合成生物学相关文章
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当前共找到 117 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-11-02 |
Viscosity Regulation of Chemically Simple Condensates
2024-09-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c00623
PMID:39166772
|
研究论文 | 研究了不同长度的聚精氨酸链（R）和柠檬酸（CA）衍生物形成的生物分子凝聚物的粘度和液固转变行为 | 通过调整支架分子的组成，展示了一种简单的方法来调节凝聚物的性质，揭示了分子组成在控制凝聚物粘度和转变动力学中的作用 | NA | 深入理解生物分子凝聚过程，并为未来在合成生物学和疾病治疗领域的应用提供策略 | 不同长度的聚精氨酸链和柠檬酸衍生物形成的生物分子凝聚物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-11-02 |
Peptide-Based Biomimetic Condensates via Liquid-Liquid Phase Separation as Biomedical Delivery Vehicles
2024-09-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c00814
PMID:39178343
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研究论文 | 本文综述了通过液-液相分离形成的基于肽的仿生凝聚物作为生物医学递送载体的最新进展 | 本文介绍了通过液-液相分离形成的基于肽的仿生凝聚物，这些凝聚物可以模拟生物分子凝聚物的相分离行为和生物物理特性，并具有作为生物医学递送载体的潜力 | NA | 探讨基于肽的仿生凝聚物的设计和构建，以及其在生物医学递送中的应用前景 | 基于肽的仿生凝聚物及其在生物医学递送中的应用 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-09-11 |
Application and research progress of MultiBac: A review
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039333
PMID:39252306
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综述 | 本文综述了MultiBac技术的发展过程、特点及其在生物技术和制药领域的应用 | MultiBac技术整合了合成生物学技术，提供了额外的多功能性 | MultiBac技术也存在一些缺点，研究人员在选择表达系统时应考虑其局限性 | 介绍MultiBac技术的发展和应用，为基本研究人员提供新方法 | MultiBac技术及其在重组蛋白和复杂蛋白复合物研究中的应用 | 生物技术 | NA | MultiBac | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-10-24 |
CryptKeeper: a negative design tool for reducing unintentional gene expression in bacteria
2024-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.611466
PMID:39282447
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研究论文 | 介绍了一种名为CryptKeeper的软件工具，用于减少细菌中无意基因表达 | 开发了一种新的软件工具CryptKeeper，能够可视化预测细菌基因表达信号并估计DNA序列可能的翻译负担 | NA | 开发一种工具来减少细菌中无意基因表达，从而避免实验中的遗传不稳定性和信号干扰 | 细菌中的基因表达信号和翻译负担 | 分子生物学 | NA | NA | NA | DNA序列 | 涉及多个已发表的例子，包括真核病毒感染克隆和单个蛋白质 |
| 25 | 2024-10-24 |
Characterization and Degradation of Triphenylmethane Dyes and Their Leuco-Derivatives by Heterologously Expressed Laccase From Coprinus cinerea
2024-Sep, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.4127
PMID:39420654
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法优化了来自Coprinus cinerea的漆酶基因Lcc1，并在Pichia pastoris中异源表达，评估了其对三苯甲烷染料及其无色衍生物的降解能力 | 通过合成生物学方法优化了漆酶基因Lcc1，并在Pichia pastoris中成功表达，展示了其对三苯甲烷染料的高效降解能力 | 研究主要集中在实验室条件下漆酶的表达和降解能力，未涉及实际环境中的应用效果 | 优化漆酶基因的表达，研究其对有机污染物的降解能力，为环境修复提供新方案 | Coprinus cinerea的漆酶基因Lcc1及其对三苯甲烷染料的降解 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 酶活性数据 | NA |
| 26 | 2024-10-24 |
Exploiting protein domain modularity to enable synthetic control of engineered cells
2024-Sep, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100550
PMID:39430298
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综述 | 本文综述了利用蛋白质域模块性在细胞控制应用中的进展 | 利用蛋白质域的模块性设计多功能合成结构和可控的分裂部分，以实现对细胞功能的精确控制 | NA | 探讨如何利用蛋白质域的模块性增强细胞疗法的功能和安全性 | 蛋白质域的模块性及其在细胞控制中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-10-20 |
Revolutionizing Molecular Design for Innovative Therapeutic Applications through Artificial Intelligence
2024-Sep-29, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29194626
PMID:39407556
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综述 | 本文综述了机器学习、人工智能和分子建模在计算蛋白质工程领域的最新进展及其在创新治疗应用中的革命性作用 | 本文介绍了深度学习、强化学习和迁移学习等技术在蛋白质结构预测、结合亲和力优化和酶设计方面的显著改进，以及这些创新如何简化了蛋白质工程流程 | 本文指出计算预测与实验验证之间的差距以及与AI驱动的蛋白质设计相关的伦理问题是当前面临的挑战 | 本文旨在全面概述计算方法在蛋白质工程中的当前状态和未来方向，强调其在创造下一代生物制剂和推进合成生物学方面的变革潜力 | 本文研究对象为计算蛋白质工程中的机器学习、人工智能和分子建模技术及其在生物技术和医学中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习、强化学习、迁移学习 | NA | 蛋白质结构 | NA |
| 28 | 2024-10-20 |
Discovery of megapolipeptins by genome mining of a Burkholderiales bacteria collection
2024-Sep-13, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc03594a
PMID:39309087
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研究论文 | 本文通过基因组挖掘技术，从316株根际来源的伯克霍尔德菌属细菌中发现了新型天然产物megapolipeptins | 本文采用基因组学驱动和合成生物学辅助的方法，成功激活了原本沉默的生物合成基因簇，发现了结构独特的新型天然产物megapolipeptins | NA | 发现新型天然产物 | 根际来源的伯克霍尔德菌属细菌 | NA | NA | 基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | 316株根际来源的伯克霍尔德菌属细菌 |
| 29 | 2024-10-19 |
Identification and Characterization of an R-M System in Paracoccus denitrifican DYTN-1 to Improve the Plasmid Conjugation Transfer Efficiency
2024-Sep-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02041
PMID:39155392
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研究论文 | 本文研究了Paracoccus denitrifican DYTN-1菌株中的R-M系统，并通过人工改造质粒提高其接合转移效率 | 首次鉴定并表征了DYTN-1菌株中的R-M系统，开发了质粒人工改造方法显著提高了接合转移效率 | NA | 提高DYTN-1菌株的质粒接合转移效率，增强其基因编辑能力 | Paracoccus denitrifican DYTN-1菌株及其R-M系统 | 合成生物学 | NA | 质粒人工改造 | NA | DNA | 1株菌株 |
| 30 | 2024-10-18 |
Leveraging artificial intelligence in vaccine development: A narrative review
2024-09, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2024.106998
PMID:39019262
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综述 | 本文综述了人工智能在疫苗开发中的应用，重点关注抗原选择、表位预测、佐剂识别和优化策略 | 人工智能算法利用基因组数据、蛋白质结构和免疫系统相互作用，预测抗原表位、评估免疫原性并优先选择抗原进行实验 | 数据异质性、模型可解释性和监管考虑是实现人工智能在疫苗开发中全部潜力的挑战 | 探讨人工智能在疫苗开发中的作用，加速安全有效疫苗的交付 | 抗原选择、表位预测、佐剂识别和优化策略 | 机器学习 | NA | 机器学习和深度学习 | NA | 基因组数据、蛋白质结构 | NA |
| 31 | 2024-10-15 |
Cellular Site-Specific Incorporation of Noncanonical Amino Acids in Synthetic Biology
2024-Sep-25, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.3c00938
PMID:39207844
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综述 | 本文综述了在合成生物学中通过遗传密码扩展（GCE）方法将非经典氨基酸（ncAAs）定点引入细胞的技术进展及其主要应用 | 本文探讨了通过非经典密码子添加扩展遗传密码、创建半自主和自主生物体、设计调控元件以及操纵和扩展肽天然产物生物合成途径等创新方法 | 本文未具体提及研究中的局限性 | 探讨遗传密码扩展（GCE）方法在合成生物学中定点引入非经典氨基酸（ncAAs）的技术进展及其未来发展前景 | 非经典氨基酸（ncAAs）的定点细胞引入及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展（GCE） | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-10-14 |
Transforming vaccinology
2024-Sep-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.021
PMID:39303685
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review | 本文回顾了过去两个世纪疫苗学领域的关键创新，并展望了未来疫苗技术的变革 | 本文介绍了逆转疫苗学、合成生物学和基于结构的疫苗设计等技术革命，以及mRNA疫苗和新型佐剂的发展对疫苗开发的影响 | NA | 探讨疫苗学领域的历史创新和未来技术变革 | 疫苗学领域的关键创新和技术进步 | NA | NA | 逆转疫苗学、合成生物学、基于结构的疫苗设计 | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-10-12 |
Soft Synthetic Cells with Mobile Membrane Ligands for Ex Vivo Expansion of Therapy-Relevant T Cell Phenotypes
2024-Sep, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202401844
PMID:38751204
|
研究论文 | 介绍了一种基于分散液-液相分离液滴支撑的脂质双层（dsLBs）的新型合成细胞技术，用于体外T细胞扩增 | 提出了基于dsLB技术的合成细胞，具有可调节的生化和生物物理特性，作为人工抗原呈递细胞（aAPCs）用于体外T细胞扩增 | NA | 开发一种能够模拟体内T细胞激活的体外T细胞扩增方法，以提高免疫治疗效果 | T细胞的体外扩增和其表型的调控 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | 细胞 | NA |
| 34 | 2024-10-11 |
Universal CRISPR-Cas12a and Toehold RNA Cascade Reaction on Paper Substrate for Visual Salmonella Genome Detection
2024-Sep, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202400508
PMID:38683016
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研究论文 | 本文介绍了一种在纸基底上使用CRISPR-Cas12a和重组酶聚合酶扩增（RPA）的合成生物学级联反应，用于可视化检测沙门氏菌基因组 | 该方法通过设计一个标准的toehold RNA开关，能够区分两种不同的沙门氏菌血清型，无需重新设计toehold RNA开关，具有高灵敏度和广泛适用性 | NA | 开发一种快速、准确且适用于现场检测沙门氏菌基因组的方法 | 沙门氏菌的基因组检测 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a, 重组酶聚合酶扩增 (RPA) | NA | 基因组 | 在纸基底上检测到最少100个沙门氏菌基因组拷贝，并在受污染的牛奶和生菜样本中成功应用 |
| 35 | 2024-10-11 |
A hierarchy of metabolite exchanges in metabolic models of microbial species and communities
2024-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012472
PMID:39325831
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研究论文 | 本文研究了微生物物种和群落代谢模型中的代谢物交换层次结构 | 提出了通过关注代谢子网络（如细胞间的代谢物交换和与环境的交换）来提高代谢网络分析的可扩展性 | 无偏方法由于组合爆炸问题，在大规模网络中扩展性较差 | 研究代谢网络中的代谢物交换层次结构，并探讨其在代谢工程和合成生物学领域的应用 | 微生物物种和群落的代谢模型 | 代谢工程 | NA | 代谢通量分析 | NA | 代谢网络模型 | 涉及从中心碳代谢到基因组规模的多种模型 |
| 36 | 2024-10-09 |
Geometric deep learning of protein-DNA binding specificity
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02372-w
PMID:39103447
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepPBS的几何深度学习模型，用于预测蛋白质-DNA结合特异性 | 提出了DeepPBS模型，能够从蛋白质-DNA结构中预测结合特异性，并提取可解释的蛋白质重原子重要性分数 | NA | 旨在通过几何深度学习模型预测蛋白质-DNA结合特异性，以理解基因调控 | 蛋白质-DNA结合特异性 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 蛋白质-DNA结构 | NA |
| 37 | 2024-10-04 |
Probing the orthogonality and robustness of the mammalian RNA-binding protein Musashi-1 in Escherichia coli
2024-Sep-30, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00448-x
PMID:39350178
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研究论文 | 研究探讨了哺乳动物RNA结合蛋白Musashi-1在Escherichia coli中的正交性和鲁棒性 | 首次将哺乳动物Musashi蛋白作为翻译调控因子在Escherichia coli中进行功能研究，并揭示了其在转录后调控中的作用 | 研究中发现合成电路在约40代后失去功能，表明其稳定性有限 | 探索RNA识别基序（RRMs）在原核生物中的功能及其在生物技术和医学应用中的潜力 | Musashi-1蛋白及其在Escherichia coli中的表达对转录组和翻译组的影响 | 生物技术 | NA | 高通量RNA测序 | NA | RNA序列 | 约40代Escherichia coli |
| 38 | 2024-10-04 |
Data-Driven Design of Triple-Targeted Protein Nanoprobes for Multiplexed Imaging of Cancer Lymphatic Metastasis
2024-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405877
PMID:38889909
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研究论文 | 本文介绍了一种基于数据驱动设计和合成生物学组装策略的三靶向蛋白质纳米探针，用于癌症淋巴转移的多重成像 | 本文创新性地设计了能够特异性结合三种靶点的蛋白质纳米探针，并通过数据驱动的方法和合成生物学策略实现了对癌症淋巴转移的多重成像 | 本文的研究主要集中在胃癌患者的淋巴结组织，未来需要进一步验证其在其他癌症类型中的适用性 | 开发一种有效的纳米探针，用于成像高度异质性的癌症淋巴转移 | 癌症淋巴转移的多重成像 | 生物医学工程 | 胃癌 | 合成生物学 | NA | 组织样本 | 19例新鲜切除的人类胃癌样本 |
| 39 | 2024-10-02 |
Engineering quorum sensing-based genetic circuits enhances growth and productivity robustness of industrial E. coli at low pH
2024-Sep-28, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02524-9
PMID:39342182
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研究论文 | 研究通过工程化群体感应基因电路，增强工业E. coli在低pH条件下的生长和生产力稳定性 | 利用Esa型群体感应电路动态调控酸抗性模块（DsrA-Hfq）的表达，实现按需和适量调控 | NA | 增强E. coli在工业发酵中低pH条件下的稳定性和生产力 | 工业E. coli菌株在低pH条件下的生长和生产力 | 合成生物学 | NA | 群体感应电路 | NA | NA | 工业E. coli菌株SCEcL3及其亲本菌株 |
| 40 | 2024-10-02 |
Immunometabolic Circuits in Infection for Advancing Host Directed Therapies
2024-Sep-13, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66980
PMID:39345111
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学方法开发基于四环素调控的合成电路，以递送琥珀酸脱氢酶作为治疗剂，消除细胞内利什曼原虫的研究 | 首次提出利用合成生物学方法开发基于四环素调控的合成电路，递送琥珀酸脱氢酶作为治疗剂，消除细胞内利什曼原虫 | 研究仅在鼠巨噬细胞系中进行，尚未在临床试验中验证 | 开发基于合成生物学的新疗法，靶向宿主相关因子，治疗利什曼病 | 利什曼原虫感染的鼠巨噬细胞 | 合成生物学 | 利什曼病 | 合成生物学 | NA | 细胞 | 鼠巨噬细胞系 |