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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-09-14 |
RiboDiffusion: tertiary structure-based RNA inverse folding with generative diffusion models
2024-06-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae259
PMID:38940178
|
研究论文 | 本文提出了一种基于生成扩散模型的RNA逆折叠方法RiboDiffusion,用于从3D结构生成RNA序列 | RiboDiffusion利用图神经网络和Transformer模型,能够从3D RNA骨架结构生成RNA序列,并在序列恢复和多样性之间进行权衡 | NA | 解决RNA逆折叠问题,即从给定的结构约束中找到功能性RNA序列 | RNA序列和其3D结构 | 生物信息学 | NA | 生成扩散模型 | 图神经网络、Transformer | RNA序列和3D结构 | 不同长度和类型的RNA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-24 |
Biophysical characterization of synthetic adhesins for predicting and tuning engineered living material properties
2024-Jun-05, Matter
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.matt.2024.03.019
PMID:39165662
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研究论文 | 本文通过多种生物物理方法对细菌合成粘附工具箱进行了定量表征 | 本文展示了通过关键参数对工程活体材料(ELM)宏观性质(拉伸强度)的预测和定量调节 | 合成粘附蛋白的表征和控制仍有待进一步发展 | 研究细菌合成多细胞系统的粘附特性,以优化工程活体材料的应用 | 细菌合成粘附工具箱及其在工程活体材料中的应用 | 生物工程 | NA | 生物物理方法 | NA | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-07 |
Biodiversity as a firewall to engineered microbiomes for restoration and conservation
2024-Jun, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.231526
PMID:39100153
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研究论文 | 本文通过数学模型模拟了合成生物学干预对生态系统的影响,探讨了其对生物多样性和生态网络的潜在影响。 | 本文首次通过数学模型展示了合成生物学干预如何通过抑制共享资源的衰减来增加生物多样性,并成功地将合成生物融入生态网络。 | 本文主要基于数学模型进行模拟,实际应用中的效果和影响可能有所不同。 | 探讨合成生物学在生态恢复和保护中的应用及其对生物多样性的影响。 | 生态系统中的生物多样性和合成生物学干预的效果。 | 生态学 | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-05 |
Removal of the large inverted repeat from the plastid genome reveals gene dosage effects and leads to increased genome copy number
2024-06, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01709-9
PMID:38802561
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研究论文 | 本研究揭示了去除叶绿体基因组中的大型倒置重复对基因剂量效应的影响及其导致基因组拷贝数增加的机制 | 本研究首次系统性地证明了叶绿体中的倒置重复区可以增强翻译能力,并探讨了基因组大小与拷贝数之间的关系 | 本研究主要基于烟草的叶绿体基因组,可能限制了结果的普遍适用性 | 探讨叶绿体基因组中倒置重复区的功能重要性及其对基因剂量效应的影响 | 烟草的叶绿体基因组及其功能特性 | 数字病理 | NA | 叶绿体转化技术 | NA | NA | 生成了具有显著减少叶绿体基因组大小的植物 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-05 |
Structural Insights Into the Terpene Cyclization Domains of Two Fungal Sesterterpene Synthases and Enzymatic Engineering for Sesterterpene Diversification
2024-06-03, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202405140
PMID:38584136
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研究论文 | 本文报道了两种真菌sesterterpene合酶的萜烯环化结构与酶工程研究 | 首次揭示了sesterterpene合酶的晶体结构及其催化机制,从而推动了sesterterpene的结构多样性扩展 | 对sesterterpene合酶的研究仍不够全面,进一步的结构-功能研究仍然必要 | 探讨sesterterpene合酶的结构与催化机制以推进结构多样性的工程 | 两种真菌的sesterterpene合酶NfSS和PbSS | 数字病理学 | NA | 晶体学,理论与实验相结合的研究方法 | NA | 结构数据,催化机制信息 | 两个酶合酶的结构样本 | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-07 |
Living Synthelectronics: A New Era for Bioelectronics Powered by Synthetic Biology
2024-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202400110
PMID:38494761
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观点 | 本文综述了生物电子学领域中利用合成生物学改造的活细胞和病毒作为核心组件的新型混合电子设备——“活体合成电子学”的最新进展 | 引入合成生物学改造的活细胞和病毒作为生物电子设备的核心组件,增强了与人体组织在信息和物质交换层面的界面潜力 | 提出了活体合成电子学面临的挑战 | 探讨活体合成电子学如何促进生物电子学与人体组织的真正整合 | 活体合成电子学设备的设计和制造策略 | 生物电子学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-07 |
Unlocking the formate utilization of wild-type Yarrowia lipolytica through adaptive laboratory evolution
2024-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400290
PMID:38900053
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研究论文 | 本研究通过使用碱基编辑工具促进适应性进化,成功提高了Yarrowia lipolytica对甲酸盐的耐受性和利用能力 | 本研究揭示了Yarrowia lipolytica中自然存在的甲酸盐代谢途径,并展示了其通过适应性进化增强甲酸盐利用的潜力 | NA | 探索和优化Yarrowia lipolytica对甲酸盐的利用,以促进全球净负碳经济的发展 | Yarrowia lipolytica的甲酸盐耐受性和利用能力 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | 转录组数据 | 两个突变株M25-70和M25-14 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-07 |
Correction: Zhantlessova et al. Advanced "Green" Prebiotic Composite of Bacterial Cellulose/Pullulan Based on Synthetic Biology-Powered Microbial Coculture Strategy. Polymers 2022, 14, 3224
2024-Jun-26, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym16131802
PMID:39000809
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-07 |
Morphological Engineering of Filamentous Fungi: Research Progress and Perspectives
2024-Jun-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02007
PMID:38693049
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综述 | 本文综述了丝状真菌形态工程的研究进展和前景 | 介绍了真菌形态发生的机制以及当前形态调控方法和策略的发展,包括物理化学和代谢工程方法 | NA | 探讨丝状真菌形态工程的未来发展 | 丝状真菌的形态调控 | 生物工程 | NA | 合成生物学和遗传操作工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-07 |
A library of reporters of the global regulators of gene expression in Escherichia coli
2024-Jun-18, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00065-24
PMID:38687030
|
research paper | 本文开发了一个包含16种全局调节因子(GR)的荧光报告基因库,用于追踪大肠杆菌中基因表达的全局调节因子的生产速率 | 该报告基因库由单拷贝质粒组成,编码与天然启动子全长的绿色荧光蛋白(GFP)融合,能够高灵敏度和特异性地检测各种应激条件下的转录活性,并揭示单细胞转录速率的变异性 | NA | 旨在开发一种工具,用于追踪和分析大肠杆菌中全局调节因子的活性,以深入理解其对转录因子网络(TFN)的影响 | 大肠杆菌中的全局调节因子(GR)及其在不同生长阶段和应激条件下的活性 | molecular biology | NA | 荧光报告基因技术 | NA | 荧光信号 | 16种全局调节因子的报告基因库 | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-07 |
Research progress on biosynthesis of erythritol and multi-dimensional optimization of production strategies
2024-Jun-13, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04043-6
PMID:38867081
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综述 | 本文综述了赤藓糖醇生物合成及其生产策略的多维度优化研究进展 | 介绍了合成生物学、代谢工程、组学系统生物学和高通量筛选技术等策略的发展,以及对赤藓糖醇生物合成途径理解的加深 | 讨论了阻碍赤藓糖醇有效生产的挑战 | 探讨赤藓糖醇的绿色、高效和可持续生产,突破生产瓶颈 | 赤藓糖醇及其衍生物的生物合成和应用 | 代谢工程 | NA | 合成生物学、代谢工程、组学系统生物学、高通量筛选技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-07 |
[Development and characterization of tobacco suspension cell chassis NBS-1]
2024-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230735
PMID:38914502
|
研究论文 | 本研究开发了一种具有高科学和工业潜力的烟草悬浮细胞底盘系统NBS-1 | NBS-1具有快速生长、高生物量、优异的分散性、高转化效率和低尼古丁含量的特点 | NA | 开发一种高效的烟草悬浮细胞底盘系统,用于植物天然产品的探索和生产 | 烟草悬浮细胞底盘系统NBS-1 | 合成生物学 | NA | 分子技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-07 |
Polycyclic aromatic hydrocarbon: underpinning the contribution of specialist microbial species to contaminant mitigation in the soil
2024-Jun-24, Environmental monitoring and assessment
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s10661-024-12778-w
PMID:38913190
|
综述 | 本文综述了专业微生物物种在土壤中多环芳烃(PAHs)污染缓解中的作用 | 探讨了微生物代谢能力将复杂PAHs转化为较少有害副产品的创新修复策略 | NA | 探索可持续的多环芳烃污染缓解策略 | 专业微生物物种在多环芳烃污染缓解中的作用 | 环境科学 | NA | omics技术, 合成生物学, 遗传工程, 纳米修复 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-07 |
Virtual Labs and Designer Bugs - Generative AI, Synthetic Biology and National Security
2024-Jun, Journal of law and medicine
IF:0.6Q2
PMID:38963250
|
研究论文 | 本文探讨了人工智能技术在合成生物学和国家级安全中的应用及其潜在风险 | 文章首次详细分析了澳大利亚在生物安全框架中对人工智能使用的监管不足 | 文章主要关注澳大利亚的情况,可能不适用于其他国家 | 探讨人工智能在生物研究中的应用及其对国家安全的潜在影响 | 人工智能技术、合成生物学、国家安全 | NA | NA | 人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-07 |
Antibacterial properties of natural products from marine fungi reported between 2012 and 2023: a review
2024-Jun, Archives of pharmacal research
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s12272-024-01500-6
PMID:38850495
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综述 | 本文综述了2012年至2023年间从海洋真菌中发现的223种具有独特结构和强大抗菌活性的化合物 | 这些化合物对多种细菌有效,包括耐药菌株如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌,显示出作为抗菌治疗剂的强大潜力 | 从药物发现到产品商业化的过渡中存在相关挑战 | 总结海洋真菌中发现的化合物的化学结构和抗菌活性,并探讨从药物发现到商业化的挑战 | 海洋真菌中的化合物及其抗菌活性 | NA | NA | 宏基因组学和合成生物学 | NA | 化合物 | 223种化合物 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-07 |
The Utilization of Bacillus subtilis to Design Environmentally Friendly Living Paints with Anti-Mold Properties
2024-Jun-18, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms12061226
PMID:38930607
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研究论文 | 研究利用枯草芽孢杆菌设计具有抗霉菌特性的环保型活体涂料 | 首次探索了将枯草芽孢杆菌应用于建筑环境中,开发具有抗霉菌特性的新型涂料 | NA | 利用枯草芽孢杆菌开发新型抗霉菌涂料,以改善居住环境健康 | 枯草芽孢杆菌及其在涂料中的抗霉菌效果 | NA | 过敏反应, 超敏性肺炎, 哮喘 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-07 |
Bridging Nature and Engineering: Protein-Derived Materials for Bio-Inspired Applications
2024-Jun-20, Biomimetics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/biomimetics9060373
PMID:38921253
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综述 | 本文综述了基于蛋白质的生物聚合物在仿生应用中的潜力和进展 | 探讨了通过合成生物学和仿生学结合的方法,改进天然蛋白质基材料的功能性,创造具有优异机械性能和适应性的新型仿生材料 | NA | 探讨蛋白质基材料在仿生应用中的潜力和进展 | 纤维蛋白、弹性蛋白、粘附/基质蛋白和蓝藻蛋白等四类蛋白质基聚合物 | 生物工程 | NA | 蛋白质工程技术 | NA | 蛋白质序列、结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-07 |
Exploring Sources, Biological Functions, and Potential Applications of the Ubiquitous Marine Cyclic Dipeptide: A Concise Review of Cyclic Glycine-Proline
2024-Jun-12, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md22060271
PMID:38921582
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综述 | 本文综述了海洋环二肽甘氨酸-脯氨酸的来源、生物功能及其潜在应用 | 强调了甘氨酸-脯氨酸作为药物发现中的基本构建模块的重要性和其在药物开发及医疗保健中的潜在作用 | NA | 旨在重新激发对海洋药物化学和合成生物学中与甘氨酸-脯氨酸相关研究的兴趣 | 海洋环二肽甘氨酸-脯氨酸 | NA | 中枢神经系统疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-07 |
Applications of the Methylotrophic Yeast Komagataella phaffii in the Context of Modern Biotechnology
2024-Jun-06, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof10060411
PMID:38921397
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综述 | 本文综述了甲基营养酵母Komagataella phaffii在现代生物技术中的应用,特别是作为生产重组蛋白及其他经济利益产品的平台。 | 介绍了Komagataella phaffii在生产生物制药、可再生化学品、燃料、生物材料和食品/饲料产品中的应用,并探讨了合成生物学方法在菌株工程中的应用。 | NA | 探讨Komagataella phaffii在现代生物技术中的应用及其在生产新型生物产品中的潜力。 | Komagataella phaffii的应用及其在生产各种经济利益产品中的作用。 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-07 |
Innovation in precision fermentation for food ingredients
2024-Jun, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2023.2166014
PMID:36640107
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学、发酵、下游处理和食品科学等领域的交叉技术,实现精准发酵生产食品成分的创新方法 | 文章介绍了利用精准发酵技术生产替代蛋白质、脂质和碳水化合物的新方法,并提供了相关的专利景观 | NA | 支持发酵衍生食品成分生产技术的发展 | 精准发酵技术在食品成分生产中的应用 | NA | NA | 精准发酵 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |