合成生物学相关文章
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当前共找到 83 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
CRISPR Tools for Engineering Prokaryotic Systems: Recent Advances and New Applications
2024-07, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 回顾CRISPR-Cas系统在原核生物工程中的最新进展与应用 | 从分子工程角度系统阐述CRISPR组件设计策略及在原核系统中的新型应用方向 | NA | 总结CRISPR技术在原核生物遗传工程中的应用现状与未来发展方向 | CRISPR-Cas系统组件及其在原核生物工程中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 原核生物 | 基于调控gRNA表达的遗传电路 | 生物传感, 生物生产, 生物治疗 |
| 2 | 2025-10-05 |
Accelerating Diverse Cell-Based Therapies Through Scalable Design
2024-07, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 本文探讨如何通过可扩展设计加速多样化细胞疗法的开发 | 整合合成生物学工具与先进基因组编写技术，提出加速细胞疗法转化的新愿景 | NA | 促进基于细胞的疗法转化应用 | 原代细胞和干细胞 | 合成生物学 | NA | 转基因方法、基因组编写技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 哺乳动物细胞 | 转基因货物设计、生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 3 | 2025-10-05 |
Fitness Landscapes and Evolution of Catalytic RNA
2024-07, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 探讨RNA催化剂的适应度景观及其在进化与合成生物学中的意义 | 结合体外筛选与高通量测序技术绘制RNA完整和局部适应度景观，并提出利用机器学习进行序列空间插值和外推的新方向 | 序列空间的庞大规模限制了纯实验研究方法的有效性 | 解析基因型与表型关系（适应度景观）以推动合成生物学发展 | 催化RNA及其序列空间 | 合成生物学 | NA | 体外筛选、高通量测序 | 机器学习 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 4 | 2025-10-05 |
CRISPR/Cas Technology: The Unique Synthetic Biology Genome-Editing Tool Shifting the Paradigm in Viral Diagnostics, Defense, and Therapeutics
2024-07, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
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综述 | 全面介绍CRISPR/Cas系统的基本原理及其在病毒检测、防御和治疗中的应用 | 系统评估了基于CRISPR/Cas的病毒诊断、疫苗开发、B细胞工程等创新技术的优势与局限 | 讨论了CRISPR/Cas系统使用中面临的挑战和生物伦理问题 | 推进生物技术方法以应对已知和未知生物威胁 | CRISPR/Cas系统及其在病毒领域的应用技术 | 合成生物学 | 病毒感染 | CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 5 | 2025-10-05 |
Engineering a Self-Assembled Protein Cage for Targeted Dual Functionalization
2024-07-31, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c01693
PMID:39017718
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研究论文 | 本研究开发了一种能够独立招募两种不同目标蛋白的自组装蛋白笼Mi3，实现了在体外和活细胞内的双重功能化 | 首次将SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag两种化学方法整合到单一蛋白笼中，实现了两种不同目标蛋白的独立可控定位 | NA | 开发能够同时负载多种功能蛋白的自组装蛋白笼平台 | 自组装蛋白笼Mi3及其双重功能化系统 | 合成生物学 | NA | SpyCatcher/SpyTag和DogCatcher/DogTag蛋白质连接技术 | NA | 蛋白质组装数据、荧光成像数据、酶活性数据 | NA | 蛋白质工程 | 活细胞 | 双重功能化蛋白笼系统，可同时负载膜靶向肽和酶蛋白 | 医学, 合成生物学 |
| 6 | 2025-10-05 |
Unpaired cysteine insertions favor transmembrane dimerization and induce ligand-independent constitutive cytokine receptor signaling
2024-07-26, Biological chemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1515/hsz-2023-0344
PMID:38695485
|
研究论文 | 本研究揭示了跨膜区PPCL插入突变如何诱导细胞因子受体发生配体非依赖性二聚化和组成性激活 | 发现PPCL跨膜区插入可作为通用策略生成配体非依赖性组成性活性细胞因子受体 | 研究主要基于Ba/F3前B细胞系，尚未在更复杂的生理环境中验证 | 探究跨膜区半胱氨酸插入对细胞因子受体激活机制的影响 | IL-7Rα及其PPCL突变体，以及IL-6、IL-12和干扰素家族的细胞因子受体 | 合成生物学 | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞信号转导分析，磷酸化检测 | NA | 细胞增殖数据，信号通路激活数据 | Ba/F3前B细胞系 | 基因改造 | 哺乳动物细胞 | 组成性活性细胞因子受体设计 | 医学 |
| 7 | 2025-10-05 |
Single-Cell Synchro-Subtractive-Additive Nanoscale Surgery with Femtosecond Lasers
2024-07-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c00970
PMID:38989671
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研究论文 | 提出一种飞秒激光单细胞手术的同步减材-增材技术，实现单细胞结构的精确修改 | 首次实现同步纳米级三维减材与增材制造，通过非热消融和双光聚合实现单细胞结构的精确移除与修饰 | 术后存活率为70%，仍有提升空间 | 开发新型单细胞操作技术以克服现有方法的不足 | 单细胞结构 | 生物工程 | NA | 飞秒激光手术、双光聚合、非热消融 | NA | NA | NA | 飞秒激光 | 单细胞 | NA | 合成生物学、医学 |
| 8 | 2025-10-05 |
Organ-Specific Gene Expression Control Using DNA Origami-Based Nanodevices
2024-07-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.4c02104
PMID:38920331
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研究论文 | 本研究开发了基于DNA折纸的纳米器件，通过脂质纳米颗粒实现器官特异性基因表达调控 | 构建了坚固的DNA折纸结构，可在低pH等恶劣条件下封装于脂质纳米颗粒中，实现器官特异性基因递送 | 未明确说明实验样本数量及具体器官靶向效率的量化数据 | 开发器官特异性基因表达控制的纳米递送系统 | DNA折纸纳米器件、脂质纳米颗粒、mRNA和siRNA | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术、低温电子显微镜 | NA | 显微镜图像、基因表达数据 | 小鼠器官（未明确具体数量） | DNA折纸 | 小鼠 | 基因递送纳米器件 | 医学 |
| 9 | 2025-10-05 |
Inteins: A Swiss army knife for synthetic biology
2024 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108349
PMID:38552727
|
综述 | 本文综述了内含肽在合成生物学中的多功能应用及其解决复杂生物挑战的潜力 | 系统阐述分裂内含肽的独特优势（紧凑性、可靠性、正交性等）及其在逻辑运算和遗传电路构建中的创新应用 | NA | 探讨内含肽在合成生物学领域的应用潜力及解决方案 | 内含肽（特别是分裂内含肽）及其蛋白质剪接机制 | 合成生物学 | 癌症 | 蛋白质剪接技术 | NA | NA | NA | 内含肽工程 | NA | 逻辑运算电路、遗传计算电路、反馈控制电路 | 医学, 生物技术, 生物医学 |
| 10 | 2025-10-05 |
pLxIS-containing domains are biochemically flexible regulators of interferons and metabolism
2024-Jul-11, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.05.030
PMID:38925114
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研究论文 | 本研究通过合成生物学平台发现含pLxIS基序的信号传导蛋白具有调控干扰素反应和代谢活动的多样化功能机制 | 首次发现两个孤儿pLxIS蛋白能独立于已知模式识别受体通路激活干扰素反应，并揭示pLxIS作为多基序信号实体的功能多样性 | NA | 探索pLxIS基序在干扰素反应和代谢调控中的新功能机制 | 含pLxIS基序的信号传导蛋白及其调控通路 | 合成生物学 | 病毒感染 | 合成生物学平台 | NA | 生化数据 | NA | NA | 人类细胞 | 多基序信号实体 | 医学 |
| 11 | 2025-10-05 |
Engineering Synthetic Erythrocytes as Next-Generation Blood Substitutes
2024-Jul-10, Advanced functional materials
IF:18.5Q1
DOI:10.1002/adfm.202315879
PMID:39386164
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综述 | 本文综述了人造红细胞作为下一代血液替代品的研究进展，重点介绍了合成工程红细胞的开发策略 | 从材料工程角度重新定义红细胞，结合合成生物学和纳米技术构建功能完整的合成红细胞 | NA | 解决全球血液短缺问题，开发安全可扩展的血液替代品 | 工程化红细胞和血液替代品 | NA | NA | 合成生物学、纳米技术、粒子制造 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、制药 |
| 12 | 2025-10-05 |
Expression of microbial lipase in filamentous fungus Aspergillus niger: a review
2024-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-024-03998-5
PMID:38841267
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综述 | 综述了微生物脂肪酶在丝状真菌黑曲霉中表达的相关研究进展 | 整合了微生物脂肪酶的最新数据，重点讨论了通过CRISPR/Cas9基因编辑技术提高脂肪酶表达效率的策略 | NA | 提高微生物脂肪酶在黑曲霉中的表达效率 | 微生物脂肪酶及其在黑曲霉中的表达系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑技术 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 黑曲霉 | 脂肪酶表达系统 | 能源,食品,日化,制药,工业生物技术 |
| 13 | 2025-10-05 |
Context-dependent redesign of robust synthetic gene circuits
2024-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.003
PMID:38320912
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综述 | 本文概述了合成基因回路与宿主细胞间环境依赖性相互作用及其对回路性能的影响，并总结了减轻这些不良效应的控制策略 | 系统总结了宿主感知和资源感知的合成基因回路设计最新进展，特别关注生长反馈和资源竞争等新兴回路-宿主相互作用机制 | NA | 理解合成基因回路与宿主细胞间的复杂关系及其对合成生物工程流程的影响 | 合成基因回路与宿主细胞的相互作用机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞 | 合成基因回路 | 工业生物技术 |
| 14 | 2025-10-05 |
Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence
2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603336
PMID:39026737
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法探究生物能量应激如何增强细菌的抗生素耐药性和持久性 | 首次构建了持续水解ATP或NADH的遗传系统，揭示了生物能量应激通过增强活性氧产生、诱变断裂修复和转录偶联修复促进抗生素耐药性进化的新机制 | 研究仅在大肠杆菌中进行，尚未在其他细菌物种中验证 | 探究抗生素诱导的生物能量应激对治疗结果的影响机制 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 构建了持续水解ATP或NADH的遗传系统 | 医学 |
| 15 | 2025-10-05 |
Bioinformatic Prediction and High Throughput In Vivo Screening to Identify Cis-Regulatory Elements for the Development of Algal Synthetic Promoters
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00199
PMID:38986010
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研究论文 | 本研究通过生物信息学预测和高通量体内筛选方法，开发了适用于藻类的合成启动子 | 结合POWRS、STREME和PhyloGibbs算法预测顺式调控元件，并通过高通量筛选验证合成启动子活性 | 需要目标藻类物种具有测序的基因组和转录组数据集 | 开发适用于藻类生物技术的合成生物学工具 | 六种不同藻类物种的启动子区域和顺式调控元件 | 合成生物学 | NA | 下一代测序、荧光激活细胞分选、生物信息学分析 | NA | 基因组序列、转录组数据 | 4533个合成启动子，数百个转基因株系 | 合成生物学方法 | 藻类 | 合成启动子设计，包含1-3个顺式调控元件拷贝 | 工业生物技术,能源 |
| 16 | 2025-10-05 |
Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00283
PMID:38981096
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研究论文 | 本研究通过定向进化方法开发具有增强非线性超声散射信号的声学报告基因 | 建立了高通量半自动化声学筛选平台，首次将定向进化应用于声学报告基因的优化 | 研究主要针对细菌培养体系，在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发性能更优的声学报告基因用于生物成像 | 气体囊泡(GVs)蛋白纳米结构及其编码基因 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量声学筛选、非线性超声散射 | NA | 声学信号数据、蛋白质序列数据 | GvpA/B同源蛋白的扫描位点饱和突变库 | 定向进化 | 细菌 | 声学报告基因系统，基于气体囊泡的超声对比剂 | 医学成像、合成生物学 |
| 17 | 2025-10-05 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.24.605010
PMID:39091764
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和体内突变分析揭示了绿藻中双顺反子转录本通过渗漏核糖体扫描机制实现多ORF翻译的分子机理 | 首次在绿藻中证实渗漏核糖体扫描是实现双顺反子可调翻译的关键机制，并构建了可逆调控的双报告基因系统 | 研究主要集中于两种绿藻物种，机制在其他真核生物中的普适性需要进一步验证 | 探究绿藻多顺反子基因的翻译机制 | 绿藻（衣藻和团藻）的双顺反子基因位点 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统 | NA | 基因组数据、荧光报告数据 | 两种绿藻物种的高可信度手动注释双顺反子位点数据集 | NA | 绿藻 | 合成双顺反子双报告基因系统（绿色荧光蛋白和荧光素酶） | 合成生物学 |
| 18 | 2025-10-05 |
A directed enolization strategy enables by-product-free construction of contiguous stereocentres en route to complex amino acids
2024-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01473-5
PMID:38565976
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研究论文 | 开发了一种铱催化的定向烯醇化策略，用于高效合成具有连续立体中心的β-取代α-氨基酸 | 利用甘氨酸衍生物N-H单元的内源性导向能力实现铱催化的定向烯醇化，实现两个连续立体中心的高效构建 | NA | 开发合成具有β-立体中心的α-氨基酸的新方法 | β-取代α-氨基酸的合成 | 有机合成化学 | NA | 铱催化、定向烯醇化、交叉偶联 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物设计、手性催化剂合成、合成生物学 |
| 19 | 2025-10-05 |
DeepEnzyme: a robust deep learning model for improved enzyme turnover number prediction by utilizing features of protein 3D-structures
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae409
PMID:39162313
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研究论文 | 开发了一种结合Transformer和GCN的深度学习模型DeepEnzyme，通过整合蛋白质序列和三维结构特征来预测酶转换数 | 首次将Transformer与图卷积网络结合，利用蛋白质三维结构特征提升对低序列相似度酶的kcat预测鲁棒性 | NA | 提高酶转换数(kcat)预测的准确性和鲁棒性 | 酶蛋白 | 机器学习 | NA | 深度学习 | Transformer, GCN | 蛋白质序列数据，三维结构数据 | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程，合成生物学 |
| 20 | 2025-10-05 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
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研究论文 | 本研究通过定向内共生方法在酵母细胞内引入光合蓝细菌，构建能进行光合固碳的酵母/蓝细菌嵌合体 | 开发了定向内共生方法将光合固碳能力引入酵母，无需传统代谢工程和实验室进化 | NA | 将异养酵母转化为具有光合自养能力的生物 | 芽殖酵母和光合蓝细菌 | 合成生物学 | NA | 定向内共生 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 蓝细菌 | 光合固碳和糖分泌系统 | 可持续生物技术, 工业生物技术 |