合成生物学相关文章
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当前共找到 68 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-08-07 |
Revealing the grammar of small RNA secretion using interpretable machine learning
2024-04-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100522
PMID:38460515
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研究论文 | 本文介绍了ExoGRU机器学习模型，用于预测小RNA从初级RNA序列中的分泌概率，并通过实验验证了其性能 | 开发了ExoGRU模型和exoCLIP技术，揭示了小RNA分泌的cis和trans因子，包括已知和新发现的RNA结合蛋白 | NA | 揭示小RNA分泌的生物学机制，并探索其在治疗和合成生物学中的应用 | 小RNA的分泌机制及其相关的RNA结合蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习 | ExoGRU | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2026-08-12 |
Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity
2024-04, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00934-3
PMID:38332200
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas9介导的单倍化方法（HAnDy），实现了兆碱基规模合成辅助染色体的高效组装与传递，并增强了宿主生物合成能力 | 提出HAnDy方法，绕过减数分裂自然过程，无需体外操作即可高效组装和传递大DNA，并成功构建1.024 Mb的合成辅助染色体，显著促进宿主适应和代谢网络扩展 | 未提及具体局限性 | 实现大规模DNA的便捷合成与传递，以扩展宿主生物合成能力并解析复杂生物学功能 | 六种系统发育多样的酵母菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9介导的单倍化、DNA组装和传递 | NA | 基因组数据 | 六种酵母菌株 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母、其他五种酵母 | 合成辅助染色体（synAC）编码542个外源基因 | 工业生物技术 |
| 3 | 2026-08-12 |
Rational evolution for altering the ligand preference of estrogen receptor alpha
2024-04, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4940
PMID:38511482
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研究论文 | 本研究通过理性蛋白质设计与多位点定向突变结合酿酒酵母中的定向进化，开发出雌激素受体α变体TERRA，其对雌激素无响应但能被他莫昔芬激活，并在哺乳动物细胞和小鼠中保持活性 | 将理性蛋白质设计、多位点定向突变和定向进化相结合，首次获得对他莫昔芬偏好而非雌激素的雌激素受体α变体，并证明其可转移至其他类固醇受体 | 摘要中未提及明显局限性，可能需要进一步验证通用性 | 改变雌激素受体α的配体偏好，以拓展其在合成生物学和基因编辑工具中的应用 | 雌激素受体α及其变体TERRA | 合成生物学 | 乳腺癌 | 多位点定向突变、定向进化 | NA | 基因序列和蛋白质功能数据 | 酿酒酵母中稳定整合的变体，哺乳动物细胞和小鼠 | NA | 酿酒酵母、哺乳动物细胞、小鼠 | 配体响应调控回路 | 医学、工业生物技术 |
| 4 | 2026-06-01 |
Peptide nucleic acid-assisted generation of targeted double-stranded DNA breaks with T7 endonuclease I
2024-04-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae148
PMID:38421613
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研究论文 | 利用γ修饰肽核酸引导T7核酸内切酶I在特定DNA位点产生双链断裂的新型基因编辑技术 | 首次利用γPNA介导的DNA入侵与T7EI的特异性切割相结合，实现无PAM限制、蛋白尺寸紧凑的可编程核酸酶系统 | 仅完成体外实验验证，未展示体内应用效果 | 开发一种新型基因编辑工具，克服现有技术在PAM依赖性和蛋白大小方面的局限 | γ修饰肽核酸与T7核酸内切酶I组成的复合系统 | 基因编辑 | NA | PNA辅助DNA链入侵技术 | NA | NA | NA | T7核酸内切酶I | NA | PNA导向的T7EI核酸酶系统 | 生物技术, 医学, 农业, 合成生物学 |
| 5 | 2026-05-31 |
Understanding and computational design of genetic circuits of metabolic networks
2024-04-30, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20230045
PMID:38662439
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综述 | 综述了一种通过计算设计代谢网络遗传电路的方法，以优化蛋白质投资下的代谢通量 | 提出了一种基于最大化每单位投资蛋白质通量的方法来推断和设计遗传电路，并用于解释大肠杆菌的天然调控策略 | 仅以大肠杆菌为模型系统进行验证，未涉及真核生物或更复杂的代谢网络 | 理解并计算设计代谢网络的遗传电路，以实现动态条件下的最优代谢适应度 | 大肠杆菌的核糖体表达调控和氨基酸生物合成酶的基因表达控制电路 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 通量优化模型 | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 代谢通量调控电路 | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-05-27 |
A pilot oral history of plant synthetic biology
2024-04-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad585
PMID:38163646
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综述 | 通过采访8位植物合成生物学领域的创始人，回顾该领域的起源和早期发展 | 首次通过口述历史的方式记录植物合成生物学的起源和早期发展，为未来的历史研究提供原始资料 | 仅采访了8位创始人，可能无法全面覆盖领域内所有关键人物和事件；作为综述而非系统性分析，可能存在主观性 | 记录植物合成生物学的起源和早期发展历程 | 植物合成生物学领域的8位创始人（来自5个国家和3个大洲） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 访谈记录和事件时间线 | 8位创始人 | NA | NA | NA | 环境科学、能源、农业 |
| 7 | 2026-05-26 |
Optogenetic and chemogenetic approaches for modeling neurological disorders in vivo
2024-04, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102600
PMID:38548126
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综述 | 综述基于光遗传学和化学遗传学的动物模型在模拟人类神经疾病中的应用 | 利用光遗传学和化学遗传学等合成生物学方法，在细胞层面精准诱导病理状态，模拟多种人类神经疾病，提供传统模型无法实现的新机遇 | 未明确说明具体局限性 | 总结基于光遗传学和化学遗传学的神经疾病动物模型及其未来发展方向 | 光遗传学和化学遗传学动物模型 | NA | 神经疾病, 阿尔茨海默病, 帕金森病, 肌萎缩侧索硬化, 癫痫, 共济失调 | 光遗传学, 化学遗传学 | NA | NA | NA | 光遗传学, 化学遗传学 | 动物（未指定具体物种） | 光遗传和化学遗传调控通路 | 医学 |
| 8 | 2026-04-14 |
Advancements in the Application of Ribosomally Synthesized and Post-Translationally Modified Peptides (RiPPs)
2024-04-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040479
PMID:38672495
|
综述 | 本文综述了核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs）在新型治疗应用方面的最新进展 | 系统总结了利用合成生物学和生物信息学新方法（如异源表达、遗传重构和利用修饰酶的底物耐受性）生产与工程化RiPPs，以及采用mRNA展示、表面展示和双杂交系统等前沿筛选技术加速具有药物潜力的RiPPs的发现 | NA | 探讨RiPPs作为新型治疗药物的潜力及其相关生产与工程化技术 | 核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs） | NA | NA | 异源表达、遗传重构、mRNA展示、表面展示、双杂交系统 | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | 医药 |
| 9 | 2026-04-05 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明水通道蛋白Aqp1可作为安全的遗传报告基因，在不同细胞类型中产生强磁共振信号且不影响细胞生理功能 | 首次系统证明Aqp1过表达不会引起内质网应激，且不影响多种细胞固有生物学功能，解决了其作为深层组织报告基因的安全性质疑 | 研究主要基于体外细胞系实验，尚未在完整生物体内验证长期安全性 | 评估Aqp1作为遗传编码磁共振报告基因的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 影像数据 | 多种小鼠和人类细胞系 | 遗传编码 | 哺乳动物细胞 | 水通道蛋白生物传感器 | 医学 |
| 10 | 2026-03-25 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过光色控制微升尺度溶液pH值调整的系统 | 创新点在于结合两种反向定向的光驱动质子泵（细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12），实现了通过光色精确控制pH变化，并采用计算机反馈环路自动调节 | NA | 研究目的是开发一种基于合成生物学的微升尺度pH控制技术，用于研究、医疗和工业应用 | 研究对象是工程化蛋白脂质体系统及其在溶液pH调节中的应用 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵技术、计算机反馈控制 | NA | NA | NA | 蛋白脂质体工程 | NA | 基于细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12的反向质子泵合成生物电路，实现光色控制的pH调节 | 医学, 工业生物技术 |
| 11 | 2026-02-20 |
Engineering transcriptional regulation for cell-based therapies
2024-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100121
PMID:38340892
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综述 | 本文综述了利用跨膜受体调控转录以开发细胞疗法的最新工程方法，重点探讨了响应细胞外信号选择性激活的系统 | 系统整合跨膜受体与转录激活平台，探索其在癌症治疗和再生医学等领域的革命性潜力 | 目前跨膜受体与转录激活平台的整合尚未充分发挥潜力，且质粒DNA的瞬时表达在临床应用中存在局限性 | 开发能够响应特定输入并激活治疗性细胞功能的合成生物学工具 | 哺乳动物细胞中的转录调控系统 | 合成生物学 | 癌症 | 基因转录调控、跨膜受体信号转导 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 跨膜受体介导的转录调控电路，包括生物传感器和信号转导通路 | 医学 |
| 12 | 2026-02-20 |
Experimental and biophysical modeling of transcription and translation dynamics in bacterial- and mammalian-based cell-free expression systems
2024-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2022.02.001
PMID:35231628
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研究论文 | 本文开发了一个基于ODE的生物物理模型，用于模拟细菌和哺乳动物细胞无表达系统中的转录和翻译动力学 | 首次开发了一个适用于细菌和哺乳动物细胞无表达系统的统一生物物理模型，填补了现有模型主要针对大肠杆菌系统的空白 | 模型基于简化假设，可能未完全捕捉所有生物复杂性；实验数据仅限于特定基因回路和细胞类型 | 建立标准生物物理模型以定量研究基因回路，并理解细胞无表达系统的基本工作机制 | 大肠杆菌和HeLa细胞的无表达系统，以及四种基因回路 | 合成生物学 | NA | 细胞无表达系统、ODE建模、实时监测技术（如Broccoli适配体和荧光蛋白） | ODE模型 | 实验数据和模拟数据 | 使用大肠杆菌和HeLa细胞的无表达系统测试四种基因回路 | NA | 大肠杆菌, HeLa细胞 | 四种基因回路，用于表征转录和翻译动力学 | 工业生物技术, 医学 |
| 13 | 2026-02-20 |
Recent advances of droplet-based microfluidics for engineering artificial cells
2024-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.05.002
PMID:37245659
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综述 | 本文总结了基于液滴的微流控技术在合成囊泡和人工细胞方面的最新进展 | 聚焦于液滴微流控技术在人工细胞工程中的应用，包括多室囊泡构建和细胞间通信研究 | NA | 综述液滴微流控技术在人工细胞工程中的进展与应用 | 人工细胞、囊泡、微流控设备 | 合成生物学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物材料、药物开发 |
| 14 | 2026-02-20 |
TidyTron: Reducing lab waste using validated wash-and-reuse protocols for common plasticware in Opentrons OT-2 lab robots
2024-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.08.007
PMID:37696493
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研究论文 | 本文介绍并验证了TidyTron，一个用于在Opentrons OT-2实验室机器人中清洗和重复使用常见塑料器皿的开源协议库，以减少生物技术实验室的塑料废物 | 开发了首个开源、经过验证的协议，利用低成本实验室机器人自动化清洗被DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的塑料器皿，促进安全重复使用 | 协议主要针对特定污染物（DNA、E. coli、S. cerevisiae）和塑料器皿（微量移液器吸头和微孔板），可能不适用于其他污染物或材料类型 | 减少生物技术实验室的塑料废物，通过自动化清洗和重复使用单次使用塑料来提高可持续性和降低研究成本 | 被DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的微量移液器吸头和微孔板 | 合成生物学 | NA | qPCR、流式细胞术、菌落形成单位测定 | NA | 实验数据 | 未明确指定样本数量，但涉及测试多种清洗溶液、接触时间和搅拌方法 | Opentrons OT-2实验室机器人 | E. coli, S. cerevisiae | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 15 | 2026-02-20 |
Employing synthetic biology to expand antibiotic discovery
2024-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100120
PMID:38340893
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综述 | 本文综述了合成生物学在扩展抗生素发现中的应用，重点关注通过基因通路表征和天然抗生素生物合成基因簇的识别来预测和诱导新型抗生素 | 利用合成生物学方法，通过克隆和诱变技术表征抗生素生物合成基因簇的天然调控，以识别导致更强抗生素活性的潜在修饰，并工程化非核糖体肽合酶和聚酮合酶系统以促进天然产物及其变体的可持续生产 | NA | 探索合成生物学在识别和开发新型抗生素以对抗抗菌耐药性细菌病原体方面的应用 | 抗生素生物合成基因簇，特别是非核糖体肽合酶和聚酮合酶途径 | NA | 抗菌耐药性感染 | 克隆，诱变技术，基因表达分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 16 | 2026-01-16 |
Biosafety and biosecurity: treading China's synbio tightrope
2024-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.014
PMID:37957090
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评论 | 本文分析中国在合成生物学领域如何平衡创新促进与严格监管，以增强生物安全、生物安保和公众信任 | 深入探讨中国在合成生物学中的复杂平衡策略，强调其在基因编辑可持续发展和防止合成病毒潜在滥用方面的独特监管方法 | NA | 研究中国在合成生物学领域的政策平衡，旨在促进创新同时确保生物安全和生物安保 | 中国的合成生物学监管框架和政策实践 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 17 | 2025-10-05 |
Targeting solid tumor antigens with chimeric receptors: cancer biology meets synthetic immunology
2024-04, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.003
PMID:38355356
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综述 | 本文综述了靶向实体瘤抗原的嵌合抗原受体T细胞疗法，结合癌症生物学与合成免疫学视角探讨其发展现状 | 从癌症生物学和基因调控角度系统分析实体瘤靶抗原，并整合新兴合成生物学策略在细胞免疫治疗中的应用 | NA | 探讨实体瘤靶向CAR-T细胞疗法的发展现状和未来方向 | 实体瘤靶抗原和嵌合抗原受体T细胞疗法 | 合成免疫学 | 实体瘤 | 嵌合抗原受体T细胞疗法 | NA | 临床数据 | NA | NA | T细胞 | 嵌合抗原受体设计 | 医学 |
| 18 | 2025-10-05 |
The biosynthetic logic and enzymatic machinery of approved fungi-derived pharmaceuticals and agricultural biopesticides
2024-04-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00040k
PMID:37990930
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综述 | 系统阐述真菌来源天然产物的生物合成逻辑与酶学机制及其在药物和农用生物农药开发中的应用 | 整合基因组挖掘与合成生物学策略，提出通过理性设计扩展真菌天然产物化学多样性的新途径 | 未明确说明具体技术实施的技术瓶颈与转化应用的时间周期 | 解析已批准真菌源药物和生物农药的生物合成机制并探索其合成生物学改造策略 | 真菌来源的天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、异源重建、代谢工程 | NA | 基因组数据、酶学数据 | NA | 异源表达宿主 | 真菌 | 聚酮合酶(PKS)、非核糖体肽合成酶(NRPS)、PKS/NRPS杂合系统、萜类、吲哚生物碱的生物合成途径 | 医药, 农业 |
| 19 | 2025-10-05 |
Research Progress on the Assembly of Large DNA Fragments
2024-04-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400054
PMID:38477700
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综述 | 本文综述了合成生物学中大片段DNA组装技术的研究进展，重点关注在不同宿主中的组装方法和挑战 | 聚焦于大片段DNA组装这一技术难点，系统比较了在大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母等不同宿主中的组装方法 | NA | 总结DNA组装技术的发展现状，特别是大片段DNA组装的研究进展 | DNA组装技术，特别是大片段DNA组装方法 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 酿酒酵母 | NA | 生物医学, 生物燃料, 新材料 |
| 20 | 2025-10-05 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
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研究论文 | 本研究开发了从天然微生物筛选到异源宿主中实现持续几丁质酶活性的完整流程 | 建立了从天然微生物发现到异源宿主稳定表达的系统性方法，并发现了在胶体几丁质存在时能上调表达的感应响应型启动子 | 未明确说明在非标准宿主中实现长期活性的具体挑战和解决方案细节 | 实现异源宿主中持续几丁质酶活性的稳定表达 | 海洋微生物来源的几丁质酶基因及异源宿主系统 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序、异源表达、核糖体结合位点优化 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 海洋水样筛选的微生物 | Gibson Assembly, iGEM | 标准宿主, 非标准宿主 | 感应响应型生物传感器、代谢通路 | 工业生物技术, 环境 |