合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-08-07	Engineering a Self-Assembled Protein Cage for Targeted Dual Functionalization 2024-07-31, Nano letters IF:9.6Q1 DOI:10.1021/acs.nanolett.4c01693 PMID:39017718	research paper	该研究设计了一种自组装蛋白笼Mi3，能够独立招募两种不同的目标蛋白，用于合成生物学和医学应用	利用SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag化学方法，实现了单个蛋白笼上两种不同目标蛋白的特异性附着，减少了组装间的变异性	NA	开发一种多功能蛋白笼平台，用于生物和生物医学应用	自组装蛋白笼Mi3及其与目标蛋白的相互作用	合成生物学	NA	SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag化学方法	NA	NA	NA
2	2025-08-07	Unpaired cysteine insertions favor transmembrane dimerization and induce ligand-independent constitutive cytokine receptor signaling 2024-07-26, Biological chemistry IF:2.9Q3 DOI:10.1515/hsz-2023-0344 PMID:38695485	research paper	研究通过插入突变的PPCL序列到细胞因子受体跨膜区，实现配体非依赖性的受体二聚化和组成性激活	发现PPCL插入突变可普遍适用于多种细胞因子受体，实现配体非依赖性的组成性激活	研究仅在Ba/F3前B细胞系中进行验证，未在更广泛的细胞类型或体内模型中测试	探索细胞因子受体跨膜区突变导致配体非依赖性激活的机制及其应用潜力	IL-7Rα及其跨膜区PPCL插入突变体，以及IL-6、IL-12和干扰素家族的细胞因子受体	分子生物学	急性淋巴细胞白血病	细胞信号转导分析、STAT5和ERK磷酸化检测	NA	实验数据	使用Ba/F3前B细胞系进行实验
3	2025-08-06	Single-Cell Synchro-Subtractive-Additive Nanoscale Surgery with Femtosecond Lasers 2024-07-24, Nano letters IF:9.6Q1 DOI:10.1021/acs.nanolett.4c00970 PMID:38989671	research paper	本文介绍了一种名为飞秒激光单细胞手术（FLSS）的原位“同步减材-增材”技术，用于解决现有单细胞操作手术方法的不足	FLSS技术通过同步纳米级三维减材和增材制造，实现了对单细胞结构的精确移除和修改，同时通过两种光聚合作用快速固化特殊设计的水凝胶	术后存活率为70%，仍有提升空间	开发一种新型单细胞手术技术，用于单细胞结构的精确操作和修改	单细胞	生物医学工程	NA	飞秒激光手术	NA	NA	NA
4	2025-08-06	Organ-Specific Gene Expression Control Using DNA Origami-Based Nanodevices 2024-07-10, Nano letters IF:9.6Q1 DOI:10.1021/acs.nanolett.4c02104 PMID:38920331	研究论文	本文介绍了一种基于DNA折纸技术的纳米装置，用于实现器官特异性基因表达控制	开发了坚韧的DNA折纸结构，可在低pH条件下封装入脂质纳米颗粒，实现器官特异性基因递送	DNA纳米结构的脆弱性和靶向能力不足仍是挑战	开发器官特异性基因表达的纳米递送系统	DNA折纸纳米装置和脂质纳米颗粒	合成生物学	NA	DNA折纸技术、冷冻电子显微镜(Cryo-EM)	NA	实验数据	小鼠器官
5	2025-07-12	Engineering Synthetic Erythrocytes as Next-Generation Blood Substitutes 2024-Jul-10, Advanced functional materials IF:18.5Q1 DOI:10.1002/adfm.202315879 PMID:39386164	综述	本文综述了人工红细胞作为下一代血液替代品的研究进展	从材料工程角度探讨合成红细胞的设计与功能重建，提出合成工程化红细胞是最有前景的方法	未提及具体临床试验数据或规模化生产的具体障碍	解决全球血液短缺问题，开发安全可扩展的血液替代品	工程化人工红细胞（合成红细胞）	生物医学工程	NA	合成生物学、纳米技术、颗粒制备技术	NA	NA	NA
6	2025-07-03	Expression of microbial lipase in filamentous fungus Aspergillus niger: a review 2024-Jul, 3 Biotech IF:2.6Q3 DOI:10.1007/s13205-024-03998-5 PMID:38841267	综述	本文综述了微生物脂肪酶在丝状真菌黑曲霉中的表达及其应用	总结了提高脂肪酶表达的各种策略，并探讨了CRISPR/Cas9基因编辑技术在构建工程化脂肪酶生产菌株中的应用	NA	综述微生物脂肪酶的来源、特性及其在黑曲霉中的表达优化策略	微生物脂肪酶及其在丝状真菌黑曲霉中的表达	合成生物学与系统生物学	NA	CRISPR/Cas9基因编辑技术	NA	文献数据	NA
7	2025-07-03	Context-dependent redesign of robust synthetic gene circuits 2024-Jul, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.003 PMID:38320912	综述	本文综述了合成基因电路设计中电路与宿主相互作用的动态影响及控制策略	总结了电路与宿主相互作用的最新进展，强调了宿主感知和资源感知的设计策略	未提及具体实验数据或案例研究	探讨合成基因电路设计中电路与宿主相互作用的动态影响及控制策略	合成基因电路及其与宿主细胞的相互作用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
8	2025-06-18	Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence 2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.12.603336 PMID:39026737	research paper	该研究探讨了生物能量应激如何通过增加ATP利用影响抗生素治疗效果，并揭示了其通过增强ROS产生、突变断裂修复和转录偶联修复促进抗菌素耐药性（AMR）进化的机制	首次利用合成生物学方法构建了组成性水解ATP或NADH的遗传系统，直接研究生物能量应激对抗生素效果的影响，并提出了统一的模型解释抗生素诱导的抗菌素耐药性和持久性	研究仅在大肠杆菌中进行，未在其他细菌中验证	理解生物能量应激对抗生素治疗效果的影响机制	大肠杆菌	合成生物学	细菌感染	合成生物学方法	遗传工程系统	NA	NA
9	2025-06-07	Accelerating Diverse Cell-Based Therapies Through Scalable Design 2024-Jul, Annual review of chemical and biomolecular engineering IF:7.6Q1 DOI:10.1146/annurev-chembioeng-100722-121610 PMID:38594944	综述	本文综述了通过基因工程改造原代细胞和干细胞以加速多样化细胞治疗的进展	整合合成生物学工具和先进基因组编写技术，提出加速创新细胞治疗转化的愿景	未提及具体临床试验数据或治疗效果验证	探讨规模化设计加速多样化细胞治疗的潜力	原代细胞和干细胞	合成生物学	NA	转基因方法、基因组编写技术	NA	NA	NA
10	2025-05-31	Bioinformatic Prediction and High Throughput In Vivo Screening to Identify Cis-Regulatory Elements for the Development of Algal Synthetic Promoters 2024-07-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00199 PMID:38986010	研究论文	本研究通过生物信息学预测和高通量体内筛选，识别顺式调控元件以开发藻类合成启动子	结合POWRS、STREME和PhyloGibbs算法预测1511个CREs，并通过高通量方法评估4533种合成启动子的转基因表达能力	需要具有测序基因组和转录组数据的藻类物种才能应用该流程	开发先进的遗传工具以促进藻类生物技术的发展	六种不同藻类物种中高表达基因的启动子区域	合成生物学	NA	下一代测序、荧光激活细胞分选	NA	基因组和转录组数据	4533种合成启动子，数百个转基因株系
11	2025-05-31	Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening 2024-07-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00283 PMID:38981096	研究论文	本文描述了通过定向进化技术改进声学报告基因（ARGs）的过程，以提高其在超声成像中的应用效果	首次将定向进化技术应用于声学报告基因的优化，开发了高通量声学筛选方法，显著增强了气体囊泡（GVs）的非线性超声散射信号	研究目前仅限于细菌培养体系中的筛选，尚未在哺乳动物细胞或活体动物中进行验证	开发更高效的声学报告基因，用于生物成像和合成生物学领域	气体囊泡（GVs）蛋白纳米结构及其声学特性	合成生物学	NA	高通量声学筛选、定向进化	NA	超声信号数据	细菌培养物中的突变体文库
12	2025-05-11	Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae 2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.24.605010 PMID:39091764	研究论文	本研究通过生物信息学和体内突变分析，探讨了绿藻中多顺反子基因的翻译机制	揭示了绿藻中多顺反子转录本通过漏读核糖体扫描机制实现多ORF翻译的新机制	研究仅针对两种绿藻，结果在其他物种中的普适性有待验证	阐明绿藻中多顺反子基因的翻译调控机制	两种分歧绿藻(未指明具体物种)的多顺反子基因位点	分子生物学	NA	生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统	NA	基因组序列数据、荧光报告基因数据	两种绿藻的高置信度手动注释双顺反子位点数据集
13	2025-04-26	A directed enolization strategy enables by-product-free construction of contiguous stereocentres en route to complex amino acids 2024-07, Nature chemistry IF:19.2Q1 DOI:10.1038/s41557-024-01473-5 PMID:38565976	研究论文	本文展示了一种铱催化的方法，能够直接将简单烯烃和甘氨酸衍生物转化为具有优异区域和立体选择性的β-取代α-氨基酸	利用甘氨酸衍生的N-H单元的本征导向能力，促进铱催化的相邻羰基烯醇化，实现了两个连续立体中心的构建	NA	开发一种合成具有β-立体中心的α-氨基酸的新方法	简单烯烃和甘氨酸衍生物	有机化学	NA	铱催化	NA	NA	NA
14	2025-03-08	DeepEnzyme: a robust deep learning model for improved enzyme turnover number prediction by utilizing features of protein 3D-structures 2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae409 PMID:39162313	研究论文	本文介绍了一种名为DeepEnzyme的深度学习模型，该模型结合了Transformer和图卷积网络（GCN），通过利用蛋白质的序列和3D结构信息来提高酶周转数（kcat）的预测准确性	DeepEnzyme模型首次结合了Transformer和GCN，利用蛋白质的序列和3D结构信息进行kcat预测，显著提高了预测的准确性和鲁棒性，特别是在处理与训练数据集序列相似性低的酶时	尽管DeepEnzyme在kcat预测上取得了显著进展，但其在处理与训练数据集序列相似性极低的酶时，可能仍存在一定的预测误差	提高酶周转数（kcat）的预测准确性，以支持蛋白质工程和合成生物学等领域的研究	酶的周转数（kcat）	机器学习	NA	深度学习	Transformer, GCN	蛋白质序列和3D结构数据	NA
15	2025-02-13	Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis 2024-Jul-16, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49585-3 PMID:39013857	研究论文	本文介绍了一种通过定向内共生方法在酵母中引入碳同化的技术	通过工程化光合作用蓝藻内共生体，使酵母细胞在光合条件下无需外部碳源即可生长，并能够生物合成天然产物	NA	研究如何将异养生物转化为部分或完全自养生物，以实现可持续生物技术和合成生物学的目标	酵母细胞和光合作用蓝藻内共生体	合成生物学	NA	定向内共生方法	NA	NA	NA
16	2024-12-20	Diverting organic waste from landfills via insect biomanufacturing using engineered black soldier flies (Hermetia illucens) 2024-07-24, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-06516-8 PMID:39048665	研究论文	本文探讨了利用工程化黑水虻（Hermetia illucens）进行昆虫生物制造，以减少有机废物进入垃圾填埋场，并将其转化为高价值产品	利用合成生物学开发黑水虻作为可持续的生物制造平台，将多种有机废物转化为增强的动物饲料、高价值生物分子和改良肥料	NA	实现循环经济，减少有机废物处理问题	黑水虻（Hermetia illucens）及其在有机废物转化中的应用	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
17	2024-12-19	Efficient and markerless gene integration with SlugCas9-HF in Kluyveromyces marxianus 2024-07-02, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-024-06487-w PMID:38956406	研究论文	本文介绍了一种基于CRISPR-Cas9的多位点基因整合方法，用于在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中组装多个外源基因	使用高保真Cas9核酸酶SlugCas9-HF提高了基因编辑的精确度，并开发了一种CRISPR-based的生物合成工具包，能够实现大基因模块的基因组整合和多位点同时整合	NA	开发一种高效的基因整合方法，促进Kluyveromyces marxianus在工业生产中的应用	非传统酵母Kluyveromyces marxianus	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9	NA	基因组	NA
18	2024-10-27	Rhodopsin-based light-harvesting system for sustainable synthetic biology 2024-07, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.14521 PMID:38949508	评论	本文探讨了利用视紫红质在可持续合成生物学中的应用及其未来潜力	视紫红质具有显著的光化学特性，可用于开发可持续和节能的技术	NA	探索视紫红质在可持续工程中的应用	视紫红质及其在生物生产和可再生能源转换中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
19	2024-09-25	Blue valorization of lignin-derived monomers via reprogramming marine bacterium Roseovarius nubinhibens 2024-07-24, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/aem.00890-24 PMID:38940564	研究论文	研究通过重新编程海洋细菌Roseovarius nubinhibens，将木质素衍生的芳香碳转化为高附加值化学品	首次在海洋细菌中应用基于CRISPR的调控系统，实现了对目标基因的精确高效抑制	NA	探索利用海洋细菌进行木质素生物转化，实现碳和水的双重节约	木质素衍生的单体4-羟基苯甲酸和海洋细菌Roseovarius nubinhibens	生物技术	NA	CRISPR干扰系统	CRISPRi	NA	NA
20	2024-09-14	Limiting the Broadcast Range of a Secreting Cell during Intercellular Signaling Using Protease-Mediated Degradation 2024-07-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00042 PMID:38885472	研究论文	研究如何通过蛋白酶介导的降解来限制分泌细胞在细胞间信号传递中的广播范围	提出了一种通过添加barrierpepsin来限制细胞在二维多细胞网络中α-因子信号响应范围的方法	NA	探索如何通过蛋白酶限制细胞间信号传递的广播范围，以实现更复杂的细胞网络功能	分泌细胞在细胞间信号传递中的广播范围	合成生物学	NA	NA	NA	NA	二维多细胞网络中的细胞