学在微生物应用中的潜力和应用	微生物及其在生物学、共培养、生物生产、生物材料和治疗学中的应用	NA	NA	光遗传学	NA	NA	NA
25	2024-08-07	Exploring the transcriptional landscape of phage-host interactions using novel high-throughput approaches 2024-02, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1 DOI:10.1016/j.mib.2023.102419 PMID:38271748	研究论文	本文探讨了使用新型高通量方法研究噬菌体与宿主相互作用的转录组景观	本文首次将高通量测序技术应用于噬菌体等微生物病毒，以详细描绘感染过程中未充分探索的RNA生物学和分子过程	NA	研究噬菌体感染细菌时引发的应激和扰动对细菌代谢和基因调控的新基本机制	噬菌体与宿主细菌的相互作用	NA	NA	高通量测序	NA	转录组数据	NA
26	2024-08-07	Carbon recycling with synthetic CO2 fixation pathways 2024-02, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2023.103023 PMID:38007984	综述	本文综述了构建合成CO2固定途径的最新进展，并讨论了设计原则及面临的挑战	结合自养生物和异养生物的优势，通过合成生物学和代谢工程在异养生物中实现合成碳固定	NA	探讨如何通过合成碳固定途径实现碳循环，以缓解全球气候变化并支持地球上的生命	合成CO2固定途径及其在不同CO浓度下的应用	合成生物学	NA	合成生物学和代谢工程	NA	NA	NA
27	2024-08-07	Pseudomonas putida as a synthetic biology chassis and a metabolic engineering platform 2024-02, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2023.103025 PMID:38061264	研究论文	本文探讨了土壤细菌Pseudomonas putida（特别是KT2440菌株）作为合成生物学底盘和代谢工程平台的应用	本文展示了Pseudomonas putida在生物转化中的应用，包括生产有价值的化学品和降解/增值环境污染物，推动了传统酶学向自然界未探索反应的边界扩展	NA	研究Pseudomonas putida作为合成生物学底盘和代谢工程平台的潜力	Pseudomonas putida KT2440菌株及其在生物转化中的应用	合成生物学	NA	遗传编程	NA	NA	NA
28	2024-08-07	Recent advances in the biological depolymerization and upcycling of polyethylene terephthalate 2024-02, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2023.103053 PMID:38128200	综述	本文综述了利用生物技术分解聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）并进行升级回收的最新进展	通过蛋白质工程策略提高PET水解酶的催化活性和效率，以及开发新型PET水解酶以实现大规模PET解聚	成本效益仍然是一个挑战，需要进一步研究以使PET升级回收在经济上可行	开发生物工具用于PET分解，并将其转化为有价值的平台化学品和材料	聚对苯二甲酸乙二醇酯（PET）及其分解产物	NA	NA	蛋白质工程	NA	NA	NA
29	2024-08-07	Photosynthesis 2.0: Realizing New-to-Nature CO2-Fixation to Overcome the Limits of Natural Metabolism 2024-02-01, Cold Spring Harbor perspectives in biology IF:6.9Q1 DOI:10.1101/cshperspect.a041669 PMID:37848245	research paper	本文探讨了通过合成生物学实现新型自然界未有的二氧化碳固定代谢途径，以克服自然光合作用的限制	提出了两种不同的策略：一是通过工程化植物实现碳中和或碳负性光呼吸代谢，如tatronyl-CoA途径，以提高二氧化碳吸收率；二是完全替代自然光合作用，引入如CETCH循环等替代性二氧化碳固定代谢途径，有望显著提高二氧化碳吸收率	NA	旨在通过合成生物学方法扩展植物代谢能力，以应对未来气候变化的挑战	工程化植物及其代谢途径	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
30	2024-08-07	OpenCell: A Low-cost, Open-Source, 3-in-1 device for DNA Extraction 2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.09.18.558349 PMID:37808818	研究论文	介绍了一种低成本、开源的3合1实验室设备OpenCell，用于DNA提取	OpenCell集成了珠磨机、微量离心机和涡旋混合器的功能，采用模块化附件和中央旋转无刷电机，设计紧凑且具有多种安全特性	NA	降低预算有限的实验室进行DNA提取的成本	OpenCell设备的开发及其在DNA提取中的应用	合成生物学	NA	3D打印	NA	NA	使用OpenCell成功从菠菜中提取DNA，平均产量为2.3 μg
31	2024-08-07	Genetic retargeting of E3 ligases to enhance CAR T cell therapy 2024-Feb-15, Cell chemical biology IF:6.6Q1 DOI:10.1016/j.chembiol.2023.10.024 PMID:37989314	研究论文	本文开发了一种双功能融合“降解”蛋白，通过连接目标蛋白和E3泛素连接酶复合体，强制目标蛋白的泛素化和降解，以增强CAR T细胞疗法的效果。	本文创新性地开发了条件性降解策略，使用可诱导的降解剂转基因表达或小分子依赖的E3招募，并设计了针对SMAD2和SMAD3的降解剂，以阻断SMAD依赖的TGFβ信号传导。	NA	开发新的方法来克服CAR T细胞疗法中的抑制信号，提高其抗肿瘤效能。	CAR T细胞疗法中的抑制信号和SMAD依赖的TGFβ信号传导。	生物技术	癌症	E3泛素连接酶	NA	蛋白质	NA
32	2024-08-07	Engineering Terpene Production Pathways in Methylobacterium extorquens AM1 2024-Feb-29, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms12030500 PMID:38543551	研究论文	本文研究了在甲基杆菌AM1中通过代谢工程增强萜类化合物生产的可能性	通过操纵代谢途径，成功在甲基杆菌中增强了萜类化合物的生产，并展示了在植物叶际中工程菌株的定殖能力	使用中等强度的组成型启动子未能实现萜类化合物的生产	探索通过代谢工程在微生物中生产萜类化合物的方法	甲基杆菌AM1及其萜类化合物生产能力	微生物技术	NA	代谢工程	NA	微生物培养	涉及野生型、缺乏类胡萝卜素途径的甲基营养突变体和工程菌株
33	2024-08-07	Next-Generation Probiotics as Novel Therapeutics for Improving Human Health: Current Trends and Future Perspectives 2024-Feb-20, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms12030430 PMID:38543481	综述	本文综述了下一代益生菌（NGPs）作为改善人类健康的新型治疗药物的当前趋势和未来展望	NGPs不仅可用于传统食品或膳食补充剂，还适用于制药应用，并提供了个性化益生菌治疗、合成生物学和基因编辑、组合疗法、靶向递送方法和治疗应用的机会	NA	探讨NGPs的潜在治疗效果及其在人类健康关键方面的影响	下一代益生菌（NGPs）及其在治疗慢性疾病中的应用	NA	慢性疾病	NA	NA	NA	NA
34	2024-08-07	Engineering stringent genetic biocontainment of yeast with a protein stability switch 2024-Feb-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-44988-8 PMID:38316765	研究论文	本文描述了一种基于条件性稳定必需蛋白质的遗传编码生物遏制系统	该系统基于条件性蛋白质稳定性，机制上与先前报道的遗传生物遏制系统正交	NA	开发一种遗传编码的生物遏制系统，以确保工程微生物在开放环境应用中的安全性	酵母菌的遗传生物遏制系统	合成生物学	NA	遗传编码生物遏制系统	NA	基因数据	775个必需基因
35	2024-08-07	Developing Ganoderma lucidum as a next-generation cell factory for food and nutraceuticals 2024-02, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2023.07.008 PMID:37659953	综述	本文探讨了利用现代合成生物学工具，通过分子策略解决Ganoderma lucidum中基因调控网络和同源重组频率低的瓶颈问题，以促进其作为食品和营养补充品的高效细胞工厂的开发	利用现代合成生物学技术，加速精确的多基因靶向和编辑，解开G. lucidum的生物合成机制	Ganoderma lucidum中强大的调控网络和低频率的同源重组限制了分子工具和精确遗传标记的发展	将Ganoderma lucidum转化为高效的细胞工厂，用于食品和营养补充品的生产	Ganoderma lucidum的生物合成机制和分子调控策略	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
36	2024-08-07	Dynamic plasmid copy number control for synthetic biology 2024-02, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2023.08.004 PMID:37689527	research paper	本文研究了用于合成生物学的动态质粒拷贝数控制	本文提出了一种动态控制质粒拷贝数的方法，该方法可以灵活调节质粒中基因或遗传电路的表达	NA	研究动态质粒拷贝数控制在合成生物学中的应用	质粒拷贝数的动态控制	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
37	2024-08-07	Noncanonical Streptococcus sanguinis ComCDE circuitry integrates environmental cues in transformation outcome decision 2024-Feb-15, Cell chemical biology IF:6.6Q1 DOI:10.1016/j.chembiol.2023.09.007 PMID:37832551	研究论文	本文介绍了链球菌属血链球菌中一种新的竞争-捕食协调机制，该机制通过非典型的ComCDE电路整合环境信号，影响转化结果的决策	发现了血链球菌中不同于其他链球菌的ComCDE电路，并揭示了其独特的竞争刺激肽（CSP）切割和出口机制	NA	研究血链球菌中竞争-捕食协调机制的新类型	血链球菌的ComCDE电路及其在环境信号整合中的作用	微生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
38	2024-08-07	Microbial production of N-acetyl-D-glucosamine (GlcNAc) for versatile applications: Biotechnological strategies for green process development 2024-Feb, Carbohydrate research IF:2.4Q2 DOI:10.1016/j.carres.2024.109039 PMID:38277719	综述	本文综述了利用微生物生产N-乙酰-D-氨基葡萄糖（GlcNAc）的生物技术策略，以及其在制药、食品、化妆品和生物燃料行业的广泛应用	介绍了利用代谢工程和合成生物学的新技术，如底物共利用策略、启动子工程和CRISPR干扰系统，来提高GlcNAc的产量和降低生产成本	需要进一步的过程优化、代谢通量优化和从培养基中高效回收GlcNAc，以实现高产品产量的目标	探讨微生物工程在生产重要药物中的潜在应用，并推动未来研究方向的发展	N-乙酰-D-氨基葡萄糖（GlcNAc）的生产和应用	生物技术	NA	代谢工程，合成生物学	NA	NA	NA
39	2024-08-07	Structure-function analysis of the cyclic β-1,2-glucan synthase from Agrobacterium tumefaciens 2024-Feb-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-45415-8 PMID:38418509	研究论文	研究了来自Agrobacterium tumefaciens的环状β-1,2-葡聚糖合酶（Cgs）的结构与功能	揭示了CβG合成的独特机制，使用酪氨酸连接的低聚糖中间体在葡聚糖链的聚合和加工循环中	NA	阐明CβG合成的机制并探索对抗依赖多糖毒力因子的病原体的可能性	环状β-1,2-葡聚糖合酶（Cgs）及其合成机制	微生物学	NA	冷冻电子显微镜（cryo-EM）	NA	蛋白质结构	NA
40	2024-08-07	Enzymatic Degradation of Deoxynivalenol with the Engineered Detoxification Enzyme Fhb7 2024-Feb-26, JACS Au IF:8.5Q1 DOI:10.1021/jacsau.3c00696 PMID:38425922	研究论文	本文报道了Fhb7酶的首次结构解析及其独特的催化机制，并通过工程化改造提高了其稳定性和DON降解性能。	首次解析了Fhb7酶的结构，并揭示了其在谷胱甘肽-S转移酶家族中的独特催化机制。通过工程化改造，显著提高了Fhb7酶的稳定性和DON降解性能。	Fhb7酶的稳定性较差，且其催化机制的复杂性限制了其实际应用。	研究Fhb7酶的结构和催化机制，并通过工程化改造提高其在DON降解中的应用潜力。	Fhb7酶及其在降解脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）中的应用。	生物技术	NA	谷胱甘肽-S转移酶（GST）	NA	结构数据	NA