合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-04-03	Targeting solid tumor antigens with chimeric receptors: cancer biology meets synthetic immunology 2024-Apr, Trends in cancer IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.003 PMID:38355356	review	本文回顾了针对实体瘤抗原的嵌合抗原受体（CAR）T细胞疗法的研究现状和临床应用	从癌症生物学和基因调控的角度探讨实体瘤靶抗原，并结合新兴临床数据讨论CAR-T细胞疗法	主要关注早期临床试验数据，尚未涉及大规模临床验证	探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的应用和发展	实体瘤靶抗原和CAR-T细胞疗法	合成免疫学	实体瘤	CAR-T细胞疗法	NA	临床数据	NA
2	2025-03-26	From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts 2024-04-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00637 PMID:38587290	research paper	该研究从自然微生物筛选出发，通过基因工程实现在外源宿主中持续表达几丁质酶活性	开发了一种从自然微生物筛选到外源宿主中稳定表达几丁质酶的完整流程，并发现了一种能在胶体几丁质存在时上调表达的启动子	未提及具体在非标准宿主中的几丁质酶活性持续时间数据	开发可持续几丁质酶活性的生物技术应用方案	海洋微生物来源的几丁质酶基因及外源表达宿主	合成生物学	NA	全基因组测序、异源表达、核糖体结合位点优化	NA	基因组数据、酶活性数据	未明确说明海洋水样具体数量
3	2025-03-23	Rational evolution for altering the ligand preference of estrogen receptor alpha 2024-Apr, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1 DOI:10.1002/pro.4940 PMID:38511482	研究论文	本文通过结合理性蛋白质设计、多位点定向诱变和定向进化技术，成功改变了雌激素受体α的配体偏好，使其对乳腺癌治疗药物他莫昔芬产生响应	开发了一种名为TERRA的雌激素受体变体，该变体失去了对雌激素的响应性，转而被他莫昔芬激活，这一特性在哺乳动物细胞和小鼠中得以保持	未明确提及具体局限性	改变雌激素受体α的配体偏好，以扩展哺乳动物合成生物学工具箱	雌激素受体α	合成生物学	乳腺癌	理性蛋白质设计、多位点定向诱变、定向进化	NA	NA	NA
4	2025-03-19	Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling 2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.04.25.591074 PMID:38712145	研究论文	本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感信号放大电路，通过利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录来回收DNA链置换电路中的核酸输入	开发了PSR电路，扩展了无细胞生物传感的能力，实现了高特异性和低检测限的RNA目标直接传感	NA	扩展无细胞电路的能力，通过PSR实现信号放大，用于生物技术中的多种应用	RNA目标和小分子检测	合成生物学	NA	聚合酶链回收（PSR），DNA链置换电路	双平衡模型	核酸	NA
5	2025-03-09	Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types 2024-Apr-22, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13036-024-00424-5 PMID:38649904	研究论文	本文研究了水通道蛋白Aqp1在多种细胞类型中作为磁共振成像报告基因的安全性和有效性	研究表明Aqp1过表达不会对细胞活力或形态产生不利影响，且不会引起ER应激，这为Aqp1作为遗传报告基因的广泛应用提供了安全依据	研究仅限于小鼠和人类细胞系，未涉及体内实验	评估Aqp1作为磁共振成像报告基因的安全性和有效性	小鼠和人类来源的多种细胞系	生物医学工程	NA	磁共振成像	NA	细胞生理数据	多种小鼠和人类细胞系
6	2025-02-26	Utilizing microbial metabolite in catalytic cascade synthesis of conjugated oligomers for In-Situ regulation of biological activity 2024-04, Bioorganic chemistry IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107188 PMID:38377815	研究论文	本文结合微生物代谢途径和钯催化过程，用于原位生成具有生物活性的共轭寡聚物	将微生物代谢途径与钯催化过程结合，实现生物活性共轭寡聚物的原位合成	NA	研究生物代谢与化学催化反应的结合，以实现非天然分子的生物合成和生物活性的原位调控	工程化大肠杆菌及其代谢产物	合成生物学	NA	钯催化的Heck反应	NA	NA	NA
7	2025-02-23	Metabolic Engineering of Escherichia coli for the Production of l-Homoserine 2024-Apr-25, Chem & bio engineering DOI:10.1021/cbe.3c00077 PMID:39974203	综述	本文综述了通过系统代谢工程策略提高大肠杆菌中l-高丝氨酸生产的最新进展	总结了通过阻断竞争和降解途径、增强关键酶和前体、以及运输系统的基因改造等策略来提高l-高丝氨酸生产的系统性方法	NA	提高l-高丝氨酸的微生物工业生产	大肠杆菌	合成生物学与生物技术	NA	微生物发酵	NA	NA	NA
8	2025-01-07	Toward the Exploitation of Sustainable Green Factory: Biotechnology Use of Nannochloropsis spp 2024-Apr-25, Biology DOI:10.3390/biology13050292 PMID:38785776	综述	本文综述了利用Nannochloropsis spp作为绿色生物工厂的现状，特别是核基因操作技术的应用	探讨了合成生物学和基因工具在Nannochloropsis spp中的应用，以提高其作为绿色生物工厂的潜力	Nannochloropsis spp的工业应用尚未实现，仍需进一步研究	探索利用Nannochloropsis spp作为可持续绿色生物工厂的潜力	Nannochloropsis spp微藻	生物技术	NA	核基因操作技术	NA	NA	NA
9	2024-11-06	Variable orthogonality of RDF - large serine integrase interactions within the ϕC31 family 2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.04.03.587898 PMID:38617232	研究论文	研究了三种相关整合酶（ϕC31、ϕBT1和TG1）及其重组方向性因子（RDF）在整合和切除反应中的正交性	发现不同整合酶-RDF对之间的正交性存在差异，TG1整合酶在正交性和方向性方面表现最佳	整合酶/RDF对的正交性较弱，需要进一步识别和表征更多的整合酶-RDF对	研究整合酶及其RDF在基因组修饰应用中的正交性和方向性	三种相关整合酶（ϕC31、ϕBT1和TG1）及其RDF	合成生物学	NA	AlphaFold-Multimer	NA	NA	三种整合酶及其RDF
10	2024-10-24	Measuring the burden of hundreds of BioBricks defines an evolutionary limit on constructability in synthetic biology 2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.04.08.588465 PMID:38645188	研究论文	研究了301个BioBricks在高拷贝质粒上对宿主细胞生长速率的影响	首次系统测量了大量BioBricks对宿主细胞生长速率的负担，并开发了一个交互式网络工具用于合成生物学教育	研究仅限于高拷贝质粒上的BioBricks，未涵盖其他类型的DNA序列	探讨合成生物学中工程化DNA对宿主细胞生长速率的影响及其进化限制	301个BioBricks及其对宿主细胞生长速率的影响	合成生物学	NA	NA	NA	NA	301个BioBricks
11	2024-08-07	Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening 2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.30.587094 PMID:38617214	研究论文	本文通过高通量声学筛选技术，对声学报告基因进行定向进化，以增强其在非侵入性生物成像中的应用	开发了一种新的高通量、半自动声学筛选方法，用于筛选突变库，以增强非线性超声散射	NA	通过定向进化提高声学报告基因的非线性超声散射能力	声学报告基因及其在生物成像中的应用	合成生物学	NA	高通量声学筛选	NA	声学信号	两轮进化实验，涉及两种同源GV结构蛋白的扫描位点饱和库
12	2024-08-07	Advancements in the Application of Ribosomally Synthesized and Post-Translationally Modified Peptides (RiPPs) 2024-Apr-15, Biomolecules IF:4.8Q1 DOI:10.3390/biom14040479 PMID:38672495	综述	本文综述了核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs）在治疗应用中的最新进展和潜力	介绍了合成生物学和生物信息学在RiPP生产和工程中的新方法，如异源表达、遗传重构和利用修饰酶的底物耐受性	NA	探讨RiPP研究中的当前进展和利用这些生物活性肽进行治疗应用的潜在机会	核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs）及其在治疗应用中的潜力	生物化学	NA	合成生物学、生物信息学	NA	NA	NA
13	2024-08-07	CXCR4-Expressing Mesenchymal Stem Cells Derived Nanovesicles for Rheumatoid Arthritis Treatment 2024-04, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1 DOI:10.1002/adhm.202303300 PMID:38145406	研究论文	本文介绍了一种新型细胞膜模拟纳米囊泡，源自基因工程改造的间充质干细胞，作为类风湿性关节炎治疗的一种潜在抗炎平台。	利用合成生物学方法，将CXCR4锚定的间充质干细胞膜融合到载药聚合物核心上，构建出仿生纳米颗粒，这些纳米颗粒能够作为趋化因子SDF-1的诱饵，用于治疗关节炎。	NA	实现免疫逃避，减缓体内清除，并提高靶向性。	基因工程改造的间充质干细胞衍生的纳米囊泡。	纳米医学	类风湿性关节炎	合成生物学	NA	纳米颗粒	胶原蛋白诱导的关节炎小鼠
14	2024-08-07	GMOCU: Digital Documentation, Management, and Biological Risk Assessment of Genetic Parts 2024-04, Advanced biology IF:3.2Q3 DOI:10.1002/adbi.202300529 PMID:38263723	研究论文	本文介绍了一种名为GMOCU的标准化半自动软件方法，用于遗传部件和转基因生物（GMOs）的实验室内部数据文档化、管理和生物风险评估	GMOCU软件通过自动化生物风险评估和维护共享的最新生物部件库存，简化了实验室内部的文档管理和数据共享流程	NA	开发一种标准化的软件工具，以简化遗传部件和转基因生物的文档化、管理和生物风险评估	遗传部件和转基因生物的文档化、管理和生物风险评估	合成生物学	NA	NA	NA	数据	NA
15	2024-08-07	Cell-Free Protein Expression in Polymer Materials 2024-04-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00628 PMID:38467017	研究论文	本文展示了在聚合物材料中使用无细胞蛋白合成技术（CFPS）的可能性，并验证了其在高温和有机溶剂环境下的耐受性	首次证明了干燥的CFPS反应在聚合物材料制备过程中对热和有机溶剂的高耐受性，并展示了其在塑料中实现空间模式化的遗传功能、现场产生抗菌剂和进行传感反应的应用	NA	探索在固体材料中实现生物系统功能的可能性	无细胞蛋白合成技术在聚合物材料中的应用	合成生物学	NA	无细胞蛋白合成（CFPS）	NA	聚合物材料	NA
16	2024-08-07	Ensemble Detection of DNA Engineering Signatures 2024-04-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00398 PMID:38468602	研究论文	开发了一个名为GUARDIAN的系统，用于自动检测DNA测序数据中的工程痕迹，并通过盲测验证其有效性	采用集成方法，通过组合多种检测策略提高检测准确性，无需专家审查	NA	解决合成生物学中基因工程生物的潜在滥用或意外释放问题	检测DNA测序数据中的工程痕迹	生物技术	NA	DNA测序	集成方法	DNA序列数据	13个目标生物
17	2024-08-07	Engineering Plant Cell Fates and Functions for Agriculture and Industry 2024-04-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00047 PMID:38573786	观点	本文讨论了通过细胞基因组学和合成生物学工具，如生物传感器和DNA记录设备，来优化植物细胞特异性程序和细胞命运，以改善植物形态、环境响应和有价值化合物的生产	结合细胞基因组学和合成生物学工具，探讨了细胞特异性工程的新兴机会	对许多植物发育程序和细胞类型特异性功能的理解仍不完整	探讨如何利用合成生物学方法优化植物形态和提高有价值化合物的生产	植物细胞命运和功能	NA	NA	细胞基因组学，合成生物学	NA	NA	NA
18	2024-08-07	Investigating the Effect of RNA Scaffolds on the Multicolor Fluorogenic Aptamer Pepper in Different Bacterial Species 2024-04-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00009 PMID:38593047	研究论文	研究RNA支架对多色荧光适配体Pepper在不同细菌种类中的影响	发现了一种名为DF30-tRNA的RNA支架，其荧光强度比单独的Pepper适配体高199倍，并允许在活细胞中进行双色同时成像	未提及	评估多色荧光适配体Pepper在革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌中的应用	多色荧光适配体Pepper及其在不同细菌种类中的表现	NA	NA	NA	NA	NA	未提及
19	2024-08-07	Metabolic Investigation and Auxiliary Enzyme Modelization of the Pyrrocidine Pathway Allow Rationalization of Paracyclophane-Decahydrofluorene Formation 2024-04-19, ACS chemical biology IF:3.5Q2 DOI:10.1021/acschembio.3c00684 PMID:38576157	研究论文	研究了真菌中含paracyclophane-decahydrofluorene的天然产物的生物合成途径，通过基因失活、代谢分析和分子建模来阐明关键酶的作用	揭示了pyrrocidine生物合成基因簇的非凡可塑性，并通过分子对接实验和模型化提出了新的生物合成机制	NA	研究pyrrocidine类化合物的生物合成途径及其关键酶的作用机制	pyrrocidine类化合物的生物合成途径及其关键酶	NA	NA	基因失活、代谢分析、分子建模	NA	代谢物	九种pyrrocidine及其类似物，以及多种突变体中积累的代谢物
20	2024-08-07	Understanding and computational design of genetic circuits of metabolic networks 2024-Apr-30, Essays in biochemistry IF:5.6Q1 DOI:10.1042/EBC20230045 PMID:38662439	综述	本文综述了通过遗传电路设计实现代谢网络优化控制的方法	提出了一种新的方法来推断和设计遗传电路，以在动态条件下实现代谢网络的最大通量	NA	探讨如何通过遗传电路设计实现代谢网络的优化控制，并为合成生物学提供设计标准	遗传电路在代谢网络中的作用及其设计方法	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA