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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-04-03 |
Engineering Material Properties of Transcription Factor Condensates to Control Gene Expression in Mammalian Cells and Mice
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202311834
PMID:38573961
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research paper | 该研究通过调节转录因子凝聚物的材料特性,探索其对基因表达调控的影响 | 首次系统性地调节光遗传诱导的转录因子凝聚物的材料特性,并揭示其对基因表达激活的影响 | 研究主要关注转录因子凝聚物的物理性质对基因表达的影响,未深入探讨具体的分子机制 | 探索生物分子凝聚物材料特性对基因表达调控的影响 | 哺乳动物细胞和小鼠中的转录因子凝聚物 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | 哺乳动物细胞和小鼠模型,使用不同合成和天然转录因子 |
2 | 2025-03-26 |
Understanding the Role of Layered Minerals in the Emergence and Preservation of Proto-Proteins and Detection of Traces of Early Life
2024-09-03, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00173
PMID:39141709
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research paper | 本文探讨了层状矿物在原始蛋白质出现和保存以及早期生命痕迹检测中的作用 | 提出了矿物可能作为环境循环现象信息转录者的新观点,并探讨了伪生物标志物的识别途径 | 实验室无法完全模拟早期行星的所有过程和样本 | 研究生命起源的基本原理及其在宇宙中的意义 | 层状矿物表面与原始生物分子的相互作用 | astrobiology | NA | 分子建模技术、空间任务、湿实验室实验、理论建模 | NA | NA | NA |
3 | 2025-03-24 |
Biosecurity Assessments for Emerging Transdisciplinary Biotechnologies: Revisiting Biodefense in an Age of Synthetic Biology
2024-Sep, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2024.0005
PMID:39372508
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研究论文 | 本文探讨了新兴跨学科生物技术中的生物安全问题,特别是合成生物学时代的生物防御 | 使用国家科学院关于合成生物学时代生物防御的研究框架,评估和缓解跨学科生物技术研发的风险 | 风险评估框架可能不适用于无法与传统生物制剂一起使用的技术,且大多数讨论集中在风险而非收益上 | 评估和缓解跨学科生物技术研发中的生物安全风险 | 合成生物学和工程生物学的研究进展 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
4 | 2025-03-23 |
Design and construction of artificial metabolic pathways for the bioproduction of useful compounds
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文介绍了合成生物学中关键的代谢设计技术,并讨论了利用植物细胞或植物基因在合成生物学中有效生产有用化合物的潜力 | 本文强调了计算科学方法在代谢途径理性设计和代谢通量优化中的有效性,并提出了通过有效循环重新设计系统的策略 | 本文主要集中于理论和方法介绍,缺乏具体实验数据和实际应用案例 | 旨在通过优化代谢反应和途径,利用生物细胞高效生产有用化合物 | 生物细胞,特别是植物细胞或植物基因 | 合成生物学 | NA | 计算科学方法 | NA | NA | NA |
5 | 2025-03-23 |
Synthetic biology in plants
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物科学中的发展和现状,强调了关键成就和新兴趋势 | 合成生物学通过工程原理重新设计和构建生物系统,为植物性状、代谢途径和环境应激反应的操控提供了创新解决方案 | 尽管合成生物学具有变革潜力,但其在植物研究和开发中的伦理和生物安全问题需要负责任地部署 | 探讨合成生物学在植物科学中的应用及其对农业和生物技术的潜在影响 | 植物 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑技术 | NA | NA | NA |
6 | 2025-03-23 |
Integrated metabolite profiling and transcriptome analysis reveal candidate genes involved in the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids in Corydalis solida
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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研究论文 | 本研究通过整合代谢物分析和转录组分析,揭示了紫堇属植物中参与苯基异喹啉生物碱(BIAs)生物合成的候选基因 | 本研究首次结合代谢物分析和转录组分析,筛选出在紫堇属植物块茎中高表达的潜在生物合成酶基因,并鉴定了两个OMT基因的功能 | 研究中仅鉴定了部分酶基因的功能,许多BIAs生物合成途径中的酶基因仍未知 | 阐明紫堇属植物中苯基异喹啉生物碱的生物合成途径,以促进其高效生产 | 紫堇属植物(Corydalis solida)的不同组织 | 植物代谢工程 | NA | 转录组分析、代谢物分析 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 紫堇属植物的不同组织 |
7 | 2025-03-23 |
Synthetic-biology approach for plant lignocellulose engineering
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文综述了植物木质纤维素工程中的合成生物学方法,旨在减少木质纤维素的顽固性并提高其工业利用价值 | 提出了八种重新设计木质素和结构聚糖途径的策略,以减少木质纤维素的顽固性,同时缓解与产量损失相关的生长惩罚 | 植物基系统在工业应用中的采用仍受到已建立的哺乳动物和其他细胞培养体系的阻碍 | 提高植物基系统在工业应用中的竞争力,促进可持续植物衍生产品的开发 | 植物木质纤维素 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
8 | 2025-03-23 |
Distribution, biosynthesis, and synthetic biology of phenylethanoid glycosides in the order Lamiales
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文综述了苯乙醇苷类化合物(PhGs)在植物中的积累与分布、生物合成途径及其生物生产的最新研究 | 本文综合了苯乙醇苷类化合物的最新研究进展,特别是在生物合成途径和生物生产方面的创新点 | 本文未涉及苯乙醇苷类化合物的具体药物开发应用 | 研究苯乙醇苷类化合物的积累、分布、生物合成途径及其生物生产 | 苯乙醇苷类化合物 | 植物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
9 | 2025-03-22 |
Preface to the special issue "Synthetic Biology and Bioproduction in Plants"
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
10 | 2025-03-05 |
Impact of sulfur substitution on biotin binding affinity to streptavidin
2024-09, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107600
PMID:38945086
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研究论文 | 本研究探讨了将生物素的四氢噻吩环替换为氧杂环或(甲基)吡咯烷基团对其分子相互作用的影响,旨在寻找适用于合成生物学体外和体内应用的替代亲和配体 | 通过分子动力学模拟和荧光滴定实验,发现氧杂生物素与链霉亲和素的结合行为与生物素相似,而氨基类似物则表现出较低的结合能力,特别是氮杂生物素在酸性条件下表现出增强的结合能力 | 研究仅关注了少数几种硫替代物,未全面评估所有可能的替代物及其在不同条件下的结合行为 | 研究硫替代对生物素与链霉亲和素结合亲和力的影响,以寻找适用于合成生物学的替代亲和配体 | 生物素及其硫替代物与链霉亲和素的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟(MD)、荧光滴定实验 | NA | 分子相互作用数据 | NA |
11 | 2025-03-01 |
Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene by modulating antisense RNA production
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405510121
PMID:39190361
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研究论文 | 本文探讨了同义密码子替换如何通过调节反义RNA的产生来影响上游基因的转录和翻译 | 揭示了同义密码子替换不仅影响单个基因的表达,还能显著影响邻近基因的表达,特别是通过反义RNA的产生 | 研究仅限于质粒编码的基因,未涉及更广泛的基因组环境 | 研究同义密码子替换对邻近基因表达的影响 | 质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因和上游的四环素抗性基因 | 分子生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 九种同义重编码的CAT基因序列 |
12 | 2025-02-14 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-Sep-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科药用植物的基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学研究的最新进展,并探讨了这些技术在制药工业和农业生物技术领域的潜在应用 | 结合基因组信息与其他组学研究,揭示药用植物遗传基础和次生代谢物生物合成途径,并探讨了现代基因编辑技术如CRISPR/Cas9和RNA干扰的应用 | NA | 探讨罂粟科药用植物的基因组学及其他组学研究,以揭示其药用活性的遗传基础 | 罂粟科药用植物,如罂粟(Papaver somniferum)和白屈菜(Chelidonium majus) | 基因组学 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR/Cas9、RNA干扰 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA |
13 | 2025-02-02 |
Decoding the genetic blueprint: regulation of key agricultural traits in sorghum
2024-Sep-18, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00039-3
PMID:39883247
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综述 | 本文综述了高粱关键农业性状的遗传调控机制,旨在通过先进的育种技术提高高粱的产量、质量和抗逆性 | 全面概述了高粱中与植物和穗结构以及抗逆性相关的功能基因和调控网络,为开发更具抗逆性和高产的高粱品种提供了理论基础 | 未提及具体实验数据或样本量,主要依赖于已有文献的综述 | 揭示高粱关键农业性状的遗传调控机制,以提高其产量、质量和抗逆性 | 高粱 | 农业遗传学 | NA | 全基因组选择、基因编辑、合成生物学 | NA | 遗传数据 | NA |
14 | 2025-02-02 |
DSCI: a database of synthetic biology components for innate immunity and cell engineering decision-making processes
2024-Sep-03, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00036-6
PMID:39883249
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研究论文 | 本文介绍了DSCI数据库,一个专注于先天免疫和细胞工程决策过程的合成生物学组件数据库 | DSCI数据库首次整合了1240个独立组件和4000多个特定条目,为先天免疫信号电路设计提供了全面的资源和策略 | 数据库的组件和条目主要来源于公开文献,可能存在数据更新不及时或覆盖不全的问题 | 旨在为先天免疫信号电路设计和细胞工程提供更好的见解和策略 | 先天免疫和细胞工程中的合成生物学组件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本和可视化信号基序 | 1240个独立组件和4000多个特定条目 |
15 | 2025-01-28 |
Spectral Algal Fingerprinting and Long Sequencing in Synthetic Algal-Microbial Communities
2024-09-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181552
PMID:39329735
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研究论文 | 本研究利用全光谱细胞术分析合成藻类-微生物群落,实现快速物种识别和计数 | 采用全光谱细胞术进行高维度单细胞分析,提供比传统流式细胞术更高的精度和灵活性 | 需要开发标准化的光谱库以改进藻类群落的表征 | 提高合成藻类-微生物群落的分析和理解 | 合成藻类-微生物群落 | 合成生物学 | NA | 全光谱细胞术 | NA | 光谱数据 | NA |
16 | 2025-01-21 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614978
PMID:39386662
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研究论文 | 本文通过定向进化技术开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎,用于可编程基因表达 | 通过将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶融合,进化出高活性的变体,显著提高了在真核系统中的蛋白表达水平 | NA | 开发一种适用于真核生物的正交基因调控系统,提高合成生物学应用的多样性和效率 | T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA |
17 | 2024-12-08 |
A Synthetic Biology Approach to Transgene Expression in Insects
2024-Sep-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00250
PMID:39198266
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研究论文 | 本文介绍了一种合成生物学方法,用于控制昆虫中的转基因表达 | 开发了一种系统方法,通过修改翻译起始序列和3'非翻译区来调节转基因表达,为蚊子和其他昆虫提供了一个基因表达调控工具箱 | NA | 解决非模式和害虫昆虫物种中基因表达调控的预测性问题 | 蚊子和其他昆虫的转基因表达调控 | 合成生物学 | NA | RNA聚合酶II启动子 | NA | 基因序列 | 多种细胞系和5'调控序列 |
18 | 2024-12-06 |
An upgraded Myxococcus xanthus chassis with enhanced growth characteristics for efficient genetic manipulation
2024-Sep, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100155
PMID:39629111
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研究论文 | 本文通过工程化改造Myxococcus xanthus菌株DK1622,获得了具有增强生长特性的Hu04菌株,以提高遗传操作效率 | 通过基因工程手段,成功改造了Myxococcus xanthus菌株,使其缺乏多细胞行为和色素,同时保持营养生长和相似的代谢背景,显著改善了分散生长特性 | NA | 提高Myxococcus xanthus菌株的遗传操作效率 | Myxococcus xanthus菌株DK1622及其工程化菌株Hu04 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
19 | 2024-11-15 |
Matching Together Living Cells and Prototissues: Will There Be Chemistry?
2024-Sep-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400378
PMID:39031571
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综述 | 本文综述了合成细胞与活细胞以及原组织与活细胞系统的当前研究进展 | 探讨了非生物与生物物质有效整合的化学、生物化学和机械化学方面,为组织工程和新技术的开发提供了新的方向 | NA | 总结当前混合合成细胞/活细胞和原组织/活细胞系统的研究现状,并探讨未来的发展方向 | 合成细胞与活细胞以及原组织与活细胞的整合 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
20 | 2024-11-07 |
Red-Shifting B12-Dependent Photoreceptor Protein via Optical Coupling for Inducible Living Materials
2024-Sep-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202411105
PMID:39239776
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光学耦合将B12依赖性光感受蛋白CarH的光响应从绿光转移到红/远红光的通用策略 | 通过硫醇-马来酰亚胺点击化学将含有半胱氨酸的CarH突变体标记为捕获红光的荧光团SulfoCyanine5 (Cy5),从而使光感受蛋白获得对红光的敏感性 | NA | 开发一种新的方法来扩展B12依赖性光感受蛋白在光遗传学和活体材料中的应用 | B12依赖性光感受蛋白CarH及其在活体材料中的应用 | 生物材料合成 | NA | 硫醇-马来酰亚胺点击化学 | NA | 蛋白质 | 涉及酵母细胞的基因工程改造 |