合成生物学相关文章
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当前共找到 114 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Integrating Deep Learning and Synthetic Biology: A Co-Design Approach for Enhancing Gene Expression via N-Terminal Coding Sequences
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00371
PMID:39229974
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研究论文 | 提出一种深度学习与合成生物学协同设计的少样本训练工作流程，用于优化N端编码序列以增强基因表达 | 开发了结合k近邻编码、word2vec、注意力机制和时间序列网络的深度学习模型，仅需六次迭代实验即可显著提升基因表达 | 仅使用GFP作为报告蛋白验证，在其他蛋白中的应用效果需进一步验证 | 优化N端编码序列以最大化基因表达 | 绿色荧光蛋白(GFP)和N-乙酰神经氨酸合成相关基因 | 机器学习 | NA | 深度学习，基因表达优化 | 注意力机制，时间序列网络，word2vec | 基因序列数据，荧光强度数据 | 少样本训练（六次迭代实验） | NA | 大肠杆菌 | 基因表达优化系统 | 工业生物技术，医药 |
| 22 | 2025-10-05 |
Multilevel Systematic Optimization To Achieve Efficient Integrated Expression of Escherichia coli
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00280
PMID:39262282
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研究论文 | 通过多层级系统优化开发大肠杆菌高效整合表达系统 | 从整合位点筛选、启动子优化和T7 RNA聚合酶过表达三个层面系统优化，构建了无需抗生素和诱导剂的高效整合表达系统 | 研究仅针对大肠杆菌BL21(DE3)菌株，未在其他宿主中验证通用性 | 开发稳定高效的外源基因基因组整合表达系统 | 大肠杆菌BL21(DE3)基因组和外源基因表达元件 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、启动子工程、蛋白表达分析 | NA | 基因表达数据、酶活性数据 | 18个基因组整合位点、16个内源启动子 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 组成型高效整合表达系统，包含优化整合位点、Plpp-T7杂合启动子和T7 RNA聚合酶过表达模块 | 工业生物技术, 酶工程 |
| 23 | 2025-10-05 |
Evaluating the Contribution of Model Complexity in Predicting Robustness in Synthetic Genetic Circuits
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00708
PMID:39264040
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研究论文 | 比较五种计算模型对三种实现相同逻辑功能的遗传电路进行预测能力评估 | 首次系统比较不同复杂度模型在预测合成遗传电路鲁棒性方面的表现差异 | 研究基于仿真分析，需要实际实验验证；模型参数获取仍存在挑战 | 评估模型复杂度对合成遗传电路鲁棒性预测能力的影响 | 三种实现相同逻辑功能的遗传电路和五种计算模型 | 合成生物学 | NA | 计算建模、仿真分析 | 多种复杂度计算模型 | 仿真数据 | 五种模型对三种电路设计的分析 | NA | NA | 实现相同逻辑功能的遗传电路 | 工业生物技术 |
| 24 | 2025-10-05 |
Yeast Surface-Displayed Quenchbody as a Novel Whole-Cell Biosensor for One-Step Detection of Influenza A (H1N1) Virus
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00317
PMID:39256183
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研究论文 | 本研究开发了一种基于酵母表面展示淬灭体的新型全细胞生物传感器，用于一步检测甲型流感（H1N1）病毒 | 首次在酵母细胞表面展示VHH基淬灭体，创建了无需分析物跨膜运输即可检测病毒颗粒的全细胞生物传感器新设计 | 检测范围有限（H1N1-HA：0.5-16 μg/mL；H1N1病毒：2.4×10至1.5×10 PFU/mL），未在真实环境样本中进行验证 | 开发能够高效检测空气传播病毒的新型全细胞生物传感器 | 甲型流感（H1N1）病毒及其血凝素蛋白H1N1-HA | 合成生物学 | 流感 | 酵母表面展示技术、VHH抗体片段筛选、淬灭体技术 | NA | 荧光信号数据 | 17个VHH抗体片段 | 酵母表面展示系统 | 酵母 | 表面展示淬灭体生物传感器 | 医学诊断,环境监测 |
| 25 | 2025-10-05 |
Ten Years of the Synthetic Biology Summer Course at Cold Spring Harbor Laboratory
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00276
PMID:39300908
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综述 | 本文回顾了冷泉港实验室合成生物学暑期课程十年来的发展历程、课程结构和教育成果 | 首次系统总结该旗舰课程的教学模式及其对合成生物学人才培养的深远影响 | NA | 分析合成生物学教育课程的设计理念与实际成效 | 冷泉港实验室合成生物学暑期课程 | 合成生物学教育 | NA | 无细胞转录翻译、DNA构建、基因回路计算建模、基因调控工程、CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 基因回路 | 教育 |
| 26 | 2025-10-05 |
Soft Synthetic Cells with Mobile Membrane Ligands for Ex Vivo Expansion of Therapy-Relevant T Cell Phenotypes
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202401844
PMID:38751204
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研究论文 | 开发了一种基于液-液相分离液滴支撑脂质双层的软合成细胞技术，用于体外扩增治疗相关T细胞表型 | 首次将侧向配体流动性作为T细胞体外扩增技术设计的第三关键维度，并揭示了其在调节T细胞表型和激活中的重要作用 | NA | 开发更接近体内T细胞激活的体外扩增技术 | 治疗相关的T细胞表型，特别是调节性CD8 T细胞 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 液-液相分离技术，脂质双分子层技术 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 人工抗原呈递细胞设计 | 医学 |
| 27 | 2025-10-05 |
Engineering Material Properties of Transcription Factor Condensates to Control Gene Expression in Mammalian Cells and Mice
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202311834
PMID:38573961
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研究论文 | 通过调控转录因子凝聚物的材料性质来控制哺乳动物细胞和小鼠中的基因表达 | 首次系统研究转录因子凝聚物材料性质对基因表达的影响，发现液态凝聚物增强基因表达而固态凝聚物抑制基因表达 | NA | 探索生物分子凝聚物材料性质对基因表达调控的影响机制 | 哺乳动物细胞和小鼠模型中的转录因子凝聚物 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | 光遗传学 | 哺乳动物细胞, 小鼠 | 转录因子凝聚物调控系统 | 医学, 合成生物学 |
| 28 | 2025-10-05 |
Understanding the Role of Layered Minerals in the Emergence and Preservation of Proto-Proteins and Detection of Traces of Early Life
2024-09-03, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00173
PMID:39141709
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综述 | 本文系统评估层状矿物在原始蛋白质出现与保存及早期生命痕迹检测中的作用 | 提出矿物可作为环境周期现象信息转录载体的新观点，并首次定义'伪生物标志物'概念 | 实验室无法完全模拟早期行星所有过程，部分样本难以获取 | 探索生命起源的化学与地质过程机制 | 层状矿物（粘土、水滑石等）与原始生物分子的相互作用 | 天体生物学 | NA | 分子模拟, 空间任务, 湿实验室实验, 理论建模 | NA | 模拟数据, 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 天体生物学, 合成生物学 |
| 29 | 2025-10-05 |
Biosecurity Assessments for Emerging Transdisciplinary Biotechnologies: Revisiting Biodefense in an Age of Synthetic Biology
2024-Sep, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2024.0005
PMID:39372508
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综述 | 本文探讨新兴跨学科生物技术的生物安全评估框架，重点关注合成生物学时代的生物防御策略 | 重新评估现有生物安全框架在合成生物学快速发展背景下的适用性，提出需同时分析风险与收益 | 风险评估框架对不涉及常规生物制剂的技术适用性有限，且当前讨论过度聚焦风险而忽视收益分析 | 评估跨学科生物技术研发的风险评估与缓解策略 | 工程生物学研究进展及其生物安全影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 30 | 2025-10-05 |
Design and construction of artificial metabolic pathways for the bioproduction of useful compounds
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文介绍了合成生物学中人工代谢途径的设计与构建方法，用于高效生物生产有用化合物 | 提出整合计算科学方法进行代谢途径理性设计，并探讨植物细胞/基因在合成生物学中的应用潜力 | NA | 优化生物细胞生产有用化合物的代谢途径设计 | 微生物及植物细胞的代谢反应与途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、计算设计方法 | NA | NA | NA | NA | 植物细胞 | 人工代谢途径、碳流与能量平衡设计 | 工业生物技术 |
| 31 | 2025-10-05 |
Synthetic biology in plants
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文探讨了合成生物学在植物科学领域的演变历程、当前发展状态及其在农业与生物技术中的应用潜力 | 系统整合了植物合成生物学领域的关键成就与新兴趋势，强调通过工程化方法改造植物性状和代谢途径的创新解决方案 | 涉及伦理和生物安全考量，需要负责任地部署合成生物学工具 | 改善营养和光合作用效率、有用次级代谢产物生产、工程生物传感器以及赋予胁迫耐受性 | 植物生物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径工程、生物传感器设计 | 农业, 环境, 食品 |
| 32 | 2025-10-05 |
Integrated metabolite profiling and transcriptome analysis reveal candidate genes involved in the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids in Corydalis solida
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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研究论文 | 本研究通过整合代谢物分析和转录组分析，揭示了延胡索中苄基异喹啉生物碱生物合成途径的关键候选基因 | 首次在延胡索中鉴定出两个OMT基因（CsOMT1和CsOMT2）的特定甲基化功能，明确了它们在苄基异喹啉生物碱生物合成途径中的作用 | 仍有许多苄基异喹啉生物碱生物合成相关酶基因尚未被发现 | 阐明延胡索中苄基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 延胡索植物的不同组织 | 合成生物学 | NA | 代谢物分析，转录组分析 | NA | 代谢组数据，转录组数据 | 延胡索不同组织样本 | NA | 延胡索植物 | 苄基异喹啉生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 33 | 2025-10-05 |
Synthetic-biology approach for plant lignocellulose engineering
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造植物木质纤维素以降低其顽固性的最新进展 | 提出了八种重新设计木质素和结构聚糖途径的策略，在降低木质纤维素顽固性的同时减轻产量损失带来的生长缺陷 | 植物系统在工业应用中面临已建立的哺乳动物细胞培养体系的竞争，且木质纤维素途径复杂涉及大量基因 | 开发植物生物质的可持续利用方法，促进植物源性产品的市场化 | 植物木质纤维素（木质素、纤维素和半纤维素） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 木质素和结构聚糖的生物合成途径重新设计 | 工业生物技术, 能源, 环境 |
| 34 | 2025-10-05 |
Distribution, biosynthesis, and synthetic biology of phenylethanoid glycosides in the order Lamiales
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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综述 | 本文综述了唇形目植物中苯乙醇苷类化合物的分布、生物合成途径及合成生物学研究进展 | 系统总结了典型苯乙醇苷类化合物毛蕊花糖苷在150多个物种中的分布特征及其生物合成机制 | NA | 探讨苯乙醇苷类化合物的植物分布规律、生物合成路径及生物制造策略 | 唇形目植物中的苯乙醇苷类化合物 | 合成生物学 | NA | 生物合成、生物生产 | NA | 文献数据 | 涉及150多个植物物种 | NA | NA | NA | 医药 |
| 35 | 2025-03-22 |
Preface to the special issue "Synthetic Biology and Bioproduction in Plants"
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2025-10-05 |
Impact of sulfur substitution on biotin binding affinity to streptavidin
2024-09, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107600
PMID:38945086
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研究论文 | 研究硫原子替换对生物素与链霉亲和素结合亲和力的影响 | 首次系统研究将生物素四氢噻吩环替换为氧杂环或氮杂环对其结合性能的影响，并发现氮杂生物素具有pH依赖性结合特性 | 仅研究了有限的几种类似物，未进行体内验证实验 | 开发适用于合成生物学体外和体内应用的替代亲和配体 | 生物素类似物（氧杂生物素、氮杂生物素、N-甲基氮杂生物素）与链霉亲和素的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、荧光滴定实验、晶体学分析 | NA | 分子模拟数据、荧光结合数据 | 三种生物素类似物 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 37 | 2025-10-05 |
Synonymous codon substitutions modulate transcription and translation of a divergent upstream gene by modulating antisense RNA production
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405510121
PMID:39190361
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研究论文 | 本文揭示了同义密码子替换通过调控反义RNA产生影响上游基因转录和翻译的机制 | 首次发现编码序列内部的同义密码子替换可通过产生长链反义RNA影响邻近基因表达，且能绕过天然转录抑制机制 | 研究仅基于质粒系统，未在完整细菌基因组中验证；仅测试了9种重编码序列中的4种显示效应 | 探究同义密码子替换对邻近基因表达的跨基因调控作用 | 质粒编码的氯霉素乙酰转移酶基因和上游四环素抗性基因 | 分子生物学 | NA | 基因重编码、RNA转录分析、蛋白质表达检测 | NA | 基因表达数据、RNA测序数据、蛋白质定量数据 | 9种同义重编码的cat基因序列 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学 |
| 38 | 2025-10-05 |
Herbgenomics meets Papaveraceae: a promising -omics perspective on medicinal plant research
2024-Sep-27, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad050
PMID:37952099
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综述 | 本文综述了罂粟科药用植物的基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学研究进展，并探讨了组学技术在药物开发和农业生物技术中的应用潜力 | 将新兴的草药基因组学应用于罂粟科药用植物研究，整合多组学数据解析药用活性成分的生物合成途径 | NA | 通过组学技术揭示药用植物的遗传信息和调控网络，促进药用植物的定向育种和合成生物学应用 | 罂粟科药用植物，包括罂粟和白屈菜等含乳胶植物 | 生物信息学 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR/Cas9、RNA干扰 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 罂粟科植物 | 次生代谢物生物合成途径 | 医药, 农业生物技术 |
| 39 | 2025-10-05 |
Decoding the genetic blueprint: regulation of key agricultural traits in sorghum
2024-Sep-18, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00039-3
PMID:39883247
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综述 | 本文全面综述了高粱关键农艺性状的遗传调控机制与育种策略 | 系统整合了高粱株型、穗型和抗逆性的功能基因与调控网络，并提出结合基因组选择、基因编辑和合成生物学的前沿育种方案 | NA | 解析高粱关键农艺性状的遗传调控机制以提升作物性能 | 高粱（Sorghum） | 作物遗传育种 | NA | 全基因组选择、基因编辑、合成生物学 | NA | 遗传数据 | NA | 基因编辑 | 高粱 | NA | 农业 |
| 40 | 2025-10-05 |
DSCI: a database of synthetic biology components for innate immunity and cell engineering decision-making processes
2024-Sep-03, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00036-6
PMID:39883249
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研究论文 | 介绍了一个名为DSCI的合成生物学数据库，专门用于先天免疫和细胞工程决策过程 | 开发了首个专注于先天免疫信号回路设计的综合性数据库，提供可视化信号基序和经过实验验证的组件资源 | NA | 为医学合成生物学中的先天免疫信号回路设计提供更好的见解和策略 | 先天免疫信号通路组件和基因回路 | 合成生物学 | NA | 数据库构建、信号通路分析 | NA | 生物组件数据、信号通路数据、文献注释数据 | 1240个独立组件和4000多个特定条目 | NA | NA | 先天免疫信号回路、调控级联信号基序、环状图 | 医学 |