合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2024-09-02	Physiological Roles of Eumelanin- and Melanogenesis-Associated Diseases: A Look at the Potentialities of Engineered and Microbial Eumelanin in Clinical Practice 2024-Jul-25, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering11080756 PMID:39199714	综述	本文旨在强调人体多个器官/组织中存在的真黑素所发挥的生理作用，并基于其独特性质合理化这一生物聚合物所扮演的常常相互冲突的功能角色	探讨了基于外源性真黑素的局部供应疗法的潜力，以及通过合成生物学生产的真黑素在重塑治疗和诊断应用中的机会	NA	分析真黑素的生理和病理作用，并深入探讨与黑色素生成相关的皮肤、眼睛、耳朵和大脑疾病	真黑素的生理和病理作用，以及与黑色素生成相关的疾病	NA	神经退行性疾病	NA	NA	NA	NA
22	2024-08-31	Lipid-Based Catalysis Demonstrated by Bilayer-Enabled Ester Hydrolysis 2024-Jul-30, Membranes IF:3.3Q2 DOI:10.3390/membranes14080168 PMID:39195420	研究论文	本文展示了脂质双层膜的疏水区域为催化反应提供适宜环境的能力，并通过酯水解反应验证了这一概念	首次展示了脂质双层膜在生物系统中作为催化剂的可能性	催化反应速度比酶催化慢，催化转化数在10-7到10-8 s之间	探索脂质及其聚集体在生物化学、药理学和合成生物学中的催化作用	脂质双层膜的催化能力及其在酯水解反应中的应用	NA	NA	H-NMR	NA	荧光	NA
23	2024-08-13	AI-Assisted Rational Design and Activity Prediction of Biological Elements for Optimizing Transcription-Factor-Based Biosensors 2024-Jul-26, Molecules (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/molecules29153512 PMID:39124917	综述	本文综述了人工智能算法在合成生物学中生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器响应性能调控中的应用	探讨了人工智能算法在分析生物数据中的强大潜力，并提出了针对该领域挑战的创新解决方案	NA	探索人工智能在合成生物学中的应用，以推动学术研究和生物技术的实际应用	生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器的调控	合成生物学	NA	机器学习、深度学习	AI算法	生物数据	NA
24	2024-08-12	CAPE: a deep learning framework with Chaos-Attention net for Promoter Evolution 2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae398 PMID:39120645	研究论文	本文介绍了一种名为CAPE的深度学习框架，该框架采用混沌注意力网络用于启动子进化，旨在预测启动子强度并指导其定向进化	CAPE模型通过综合提取启动子内的进化信息，并使用改进的DenseNet和Transformer结构处理整体信息，实现了对原核生物启动子强度预测的最新成果	NA	预测启动子强度并指导其定向进化，以降低传统启动子工程中的实验成本	原核生物启动子	机器学习	NA	深度学习	DenseNet, Transformer	启动子序列信息	NA
25	2024-08-09	Pseudomonas putida KT2440: the long journey of a soil-dweller to become a synthetic biology chassis 2024-07-25, Journal of bacteriology IF:2.7Q3 DOI:10.1128/jb.00136-24 PMID:38975763	研究论文	本文总结了 Pseudomonas putida KT2440 从作为芳香化合物生物降解基础研究的系统，到成为代谢工程和合成生物学中首选底盘的逐步升级过程	KT2440 因其历史偶然性和内在特性，成为适用于重组 DNA 技术的环境微生物原型，并能降解化学污染物	KT2440 的分类学分类仍存在不确定性	探讨 Pseudomonas putida KT2440 在生物技术应用中的发展及其在代谢工程和合成生物学中的应用	Pseudomonas putida KT2440 菌株及其在生物技术中的应用	合成生物学	NA	重组 DNA 技术	NA	NA	NA
26	2024-08-09	Turn-on protein switches for controlling actin binding in cells 2024-Jul-11, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49934-2 PMID:38992021	research paper	本文介绍了一组可设计蛋白，即可控肌动蛋白结合开关工具（CASTs），这些蛋白的肌动蛋白结合行为可以通过外部刺激进行控制	CASTs蛋白可以通过外部输入响应不同的外部刺激，提供开启动力学选项，并实现正交性和多路复用	NA	开发一种新的方法来控制细胞内肌动蛋白的结合，以实现合成生物学目的	肌动蛋白结合蛋白（ABPs）及其在细胞活动中的影响	NA	NA	NA	NA	NA	NA
27	2024-08-05	Directed evolution of material-producing microorganisms 2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2403585121 PMID:39042685	研究论文	本文利用高通量定向进化平台增强微生物的物质生产能力	提出了一种新的高通量平台，通过选择压力促进微生物的进化，揭示了细胞纤维素生产能力与基因的关联	缺乏对其他微生物或材料生产的研究，可能限制了成果的广泛应用	研究微生物材料生产的能力，寻找基因型-表型的联系	以产纤维素的微生物为模型进行研究	合成生物学	NA	高通量定向进化	NA	基因组序列	40,000个随机突变体
28	2024-08-05	Advances in the development of synthetic biology tools for the bioproduction of natural product analogues 2024-07-01, Postepy biochemii DOI:10.18388/pb.2021_531 PMID:39083471	研究论文	本文介绍了自然产物及其衍生物在多个行业的应用以及合成生物学工具的进展	强调了合成生物学工具在生物生产生物活性二次代谢物方面的进展	NA	探讨合成生物学工具在自然产物生物生产中的应用	自然产物及其生物活性二次代谢物	合成生物学	NA	NA	NA	化学化合物	NA
29	2024-08-05	An Enzymatic Prodrug-like Route to Thio and Selenoamides 2024-07-29, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202404243 PMID:38747847	研究论文	本文揭示了一种酶促的前药样途径，用于硫和硒酰胺的合成	首次系统阐明了6-硫鸟嘌呤的生物合成机制和相关酶的功能，并发现了前药样的硫结合物中间体	未充分探索硫转移机制中的所有潜在中间体	研究细菌中稀有硫酰胺的形成机制	关注Erwinia amylovorans产生的6-硫鸟嘌呤及其生物合成途径	合成生物学	肿瘤	酶促反应重组	NA	化学物质	使用多种底物进行反应，样本数量未详细说明
30	2024-08-05	Direct α-Hydroxy Acid Loading onto a Bacterial Thiotemplate Assembly Line via a Multienzyme Gateway 2024-07-22, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202405165 PMID:38728443	研究论文	本研究揭示了将α-羟基酸直接加载到细菌非核糖体肽合成酶模块的过程	首次报告了细菌中将α-羟基酸直接加载到非核糖体肽合成酶模块的专门通道，拓展了合成生物学工具箱	部分研究步骤依赖于突变分析和酶活性测定，可能限制了结果的普遍性	研究α-羟基酸在细菌非核糖体肽合成中作为构建块的加载机制	焦链酸的加载过程及相关酶的功能	合成生物学	NA	生物信息学，代谢组学，生化分析	NA	生物化学数据	NA
31	2024-08-05	Leveraging DNA-Encoded Cell-Mimics for Environment-Adaptive Transmembrane Channel Release-Induced Cell Death 2024-07-22, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202406186 PMID:38738850	研究论文	本文介绍了一种创新的DNA编码的人工T细胞模型，能够模拟T细胞的行为并诱导细胞死亡	提出了一种基于DNA的人工T细胞模仿物，能够在肿瘤微环境下响应酸性条件，并选择性释放嵌入脂质和胆固醇的DNA链	NA	研究环境适应性细胞死亡的机制	DNA编码的人工T细胞模仿物（ARTC）	生物医学工程	肿瘤	DNA编码	NA	NA	NA
32	2024-08-05	Measuring the burden of hundreds of BioBricks defines an evolutionary limit on constructability in synthetic biology 2024-Jul-24, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-50639-9 PMID:39048554	研究论文	本文测量了301种BioBrick质粒对大肠杆菌生长的影响	本文首次系统地表征了生物零件对宿主细胞的负担，确立了合成生物学中构建的进化限制	只研究了301种BioBrick质粒，样本数量相对较少	研究合成生物学中生物零件对宿主细胞生长的影响	301种BioBrick质粒和大肠杆菌	合成生物学	NA	NA	种群遗传模型	NA	301种BioBrick质粒
33	2024-08-05	Advances in the Synthesis and Physiological Metabolic Regulation of Nicotinamide Mononucleotide 2024-Jul-20, Nutrients IF:4.8Q1 DOI:10.3390/nu16142354 PMID:39064797	综述	该文章总结了烟酰胺单核苷酸（NMN）的合成和生理代谢调控的最新进展	介绍了微生物细胞工厂在NMN生产中的应用，提供了化学合成及生物合成策略的最新研究进展	存在有机化学方法面临的环境和安全问题的讨论	旨在提供NMN高效生物合成的技术指导及其在食品、医药和化妆品领域的应用基础	研究对象为烟酰胺单核苷酸及其合成方法	数字病理学	衰老相关疾病	合成生物学	微生物细胞工厂	NA	NA
34	2024-08-05	The Undeniable Potential of Thermophiles in Industrial Processes 2024-Jul-13, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms25147685 PMID:39062928	综述	本综述讨论了极端嗜热微生物在工业过程中的应用潜力	揭示了嗜热微生物在合成生物学和可持续生物过程开发中的重要性	本综述未包含所有类型的极端微生物以及它们在其他领域的应用	旨在探讨嗜热微生物在生物制造和工业应用中的进展	极端嗜热微生物及其生物制造的高附加值生物产品	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
35	2024-08-07	pLxIS-containing domains are biochemically flexible regulators of interferons and metabolism 2024-Jul-11, Molecular cell IF:14.5Q1 DOI:10.1016/j.molcel.2024.05.030 PMID:38925114	研究论文	这篇文章研究了含有pLxIS基序的信号转导蛋白在干扰素反应中作为灵活调节因子的作用	文章揭示了pLxIS基序的多样性信号机制及其在干扰素应答中的新作用	未探讨pLxIS基序在其他生物过程中的可能影响	探索pLxIS基序在干扰素和代谢调节中的新功能	两个孤立的pLxIS含量蛋白，它们独立于已知的模式识别受体通路刺激干扰素应答	数字病理学	NA	合成生物学平台	NA	细胞	人类细胞的多样性
36	2024-08-05	Ion Signaling in Cell Motility and Development in Dictyostelium discoideum 2024-Jul-10, Biomolecules IF:4.8Q1 DOI:10.3390/biom14070830 PMID:39062545	综述	本文讨论了离子信号在粘菌细胞运动和发育中的作用	探讨了离子信号在细胞间相互作用及多细胞形成机制中的新见解	NA	旨在提升对细胞间通信、协调及分化的理解	以粘菌为模型生物进行细胞间和离子信号的探讨	发育生物学	NA	NA	NA	NA	NA
37	2024-08-05	Application of Cyanobacteria as Chassis Cells in Synthetic Biology 2024-Jul-05, Microorganisms IF:4.1Q2 DOI:10.3390/microorganisms12071375 PMID:39065143	review	本综述总结了来自蓝藻底盘细胞和合成生物学的应用改进策略	探讨了蓝藻合成生物学在生物化学合成、环境监测和修复中的应用及其挑战	蓝藻合成生物学仍处于早期阶段，实施和开发面临困难和挑战	评估蓝藻作为合成生物学底盘细胞的应用及其改进策略	蓝藻及其在生物化学合成中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
38	2024-08-05	CRISPR Tools for Engineering Prokaryotic Systems: Recent Advances and New Applications 2024-Jul, Annual review of chemical and biomolecular engineering IF:7.6Q1 DOI:10.1146/annurev-chembioeng-100522-114706 PMID:38598861	研究论文	本文回顾了CRISPR-Cas系统在原核系统中的应用及其技术进展	提出了新的CRISPR组件设计和多种应用示例，包括生物传感、生产和治疗	关于具体实验数据和案例的详细描述较少	探讨CRISPR技术在生物工程中的潜在应用及其未来发展	原核生物系统中的CRISPR工具与技术	合成生物学	NA	CRISPR-Cas系统	NA	NA	NA
39	2024-08-05	Cell factory design with advanced metabolic modelling empowered by artificial intelligence 2024-Jul-20, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2024.07.003 PMID:39038602	综述	本文总结了先进代谢模型与人工智能在计算菌株设计中的应用	探讨了人工智能与代谢模型的深度集成，以构建高性能细胞工厂	NA	提高高性能细胞工厂的构建效率和一致性	代谢网络模型和计算菌株设计	合成生物学	NA	代谢建模、人工智能	NA	NA	NA
40	2024-08-05	Advancement of Research Progress on Synthesis Mechanism of Cannabidiol (CBD) 2024-Jul-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00239 PMID:38900848	综述	本文回顾了使用生物技术生产CBD的潜力	探讨了运用代谢工程、合成生物学和异源表达提高CBD生产的创新方法	缺乏对实际生产效率和经济可行性的实证研究	研究CBD的合成机制及其生物技术生产的潜力	主要关注大麻二酚（CBD）及其相关的次级代谢物	NA	NA	代谢工程、合成生物学	NA	NA	NA