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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-07-11 |
Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity
2024-Apr, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00934-3
PMID:38332200
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研究论文 | 本文介绍了一种CRISPR/Cas9介导的单倍化方法HAnDy,用于高效组装和传递大片段DNA,无需繁琐的体外操作 | 开发了HAnDy方法,能够高效组装和传递大片段DNA,并成功应用于六个系统发育不同的酵母中 | 未提及该方法在其他生物系统中的适用性或潜在的技术限制 | 扩展和解析复杂的生物学功能 | 酵母 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA | 六个系统发育不同的酵母 |
2 | 2025-07-03 |
TidyTron: Reducing lab waste using validated wash-and-reuse protocols for common plasticware in Opentrons OT-2 lab robots
2024-Apr, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2023.08.007
PMID:37696493
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研究论文 | 介绍并验证了TidyTron,一个用于清洁被DNA、大肠杆菌和酿酒酵母污染的微量移液器吸头和微孔板的协议库 | 开发了首个使用低成本实验室机器人进行塑料器皿有效去污的开源验证协议,促进了安全重复使用 | 仅测试了DNA、E. coli和S. cerevisiae的污染,未涵盖所有可能的生物污染物 | 提高生物技术实验室的可持续性,减少塑料废物和重复成本 | 微量移液器吸头和微孔板 | 合成生物学 | NA | qPCR, 流式细胞术 | NA | 实验数据 | 未明确提及具体样本数量,但涉及多种清洁溶液、接触时间和搅拌方法的测试 |
3 | 2025-06-03 |
Synthetic biology-based bacterial extracellular vesicles displaying BMP-2 and CXCR4 to ameliorate osteoporosis
2024-Apr, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.12429
PMID:38576241
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研究论文 | 该研究利用合成生物学技术构建了一种展示BMP-2和CXCR4的细菌胞外囊泡(BEVs-BC),用于改善骨质疏松症 | 首次将BMP-2和CXCR4与BEVs表面蛋白ClyA融合过表达,构建了具有骨靶向和骨形成双重功能的一步法合成生物学系统 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发一种基于合成生物学的骨质疏松症治疗新策略 | 骨质疏松症小鼠模型和骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 合成生物学技术、细菌胞外囊泡工程 | OVX小鼠模型 | NA | NA |
4 | 2025-05-29 |
Enhancing Escherichia coli abiotic stress resistance through ornithine lipid formation
2024-Apr-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13130-5
PMID:38587638
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研究论文 | 通过工程改造大肠杆菌使其产生鸟氨酸脂质,以增强其对非生物胁迫的抗性 | 首次将鸟氨酸脂质(OLs)的合成能力引入原本不具备此能力的大肠杆菌中,并证明其能增强胁迫抗性和生物量产量 | 研究仅针对特定胁迫条件(如pH变化和磷酸盐限制),未涵盖所有可能的非生物胁迫 | 通过改造大肠杆菌的膜脂组成,构建具有增强非生物胁迫抗性的宿主,用于生物技术和合成生物学应用 | 大肠杆菌(Escherichia coli)及其工程改造菌株 | 合成生物学 | NA | 基因工程(表达合成操纵子olsFC)、转录组分析 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 多种工程改造的大肠杆菌菌株 |
5 | 2025-04-26 |
Artificial cell synthesis using biocatalytic polymerization-induced self-assembly
2024-04, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-023-01391-y
PMID:38049652
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研究论文 | 本文报道了利用生物催化聚合诱导自组装技术合成具有蛋白质表达能力的聚合物基人工细胞 | 首次利用生物催化原子转移自由基聚合诱导自组装技术合成人工细胞,并展示其蛋白质表达能力 | NA | 开发新型人工细胞合成方法并探索其功能特性 | 基于聚合物的仿生人工细胞 | 合成生物学 | NA | 生物催化原子转移自由基聚合诱导自组装 | NA | NA | NA |
6 | 2025-04-11 |
Investigating the Effect of RNA Scaffolds on the Multicolor Fluorogenic Aptamer Pepper in Different Bacterial Species
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00009
PMID:38593047
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research paper | 研究多色荧光适配体Pepper在不同细菌种类中RNA支架的影响 | 评估了多色荧光适配体Pepper在革兰氏阳性和阴性细菌中的应用,并发现不同RNA支架对荧光有显著影响 | 未明确说明研究的细菌种类数量及实验的具体条件 | 研究RNA支架对多色荧光适配体Pepper在不同细菌中荧光效果的影响 | 革兰氏阳性和阴性细菌 | RNA合成生物学 | NA | 多色荧光成像 | NA | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及多种细菌 |
7 | 2025-04-03 |
Targeting solid tumor antigens with chimeric receptors: cancer biology meets synthetic immunology
2024-Apr, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.003
PMID:38355356
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review | 本文回顾了针对实体瘤抗原的嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法的研究现状和临床应用 | 从癌症生物学和基因调控的角度探讨实体瘤靶抗原,并结合新兴临床数据讨论CAR-T细胞疗法 | 主要关注早期临床试验数据,尚未涉及大规模临床验证 | 探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的应用和发展 | 实体瘤靶抗原和CAR-T细胞疗法 | 合成免疫学 | 实体瘤 | CAR-T细胞疗法 | NA | 临床数据 | NA |
8 | 2025-03-26 |
From Natural Microbe Screening to Sustained Chitinase Activity in Exogenous Hosts
2024-04-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00637
PMID:38587290
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research paper | 该研究从自然微生物筛选出发,通过基因工程实现在外源宿主中持续表达几丁质酶活性 | 开发了一种从自然微生物筛选到外源宿主中稳定表达几丁质酶的完整流程,并发现了一种能在胶体几丁质存在时上调表达的启动子 | 未提及具体在非标准宿主中的几丁质酶活性持续时间数据 | 开发可持续几丁质酶活性的生物技术应用方案 | 海洋微生物来源的几丁质酶基因及外源表达宿主 | 合成生物学 | NA | 全基因组测序、异源表达、核糖体结合位点优化 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 未明确说明海洋水样具体数量 |
9 | 2025-03-23 |
Rational evolution for altering the ligand preference of estrogen receptor alpha
2024-Apr, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.4940
PMID:38511482
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研究论文 | 本文通过结合理性蛋白质设计、多位点定向诱变和定向进化技术,成功改变了雌激素受体α的配体偏好,使其对乳腺癌治疗药物他莫昔芬产生响应 | 开发了一种名为TERRA的雌激素受体变体,该变体失去了对雌激素的响应性,转而被他莫昔芬激活,这一特性在哺乳动物细胞和小鼠中得以保持 | 未明确提及具体局限性 | 改变雌激素受体α的配体偏好,以扩展哺乳动物合成生物学工具箱 | 雌激素受体α | 合成生物学 | 乳腺癌 | 理性蛋白质设计、多位点定向诱变、定向进化 | NA | NA | NA |
10 | 2025-03-19 |
Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591074
PMID:38712145
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研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收(PSR)的无细胞生物传感信号放大电路,通过利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录来回收DNA链置换电路中的核酸输入 | 开发了PSR电路,扩展了无细胞生物传感的能力,实现了高特异性和低检测限的RNA目标直接传感 | NA | 扩展无细胞电路的能力,通过PSR实现信号放大,用于生物技术中的多种应用 | RNA目标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收(PSR),DNA链置换电路 | 双平衡模型 | 核酸 | NA |
11 | 2025-03-09 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本文研究了水通道蛋白Aqp1在多种细胞类型中作为磁共振成像报告基因的安全性和有效性 | 研究表明Aqp1过表达不会对细胞活力或形态产生不利影响,且不会引起ER应激,这为Aqp1作为遗传报告基因的广泛应用提供了安全依据 | 研究仅限于小鼠和人类细胞系,未涉及体内实验 | 评估Aqp1作为磁共振成像报告基因的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 生物医学工程 | NA | 磁共振成像 | NA | 细胞生理数据 | 多种小鼠和人类细胞系 |
12 | 2025-02-26 |
Utilizing microbial metabolite in catalytic cascade synthesis of conjugated oligomers for In-Situ regulation of biological activity
2024-04, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107188
PMID:38377815
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研究论文 | 本文结合微生物代谢途径和钯催化过程,用于原位生成具有生物活性的共轭寡聚物 | 将微生物代谢途径与钯催化过程结合,实现生物活性共轭寡聚物的原位合成 | NA | 研究生物代谢与化学催化反应的结合,以实现非天然分子的生物合成和生物活性的原位调控 | 工程化大肠杆菌及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 钯催化的Heck反应 | NA | NA | NA |
13 | 2025-02-23 |
Metabolic Engineering of Escherichia coli for the Production of l-Homoserine
2024-Apr-25, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.3c00077
PMID:39974203
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综述 | 本文综述了通过系统代谢工程策略提高大肠杆菌中l-高丝氨酸生产的最新进展 | 总结了通过阻断竞争和降解途径、增强关键酶和前体、以及运输系统的基因改造等策略来提高l-高丝氨酸生产的系统性方法 | NA | 提高l-高丝氨酸的微生物工业生产 | 大肠杆菌 | 合成生物学与生物技术 | NA | 微生物发酵 | NA | NA | NA |
14 | 2025-01-07 |
Toward the Exploitation of Sustainable Green Factory: Biotechnology Use of Nannochloropsis spp
2024-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology13050292
PMID:38785776
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综述 | 本文综述了利用Nannochloropsis spp作为绿色生物工厂的现状,特别是核基因操作技术的应用 | 探讨了合成生物学和基因工具在Nannochloropsis spp中的应用,以提高其作为绿色生物工厂的潜力 | Nannochloropsis spp的工业应用尚未实现,仍需进一步研究 | 探索利用Nannochloropsis spp作为可持续绿色生物工厂的潜力 | Nannochloropsis spp微藻 | 生物技术 | NA | 核基因操作技术 | NA | NA | NA |
15 | 2024-11-06 |
Variable orthogonality of RDF - large serine integrase interactions within the ϕC31 family
2024-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.03.587898
PMID:38617232
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研究论文 | 研究了三种相关整合酶(ϕC31、ϕBT1和TG1)及其重组方向性因子(RDF)在整合和切除反应中的正交性 | 发现不同整合酶-RDF对之间的正交性存在差异,TG1整合酶在正交性和方向性方面表现最佳 | 整合酶/RDF对的正交性较弱,需要进一步识别和表征更多的整合酶-RDF对 | 研究整合酶及其RDF在基因组修饰应用中的正交性和方向性 | 三种相关整合酶(ϕC31、ϕBT1和TG1)及其RDF | 合成生物学 | NA | AlphaFold-Multimer | NA | NA | 三种整合酶及其RDF |
16 | 2024-10-24 |
Measuring the burden of hundreds of BioBricks defines an evolutionary limit on constructability in synthetic biology
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.08.588465
PMID:38645188
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研究论文 | 研究了301个BioBricks在高拷贝质粒上对宿主细胞生长速率的影响 | 首次系统测量了大量BioBricks对宿主细胞生长速率的负担,并开发了一个交互式网络工具用于合成生物学教育 | 研究仅限于高拷贝质粒上的BioBricks,未涵盖其他类型的DNA序列 | 探讨合成生物学中工程化DNA对宿主细胞生长速率的影响及其进化限制 | 301个BioBricks及其对宿主细胞生长速率的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 301个BioBricks |
17 | 2024-08-07 |
Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening
2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.30.587094
PMID:38617214
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研究论文 | 本文通过高通量声学筛选技术,对声学报告基因进行定向进化,以增强其在非侵入性生物成像中的应用 | 开发了一种新的高通量、半自动声学筛选方法,用于筛选突变库,以增强非线性超声散射 | NA | 通过定向进化提高声学报告基因的非线性超声散射能力 | 声学报告基因及其在生物成像中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量声学筛选 | NA | 声学信号 | 两轮进化实验,涉及两种同源GV结构蛋白的扫描位点饱和库 |
18 | 2024-08-07 |
Advancements in the Application of Ribosomally Synthesized and Post-Translationally Modified Peptides (RiPPs)
2024-Apr-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040479
PMID:38672495
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综述 | 本文综述了核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)在治疗应用中的最新进展和潜力 | 介绍了合成生物学和生物信息学在RiPP生产和工程中的新方法,如异源表达、遗传重构和利用修饰酶的底物耐受性 | NA | 探讨RiPP研究中的当前进展和利用这些生物活性肽进行治疗应用的潜在机会 | 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)及其在治疗应用中的潜力 | 生物化学 | NA | 合成生物学、生物信息学 | NA | NA | NA |
19 | 2024-08-07 |
CXCR4-Expressing Mesenchymal Stem Cells Derived Nanovesicles for Rheumatoid Arthritis Treatment
2024-04, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202303300
PMID:38145406
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研究论文 | 本文介绍了一种新型细胞膜模拟纳米囊泡,源自基因工程改造的间充质干细胞,作为类风湿性关节炎治疗的一种潜在抗炎平台。 | 利用合成生物学方法,将CXCR4锚定的间充质干细胞膜融合到载药聚合物核心上,构建出仿生纳米颗粒,这些纳米颗粒能够作为趋化因子SDF-1的诱饵,用于治疗关节炎。 | NA | 实现免疫逃避,减缓体内清除,并提高靶向性。 | 基因工程改造的间充质干细胞衍生的纳米囊泡。 | 纳米医学 | 类风湿性关节炎 | 合成生物学 | NA | 纳米颗粒 | 胶原蛋白诱导的关节炎小鼠 |
20 | 2024-08-07 |
GMOCU: Digital Documentation, Management, and Biological Risk Assessment of Genetic Parts
2024-04, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202300529
PMID:38263723
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GMOCU的标准化半自动软件方法,用于遗传部件和转基因生物(GMOs)的实验室内部数据文档化、管理和生物风险评估 | GMOCU软件通过自动化生物风险评估和维护共享的最新生物部件库存,简化了实验室内部的文档管理和数据共享流程 | NA | 开发一种标准化的软件工具,以简化遗传部件和转基因生物的文档化、管理和生物风险评估 | 遗传部件和转基因生物的文档化、管理和生物风险评估 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据 | NA |