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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2024-08-07 |
Developing the E. coli platform for efficient production of UMP-derived chemicals
2024-May, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.03.004
PMID:38522576
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研究论文 | 本文通过设计一个人工途径,首次在E. coli中实现了5-甲基尿苷(5-MU)的高效生产,并进一步开发了一个多功能且稳健的平台,用于生产多种UMP衍生化学品。 | 首次在E. coli中通过设计的人工途径高效生产5-MU,并开发了抗生素免费发酵策略,实现了5-MU的高产量。 | NA | 开发E. coli平台,用于高效生产UMP衍生化学品。 | 5-甲基尿苷(5-MU)及其衍生化学品。 | 合成生物学 | NA | 酶工程 | NA | NA | E. coli MB229 (ΔthyA 菌株) |
42 | 2024-08-07 |
Self-controlled in silico gene knockdown strategies to enhance the sustainable production of heterologous terpenoid by Saccharomyces cerevisiae
2024-May, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.04.005
PMID:38648878
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研究论文 | 本研究利用合成生物学和计算生物学方法,通过基因敲除和负反馈回路设计,优化了酵母细胞中异源萜类化合物的生产 | 本研究创新性地结合了OptKnock模拟和合成生物学方法,通过负反馈回路动态调节基因表达,提高了目标产物的可持续生产 | 基因敲除在批量培养中效果显著,但在连续培养模式下效果减弱,表明基因敲除不支持目标产物的可持续生产 | 提高酵母细胞中异源萜类化合物的生产效率和可持续性 | 酵母细胞中的异源萜类化合物生产 | 合成生物学 | NA | OptKnock模拟 | 基因敲除 | 基因组规模代谢模型 | 构建了多种酵母菌株进行实验 |
43 | 2024-08-07 |
Robust genetic codes enhance protein evolvability
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002594
PMID:38754362
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研究论文 | 本文通过大规模并行序列到功能测定数据,分析了数百种重构遗传密码下的6个经验适应性景观,探讨了遗传密码的鲁棒性对蛋白质可演化性的影响。 | 发现鲁棒的遗传密码通过呈现平滑的适应性景观,从而增强蛋白质的可演化性,并揭示了设计非标准遗传密码以增强或减弱可演化性的一般原则。 | 研究主要集中在遗传密码的鲁棒性对蛋白质可演化性的影响,未涉及其他可能影响蛋白质演化的因素。 | 探讨遗传密码的鲁棒性如何影响蛋白质的可演化性。 | 遗传密码的鲁棒性及其对蛋白质可演化性的影响。 | 合成生物学 | NA | 大规模并行序列到功能测定 | NA | 序列数据 | 超过1600万条mRNA序列 |
44 | 2024-08-07 |
Eye Diseases: When the Solution Comes from Plant Alkaloids
2024-May, Planta medica
IF:2.1Q2
DOI:10.1055/a-2283-2350
PMID:38452806
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综述 | 本文综述了用于治疗眼病的植物生物碱,包括其历史概述、提取来源植物以及支持其治疗活性的临床和分子数据 | 探讨了生物技术在生物碱生产中的应用,如基因工程和合成生物学 | 需要进一步研究以完全满足制药需求 | 提供关于用于治疗眼病的植物生物碱的全面概述 | 植物生物碱及其在眼病治疗中的应用 | NA | 眼病 | NA | NA | NA | NA |
45 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering for enhanced terpenoid production: Leveraging new horizons with an old technique
2024-May, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.108511
PMID:38593484
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综述 | 本文综述了利用代谢工程增强萜类化合物生产的策略及其在药用植物中的应用前景 | 探讨了通过代谢工程在微生物和快速生长植物中生产有价值萜类化合物的新方法 | 需要进一步实施基因组编辑、代谢途径的阐明以及系统生物学和合成生物学策略 | 解决萜类化合物商业规模生产中的问题 | 萜类化合物及其在植物中的生物合成途径 | 植物生物技术 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
46 | 2024-08-07 |
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for the biosynthesis of a fungal pigment from the phytopathogenic fungus Cladosporium phlei
2024-May-13, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00429-0
PMID:38741106
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,将Cladosporium phlei中负责合成phleichrome色素的非还原聚酮合酶基因Cppks1及Aspergillus nidulans中的磷酸泛酰巯基乙胺转移酶基因导入Saccharomyces cerevisiae,实现了phleichrome色素在酵母中的生物合成 | 首次在Saccharomyces cerevisiae中通过代谢工程和多基因表达成功合成了phleichrome色素 | Cppks1基因的表达对酵母细胞生长有显著不利影响,需要选择压力来维持Cppks1表达载体 | 探索通过代谢工程在Saccharomyces cerevisiae中合成phleichrome色素的可能性 | Cladosporium phlei中的phleichrome色素及其在Saccharomyces cerevisiae中的生物合成 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
47 | 2024-08-07 |
Effect of Quorum Sensing Molecules on the Quality of Bacterial Nanocellulose Materials
2024-May-07, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.3c10053
PMID:38737048
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研究论文 | 研究了群体感应分子对细菌纳米纤维素材料质量的影响 | 通过使用多种表面表征方法,揭示了特定群体感应信号分子对细菌纳米纤维素生物膜形态特性的影响 | 细菌纳米纤维素生物膜的生产和转化为实际形式存在挑战,主要受细胞密度异质性的影响 | 探讨群体感应分子如何影响细菌纳米纤维素生物膜的形态特性 | 细菌纳米纤维素生物膜及其在不同浓度群体感应信号分子下的形态特性 | 生物材料 | NA | 扫描电子显微镜, 能量散射光谱, 漫反射红外傅里叶变换光谱, 原子力显微镜 | NA | 生物膜 | 不同浓度的特定群体感应信号分子 |
48 | 2024-08-07 |
Strategies, Achievements, and Potential Challenges of Plant and Microbial Chassis in the Biosynthesis of Plant Secondary Metabolites
2024-May-02, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29092106
PMID:38731602
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综述 | 本文综述了植物和微生物底盘在植物次生代谢物生物合成中的策略、成就及潜在挑战 | 随着合成生物学的发展,更多研究聚焦于利用微生物进行异源合成 | 大规模种植宿主植物消耗土地资源且易受病虫害影响,化学合成的多步骤和高要求增加了生产成本,限制了其广泛应用 | 评估植物和微生物底盘在合成各种类型次生代谢物方面的表现,并探讨其面临的挑战及未来努力方向 | 植物次生代谢物 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
49 | 2024-08-07 |
Tailored UPRE2 variants for dynamic gene regulation in yeast
2024-May-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2315729121
PMID:38687789
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研究论文 | 本文通过创建UPRE2突变体库,筛选出具有增强响应性和更宽动态范围的元素,并研究了其与转录因子Hac1的相互作用,以提高酵母中重组蛋白和天然产物合成的效率 | 开发了新的UPRE2突变体,增强了与Hac1的结合亲和力,提高了基因表达的动态调控能力 | NA | 研究如何通过合成生物学方法优化酵母中的基因调控,以提高化学品和重组蛋白的生产效率 | UPRE2突变体及其在酵母细胞中的基因调控作用 | 合成生物学 | NA | 分子建模,定点突变 | NA | 基因序列 | 多个UPRE2突变体元素 |
50 | 2024-08-07 |
Reversing the directionality of reactions between non-oxidative pentose phosphate pathway and glycolytic pathway boosts mycosporine-like amino acid production in Saccharomyces cerevisiae
2024-May-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02365-6
PMID:38725068
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研究论文 | 研究通过改变非氧化戊糖磷酸途径与糖酵解途径之间的反应方向性,提高酵母中类海藻氨基酸的生产 | 提出了一种新的代谢工程策略,通过逆转糖酵解与非氧化戊糖磷酸途径之间的通量方向,增强类海藻氨基酸的生产 | NA | 探索调控类海藻氨基酸生产的细胞因子 | 类海藻氨基酸在酵母中的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
51 | 2024-08-07 |
Self-Assembly of Heterogeneous Ferritin Nanocages for Tumor Uptake and Penetration
2024-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309271
PMID:38368258
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学的方法,用于制造具有高度可控性和可重复性的蛋白质基纳米粒子,并探讨了这些纳米粒子与肿瘤目标和渗透之间的相互作用。 | 开发了一种新的合成生物学策略,用于精确控制纳米粒子的异质成分,并展示了这种策略在肿瘤积累和渗透中的应用。 | NA | 研究纳米粒子的异质性如何影响其在生物系统中的命运。 | 研究了不同密度的铁蛋白重链和轻链混合纳米笼(FHn)在肿瘤细胞摄取、体内肿瘤积累和组织渗透中的作用。 | 纳米技术 | 肿瘤 | 合成生物学 | NA | 纳米粒子 | NA |
52 | 2024-08-07 |
De novo production of bioactive sesterterpenoid ophiobolins in Saccharomyces cerevisiae cell factories
2024-May-06, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02406-0
PMID:38711040
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,在酵母细胞工厂中成功合成了具有生物活性的sesterterpenoid ophiobolins | 首次在酵母中实现了sesterterpenoid ophiobolins的异源生物合成,为新药开发提供了有价值的解决方案 | NA | 开发一种细胞工厂,用于ophiobolin的生物合成,以满足药物开发的需求 | sesterterpenoid ophiobolins及其氧化衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
53 | 2024-08-07 |
Molecular Transportation Conversion of Membrane Tension Using a Mechanosensitive Channel in Asymmetric Lipid-Protein Vesicles
2024-May-01, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c02370
PMID:38594642
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研究论文 | 研究通过改变不对称脂质-蛋白质囊泡的膜张力,评估了大型机械敏感通道(MscL)的分子运输能力 | 首次在不对称脂质-蛋白质囊泡中评估了MscL通道的分子运输能力,并揭示了MscL在囊泡内 leaflet 的插入方向 | NA | 评估不对称脂质-蛋白质囊泡中MscL通道的分子运输能力及其在复杂人工细胞模型中的应用潜力 | 不对称脂质-蛋白质囊泡中的MscL通道及其分子运输 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | MscL通道 | 囊泡 | NA |
54 | 2024-08-07 |
Modification of the endoplasmic reticulum morphology enables improved recombinant antibody expression in Saccharomyces cerevisiae
2024-May-20, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.03.009
PMID:38555020
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研究论文 | 研究通过改变酵母内质网形态来提高重组抗体表达 | 通过删除Rtn1p、Rtn2p和Yop1p编码基因的不同组合,创建了具有不同内质网形态的酵母菌株,实现了抗体滴度高达2.2倍的提升 | NA | 探究内质网结构对细胞生产力的影响 | 酵母细胞内质网形态及其对抗体表达的影响 | 生物工程 | NA | 基因编辑 | NA | 细胞 | 不同组合的酵母菌株 |
55 | 2024-08-07 |
Chromosome-level Alstonia scholaris genome unveils evolutionary insights into biosynthesis of monoterpenoid indole alkaloids
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109599
PMID:38646178
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研究论文 | 本研究通过使用纳米孔和Hi-C数据组装了高质量的染色体水平Alstonia scholaris基因组,旨在深入了解单萜吲哚生物碱(MIAs)的生物合成 | 首次组装了Alstonia scholaris的高质量染色体水平基因组,并发现了与MIAs生物合成途径相关的基因簇 | NA | 探索Alstonia scholaris中单萜吲哚生物碱的生物合成及其进化起源 | Alstonia scholaris植物及其基因组 | 数字病理学 | 癌症 | 纳米孔测序,Hi-C | NA | 基因组数据 | 一个Alstonia scholaris样本 |
56 | 2024-08-07 |
Engineered bacteria in tumor immunotherapy
2024-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216817
PMID:38492769
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综述 | 本文综述了工程化细菌在肿瘤免疫治疗中的应用及其与免疫系统的复杂相互作用 | 利用遗传和合成生物学技术,工程化细菌作为肿瘤靶向载体和原位制药工厂,为免疫治疗提供了新的策略 | NA | 探讨工程化细菌在肿瘤免疫治疗中的应用及其优化策略 | 工程化细菌及其在免疫治疗中的作用 | 生物技术 | 肿瘤 | 遗传和合成生物学技术 | NA | NA | NA |
57 | 2024-08-07 |
Rational construction of synthetic consortia: Key considerations and model-based methods for guiding the development of a novel biosynthesis platform
2024 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108348
PMID:38531490
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综述 | 本文综述了合成生物学中合成群落的构建及其在生物合成平台中的应用 | 合成群落作为一种新兴且高效的生物合成平台,能够减轻代谢负担并提高产品产量 | 合成群落的研究仍处于初级阶段,设计和构建稳定的合成群落面临诸多挑战 | 探讨合成群落的工程化关键考虑因素及模拟计算工具,以推动其发展 | 合成群落的设计与构建 | 合成生物学 | NA | 人工智慧和机器学习 | NA | NA | NA |
58 | 2024-08-07 |
Multiomics unravels potential molecular switches in the C3 to CAM transition of Mesembryanthemum crystallinum
2024-May-15, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2024.105145
PMID:38431086
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研究论文 | 本研究利用转录组学、蛋白质组学和靶向代谢组学分析了Mesembryanthemum crystallinum从C到CAM光合作用的分子变化 | 发现了新的发现,如转录本的昼夜节律调控比蛋白质更强,氧化磷酸化和肌醇甲基化可能在转变中起重要作用,V型H-ATP酶在质子泵送中的作用,以及蛋白磷酸酶2C在ABA信号通路中的潜在触发作用 | NA | 揭示Mesembryanthemum crystallinum从C到CAM光合作用转变中的潜在分子开关 | Mesembryanthemum crystallinum的分子变化 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学、靶向代谢组学 | NA | 转录组、蛋白质组、代谢组 | NA |
59 | 2024-08-07 |
Exploring the frontier of rapid prototyping technologies for plant synthetic biology and what could lie beyond
2024-May, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.19650
PMID:38426415
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综述 | 本文综述了近期研究中展示的各种快速原型技术,这些技术克服了植物合成生物学中的一些瓶颈,加速了进展 | 探讨了将不同快速原型技术结合的可能性,以实现植物合成生物学的快速和可扩展部署 | 每种技术都有其局限性,限制了它们的广泛应用 | 实现植物合成生物学的全部潜力,阐明基因型与表型之间的关系,并应用这些见解来工程化性状 | 植物合成生物学中的快速原型技术 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
60 | 2024-08-07 |
Exploiting synthetic biology platforms for enhanced biosynthesis of natural products in Yarrowia lipolytica
2024-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.130614
PMID:38513925
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综述 | 本文主要回顾了合成生物学技术在Yarrowia lipolytica中的发展,并总结了近期在Y. lipolytica中合成天然产品的研究进展 | 利用合成生物学平台设计、修改甚至从头合成微生物,赋予微生物非自然功能,促进功能产品的开发 | NA | 解决天然产品供应不足的关键问题,如低产量、长生产周期和繁琐的程序 | Yarrowia lipolytica中的合成生物学技术和天然产品合成 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |