合成生物学相关文章
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当前共找到 62 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
[Closed-loop synthetic gene circuits for cell-based therapies]
2024-May, Medecine sciences : M/S
DOI:10.1051/medsci/2024054
PMID:38819279
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研究论文 | 本文探讨了利用闭环合成基因电路的细胞疗法，这些细胞能够自主治疗慢性疾病 | 最新一代的合成电路通过先进的生物工程策略来解决安全性和可行性问题 | 这些疗法在临床上仍面临安全性和体内实施可行性的挑战 | 旨在开发新的细胞疗法，用于自主治疗慢性疾病 | 闭环合成基因电路的细胞 | 合成生物学 | 慢性疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-07 |
CRISPR-Cas tools for simultaneous transcription & translation control in bacteria
2024-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae275
PMID:38613390
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研究论文 | 本文利用CRISPR-dCas13系统在细菌中实现对基因转录和翻译的同时控制 | 通过结合dCas9的转录激活和dCas13的翻译抑制，实现了在多基因操纵子中选择性激活单个基因，并减少了极性效应 | NA | 开发能够在微生物合成生物学中精确控制基因翻译的工具 | 大肠杆菌中的基因转录和翻译控制 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13 | NA | 基因组数据 | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
Nudix hydrolase WvNUDX24 is involved in borneol biosynthesis in Wurfbainia villosa
2024-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16669
PMID:38323895
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研究论文 | 本文研究了Nudix水解酶WvNUDX24在Wurfbainia villosa中参与龙脑生物合成的作用 | 首次报道了负责将龙脑二磷酸（BPP）水解生成龙脑的酶 | NA | 鉴定并功能性表征参与龙脑生物合成的Nudix水解酶WvNUDX24 | Nudix水解酶WvNUDX24及其在龙脑生物合成中的作用 | NA | NA | 定点突变实验 | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
Circular single-stranded DNA as a programmable vector for gene regulation in cell-free protein expression systems
2024-May-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49021-6
PMID:38821953
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研究论文 | 本文介绍了一种可编程的载体——环状单链DNA（CssDNA），用于在基于酵母的无细胞蛋白表达系统中进行基因表达调控 | CssDNA不仅可用于通过正义CssDNA和反义CssDNA的不同途径进行基因调控，还可构建为无细胞蛋白表达系统中的几种基因调控逻辑门 | NA | 探索CssDNA在基因表达和基因调控中的应用，丰富合成生物学工具箱 | 环状单链DNA（CssDNA）在无细胞蛋白表达系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
A new mRNA structure prediction based approach to identifying improved signal peptides for bone morphogenetic protein 2
2024-May-23, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00858-1
PMID:38783306
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研究论文 | 本文提出了一种基于mRNA结构预测的新方法，用于系统筛选候选信号肽序列，以改进骨形态发生蛋白2（BMP2）的生产 | 首次将mRNA结构预测应用于信号肽选择，结合多种计算工具进行信号肽活性、定位目标和mRNA结构的预测 | mRNA结构预测的准确性有待提高，且实验结果显示在不同细胞系中信号肽活性的表现不一 | 开发一种系统筛选候选信号肽序列的方法，以提高BMP2的生产效率和降低成本 | 骨形态发生蛋白2（BMP2）的信号肽 | 生物信息学 | NA | 计算工具（SignalP, DeepLoc, MXFold2） | NA | 氨基酸序列, mRNA结构 | 2,611个来自TGF-β超家族的信号肽序列 |
| 26 | 2024-08-07 |
ORBIT for E. coli: kilobase-scale oligonucleotide recombineering at high throughput and high efficiency
2024-May-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae227
PMID:38587185
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ORBIT的高效高通量方法，用于在E. coli中进行千碱基规模的基因组修饰 | ORBIT方法使用DNA寡核苷酸指导非复制性质粒的整合，显著提高了效率并支持高吞吐量操作 | NA | 开发一种新的基因组修饰方法，以克服现有方法的低效率和难以规模化的问题 | E. coli的基因组 | 合成生物学 | NA | DNA寡核苷酸重组技术 | NA | 基因组数据 | 数千个独特的基因组条码（>30k） |
| 27 | 2024-08-07 |
Synthetic biology approaches for improving the specificity and efficacy of cancer immunotherapy
2024-May, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-024-01153-x
PMID:38605087
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综述 | 本文综述了合成生物学在提高癌症免疫治疗特异性、可控性和疗效方面的应用和未来展望 | 合成生物学为克服免疫治疗中的挑战提供了创新工具，特别是通过工程化免疫细胞和基因电路来增强治疗的特异性和可控性 | 文章未明确提及当前研究的局限性 | 探讨合成生物学在癌症免疫治疗中的应用，以提高治疗的特异性和疗效 | 癌症免疫治疗中的挑战，包括靶向非肿瘤毒性、系统性毒性和治疗效果的持续性 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Cell envelope and stress-responsive pathways underlie an evolved oleaginous Rhodotorula toruloides strain multi-stress tolerance
2024-May-28, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02518-0
PMID:38807231
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研究论文 | 本研究通过适应性实验室进化方法，从三倍体变为二倍体，产生了对多种抑制化合物和甲醇具有耐受性的红油酵母Rhodotorula toruloides菌株，并进行了基因组和转录组分析 | 本研究通过适应性实验室进化方法，成功提高了Rhodotorula toruloides菌株对多种压力的耐受性，并揭示了相关的基因和通路 | NA | 研究Rhodotorula toruloides菌株对多种压力的耐受性机制 | 红油酵母Rhodotorula toruloides菌株 | NA | NA | 适应性实验室进化、基因组分析、转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 21,489个突变和242个基因显示拷贝数变异 |
| 29 | 2024-08-07 |
The effect of pseudoknot base pairing on cotranscriptional structural switching of the fluoride riboswitch
2024-May-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae231
PMID:38567721
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研究论文 | 研究了伪结碱基配对对转录过程中氟化物核开关结构转换的影响 | 发现了单个摆动碱基对在伪结功能中的关键作用，并通过分子动力学模拟支持了实验结果 | NA | 探讨RNA序列变化如何影响转录过程中动态构象变化 | 氟化物核开关，一种通过伪结适配子域和下游内在终止子表达平台协调折叠和重排的非编码RNA | 生物学 | NA | 体外转录和细胞基因表达分析 | NA | RNA序列 | 涉及中温和高温氟化物核开关变体 |
| 30 | 2024-08-07 |
A Gene-Switch Platform Interfacing with Reactive Oxygen Species Enables Transcription Fine-Tuning by Soluble and Volatile Pharmacologics and Food Additives
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202306333
PMID:38526196
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研究论文 | 本研究开发了一种基于活性氧物种（ROS）的哺乳动物基因开关平台，能够通过多种分子精细调控治疗基因的表达 | 该系统利用KEAP1作为ROS传感器，通过NRF2的核转位激活目标基因表达，扩展了可驱动治疗基因开关的小分子诱导剂种类 | NA | 旨在通过合成生物学方法，精确控制基于细胞的基因治疗中的治疗蛋白质表达 | 开发一种能够通过多种分子生成低毒性ROS来控制治疗基因表达的基因开关平台 | 合成生物学 | 糖尿病 | NA | NA | NA | 实验使用了患有1型糖尿病的小鼠模型 |
| 31 | 2024-08-07 |
Advancing Engineered Plant Living Materials through Tobacco BY-2 Cell Growth and Transfection within Tailored Granular Hydrogel Scaffolds
2024-May-22, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c00338
PMID:38799669
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研究论文 | 本研究介绍了一种创新的方法，利用合成生物学和工程学的复杂相互作用，在定制的颗粒水凝胶支架内精确空间图案化和遗传转化烟草BY-2细胞系 | 本研究开发了一种3D生物打印技术，能够在定制的颗粒水凝胶支架内同时促进烟草BY-2细胞的生长和遗传转化，展示了EPLMs的独特结构和功能特性 | NA | 推动工程化植物活体材料的发展 | 烟草BY-2细胞系及其在定制水凝胶支架内的生长和转化 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印技术 | NA | 细胞 | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
New strategies to study in depth the metabolic mechanism of astaxanthin biosynthesis in Phaffia rhodozyma
2024-May-26, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2344578
PMID:38797672
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综述 | 本文综述了虾青素生物合成代谢途径、调控机制及提高产量的初步策略 | 提出了利用组学、基因组编辑、蛋白质结构-活性分析和合成生物学等前沿方法深入研究虾青素合成机制的新策略 | 需要进一步研究关键基因的具体功能、双功能酶的作用机制和代谢通量的调控，以完全揭示虾青素合成的完整途径 | 深入研究虾青素生物合成的代谢机制并提高其产量 | 虾青素在Phaffia rhodozyma中的生物合成 | NA | NA | 组学、基因组编辑、蛋白质结构-活性分析、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Enzyme-assisted high throughput sequencing of an expanded genetic alphabet at single base resolution
2024-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48408-9
PMID:38744910
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研究论文 | 本文报道了一种酶辅助的扩展遗传字母序列（ESEGA）方法，用于在单碱基分辨率下测序六字母的AEGIS DNA | 开发了一种新的酶辅助序列方法ESEGA，用于测序扩展的遗传字母DNA，并展示了其在优化条件下的六核苷酸PCR中的应用 | NA | 开发适用于扩展DNA的分析工具，以支持其在生物技术中的进一步应用 | 扩展的遗传字母DNA（AEGIS DNA）及其在生物技术中的应用 | 合成生物学 | NA | 酶辅助序列方法（ESEGA） | NA | DNA序列 | 涉及六核苷酸PCR的优化条件及多种DNA聚合酶的保真性评估 |
| 34 | 2024-08-07 |
N-Terminal Amino Acid Affects the Translation Efficiency at Lower Temperatures in a Reconstituted Protein Synthesis System
2024-May-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25105264
PMID:38791303
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研究论文 | 研究了N端氨基酸序列对基于PURE系统的蛋白质合成效率的影响，特别是在低温条件下 | 发现N端单个氨基酸替换显著改变了PURE系统中的翻译效率，尤其是在低温条件下 | NA | 探讨N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | N端氨基酸序列对蛋白质合成效率的影响 | 合成生物学 | NA | 细胞自由蛋白质合成系统 | NA | 氨基酸序列 | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
An integrative database and its application for plant synthetic biology research
2024-May-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.100827
PMID:38297840
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研究论文 | 构建了一个基于网络的植物合成生物学数据库（PSBD），用于分类和提供植物合成生物学研究中的生物部件和化学物质信息 | PSBD数据库整合了1677个催化生物部件和384个调控元件，并提供了在线生物信息学工具，以辅助植物基因表达的合理设计 | NA | 开发一个集成且用户为中心的平台，为植物合成生物学研究提供一站式服务 | 植物合成生物学中的生物部件和化学物质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 1677个催化生物部件，384个调控元件，309个物种，850种化学物质 |
| 36 | 2024-08-07 |
Unveiling Amaryllidaceae alkaloids: from biosynthesis to antiviral potential - a review
2024-May-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00044c
PMID:38131392
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综述 | 本文综述了Amaryllidaceae生物碱（AAs）的结构多样性、生物合成途径及其在抗病毒药物发现中的潜在应用 | 本文强调了合成和手性选择性研究在验证生物合成结论中的关键作用，并探讨了AAs作为抗病毒药物先导化合物的潜力 | AAs的生物合成过程尚未完全定义，需要进一步的跨学科努力以完全理解其生物合成途径及其结构-活性关系 | 探讨Amaryllidaceae生物碱的生物合成途径及其在抗病毒药物发现中的应用 | Amaryllidaceae生物碱及其生物合成途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
Ethics and engagement: steering China's synbio future
2024-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.013
PMID:37968158
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研究论文 | 本文探讨了公众参与和伦理指导在塑造中国合成生物学未来发展轨迹中的关键作用 | NA | NA | 探讨公众参与和伦理指导在合成生物学领域中的重要性 | 合成生物学在中国的发展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-07 |
The hope, hype and obstacles surrounding cell therapy
2024-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.18359
PMID:38770886
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研究论文 | 本文探讨了细胞疗法在医学领域的希望与挑战 | 介绍了合成生物学在细胞疗法中的潜在解决方案 | 细胞疗法在治疗某些疾病如遗传性疾病和纤毛病方面的局限性 | 分析细胞疗法的潜力及其在不同疾病治疗中的应用 | 干细胞及其衍生品在疾病治疗中的应用 | NA | 糖尿病, 帕金森病, 镰状细胞病, 遗传性疾病, 纤毛病 | 细胞疗法, 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-07 |
Bacterial cyclophane-containing RiPPs from radical SAM enzymes
2024-May-22, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d3np00030c
PMID:38047390
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research paper | 本文聚焦于细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs，这些RiPPs由自由基SAM/SPASM酶产生，通过在 precursor peptide 的两个氨基酸残基的芳香环和侧链之间形成交联。 | 本文介绍了近年来含环状聚酰胺的RiPP天然产物及其生物合成途径的发现，并讨论了这些途径和产品的发现方法。 | NA | 探讨细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs及其生物合成酶，作为药物发现和合成生物学工具的未开发资源。 | 细菌中含单芳基环状聚酰胺的RiPPs及其生物合成酶。 | NA | NA | 自由基SAM/SPASM酶 | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-07 |
Reverse engineering morphogenesis through Bayesian optimization of physics-based models
2024-May-07, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00375-z
PMID:38714708
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研究论文 | 本文通过贝叶斯优化物理模型，逆向工程了形态发生过程，以匹配实验观察到的器官形状 | 开发了一种贝叶斯优化框架，利用高斯过程回归学习形态发生程序的映射函数，成功推断出模拟数据与实验数据匹配所需的核心参数变化 | NA | 解决物理模型参数校准的逆问题，优化细胞力分布以预测器官形状、大小和功能 | 果蝇翅膀的成虫盘，研究从发育到癌症的表皮过程 | 系统生物学 | NA | 贝叶斯优化 | 高斯过程回归 | 图像数据 | 果蝇翅膀成虫盘样本 |