合成生物学相关文章
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当前共找到 110 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Iterative deep learning-design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell type-specificity
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.599076
PMID:38915713
|
研究论文 | 本研究应用迭代深度学习设计在两种人类细胞系间具有强差异活性的合成增强子 | 首次将迭代深度学习应用于合成增强子设计，通过实验验证与模型重新优化的循环策略实现细胞类型特异性 | 仅针对两种人类细胞系进行验证，尚未在更广泛的细胞类型中测试 | 解决合成生物学中基因表达细胞类型特异性靶向的重要问题 | 人类合成增强子序列 | 机器学习 | NA | 深度学习，染色质可及性分析，转录因子结合位点分析，单细胞水平表达分析 | 深度学习模型 | 基因组序列数据，增强子活性数据，染色质可及性数据 | NA | NA | 人类细胞系 | 合成增强子设计，包含浓缩序列语法和选择性转录因子结合位点词汇 | 医学，合成生物学 |
| 22 | 2025-10-05 |
Robust soybean leaf agroinfiltration
2024-Jun-05, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-024-03245-4
PMID:38837057
|
研究论文 | 开发了一种适用于大豆叶片的稳健农杆菌浸润介导的瞬时基因表达方法 | 建立了首个针对大豆叶片的优化农杆菌浸润方法，确定了影响成功的关键参数 | 方法仅针对大豆特定品种和生长阶段进行验证，未在其他作物中广泛测试 | 开发适用于大豆的瞬时基因表达技术平台 | 大豆叶片（品种V17-0799DT和TN16-5004） | 植物生物技术 | NA | 农杆菌浸润法 | NA | 基因表达数据 | 两个大豆品系 | 农杆菌介导转化 | 大豆（Glycine max） | 报告基因表达系统（GUS、荧光蛋白、RUBY报告系统） | 农业 |
| 23 | 2025-10-05 |
The specificity of intermodular recognition in a prototypical nonribosomal peptide synthetase depends on an adaptor domain
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9404
PMID:38896613
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研究论文 | 本研究通过核磁共振和质谱技术揭示了tomaymycin非核糖体肽合成酶中模块间识别与载体蛋白特异性偶联的机制 | 发现了一个适配器结构域可直接将负载的载体蛋白从起始模块招募至延伸模块，并揭示了其作用机制 | NA | 探索非核糖体肽合成酶中模块间识别的生物物理原理 | tomaymycin非核糖体肽合成酶 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱, 质谱 | NA | 光谱数据 | NA | NA | NA | 非核糖体肽合成酶工程化设计 | 医药 |
| 24 | 2025-10-05 |
Parsing patterns: Emerging roles of tissue self-organization in health and disease
2024-Jun-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.016
PMID:38906093
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综述 | 探讨生物组织自组织模式在胚胎发育和成体组织中的形成机制及其在健康与疾病中的作用 | 提出自组织模式生成是组织稳态和修复的核心机制，并探索通过工程化模式驱动分子回路应用于合成生物学和类器官构建 | NA | 综述组织自组织模式的形成原理及其在生理和病理条件下的作用 | 胚胎组织和成体组织的自组织模式 | 发育生物学 | 炎症性皮肤病、肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 模式驱动分子回路 | 医学、合成生物学 |
| 25 | 2025-10-05 |
Harnessing iron‑sulfur enzymes for synthetic biology
2024-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119718
PMID:38574823
|
综述 | 本文探讨了铁硫酶在合成生物学应用中面临的三大核心挑战及相应解决方案 | 系统归纳了铁硫酶在工程化代谢途径中的三大瓶颈问题，并提出蛋白质结构预测与设计技术有望突破这些难题 | 主要基于文献综述，缺乏实验验证数据 | 开发铁硫酶在合成生物学中的可靠工具包，加速工业级生物合成路径的开发 | 铁硫酶及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结构预测与设计 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 铁硫酶依赖的生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 26 | 2025-10-05 |
Protocol for in vitro phospholipid synthesis combining fatty acid synthesis and cell-free gene expression
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103051
PMID:38700978
|
研究论文 | 本文提出了一种在体外结合脂肪酸合成和无细胞基因表达合成磷脂的完整实验方案 | 开发了整合脂肪酸合成与无细胞基因表达系统的体外磷脂合成方法，可在一天内完成反应并通过LC-MS进行定量分析 | NA | 建立体外磷脂合成和定量分析的标准化实验流程 | 磷脂生物分子 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-质谱联用(LC-MS), 无细胞基因表达 | NA | 质谱数据 | NA | 无细胞表达系统 | NA | 脂肪酸合成与酰基转移酶表达系统 | 合成生物学, 生物燃料 |
| 27 | 2025-10-05 |
Technologies for the discovery of G protein-coupled receptor-targeting biologics
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103138
PMID:38728825
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综述 | 本文综述了靶向G蛋白偶联受体的生物制剂发现技术及其发展前景 | 系统总结了最先进的GPCR靶向生物制剂工程技术，并前瞻性地指出DNA合成和合成生物学技术将推动该领域发展 | NA | 回顾GPCR靶向生物制剂发现的技术现状并展望未来发展方向 | G蛋白偶联受体及其靶向生物制剂 | 生物医药技术 | 代谢性疾病、神经系统疾病、心血管疾病 | DNA合成、展示技术、功能筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 28 | 2025-10-05 |
Engineering Whole-Cell Biosensors for Enhanced Detection of Environmental Antibiotics Using a Synthetic Biology Approach
2024-Jun, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-024-01259-w
PMID:39010990
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造双组分系统开发生物传感器用于环境抗生素检测 | 探索基于EMeRALD的生物传感器，通过合成生物学方法重新利用微生物双组分系统的传感模块 | NA | 开发用于环境抗生素检测的合成生物学工具 | 细菌双组分系统和EMeRALD生物传感器 | 合成生物学 | 抗生素耐药性 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | EMeRALD | 细菌 | 双组分调控系统合成调控回路 | 环境监测 |
| 29 | 2025-10-05 |
Biosecurity Risk Assessment for the Use of Artificial Intelligence in Synthetic Biology
2024-Jun, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2023.0031
PMID:39131181
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研究论文 | 本文提出了一种专门用于评估人工智能在合成生物学中应用的生物安全风险评估流程 | 首次在文献中提供了针对合成生物学中AI应用的生物安全风险评估工具和方法论 | NA | 评估人工智能在合成生物学应用中带来的生物安全风险 | 用于合成生物学的人工智能语言模型 | 机器学习 | NA | 风险评估方法 | 大型语言模型(ChatGPT 4.0) | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 30 | 2025-10-05 |
Developing a Common Global Baseline for Nucleic Acid Synthesis Screening
2024-Jun, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2023.0034
PMID:39131178
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研究论文 | 本文介绍了用于预防合成核酸技术滥用的通用DNA合成筛选机制 | 开发了首个面向国际的核酸合成筛选通用机制，整合了多种序列分析方法 | 未提供具体的技术实施细节和性能评估数据 | 建立国际通用的核酸合成筛选标准以保障生物安全 | 合成核酸序列及其潜在生物安全风险 | 合成生物学 | NA | DNA合成筛选技术 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | NA | 生物安全 |
| 31 | 2025-10-05 |
Enhancing Gene Synthesis Security: An Updated Framework for Synthetic Nucleic Acid Screening and the Responsible Use of Synthetic Biological Materials
2024-Jun, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2023.0036
PMID:39144102
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综述 | 介绍美国政府对合成核酸筛查框架的更新过程及其对生命科学研究社区的影响 | 将2010年筛查框架的范围扩展到所有形式的合成核酸，涵盖更多参与实体和生物安全专业人员的新职责 | NA | 评估合成核酸筛查框架的更新过程及其预期影响 | 合成核酸筛查框架和利益相关者意见 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本评论 | 41份独特回复（2020年15份共220页，2022年26份共79页） | NA | NA | NA | 医学, 生物安全 |
| 32 | 2025-10-05 |
Information Transmission through Biotic-Abiotic Interfaces to Restore or Enhance Human Function
2024-06-17, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.4c00435
PMID:38729914
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综述 | 本文提出了一个模块化框架，用于定义和描述生物-非生物界面的工程设计，以促进通过光或电实现信息传输，从而恢复或增强人类功能 | 开发了统一的模块化框架来系统描述生物-非生物界面工程，整合了合成生物学、材料科学和电子工程等多学科技术 | NA | 通过生物-非生物界面信息传输技术恢复或增强人类功能 | 神经元细胞、视网膜、脊髓损伤患者、神经系统 | 生物医学工程 | 脊髓损伤、视网膜盲症、神经系统疾病 | 合成生物学、电生理学、光遗传学、脑机接口 | NA | 电信号、光信号 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | 光敏感蛋白工程、神经信号控制电路、生物传感器 | 医学 |
| 33 | 2025-10-06 |
Bacterial imaging in tumour diagnosis
2024-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14474
PMID:38808743
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综述 | 本文综述了细菌成像技术在肿瘤诊断中的应用与进展 | 整合多种成像技术（光学、声学、MRI、核医学）与合成生物学/纳米材料工程改造细菌，实现肿瘤的动态实时监测 | 肿瘤内细菌丰度较低且分布不均、空间数据集维度高、成像标记工具存在限制 | 开发细菌成像方法用于肿瘤诊断 | 肿瘤相关细菌（如大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌） | 医学影像 | 肿瘤 | 光学成像、声学成像、磁共振成像、核医学成像（PET/SPECT） | NA | 影像数据 | NA | 合成生物学改造、纳米材料工程 | 大肠杆菌, 鼠伤寒沙门氏菌 | 外源治疗基因表达 | 医学 |
| 34 | 2024-12-20 |
Broadening the application of Yarrowia lipolytica synthetic biology tools to explore the potential of Yarrowia clade diversity
2024-06, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001472
PMID:38913407
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研究论文 | 本研究展示了将Yarrowia lipolytica合成生物学工具应用于Yarrowia分支其他酵母菌株的潜力 | 首次将Yarrowia lipolytica的合成生物学工具应用于Yarrowia分支的其他酵母菌株，展示了这些工具的多功能性 | 研究仅限于表达荧光蛋白和类胡萝卜素途径，尚未全面评估其他潜在应用 | 探索Yarrowia分支多样性在工业应用中的潜力 | Yarrowia分支的其他酵母菌株 | 合成生物学 | NA | Golden Gate工具包 | NA | NA | 至少五个Yarrowia分支的成员 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-11-11 |
The elimination of two restriction enzyme genes allows for electroporation-based transformation and CRISPR-Cas9-based base editing in the non-competent Gram-negative bacterium Acinetobacter sp. Tol 5
2024-06-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00400-24
PMID:38722179
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研究论文 | 本研究通过删除两种限制性酶基因，实现了非竞争性革兰氏阴性菌Acinetobacter sp. Tol 5的电穿孔转化和CRISPR-Cas9基础编辑 | 首次在Acinetobacter sp. Tol 5中实现了高效的电穿孔转化和CRISPR-Cas9基础编辑，为环境分离菌的基因改造提供了新策略 | NA | 开发环境分离菌Acinetobacter sp. Tol 5的基因改造方法，以促进其在合成生物学中的应用 | Acinetobacter sp. Tol 5菌株及其基因改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基础编辑 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-10-28 |
Regulatory RNAs in Bacillus subtilis: A review on regulatory mechanism and applications in synthetic biology
2024-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.01.013
PMID:38385150
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综述 | 本文综述了枯草芽孢杆菌中调控RNA的机制及其在合成生物学中的应用 | 本文首次系统总结了枯草芽孢杆菌中内源性调控RNA的机制和功能，并探讨了其在合成生物学领域的工程和实际应用 | 主要集中在枯草芽孢杆菌上，未涵盖其他细菌模型 | 总结枯草芽孢杆菌中调控RNA的机制及其在合成生物学中的应用 | 枯草芽孢杆菌中的调控RNA及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-10-18 |
Controlling the expression of heterologous genes in Bdellovibrio bacteriovorus using synthetic biology strategies
2024-06, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14517
PMID:38934530
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研究论文 | 本文研究了在Bdellovibrio bacteriovorus HD100中使用合成生物学策略控制异源基因表达的方法 | 首次将分层组装克隆技术Golden Standard (GS) 适应于B. bacteriovorus HD100，并结合Tn7转座子的移动元件进行染色体整合，系统地表征了一系列组成型和诱导型启动子，实现了对该细菌中异源基因表达的控制 | 缺乏适用于捕食者驯化的合成生物学工具 | 开发适用于B. bacteriovorus HD100的合成生物学工具，以实现其在微生物生物技术中的应用 | Bdellovibrio bacteriovorus HD100中的异源基因表达控制 | 合成生物学 | NA | 分层组装克隆技术Golden Standard (GS)，Tn7转座子 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-10-12 |
Bacterial microcompartments as a next-generation metabolic engineering tool: utilizing nature's solution for confining challenging catabolic pathways
2024-06-26, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20230229
PMID:38813858
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研究论文 | 本文探讨了细菌微区室作为下一代代谢工程工具的潜力，通过利用自然界提供的解决方案来限制具有挑战性的分解代谢途径 | 本文介绍了细菌微区室（BMCs）作为一种自主催化模块，能够克服异源生产途径中的低通量、酶的杂乱性、有毒中间体的形成或中间体流失到竞争反应中的问题 | NA | 研究细菌微区室在代谢工程中的应用，以提高生物产品的合成效率 | 细菌微区室及其在异源代谢途径中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-10-04 |
Engineering bacterial warriors: harnessing microbes to modulate animal physiology
2024-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103113
PMID:38564969
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研究论文 | 本文探讨了利用微生物调节动物生理的合成生物学方法 | 利用微生物与动物的共生关系，通过工程化微生物有效操纵动物生理 | 多细胞动物的工程化仍具有挑战性，因其系统复杂性 | 重新编程活体系统以实现预定的生物功能 | 微生物与动物的共生关系 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-09-14 |
Partial RNA design
2024-06-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae222
PMID:38940170
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研究论文 | 本文提出了一种新的RNA设计范式——部分RNA设计，通过分离设计空间和目标，实现了对RNA序列和结构约束的精确控制 | 提出了部分RNA设计这一新范式，解决了现有RNA设计方法在搜索空间定义上的局限性 | NA | 开发一种新的RNA设计方法，以实现对RNA序列和结构约束的精确控制 | RNA序列和结构 | 生物技术 | NA | RNA设计 | libLEARNA算法 | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |