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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Engineering Material Properties of Transcription Factor Condensates to Control Gene Expression in Mammalian Cells and Mice
2024-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202311834
PMID:38573961
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研究论文 | 通过调控转录因子凝聚物的材料性质来控制哺乳动物细胞和小鼠中的基因表达 | 首次系统研究转录因子凝聚物材料性质对基因表达的影响,发现液态凝聚物增强基因表达而固态凝聚物抑制基因表达 | NA | 探索生物分子凝聚物材料性质对基因表达调控的影响机制 | 哺乳动物细胞和小鼠模型中的转录因子凝聚物 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | 光遗传学 | 哺乳动物细胞, 小鼠 | 转录因子凝聚物调控系统 | 医学, 合成生物学 |
| 42 | 2025-10-05 |
Understanding the Role of Layered Minerals in the Emergence and Preservation of Proto-Proteins and Detection of Traces of Early Life
2024-09-03, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00173
PMID:39141709
|
综述 | 本文系统评估层状矿物在原始蛋白质出现与保存及早期生命痕迹检测中的作用 | 提出矿物可作为环境周期现象信息转录载体的新观点,并首次定义'伪生物标志物'概念 | 实验室无法完全模拟早期行星所有过程,部分样本难以获取 | 探索生命起源的化学与地质过程机制 | 层状矿物(粘土、水滑石等)与原始生物分子的相互作用 | 天体生物学 | NA | 分子模拟, 空间任务, 湿实验室实验, 理论建模 | NA | 模拟数据, 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 天体生物学, 合成生物学 |
| 43 | 2025-10-05 |
Biosecurity Assessments for Emerging Transdisciplinary Biotechnologies: Revisiting Biodefense in an Age of Synthetic Biology
2024-Sep, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2024.0005
PMID:39372508
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综述 | 本文探讨新兴跨学科生物技术的生物安全评估框架,重点关注合成生物学时代的生物防御策略 | 重新评估现有生物安全框架在合成生物学快速发展背景下的适用性,提出需同时分析风险与收益 | 风险评估框架对不涉及常规生物制剂的技术适用性有限,且当前讨论过度聚焦风险而忽视收益分析 | 评估跨学科生物技术研发的风险评估与缓解策略 | 工程生物学研究进展及其生物安全影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 44 | 2025-10-05 |
Design and construction of artificial metabolic pathways for the bioproduction of useful compounds
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
综述 | 本文介绍了合成生物学中人工代谢途径的设计与构建方法,用于高效生物生产有用化合物 | 提出整合计算科学方法进行代谢途径理性设计,并探讨植物细胞/基因在合成生物学中的应用潜力 | NA | 优化生物细胞生产有用化合物的代谢途径设计 | 微生物及植物细胞的代谢反应与途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、计算设计方法 | NA | NA | NA | NA | 植物细胞 | 人工代谢途径、碳流与能量平衡设计 | 工业生物技术 |
| 45 | 2025-10-05 |
Synthetic biology in plants
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
综述 | 本文探讨了合成生物学在植物科学领域的演变历程、当前发展状态及其在农业与生物技术中的应用潜力 | 系统整合了植物合成生物学领域的关键成就与新兴趋势,强调通过工程化方法改造植物性状和代谢途径的创新解决方案 | 涉及伦理和生物安全考量,需要负责任地部署合成生物学工具 | 改善营养和光合作用效率、有用次级代谢产物生产、工程生物传感器以及赋予胁迫耐受性 | 植物生物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑技术 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径工程、生物传感器设计 | 农业, 环境, 食品 |
| 46 | 2025-10-05 |
Integrated metabolite profiling and transcriptome analysis reveal candidate genes involved in the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids in Corydalis solida
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
研究论文 | 本研究通过整合代谢物分析和转录组分析,揭示了延胡索中苄基异喹啉生物碱生物合成途径的关键候选基因 | 首次在延胡索中鉴定出两个OMT基因(CsOMT1和CsOMT2)的特定甲基化功能,明确了它们在苄基异喹啉生物碱生物合成途径中的作用 | 仍有许多苄基异喹啉生物碱生物合成相关酶基因尚未被发现 | 阐明延胡索中苄基异喹啉生物碱的生物合成途径 | 延胡索植物的不同组织 | 合成生物学 | NA | 代谢物分析,转录组分析 | NA | 代谢组数据,转录组数据 | 延胡索不同组织样本 | NA | 延胡索植物 | 苄基异喹啉生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 47 | 2025-10-05 |
Synthetic-biology approach for plant lignocellulose engineering
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学方法改造植物木质纤维素以降低其顽固性的最新进展 | 提出了八种重新设计木质素和结构聚糖途径的策略,在降低木质纤维素顽固性的同时减轻产量损失带来的生长缺陷 | 植物系统在工业应用中面临已建立的哺乳动物细胞培养体系的竞争,且木质纤维素途径复杂涉及大量基因 | 开发植物生物质的可持续利用方法,促进植物源性产品的市场化 | 植物木质纤维素(木质素、纤维素和半纤维素) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 木质素和结构聚糖的生物合成途径重新设计 | 工业生物技术, 能源, 环境 |
| 48 | 2025-10-05 |
Distribution, biosynthesis, and synthetic biology of phenylethanoid glycosides in the order Lamiales
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
综述 | 本文综述了唇形目植物中苯乙醇苷类化合物的分布、生物合成途径及合成生物学研究进展 | 系统总结了典型苯乙醇苷类化合物毛蕊花糖苷在150多个物种中的分布特征及其生物合成机制 | NA | 探讨苯乙醇苷类化合物的植物分布规律、生物合成路径及生物制造策略 | 唇形目植物中的苯乙醇苷类化合物 | 合成生物学 | NA | 生物合成、生物生产 | NA | 文献数据 | 涉及150多个植物物种 | NA | NA | NA | 医药 |
| 49 | 2025-03-22 |
Preface to the special issue "Synthetic Biology and Bioproduction in Plants"
2024-Sep-25, Plant biotechnology (Tokyo, Japan)
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2025-10-05 |
Impact of sulfur substitution on biotin binding affinity to streptavidin
2024-09, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107600
PMID:38945086
|
研究论文 | 研究硫原子替换对生物素与链霉亲和素结合亲和力的影响 | 首次系统研究将生物素四氢噻吩环替换为氧杂环或氮杂环对其结合性能的影响,并发现氮杂生物素具有pH依赖性结合特性 | 仅研究了有限的几种类似物,未进行体内验证实验 | 开发适用于合成生物学体外和体内应用的替代亲和配体 | 生物素类似物(氧杂生物素、氮杂生物素、N-甲基氮杂生物素)与链霉亲和素的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟、荧光滴定实验、晶体学分析 | NA | 分子模拟数据、荧光结合数据 | 三种生物素类似物 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 51 | 2025-10-05 |
Decoding the genetic blueprint: regulation of key agricultural traits in sorghum
2024-Sep-18, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00039-3
PMID:39883247
|
综述 | 本文全面综述了高粱关键农艺性状的遗传调控机制与育种策略 | 系统整合了高粱株型、穗型和抗逆性的功能基因与调控网络,并提出结合基因组选择、基因编辑和合成生物学的前沿育种方案 | NA | 解析高粱关键农艺性状的遗传调控机制以提升作物性能 | 高粱(Sorghum) | 作物遗传育种 | NA | 全基因组选择、基因编辑、合成生物学 | NA | 遗传数据 | NA | 基因编辑 | 高粱 | NA | 农业 |
| 52 | 2025-10-05 |
DSCI: a database of synthetic biology components for innate immunity and cell engineering decision-making processes
2024-Sep-03, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-024-00036-6
PMID:39883249
|
研究论文 | 介绍了一个名为DSCI的合成生物学数据库,专门用于先天免疫和细胞工程决策过程 | 开发了首个专注于先天免疫信号回路设计的综合性数据库,提供可视化信号基序和经过实验验证的组件资源 | NA | 为医学合成生物学中的先天免疫信号回路设计提供更好的见解和策略 | 先天免疫信号通路组件和基因回路 | 合成生物学 | NA | 数据库构建、信号通路分析 | NA | 生物组件数据、信号通路数据、文献注释数据 | 1240个独立组件和4000多个特定条目 | NA | NA | 先天免疫信号回路、调控级联信号基序、环状图 | 医学 |
| 53 | 2025-10-06 |
Spectral Algal Fingerprinting and Long Sequencing in Synthetic Algal-Microbial Communities
2024-09-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181552
PMID:39329735
|
研究论文 | 本研究利用全光谱流式细胞术分析合成藻类-微生物群落,实现快速物种鉴定和计数 | 开发基于全光谱流式细胞术的光谱虚拟过滤系统,实现藻类群落的高通量多维分析和精确种群分离 | 需要建立标准化光谱库以提升藻类群落表征能力 | 推进合成生物学和浮游植物生态学研究 | 合成藻类-微生物群落 | 合成生物学 | NA | 全光谱流式细胞术 | NA | 光谱数据 | NA | NA | 藻类-微生物群落 | NA | 环境 |
| 54 | 2025-10-06 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614978
PMID:39386662
|
研究论文 | 本研究通过定向进化开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎,显著提高了基因表达效率 | 将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒单亚基加帽酶融合,通过定向进化获得活性提高两个数量级的变体 | NA | 开发适用于真核生物的正交基因表达调控系统 | T7 RNA聚合酶与加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酵母, 哺乳动物细胞 | T7 RNAP为基础的遗传电路 | 医学, 工业生物技术 |
| 55 | 2024-12-06 |
An upgraded Myxococcus xanthus chassis with enhanced growth characteristics for efficient genetic manipulation
2024-Sep, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100155
PMID:39629111
|
研究论文 | 本文通过工程化改造Myxococcus xanthus菌株DK1622,获得了具有增强生长特性的Hu04菌株,以提高遗传操作效率 | 通过基因工程手段,成功改造了Myxococcus xanthus菌株,使其缺乏多细胞行为和色素,同时保持营养生长和相似的代谢背景,显著改善了分散生长特性 | NA | 提高Myxococcus xanthus菌株的遗传操作效率 | Myxococcus xanthus菌株DK1622及其工程化菌株Hu04 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-11-15 |
Matching Together Living Cells and Prototissues: Will There Be Chemistry?
2024-Sep-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400378
PMID:39031571
|
综述 | 本文综述了合成细胞与活细胞以及原组织与活细胞系统的当前研究进展 | 探讨了非生物与生物物质有效整合的化学、生物化学和机械化学方面,为组织工程和新技术的开发提供了新的方向 | NA | 总结当前混合合成细胞/活细胞和原组织/活细胞系统的研究现状,并探讨未来的发展方向 | 合成细胞与活细胞以及原组织与活细胞的整合 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-11-07 |
Red-Shifting B12-Dependent Photoreceptor Protein via Optical Coupling for Inducible Living Materials
2024-Sep-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202411105
PMID:39239776
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光学耦合将B12依赖性光感受蛋白CarH的光响应从绿光转移到红/远红光的通用策略 | 通过硫醇-马来酰亚胺点击化学将含有半胱氨酸的CarH突变体标记为捕获红光的荧光团SulfoCyanine5 (Cy5),从而使光感受蛋白获得对红光的敏感性 | NA | 开发一种新的方法来扩展B12依赖性光感受蛋白在光遗传学和活体材料中的应用 | B12依赖性光感受蛋白CarH及其在活体材料中的应用 | 生物材料合成 | NA | 硫醇-马来酰亚胺点击化学 | NA | 蛋白质 | 涉及酵母细胞的基因工程改造 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-11-02 |
Viscosity Regulation of Chemically Simple Condensates
2024-09-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c00623
PMID:39166772
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研究论文 | 研究了不同长度的聚精氨酸链(R)和柠檬酸(CA)衍生物形成的生物分子凝聚物的粘度和液固转变行为 | 通过调整支架分子的组成,展示了一种简单的方法来调节凝聚物的性质,揭示了分子组成在控制凝聚物粘度和转变动力学中的作用 | NA | 深入理解生物分子凝聚过程,并为未来在合成生物学和疾病治疗领域的应用提供策略 | 不同长度的聚精氨酸链和柠檬酸衍生物形成的生物分子凝聚物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-11-02 |
Peptide-Based Biomimetic Condensates via Liquid-Liquid Phase Separation as Biomedical Delivery Vehicles
2024-09-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c00814
PMID:39178343
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研究论文 | 本文综述了通过液-液相分离形成的基于肽的仿生凝聚物作为生物医学递送载体的最新进展 | 本文介绍了通过液-液相分离形成的基于肽的仿生凝聚物,这些凝聚物可以模拟生物分子凝聚物的相分离行为和生物物理特性,并具有作为生物医学递送载体的潜力 | NA | 探讨基于肽的仿生凝聚物的设计和构建,以及其在生物医学递送中的应用前景 | 基于肽的仿生凝聚物及其在生物医学递送中的应用 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-10-24 |
CryptKeeper: a negative design tool for reducing unintentional gene expression in bacteria
2024-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.611466
PMID:39282447
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研究论文 | 介绍了一种名为CryptKeeper的软件工具,用于减少细菌中无意基因表达 | 开发了一种新的软件工具CryptKeeper,能够可视化预测细菌基因表达信号并估计DNA序列可能的翻译负担 | NA | 开发一种工具来减少细菌中无意基因表达,从而避免实验中的遗传不稳定性和信号干扰 | 细菌中的基因表达信号和翻译负担 | 分子生物学 | NA | NA | NA | DNA序列 | 涉及多个已发表的例子,包括真核病毒感染克隆和单个蛋白质 | NA | NA | NA | NA |