合成生物学相关文章
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当前共找到 68 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
Chalkophomycin Biosynthesis Revealing Unique Enzyme Architecture for a Hybrid Nonribosomal Peptide Synthetase and Polyketide Synthase
2024-Apr-25, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29091982
PMID:38731473
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研究论文 | 本文研究了来自sp. CB00271的chalkophomycin的生物合成机制，揭示了其独特的非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的酶结构 | 首次揭示了chalkophomycin生物合成中独特的酶结构，涉及非核糖体肽合成酶和聚酮合成酶的混合体系 | NA | 阐明chalkophomycin的生物合成机制，并为通过合成生物学方法工程化chalkophomycin类似物奠定基础 | chalkophomycin的生物合成基因簇及其编码的酶 | 生物化学 | NA | 基因替换 | NA | DNA序列 | 涉及约31 kb的DNA区域，包含19个开放阅读框 |
| 22 | 2024-08-07 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明了Aquaporin-1（Aqp1）在多种细胞类型中产生基于扩散的磁共振信号，且不会对细胞活力或形态产生不利影响 | 发现Aqp1的过度表达不会引起内质网应激，也不会对细胞的固有生物活性产生负面影响 | NA | 验证Aqp1作为基因报告器的使用安全性及其在体内研究中的应用 | 来自小鼠和人类的不同细胞系 | 生物医学工程 | NA | 磁共振成像 | NA | 细胞 | 多种细胞系 |
| 23 | 2024-08-07 |
Ribosome Pool Engineering Increases Protein Biosynthesis Yields
2024-Apr-24, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.3c01413
PMID:38680563
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研究论文 | 研究通过改造细菌核糖体池来提高蛋白质生物合成产量的方法 | 首次系统地测量了来自不同rRNA操纵子的核糖体的蛋白质生产能力，并展示了通过单一rRNA操纵子表达的均质核糖体池在蛋白质生产中的优越性 | NA | 探索和利用序列优化的核糖体版本，以提高蛋白质生物合成产量 | 细菌核糖体及其rRNA操纵子序列的功能差异 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成和翻译平台 | NA | rRNA序列 | 七种不同的rRNA操纵子序列 |
| 24 | 2024-08-07 |
Engineering pluripotent stem cells with synthetic biology for regenerative medicine
2024-Apr, Medical review (2021)
DOI:10.1515/mr-2023-0050
PMID:38680679
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综述 | 本文综述了利用合成生物学工具在多能干细胞工程领域的进展、挑战及其在再生医学中的应用 | 介绍了合成受体和遗传电路在精确控制细胞命运决策和功能重建中的作用 | 该领域仍处于初级阶段，部分原因是缺乏稳健和精确控制干细胞行为的策略 | 探讨合成生物学在多能干细胞工程中的应用，以推动再生医学的发展 | 多能干细胞及其衍生的细胞和多细胞系统，特别是类器官 | 再生医学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
Unravelling and reconstructing the biosynthetic pathway of bergenin
2024-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47502-2
PMID:38670975
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研究论文 | 本文阐明了Ardisia japonica中bergenin的生物合成途径，并通过代谢工程在E. coli中重建了其前体的从头生物合成途径，提高了bergenin的产量 | 首次阐明了bergenin的生物合成途径，并通过合成生物学方法在E. coli中重建了其前体的从头生物合成途径，显著提高了bergenin的产量 | NA | 阐明bergenin的生物合成途径并提高其产量，以解决其资源短缺问题 | bergenin的生物合成途径及其前体的从头生物合成 | 合成生物学 | 慢性气管炎 | 代谢工程 | NA | NA | 3升生物反应器 |
| 26 | 2024-08-07 |
A Point Mutation in Cassette Relieves the Repression Regulation of CcpA Resulting in an Increase in the Degradation of 2,3-Butanediol in Lactococcus lactis
2024-Apr-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12040773
PMID:38674718
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸乳球菌中CcpA转录调控因子对2,3-丁二醇代谢的影响，发现一个点突变导致CcpA从应答元件解离，从而激活了2,3-丁二醇脱氢酶基因簇的表达 | 首次报道了乳酸菌中CcpA抑制效应的消除，改变了酶催化方向和碳代谢方向 | NA | 研究CcpA对乳酸乳球菌中2,3-丁二醇代谢的调控机制 | 乳酸乳球菌中的CcpA转录调控因子和2,3-丁二醇代谢 | NA | NA | 定量聚合酶链反应（Q-PCR），微量热泳动实验 | NA | 转录组数据 | N8-1和N8-2两种突变菌株 |
| 27 | 2024-08-07 |
Biology System Description Language (BiSDL): a modeling language for the design of multicellular synthetic biological systems
2024-Apr-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05782-x
PMID:38664639
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研究论文 | 介绍了一种名为BiSDL的计算语言，用于设计和模拟多细胞合成生物系统 | BiSDL填补了现有技术中在表示多细胞设计中空间性和多层次细胞动态方面的空白 | NA | 开发一种易于使用的计算语言，用于设计和模拟多细胞合成生物系统 | 多细胞合成生物系统 | 合成生物学 | NA | NA | Nets-Within-Nets (NWNs) | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Utilizing 5' UTR Engineering Enables Fine-Tuning of Multiple Genes within Operons to Balance Metabolic Flux in Bacillus subtilis
2024-Apr-19, Biology
DOI:10.3390/biology13040277
PMID:38666889
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研究论文 | 本研究利用高通量筛选策略，从168基因组中识别出一种5' UTR序列，该序列能够显著提高EGFP的表达水平，并通过调控操纵子中的基因表达，优化了枯草芽孢杆菌中的代谢通量，从而增加了核黄素的产量。 | 本研究首次利用5' UTR序列进行基因表达的精细调控，构建了一个5' UTR库，实现了对操纵子中基因表达的广泛调控，显著提高了核黄素的产量。 | NA | 通过合成生物学工具精细调控基因表达，优化代谢通量，提高目标产品的产量。 | 枯草芽孢杆菌中的基因表达和代谢通量调控。 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选 | NA | 基因序列 | 涉及168基因组的5' UTR序列 |
| 29 | 2024-08-07 |
The biosynthetic logic and enzymatic machinery of approved fungi-derived pharmaceuticals and agricultural biopesticides
2024-Apr-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00040k
PMID:37990930
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研究论文 | 本文探讨了真菌来源的药物和农业生物农药的生物合成逻辑和酶机制 | 介绍了通过合成生物学对现有药物进行合理设计和系统生产新化学结构的方法 | 开发新药物的时间和成本仍然很高 | 最大化现有药物的利用率，通过合成生物学设计新的化学结构 | 真菌来源的天然产物及其生物合成基因簇 | NA | NA | 代谢工程，途径重编程，细胞工厂开发 | NA | 基因组数据 | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Multiplex genetic manipulations in Clostridium butyricum and Clostridium sporogenes to secrete recombinant antigen proteins for oral-spore vaccination
2024-Apr-24, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02389-y
PMID:38659027
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研究论文 | 本文通过基因工程手段改造梭状芽孢杆菌，使其能够分泌重组抗原蛋白，用于口服疫苗的研发 | 利用非典型翻译起始密码子AUU，成功克服了在E. coli中克隆困难蛋白的挑战，并实现了在梭状芽孢杆菌中的重组蛋白分泌 | NA | 探索利用梭状芽孢杆菌作为口服疫苗载体的可能性 | 梭状芽孢杆菌C. butyricum和C. sporogenes | 生物技术 | 癌症, 病毒性疾病 | 基因工程 | NA | 蛋白质 | 涉及多种梭状芽孢杆菌菌株和重组抗原蛋白 |
| 31 | 2024-08-07 |
A model-driven approach to upcycling recalcitrant feedstocks in Pseudomonas putida by decoupling PHA production from nutrient limitation
2024-Apr-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113979
PMID:38517887
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研究论文 | 本研究通过模型驱动的方法，利用合成生物学技术重新引导碳流并解除调控限制，实现了在营养非限制条件下提高Pseudomonas putida中PHA产量 | 成功在生长阶段实现PHA生产，达到高达46%的PHA/细胞干重，并验证了使用酶解聚乙烯对苯二甲酸酯作为原料的上循环场景 | NA | 克服传统PHA生产生物过程的复杂性，推动PHA生产技术的发展 | Pseudomonas putida菌株及PHA生产 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Metal-Organic Framework-Mediated Delivery of Nucleic Acid across Intact Plant Cells
2024-Apr-17, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c19571
PMID:38564422
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research paper | 本研究探讨了利用金属有机框架（MOFs）通过渗透方式将核酸递送至完整植物细胞的方法 | 本研究采用了小尺寸的ZIF-8纳米颗粒（小于20 nm），有效实现了DNA/RNA向叶片和根部的递送，并展示了其在保护RNA免受RNase降解和通过递送siRNA沉默内源基因方面的应用 | NA | 解决植物细胞壁和完整细胞膜对基因递送的挑战 | 植物细胞和核酸递送 | NA | NA | 金属有机框架（MOFs） | NA | DNA/RNA | 叶片和根部 |
| 33 | 2024-08-07 |
Strategies for the efficient biosynthesis of β-carotene through microbial fermentation
2024-Apr-12, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-03955-7
PMID:38607448
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综述 | 本文综述了通过微生物发酵高效合成β-胡萝卜素的研究进展和策略 | 介绍了利用廉价碳源合成β-胡萝卜素以及提出进一步提高β-胡萝卜素产量的新策略 | NA | 总结天然类胡萝卜素产生菌和代谢工程策略在工程微生物异源合成β-胡萝卜素中的应用 | β-胡萝卜素的微生物发酵合成 | NA | 心血管疾病 | 微生物发酵 | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
[Development the agricultural synthesis biology course for postgraduates]
2024-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230539
PMID:38658161
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research paper | 本文介绍了为研究生开设的农业合成生物学课程的开发 | 该课程强调跨学科合作、创新和新技术实际应用，旨在培养学生解决生物育种领域关键科技问题的能力 | NA | 旨在培养研究生在生物育种领域的科技创新能力 | 研究生 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Engineering a synthetic gene circuit for high-performance inducible expression in mammalian systems
2024-Apr-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47592-y
PMID:38632224
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研究论文 | 本文介绍了一种用于哺乳动物系统中高表现诱导表达的合成基因电路CASwitch的设计与应用 | CASwitch结合了Coherent Feed-Forward Loop和Mutual Inhibition两种网络结构，以及CRISPR-Cas内切酶CasRx和Tet-On3G诱导基因系统，实现了在不修改转录因子或启动子的情况下，减少泄漏表达同时保持高表达 | NA | 设计并验证一种新的合成基因电路，用于在哺乳动物系统中实现高效诱导基因表达 | 合成基因电路CASwitch及其在不同生物技术应用中的性能 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas | 合成基因电路 | 基因表达数据 | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
CRISPR-COPIES: an in silico platform for discovery of neutral integration sites for CRISPR/Cas-facilitated gene integration
2024-Apr-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae062
PMID:38346683
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研究论文 | 开发了一个名为CRISPR-COPIES的计算平台，用于发现CRISPR/Cas系统辅助基因整合的中性整合位点 | 利用ScaNN模型进行基于嵌入的最近邻搜索，快速准确地识别细菌和真菌基因组中的基因间位点 | NA | 解决CRISPR/Cas系统在基因整合中寻找最佳染色体位点的难题 | CRISPR/Cas系统的中性整合位点 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | ScaNN | 基因组数据 | 涉及三种不同物种：酿酒酵母、Cupriavidus necator和HEK293T细胞 |
| 37 | 2024-08-07 |
Peptide nucleic acid-assisted generation of targeted double-stranded DNA breaks with T7 endonuclease I
2024-Apr-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae148
PMID:38421613
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研究论文 | 本文利用γ-修饰的肽核酸（γPNAs）促进靶向特异性DNA入侵，并使用T7核酸内切酶I（T7EI）识别并切割γPNA入侵的DNA，实现双链DNA断裂（DSBs）的引入。 | 开发了一种新的PNA引导的T7EI（PG-T7EI）技术，该技术能够作为可编程核酸酶，在体外广泛条件下生成单个或多个特定的DSBs，并具有在大型基因组操作中应用的潜力。 | NA | 探索和扩展DNA操作技术，包括体外和体内的克隆、大片段DNA组装和基因编辑。 | γ-修饰的肽核酸（γPNAs）和T7核酸内切酶I（T7EI）在DNA操作中的应用。 | 生物技术 | NA | 肽核酸（PNA）和T7核酸内切酶I（T7EI） | NA | DNA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
Revealing the grammar of small RNA secretion using interpretable machine learning
2024-Apr-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100522
PMID:38460515
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研究论文 | 本文介绍了ExoGRU机器学习模型，用于预测小RNA从初级RNA序列中的分泌概率，并通过实验验证了其性能 | 开发了ExoGRU模型和exoCLIP技术，揭示了小RNA分泌的cis和trans因子，包括已知和新发现的RNA结合蛋白 | NA | 揭示小RNA分泌的生物学机制，并探索其在治疗和合成生物学中的应用 | 小RNA的分泌机制及其相关的RNA结合蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习 | ExoGRU | RNA序列 | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Self-assembly of stabilized droplets from liquid-liquid phase separation for higher-order structures and functions
2024-Apr-09, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-024-01168-5
PMID:38594355
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综述 | 本文综述了通过液-液相分离产生的动态微尺度液滴的稳定化策略及其在合成生物学和生物医学材料中的应用 | 探讨了如何通过自组装使稳定化的液滴形成更高阶结构，展示协同功能，以充分发挥其在自下而上合成生物学和生物医学应用中的潜力 | NA | 探讨液滴稳定化及其在合成生物学和生物医学材料中的应用 | 液-液相分离产生的动态微尺度液滴 | NA | NA | 液-液相分离 (LLPS) | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes
2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202307524
PMID:38342618
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研究论文 | 本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过不同颜色的光控制微升尺度水溶液pH值的系统 | 该系统利用两种光驱动质子泵——细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12，在脂质膜中方向相反地排列，将不同颜色的光转化为特定的pH变化 | NA | 开发一种在微升尺度上控制pH值的方法，适用于研究、医学和工业应用 | 工程化蛋白脂质体和光驱动质子泵 | 合成生物学 | NA | 光驱动质子泵 | NA | 溶液pH值 | NA |