本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Orthogonal Serine Integrases Enable Scalable Gene Storage Cascades in Bacterial Genome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00505
PMID:39238421
|
研究论文 | 开发基于正交丝氨酸整合酶的迭代基因组整合方法,实现细菌染色体中多基因的稳定存储 | 首次利用正交丝氨酸整合酶系统实现可扩展的基因存储级联,支持长达13 kb DNA片段的标记自由高效整合 | 未明确说明整合效率的具体量化数据和系统在不同宿主中的普适性验证 | 开发可扩展的基因组整合工具用于合成生物学应用 | 大肠杆菌MG1655菌株 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的基因组整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 工程化整合载体 | 大肠杆菌 | 基因存储级联系统,多基因表达通路 | 工业生物技术, 医学 |
| 22 | 2025-10-05 |
A Simple and Effective Strategy for the Development of Robust Promoter-Centric Gene Expression Tools
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00092
PMID:39120429
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过改造启动子区域来创建稳健基因表达工具的简单有效策略 | 通过在原始启动子-35区域上游引入额外的-35样基序,并在5'-UTR区域整合回文元件,显著增强了启动子活性 | NA | 开发稳健的启动子中心基因表达工具 | 链霉菌及其基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 启动子工程 | NA | NA | NA | 启动子改造 | 链霉菌 | 组成型和诱导型基因表达系统,包括木四环素诱导型基因表达系统 | 工业生物技术 |
| 23 | 2025-10-05 |
Desiccated Cyanobacteria Serve As Efficient Plasmid DNA Carriers in Space Flight
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00672
PMID:39150229
|
研究论文 | 本研究探索利用干燥蓝藻作为质粒DNA载体在太空飞行中的有效运输方法 | 首次利用天然耐干燥的蓝藻作为质粒DNA载体,实现无需低温储存的太空往返运输 | 仅为概念验证研究,样本规模有限,需要进一步验证不同质粒和环境的适用性 | 开发适用于太空环境的生物部件运输方法,支持太空合成生物学和生物制造 | 蓝藻菌株PC73102和pSCR119质粒 | 合成生物学 | NA | 质粒提取、细菌转化 | NA | 分子生物学数据 | 概念验证规模,具体样本数量未明确说明 | NA | 蓝藻PC73102, 大肠杆菌 | 质粒载体系统,包含卡那霉素抗性基因 | 太空生物技术 |
| 24 | 2025-10-05 |
Genetic Code Expansion in Shewanella oneidensis MR-1 Allows Site-Specific Incorporation of Bioorthogonal Functional Groups into a c-Type Cytochrome
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00248
PMID:39158169
|
研究论文 | 本研究开发了在希瓦氏菌MR-1中实现位点特异性非经典氨基酸掺入的高效方法 | 首次在电活性细菌MR-1中建立遗传密码扩展系统,实现c型细胞色素MtrC的位点特异性修饰 | NA | 扩展电活性细菌中蛋白质的化学功能多样性 | 希瓦氏菌MR-1及其c型细胞色素MtrC | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 蛋白质结构数据、电化学数据 | NA | 遗传密码扩展 | Shewanella oneidensis MR-1 | 非经典氨基酸掺入系统 | 工业生物技术 |
| 25 | 2025-10-05 |
GOLDBAR: A Framework for Combinatorial Biological Design
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00296
PMID:39162314
|
研究论文 | 提出名为GOLDBAR的组合生物设计框架,用于支持合成生物学中的自动化分析和机器学习 | 能够对生物设计类别进行交集和合并操作,提取共同设计模式并推断新设计,相比现有框架支持形式化设计比较 | NA | 开发支持合成生物学中组合设计形式化比较的框架 | 组合生物设计库和设计规则 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | 基于文法的机器学习 | 生物设计数据 | NA | NA | NA | TetR同源转录逻辑电路、基因簇 | 工业生物技术 |
| 26 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology of Natural Products Engineering: Recent Advances Across the Discover-Design-Build-Test-Learn Cycle
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00391
PMID:39163395
|
综述 | 本文系统总结了合成生物学在天然产物工程领域的最新进展,涵盖从发现到学习的完整生物工程周期 | 整合了AI辅助基因组挖掘、酶与途径工程、新型宿主系统等最新技术进展,并强调在工艺开发早期进行预期分析的重要性 | NA | 总结天然产物工程领域合成生物学技术的最新发展 | 天然产物生物合成工程 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、AI辅助基因组挖掘、酶工程、途径工程 | NA | NA | NA | NA | 新型宿主系统 | 生物合成途径工程 | 医药, 工业生物技术 |
| 27 | 2025-10-05 |
MutaT7GDE: A Single Chimera for the Targeted, Balanced, Efficient, and Processive Installation of All Possible Transition Mutations In Vivo
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00316
PMID:39190860
|
研究论文 | 开发了一种名为MutaT7GDE的新型嵌合酶,能够在体内高效安装所有可能的转换突变 | 首次利用底物混杂性通用脱氨酶构建单一嵌合酶,可同时靶向脱氧腺苷和脱氧胞苷进行突变 | NA | 开发更高效的定向进化工具,实现目标基因的多样化 | MutaT7嵌合酶系统 | 合成生物学 | NA | 脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合技术 | NA | 突变分析数据 | 四种不同的MutaT7构建体 | 蛋白质工程 | NA | 脱氨酶-T7 RNA聚合酶嵌合系统 | 工业生物技术 |
| 28 | 2025-10-05 |
Integrating Deep Learning and Synthetic Biology: A Co-Design Approach for Enhancing Gene Expression via N-Terminal Coding Sequences
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00371
PMID:39229974
|
研究论文 | 提出一种深度学习与合成生物学协同设计的少样本训练工作流程,用于优化N端编码序列以增强基因表达 | 开发了结合k近邻编码、word2vec、注意力机制和时间序列网络的深度学习模型,仅需六次迭代实验即可显著提升基因表达 | 仅使用GFP作为报告蛋白验证,在其他蛋白中的应用效果需进一步验证 | 优化N端编码序列以最大化基因表达 | 绿色荧光蛋白(GFP)和N-乙酰神经氨酸合成相关基因 | 机器学习 | NA | 深度学习,基因表达优化 | 注意力机制,时间序列网络,word2vec | 基因序列数据,荧光强度数据 | 少样本训练(六次迭代实验) | NA | 大肠杆菌 | 基因表达优化系统 | 工业生物技术,医药 |
| 29 | 2025-10-05 |
Multilevel Systematic Optimization To Achieve Efficient Integrated Expression of Escherichia coli
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00280
PMID:39262282
|
研究论文 | 通过多层级系统优化开发大肠杆菌高效整合表达系统 | 从整合位点筛选、启动子优化和T7 RNA聚合酶过表达三个层面系统优化,构建了无需抗生素和诱导剂的高效整合表达系统 | 研究仅针对大肠杆菌BL21(DE3)菌株,未在其他宿主中验证通用性 | 开发稳定高效的外源基因基因组整合表达系统 | 大肠杆菌BL21(DE3)基因组和外源基因表达元件 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、启动子工程、蛋白表达分析 | NA | 基因表达数据、酶活性数据 | 18个基因组整合位点、16个内源启动子 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 组成型高效整合表达系统,包含优化整合位点、Plpp-T7杂合启动子和T7 RNA聚合酶过表达模块 | 工业生物技术, 酶工程 |
| 30 | 2025-10-05 |
Evaluating the Contribution of Model Complexity in Predicting Robustness in Synthetic Genetic Circuits
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00708
PMID:39264040
|
研究论文 | 比较五种计算模型对三种实现相同逻辑功能的遗传电路进行预测能力评估 | 首次系统比较不同复杂度模型在预测合成遗传电路鲁棒性方面的表现差异 | 研究基于仿真分析,需要实际实验验证;模型参数获取仍存在挑战 | 评估模型复杂度对合成遗传电路鲁棒性预测能力的影响 | 三种实现相同逻辑功能的遗传电路和五种计算模型 | 合成生物学 | NA | 计算建模、仿真分析 | 多种复杂度计算模型 | 仿真数据 | 五种模型对三种电路设计的分析 | NA | NA | 实现相同逻辑功能的遗传电路 | 工业生物技术 |
| 31 | 2025-10-05 |
Yeast Surface-Displayed Quenchbody as a Novel Whole-Cell Biosensor for One-Step Detection of Influenza A (H1N1) Virus
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00317
PMID:39256183
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于酵母表面展示淬灭体的新型全细胞生物传感器,用于一步检测甲型流感(H1N1)病毒 | 首次在酵母细胞表面展示VHH基淬灭体,创建了无需分析物跨膜运输即可检测病毒颗粒的全细胞生物传感器新设计 | 检测范围有限(H1N1-HA:0.5-16 μg/mL;H1N1病毒:2.4×10至1.5×10 PFU/mL),未在真实环境样本中进行验证 | 开发能够高效检测空气传播病毒的新型全细胞生物传感器 | 甲型流感(H1N1)病毒及其血凝素蛋白H1N1-HA | 合成生物学 | 流感 | 酵母表面展示技术、VHH抗体片段筛选、淬灭体技术 | NA | 荧光信号数据 | 17个VHH抗体片段 | 酵母表面展示系统 | 酵母 | 表面展示淬灭体生物传感器 | 医学诊断,环境监测 |
| 32 | 2025-10-05 |
Ten Years of the Synthetic Biology Summer Course at Cold Spring Harbor Laboratory
2024-09-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00276
PMID:39300908
|
综述 | 本文回顾了冷泉港实验室合成生物学暑期课程十年来的发展历程、课程结构和教育成果 | 首次系统总结该旗舰课程的教学模式及其对合成生物学人才培养的深远影响 | NA | 分析合成生物学教育课程的设计理念与实际成效 | 冷泉港实验室合成生物学暑期课程 | 合成生物学教育 | NA | 无细胞转录翻译、DNA构建、基因回路计算建模、基因调控工程、CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | 基因回路 | 教育 |
| 33 | 2025-10-05 |
Soft Synthetic Cells with Mobile Membrane Ligands for Ex Vivo Expansion of Therapy-Relevant T Cell Phenotypes
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202401844
PMID:38751204
|
研究论文 | 开发了一种基于液-液相分离液滴支撑脂质双层的软合成细胞技术,用于体外扩增治疗相关T细胞表型 | 首次将侧向配体流动性作为T细胞体外扩增技术设计的第三关键维度,并揭示了其在调节T细胞表型和激活中的重要作用 | NA | 开发更接近体内T细胞激活的体外扩增技术 | 治疗相关的T细胞表型,特别是调节性CD8 T细胞 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 液-液相分离技术,脂质双分子层技术 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 人工抗原呈递细胞设计 | 医学 |
| 34 | 2025-10-05 |
Engineering Material Properties of Transcription Factor Condensates to Control Gene Expression in Mammalian Cells and Mice
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202311834
PMID:38573961
|
研究论文 | 通过调控转录因子凝聚物的材料性质来控制哺乳动物细胞和小鼠中的基因表达 | 首次系统研究转录因子凝聚物材料性质对基因表达的影响,发现液态凝聚物增强基因表达而固态凝聚物抑制基因表达 | NA | 探索生物分子凝聚物材料性质对基因表达调控的影响机制 | 哺乳动物细胞和小鼠模型中的转录因子凝聚物 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | 光遗传学 | 哺乳动物细胞, 小鼠 | 转录因子凝聚物调控系统 | 医学, 合成生物学 |
| 35 | 2025-10-05 |
Understanding the Role of Layered Minerals in the Emergence and Preservation of Proto-Proteins and Detection of Traces of Early Life
2024-09-03, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00173
PMID:39141709
|
综述 | 本文系统评估层状矿物在原始蛋白质出现与保存及早期生命痕迹检测中的作用 | 提出矿物可作为环境周期现象信息转录载体的新观点,并首次定义'伪生物标志物'概念 | 实验室无法完全模拟早期行星所有过程,部分样本难以获取 | 探索生命起源的化学与地质过程机制 | 层状矿物(粘土、水滑石等)与原始生物分子的相互作用 | 天体生物学 | NA | 分子模拟, 空间任务, 湿实验室实验, 理论建模 | NA | 模拟数据, 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 天体生物学, 合成生物学 |
| 36 | 2025-10-05 |
Biosecurity Assessments for Emerging Transdisciplinary Biotechnologies: Revisiting Biodefense in an Age of Synthetic Biology
2024-Sep, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2024.0005
PMID:39372508
|
综述 | 本文探讨新兴跨学科生物技术的生物安全评估框架,重点关注合成生物学时代的生物防御策略 | 重新评估现有生物安全框架在合成生物学快速发展背景下的适用性,提出需同时分析风险与收益 | 风险评估框架对不涉及常规生物制剂的技术适用性有限,且当前讨论过度聚焦风险而忽视收益分析 | 评估跨学科生物技术研发的风险评估与缓解策略 | 工程生物学研究进展及其生物安全影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 37 | 2025-10-05 |
Design and construction of artificial metabolic pathways for the bioproduction of useful compounds
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
综述 | 本文介绍了合成生物学中人工代谢途径的设计与构建方法,用于高效生物生产有用化合物 | 提出整合计算科学方法进行代谢途径理性设计,并探讨植物细胞/基因在合成生物学中的应用潜力 | NA | 优化生物细胞生产有用化合物的代谢途径设计 | 微生物及植物细胞的代谢反应与途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、计算设计方法 | NA | NA | NA | NA | 植物细胞 | 人工代谢途径、碳流与能量平衡设计 | 工业生物技术 |
| 38 | 2025-10-05 |
Synthetic biology in plants
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
综述 | 本文探讨了合成生物学在植物科学领域的演变历程、当前发展状态及其在农业与生物技术中的应用潜力 | 系统整合了植物合成生物学领域的关键成就与新兴趋势,强调通过工程化方法改造植物性状和代谢途径的创新解决方案 | 涉及伦理和生物安全考量,需要负责任地部署合成生物学工具 | 改善营养和光合作用效率、有用次级代谢产物生产、工程生物传感器以及赋予胁迫耐受性 | 植物生物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径工程、生物传感器设计 | 农业, 环境, 食品 |
| 39 | 2025-10-05 |
Integrated metabolite profiling and transcriptome analysis reveal candidate genes involved in the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids in Corydalis solida
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
研究论文 | 本研究通过整合代谢物分析和转录组分析,揭示了延胡索中苄基异喹啉生物碱生物合成途径的关键候选基因 | 首次在延胡索中鉴定出两个OMT基因(CsOMT1和CsOMT2)的特定甲基化功能,明确了它们在苄基异喹啉生物碱生物合成途径中的作用 | 仍有许多苄基异喹啉生物碱生物合成相关酶基因尚未被发现 | 阐明延胡索中苄基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 延胡索植物的不同组织 | 合成生物学 | NA | 代谢物分析,转录组分析 | NA | 代谢组数据,转录组数据 | 延胡索不同组织样本 | NA | 延胡索植物 | 苄基异喹啉生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 40 | 2025-10-05 |
Synthetic-biology approach for plant lignocellulose engineering
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造植物木质纤维素以降低其顽固性的最新进展 | 提出了八种重新设计木质素和结构聚糖途径的策略,在降低木质纤维素顽固性的同时减轻产量损失带来的生长缺陷 | 植物系统在工业应用中面临已建立的哺乳动物细胞培养体系的竞争,且木质纤维素途径复杂涉及大量基因 | 开发植物生物质的可持续利用方法,促进植物源性产品的市场化 | 植物木质纤维素(木质素、纤维素和半纤维素) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 木质素和结构聚糖的生物合成途径重新设计 | 工业生物技术, 能源, 环境 |