合成生物学相关文章
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当前共找到 68 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-11-06 |
Variable orthogonality of RDF - large serine integrase interactions within the ϕC31 family
2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.03.587898
PMID:38617232
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研究论文 | 研究了三种相关整合酶（ϕC31、ϕBT1和TG1）及其重组方向性因子（RDF）在整合和切除反应中的正交性 | 发现不同整合酶-RDF对之间的正交性存在差异，TG1整合酶在正交性和方向性方面表现最佳 | 整合酶/RDF对的正交性较弱，需要进一步识别和表征更多的整合酶-RDF对 | 研究整合酶及其RDF在基因组修饰应用中的正交性和方向性 | 三种相关整合酶（ϕC31、ϕBT1和TG1）及其RDF | 合成生物学 | NA | AlphaFold-Multimer | NA | NA | 三种整合酶及其RDF |
| 2 | 2024-10-24 |
Measuring the burden of hundreds of BioBricks defines an evolutionary limit on constructability in synthetic biology
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588465
PMID:38645188
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研究论文 | 研究了301个BioBricks在高拷贝质粒上对宿主细胞生长速率的影响 | 首次系统测量了大量BioBricks对宿主细胞生长速率的负担，并开发了一个交互式网络工具用于合成生物学教育 | 研究仅限于高拷贝质粒上的BioBricks，未涵盖其他类型的DNA序列 | 探讨合成生物学中工程化DNA对宿主细胞生长速率的影响及其进化限制 | 301个BioBricks及其对宿主细胞生长速率的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 301个BioBricks |
| 3 | 2024-10-05 |
Self-pigmenting textiles grown from cellulose-producing bacteria with engineered tyrosinase expression
2024-Apr-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02194-3
PMID:38565971
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研究论文 | 本文通过基因工程改造Komagataeibacter rhaeticus，使其产生自着色的细菌纤维素纺织品 | 首次实现通过基因工程使细菌纤维素自着色，并展示了其在纺织品制造中的应用潜力 | NA | 开发可持续的纺织品染色方法 | 细菌纤维素纺织品 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-07 |
Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening
2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.30.587094
PMID:38617214
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研究论文 | 本文通过高通量声学筛选技术，对声学报告基因进行定向进化，以增强其在非侵入性生物成像中的应用 | 开发了一种新的高通量、半自动声学筛选方法，用于筛选突变库，以增强非线性超声散射 | NA | 通过定向进化提高声学报告基因的非线性超声散射能力 | 声学报告基因及其在生物成像中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量声学筛选 | NA | 声学信号 | 两轮进化实验，涉及两种同源GV结构蛋白的扫描位点饱和库 |
| 5 | 2024-08-07 |
Advancements in the Application of Ribosomally Synthesized and Post-Translationally Modified Peptides (RiPPs)
2024-Apr-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040479
PMID:38672495
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综述 | 本文综述了核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs）在治疗应用中的最新进展和潜力 | 介绍了合成生物学和生物信息学在RiPP生产和工程中的新方法，如异源表达、遗传重构和利用修饰酶的底物耐受性 | NA | 探讨RiPP研究中的当前进展和利用这些生物活性肽进行治疗应用的潜在机会 | 核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs）及其在治疗应用中的潜力 | 生物化学 | NA | 合成生物学、生物信息学 | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
CXCR4-Expressing Mesenchymal Stem Cells Derived Nanovesicles for Rheumatoid Arthritis Treatment
2024-04, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202303300
PMID:38145406
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研究论文 | 本文介绍了一种新型细胞膜模拟纳米囊泡，源自基因工程改造的间充质干细胞，作为类风湿性关节炎治疗的一种潜在抗炎平台。 | 利用合成生物学方法，将CXCR4锚定的间充质干细胞膜融合到载药聚合物核心上，构建出仿生纳米颗粒，这些纳米颗粒能够作为趋化因子SDF-1的诱饵，用于治疗关节炎。 | NA | 实现免疫逃避，减缓体内清除，并提高靶向性。 | 基因工程改造的间充质干细胞衍生的纳米囊泡。 | 纳米医学 | 类风湿性关节炎 | 合成生物学 | NA | 纳米颗粒 | 胶原蛋白诱导的关节炎小鼠 |
| 7 | 2024-08-07 |
GMOCU: Digital Documentation, Management, and Biological Risk Assessment of Genetic Parts
2024-04, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300529
PMID:38263723
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GMOCU的标准化半自动软件方法，用于遗传部件和转基因生物（GMOs）的实验室内部数据文档化、管理和生物风险评估 | GMOCU软件通过自动化生物风险评估和维护共享的最新生物部件库存，简化了实验室内部的文档管理和数据共享流程 | NA | 开发一种标准化的软件工具，以简化遗传部件和转基因生物的文档化、管理和生物风险评估 | 遗传部件和转基因生物的文档化、管理和生物风险评估 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据 | NA |
| 8 | 2024-08-07 |
Cell-Free Protein Expression in Polymer Materials
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00628
PMID:38467017
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研究论文 | 本文展示了在聚合物材料中使用无细胞蛋白合成技术（CFPS）的可能性，并验证了其在高温和有机溶剂环境下的耐受性 | 首次证明了干燥的CFPS反应在聚合物材料制备过程中对热和有机溶剂的高耐受性，并展示了其在塑料中实现空间模式化的遗传功能、现场产生抗菌剂和进行传感反应的应用 | NA | 探索在固体材料中实现生物系统功能的可能性 | 无细胞蛋白合成技术在聚合物材料中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成（CFPS） | NA | 聚合物材料 | NA |
| 9 | 2024-08-07 |
Ensemble Detection of DNA Engineering Signatures
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00398
PMID:38468602
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研究论文 | 开发了一个名为GUARDIAN的系统，用于自动检测DNA测序数据中的工程痕迹，并通过盲测验证其有效性 | 采用集成方法，通过组合多种检测策略提高检测准确性，无需专家审查 | NA | 解决合成生物学中基因工程生物的潜在滥用或意外释放问题 | 检测DNA测序数据中的工程痕迹 | 生物技术 | NA | DNA测序 | 集成方法 | DNA序列数据 | 13个目标生物 |
| 10 | 2024-08-07 |
Engineering Plant Cell Fates and Functions for Agriculture and Industry
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00047
PMID:38573786
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观点 | 本文讨论了通过细胞基因组学和合成生物学工具，如生物传感器和DNA记录设备，来优化植物细胞特异性程序和细胞命运，以改善植物形态、环境响应和有价值化合物的生产 | 结合细胞基因组学和合成生物学工具，探讨了细胞特异性工程的新兴机会 | 对许多植物发育程序和细胞类型特异性功能的理解仍不完整 | 探讨如何利用合成生物学方法优化植物形态和提高有价值化合物的生产 | 植物细胞命运和功能 | NA | NA | 细胞基因组学，合成生物学 | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-07 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
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研究论文 | 本文从自然界筛选具有几丁质酶活性的微生物，并通过基因工程手段在异源宿主中实现持续的几丁质酶活性 | 开发了一种新的方法来筛选具有几丁质酶活性的微生物，并通过优化核糖体结合位点和发现有益的启动子，实现了在异源宿主中持续几丁质酶活性的表达 | 文章未明确提及具体的局限性 | 实现几丁质酶在异源宿主中的持续活性，以应用于工业生产 | 几丁质酶及其在异源宿主中的表达 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序 | NA | 基因 | 海洋水样 |
| 12 | 2024-08-07 |
Investigating the Effect of RNA Scaffolds on the Multicolor Fluorogenic Aptamer Pepper in Different Bacterial Species
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00009
PMID:38593047
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研究论文 | 研究RNA支架对多色荧光适配体Pepper在不同细菌种类中的影响 | 发现了一种名为DF30-tRNA的RNA支架，其荧光强度比单独的Pepper适配体高199倍，并允许在活细胞中进行双色同时成像 | 未提及 | 评估多色荧光适配体Pepper在革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌中的应用 | 多色荧光适配体Pepper及其在不同细菌种类中的表现 | NA | NA | NA | NA | NA | 未提及 |
| 13 | 2024-08-07 |
Metabolic Investigation and Auxiliary Enzyme Modelization of the Pyrrocidine Pathway Allow Rationalization of Paracyclophane-Decahydrofluorene Formation
2024-04-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.3c00684
PMID:38576157
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研究论文 | 研究了真菌中含paracyclophane-decahydrofluorene的天然产物的生物合成途径，通过基因失活、代谢分析和分子建模来阐明关键酶的作用 | 揭示了pyrrocidine生物合成基因簇的非凡可塑性，并通过分子对接实验和模型化提出了新的生物合成机制 | NA | 研究pyrrocidine类化合物的生物合成途径及其关键酶的作用机制 | pyrrocidine类化合物的生物合成途径及其关键酶 | NA | NA | 基因失活、代谢分析、分子建模 | NA | 代谢物 | 九种pyrrocidine及其类似物，以及多种突变体中积累的代谢物 |
| 14 | 2024-08-07 |
Understanding and computational design of genetic circuits of metabolic networks
2024-Apr-30, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20230045
PMID:38662439
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综述 | 本文综述了通过遗传电路设计实现代谢网络优化控制的方法 | 提出了一种新的方法来推断和设计遗传电路，以在动态条件下实现代谢网络的最大通量 | NA | 探讨如何通过遗传电路设计实现代谢网络的优化控制，并为合成生物学提供设计标准 | 遗传电路在代谢网络中的作用及其设计方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
On the pursuit to reconstitute the Escherichia coli ribosome from purified components
2024-Apr-29, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvad121
PMID:38236695
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评论 | 本文讨论了从纯化组件中体外重建大肠杆菌核糖体的历史和最新进展 | Aoyama等人最近报道了使用33种重组核糖体蛋白重建50S核糖体，这是向使用重组蛋白和体外转录rRNA完全重建全核糖体复合体迈出的新一步 | 本文未提及具体限制 | 探讨体外重建核糖体的意义及其在生物技术和合成生物学中的潜在应用 | 大肠杆菌的核糖体 | NA | NA | 重组核糖体蛋白和体外转录rRNA | NA | NA | 33种重组核糖体蛋白 |
| 16 | 2024-08-07 |
Green horizons: how plant synthetic biology can enable space exploration and drive on Earth sustainability
2024-04, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103069
PMID:38341984
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研究论文 | 本文探讨了利用植物合成生物学技术在太空探索中实现资源高效利用和自给自足的可能性，并强调这些技术在地球可持续发展中的应用价值 | 利用合成生物学技术，将微生物系统的经验应用于碳效率更高的光合作用生物，以满足从燃料到材料和药物的各种需求 | NA | 探讨植物合成生物学在太空探索和地球可持续发展中的应用 | 植物合成生物学技术及其在太空和地球环境中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
Is Life Binary or Gradual?
2024-Apr-27, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life14050564
PMID:38792586
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研究论文 | 本文探讨了生命本质的二元性和非二元性概念，特别是在微生物学、病毒学、合成生物学和系统化学等领域中，中间实体对生命与非生命简单分类的挑战 | 提出生命可能是一个渐进的光谱，而非简单的二元区分 | 目前科学状态下，是否存在一个明确的界限仍未确定 | 探索生命的定义及其在生命起源研究和天体生物学中的应用 | 生命的本质及其分类 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Toward the Exploitation of Sustainable Green Factory: Biotechnology Use of Nannochloropsis spp
2024-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology13050292
PMID:38785776
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综述 | 本文综述了利用Nannochloropsis spp.作为绿色生物工厂生产高价值产品的现状和前景 | 探讨了合成生物学和遗传工具在Nannochloropsis spp.中的应用，为其实际工业应用提供了可能性 | 目前Nannochloropsis spp.的工业应用尚未实现 | 探索如何利用Nannochloropsis spp.作为可持续的绿色工厂，生产食品、能源和原材料 | Nannochloropsis spp.及其在生物技术中的应用 | 生物技术 | NA | 遗传操作技术 | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
A pilot oral history of plant synthetic biology
2024-Apr-30, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiad585
PMID:38163646
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review | 本文通过采访8位植物合成生物学领域的创始人，记录并回顾了该领域的起源和发展 | 首次通过口述历史的方式，系统地记录了植物合成生物学的早期发展历程 | 由于植物合成生物学领域尚新，历史分析可能不够全面 | 捕捉植物合成生物学的起源和早期发展的本质 | 植物合成生物学的创始人和早期发展 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | 8位领域的创始人 |
| 20 | 2024-08-07 |
Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591074
PMID:38712145
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研究论文 | 本文通过工程化一种名为聚合酶链式回收（PSR）的等温信号放大电路，扩展了无细胞生物传感技术 | 利用T7 RNA聚合酶的非目标转录来在DNA链置换电路中回收核酸输入，设计了PSR电路组件的设计规则，并构建了可直接感知不同RNA目标的模块化生物传感器 | NA | 扩展无细胞电路的当前能力，通过整合PSR技术 | 无细胞生物传感系统中的信号放大电路 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链式回收（PSR） | NA | 核酸 | NA |