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当前共找到 114 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Spectral Algal Fingerprinting and Long Sequencing in Synthetic Algal-Microbial Communities
2024-09-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells13181552
PMID:39329735
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研究论文 | 本研究利用全光谱流式细胞术分析合成藻类-微生物群落，实现快速物种鉴定和计数 | 开发基于全光谱流式细胞术的光谱虚拟过滤系统，实现藻类群落的高通量多维分析和精确种群分离 | 需要建立标准化光谱库以提升藻类群落表征能力 | 推进合成生物学和浮游植物生态学研究 | 合成藻类-微生物群落 | 合成生物学 | NA | 全光谱流式细胞术 | NA | 光谱数据 | NA | NA | 藻类-微生物群落 | NA | 环境 |
| 42 | 2025-10-06 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614978
PMID:39386662
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研究论文 | 本研究通过定向进化开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎，显著提高了基因表达效率 | 将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒单亚基加帽酶融合，通过定向进化获得活性提高两个数量级的变体 | NA | 开发适用于真核生物的正交基因表达调控系统 | T7 RNA聚合酶与加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA | 定向进化 | 酵母, 哺乳动物细胞 | T7 RNAP为基础的遗传电路 | 医学, 工业生物技术 |
| 43 | 2024-12-06 |
An upgraded Myxococcus xanthus chassis with enhanced growth characteristics for efficient genetic manipulation
2024-Sep, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100155
PMID:39629111
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研究论文 | 本文通过工程化改造Myxococcus xanthus菌株DK1622，获得了具有增强生长特性的Hu04菌株，以提高遗传操作效率 | 通过基因工程手段，成功改造了Myxococcus xanthus菌株，使其缺乏多细胞行为和色素，同时保持营养生长和相似的代谢背景，显著改善了分散生长特性 | NA | 提高Myxococcus xanthus菌株的遗传操作效率 | Myxococcus xanthus菌株DK1622及其工程化菌株Hu04 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-11-15 |
Matching Together Living Cells and Prototissues: Will There Be Chemistry?
2024-Sep-16, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202400378
PMID:39031571
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综述 | 本文综述了合成细胞与活细胞以及原组织与活细胞系统的当前研究进展 | 探讨了非生物与生物物质有效整合的化学、生物化学和机械化学方面，为组织工程和新技术的开发提供了新的方向 | NA | 总结当前混合合成细胞/活细胞和原组织/活细胞系统的研究现状，并探讨未来的发展方向 | 合成细胞与活细胞以及原组织与活细胞的整合 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-11-07 |
Red-Shifting B12-Dependent Photoreceptor Protein via Optical Coupling for Inducible Living Materials
2024-Sep-06, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202411105
PMID:39239776
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光学耦合将B12依赖性光感受蛋白CarH的光响应从绿光转移到红/远红光的通用策略 | 通过硫醇-马来酰亚胺点击化学将含有半胱氨酸的CarH突变体标记为捕获红光的荧光团SulfoCyanine5 (Cy5)，从而使光感受蛋白获得对红光的敏感性 | NA | 开发一种新的方法来扩展B12依赖性光感受蛋白在光遗传学和活体材料中的应用 | B12依赖性光感受蛋白CarH及其在活体材料中的应用 | 生物材料合成 | NA | 硫醇-马来酰亚胺点击化学 | NA | 蛋白质 | 涉及酵母细胞的基因工程改造 | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-11-02 |
Viscosity Regulation of Chemically Simple Condensates
2024-09-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c00623
PMID:39166772
|
研究论文 | 研究了不同长度的聚精氨酸链（R）和柠檬酸（CA）衍生物形成的生物分子凝聚物的粘度和液固转变行为 | 通过调整支架分子的组成，展示了一种简单的方法来调节凝聚物的性质，揭示了分子组成在控制凝聚物粘度和转变动力学中的作用 | NA | 深入理解生物分子凝聚过程，并为未来在合成生物学和疾病治疗领域的应用提供策略 | 不同长度的聚精氨酸链和柠檬酸衍生物形成的生物分子凝聚物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-11-02 |
Peptide-Based Biomimetic Condensates via Liquid-Liquid Phase Separation as Biomedical Delivery Vehicles
2024-09-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c00814
PMID:39178343
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研究论文 | 本文综述了通过液-液相分离形成的基于肽的仿生凝聚物作为生物医学递送载体的最新进展 | 本文介绍了通过液-液相分离形成的基于肽的仿生凝聚物，这些凝聚物可以模拟生物分子凝聚物的相分离行为和生物物理特性，并具有作为生物医学递送载体的潜力 | NA | 探讨基于肽的仿生凝聚物的设计和构建，以及其在生物医学递送中的应用前景 | 基于肽的仿生凝聚物及其在生物医学递送中的应用 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-10-24 |
CryptKeeper: a negative design tool for reducing unintentional gene expression in bacteria
2024-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.611466
PMID:39282447
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研究论文 | 介绍了一种名为CryptKeeper的软件工具，用于减少细菌中无意基因表达 | 开发了一种新的软件工具CryptKeeper，能够可视化预测细菌基因表达信号并估计DNA序列可能的翻译负担 | NA | 开发一种工具来减少细菌中无意基因表达，从而避免实验中的遗传不稳定性和信号干扰 | 细菌中的基因表达信号和翻译负担 | 分子生物学 | NA | NA | NA | DNA序列 | 涉及多个已发表的例子，包括真核病毒感染克隆和单个蛋白质 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-10-24 |
Characterization and Degradation of Triphenylmethane Dyes and Their Leuco-Derivatives by Heterologously Expressed Laccase From Coprinus cinerea
2024-Sep, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.4127
PMID:39420654
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法优化了来自Coprinus cinerea的漆酶基因Lcc1，并在Pichia pastoris中异源表达，评估了其对三苯甲烷染料及其无色衍生物的降解能力 | 通过合成生物学方法优化了漆酶基因Lcc1，并在Pichia pastoris中成功表达，展示了其对三苯甲烷染料的高效降解能力 | 研究主要集中在实验室条件下漆酶的表达和降解能力，未涉及实际环境中的应用效果 | 优化漆酶基因的表达，研究其对有机污染物的降解能力，为环境修复提供新方案 | Coprinus cinerea的漆酶基因Lcc1及其对三苯甲烷染料的降解 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-10-20 |
Revolutionizing Molecular Design for Innovative Therapeutic Applications through Artificial Intelligence
2024-Sep-29, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29194626
PMID:39407556
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综述 | 本文综述了机器学习、人工智能和分子建模在计算蛋白质工程领域的最新进展及其在创新治疗应用中的革命性作用 | 本文介绍了深度学习、强化学习和迁移学习等技术在蛋白质结构预测、结合亲和力优化和酶设计方面的显著改进，以及这些创新如何简化了蛋白质工程流程 | 本文指出计算预测与实验验证之间的差距以及与AI驱动的蛋白质设计相关的伦理问题是当前面临的挑战 | 本文旨在全面概述计算方法在蛋白质工程中的当前状态和未来方向，强调其在创造下一代生物制剂和推进合成生物学方面的变革潜力 | 本文研究对象为计算蛋白质工程中的机器学习、人工智能和分子建模技术及其在生物技术和医学中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习、强化学习、迁移学习 | NA | 蛋白质结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-10-20 |
Discovery of megapolipeptins by genome mining of a Burkholderiales bacteria collection
2024-Sep-13, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc03594a
PMID:39309087
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研究论文 | 本文通过基因组挖掘技术，从316株根际来源的伯克霍尔德菌属细菌中发现了新型天然产物megapolipeptins | 本文采用基因组学驱动和合成生物学辅助的方法，成功激活了原本沉默的生物合成基因簇，发现了结构独特的新型天然产物megapolipeptins | NA | 发现新型天然产物 | 根际来源的伯克霍尔德菌属细菌 | NA | NA | 基因组挖掘 | NA | 基因组数据 | 316株根际来源的伯克霍尔德菌属细菌 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-10-19 |
Identification and Characterization of an R-M System in Paracoccus denitrifican DYTN-1 to Improve the Plasmid Conjugation Transfer Efficiency
2024-Sep-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02041
PMID:39155392
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研究论文 | 本文研究了Paracoccus denitrifican DYTN-1菌株中的R-M系统，并通过人工改造质粒提高其接合转移效率 | 首次鉴定并表征了DYTN-1菌株中的R-M系统，开发了质粒人工改造方法显著提高了接合转移效率 | NA | 提高DYTN-1菌株的质粒接合转移效率，增强其基因编辑能力 | Paracoccus denitrifican DYTN-1菌株及其R-M系统 | 合成生物学 | NA | 质粒人工改造 | NA | DNA | 1株菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-10-18 |
Leveraging artificial intelligence in vaccine development: A narrative review
2024-09, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2024.106998
PMID:39019262
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综述 | 本文综述了人工智能在疫苗开发中的应用，重点关注抗原选择、表位预测、佐剂识别和优化策略 | 人工智能算法利用基因组数据、蛋白质结构和免疫系统相互作用，预测抗原表位、评估免疫原性并优先选择抗原进行实验 | 数据异质性、模型可解释性和监管考虑是实现人工智能在疫苗开发中全部潜力的挑战 | 探讨人工智能在疫苗开发中的作用，加速安全有效疫苗的交付 | 抗原选择、表位预测、佐剂识别和优化策略 | 机器学习 | NA | 机器学习和深度学习 | NA | 基因组数据、蛋白质结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-10-11 |
Universal CRISPR-Cas12a and Toehold RNA Cascade Reaction on Paper Substrate for Visual Salmonella Genome Detection
2024-Sep, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202400508
PMID:38683016
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研究论文 | 本文介绍了一种在纸基底上使用CRISPR-Cas12a和重组酶聚合酶扩增（RPA）的合成生物学级联反应，用于可视化检测沙门氏菌基因组 | 该方法通过设计一个标准的toehold RNA开关，能够区分两种不同的沙门氏菌血清型，无需重新设计toehold RNA开关，具有高灵敏度和广泛适用性 | NA | 开发一种快速、准确且适用于现场检测沙门氏菌基因组的方法 | 沙门氏菌的基因组检测 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a, 重组酶聚合酶扩增 (RPA) | NA | 基因组 | 在纸基底上检测到最少100个沙门氏菌基因组拷贝，并在受污染的牛奶和生菜样本中成功应用 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-10-11 |
A hierarchy of metabolite exchanges in metabolic models of microbial species and communities
2024-Sep, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012472
PMID:39325831
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研究论文 | 本文研究了微生物物种和群落代谢模型中的代谢物交换层次结构 | 提出了通过关注代谢子网络（如细胞间的代谢物交换和与环境的交换）来提高代谢网络分析的可扩展性 | 无偏方法由于组合爆炸问题，在大规模网络中扩展性较差 | 研究代谢网络中的代谢物交换层次结构，并探讨其在代谢工程和合成生物学领域的应用 | 微生物物种和群落的代谢模型 | 代谢工程 | NA | 代谢通量分析 | NA | 代谢网络模型 | 涉及从中心碳代谢到基因组规模的多种模型 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-10-09 |
Geometric deep learning of protein-DNA binding specificity
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02372-w
PMID:39103447
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepPBS的几何深度学习模型，用于预测蛋白质-DNA结合特异性 | 提出了DeepPBS模型，能够从蛋白质-DNA结构中预测结合特异性，并提取可解释的蛋白质重原子重要性分数 | NA | 旨在通过几何深度学习模型预测蛋白质-DNA结合特异性，以理解基因调控 | 蛋白质-DNA结合特异性 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 蛋白质-DNA结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-10-04 |
Probing the orthogonality and robustness of the mammalian RNA-binding protein Musashi-1 in Escherichia coli
2024-Sep-30, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00448-x
PMID:39350178
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研究论文 | 研究探讨了哺乳动物RNA结合蛋白Musashi-1在Escherichia coli中的正交性和鲁棒性 | 首次将哺乳动物Musashi蛋白作为翻译调控因子在Escherichia coli中进行功能研究，并揭示了其在转录后调控中的作用 | 研究中发现合成电路在约40代后失去功能，表明其稳定性有限 | 探索RNA识别基序（RRMs）在原核生物中的功能及其在生物技术和医学应用中的潜力 | Musashi-1蛋白及其在Escherichia coli中的表达对转录组和翻译组的影响 | 生物技术 | NA | 高通量RNA测序 | NA | RNA序列 | 约40代Escherichia coli | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-10-04 |
Data-Driven Design of Triple-Targeted Protein Nanoprobes for Multiplexed Imaging of Cancer Lymphatic Metastasis
2024-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202405877
PMID:38889909
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研究论文 | 本文介绍了一种基于数据驱动设计和合成生物学组装策略的三靶向蛋白质纳米探针，用于癌症淋巴转移的多重成像 | 本文创新性地设计了能够特异性结合三种靶点的蛋白质纳米探针，并通过数据驱动的方法和合成生物学策略实现了对癌症淋巴转移的多重成像 | 本文的研究主要集中在胃癌患者的淋巴结组织，未来需要进一步验证其在其他癌症类型中的适用性 | 开发一种有效的纳米探针，用于成像高度异质性的癌症淋巴转移 | 癌症淋巴转移的多重成像 | 生物医学工程 | 胃癌 | 合成生物学 | NA | 组织样本 | 19例新鲜切除的人类胃癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-10-02 |
Engineering quorum sensing-based genetic circuits enhances growth and productivity robustness of industrial E. coli at low pH
2024-Sep-28, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02524-9
PMID:39342182
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研究论文 | 研究通过工程化群体感应基因电路，增强工业E. coli在低pH条件下的生长和生产力稳定性 | 利用Esa型群体感应电路动态调控酸抗性模块（DsrA-Hfq）的表达，实现按需和适量调控 | NA | 增强E. coli在工业发酵中低pH条件下的稳定性和生产力 | 工业E. coli菌株在低pH条件下的生长和生产力 | 合成生物学 | NA | 群体感应电路 | NA | NA | 工业E. coli菌株SCEcL3及其亲本菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-10-02 |
Immunometabolic Circuits in Infection for Advancing Host Directed Therapies
2024-Sep-13, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66980
PMID:39345111
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学方法开发基于四环素调控的合成电路，以递送琥珀酸脱氢酶作为治疗剂，消除细胞内利什曼原虫的研究 | 首次提出利用合成生物学方法开发基于四环素调控的合成电路，递送琥珀酸脱氢酶作为治疗剂，消除细胞内利什曼原虫 | 研究仅在鼠巨噬细胞系中进行，尚未在临床试验中验证 | 开发基于合成生物学的新疗法，靶向宿主相关因子，治疗利什曼病 | 利什曼原虫感染的鼠巨噬细胞 | 合成生物学 | 利什曼病 | 合成生物学 | NA | 细胞 | 鼠巨噬细胞系 | NA | NA | NA | NA |