合成生物学相关文章
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当前共找到 69 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-07 |
Postamplifying Cas12a Activation through Hybridization Chain Reaction-Triggered Fluorescent Nanocluster Formation for Ultrasensitive Nucleic Acid Detection
2024-Feb-28, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c18732
PMID:38353672
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研究论文 | 本文开发了一种无需标记的系统，通过整合杂交链反应（HCR）和DNA-铜纳米簇（DNA-CuNCs）来后放大Cas12a的激活，实现超灵敏的核酸检测 | 首次利用HCR操纵DNA-CuNC的形成，以实现高度灵敏和成本效益的Cas12a报告 | NA | 开发一种新的生物传感平台，用于提高Cas12a激活的检测灵敏度和成本效益 | Cas12a激活的检测和猴痘病毒（MPXV）的检测 | 生物传感 | NA | CRISPR/Cas12a, 杂交链反应（HCR）, DNA-铜纳米簇（DNA-CuNCs） | NA | DNA | 检测极限为5 fM的DNA，以及在人血清中检测到1份猴痘病毒（MPXV）质粒 |
| 42 | 2024-08-07 |
Advanced probiotics: bioengineering and their therapeutic application
2024-Feb-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-024-09309-8
PMID:38403783
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术改造乳酸菌（LAB）以增强其治疗应用的方法和科学原理 | 介绍了下一代设计型益生菌的创建，这些益生菌具有增强的耐受性和特殊能力，有助于深入了解益生菌生理影响的分子机制及其与宿主和微生物群的相互作用 | NA | 旨在提供关于创建改良益生菌的方法及其在治疗炎症性肠病、癌症、细菌感染和各种代谢疾病中的应用的简要概述 | 乳酸菌（LAB）及其在医学领域的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病, 癌症, 细菌感染, 代谢疾病 | 基因编辑技术 | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
Engineering and transcriptome study of Saccharomyces cerevisiae to produce ginsenoside compound K by glycerol
2024-Feb, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202300383
PMID:38403397
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法改造酵母菌Saccharomyces cerevisiae，以甘油为碳源生产人参皂苷化合物K | 工程菌株能够利用甘油作为唯一碳源，显著提高人参皂苷化合物K的产量，达到433.1 ± 8.3 mg/L，是葡萄糖培养基中的2.4倍 | NA | 探索甘油作为碳源在酵母菌中生产人参皂苷化合物K的效果 | 酵母菌Saccharomyces cerevisiae | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 44 | 2024-08-07 |
Enhancing the safety of CAR-T cell therapy: Synthetic genetic switch for spatiotemporal control
2024-Feb-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj6251
PMID:38394207
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法增强CAR-T细胞疗法的安全性和可控性，特别是在时间和空间维度上的控制方法。 | 介绍了基于遗传工程技术的合成生物学方法，用于构建人工细胞或生物体，以实现CAR-T细胞疗法的可控性。 | NA | 探讨如何通过合成生物学方法提高CAR-T细胞疗法的安全性和可控性。 | CAR-T细胞疗法的安全性和可控性。 | 生物技术 | 癌症 | 遗传工程技术 | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-07 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2024-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.579278
PMID:38370680
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meta-analysis | 本研究通过多队列分析炎症性肠病（IBD）患者和健康对照者的肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇（BGCs），发现与IBD显著相关的Clostridia来源的BGCs，并利用合成生物学方法鉴定了六种脂肪酸酰胺作为这些BGCs的产物。 | 首次通过多队列分析和合成生物学方法，鉴定了与IBD相关的肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇及其产物，并展示了这些小分子在动物模型中加剧肠道炎症的作用。 | NA | 探索肠道微生物组与炎症性肠病之间的分子和功能联系。 | 炎症性肠病患者和健康对照者的肠道微生物组中的小分子生物合成基因簇。 | NA | 炎症性肠病 | 合成生物学 | NA | metagenomic | 5,306个肠道微生物组样本，包括2,033名IBD患者和833名健康对照者 |
| 46 | 2024-08-07 |
A versatile in situ cofactor enhancing system for meeting cellular demands for engineered metabolic pathways
2024-Feb, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105598
PMID:38159859
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研究论文 | 本文介绍了一种利用木糖还原酶和乳糖（XR/lactose）系统提高大肠杆菌中糖磷酸盐池水平的方法，该池与NAD(P)H、FAD、FMN和ATP的生物合成相关 | 开发了一种新的系统XR/lactose，能够增加代谢工程细胞中辅因子的前体量，从而提高细胞的生产力 | 文章未明确指出具体的局限性 | 旨在解决代谢工程细胞中辅因子不平衡问题，提高细胞的生产力 | 研究对象包括脂肪酸醇生物合成、生物发光光产生和烷烃生物合成等不同的代谢工程细胞系统 | 合成生物学 | NA | 代谢组学分析、转录组学分析 | NA | 代谢物数据、转录数据 | 涉及三种不同的代谢工程细胞系统 |
| 47 | 2024-08-07 |
DNA-Diffusion: Leveraging Generative Models for Controlling Chromatin Accessibility and Gene Expression via Synthetic Regulatory Elements
2024-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.01.578352
PMID:38352499
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研究论文 | 本文利用扩散模型设计特定上下文的DNA调控序列，以实现精确的基因表达控制 | 本文首次利用扩散模型设计特定细胞类型的合成200 bp调控元件，这些元件具有精确调节基因表达的潜力 | NA | 开发一种新的方法来系统地修改和优化调控元件，以实现精确的基因表达控制 | DNA调控序列及其在不同细胞类型中的基因表达调控能力 | 合成生物学 | NA | 扩散模型 | 扩散模型 | DNA序列 | 合成200 bp调控元件 |
| 48 | 2024-08-07 |
Expression and Purification of Cp3GT: Structural Analysis and Modeling of a Key Plant Flavonol-3-O Glucosyltransferase from Citrus paradisi
2024-Feb-07, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech13010004
PMID:38390907
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研究论文 | 本研究聚焦于植物黄酮醇特异性3-O葡萄糖基转移酶（Cp3GT）的规模化表达、纯化及其结构分析与建模 | 通过优化培养条件和纯化过程，成功解决了重组蛋白生产中的蛋白酶降解问题，并实现了Cp3GT的高纯度制备 | NA | 研究Cp3GT的结构和功能机制，为合成生物学和酶工程在制药应用中的发展提供支持 | 植物黄酮醇特异性3-O葡萄糖基转移酶（Cp3GT） | 生物技术 | NA | 亲和层析、阴离子交换层析和尺寸排阻层析 | AlphaFold2 | 蛋白质结构 | NA |
| 49 | 2024-08-07 |
A non-equilibrium dissipation system with tunable molecular fuel flux
2024-Feb-22, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d3nr06136a
PMID:38334944
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研究论文 | 本文报道了一种基于动态DNA纳米技术的仿生耗散系统，该系统具有可调节的分子燃料通量 | 通过调节链置换和酶反应速率，控制燃料通量并进一步调节非平衡瞬态状态的强度，实现了对金纳米粒子动态组装和解组的调控 | NA | 展示一种具有可调节分子燃料通量的耗散系统，并探讨其在生物仿生学、合成生物学、智能材料、生物传感及人工细胞等领域的应用潜力 | 仿生耗散系统及其在金纳米粒子组装和解组中的应用 | 合成生物学 | NA | 动态DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
Precise integration of large DNA sequences in plant genomes using PrimeRoot editors
2024-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01769-w
PMID:37095350
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PrimeRoot的基因编辑方法，用于在植物基因组中精确插入大型DNA片段 | PrimeRoot编辑器采用了优化的引导RNA设计、增强的植物编辑器和先进的重组酶，能够实现高达11.1千碱基的精确DNA插入 | NA | 开发一种技术，用于在植物基因组中精确插入大型DNA片段，以促进农业特性和信号及代谢途径的引入 | 植物基因组和基因调控元件 | 基因编辑 | NA | PrimeRoot编辑器 | NA | DNA序列 | 在Kitaake水稻中进行了基因盒的整合，获得了含有预期插入的编辑植物，效率为6.3% |
| 51 | 2024-08-07 |
A genetic toolbox to empower Paracoccus pantotrophus DSM 2944 as a metabolically versatile SynBio chassis
2024-Feb-15, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02325-0
PMID:38360576
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研究论文 | 本研究旨在将Paracoccus pantotrophus DSM 2944转化为高效的合成生物学底盘，并开发了一套遗传工具箱以实现基因编辑和多种应用的可能性 | 成功开发了一套遗传工具箱，包括抗生素抗性分析、复制起点选择、基因转移方法评估、基因删除和整合技术，以及适应性实验室进化，以增强底盘的代谢多样性和应用潜力 | NA | 将Paracoccus pantotrophus DSM 2944发展为高效的合成生物学底盘 | Paracoccus pantotrophus DSM 2944的遗传改造和应用潜力 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 基因组数据 | 单个菌株Paracoccus pantotrophus DSM 2944 |
| 52 | 2024-08-07 |
Cytokine signaling in chimeric antigen receptor T-cell therapy
2024-Feb-14, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxad033
PMID:37591521
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综述 | 本文综述了通过基因工程调节细胞因子信号以增强嵌合抗原受体T细胞（CAR-T细胞）治疗效果的合成生物学方法 | 提出了通过基因工程调节CAR-T细胞中的细胞因子信号，包括外源表达细胞因子和细胞因子受体，以及通过转录和表观遗传修饰增强自分泌IL-2信号 | 文章未明确提及具体限制 | 旨在探讨如何通过调节细胞因子信号来增强CAR-T细胞的治疗效果并减轻相关毒性 | CAR-T细胞及其在治疗中的应用 | 免疫疗法 | 血液恶性肿瘤 | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Choreographing root architecture and rhizosphere interactions through synthetic biology
2024-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45272-5
PMID:38355570
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学技术调控植物根系结构及其与根际微生物相互作用，以应对气候变化对全球粮食安全和生物能源的威胁 | 利用合成遗传电路技术控制植物根系结构和功能及其相关微生物群落，为培育适应气候变化的作物提供新策略 | NA | 通过合成生物学技术改善植物根系及其与根际微生物的相互作用，以增强作物对气候变化的适应性 | 植物根系结构、根系分泌物及根表微生物活性 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路 | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-07 |
An open-source, 3D printed inkjet DNA synthesizer
2024-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53944-x
PMID:38355610
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研究论文 | 本文介绍了一种开源的3D打印喷墨DNA合成器（OpenIDS），该设备利用3D打印、Arduino和Raspberry Pi技术，实现了高密度寡核苷酸的合成，具有易于构建、快速部署和灵活扩展的特点。 | OpenIDS采用开源设计和3D打印技术，降低了生产成本，并允许用户根据研究需求自由修改结构和添加打印头。 | NA | 开发一种成本低廉、易于构建和操作的DNA合成设备，以支持生物学领域的研究。 | 开源喷墨DNA合成器的设计、构建和性能验证。 | 合成生物学 | NA | 3D打印, Arduino, Raspberry Pi | NA | 寡核苷酸 | 在15×25毫米的硅片上合成了144个点的寡核苷酸 |
| 55 | 2024-08-07 |
A robust yeast chassis: comprehensive characterization of a fast-growing Saccharomyces cerevisiae
2024-Feb-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03196-23
PMID:38214535
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研究论文 | 本研究全面描述了一种新型快速生长酵母菌株XP的特性，并通过基因组、转录组和代谢组分析揭示了其快速生长的机制 | 开发了一种遗传可塑性强的快速生长酵母菌株XP，并构建了用于遗传操作的工具箱，用于高效生产l-乳酸 | NA | 探索和优化用于合成生物学的稳健底盘 | 新型快速生长酵母菌株XP及其遗传操作工具箱 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、转录组分析、代谢组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | 一种新型酵母菌株XP |
| 56 | 2024-08-07 |
Protein-Rich Rafts in Hybrid Polymer/Lipid Giant Unilamellar Vesicles
2024-Feb-12, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.3c00972
PMID:38190609
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研究论文 | 本文介绍了在混合聚合物/脂质巨型单层囊泡（GUVs）中共同重组质子泵氧化酶和质子消耗ATP合酶的方法 | 本文提出了一种新的重组方法，通过融合/电形成技术，允许定制重组协议和控制囊泡大小，并提供了蛋白质标记的合成机制，模拟自然界中的相分离和蛋白质隔离 | 目前该方法主要限于天然脂质，对复杂和敏感的膜蛋白的同时插入仍具有实验挑战性 | 研究脂质筏在细胞功能中的作用，并开发一种合成替代方法来模拟细胞行为 | 质子泵氧化酶和质子消耗ATP合酶在混合聚合物/脂质巨型单层囊泡中的重组 | NA | NA | 融合/电形成技术 | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
De novo design of modular protein hydrogels with programmable intra- and extracellular viscoelasticity
2024-Feb-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2309457121
PMID:38289949
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研究论文 | 本文利用计算设计方法，研究了蛋白质水凝胶的宏观粘弹性与其分子参数之间的关系 | 通过计算设计异二聚体可逆交联同寡聚体组件，实现了水凝胶在静止和低剪切下呈现流体特性，在高频率下呈现固体特性的独特行为 | NA | 探究蛋白质水凝胶的宏观粘弹性与其分子参数之间的关系 | 蛋白质水凝胶的分子参数及其宏观粘弹性 | 生物医学工程 | NA | 计算设计 | NA | 蛋白质水凝胶 | 涉及2、5、24或120个蛋白质组件的同寡聚体 |
| 58 | 2024-08-07 |
Enhancing circuit stability under growth feedback with supplementary repressive regulation
2024-Feb-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad1233
PMID:38164993
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research paper | 本文提出了一种通过在生长敏感的双稳态电路中加入抑制边来增强电路稳定性的策略 | 通过模拟和体外实验，展示了这种额外的抑制节点如何稳定蛋白质水平并增强双稳态电路对生长反馈的鲁棒性 | NA | 实现电路性能的稳健性，稳定和隔离电路行为以抵抗生长变化 | 生长敏感的双稳态电路及其在生长反馈下的稳定性 | synthetic biology | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Efficient natural plasmid transformation of Vibrio natriegens enables zero-capital molecular biology
2024-Feb, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgad444
PMID:38352175
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研究论文 | 本文介绍了一种高效的自然转化方法，用于在Vibrio natriegens中进行质粒转化，无需额外设备，实现了零成本分子生物学操作 | 开发了一种新的最小化竞争媒体（MCM），使用乙酸盐作为能源，使得细胞在同一媒体中完成创建、转化和恢复，无需更换或添加新鲜媒体 | NA | 探索Vibrio natriegens作为低成本和高可扩展性合成生物学底盘的潜力 | Vibrio natriegens的自然转化能力及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 自然转化 | NA | DNA | 10 cfu/μg |
| 60 | 2024-08-07 |
Transcriptomic and physiological analysis of the response of Spirodela polyrrhiza to sodium nitroprusside
2024-Feb-08, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-024-04766-6
PMID:38331719
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研究论文 | 研究了Spirodela polyrrhiza对硝普钠（SNP）的转录组和生理反应 | 揭示了SNP处理后S. polyrrhiza中代谢通量重新定向至淀粉合成和黄酮类化合物合成途径的机制 | NA | 探究SNP对S. polyrrhiza生长和代谢通量的影响及其分子机制 | Spirodela polyrrhiza对硝普钠的反应 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 2776个差异表达基因（1425个上调和1351个下调） |