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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-20 |
Engineering transcriptional regulation for cell-based therapies
2024-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100121
PMID:38340892
|
综述 | 本文综述了利用跨膜受体调控转录以开发细胞疗法的最新工程方法,重点探讨了响应细胞外信号选择性激活的系统 | 系统整合跨膜受体与转录激活平台,探索其在癌症治疗和再生医学等领域的革命性潜力 | 目前跨膜受体与转录激活平台的整合尚未充分发挥潜力,且质粒DNA的瞬时表达在临床应用中存在局限性 | 开发能够响应特定输入并激活治疗性细胞功能的合成生物学工具 | 哺乳动物细胞中的转录调控系统 | 合成生物学 | 癌症 | 基因转录调控、跨膜受体信号转导 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 跨膜受体介导的转录调控电路,包括生物传感器和信号转导通路 | 医学 |
| 2 | 2026-02-20 |
Experimental and biophysical modeling of transcription and translation dynamics in bacterial- and mammalian-based cell-free expression systems
2024-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2022.02.001
PMID:35231628
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研究论文 | 本文开发了一个基于ODE的生物物理模型,用于模拟细菌和哺乳动物细胞无表达系统中的转录和翻译动力学 | 首次开发了一个适用于细菌和哺乳动物细胞无表达系统的统一生物物理模型,填补了现有模型主要针对大肠杆菌系统的空白 | 模型基于简化假设,可能未完全捕捉所有生物复杂性;实验数据仅限于特定基因回路和细胞类型 | 建立标准生物物理模型以定量研究基因回路,并理解细胞无表达系统的基本工作机制 | 大肠杆菌和HeLa细胞的无表达系统,以及四种基因回路 | 合成生物学 | NA | 细胞无表达系统、ODE建模、实时监测技术(如Broccoli适配体和荧光蛋白) | ODE模型 | 实验数据和模拟数据 | 使用大肠杆菌和HeLa细胞的无表达系统测试四种基因回路 | NA | 大肠杆菌, HeLa细胞 | 四种基因回路,用于表征转录和翻译动力学 | 工业生物技术, 医学 |
| 3 | 2026-02-20 |
Recent advances of droplet-based microfluidics for engineering artificial cells
2024-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.05.002
PMID:37245659
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综述 | 本文总结了基于液滴的微流控技术在合成囊泡和人工细胞方面的最新进展 | 聚焦于液滴微流控技术在人工细胞工程中的应用,包括多室囊泡构建和细胞间通信研究 | NA | 综述液滴微流控技术在人工细胞工程中的进展与应用 | 人工细胞、囊泡、微流控设备 | 合成生物学 | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物材料、药物开发 |
| 4 | 2026-02-20 |
TidyTron: Reducing lab waste using validated wash-and-reuse protocols for common plasticware in Opentrons OT-2 lab robots
2024-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.08.007
PMID:37696493
|
研究论文 | 本文介绍并验证了TidyTron,一个用于在Opentrons OT-2实验室机器人中清洗和重复使用常见塑料器皿的开源协议库,以减少生物技术实验室的塑料废物 | 开发了首个开源、经过验证的协议,利用低成本实验室机器人自动化清洗被DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的塑料器皿,促进安全重复使用 | 协议主要针对特定污染物(DNA、E. coli、S. cerevisiae)和塑料器皿(微量移液器吸头和微孔板),可能不适用于其他污染物或材料类型 | 减少生物技术实验室的塑料废物,通过自动化清洗和重复使用单次使用塑料来提高可持续性和降低研究成本 | 被DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的微量移液器吸头和微孔板 | 合成生物学 | NA | qPCR、流式细胞术、菌落形成单位测定 | NA | 实验数据 | 未明确指定样本数量,但涉及测试多种清洗溶液、接触时间和搅拌方法 | Opentrons OT-2实验室机器人 | E. coli, S. cerevisiae | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 5 | 2026-02-20 |
Employing synthetic biology to expand antibiotic discovery
2024-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100120
PMID:38340893
|
综述 | 本文综述了合成生物学在扩展抗生素发现中的应用,重点关注通过基因通路表征和天然抗生素生物合成基因簇的识别来预测和诱导新型抗生素 | 利用合成生物学方法,通过克隆和诱变技术表征抗生素生物合成基因簇的天然调控,以识别导致更强抗生素活性的潜在修饰,并工程化非核糖体肽合酶和聚酮合酶系统以促进天然产物及其变体的可持续生产 | NA | 探索合成生物学在识别和开发新型抗生素以对抗抗菌耐药性细菌病原体方面的应用 | 抗生素生物合成基因簇,特别是非核糖体肽合酶和聚酮合酶途径 | NA | 抗菌耐药性感染 | 克隆,诱变技术,基因表达分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2026-01-16 |
Biosafety and biosecurity: treading China's synbio tightrope
2024-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.014
PMID:37957090
|
评论 | 本文分析中国在合成生物学领域如何平衡创新促进与严格监管,以增强生物安全、生物安保和公众信任 | 深入探讨中国在合成生物学中的复杂平衡策略,强调其在基因编辑可持续发展和防止合成病毒潜在滥用方面的独特监管方法 | NA | 研究中国在合成生物学领域的政策平衡,旨在促进创新同时确保生物安全和生物安保 | 中国的合成生物学监管框架和政策实践 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 7 | 2026-01-14 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过不同颜色光控制微升尺度溶液pH值的系统 | 开发了基于光驱动质子泵(细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12)的蛋白脂质体系统,首次实现通过光颜色精确调控pH值 | 未明确说明系统的长期稳定性、规模化应用潜力或在不同环境条件下的性能限制 | 开发微升尺度pH控制技术,用于合成生物学和微流控应用 | 工程化蛋白脂质体系统及其在溶液pH调控中的应用 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵技术、计算机控制反馈系统 | NA | 实验数据 | NA | 蛋白脂质体工程 | NA | 基于细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12的反向质子泵膜系统 | 医学、工业、研究 |
| 8 | 2025-10-05 |
Targeting solid tumor antigens with chimeric receptors: cancer biology meets synthetic immunology
2024-04, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.003
PMID:38355356
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综述 | 本文综述了靶向实体瘤抗原的嵌合抗原受体T细胞疗法,结合癌症生物学与合成免疫学视角探讨其发展现状 | 从癌症生物学和基因调控角度系统分析实体瘤靶抗原,并整合新兴合成生物学策略在细胞免疫治疗中的应用 | NA | 探讨实体瘤靶向CAR-T细胞疗法的发展现状和未来方向 | 实体瘤靶抗原和嵌合抗原受体T细胞疗法 | 合成免疫学 | 实体瘤 | 嵌合抗原受体T细胞疗法 | NA | 临床数据 | NA | NA | T细胞 | 嵌合抗原受体设计 | 医学 |
| 9 | 2025-10-05 |
The biosynthetic logic and enzymatic machinery of approved fungi-derived pharmaceuticals and agricultural biopesticides
2024-04-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00040k
PMID:37990930
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综述 | 系统阐述真菌来源天然产物的生物合成逻辑与酶学机制及其在药物和农用生物农药开发中的应用 | 整合基因组挖掘与合成生物学策略,提出通过理性设计扩展真菌天然产物化学多样性的新途径 | 未明确说明具体技术实施的技术瓶颈与转化应用的时间周期 | 解析已批准真菌源药物和生物农药的生物合成机制并探索其合成生物学改造策略 | 真菌来源的天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、异源重建、代谢工程 | NA | 基因组数据、酶学数据 | NA | 异源表达宿主 | 真菌 | 聚酮合酶(PKS)、非核糖体肽合成酶(NRPS)、PKS/NRPS杂合系统、萜类、吲哚生物碱的生物合成途径 | 医药, 农业 |
| 10 | 2025-10-05 |
Research Progress on the Assembly of Large DNA Fragments
2024-04-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400054
PMID:38477700
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综述 | 本文综述了合成生物学中大片段DNA组装技术的研究进展,重点关注在不同宿主中的组装方法和挑战 | 聚焦于大片段DNA组装这一技术难点,系统比较了在大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母等不同宿主中的组装方法 | NA | 总结DNA组装技术的发展现状,特别是大片段DNA组装的研究进展 | DNA组装技术,特别是大片段DNA组装方法 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 酿酒酵母 | NA | 生物医学, 生物燃料, 新材料 |
| 11 | 2025-10-05 |
Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity
2024-Apr, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00934-3
PMID:38332200
|
研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas9的单倍体化方法HAnDy,用于高效组装和传递大片段DNA,并成功构建了1.024 Mb的合成辅助染色体 | 开发了绕过自然减数分裂过程的CRISPR/Cas9介导单倍体化方法,建立了无需体外操作的大片段DNA组装传递技术 | NA | 解决大尺度遗传信息重建的挑战,扩展宿主的生物合成能力 | 酵母菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 六种系统发育多样的酵母菌 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 合成辅助染色体,编码542个外源基因的代谢网络 | 工业生物技术 |
| 12 | 2025-10-05 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明水通道蛋白Aqp1可作为安全的遗传报告基因,在多种细胞类型中产生磁共振信号且不影响细胞生理功能 | 首次系统证明Aqp1过表达不会引起内质网应激,且不影响多种天然生物活性,解决了其作为深层组织报告基因的安全性问题 | 研究仅限于小鼠和人类细胞系,尚未在活体动物模型中进行验证 | 评估Aqp1作为遗传报告基因在磁共振成像中的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 成像数据 | 多种小鼠和人类细胞系 | 遗传编码 | 小鼠细胞, 人类细胞 | 水通道蛋白生物传感器 | 医学 |
| 13 | 2025-10-05 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
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研究论文 | 本研究开发了从天然微生物筛选到异源宿主中实现持续几丁质酶活性的完整流程 | 建立了从天然微生物发现到异源宿主稳定表达的系统性方法,并发现了在胶体几丁质存在时能上调表达的感应响应型启动子 | 未明确说明在非标准宿主中实现长期活性的具体挑战和解决方案细节 | 实现异源宿主中持续几丁质酶活性的稳定表达 | 海洋微生物来源的几丁质酶基因及异源宿主系统 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序、异源表达、核糖体结合位点优化 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 海洋水样筛选的微生物 | Gibson Assembly, iGEM | 标准宿主, 非标准宿主 | 感应响应型生物传感器、代谢通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 14 | 2025-10-05 |
Advancements in the Application of Ribosomally Synthesized and Post-Translationally Modified Peptides (RiPPs)
2024-Apr-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040479
PMID:38672495
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综述 | 本文综述了核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)在治疗应用中的最新进展 | 结合传统生物化学与当代合成生物学方法,开发新型RiPP类似物和高效筛选技术 | NA | 探讨RiPPs的治疗应用潜力及生产技术发展 | 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs) | 合成生物学 | NA | 异源表达、遗传重构、mRNA展示、表面展示、双杂交系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 15 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-based bacterial extracellular vesicles displaying BMP-2 and CXCR4 to ameliorate osteoporosis
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12429
PMID:38576241
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术构建了展示BMP-2和CXCR4的细菌胞外囊泡,用于改善骨质疏松症 | 首次将骨形态发生蛋白BMP-2和趋化因子受体CXCR4与细菌胞外囊泡表面蛋白ClyA融合表达,实现一步法构建兼具骨靶向和骨形成功能的治疗系统 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未进行临床前安全性和有效性评估 | 开发基于合成生物学的骨质疏松症治疗新策略 | 骨质疏松症小鼠模型和骨髓间充质干细胞BMSCs | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 细菌胞外囊泡工程、蛋白融合表达 | NA | 体内外实验数据 | 卵巢切除小鼠模型 | PET28a载体系统 | 大肠杆菌Nissle 1917 | ClyA-BMP-2-CXCR4融合蛋白表达系统,用于细菌胞外囊泡表面展示 | 医药 |
| 16 | 2025-10-05 |
Enhancing Escherichia coli abiotic stress resistance through ornithine lipid formation
2024-Apr-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13130-5
PMID:38587638
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研究论文 | 通过在大肠杆菌中表达合成操纵子olsFC生产鸟氨酸脂质,增强其对非生物胁迫的抗性 | 首次在本身不编码鸟氨酸脂质合成能力的大肠杆菌中实现异源生产鸟氨酸脂质,并证明其能增强胁迫抗性 | 研究仅限于大肠杆菌模型,未在其他宿主中验证 | 通过改造大肠杆菌膜脂质组成增强其非生物胁迫抗性 | 工程化改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程、转录组分析 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 多种工程化大肠杆菌菌株 | 合成操纵子表达 | 大肠杆菌 | olsFC合成操纵子表达系统,用于生产未修饰和羟基化鸟氨酸脂质 | 工业生物技术 |
| 17 | 2025-10-05 |
Artificial cell synthesis using biocatalytic polymerization-induced self-assembly
2024-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01391-y
PMID:38049652
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研究论文 | 本研究开发了通过酶催化聚合诱导自组装合成能够表达蛋白质的聚合物人工细胞 | 首次利用肌红蛋白催化的原子转移自由基聚合诱导自组装技术合成具有蛋白质表达功能的人工细胞 | NA | 开发新型人工细胞合成方法并实现其生物学功能模拟 | 基于聚合物的人工细胞微结构 | 合成生物学 | NA | 原子转移自由基聚合诱导自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质表达系统 | 分子系统工程, 合成生物学 |
| 18 | 2025-10-05 |
Investigating the Effect of RNA Scaffolds on the Multicolor Fluorogenic Aptamer Pepper in Different Bacterial Species
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00009
PMID:38593047
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研究论文 | 评估多色荧光适配体Pepper在不同细菌物种中的性能,并研究RNA支架对其荧光强度的影响 | 发现DF30-tRNA支架能使Pepper适配体荧光增强199倍,并实现活细胞中双色同时成像 | NA | 研究RNA支架对多色荧光适配体Pepper在不同细菌物种中荧光性能的影响 | 革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和鼠伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | NA | 荧光成像 | NA | 荧光信号数据 | NA | RNA合成生物学工具 | 革兰氏阳性菌,革兰氏阴性菌,鼠伤寒沙门氏菌 | 多色荧光适配体Pepper, DF30-tRNA支架 | 工业生物技术,医学 |
| 19 | 2025-10-05 |
Rational evolution for altering the ligand preference of estrogen receptor alpha
2024-Apr, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4940
PMID:38511482
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研究论文 | 通过理性蛋白质设计和定向进化开发了对它莫西芬响应的雌激素受体α变体TERRA | 结合理性蛋白质设计与多点位定向诱变,在酿酒酵母中通过定向进化成功改变了雌激素受体α的配体偏好性 | NA | 改变雌激素受体α的配体偏好性以扩展合成生物学工具的应用范围 | 雌激素受体α及其变体TERRA | 合成生物学 | 乳腺癌 | 理性蛋白质设计、多点位定向诱变、定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酿酒酵母, 哺乳动物细胞, 小鼠 | 配体响应型受体设计 | 医学, 合成生物学 |
| 20 | 2025-10-05 |
Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591074
PMID:38712145
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研究论文 | 本研究开发了一种基于聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路 | 利用T7 RNA聚合酶脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入,实现了高特异性等温信号放大 | NA | 扩展无细胞生物传感能力,开发高灵敏度生物传感器 | 核酸靶标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | DNA链置换,等温扩增 | 双平衡模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 无细胞系统 | 聚合酶链回收(PSR)信号放大电路,模块化生物传感器 | 生物技术 |