合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2024-10-10	Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene by modulating antisense RNA production 2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2405510121 PMID:39190361	研究论文	研究展示了同义密码子替换如何通过调节反义RNA的产生来影响上游基因的转录和翻译	首次揭示了同义密码子替换对邻近基因表达的显著影响，并发现反义RNA的转录可以绕过原生的转录抑制机制	研究主要集中在质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因上，可能需要进一步验证在其他基因和生物体中的适用性	探讨同义密码子替换对基因表达和蛋白质稳态机制的影响	质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因及其上游的四环素抗性基因	基因表达调控	NA	NA	NA	基因序列	九种同义重编码的基因序列
22	2024-10-09	Geometric deep learning of protein-DNA binding specificity 2024-Sep, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-024-02372-w PMID:39103447	研究论文	本文介绍了一种名为DeepPBS的几何深度学习模型，用于预测蛋白质-DNA结合特异性	提出了DeepPBS模型，能够从蛋白质-DNA结构中预测结合特异性，并提取可解释的蛋白质重原子重要性分数	NA	旨在通过几何深度学习模型预测蛋白质-DNA结合特异性，以理解基因调控	蛋白质-DNA结合特异性	机器学习	NA	几何深度学习	几何深度学习模型	蛋白质-DNA结构	NA
23	2024-10-09	Biosecurity Assessments for Emerging Transdisciplinary Biotechnologies: Revisiting Biodefense in an Age of Synthetic Biology 2024-Sep, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association IF:0.5Q4 DOI:10.1089/apb.2024.0005 PMID:39372508	研究论文	本文探讨了新兴跨学科生物技术在合成生物学时代的生物防御评估框架	提出了合成生物学评估框架，用于评估使用先进方法和技术增强或创造新型病原体和毒素的风险	该框架可能不足以评估对传统生物制剂不可用的技术，这些技术可能引发经济或更广泛的国家安全问题	研究新兴跨学科生物技术的生物安全框架，以减轻国家和非国家行为者对生物技术的恶意利用	跨学科生物技术研究和开发的风险评估与缓解	NA	NA	NA	NA	NA	NA
24	2024-10-05	Engineering Material Properties of Transcription Factor Condensates to Control Gene Expression in Mammalian Cells and Mice 2024-Sep, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202311834 PMID:38573961	研究论文	本文研究了转录因子凝聚物的材料特性对基因表达调控的影响	首次系统地调整了光遗传学诱导的转录因子凝聚物的材料特性，并探讨了其对目标启动子激活的影响	NA	探讨生物分子凝聚物的材料特性对基因表达调控的影响	转录因子凝聚物的材料特性及其对基因表达的影响	合成生物学	NA	光遗传学	NA	NA	哺乳动物细胞和小鼠
25	2024-10-04	Probing the orthogonality and robustness of the mammalian RNA-binding protein Musashi-1 in Escherichia coli 2024-Sep-30, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13036-024-00448-x PMID:39350178	研究论文	研究探讨了哺乳动物RNA结合蛋白Musashi-1在Escherichia coli中的正交性和鲁棒性	首次将哺乳动物Musashi蛋白作为翻译调控因子在Escherichia coli中进行功能研究，并揭示了其在转录后调控中的作用	研究中发现合成电路在约40代后失去功能，表明其稳定性有限	探索RNA识别基序（RRMs）在原核生物中的功能及其在生物技术和医学应用中的潜力	Musashi-1蛋白及其在Escherichia coli中的表达对转录组和翻译组的影响	生物技术	NA	高通量RNA测序	NA	RNA序列	约40代Escherichia coli
26	2024-10-04	Data-Driven Design of Triple-Targeted Protein Nanoprobes for Multiplexed Imaging of Cancer Lymphatic Metastasis 2024-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202405877 PMID:38889909	研究论文	本文介绍了一种基于数据驱动设计和合成生物学组装策略的三靶向蛋白质纳米探针，用于癌症淋巴转移的多重成像	本文创新性地设计了能够特异性结合三种靶点的蛋白质纳米探针，并通过数据驱动的方法和合成生物学策略实现了对癌症淋巴转移的多重成像	本文的研究主要集中在胃癌患者的淋巴结组织，未来需要进一步验证其在其他癌症类型中的适用性	开发一种有效的纳米探针，用于成像高度异质性的癌症淋巴转移	癌症淋巴转移的多重成像	生物医学工程	胃癌	合成生物学	NA	组织样本	19例新鲜切除的人类胃癌样本
27	2024-10-02	Engineering quorum sensing-based genetic circuits enhances growth and productivity robustness of industrial E. coli at low pH 2024-Sep-28, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-024-02524-9 PMID:39342182	研究论文	研究通过工程化群体感应基因电路，增强工业E. coli在低pH条件下的生长和生产力稳定性	利用Esa型群体感应电路动态调控酸抗性模块（DsrA-Hfq）的表达，实现按需和适量调控	NA	增强E. coli在工业发酵中低pH条件下的稳定性和生产力	工业E. coli菌株在低pH条件下的生长和生产力	合成生物学	NA	群体感应电路	NA	NA	工业E. coli菌株SCEcL3及其亲本菌株
28	2024-10-02	Immunometabolic Circuits in Infection for Advancing Host Directed Therapies 2024-Sep-13, Journal of visualized experiments : JoVE DOI:10.3791/66980 PMID:39345111	研究论文	本文探讨了利用合成生物学方法开发基于四环素调控的合成电路，以递送琥珀酸脱氢酶作为治疗剂，消除细胞内利什曼原虫的研究	首次提出利用合成生物学方法开发基于四环素调控的合成电路，递送琥珀酸脱氢酶作为治疗剂，消除细胞内利什曼原虫	研究仅在鼠巨噬细胞系中进行，尚未在临床试验中验证	开发基于合成生物学的新疗法，靶向宿主相关因子，治疗利什曼病	利什曼原虫感染的鼠巨噬细胞	合成生物学	利什曼病	合成生物学	NA	细胞	鼠巨噬细胞系
29	2024-10-01	Enzymatic Characterization of SpPAL Genes in S. polyrhiza and Overexpression of the SpPAL3 2024-Sep-18, Plants (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/plants13182607 PMID:39339582	研究论文	研究了巨型浮萍中的PAL基因，并探讨了SpPAL3基因的过表达对植物生长的影响	首次在巨型浮萍中鉴定并克隆了三个PAL基因，并研究了其在植物生长和次生代谢中的作用	NA	研究巨型浮萍中PAL基因的功能及其在植物生长和次生代谢中的作用	巨型浮萍中的PAL基因及其编码蛋白	NA	NA	qRT-PCR	NA	基因表达数据	NA
30	2024-10-01	Production of Terpene Trilactones from Cell and Organ Cultures of Ginkgo biloba 2024-Sep-13, Plants (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/plants13182575 PMID:39339550	综述	本文综述了利用银杏细胞和器官培养生产萜三萜内酯的研究策略	介绍了通过代谢工程和合成生物学方法进行异源生产萜三萜内酯的创新	银杏生长缓慢，成熟期长，且萜三萜内酯的积累受年龄、性别、季节和地理因素影响	探讨利用细胞培养技术高效生产银杏中的萜三萜内酯	银杏细胞和器官培养中的萜三萜内酯生产	NA	NA	代谢工程和合成生物学	NA	NA	NA
31	2024-09-30	Editorial overview: Plant synthetic biology 2024-Sep-27, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.copbio.2024.103211 PMID:39340896	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
32	2024-09-30	Sustainable production of porphyrins through synthetic biology 2024-Sep-27, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.009 PMID:39341742	评论	本文讨论了通过合成生物学实现卟啉化合物可持续生产的研究进展	介绍了不同物种中卟啉生物合成的最新突破	NA	促进卟啉化合物的可持续生产	卟啉化合物的生物合成	合成生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
33	2024-09-30	Spectral Algal Fingerprinting and Long Sequencing in Synthetic Algal-Microbial Communities 2024-Sep-14, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells13181552 PMID:39329735	研究论文	本研究利用全谱流式细胞术分析合成藻类-微生物群落，实现了快速物种鉴定和计数	采用全谱流式细胞术进行高吞吐量、多维度的单细胞分析，提供比传统流式细胞术更高的精度和灵活性	需要开发标准化的光谱库以进一步提高藻类群落的表征	研究合成藻类-微生物群落的动态及其对环境压力的响应	合成藻类-微生物群落	合成生物学	NA	全谱流式细胞术	NA	光谱数据	NA
34	2024-09-28	Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research 2024-Sep-27, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3 DOI:10.1093/bfgp/elad050 PMID:37952099	综述	本文综述了Papaveraceae科植物在基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学方面的最新进展，并探讨了其在制药和农业生物技术领域的潜在应用	结合基因组学与其他组学研究，揭示了草药的遗传基础、关键基因功能和次生代谢途径	NA	探讨基因组学技术在草药研究中的应用，特别是Papaveraceae科植物的基因信息与其药用活性之间的关系	Papaveraceae科植物，包括Papaver somniferum和Chelidonium majus等具有药用特性的物种	基因组学	NA	高通量技术、测序工具、CRISPR/Cas9、RNA干扰	NA	基因组、转录组、蛋白质组、代谢组	NA
35	2024-09-26	START: A Versatile Platform for Bacterial Ligand Sensing with Programmable Performances 2024-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202402029 PMID:39075726	研究论文	介绍了一种名为START的新型平台，用于配体响应基因调控	结合了细菌配体感应系统和合成基因调控开关，实现了多种配体的合成生物传感器	NA	开发一种多功能平台，用于细菌配体感应和基因调控	细菌配体感应系统和基因调控	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
36	2024-09-28	Compliant DNA Origami Nanoactuators as Size-Selective Nanopores 2024-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202405104 PMID:39014922	研究论文	本文介绍了一种可调节大小的DNA折纸纳米孔（MechanoPore，MP），通过分子触发器实现其腔径的可调性	利用DNA折纸纳米技术、机器设计理念和合成生物学的独特结合，开发了一种结构可重构的DNA折纸纳米孔，其腔径可通过分子触发器调节	NA	开发一种可调节大小的纳米孔，用于药物输送、生物分子分类和传感等领域	DNA折纸纳米孔（MechanoPore，MP）及其在脂质膜中的应用	合成生物学	NA	DNA折纸技术	NA	图像	NA
37	2024-09-27	[Research progress in bacterial cellulose synthase subunit diversity and fiber structure formation] 2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.230829 PMID:39319708	综述	本文综述了细菌纤维素合成酶亚基多样性及其纤维结构形成的最新研究进展	详细阐述了细菌纤维素合成机制、合成酶亚基间的相互作用以及菌株结构特征与高度有序纤维结构形成之间的关系	NA	总结细菌纤维素生产菌株及其合成酶的差异，探讨细菌纤维素合成与分泌机制	细菌纤维素合成酶及其亚基多样性，纤维结构形成	NA	NA	NA	NA	NA	NA
38	2024-09-27	[Biosafety risks, control, and biocontainment of engineered microalgae] 2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.230812 PMID:39319717	研究论文	本文总结了前沿生物技术在微藻工程中的应用，以及工程微藻逃逸带来的生物安全风险和管理法规，并介绍了针对工程微藻的新型生物遏制技术的进展	本文介绍了基于有毒蛋白的kill switch设计和敲除必需基因以构建营养缺陷型菌株等新型生物遏制技术	NA	探讨工程微藻的生物安全风险及其控制和管理技术	工程微藻及其在自然环境中的生存和扩散	生物技术	NA	合成生物学和基因编辑技术	NA	NA	NA
39	2024-09-27	Desiccated Cyanobacteria Serve As Efficient Plasmid DNA Carriers in Space Flight 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00672 PMID:39150229	研究论文	研究探讨了在太空旅行中使用脱水蓝细菌作为质粒DNA的有效载体	首次展示了脱水蓝细菌能够在无需低温或冷冻储存的情况下，安全地将质粒DNA运输到国际空间站并返回	研究仅限于特定的蓝细菌株和质粒，可能不适用于所有生物系统	探索在太空环境中使用合成生物学和生物制造的有效运输方法	脱水蓝细菌PC73102及其携带的非天然质粒pSCR119	合成生物学	NA	NA	NA	DNA	涉及一种蓝细菌株PC73102和一种质粒pSCR119
40	2024-09-27	Genetic Code Expansion in Shewanella oneidensis MR-1 Allows Site-Specific Incorporation of Bioorthogonal Functional Groups into a c-Type Cytochrome 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00248 PMID:39158169	研究论文	本文报道了在Shewanella oneidensis MR-1中开发高效方法，实现非经典氨基酸（ncAAs）在c型细胞色素中的位点特异性插入	本文展示了ncAA插入的生物合成机制与MR-1的天然蛋白质合成、成熟和分泌途径的兼容性和正交性，并成功合成了包含ncAA的c型细胞色素MtrC	NA	开发在Shewanella oneidensis MR-1中实现非经典氨基酸位点特异性插入的方法	c型细胞色素MtrC	生物技术	NA	遗传密码扩展	NA	蛋白质	Shewanella oneidensis MR-1细胞