合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-08-07	Strategies for the efficient biosynthesis of β-carotene through microbial fermentation 2024-Apr-12, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2 DOI:10.1007/s11274-024-03955-7 PMID:38607448	综述	本文综述了通过微生物发酵高效合成β-胡萝卜素的研究进展和策略	介绍了利用廉价碳源合成β-胡萝卜素以及提出进一步提高β-胡萝卜素产量的新策略	NA	总结天然类胡萝卜素产生菌和代谢工程策略在工程微生物异源合成β-胡萝卜素中的应用	β-胡萝卜素的微生物发酵合成	NA	心血管疾病	微生物发酵	NA	NA	NA
42	2024-08-07	[Development the agricultural synthesis biology course for postgraduates] 2024-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.230539 PMID:38658161	research paper	本文介绍了为研究生开设的农业合成生物学课程的开发	该课程强调跨学科合作、创新和新技术实际应用，旨在培养学生解决生物育种领域关键科技问题的能力	NA	旨在培养研究生在生物育种领域的科技创新能力	研究生	NA	NA	NA	NA	NA	NA
43	2024-08-07	Engineering a synthetic gene circuit for high-performance inducible expression in mammalian systems 2024-Apr-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-47592-y PMID:38632224	研究论文	本文介绍了一种用于哺乳动物系统中高表现诱导表达的合成基因电路CASwitch的设计与应用	CASwitch结合了Coherent Feed-Forward Loop和Mutual Inhibition两种网络结构，以及CRISPR-Cas内切酶CasRx和Tet-On3G诱导基因系统，实现了在不修改转录因子或启动子的情况下，减少泄漏表达同时保持高表达	NA	设计并验证一种新的合成基因电路，用于在哺乳动物系统中实现高效诱导基因表达	合成基因电路CASwitch及其在不同生物技术应用中的性能	合成生物学	NA	CRISPR-Cas	合成基因电路	基因表达数据	NA
44	2024-08-07	CRISPR-COPIES: an in silico platform for discovery of neutral integration sites for CRISPR/Cas-facilitated gene integration 2024-Apr-12, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae062 PMID:38346683	研究论文	开发了一个名为CRISPR-COPIES的计算平台，用于发现CRISPR/Cas系统辅助基因整合的中性整合位点	利用ScaNN模型进行基于嵌入的最近邻搜索，快速准确地识别细菌和真菌基因组中的基因间位点	NA	解决CRISPR/Cas系统在基因整合中寻找最佳染色体位点的难题	CRISPR/Cas系统的中性整合位点	合成生物学	NA	CRISPR/Cas系统	ScaNN	基因组数据	涉及三种不同物种：酿酒酵母、Cupriavidus necator和HEK293T细胞
45	2024-08-07	Peptide nucleic acid-assisted generation of targeted double-stranded DNA breaks with T7 endonuclease I 2024-Apr-12, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae148 PMID:38421613	研究论文	本文利用γ-修饰的肽核酸（γPNAs）促进靶向特异性DNA入侵，并使用T7核酸内切酶I（T7EI）识别并切割γPNA入侵的DNA，实现双链DNA断裂（DSBs）的引入。	开发了一种新的PNA引导的T7EI（PG-T7EI）技术，该技术能够作为可编程核酸酶，在体外广泛条件下生成单个或多个特定的DSBs，并具有在大型基因组操作中应用的潜力。	NA	探索和扩展DNA操作技术，包括体外和体内的克隆、大片段DNA组装和基因编辑。	γ-修饰的肽核酸（γPNAs）和T7核酸内切酶I（T7EI）在DNA操作中的应用。	生物技术	NA	肽核酸（PNA）和T7核酸内切酶I（T7EI）	NA	DNA	NA
46	2024-08-07	Revealing the grammar of small RNA secretion using interpretable machine learning 2024-Apr-10, Cell genomics IF:11.1Q1 DOI:10.1016/j.xgen.2024.100522 PMID:38460515	研究论文	本文介绍了ExoGRU机器学习模型，用于预测小RNA从初级RNA序列中的分泌概率，并通过实验验证了其性能	开发了ExoGRU模型和exoCLIP技术，揭示了小RNA分泌的cis和trans因子，包括已知和新发现的RNA结合蛋白	NA	揭示小RNA分泌的生物学机制，并探索其在治疗和合成生物学中的应用	小RNA的分泌机制及其相关的RNA结合蛋白	机器学习	NA	机器学习	ExoGRU	RNA序列	NA
47	2024-08-07	Self-assembly of stabilized droplets from liquid-liquid phase separation for higher-order structures and functions 2024-Apr-09, Communications chemistry IF:5.9Q1 DOI:10.1038/s42004-024-01168-5 PMID:38594355	综述	本文综述了通过液-液相分离产生的动态微尺度液滴的稳定化策略及其在合成生物学和生物医学材料中的应用	探讨了如何通过自组装使稳定化的液滴形成更高阶结构，展示协同功能，以充分发挥其在自下而上合成生物学和生物医学应用中的潜力	NA	探讨液滴稳定化及其在合成生物学和生物医学材料中的应用	液-液相分离产生的动态微尺度液滴	NA	NA	液-液相分离 (LLPS)	NA	NA	NA
48	2024-08-07	Light Color-Controlled pH-Adjustment of Aqueous Solutions Using Engineered Proteoliposomes 2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202307524 PMID:38342618	研究论文	本文介绍了一种利用工程化蛋白脂质体通过不同颜色的光控制微升尺度水溶液pH值的系统	该系统利用两种光驱动质子泵——细菌视紫红质和蓝光吸收蛋白视紫红质Med12，在脂质膜中方向相反地排列，将不同颜色的光转化为特定的pH变化	NA	开发一种在微升尺度上控制pH值的方法，适用于研究、医学和工业应用	工程化蛋白脂质体和光驱动质子泵	合成生物学	NA	光驱动质子泵	NA	溶液pH值	NA
49	2024-08-07	Insights into the Impact of Trans-Zeatin Overproduction-Engineered Sinorhizobium meliloti on Alfalfa (Medicago sativa L.) Tolerance to Drought Stress 2024-Apr-17, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c00115 PMID:38564678	研究论文	研究通过合成生物学方法改造根瘤菌，使其过量生产反式玉米素，以提高苜蓿对干旱胁迫的耐受性	首次通过基因工程改造植物促生长根瘤菌，增加细胞分裂素的产量，以增强苜蓿的干旱耐受性	在非干旱条件下，改造后的根瘤菌对苜蓿生物量和根瘤形成没有显著影响	研究如何通过基因工程提高苜蓿对干旱胁迫的耐受性	反式玉米素过量生产的根瘤菌和苜蓿	NA	NA	合成生物学	NA	NA	两株改造后的根瘤菌
50	2024-08-07	Research Progress on the Assembly of Large DNA Fragments 2024-Apr-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3 DOI:10.1002/cbic.202400054 PMID:38477700	research paper	本文综述了DNA组装技术的发展现状，特别是大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母中大型DNA片段组装的最新进展	文章强调了在不同宿主中组装大型DNA片段的方法和挑战，这些进展有助于构建定制基因组，修改细胞功能甚至创造人工生命	大型DNA片段由于其高分子量和易断裂性，其组装仍是一个挑战	探讨合成生物学中DNA组装技术的发展，特别是大型DNA片段的组装	DNA组装技术，特别是大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和酿酒酵母中大型DNA片段的组装	合成生物学	NA	DNA组装技术	NA	NA	NA
51	2024-08-07	Rainbow screening: Chromoproteins enable visualized molecular cloning 2024-Apr, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.202400114 PMID:38622790	研究论文	本文介绍了一种名为Rainbow Screening的新方法，通过结合Gibson Assembly和chromoproteins，实现无需额外遗传操作或成本的分子克隆可视化筛选	Rainbow Screening方法简化了分子克隆的可视化过程，无需额外遗传操作或成本，通过肉眼即可区分大肠杆菌菌落	NA	开发一种简化的分子克隆可视化筛选方法	大肠杆菌菌落和插入片段（E. coli 16s rRNA和sfGFP表达模块）	生物技术	NA	Gibson Assembly	NA	菌落	NA
52	2024-08-07	Optogenetic and chemogenetic approaches for modeling neurological disorders in vivo 2024-Apr, Progress in neurobiology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.pneurobio.2024.102600 PMID:38548126	综述	本文综述了基于光遗传学和化学遗传学的动物模型在人类神经退行性疾病研究中的应用	光遗传学和化学遗传学技术为研究人类神经退行性疾病提供了新的机会，能够在细胞水平上模拟多种病理状态	NA	探讨光遗传学和化学遗传学在模拟人类神经退行性疾病中的应用及未来发展方向	人类神经退行性疾病，包括与年龄相关的痴呆、阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、癫痫和共济失调等	NA	神经退行性疾病	光遗传学和化学遗传学	NA	NA	NA
53	2024-08-07	Two Cytochrome P450 Enzymes Form the Tricyclic Nested Skeleton of Meroterpenoids by Sequential Oxidative Reactions 2024-Apr-11, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.4c01943 PMID:38602511	研究论文	本文研究了两种细胞色素P450酶在形成三环嵌套骨架过程中的氧化反应作用	首次发现并证明了ClaR和ClaT两种酶在clavilactone生物合成中的关键作用，特别是ClaR作为大环酶催化非萜类部分的氧化环化	NA	探索并阐明在clavilactone生物合成中形成10/5/3三环嵌套骨架的自然酶机制	clavilactone的生物合成机制及其在真菌中的基因簇	NA	NA	细胞色素P450单加氧酶	NA	基因簇	NA
54	2024-08-07	Engineering transcriptional regulation for cell-based therapies 2024-Apr, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2024.100121 PMID:38340892	综述	本文综述了利用合成生物学工具，特别是基于跨膜受体的转录调控平台，来开发细胞疗法的当前工程方法	探讨了将跨膜受体与转录激活平台结合的潜力，以及如何通过这些技术实现对基因调控的更精确控制	尚未完全实现跨膜受体与转录激活平台的全部潜力	探索和改进用于细胞疗法的转录调控技术，特别是在响应外部信号方面	哺乳动物细胞中的转录调控系统	合成生物学	NA	转录调控	NA	NA	NA
55	2024-08-07	Experimental and biophysical modeling of transcription and translation dynamics in bacterial- and mammalian-based cell-free expression systems 2024-Apr, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2022.02.001 PMID:35231628	研究论文	本文开发了一个基于常微分方程（ODE）的生物物理模型，用于模拟细菌和哺乳动物细胞自由表达系统中的转录和翻译动力学	首次提出了一种适用于细菌和哺乳动物细胞自由表达系统的计算模型	NA	为基因回路定量研究提供一个标准的生物物理模型，以深入理解细胞自由表达系统的基本工作机制	细菌和哺乳动物细胞自由表达系统中的转录和翻译动力学	合成生物学	NA	NA	ODE	实验数据	四个基因回路在E. coli和HeLa细胞自由表达系统中的测试
56	2024-08-07	Recent advances of droplet-based microfluidics for engineering artificial cells 2024-Apr, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2023.05.002 PMID:37245659	综述	本文总结了基于液滴的微流控技术在人工细胞合成方面的最新进展	介绍了多种基于液滴的微流控设备类型及其在多隔室囊泡和人工细胞形成中的应用	讨论了当前基于液滴的微流控方法在工程人工细胞方面的挑战和未来展望	构建具有最少部件和复杂性的活细胞	人工细胞的合成及其在基因表达、细胞间通信和机械生物学中的应用	微流控技术	NA	基于液滴的微流控技术	NA	NA	NA
57	2024-08-07	Employing synthetic biology to expand antibiotic discovery 2024-Apr, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2024.100120 PMID:38340893	综述	本文综述了利用合成生物学在抗生素发现领域的最新进展	合成生物学被用作预测和诱导新型天然抗生素的关键策略，通过克隆和突变技术来识别和修改抗生素生物合成基因簇（BGCs），以产生更有效的抗生素	NA	探索和改进抗生素的生物合成途径，以对抗抗药性细菌	抗生素生物合成基因簇（BGCs）及其相关的非核糖体肽合成酶（NRPS）和聚酮合成酶（PKS）途径	合成生物学	抗药性细菌感染	克隆和突变技术	NA	基因序列	NA
58	2024-08-07	Biosafety and biosecurity: treading China's synbio tightrope 2024-Apr, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.014 PMID:37957090	research paper	本文分析了中国在合成生物学领域如何在促进创新与实施严格监管之间进行复杂平衡	NA	NA	探讨如何在中国合成生物学领域增强生物安全和生物安保，以及提升公众信任	中国合成生物学领域的创新与监管平衡	NA	NA	NA	NA	NA	NA
59	2024-08-07	Design of a Biohybrid Materials Circuit with Binary Decoder Functionality 2024-Apr, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202308092 PMID:38118057	研究论文	本文设计了一种基于蛋白酶的生物混合材料电路，具有二进制解码功能	开发了一组可通过诱导或抑制其生物活性来调控的蛋白酶基生物混合模块，并将其应用于材料中进行信息处理	NA	将合成生物学中的计算功能转移到材料系统中，实现高级信息处理电路的实现	蛋白酶基生物混合模块及其在材料中的应用	生物技术	NA	生物工程	NA	生物分子	2输入/4输出二进制解码器
60	2024-08-07	The emerging tumor microbe microenvironment: From delineation to multidisciplinary approach-based interventions 2024-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B DOI:10.1016/j.apsb.2023.11.018 PMID:38572104	综述	本文综述了肿瘤微环境中的微生物群落，探讨了其在肿瘤发生、转移、免疫监视和预后中的作用，以及多学科方法在肿瘤微生物组干预中的应用。	强调了肿瘤微环境中微生物群落的新角色及其对传统肿瘤微环境的多样化影响。	NA	深入理解癌症-免疫-微生物的相互作用，并促进基于微生物的肿瘤特异性治疗的发展。	肿瘤微环境中的微生物群落及其在不同类型肿瘤中的异质性。	NA	NA	NA	NA	NA	NA