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当前共找到 114 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology
2024-Sep-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.3c00938
PMID:39207844
|
综述 | 本文综述了遗传密码扩展技术在合成生物学中实现非经典氨基酸定点掺入的方法进展与主要应用 | 系统整合了非经典氨基酸定点掺入技术的双向促进作用：既为合成生物学提供超越自然限制的工具，又受益于合成生物学发展的创新策略 | NA | 探讨遗传密码扩展技术在合成生物学中的应用与发展前景 | 非经典氨基酸的细胞定点掺入技术 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | NA | NA | NA | 半自主和自主生物体 | 调控元件设计、肽类天然产物生物合成途径操纵 | 工业生物技术 |
| 2 | 2025-10-05 |
Transforming vaccinology
2024-Sep-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.021
PMID:39303685
|
综述 | 本文回顾疫苗学发展历程并展望未来技术变革，重点介绍mRNA疫苗等突破性技术对疫苗领域的革新作用 | 系统梳理疫苗学关键技术演进，强调反向疫苗学、合成生物学和mRNA平台等革命性技术如何将失败转化为成功疫苗 | 未涉及具体实验数据或临床研究，主要基于历史视角和技术展望 | 探讨疫苗学技术发展历程及未来变革方向 | 疫苗技术发展历程及免疫机制研究 | 疫苗学 | 传染病（脑膜炎B型、呼吸道合胞病毒等） | 反向疫苗学、合成生物学、结构设计、mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2025-10-05 |
Application and research progress of MultiBac: A review
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039333
PMID:39252306
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综述 | 本文回顾了MultiBac技术的发展历程、特点及其在生物技术和制药领域的应用 | 引入相对较新的MultiBac技术，整合合成生物学方法增强多功能性 | 存在某些缺陷，研究人员需根据具体需求考虑其局限性 | 为基础研究人员提供新的蛋白表达方法 | MultiBac技术及其在重组蛋白生产和复杂蛋白复合物研究中的应用 | 生物技术 | NA | MultiBac技术 | NA | NA | NA | MultiBac | 昆虫细胞 | NA | 制药, 生物技术 |
| 4 | 2025-10-05 |
Exploiting protein domain modularity to enable synthetic control of engineered cells
2024-Sep, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100550
PMID:39430298
|
综述 | 本文综述了如何利用蛋白质结构域模块化实现工程化细胞的合成控制 | 利用蛋白质结构域融合和分裂的自然进化趋势，设计多功能合成构建体和可控分裂元件 | NA | 通过合成生物学方法增强细胞治疗的功能和安全性 | 蛋白质结构域模块化 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 工程化细胞 | 多功能合成构建体、可控分裂元件 | 医学 |
| 5 | 2025-10-05 |
Engineering Microbial Consortia as Living Materials: Advances and Prospectives
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00313
PMID:39174016
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综述 | 本文综述了基于微生物群体的工程活材料的研究进展与前景 | 系统提出构建微生物群体ELMs的两种策略：自上而下模拟自然生态系统和自下而上理性设计合成群体 | 基于微生物群体的工程活材料仍处于发展阶段 | 探讨工程活材料领域中微生物群体的设计与应用 | 微生物群体和工程活材料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 合成群体、生态系统重建 | 材料, 工业生物技术 |
| 6 | 2025-10-05 |
Optimized CRISPR Interference System for Investigating Pseudomonas alloputida Genes Involved in Rhizosphere Microbiome Assembly
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00312
PMID:39163848
|
研究论文 | 开发了一种用于恶臭假单胞菌KT2440的CRISPR干扰系统，用于研究根际微生物组组装中的基因功能 | 设计了包含三种不同启动子系统和假单胞菌密码子优化的dCas9的CRISPRi系统，首次在根际定殖细菌中实现功能验证 | 未提及具体的技术限制 | 开发用于研究根际微生物相互作用的基因调控工具 | 恶臭假单胞菌KT2440及其在根际环境中的基因功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰(CRISPRi) | NA | 基因表达数据、微生物计数数据 | NA | CRISPR-Cas9, mini-Tn7转座子, pSEVA载体 | Pseudomonas alloputida KT2440 | 基因 repression 系统，包含XylS/Pm、LacI/PTac和AraC/PBAD三种启动子系统 | 环境, 工业生物技术 |
| 7 | 2025-10-05 |
Mutagenesis techniques for evolutionary engineering of microbes - exploiting CRISPR-Cas, oligonucleotides, recombinases, and polymerases
2024-09, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.02.006
PMID:38493013
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综述 | 本文总结了微生物进化工程领域的最新进展，重点介绍了利用CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶和聚合酶等技术增强微生物遗传多样性的方法 | 系统比较了多种现代诱变技术，特别强调通过合成生物学和CRISPR-Cas技术实现突变类型和位置的可控性 | 主要聚焦于模式微生物，未全面涵盖非模式工业微生物的应用 | 开发高效微生物进化工程技术以优化工业微生物性能 | 工业微生物及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 寡核苷酸介导诱变, 重组酶技术, 聚合酶工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 模式微生物 | 代谢途径优化 | 工业生物技术 |
| 8 | 2025-10-05 |
Accurately predicting enzyme functions through geometric graph learning on ESMFold-predicted structures
2024-09-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52533-w
PMID:39294165
|
研究论文 | 提出基于几何图学习的酶功能预测模型GraphEC，通过ESMFold预测结构和预训练蛋白质语言模型准确预测EC编号、活性位点和最适pH | 首次将几何图学习应用于酶功能预测，结合ESMFold预测结构和活性位点信息，并通过标签扩散算法整合同源信息提升预测性能 | 依赖ESMFold预测的蛋白质结构准确性，未明确说明模型在哪些特定酶类别上表现较差 | 开发更准确的酶功能预测方法，特别关注酶活性位点和结构特征的重要性 | 酶蛋白质及其功能特征（EC编号、活性位点、最适pH） | 生物信息学 | NA | 几何图学习、ESMFold结构预测、蛋白质语言模型、标签扩散算法 | 图神经网络 | 蛋白质序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基因组学 |
| 9 | 2025-10-05 |
Tunable cell differentiation via reprogrammed mating-type switching
2024-09-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52282-w
PMID:39289346
|
研究论文 | 本研究通过重编程酵母交配型转换机制实现可调控的细胞分化，促进合成微生物群落形成与协作 | 将天然酵母交配型转换机制改造为可诱导单倍体群体不对称性分化的遗传逻辑门 | NA | 开发可调控细胞分化的合成生物学方法以促进微生物群落协作 | 酿酒酵母单倍体群体 | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程 | NA | NA | NA | 遗传电路设计 | 酿酒酵母 | 基于交配型转换机制的可调谐分化逻辑门 | 工业生物技术 |
| 10 | 2025-10-05 |
Effects of growth feedback on adaptive gene circuits: A dynamical understanding
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543915
PMID:37333159
|
研究论文 | 本研究系统分析了生长反馈对适应性基因电路的影响，揭示了电路失效的动力学机制 | 发现了生长反馈下电路失效的三种动力学机制，并识别出对生长反馈具有鲁棒性的电路拓扑结构 | 研究主要基于计算模拟，需要实验验证 | 理解生长反馈对合成基因电路的影响机制，识别鲁棒性电路拓扑 | 转录调控适应性基因电路 | 合成生物学 | NA | 计算模拟，系统拓扑分析 | 动力学模型 | 模拟数据 | 400多种电路拓扑结构 | NA | NA | 适应性基因电路，转录调控网络 | 工业生物技术 |
| 11 | 2025-10-05 |
A Synthetic Biology Approach to Transgene Expression in Insects
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00250
PMID:39198266
|
研究论文 | 开发了一种系统方法来表征转基因翻译起始序列和3'非翻译区的修饰，创建了用于蚊子和昆虫基因表达调控的工具箱 | 通过系统表征TIS和3'UTR修饰，实现了跨细胞系和5'调控序列的高度可预测基因表达变化 | 主要针对蚊子和非模式昆虫物种，在其他昆虫中的应用潜力尚未完全验证 | 开发合成生物学方法调控昆虫中转基因表达水平 | 蚊子和非模式昆虫物种 | 合成生物学 | NA | 转基因技术，基因表达调控 | NA | 基因表达数据 | 多种细胞系 | 转基因方法 | 蚊子，昆虫 | 基因表达调控工具箱，包含翻译起始序列和3'非翻译区修饰 | 农业，环境 |
| 12 | 2025-10-05 |
Computational Synthetic Biology Enabled through JAX: A Showcase
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00307
PMID:39230510
|
研究论文 | 本文展示了JAX计算框架在计算合成生物学中的应用价值 | 首次系统展示JAX在计算合成生物学中的多功能应用，包括灵活的GPU扩展、快速运行时间和自动微分等数学增强功能 | JAX在计算生物学领域仍处于探索不足的状态，应用案例有限 | 促进数学建模在合成生物学中的更广泛应用，展示现代计算框架的潜力 | 合成生物学和定向进化中的计算建模问题 | 计算生物学 | NA | 数学建模，GPU加速计算，自动微分 | 机制模型，随机模型，数据驱动模型，AI模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | 基因网络优化，细胞内动力学模拟 | 工业生物技术 |
| 13 | 2025-10-05 |
SeqImprove: Machine-Learning-Assisted Curation of Genetic Circuit Sequence Information
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00392
PMID:39230953
|
研究论文 | 开发了一种名为SeqImprove的机器学习辅助工具，用于改进遗传电路序列信息的整理过程 | 结合命名实体识别、实体规范化和序列匹配技术，创建了作者可审查编辑的机器可访问序列数据和元数据注释系统 | NA | 解决合成生物学中文献研究和复制记录不完整工作时面临的困难 | 遗传电路序列信息 | 机器学习 | NA | 命名实体识别, 实体规范化, 序列匹配 | NA | 序列数据, 元数据 | NA | NA | NA | 遗传电路 | 工业生物技术 |
| 14 | 2025-10-05 |
Orthogonal Serine Integrases Enable Scalable Gene Storage Cascades in Bacterial Genome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00505
PMID:39238421
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研究论文 | 开发基于正交丝氨酸整合酶的迭代基因组整合方法，实现细菌染色体中多基因的稳定存储 | 首次利用正交丝氨酸整合酶系统实现可扩展的基因存储级联，支持长达13 kb DNA片段的标记自由高效整合 | 未明确说明整合效率的具体量化数据和系统在不同宿主中的普适性验证 | 开发可扩展的基因组整合工具用于合成生物学应用 | 大肠杆菌MG1655菌株 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的基因组整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 工程化整合载体 | 大肠杆菌 | 基因存储级联系统，多基因表达通路 | 工业生物技术, 医学 |
| 15 | 2025-10-05 |
A Simple and Effective Strategy for the Development of Robust Promoter-Centric Gene Expression Tools
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00092
PMID:39120429
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过改造启动子区域来创建稳健基因表达工具的简单有效策略 | 通过在原始启动子-35区域上游引入额外的-35样基序，并在5'-UTR区域整合回文元件，显著增强了启动子活性 | NA | 开发稳健的启动子中心基因表达工具 | 链霉菌及其基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 启动子工程 | NA | NA | NA | 启动子改造 | 链霉菌 | 组成型和诱导型基因表达系统，包括木四环素诱导型基因表达系统 | 工业生物技术 |
| 16 | 2025-10-05 |
Desiccated Cyanobacteria Serve As Efficient Plasmid DNA Carriers in Space Flight
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00672
PMID:39150229
|
研究论文 | 本研究探索利用干燥蓝藻作为质粒DNA载体在太空飞行中的有效运输方法 | 首次利用天然耐干燥的蓝藻作为质粒DNA载体，实现无需低温储存的太空往返运输 | 仅为概念验证研究，样本规模有限，需要进一步验证不同质粒和环境的适用性 | 开发适用于太空环境的生物部件运输方法，支持太空合成生物学和生物制造 | 蓝藻菌株PC73102和pSCR119质粒 | 合成生物学 | NA | 质粒提取、细菌转化 | NA | 分子生物学数据 | 概念验证规模，具体样本数量未明确说明 | NA | 蓝藻PC73102, 大肠杆菌 | 质粒载体系统，包含卡那霉素抗性基因 | 太空生物技术 |
| 17 | 2025-10-05 |
Genetic Code Expansion in Shewanella oneidensis MR-1 Allows Site-Specific Incorporation of Bioorthogonal Functional Groups into a c-Type Cytochrome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00248
PMID:39158169
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研究论文 | 本研究开发了在希瓦氏菌MR-1中实现位点特异性非经典氨基酸掺入的高效方法 | 首次在电活性细菌MR-1中建立遗传密码扩展系统，实现c型细胞色素MtrC的位点特异性修饰 | NA | 扩展电活性细菌中蛋白质的化学功能多样性 | 希瓦氏菌MR-1及其c型细胞色素MtrC | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 蛋白质结构数据、电化学数据 | NA | 遗传密码扩展 | Shewanella oneidensis MR-1 | 非经典氨基酸掺入系统 | 工业生物技术 |
| 18 | 2025-10-05 |
GOLDBAR: A Framework for Combinatorial Biological Design
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00296
PMID:39162314
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研究论文 | 提出名为GOLDBAR的组合生物设计框架，用于支持合成生物学中的自动化分析和机器学习 | 能够对生物设计类别进行交集和合并操作，提取共同设计模式并推断新设计，相比现有框架支持形式化设计比较 | NA | 开发支持合成生物学中组合设计形式化比较的框架 | 组合生物设计库和设计规则 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | 基于文法的机器学习 | 生物设计数据 | NA | NA | NA | TetR同源转录逻辑电路、基因簇 | 工业生物技术 |
| 19 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology of Natural Products Engineering: Recent Advances Across the Discover-Design-Build-Test-Learn Cycle
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00391
PMID:39163395
|
综述 | 本文系统总结了合成生物学在天然产物工程领域的最新进展，涵盖从发现到学习的完整生物工程周期 | 整合了AI辅助基因组挖掘、酶与途径工程、新型宿主系统等最新技术进展，并强调在工艺开发早期进行预期分析的重要性 | NA | 总结天然产物工程领域合成生物学技术的最新发展 | 天然产物生物合成工程 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、AI辅助基因组挖掘、酶工程、途径工程 | NA | NA | NA | NA | 新型宿主系统 | 生物合成途径工程 | 医药, 工业生物技术 |
| 20 | 2025-10-05 |
MutaT7GDE: A Single Chimera for the Targeted, Balanced, Efficient, and Processive Installation of All Possible Transition Mutations In Vivo
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00316
PMID:39190860
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研究论文 | 开发了一种名为MutaT7GDE的新型嵌合酶，能够在体内高效安装所有可能的转换突变 | 首次利用底物混杂性通用脱氨酶构建单一嵌合酶，可同时靶向脱氧腺苷和脱氧胞苷进行突变 | NA | 开发更高效的定向进化工具，实现目标基因的多样化 | MutaT7嵌合酶系统 | 合成生物学 | NA | 脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合技术 | NA | 突变分析数据 | 四种不同的MutaT7构建体 | 蛋白质工程 | NA | 脱氨酶-T7 RNA聚合酶嵌合系统 | 工业生物技术 |