合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 82 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Bioenergetic stress potentiates antimicrobial resistance and persistence
2024-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.12.603336
PMID:39026737
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法探究生物能量应激如何增强细菌的抗生素耐药性和持久性 | 首次构建了持续水解ATP或NADH的遗传系统，揭示了生物能量应激通过增强活性氧产生、诱变断裂修复和转录偶联修复促进抗生素耐药性进化的新机制 | 研究仅在大肠杆菌中进行，尚未在其他细菌物种中验证 | 探究抗生素诱导的生物能量应激对治疗结果的影响机制 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 构建了持续水解ATP或NADH的遗传系统 | 医学 |
| 22 | 2025-10-05 |
Bioinformatic Prediction and High Throughput In Vivo Screening to Identify Cis-Regulatory Elements for the Development of Algal Synthetic Promoters
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00199
PMID:38986010
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学预测和高通量体内筛选方法，开发了适用于藻类的合成启动子 | 结合POWRS、STREME和PhyloGibbs算法预测顺式调控元件，并通过高通量筛选验证合成启动子活性 | 需要目标藻类物种具有测序的基因组和转录组数据集 | 开发适用于藻类生物技术的合成生物学工具 | 六种不同藻类物种的启动子区域和顺式调控元件 | 合成生物学 | NA | 下一代测序、荧光激活细胞分选、生物信息学分析 | NA | 基因组序列、转录组数据 | 4533个合成启动子，数百个转基因株系 | 合成生物学方法 | 藻类 | 合成启动子设计，包含1-3个顺式调控元件拷贝 | 工业生物技术,能源 |
| 23 | 2025-10-05 |
Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00283
PMID:38981096
|
研究论文 | 本研究通过定向进化方法开发具有增强非线性超声散射信号的声学报告基因 | 建立了高通量半自动化声学筛选平台，首次将定向进化应用于声学报告基因的优化 | 研究主要针对细菌培养体系，在哺乳动物系统中的适用性需要进一步验证 | 开发性能更优的声学报告基因用于生物成像 | 气体囊泡(GVs)蛋白纳米结构及其编码基因 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量声学筛选、非线性超声散射 | NA | 声学信号数据、蛋白质序列数据 | GvpA/B同源蛋白的扫描位点饱和突变库 | 定向进化 | 细菌 | 声学报告基因系统，基于气体囊泡的超声对比剂 | 医学成像、合成生物学 |
| 24 | 2025-10-05 |
Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae
2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.24.605010
PMID:39091764
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和体内突变分析揭示了绿藻中双顺反子转录本通过渗漏核糖体扫描机制实现多ORF翻译的分子机理 | 首次在绿藻中证实渗漏核糖体扫描是实现双顺反子可调翻译的关键机制，并构建了可逆调控的双报告基因系统 | 研究主要集中于两种绿藻物种，机制在其他真核生物中的普适性需要进一步验证 | 探究绿藻多顺反子基因的翻译机制 | 绿藻（衣藻和团藻）的双顺反子基因位点 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统 | NA | 基因组数据、荧光报告数据 | 两种绿藻物种的高可信度手动注释双顺反子位点数据集 | NA | 绿藻 | 合成双顺反子双报告基因系统（绿色荧光蛋白和荧光素酶） | 合成生物学 |
| 25 | 2025-10-05 |
A directed enolization strategy enables by-product-free construction of contiguous stereocentres en route to complex amino acids
2024-07, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-024-01473-5
PMID:38565976
|
研究论文 | 开发了一种铱催化的定向烯醇化策略，用于高效合成具有连续立体中心的β-取代α-氨基酸 | 利用甘氨酸衍生物N-H单元的内源性导向能力实现铱催化的定向烯醇化，实现两个连续立体中心的高效构建 | NA | 开发合成具有β-立体中心的α-氨基酸的新方法 | β-取代α-氨基酸的合成 | 有机合成化学 | NA | 铱催化、定向烯醇化、交叉偶联 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物设计、手性催化剂合成、合成生物学 |
| 26 | 2025-10-05 |
DeepEnzyme: a robust deep learning model for improved enzyme turnover number prediction by utilizing features of protein 3D-structures
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae409
PMID:39162313
|
研究论文 | 开发了一种结合Transformer和GCN的深度学习模型DeepEnzyme，通过整合蛋白质序列和三维结构特征来预测酶转换数 | 首次将Transformer与图卷积网络结合，利用蛋白质三维结构特征提升对低序列相似度酶的kcat预测鲁棒性 | NA | 提高酶转换数(kcat)预测的准确性和鲁棒性 | 酶蛋白 | 机器学习 | NA | 深度学习 | Transformer, GCN | 蛋白质序列数据，三维结构数据 | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程，合成生物学 |
| 27 | 2025-10-05 |
Introducing carbon assimilation in yeasts using photosynthetic directed endosymbiosis
2024-Jul-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49585-3
PMID:39013857
|
研究论文 | 本研究通过定向内共生方法在酵母细胞内引入光合蓝细菌，构建能进行光合固碳的酵母/蓝细菌嵌合体 | 开发了定向内共生方法将光合固碳能力引入酵母，无需传统代谢工程和实验室进化 | NA | 将异养酵母转化为具有光合自养能力的生物 | 芽殖酵母和光合蓝细菌 | 合成生物学 | NA | 定向内共生 | NA | NA | NA | NA | 酵母, 蓝细菌 | 光合固碳和糖分泌系统 | 可持续生物技术, 工业生物技术 |
| 28 | 2025-10-06 |
Pseudomonas putida KT2440: the long journey of a soil-dweller to become a synthetic biology chassis
2024-07-25, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00136-24
PMID:38975763
|
综述 | 本文总结了恶臭假单胞菌KT2440从环境微生物逐步发展为合成生物学底盘细胞的历程 | 系统梳理了KT2440菌株从污染物降解研究到合成生物学底盘应用的升级路径 | KT2440的分类学地位仍存在不确定性 | 回顾恶臭假单胞菌KT2440作为合成生物学平台的发展历程 | 恶臭假单胞菌KT2440菌株及其应用发展 | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | Pseudomonas putida KT2440 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 29 | 2024-12-20 |
Diverting organic waste from landfills via insect biomanufacturing using engineered black soldier flies (Hermetia illucens)
2024-07-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06516-8
PMID:39048665
|
研究论文 | 本文探讨了利用工程化黑水虻（Hermetia illucens）进行昆虫生物制造，以减少有机废物进入垃圾填埋场，并将其转化为高价值产品 | 利用合成生物学开发黑水虻作为可持续的生物制造平台，将多种有机废物转化为增强的动物饲料、高价值生物分子和改良肥料 | NA | 实现循环经济，减少有机废物处理问题 | 黑水虻（Hermetia illucens）及其在有机废物转化中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-12-19 |
Efficient and markerless gene integration with SlugCas9-HF in Kluyveromyces marxianus
2024-07-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06487-w
PMID:38956406
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR-Cas9的多位点基因整合方法，用于在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中组装多个外源基因 | 使用高保真Cas9核酸酶SlugCas9-HF提高了基因编辑的精确度，并开发了一种CRISPR-based的生物合成工具包，能够实现大基因模块的基因组整合和多位点同时整合 | NA | 开发一种高效的基因整合方法，促进Kluyveromyces marxianus在工业生产中的应用 | 非传统酵母Kluyveromyces marxianus | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-10-27 |
Rhodopsin-based light-harvesting system for sustainable synthetic biology
2024-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14521
PMID:38949508
|
评论 | 本文探讨了利用视紫红质在可持续合成生物学中的应用及其未来潜力 | 视紫红质具有显著的光化学特性，可用于开发可持续和节能的技术 | NA | 探索视紫红质在可持续工程中的应用 | 视紫红质及其在生物生产和可再生能源转换中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-09-25 |
Blue valorization of lignin-derived monomers via reprogramming marine bacterium Roseovarius nubinhibens
2024-07-24, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00890-24
PMID:38940564
|
研究论文 | 研究通过重新编程海洋细菌Roseovarius nubinhibens，将木质素衍生的芳香碳转化为高附加值化学品 | 首次在海洋细菌中应用基于CRISPR的调控系统，实现了对目标基因的精确高效抑制 | NA | 探索利用海洋细菌进行木质素生物转化，实现碳和水的双重节约 | 木质素衍生的单体4-羟基苯甲酸和海洋细菌Roseovarius nubinhibens | 生物技术 | NA | CRISPR干扰系统 | CRISPRi | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-09-14 |
Limiting the Broadcast Range of a Secreting Cell during Intercellular Signaling Using Protease-Mediated Degradation
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00042
PMID:38885472
|
研究论文 | 研究如何通过蛋白酶介导的降解来限制分泌细胞在细胞间信号传递中的广播范围 | 提出了一种通过添加barrierpepsin来限制细胞在二维多细胞网络中α-因子信号响应范围的方法 | NA | 探索如何通过蛋白酶限制细胞间信号传递的广播范围，以实现更复杂的细胞网络功能 | 分泌细胞在细胞间信号传递中的广播范围 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 二维多细胞网络中的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-09-02 |
Physiological Roles of Eumelanin- and Melanogenesis-Associated Diseases: A Look at the Potentialities of Engineered and Microbial Eumelanin in Clinical Practice
2024-Jul-25, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering11080756
PMID:39199714
|
综述 | 本文旨在强调人体多个器官/组织中存在的真黑素所发挥的生理作用，并基于其独特性质合理化这一生物聚合物所扮演的常常相互冲突的功能角色 | 探讨了基于外源性真黑素的局部供应疗法的潜力，以及通过合成生物学生产的真黑素在重塑治疗和诊断应用中的机会 | NA | 分析真黑素的生理和病理作用，并深入探讨与黑色素生成相关的皮肤、眼睛、耳朵和大脑疾病 | 真黑素的生理和病理作用，以及与黑色素生成相关的疾病 | NA | 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-31 |
Lipid-Based Catalysis Demonstrated by Bilayer-Enabled Ester Hydrolysis
2024-Jul-30, Membranes
IF:3.3Q2
DOI:10.3390/membranes14080168
PMID:39195420
|
研究论文 | 本文展示了脂质双层膜的疏水区域为催化反应提供适宜环境的能力，并通过酯水解反应验证了这一概念 | 首次展示了脂质双层膜在生物系统中作为催化剂的可能性 | 催化反应速度比酶催化慢，催化转化数在10-7到10-8 s之间 | 探索脂质及其聚集体在生物化学、药理学和合成生物学中的催化作用 | 脂质双层膜的催化能力及其在酯水解反应中的应用 | NA | NA | H-NMR | NA | 荧光 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-13 |
AI-Assisted Rational Design and Activity Prediction of Biological Elements for Optimizing Transcription-Factor-Based Biosensors
2024-Jul-26, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29153512
PMID:39124917
|
综述 | 本文综述了人工智能算法在合成生物学中生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器响应性能调控中的应用 | 探讨了人工智能算法在分析生物数据中的强大潜力，并提出了针对该领域挑战的创新解决方案 | NA | 探索人工智能在合成生物学中的应用，以推动学术研究和生物技术的实际应用 | 生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器的调控 | 合成生物学 | NA | 机器学习、深度学习 | AI算法 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-12 |
CAPE: a deep learning framework with Chaos-Attention net for Promoter Evolution
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae398
PMID:39120645
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CAPE的深度学习框架，该框架采用混沌注意力网络用于启动子进化，旨在预测启动子强度并指导其定向进化 | CAPE模型通过综合提取启动子内的进化信息，并使用改进的DenseNet和Transformer结构处理整体信息，实现了对原核生物启动子强度预测的最新成果 | NA | 预测启动子强度并指导其定向进化，以降低传统启动子工程中的实验成本 | 原核生物启动子 | 机器学习 | NA | 深度学习 | DenseNet, Transformer | 启动子序列信息 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-09 |
Turn-on protein switches for controlling actin binding in cells
2024-Jul-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49934-2
PMID:38992021
|
research paper | 本文介绍了一组可设计蛋白，即可控肌动蛋白结合开关工具（CASTs），这些蛋白的肌动蛋白结合行为可以通过外部刺激进行控制 | CASTs蛋白可以通过外部输入响应不同的外部刺激，提供开启动力学选项，并实现正交性和多路复用 | NA | 开发一种新的方法来控制细胞内肌动蛋白的结合，以实现合成生物学目的 | 肌动蛋白结合蛋白（ABPs）及其在细胞活动中的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-05 |
Directed evolution of material-producing microorganisms
2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2403585121
PMID:39042685
|
研究论文 | 本文利用高通量定向进化平台增强微生物的物质生产能力 | 提出了一种新的高通量平台，通过选择压力促进微生物的进化，揭示了细胞纤维素生产能力与基因的关联 | 缺乏对其他微生物或材料生产的研究，可能限制了成果的广泛应用 | 研究微生物材料生产的能力，寻找基因型-表型的联系 | 以产纤维素的微生物为模型进行研究 | 合成生物学 | NA | 高通量定向进化 | NA | 基因组序列 | 40,000个随机突变体 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-05 |
Advances in the development of synthetic biology tools for the bioproduction of natural product analogues
2024-07-01, Postepy biochemii
DOI:10.18388/pb.2021_531
PMID:39083471
|
研究论文 | 本文介绍了自然产物及其衍生物在多个行业的应用以及合成生物学工具的进展 | 强调了合成生物学工具在生物生产生物活性二次代谢物方面的进展 | NA | 探讨合成生物学工具在自然产物生物生产中的应用 | 自然产物及其生物活性二次代谢物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 化学化合物 | NA | NA | NA | NA | NA |