合成生物学相关文章
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当前共找到 68 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Targeting solid tumor antigens with chimeric receptors: cancer biology meets synthetic immunology
2024-04, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.003
PMID:38355356
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综述 | 本文综述了靶向实体瘤抗原的嵌合抗原受体T细胞疗法，结合癌症生物学与合成免疫学视角探讨其发展现状 | 从癌症生物学和基因调控角度系统分析实体瘤靶抗原，并整合新兴合成生物学策略在细胞免疫治疗中的应用 | NA | 探讨实体瘤靶向CAR-T细胞疗法的发展现状和未来方向 | 实体瘤靶抗原和嵌合抗原受体T细胞疗法 | 合成免疫学 | 实体瘤 | 嵌合抗原受体T细胞疗法 | NA | 临床数据 | NA | NA | T细胞 | 嵌合抗原受体设计 | 医学 |
| 2 | 2025-10-05 |
The biosynthetic logic and enzymatic machinery of approved fungi-derived pharmaceuticals and agricultural biopesticides
2024-04-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00040k
PMID:37990930
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综述 | 系统阐述真菌来源天然产物的生物合成逻辑与酶学机制及其在药物和农用生物农药开发中的应用 | 整合基因组挖掘与合成生物学策略，提出通过理性设计扩展真菌天然产物化学多样性的新途径 | 未明确说明具体技术实施的技术瓶颈与转化应用的时间周期 | 解析已批准真菌源药物和生物农药的生物合成机制并探索其合成生物学改造策略 | 真菌来源的天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、异源重建、代谢工程 | NA | 基因组数据、酶学数据 | NA | 异源表达宿主 | 真菌 | 聚酮合酶(PKS)、非核糖体肽合成酶(NRPS)、PKS/NRPS杂合系统、萜类、吲哚生物碱的生物合成途径 | 医药, 农业 |
| 3 | 2025-10-05 |
Research Progress on the Assembly of Large DNA Fragments
2024-04-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400054
PMID:38477700
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综述 | 本文综述了合成生物学中大片段DNA组装技术的研究进展，重点关注在不同宿主中的组装方法和挑战 | 聚焦于大片段DNA组装这一技术难点，系统比较了在大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母等不同宿主中的组装方法 | NA | 总结DNA组装技术的发展现状，特别是大片段DNA组装的研究进展 | DNA组装技术，特别是大片段DNA组装方法 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 酿酒酵母 | NA | 生物医学, 生物燃料, 新材料 |
| 4 | 2025-10-05 |
Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity
2024-Apr, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00934-3
PMID:38332200
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas9的单倍体化方法HAnDy，用于高效组装和传递大片段DNA，并成功构建了1.024 Mb的合成辅助染色体 | 开发了绕过自然减数分裂过程的CRISPR/Cas9介导单倍体化方法，建立了无需体外操作的大片段DNA组装传递技术 | NA | 解决大尺度遗传信息重建的挑战，扩展宿主的生物合成能力 | 酵母菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 六种系统发育多样的酵母菌 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 合成辅助染色体，编码542个外源基因的代谢网络 | 工业生物技术 |
| 5 | 2025-10-05 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明水通道蛋白Aqp1可作为安全的遗传报告基因，在多种细胞类型中产生磁共振信号且不影响细胞生理功能 | 首次系统证明Aqp1过表达不会引起内质网应激，且不影响多种天然生物活性，解决了其作为深层组织报告基因的安全性问题 | 研究仅限于小鼠和人类细胞系，尚未在活体动物模型中进行验证 | 评估Aqp1作为遗传报告基因在磁共振成像中的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 成像数据 | 多种小鼠和人类细胞系 | 遗传编码 | 小鼠细胞, 人类细胞 | 水通道蛋白生物传感器 | 医学 |
| 6 | 2025-10-05 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
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研究论文 | 本研究开发了从天然微生物筛选到异源宿主中实现持续几丁质酶活性的完整流程 | 建立了从天然微生物发现到异源宿主稳定表达的系统性方法，并发现了在胶体几丁质存在时能上调表达的感应响应型启动子 | 未明确说明在非标准宿主中实现长期活性的具体挑战和解决方案细节 | 实现异源宿主中持续几丁质酶活性的稳定表达 | 海洋微生物来源的几丁质酶基因及异源宿主系统 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序、异源表达、核糖体结合位点优化 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 海洋水样筛选的微生物 | Gibson Assembly, iGEM | 标准宿主, 非标准宿主 | 感应响应型生物传感器、代谢通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 7 | 2025-10-05 |
Advancements in the Application of Ribosomally Synthesized and Post-Translationally Modified Peptides (RiPPs)
2024-Apr-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040479
PMID:38672495
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综述 | 本文综述了核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs）在治疗应用中的最新进展 | 结合传统生物化学与当代合成生物学方法，开发新型RiPP类似物和高效筛选技术 | NA | 探讨RiPPs的治疗应用潜力及生产技术发展 | 核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPPs） | 合成生物学 | NA | 异源表达、遗传重构、mRNA展示、表面展示、双杂交系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 8 | 2025-10-05 |
TidyTron: Reducing lab waste using validated wash-and-reuse protocols for common plasticware in Opentrons OT-2 lab robots
2024-Apr, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.08.007
PMID:37696493
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研究论文 | 开发并验证了用于Opentrons OT-2实验室机器人清洗常见塑料器件的开源协议库TidyTron，以减少实验室塑料废物 | 首次开发了使用低成本实验室机器人自动化清洗单次使用塑料器件的开源验证协议，实现了对DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的有效去污 | 仅验证了特定类型的塑料器件（微量移液器吸头和微孔板）和特定污染物（DNA、E. coli、S. cerevisiae） | 通过自动化清洗和重复使用单次使用塑料器件，提高生物技术实验室的可持续性并降低重复成本 | 被DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的微量移液器吸头和微孔板 | 合成生物学 | NA | qPCR, 流式细胞术, 菌落形成单位测定 | NA | 实验数据 | NA | Opentrons OT-2 | E. coli, S. cerevisiae | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 9 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-based bacterial extracellular vesicles displaying BMP-2 and CXCR4 to ameliorate osteoporosis
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12429
PMID:38576241
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术构建了展示BMP-2和CXCR4的细菌胞外囊泡，用于改善骨质疏松症 | 首次将骨形态发生蛋白BMP-2和趋化因子受体CXCR4与细菌胞外囊泡表面蛋白ClyA融合表达，实现一步法构建兼具骨靶向和骨形成功能的治疗系统 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未进行临床前安全性和有效性评估 | 开发基于合成生物学的骨质疏松症治疗新策略 | 骨质疏松症小鼠模型和骨髓间充质干细胞BMSCs | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 细菌胞外囊泡工程、蛋白融合表达 | NA | 体内外实验数据 | 卵巢切除小鼠模型 | PET28a载体系统 | 大肠杆菌Nissle 1917 | ClyA-BMP-2-CXCR4融合蛋白表达系统，用于细菌胞外囊泡表面展示 | 医药 |
| 10 | 2025-10-05 |
Enhancing Escherichia coli abiotic stress resistance through ornithine lipid formation
2024-Apr-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13130-5
PMID:38587638
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研究论文 | 通过在大肠杆菌中表达合成操纵子olsFC生产鸟氨酸脂质，增强其对非生物胁迫的抗性 | 首次在本身不编码鸟氨酸脂质合成能力的大肠杆菌中实现异源生产鸟氨酸脂质，并证明其能增强胁迫抗性 | 研究仅限于大肠杆菌模型，未在其他宿主中验证 | 通过改造大肠杆菌膜脂质组成增强其非生物胁迫抗性 | 工程化改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程、转录组分析 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 多种工程化大肠杆菌菌株 | 合成操纵子表达 | 大肠杆菌 | olsFC合成操纵子表达系统，用于生产未修饰和羟基化鸟氨酸脂质 | 工业生物技术 |
| 11 | 2025-10-05 |
Artificial cell synthesis using biocatalytic polymerization-induced self-assembly
2024-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01391-y
PMID:38049652
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研究论文 | 本研究开发了通过酶催化聚合诱导自组装合成能够表达蛋白质的聚合物人工细胞 | 首次利用肌红蛋白催化的原子转移自由基聚合诱导自组装技术合成具有蛋白质表达功能的人工细胞 | NA | 开发新型人工细胞合成方法并实现其生物学功能模拟 | 基于聚合物的人工细胞微结构 | 合成生物学 | NA | 原子转移自由基聚合诱导自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白质表达系统 | 分子系统工程, 合成生物学 |
| 12 | 2025-10-05 |
Investigating the Effect of RNA Scaffolds on the Multicolor Fluorogenic Aptamer Pepper in Different Bacterial Species
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00009
PMID:38593047
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研究论文 | 评估多色荧光适配体Pepper在不同细菌物种中的性能，并研究RNA支架对其荧光强度的影响 | 发现DF30-tRNA支架能使Pepper适配体荧光增强199倍，并实现活细胞中双色同时成像 | NA | 研究RNA支架对多色荧光适配体Pepper在不同细菌物种中荧光性能的影响 | 革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和鼠伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | NA | 荧光成像 | NA | 荧光信号数据 | NA | RNA合成生物学工具 | 革兰氏阳性菌,革兰氏阴性菌,鼠伤寒沙门氏菌 | 多色荧光适配体Pepper, DF30-tRNA支架 | 工业生物技术,医学 |
| 13 | 2025-10-05 |
Rational evolution for altering the ligand preference of estrogen receptor alpha
2024-Apr, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4940
PMID:38511482
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研究论文 | 通过理性蛋白质设计和定向进化开发了对它莫西芬响应的雌激素受体α变体TERRA | 结合理性蛋白质设计与多点位定向诱变，在酿酒酵母中通过定向进化成功改变了雌激素受体α的配体偏好性 | NA | 改变雌激素受体α的配体偏好性以扩展合成生物学工具的应用范围 | 雌激素受体α及其变体TERRA | 合成生物学 | 乳腺癌 | 理性蛋白质设计、多点位定向诱变、定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酿酒酵母, 哺乳动物细胞, 小鼠 | 配体响应型受体设计 | 医学, 合成生物学 |
| 14 | 2025-10-05 |
Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591074
PMID:38712145
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研究论文 | 本研究开发了一种基于聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感器信号放大电路 | 利用T7 RNA聚合酶脱靶转录在DNA链置换电路中回收核酸输入，实现了高特异性等温信号放大 | NA | 扩展无细胞生物传感能力，开发高灵敏度生物传感器 | 核酸靶标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | DNA链置换，等温扩增 | 双平衡模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 无细胞系统 | 聚合酶链回收(PSR)信号放大电路，模块化生物传感器 | 生物技术 |
| 15 | 2025-10-05 |
Utilizing microbial metabolite in catalytic cascade synthesis of conjugated oligomers for In-Situ regulation of biological activity
2024-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107188
PMID:38377815
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研究论文 | 结合微生物代谢途径与钯催化过程在活体生物中原位生成具有生物活性的共轭寡聚物 | 首次将微生物发酵过程与钯催化的Heck反应结合，实现生物代谢与化学催化在活体系统中的协同作用 | NA | 开发生物代谢与化学催化相结合的新方法，用于原位调控生物活性 | 工程化大肠杆菌代谢产物与共轭寡聚物的合成 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、Pd催化Heck反应 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 代谢途径工程，将葡萄糖转化为苯乙烯 | 医药, 工业生物技术 |
| 16 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Escherichia coli for the Production of l-Homoserine
2024-Apr-25, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.3c00077
PMID:39974203
|
综述 | 总结大肠杆菌生产L-高丝氨酸的系统代谢工程策略进展 | 系统总结并比较了通过阻断竞争降解途径、强化关键酶和前体、改造转运系统等代谢工程策略提高L-高丝氨酸产量的方法 | NA | 提高微生物发酵生产L-高丝氨酸的产量和效率 | 大肠杆菌代谢工程 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、微生物发酵 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 代谢通路工程，包括阻断竞争降解途径、强化关键酶和前体、改造转运系统 | 工业生物技术 |
| 17 | 2025-10-06 |
A model-driven approach to upcycling recalcitrant feedstocks in Pseudomonas putida by decoupling PHA production from nutrient limitation
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113979
PMID:38517887
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研究论文 | 本研究通过模型驱动方法在恶臭假单胞菌中实现生长阶段PHA生产，解决了传统营养限制条件下PHA生产的限制 | 采用合成生物学方法解除PHA生产与营养限制的耦合关系，首次在生长阶段实现高效PHA生产 | NA | 开发新型PHA生产策略以克服传统生物工艺的复杂性 | 恶臭假单胞菌工程菌株及其PHA生产能力 | 合成生物学 | NA | 合成生物学，模型驱动方法，生长耦合策略 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 恶臭假单胞菌 | 碳流重定向和调控约束解除的代谢工程策略 | 工业生物技术，环境 |
| 18 | 2025-01-07 |
Toward the Exploitation of Sustainable Green Factory: Biotechnology Use of Nannochloropsis spp
2024-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology13050292
PMID:38785776
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综述 | 本文综述了利用Nannochloropsis spp作为绿色生物工厂的现状，特别是核基因操作技术的应用 | 探讨了合成生物学和基因工具在Nannochloropsis spp中的应用，以提高其作为绿色生物工厂的潜力 | Nannochloropsis spp的工业应用尚未实现，仍需进一步研究 | 探索利用Nannochloropsis spp作为可持续绿色生物工厂的潜力 | Nannochloropsis spp微藻 | 生物技术 | NA | 核基因操作技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-11-06 |
Variable orthogonality of RDF - large serine integrase interactions within the ϕC31 family
2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.03.587898
PMID:38617232
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研究论文 | 研究了三种相关整合酶（ϕC31、ϕBT1和TG1）及其重组方向性因子（RDF）在整合和切除反应中的正交性 | 发现不同整合酶-RDF对之间的正交性存在差异，TG1整合酶在正交性和方向性方面表现最佳 | 整合酶/RDF对的正交性较弱，需要进一步识别和表征更多的整合酶-RDF对 | 研究整合酶及其RDF在基因组修饰应用中的正交性和方向性 | 三种相关整合酶（ϕC31、ϕBT1和TG1）及其RDF | 合成生物学 | NA | AlphaFold-Multimer | NA | NA | 三种整合酶及其RDF | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-10-24 |
Measuring the burden of hundreds of BioBricks defines an evolutionary limit on constructability in synthetic biology
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588465
PMID:38645188
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研究论文 | 研究了301个BioBricks在高拷贝质粒上对宿主细胞生长速率的影响 | 首次系统测量了大量BioBricks对宿主细胞生长速率的负担，并开发了一个交互式网络工具用于合成生物学教育 | 研究仅限于高拷贝质粒上的BioBricks，未涵盖其他类型的DNA序列 | 探讨合成生物学中工程化DNA对宿主细胞生长速率的影响及其进化限制 | 301个BioBricks及其对宿主细胞生长速率的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 301个BioBricks | NA | NA | NA | NA |