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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Unveiling Amaryllidaceae alkaloids: from biosynthesis to antiviral potential - a review
2024-05-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00044c
PMID:38131392
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综述 | 本文综述了石蒜科生物碱从生物合成到抗病毒潜力的研究进展 | 整合了2017-2023年最新研究成果,强调合成和对映选择性研究在验证生物合成结论中的关键作用,并确立其作为抗病毒先导化合物的潜力 | 生物合成途径尚未完全阐明,需要进一步跨学科研究来理解结构-活性关系 | 系统梳理石蒜科生物碱的生物合成途径及其抗病毒应用潜力 | 石蒜科生物碱及其生物合成途径 | 天然产物化学与合成生物学 | 病毒性疾病 | 天然产物化学、合成有机化学、生物化学、系统生物学、合成生物学 | NA | 文献资料与实验数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 2 | 2025-10-05 |
Bacterial cyclophane-containing RiPPs from radical SAM enzymes
2024-05-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00030c
PMID:38047390
|
综述 | 本文重点介绍由自由基SAM/SPASM酶催化的细菌单芳基环烷结构RiPPs天然产物的生物合成途径、发现方法和应用前景 | 系统总结了2016-2023年间细菌环烷结构RiPPs的研究进展,重点关注其独特的生物合成机制和药物开发潜力 | 仅聚焦于细菌来源的单芳基环烷RiPPs,未涵盖其他类型环烷结构或真核生物来源的RiPPs | 探讨含环烷结构的核糖体合成后修饰肽(RiPPs)的生物合成途径、酶学机制和应用价值 | 细菌来源的环烷结构RiPPs天然产物及其生物合成酶 | 天然产物化学 | 细菌感染 | 自由基SAM/SPASM酶催化 | NA | 文献综述 | NA | NA | 细菌 | NA | 药物发现, 合成生物学 |
| 3 | 2025-10-05 |
A new mRNA structure prediction based approach to identifying improved signal peptides for bone morphogenetic protein 2
2024-05-23, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00858-1
PMID:38783306
|
研究论文 | 开发了一种基于mRNA结构预测的信号肽筛选方法,用于改进骨形态发生蛋白2的生产 | 首次结合氨基酸序列和mRNA二级结构预测来系统筛选信号肽,将MXFold2等计算工具应用于信号肽工程 | mRNA结构预测工具在此应用中可靠性不足,筛选的信号肽在C2C12细胞中活性均不如天然序列 | 开发基于计算预测的信号肽筛选方法,提高BMP2蛋白的生产效率 | 骨形态发生蛋白2(BMP2)及其信号肽 | 合成生物学 | 骨科疾病 | mRNA结构预测,信号肽活性预测,细胞培养实验 | SignalP,DeepLoc,MXFold2 | 氨基酸序列,核苷酸序列 | 2,611个TGF-β超家族信号肽,7个选定序列进行体外测试 | NA | HEK293T细胞,C2C12细胞 | NA | 医学 |
| 4 | 2025-10-05 |
Rational construction of synthetic consortia: Key considerations and model-based methods for guiding the development of a novel biosynthesis platform
2024 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108348
PMID:38531490
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综述 | 本文系统比较了单培养系统与合成菌群的优缺点,总结了构建合成菌群的关键考量因素,并讨论了指导合成菌群发展的模拟与计算工具 | 提出了结合人工智能和机器学习等新兴技术开发更高效、更具成本效益的合成菌群的新方向 | 合成菌群研究仍处于起步阶段,在稳定合成菌群的设计和构建方面存在诸多挑战 | 指导新型生物合成平台的开发 | 合成菌群(由两个或多个具有互补功能的微生物物种或菌株组成) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、人工智能、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 微生物物种或菌株 | 合成菌群系统 | 工业生物技术 |
| 5 | 2025-10-05 |
Robust genetic codes enhance protein evolvability
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002594
PMID:38754362
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研究论文 | 通过大规模并行实验分析数百种重编程遗传密码对蛋白质进化能力的影响 | 首次系统证明稳健遗传密码通过创造平滑的适应性景观来增强蛋白质进化能力,并发现标准遗传密码在进化能力方面并非最优 | 进化能力最优化的遗传密码在一定程度上取决于氨基酸序列与蛋白质功能的具体关系 | 探究遗传密码的稳健性对蛋白质进化能力的影响机制 | mRNA序列和蛋白质功能关系 | 合成生物学 | NA | 大规模并行序列到功能分析 | 适应性景观模型 | 序列数据 | 每个景观包含超过1600万条mRNA序列 | 遗传密码重编程 | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 |
| 6 | 2025-10-05 |
Synthetic biology approaches for improving the specificity and efficacy of cancer immunotherapy
2024-May, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01153-x
PMID:38605087
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综述 | 本文综述了合成生物学方法在提高癌症免疫疗法特异性和疗效方面的应用现状与前景 | 强调合成生物学通过工程化活细胞和基因回路来增强免疫疗法的特异性、可控性和疗效 | NA | 探讨合成生物学在克服癌症免疫疗法挑战中的应用潜力 | 癌症免疫疗法和合成生物学策略 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 工程化免疫细胞 | 靶向肿瘤表面抗原的工程化免疫细胞和检测肿瘤内疾病特征的工程化基因回路 | 医学 |
| 7 | 2025-10-05 |
Controlled Supramolecular Polymerization via Bioinspired, Liquid-Liquid Phase Separation of Monomers
2024-05-08, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c01377
PMID:38683934
|
研究论文 | 通过仿生液-液相分离策略实现可控超分子聚合 | 提出将亚稳态凝聚液滴作为休眠单体相用于可控超分子聚合的新视角,并展示了具有活生长特性的种子诱导聚合 | NA | 开发受蛋白质自组装启发的可控超分子聚合方法 | 基于π共轭单体的合成超分子聚合物 | 材料科学 | NA | 光谱学表征、显微镜表征 | NA | 光谱数据、显微镜图像 | NA | NA | NA | NA | 材料 |
| 8 | 2024-12-20 |
A vector system for single and tandem expression of cloned genes and multi-colour fluorescent tagging in Haloferax volcanii
2024-05, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001461
PMID:38787390
|
研究论文 | 本文开发了一种在嗜盐古菌中进行单基因和串联表达的质粒载体系统,并实现了多色荧光标记 | 本文创新性地设计了包含多种密码子优化荧光蛋白的质粒载体,用于蛋白质的N端或C端标记,并展示了其在细胞骨架蛋白融合中的应用 | 本文未详细讨论该系统在其他古菌物种中的适用性及其在大规模应用中的潜在限制 | 开发用于古菌分子和细胞生物学及生物技术研究的新工具 | 嗜盐古菌中的蛋白质表达、定位及功能研究 | 合成生物学 | NA | 荧光蛋白标记 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-12-18 |
In vitro generation of genetic diversity for directed evolution by error-prone artificial DNA synthesis
2024-05-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06340-0
PMID:38789612
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研究论文 | 本文介绍了一种通过易错人工DNA合成(epADS)在体外生成遗传多样性的方法,用于定向进化的应用 | 提出了通过易错人工DNA合成(epADS)生成遗传多样性的新方法,丰富了定向进化的工具箱 | NA | 探索在合成生物学中用于定向进化的遗传多样性生成方法 | 基因编码的荧光蛋白、调控遗传元件、合成基因回路以及微生物对卡贝西林的耐受性 | 合成生物学 | NA | 易错人工DNA合成(epADS) | NA | DNA序列 | 基因编码的荧光蛋白、调控遗传元件、合成基因回路以及微生物样本 | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-12-16 |
Landscape of human organoids: Ideal model in clinics and research
2024-May-06, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2024.100620
PMID:38706954
|
综述 | 本文综述了人类类器官领域的现状和未来发展趋势,涵盖了其在临床和研究中的应用 | 本文首次提供了对类器官领域全面且准确的概述,结合了学术研究、工业应用和临床实践的经验 | 本文主要为综述性质,未涉及具体的实验数据或技术细节 | 旨在填补类器官领域缺乏全面概述的空白,并为研究人员、临床医生和患者提供有价值的见解 | 类器官技术及其在个性化医疗、肿瘤学、药物发现等领域的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-10-30 |
Microbial remediation of petroleum-contaminated soil focused on the mechanism and microbial response: a review
2024-May, Environmental science and pollution research international
DOI:10.1007/s11356-024-33474-9
PMID:38709405
|
综述 | 本文综述了微生物修复石油污染土壤的机制和微生物响应 | 本文提出了合成生物学和新技术组合的独特视角,为研究趋势提供了见解 | 本文未详细讨论具体的实验数据或案例研究 | 探讨微生物修复石油污染土壤的机制和未来发展方向 | 石油污染土壤的微生物修复方法及其影响因素 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-09-07 |
Integrating microfluidics and synthetic biology: advancements and diverse applications across organisms
2024-05-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc01090b
PMID:38712893
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综述 | 本文综述了微流控技术与合成生物学的结合及其在不同生物体中的应用 | 本文创新性地探讨了微流控平台在合成生物学中的作用,特别是其在自动化设计-构建-测试-学习循环中的应用 | 本文主要为综述性质,未涉及具体实验数据或技术细节 | 探讨微流控技术如何促进合成生物学在不同领域中的应用 | 细菌细胞、酵母、真菌、动物细胞及无细胞系统 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-21 |
Blue light-mediated gene expression as a promising strategy to reduce antibiotic resistance in Escherichia coli
2024-May, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400023
PMID:38719589
|
研究论文 | 本文研究了利用蓝光调控基因表达系统来减少大肠杆菌对抗生素的耐药性 | 首次成功应用蓝光调控基因表达系统,有效降低了工程化大肠杆菌对氨苄西林和链霉素的耐药性 | NA | 开发新兴的非传统技术以应对抗生素耐药性的挑战 | 大肠杆菌的抗生素耐药性 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | 工程化大肠杆菌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
Exploring the landscape of synthetic IL-6-type cytokines
2024-May, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16909
PMID:37467060
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研究论文 | 本文探讨了合成IL-6型细胞因子的研究进展及其潜在临床应用 | 介绍了通过突变、融合蛋白和细胞因子互换等合成生物学方法,开发出具有改变的受体亲和力、扩展的目标细胞谱和非天然细胞因子受体复合物靶向的IL-6型细胞因子 | 目前天然类似IL-6型细胞因子的促炎作用阻碍了基于这些细胞因子的治疗药物的开发 | 探索合成IL-6型细胞因子的方法及其在治疗2型糖尿病和脑损伤中的潜在应用 | IL-6型细胞因子及其合成变体 | NA | 自身免疫疾病,慢性炎症,癌症,2型糖尿病,脑损伤 | 合成生物学方法,包括突变、融合蛋白和细胞因子互换 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
Advances and prospects in microbial production of biotin
2024-May-12, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02413-1
PMID:38735926
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综述 | 本文综述了生物素生物合成的途径和调控机制,并讨论了通过传统化学诱变和先进代谢工程提高生物素产量的策略 | 介绍了合成生物学领域中利用微生物细胞工厂生产生物素的新方法,作为化学合成的成本效益替代方案 | 探讨了微生物生物素生产的局限性和未来展望 | 旨在提高生物素产量并深入探讨系统代谢工程方法 | 生物素的生物合成途径和调控机制 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-07 |
Nanodiamonds in biomedical research: Therapeutic applications and beyond
2024-May, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgae198
PMID:38983694
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综述 | 本文综述了纳米钻石(NDs)在生物医学领域的应用及其潜在用途 | 纳米钻石因其高生物相容性、体内稳定性和可调控的表面化学性质,在生物医学应用中具有广泛潜力 | NA | 旨在深入理解纳米钻石在预防、诊断和治疗人类疾病方面的应用 | 纳米钻石及其在生物医学领域的应用 | 生物医学 | NA | NA | NA | NA | 约2000篇最近5年内发表的文章,包括150多篇相关出版物 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
Designing RNA switches for synthetic biology using inverse-RNA-folding
2024-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.11.005
PMID:38040620
|
研究论文 | 本文讨论了如何利用逆RNA折叠技术精确设计RNA开关 | 介绍了逆RNA折叠技术在RNA开关设计中的应用 | NA | 探讨RNA开关的精确设计方法 | RNA开关的设计 | 合成生物学 | NA | 逆RNA折叠 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
Implications of Artificial Intelligence in Addressing Antimicrobial Resistance: Innovations, Global Challenges, and Healthcare's Future
2024-May-29, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13060502
PMID:38927169
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research paper | 本文探讨了人工智能在应对抗生素抗药性方面的创新策略及其面临的全球挑战和未来医疗的影响 | 人工智能可以分析基因组数据以早期检测抗药性标记,优化抗生素使用,并加速新药物的发现 | 数据质量、模型可解释性和实际应用中的挑战仍然存在 | 研究人工智能在解决抗生素抗药性问题中的应用和潜力 | 抗生素抗药性问题及其对全球公共健康的影响 | machine learning | NA | AI | NA | genomic data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
Engineered probiotics as live biotherapeutics for diagnosis and treatment of human diseases
2024-May, Critical reviews in microbiology
IF:6.0Q1
DOI:10.1080/1040841X.2023.2190392
PMID:36946080
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研究论文 | 本文总结了传统益生菌的作用机制及其局限性,并强调了利用合成生物学设计构建用于疾病检测和治疗的工程化益生菌的最新进展 | 利用合成生物学技术开发具有特定特性和功能的工程化益生菌,以改善人类健康 | 讨论了工程化益生菌的相关担忧及相应对策 | 探讨工程化益生菌作为活体生物治疗剂的设计和构建,用于检测和治疗一系列疾病 | 工程化益生菌的设计和构建,以及其在多种疾病治疗中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Understanding and manipulating extracellular behaviors of Wnt ligands
2024-May, In vitro cellular & developmental biology. Animal
DOI:10.1007/s11626-024-00856-9
PMID:38379096
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研究论文 | 本文探讨了Wnt配体在细胞外的行为,并讨论了量化分析方法和分子操控技术 | 介绍了使用荧光相关光谱(FCS)和荧光恢复后漂白(FRAP)等量化分析方法来理解Wnt配体的细胞外行为 | Wnt配体的实际空间分布及其在细胞外空间的行为仍知之甚少 | 理解Wnt配体在细胞外的行为及其在发育、器官形成、癌症和干细胞功能中的作用 | Wnt配体及其在细胞外的行为 | NA | NA | 荧光相关光谱(FCS),荧光恢复后漂白(FRAP) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |