合成生物学相关文章
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当前共找到 83 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Pseudomonas putida KT2440: the long journey of a soil-dweller to become a synthetic biology chassis
2024-07-25, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/jb.00136-24
PMID:38975763
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综述 | 本文总结了恶臭假单胞菌KT2440从环境微生物逐步发展为合成生物学底盘细胞的历程 | 系统梳理了KT2440菌株从污染物降解研究到合成生物学底盘应用的升级路径 | KT2440的分类学地位仍存在不确定性 | 回顾恶臭假单胞菌KT2440作为合成生物学平台的发展历程 | 恶臭假单胞菌KT2440菌株及其应用发展 | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | Pseudomonas putida KT2440 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 22 | 2024-12-20 |
Diverting organic waste from landfills via insect biomanufacturing using engineered black soldier flies (Hermetia illucens)
2024-07-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06516-8
PMID:39048665
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研究论文 | 本文探讨了利用工程化黑水虻（Hermetia illucens）进行昆虫生物制造，以减少有机废物进入垃圾填埋场，并将其转化为高价值产品 | 利用合成生物学开发黑水虻作为可持续的生物制造平台，将多种有机废物转化为增强的动物饲料、高价值生物分子和改良肥料 | NA | 实现循环经济，减少有机废物处理问题 | 黑水虻（Hermetia illucens）及其在有机废物转化中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-12-19 |
Efficient and markerless gene integration with SlugCas9-HF in Kluyveromyces marxianus
2024-07-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06487-w
PMID:38956406
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR-Cas9的多位点基因整合方法，用于在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中组装多个外源基因 | 使用高保真Cas9核酸酶SlugCas9-HF提高了基因编辑的精确度，并开发了一种CRISPR-based的生物合成工具包，能够实现大基因模块的基因组整合和多位点同时整合 | NA | 开发一种高效的基因整合方法，促进Kluyveromyces marxianus在工业生产中的应用 | 非传统酵母Kluyveromyces marxianus | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-10-27 |
Rhodopsin-based light-harvesting system for sustainable synthetic biology
2024-07, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.14521
PMID:38949508
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评论 | 本文探讨了利用视紫红质在可持续合成生物学中的应用及其未来潜力 | 视紫红质具有显著的光化学特性，可用于开发可持续和节能的技术 | NA | 探索视紫红质在可持续工程中的应用 | 视紫红质及其在生物生产和可再生能源转换中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-09-25 |
Blue valorization of lignin-derived monomers via reprogramming marine bacterium Roseovarius nubinhibens
2024-07-24, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00890-24
PMID:38940564
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研究论文 | 研究通过重新编程海洋细菌Roseovarius nubinhibens，将木质素衍生的芳香碳转化为高附加值化学品 | 首次在海洋细菌中应用基于CRISPR的调控系统，实现了对目标基因的精确高效抑制 | NA | 探索利用海洋细菌进行木质素生物转化，实现碳和水的双重节约 | 木质素衍生的单体4-羟基苯甲酸和海洋细菌Roseovarius nubinhibens | 生物技术 | NA | CRISPR干扰系统 | CRISPRi | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-09-14 |
Limiting the Broadcast Range of a Secreting Cell during Intercellular Signaling Using Protease-Mediated Degradation
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00042
PMID:38885472
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研究论文 | 研究如何通过蛋白酶介导的降解来限制分泌细胞在细胞间信号传递中的广播范围 | 提出了一种通过添加barrierpepsin来限制细胞在二维多细胞网络中α-因子信号响应范围的方法 | NA | 探索如何通过蛋白酶限制细胞间信号传递的广播范围，以实现更复杂的细胞网络功能 | 分泌细胞在细胞间信号传递中的广播范围 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 二维多细胞网络中的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-09-02 |
Physiological Roles of Eumelanin- and Melanogenesis-Associated Diseases: A Look at the Potentialities of Engineered and Microbial Eumelanin in Clinical Practice
2024-Jul-25, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering11080756
PMID:39199714
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综述 | 本文旨在强调人体多个器官/组织中存在的真黑素所发挥的生理作用，并基于其独特性质合理化这一生物聚合物所扮演的常常相互冲突的功能角色 | 探讨了基于外源性真黑素的局部供应疗法的潜力，以及通过合成生物学生产的真黑素在重塑治疗和诊断应用中的机会 | NA | 分析真黑素的生理和病理作用，并深入探讨与黑色素生成相关的皮肤、眼睛、耳朵和大脑疾病 | 真黑素的生理和病理作用，以及与黑色素生成相关的疾病 | NA | 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-31 |
Lipid-Based Catalysis Demonstrated by Bilayer-Enabled Ester Hydrolysis
2024-Jul-30, Membranes
IF:3.3Q2
DOI:10.3390/membranes14080168
PMID:39195420
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研究论文 | 本文展示了脂质双层膜的疏水区域为催化反应提供适宜环境的能力，并通过酯水解反应验证了这一概念 | 首次展示了脂质双层膜在生物系统中作为催化剂的可能性 | 催化反应速度比酶催化慢，催化转化数在10-7到10-8 s之间 | 探索脂质及其聚集体在生物化学、药理学和合成生物学中的催化作用 | 脂质双层膜的催化能力及其在酯水解反应中的应用 | NA | NA | H-NMR | NA | 荧光 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-13 |
AI-Assisted Rational Design and Activity Prediction of Biological Elements for Optimizing Transcription-Factor-Based Biosensors
2024-Jul-26, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29153512
PMID:39124917
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综述 | 本文综述了人工智能算法在合成生物学中生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器响应性能调控中的应用 | 探讨了人工智能算法在分析生物数据中的强大潜力，并提出了针对该领域挑战的创新解决方案 | NA | 探索人工智能在合成生物学中的应用，以推动学术研究和生物技术的实际应用 | 生物元素的合理设计、活性预测及转录因子基生物传感器的调控 | 合成生物学 | NA | 机器学习、深度学习 | AI算法 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-12 |
CAPE: a deep learning framework with Chaos-Attention net for Promoter Evolution
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae398
PMID:39120645
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CAPE的深度学习框架，该框架采用混沌注意力网络用于启动子进化，旨在预测启动子强度并指导其定向进化 | CAPE模型通过综合提取启动子内的进化信息，并使用改进的DenseNet和Transformer结构处理整体信息，实现了对原核生物启动子强度预测的最新成果 | NA | 预测启动子强度并指导其定向进化，以降低传统启动子工程中的实验成本 | 原核生物启动子 | 机器学习 | NA | 深度学习 | DenseNet, Transformer | 启动子序列信息 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-09 |
Turn-on protein switches for controlling actin binding in cells
2024-Jul-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49934-2
PMID:38992021
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research paper | 本文介绍了一组可设计蛋白，即可控肌动蛋白结合开关工具（CASTs），这些蛋白的肌动蛋白结合行为可以通过外部刺激进行控制 | CASTs蛋白可以通过外部输入响应不同的外部刺激，提供开启动力学选项，并实现正交性和多路复用 | NA | 开发一种新的方法来控制细胞内肌动蛋白的结合，以实现合成生物学目的 | 肌动蛋白结合蛋白（ABPs）及其在细胞活动中的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-05 |
Directed evolution of material-producing microorganisms
2024-Jul-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2403585121
PMID:39042685
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研究论文 | 本文利用高通量定向进化平台增强微生物的物质生产能力 | 提出了一种新的高通量平台，通过选择压力促进微生物的进化，揭示了细胞纤维素生产能力与基因的关联 | 缺乏对其他微生物或材料生产的研究，可能限制了成果的广泛应用 | 研究微生物材料生产的能力，寻找基因型-表型的联系 | 以产纤维素的微生物为模型进行研究 | 合成生物学 | NA | 高通量定向进化 | NA | 基因组序列 | 40,000个随机突变体 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-05 |
Advances in the development of synthetic biology tools for the bioproduction of natural product analogues
2024-07-01, Postepy biochemii
DOI:10.18388/pb.2021_531
PMID:39083471
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研究论文 | 本文介绍了自然产物及其衍生物在多个行业的应用以及合成生物学工具的进展 | 强调了合成生物学工具在生物生产生物活性二次代谢物方面的进展 | NA | 探讨合成生物学工具在自然产物生物生产中的应用 | 自然产物及其生物活性二次代谢物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 化学化合物 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-05 |
An Enzymatic Prodrug-like Route to Thio and Selenoamides
2024-07-29, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202404243
PMID:38747847
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研究论文 | 本文揭示了一种酶促的前药样途径，用于硫和硒酰胺的合成 | 首次系统阐明了6-硫鸟嘌呤的生物合成机制和相关酶的功能，并发现了前药样的硫结合物中间体 | 未充分探索硫转移机制中的所有潜在中间体 | 研究细菌中稀有硫酰胺的形成机制 | 关注Erwinia amylovorans产生的6-硫鸟嘌呤及其生物合成途径 | 合成生物学 | 肿瘤 | 酶促反应重组 | NA | 化学物质 | 使用多种底物进行反应，样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-05 |
Direct α-Hydroxy Acid Loading onto a Bacterial Thiotemplate Assembly Line via a Multienzyme Gateway
2024-07-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202405165
PMID:38728443
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研究论文 | 本研究揭示了将α-羟基酸直接加载到细菌非核糖体肽合成酶模块的过程 | 首次报告了细菌中将α-羟基酸直接加载到非核糖体肽合成酶模块的专门通道，拓展了合成生物学工具箱 | 部分研究步骤依赖于突变分析和酶活性测定，可能限制了结果的普遍性 | 研究α-羟基酸在细菌非核糖体肽合成中作为构建块的加载机制 | 焦链酸的加载过程及相关酶的功能 | 合成生物学 | NA | 生物信息学，代谢组学，生化分析 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-05 |
Leveraging DNA-Encoded Cell-Mimics for Environment-Adaptive Transmembrane Channel Release-Induced Cell Death
2024-07-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202406186
PMID:38738850
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研究论文 | 本文介绍了一种创新的DNA编码的人工T细胞模型，能够模拟T细胞的行为并诱导细胞死亡 | 提出了一种基于DNA的人工T细胞模仿物，能够在肿瘤微环境下响应酸性条件，并选择性释放嵌入脂质和胆固醇的DNA链 | NA | 研究环境适应性细胞死亡的机制 | DNA编码的人工T细胞模仿物（ARTC） | 生物医学工程 | 肿瘤 | DNA编码 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-05 |
Measuring the burden of hundreds of BioBricks defines an evolutionary limit on constructability in synthetic biology
2024-Jul-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50639-9
PMID:39048554
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研究论文 | 本文测量了301种BioBrick质粒对大肠杆菌生长的影响 | 本文首次系统地表征了生物零件对宿主细胞的负担，确立了合成生物学中构建的进化限制 | 只研究了301种BioBrick质粒，样本数量相对较少 | 研究合成生物学中生物零件对宿主细胞生长的影响 | 301种BioBrick质粒和大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | NA | 种群遗传模型 | NA | 301种BioBrick质粒 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-05 |
Advances in the Synthesis and Physiological Metabolic Regulation of Nicotinamide Mononucleotide
2024-Jul-20, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu16142354
PMID:39064797
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综述 | 该文章总结了烟酰胺单核苷酸（NMN）的合成和生理代谢调控的最新进展 | 介绍了微生物细胞工厂在NMN生产中的应用，提供了化学合成及生物合成策略的最新研究进展 | 存在有机化学方法面临的环境和安全问题的讨论 | 旨在提供NMN高效生物合成的技术指导及其在食品、医药和化妆品领域的应用基础 | 研究对象为烟酰胺单核苷酸及其合成方法 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 合成生物学 | 微生物细胞工厂 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-05 |
The Undeniable Potential of Thermophiles in Industrial Processes
2024-Jul-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25147685
PMID:39062928
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综述 | 本综述讨论了极端嗜热微生物在工业过程中的应用潜力 | 揭示了嗜热微生物在合成生物学和可持续生物过程开发中的重要性 | 本综述未包含所有类型的极端微生物以及它们在其他领域的应用 | 旨在探讨嗜热微生物在生物制造和工业应用中的进展 | 极端嗜热微生物及其生物制造的高附加值生物产品 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-05 |
Ion Signaling in Cell Motility and Development in Dictyostelium discoideum
2024-Jul-10, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070830
PMID:39062545
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综述 | 本文讨论了离子信号在粘菌细胞运动和发育中的作用 | 探讨了离子信号在细胞间相互作用及多细胞形成机制中的新见解 | NA | 旨在提升对细胞间通信、协调及分化的理解 | 以粘菌为模型生物进行细胞间和离子信号的探讨 | 发育生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |