合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2024-08-07	On the pursuit to reconstitute the Escherichia coli ribosome from purified components 2024-Apr-29, Journal of biochemistry IF:2.1Q4 DOI:10.1093/jb/mvad121 PMID:38236695	评论	本文讨论了从纯化组件中体外重建大肠杆菌核糖体的历史和最新进展	Aoyama等人最近报道了使用33种重组核糖体蛋白重建50S核糖体，这是向使用重组蛋白和体外转录rRNA完全重建全核糖体复合体迈出的新一步	本文未提及具体限制	探讨体外重建核糖体的意义及其在生物技术和合成生物学中的潜在应用	大肠杆菌的核糖体	NA	NA	重组核糖体蛋白和体外转录rRNA	NA	NA	33种重组核糖体蛋白
22	2024-08-07	Green horizons: how plant synthetic biology can enable space exploration and drive on Earth sustainability 2024-04, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2024.103069 PMID:38341984	研究论文	本文探讨了利用植物合成生物学技术在太空探索中实现资源高效利用和自给自足的可能性，并强调这些技术在地球可持续发展中的应用价值	利用合成生物学技术，将微生物系统的经验应用于碳效率更高的光合作用生物，以满足从燃料到材料和药物的各种需求	NA	探讨植物合成生物学在太空探索和地球可持续发展中的应用	植物合成生物学技术及其在太空和地球环境中的应用	合成生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
23	2024-08-07	Is Life Binary or Gradual? 2024-Apr-27, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life14050564 PMID:38792586	研究论文	本文探讨了生命本质的二元性和非二元性概念，特别是在微生物学、病毒学、合成生物学和系统化学等领域中，中间实体对生命与非生命简单分类的挑战	提出生命可能是一个渐进的光谱，而非简单的二元区分	目前科学状态下，是否存在一个明确的界限仍未确定	探索生命的定义及其在生命起源研究和天体生物学中的应用	生命的本质及其分类	NA	NA	NA	NA	NA	NA
24	2024-08-07	A pilot oral history of plant synthetic biology 2024-Apr-30, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiad585 PMID:38163646	review	本文通过采访8位植物合成生物学领域的创始人，记录并回顾了该领域的起源和发展	首次通过口述历史的方式，系统地记录了植物合成生物学的早期发展历程	由于植物合成生物学领域尚新，历史分析可能不够全面	捕捉植物合成生物学的起源和早期发展的本质	植物合成生物学的创始人和早期发展	合成生物学	NA	NA	NA	文本	8位领域的创始人
25	2024-08-07	Chalkophomycin Biosynthesis Revealing Unique Enzyme Architecture for a Hybrid Nonribosomal Peptide Synthetase and Polyketide Synthase 2024-Apr-25, Molecules (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/molecules29091982 PMID:38731473	研究论文	本文研究了来自sp. CB00271的chalkophomycin的生物合成机制，揭示了其独特的非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的酶结构	首次揭示了chalkophomycin生物合成中独特的酶结构，涉及非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的混合体系	NA	阐明chalkophomycin的生物合成机制，并为通过合成生物学方法工程化chalkophomycin类似物奠定基础	chalkophomycin的生物合成基因簇及其编码的酶	生物化学	NA	基因替换	NA	DNA序列	涉及约31 kb的DNA区域，包含19个开放阅读框
26	2024-08-07	Ribosome Pool Engineering Increases Protein Biosynthesis Yields 2024-Apr-24, ACS central science IF:12.7Q1 DOI:10.1021/acscentsci.3c01413 PMID:38680563	研究论文	研究通过改造细菌核糖体池来提高蛋白质生物合成产量的方法	首次系统地测量了来自不同rRNA操纵子的核糖体的蛋白质生产能力，并展示了通过单一rRNA操纵子表达的均质核糖体池在蛋白质生产中的优越性	NA	探索和利用序列优化的核糖体版本，以提高蛋白质生物合成产量	细菌核糖体及其rRNA操纵子序列的功能差异	合成生物学	NA	核糖体合成和翻译平台	NA	rRNA序列	七种不同的rRNA操纵子序列
27	2024-08-07	Engineering pluripotent stem cells with synthetic biology for regenerative medicine 2024-Apr, Medical review (2021) DOI:10.1515/mr-2023-0050 PMID:38680679	综述	本文综述了利用合成生物学工具在多能干细胞工程领域的进展、挑战及其在再生医学中的应用	介绍了合成受体和遗传电路在精确控制细胞命运决策和功能重建中的作用	该领域仍处于初级阶段，部分原因是缺乏稳健和精确控制干细胞行为的策略	探讨合成生物学在多能干细胞工程中的应用，以推动再生医学的发展	多能干细胞及其衍生的细胞和多细胞系统，特别是类器官	再生医学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
28	2024-08-07	Unravelling and reconstructing the biosynthetic pathway of bergenin 2024-Apr-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-47502-2 PMID:38670975	研究论文	本文阐明了Ardisia japonica中bergenin的生物合成途径，并通过代谢工程在E. coli中重建了其前体的从头生物合成途径，提高了bergenin的产量	首次阐明了bergenin的生物合成途径，并通过合成生物学方法在E. coli中重建了其前体的从头生物合成途径，显著提高了bergenin的产量	NA	阐明bergenin的生物合成途径并提高其产量，以解决其资源短缺问题	bergenin的生物合成途径及其前体的从头生物合成	合成生物学	慢性气管炎	代谢工程	NA	NA	3升生物反应器
29	2024-08-07	A Point Mutation in Cassette Relieves the Repression Regulation of CcpA Resulting in an Increase in the Degradation of 2,3-Butanediol in Lactococcus lactis 2024-Apr-11, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms12040773 PMID:38674718	研究论文	本研究探讨了乳酸乳球菌中CcpA转录调控因子对2,3-丁二醇代谢的影响，发现一个点突变导致CcpA从应答元件解离，从而激活了2,3-丁二醇脱氢酶基因簇的表达	首次报道了乳酸菌中CcpA抑制效应的消除，改变了酶催化方向和碳代谢方向	NA	研究CcpA对乳酸乳球菌中2,3-丁二醇代谢的调控机制	乳酸乳球菌中的CcpA转录调控因子和2,3-丁二醇代谢	NA	NA	定量聚合酶链反应（Q-PCR），微量热泳动实验	NA	转录组数据	N8-1和N8-2两种突变菌株
30	2024-08-07	Biology System Description Language (BiSDL): a modeling language for the design of multicellular synthetic biological systems 2024-Apr-25, BMC bioinformatics IF:2.9Q1 DOI:10.1186/s12859-024-05782-x PMID:38664639	研究论文	介绍了一种名为BiSDL的计算语言，用于设计和模拟多细胞合成生物系统	BiSDL填补了现有技术中在表示多细胞设计中空间性和多层次细胞动态方面的空白	NA	开发一种易于使用的计算语言，用于设计和模拟多细胞合成生物系统	多细胞合成生物系统	合成生物学	NA	NA	Nets-Within-Nets (NWNs)	NA	NA
31	2024-08-07	Utilizing 5' UTR Engineering Enables Fine-Tuning of Multiple Genes within Operons to Balance Metabolic Flux in Bacillus subtilis 2024-Apr-19, Biology DOI:10.3390/biology13040277 PMID:38666889	研究论文	本研究利用高通量筛选策略，从168基因组中识别出一种5' UTR序列，该序列能够显著提高EGFP的表达水平，并通过调控操纵子中的基因表达，优化了枯草芽孢杆菌中的代谢通量，从而增加了核黄素的产量。	本研究首次利用5' UTR序列进行基因表达的精细调控，构建了一个5' UTR库，实现了对操纵子中基因表达的广泛调控，显著提高了核黄素的产量。	NA	通过合成生物学工具精细调控基因表达，优化代谢通量，提高目标产品的产量。	枯草芽孢杆菌中的基因表达和代谢通量调控。	合成生物学	NA	高通量筛选	NA	基因序列	涉及168基因组的5' UTR序列
32	2024-08-07	The biosynthetic logic and enzymatic machinery of approved fungi-derived pharmaceuticals and agricultural biopesticides 2024-Apr-24, Natural product reports IF:10.2Q1 DOI:10.1039/d3np00040k PMID:37990930	研究论文	本文探讨了真菌来源的药物和农业生物农药的生物合成逻辑和酶机制	介绍了通过合成生物学对现有药物进行合理设计和系统生产新化学结构的方法	开发新药物的时间和成本仍然很高	最大化现有药物的利用率，通过合成生物学设计新的化学结构	真菌来源的天然产物及其生物合成基因簇	NA	NA	代谢工程，途径重编程，细胞工厂开发	NA	基因组数据	NA
33	2024-08-07	Multiplex genetic manipulations in Clostridium butyricum and Clostridium sporogenes to secrete recombinant antigen proteins for oral-spore vaccination 2024-Apr-24, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-024-02389-y PMID:38659027	研究论文	本文通过基因工程手段改造梭状芽孢杆菌，使其能够分泌重组抗原蛋白，用于口服疫苗的研发	利用非典型翻译起始密码子AUU，成功克服了在E. coli中克隆困难蛋白的挑战，并实现了在梭状芽孢杆菌中的重组蛋白分泌	NA	探索利用梭状芽孢杆菌作为口服疫苗载体的可能性	梭状芽孢杆菌C. butyricum和C. sporogenes	生物技术	癌症, 病毒性疾病	基因工程	NA	蛋白质	涉及多种梭状芽孢杆菌菌株和重组抗原蛋白
34	2024-08-07	A model-driven approach to upcycling recalcitrant feedstocks in Pseudomonas putida by decoupling PHA production from nutrient limitation 2024-Apr-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113979 PMID:38517887	研究论文	本研究通过模型驱动的方法，利用合成生物学技术重新引导碳流并解除调控限制，实现了在营养非限制条件下提高Pseudomonas putida中PHA产量	成功在生长阶段实现PHA生产，达到高达46%的PHA/细胞干重，并验证了使用酶解聚乙烯对苯二甲酸酯作为原料的上循环场景	NA	克服传统PHA生产生物过程的复杂性，推动PHA生产技术的发展	Pseudomonas putida菌株及PHA生产	合成生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
35	2024-08-07	Metal-Organic Framework-Mediated Delivery of Nucleic Acid across Intact Plant Cells 2024-Apr-17, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.3c19571 PMID:38564422	research paper	本研究探讨了利用金属有机框架（MOFs）通过渗透方式将核酸递送至完整植物细胞的方法	本研究采用了小尺寸的ZIF-8纳米颗粒（小于20 nm），有效实现了DNA/RNA向叶片和根部的递送，并展示了其在保护RNA免受RNase降解和通过递送siRNA沉默内源基因方面的应用	NA	解决植物细胞壁和完整细胞膜对基因递送的挑战	植物细胞和核酸递送	NA	NA	金属有机框架（MOFs）	NA	DNA/RNA	叶片和根部
36	2024-08-07	Strategies for the efficient biosynthesis of β-carotene through microbial fermentation 2024-Apr-12, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2 DOI:10.1007/s11274-024-03955-7 PMID:38607448	综述	本文综述了通过微生物发酵高效合成β-胡萝卜素的研究进展和策略	介绍了利用廉价碳源合成β-胡萝卜素以及提出进一步提高β-胡萝卜素产量的新策略	NA	总结天然类胡萝卜素产生菌和代谢工程策略在工程微生物异源合成β-胡萝卜素中的应用	β-胡萝卜素的微生物发酵合成	NA	心血管疾病	微生物发酵	NA	NA	NA
37	2024-08-07	[Development the agricultural synthesis biology course for postgraduates] 2024-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.230539 PMID:38658161	research paper	本文介绍了为研究生开设的农业合成生物学课程的开发	该课程强调跨学科合作、创新和新技术实际应用，旨在培养学生解决生物育种领域关键科技问题的能力	NA	旨在培养研究生在生物育种领域的科技创新能力	研究生	NA	NA	NA	NA	NA	NA
38	2024-08-07	Engineering a synthetic gene circuit for high-performance inducible expression in mammalian systems 2024-Apr-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-47592-y PMID:38632224	研究论文	本文介绍了一种用于哺乳动物系统中高表现诱导表达的合成基因电路CASwitch的设计与应用	CASwitch结合了Coherent Feed-Forward Loop和Mutual Inhibition两种网络结构，以及CRISPR-Cas内切酶CasRx和Tet-On3G诱导基因系统，实现了在不修改转录因子或启动子的情况下，减少泄漏表达同时保持高表达	NA	设计并验证一种新的合成基因电路，用于在哺乳动物系统中实现高效诱导基因表达	合成基因电路CASwitch及其在不同生物技术应用中的性能	合成生物学	NA	CRISPR-Cas	合成基因电路	基因表达数据	NA
39	2024-08-07	CRISPR-COPIES: an in silico platform for discovery of neutral integration sites for CRISPR/Cas-facilitated gene integration 2024-Apr-12, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae062 PMID:38346683	研究论文	开发了一个名为CRISPR-COPIES的计算平台，用于发现CRISPR/Cas系统辅助基因整合的中性整合位点	利用ScaNN模型进行基于嵌入的最近邻搜索，快速准确地识别细菌和真菌基因组中的基因间位点	NA	解决CRISPR/Cas系统在基因整合中寻找最佳染色体位点的难题	CRISPR/Cas系统的中性整合位点	合成生物学	NA	CRISPR/Cas系统	ScaNN	基因组数据	涉及三种不同物种：酿酒酵母、Cupriavidus necator和HEK293T细胞
40	2024-08-07	Peptide nucleic acid-assisted generation of targeted double-stranded DNA breaks with T7 endonuclease I 2024-Apr-12, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae148 PMID:38421613	研究论文	本文利用γ-修饰的肽核酸（γPNAs）促进靶向特异性DNA入侵，并使用T7核酸内切酶I（T7EI）识别并切割γPNA入侵的DNA，实现双链DNA断裂（DSBs）的引入。	开发了一种新的PNA引导的T7EI（PG-T7EI）技术，该技术能够作为可编程核酸酶，在体外广泛条件下生成单个或多个特定的DSBs，并具有在大型基因组操作中应用的潜力。	NA	探索和扩展DNA操作技术，包括体外和体内的克隆、大片段DNA组装和基因编辑。	γ-修饰的肽核酸（γPNAs）和T7核酸内切酶I（T7EI）在DNA操作中的应用。	生物技术	NA	肽核酸（PNA）和T7核酸内切酶I（T7EI）	NA	DNA	NA