合成生物学相关文章
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当前共找到 114 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-06 |
Plants against cancer: towards green Taxol production through pathway discovery and metabolic engineering
2024-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-024-00170-8
PMID:39279861
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综述 | 本文综述了植物天然产物发现与工程中的挑战与进展，以抗癌药物紫杉醇生物合成途径中缺失酶的突破性发现为例 | 通过高通量测序和合成生物学方法，成功鉴定了紫杉醇生物合成途径中的关键缺失酶，为绿色生产提供了新途径 | NA | 加速药物发现并解决人类健康问题，特别是通过植物天然产物的工程化生产抗癌药物 | 植物天然产物，尤其是紫杉醇的生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 高通量测序、基因组组装、基因合成、分析技术 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 紫杉醇的生物合成途径 | 医药 |
| 2 | 2026-02-27 |
Data-Driven Design of Triple-Targeted Protein Nanoprobes for Multiplexed Imaging of Cancer Lymphatic Metastasis
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405877
PMID:38889909
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研究论文 | 本文介绍了一种通过数据驱动设计和合成生物学组装策略开发的三靶向蛋白质纳米探针，用于癌症淋巴转移的多重成像 | 利用机器学习生物信息学分析结合患者组织检查，识别出CXCR4、TfR1和VEGFR3三个靶点组合，并设计出能特异性结合所有三个靶点的铁蛋白纳米笼探针，实现了对高度异质性淋巴转移的多重成像 | NA | 开发用于癌症淋巴转移成像的靶向纳米探针 | 癌症淋巴转移的异质性靶点及成像 | 数字病理学 | 胃癌 | 机器学习生物信息学分析、合成生物学组装 | NA | 组织样本数据、成像数据 | 19个新鲜切除的人类胃癌标本及患者淋巴组织 | 合成生物学方法 | NA | 基于基因工程铁蛋白亚基自组装的纳米笼探针 | 医学 |
| 3 | 2026-02-26 |
Compliant DNA Origami Nanoactuators as Size-Selective Nanopores
2024-09, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405104
PMID:39014922
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研究论文 | 本文介绍了一种可重构的DNA折纸纳米孔，其孔径可通过分子触发器调节，实现了尺寸选择性跨膜运输 | 结合DNA折纸纳米技术、机械启发设计和合成生物学，创建了具有可调孔径和可逆构象变化的纳米孔，克服了传统生物纳米孔孔径固定的限制 | NA | 开发一种可调节孔径的纳米孔技术，以扩展其在生物物理学和生物技术中的应用 | DNA折纸纳米孔（MechanoPore）及其在脂质体膜中的重构与功能 | 合成生物学 | NA | DNA折纸纳米技术、3D-DNA-PAINT超分辨率成像、染料流入测定、倒置乳液cDICE技术、共聚焦成像 | NA | 图像数据（超分辨率和共聚焦成像） | NA | DNA折纸 | 脂质体（人工膜系统） | 可重构纳米孔（MechanoPore），具有三个稳定状态和可调孔径的机械开关 | 药物递送, 生物分子分选, 传感, 合成生物学 |
| 4 | 2026-02-21 |
Universal CRISPR-Cas12a and Toehold RNA Cascade Reaction on Paper Substrate for Visual Salmonella Genome Detection
2024-09, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202400508
PMID:38683016
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研究论文 | 本文提出了一种基于纸基底的通用CRISPR-Cas12a和Toehold RNA级联反应方法，用于可视化检测沙门氏菌基因组 | 利用单一Toehold RNA开关设计区分不同沙门氏菌血清型，无需重新设计开关，实现了高灵敏度的可视化检测 | NA | 开发一种快速、准确的现场沙门氏菌基因组检测和血清分型方法 | 沙门氏菌（S. Typhimurium和S. Enteritidis）的基因组 | 合成生物学 | 食源性疾病 | CRISPR-Cas12a, 重组酶聚合酶扩增（RPA）, Toehold RNA开关 | NA | 基因组数据 | 模型沙门氏菌病原体、污染牛奶和生菜样本 | CRISPR-Cas12a | 无细胞系统 | Toehold RNA开关级联反应 | 医学, 食品 |
| 5 | 2026-01-17 |
Killer yeasts: expanding frontiers in the age of synthetic biology
2024-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.003
PMID:38575438
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综述 | 本文探讨了合成生物学技术如何推动酵母杀手系统在抗真菌耐药性和粮食安全等领域的应用潜力 | 提出利用合成生物学技术改造酵母杀手毒素及其来源的dsRNA真菌病毒，以开发新型抗真菌工具和生物技术平台 | NA | 探讨合成生物学技术对酵母杀手系统生物技术应用的推动作用 | 酵母杀手毒素及其来源的双链RNA真菌病毒 | 合成生物学 | 真菌感染 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医药, 农业, 食品 |
| 6 | 2026-01-17 |
Measuring the economic efficiency of laboratory automation in biotechnology
2024-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.02.001
PMID:38402137
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研究论文 | 本文提出实验价格指数（EPI）来量化比较时间、成本和样本数量等因素，以衡量实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的效率 | 引入实验价格指数（EPI）作为量化工具，首次系统评估实验室自动化在合成生物学中的经济影响 | 未提供具体实验数据或案例研究来验证EPI的实用性，且可能未考虑所有影响经济效率的因素 | 评估实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的经济效率 | 实验室自动化过程，包括时间、成本和样本数量等经济因素 | NA | NA | 实验室自动化与机器人辅助过程 | NA | 经济数据（时间、成本、样本数量） | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-01-17 |
Transforming drug development with synthetic biology and AI
2024-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.008
PMID:38383215
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综述 | 本文探讨了合成生物学和人工智能如何共同变革药物开发过程 | 结合合成生物学和AI技术，以应对药物候选物识别中的挑战，特别是在RNA平台药物开发领域 | NA | 利用合成生物学和AI技术革新药物开发流程 | 药物候选物识别，特别是基于RNA平台的药物开发 | 机器学习 | NA | NA | AI模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 8 | 2025-10-05 |
Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology
2024-Sep-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.3c00938
PMID:39207844
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综述 | 本文综述了遗传密码扩展技术在合成生物学中实现非经典氨基酸定点掺入的方法进展与主要应用 | 系统整合了非经典氨基酸定点掺入技术的双向促进作用：既为合成生物学提供超越自然限制的工具，又受益于合成生物学发展的创新策略 | NA | 探讨遗传密码扩展技术在合成生物学中的应用与发展前景 | 非经典氨基酸的细胞定点掺入技术 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | NA | NA | NA | 半自主和自主生物体 | 调控元件设计、肽类天然产物生物合成途径操纵 | 工业生物技术 |
| 9 | 2025-10-05 |
Transforming vaccinology
2024-Sep-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.021
PMID:39303685
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综述 | 本文回顾疫苗学发展历程并展望未来技术变革，重点介绍mRNA疫苗等突破性技术对疫苗领域的革新作用 | 系统梳理疫苗学关键技术演进，强调反向疫苗学、合成生物学和mRNA平台等革命性技术如何将失败转化为成功疫苗 | 未涉及具体实验数据或临床研究，主要基于历史视角和技术展望 | 探讨疫苗学技术发展历程及未来变革方向 | 疫苗技术发展历程及免疫机制研究 | 疫苗学 | 传染病（脑膜炎B型、呼吸道合胞病毒等） | 反向疫苗学、合成生物学、结构设计、mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 10 | 2025-10-05 |
Application and research progress of MultiBac: A review
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039333
PMID:39252306
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综述 | 本文回顾了MultiBac技术的发展历程、特点及其在生物技术和制药领域的应用 | 引入相对较新的MultiBac技术，整合合成生物学方法增强多功能性 | 存在某些缺陷，研究人员需根据具体需求考虑其局限性 | 为基础研究人员提供新的蛋白表达方法 | MultiBac技术及其在重组蛋白生产和复杂蛋白复合物研究中的应用 | 生物技术 | NA | MultiBac技术 | NA | NA | NA | MultiBac | 昆虫细胞 | NA | 制药, 生物技术 |
| 11 | 2025-10-05 |
Exploiting protein domain modularity to enable synthetic control of engineered cells
2024-Sep, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100550
PMID:39430298
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综述 | 本文综述了如何利用蛋白质结构域模块化实现工程化细胞的合成控制 | 利用蛋白质结构域融合和分裂的自然进化趋势，设计多功能合成构建体和可控分裂元件 | NA | 通过合成生物学方法增强细胞治疗的功能和安全性 | 蛋白质结构域模块化 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 工程化细胞 | 多功能合成构建体、可控分裂元件 | 医学 |
| 12 | 2025-10-05 |
Engineering Microbial Consortia as Living Materials: Advances and Prospectives
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00313
PMID:39174016
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综述 | 本文综述了基于微生物群体的工程活材料的研究进展与前景 | 系统提出构建微生物群体ELMs的两种策略：自上而下模拟自然生态系统和自下而上理性设计合成群体 | 基于微生物群体的工程活材料仍处于发展阶段 | 探讨工程活材料领域中微生物群体的设计与应用 | 微生物群体和工程活材料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 合成群体、生态系统重建 | 材料, 工业生物技术 |
| 13 | 2025-10-05 |
Optimized CRISPR Interference System for Investigating Pseudomonas alloputida Genes Involved in Rhizosphere Microbiome Assembly
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00312
PMID:39163848
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研究论文 | 开发了一种用于恶臭假单胞菌KT2440的CRISPR干扰系统，用于研究根际微生物组组装中的基因功能 | 设计了包含三种不同启动子系统和假单胞菌密码子优化的dCas9的CRISPRi系统，首次在根际定殖细菌中实现功能验证 | 未提及具体的技术限制 | 开发用于研究根际微生物相互作用的基因调控工具 | 恶臭假单胞菌KT2440及其在根际环境中的基因功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰(CRISPRi) | NA | 基因表达数据、微生物计数数据 | NA | CRISPR-Cas9, mini-Tn7转座子, pSEVA载体 | Pseudomonas alloputida KT2440 | 基因 repression 系统，包含XylS/Pm、LacI/PTac和AraC/PBAD三种启动子系统 | 环境, 工业生物技术 |
| 14 | 2025-10-05 |
Mutagenesis techniques for evolutionary engineering of microbes - exploiting CRISPR-Cas, oligonucleotides, recombinases, and polymerases
2024-09, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.02.006
PMID:38493013
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综述 | 本文总结了微生物进化工程领域的最新进展，重点介绍了利用CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶和聚合酶等技术增强微生物遗传多样性的方法 | 系统比较了多种现代诱变技术，特别强调通过合成生物学和CRISPR-Cas技术实现突变类型和位置的可控性 | 主要聚焦于模式微生物，未全面涵盖非模式工业微生物的应用 | 开发高效微生物进化工程技术以优化工业微生物性能 | 工业微生物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 寡核苷酸介导诱变, 重组酶技术, 聚合酶工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 模式微生物 | 代谢途径优化 | 工业生物技术 |
| 15 | 2025-10-05 |
Accurately predicting enzyme functions through geometric graph learning on ESMFold-predicted structures
2024-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52533-w
PMID:39294165
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研究论文 | 提出基于几何图学习的酶功能预测模型GraphEC，通过ESMFold预测结构和预训练蛋白质语言模型准确预测EC编号、活性位点和最适pH | 首次将几何图学习应用于酶功能预测，结合ESMFold预测结构和活性位点信息，并通过标签扩散算法整合同源信息提升预测性能 | 依赖ESMFold预测的蛋白质结构准确性，未明确说明模型在哪些特定酶类别上表现较差 | 开发更准确的酶功能预测方法，特别关注酶活性位点和结构特征的重要性 | 酶蛋白质及其功能特征（EC编号、活性位点、最适pH） | 生物信息学 | NA | 几何图学习、ESMFold结构预测、蛋白质语言模型、标签扩散算法 | 图神经网络 | 蛋白质序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基因组学 |
| 16 | 2025-10-05 |
Tunable cell differentiation via reprogrammed mating-type switching
2024-09-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52282-w
PMID:39289346
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研究论文 | 本研究通过重编程酵母交配型转换机制实现可调控的细胞分化，促进合成微生物群落形成与协作 | 将天然酵母交配型转换机制改造为可诱导单倍体群体不对称性分化的遗传逻辑门 | NA | 开发可调控细胞分化的合成生物学方法以促进微生物群落协作 | 酿酒酵母单倍体群体 | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程 | NA | NA | NA | 遗传电路设计 | 酿酒酵母 | 基于交配型转换机制的可调谐分化逻辑门 | 工业生物技术 |
| 17 | 2025-10-05 |
Effects of growth feedback on adaptive gene circuits: A dynamical understanding
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543915
PMID:37333159
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研究论文 | 本研究系统分析了生长反馈对适应性基因电路的影响，揭示了电路失效的动力学机制 | 发现了生长反馈下电路失效的三种动力学机制，并识别出对生长反馈具有鲁棒性的电路拓扑结构 | 研究主要基于计算模拟，需要实验验证 | 理解生长反馈对合成基因电路的影响机制，识别鲁棒性电路拓扑 | 转录调控适应性基因电路 | 合成生物学 | NA | 计算模拟，系统拓扑分析 | 动力学模型 | 模拟数据 | 400多种电路拓扑结构 | NA | NA | 适应性基因电路，转录调控网络 | 工业生物技术 |
| 18 | 2025-10-05 |
A Synthetic Biology Approach to Transgene Expression in Insects
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00250
PMID:39198266
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研究论文 | 开发了一种系统方法来表征转基因翻译起始序列和3'非翻译区的修饰，创建了用于蚊子和昆虫基因表达调控的工具箱 | 通过系统表征TIS和3'UTR修饰，实现了跨细胞系和5'调控序列的高度可预测基因表达变化 | 主要针对蚊子和非模式昆虫物种，在其他昆虫中的应用潜力尚未完全验证 | 开发合成生物学方法调控昆虫中转基因表达水平 | 蚊子和非模式昆虫物种 | 合成生物学 | NA | 转基因技术，基因表达调控 | NA | 基因表达数据 | 多种细胞系 | 转基因方法 | 蚊子，昆虫 | 基因表达调控工具箱，包含翻译起始序列和3'非翻译区修饰 | 农业，环境 |
| 19 | 2025-10-05 |
Computational Synthetic Biology Enabled through JAX: A Showcase
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00307
PMID:39230510
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研究论文 | 本文展示了JAX计算框架在计算合成生物学中的应用价值 | 首次系统展示JAX在计算合成生物学中的多功能应用，包括灵活的GPU扩展、快速运行时间和自动微分等数学增强功能 | JAX在计算生物学领域仍处于探索不足的状态，应用案例有限 | 促进数学建模在合成生物学中的更广泛应用，展示现代计算框架的潜力 | 合成生物学和定向进化中的计算建模问题 | 计算生物学 | NA | 数学建模，GPU加速计算，自动微分 | 机制模型，随机模型，数据驱动模型，AI模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | 基因网络优化，细胞内动力学模拟 | 工业生物技术 |
| 20 | 2025-10-05 |
SeqImprove: Machine-Learning-Assisted Curation of Genetic Circuit Sequence Information
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00392
PMID:39230953
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研究论文 | 开发了一种名为SeqImprove的机器学习辅助工具，用于改进遗传电路序列信息的整理过程 | 结合命名实体识别、实体规范化和序列匹配技术，创建了作者可审查编辑的机器可访问序列数据和元数据注释系统 | NA | 解决合成生物学中文献研究和复制记录不完整工作时面临的困难 | 遗传电路序列信息 | 机器学习 | NA | 命名实体识别, 实体规范化, 序列匹配 | NA | 序列数据, 元数据 | NA | NA | NA | 遗传电路 | 工业生物技术 |