合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2024-09-21	Evaluating the Contribution of Model Complexity in Predicting Robustness in Synthetic Genetic Circuits 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00708 PMID:39264040	研究论文	本文比较了三种不同遗传电路实现的五种计算模型，评估其在预测合成电路性能和噪声韧性方面的相对预测能力	探讨了在缺乏特征化部件或现有设计的情况下，简单模型是否能与复杂模型得出相似结论，并评估了不同模型在分析上的优势	当需要准确量化失败概率时，使用更精确的模型需要额外的努力	评估模型复杂性在预测合成遗传电路鲁棒性中的贡献	三种不同遗传电路实现的五种计算模型	合成生物学	NA	计算建模	NA	模拟数据	五种计算模型，三种遗传电路实现
62	2024-09-21	Yeast Surface-Displayed Quenchbody as a Novel Whole-Cell Biosensor for One-Step Detection of Influenza A (H1N1) Virus 2024-Sep-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00317 PMID:39256183	研究论文	开发了一种基于酵母表面展示的Quenchbody新型全细胞生物传感器，用于一步检测流感A（H1N1）病毒	提出了一种新的全细胞生物传感器设计，通过在酵母细胞表面展示VHH-based quenchbody，实现对流感A（H1N1）病毒的一步检测，避免了分析物进入生物传感器细胞的需求	NA	开发一种敏感、高效且成本效益高的方法来检测空气中的病毒，以防止传染病的传播并保障人类健康	流感A（H1N1）病毒及其血凝素蛋白H1N1-HA	生物传感器	流感	酵母表面展示技术	NA	生物分子	17种VHH抗体片段
63	2024-09-21	Exploring the potential of plant astrobiology: adapting flora for extra-terrestrial habitats: a review 2024-Sep-20, Biologia futura IF:1.8Q3 DOI:10.1007/s42977-024-00245-z PMID:39302628	综述	探讨植物天体生物学领域，研究地球植物适应外星环境的可能性及其在太空任务中的应用	结合植物学和天体生物学，探讨植物在太空和其他天体上生存和繁殖的适应机制	主要集中在理论探讨和现有研究的综述，缺乏实际实验数据	探讨植物天体生物学的潜力及其在太空探索中的应用	地球植物在外星环境中的适应性和生存机制	NA	NA	基因改造和合成生物学技术	NA	NA	NA
64	2024-09-21	Tunable cell differentiation via reprogrammed mating-type switching 2024-Sep-17, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52282-w PMID:39289346	研究论文	本研究通过合成生物学方法重新编程酵母的交配类型转换机制，实现可调节的细胞分化	引入了一种合成生物学方法，重新编程酵母的交配类型转换机制，用于可调节的细胞分化，促进合成微生物群落的形成和合作	NA	开发一种新的合成生物学方法，用于可调节的细胞分化和微生物群落合作	酵母的交配类型转换机制和微生物群落的合作	合成生物学	NA	遗传逻辑门工程	NA	NA	NA
65	2024-09-20	Pangenomic landscapes shape performances of a synthetic genetic circuit across Stutzerimonas species 2024-Sep-17, mSystems IF:5.0Q1 DOI:10.1128/msystems.00849-24 PMID:39166875	研究论文	研究探讨了基因电路在不同Stutzerimonas物种中的性能差异，揭示了基因组结构和功能对底盘效应的影响	通过泛基因组分析和基因表达定量测量，揭示了核心基因组的差异表达是影响基因电路性能的主要因素	研究仅限于六个密切相关的非模式细菌宿主，可能无法完全代表所有微生物的情况	研究基因组和生理环境如何影响基因电路在不同微生物中的性能，以改进跨多样微生物的生物设计策略	六个密切相关的Stutzerimonas物种中的基因电路性能	合成生物学	NA	泛基因组分析	NA	基因表达数据	六个密切相关的Stutzerimonas物种
66	2024-09-20	CRISPR/Cas9-based genome engineering in the filamentous fungus Rhizopus oryzae and its application to L-lactic acid production 2024-Sep, Biotechnology journal IF:3.2Q2 DOI:10.1002/biot.202400309 PMID:39295562	研究论文	开发了一种适用于丝状真菌Rhizopus oryzae的高效CRISPR-Cas9基因编辑系统，并应用于L-乳酸生产	首次开发了适用于Rhizopus oryzae的CRISPR-Cas9基因编辑系统，并成功应用于代谢工程调控和合成生物学改造	NA	开发适用于Rhizopus oryzae的基因编辑工具，并应用于提高L-乳酸产量	丝状真菌Rhizopus oryzae及其基因组编辑	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9基因编辑	NA	基因组数据	NA
67	2024-09-19	Intracellular Construction of Organelle-like Compartments Facilitates Metabolic Flux in Escherichia coli 2024-Sep-18, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c06895 PMID:39230507	研究论文	本文利用Wnt信号通路中的DIX结构域构建了细菌内的合成隔室，以增强代谢通量	首次使用DIX结构域及其相互作用基序构建了细菌内的合成隔室，显著增强了代谢通量	NA	研究在细菌内构建稳定的合成隔室以增强代谢通量的方法	大肠杆菌内的合成隔室及其对代谢通量的影响	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
68	2024-09-19	Engineering Yarrowia lipolytica for Efficient Synthesis of Geranylgeraniol 2024-Sep-18, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c06749 PMID:39241196	研究论文	本文通过合成生物学方法改造Yarrowia lipolytica，高效合成Geranylgeraniol	通过表达异源磷酸酶基因、增强前体供应和下调角鲨烯合成途径，实现了Geranylgeraniol的高效合成，创下了摇瓶中Geranylgeraniol产量的新纪录	NA	提高Geranylgeraniol的合成效率	Yarrowia lipolytica	合成生物学	NA	合成生物学	NA	NA	NA
69	2024-09-19	RNA exon editing: Splicing the way to treat human diseases 2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids DOI:10.1016/j.omtn.2024.102311 PMID:39281698	综述	本文综述了RNA外显子编辑作为一种治疗策略，通过诱导合成RNA分子与内源性前mRNA目标之间的剪接，纠正致病突变，恢复功能性mRNA和蛋白质	本文介绍了RNA外显子编辑的新进展，包括在临床试验中的首次应用，以及如何利用现代合成生物学、下一代测序和生物信息学的进步，开发新的RNA外显子编辑分子	NA	探讨RNA外显子编辑在治疗人类疾病中的应用及其发展历程	RNA外显子编辑技术及其在治疗遗传性疾病中的应用	基因治疗	遗传性疾病	RNA剪接	NA	NA	NA
70	2024-09-19	Laws of thought in living cells 2024-Sep-05, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.08.005 PMID:39241745	研究论文	本文介绍了一种基于三态逻辑的生物计算平台TriLoS，旨在提高生物计算的复杂性	TriLoS平台提供了一种扩展生物计算复杂性的解决方案，超越了原理验证阶段	NA	开发一种能够扩展生物计算复杂性的新型平台	TriLoS三态逻辑合成平台	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
71	2024-09-19	Temporal epigenome modulation enables efficient bacteriophage engineering and functional analysis of phage DNA modifications 2024-Sep, PLoS genetics IF:4.0Q1 DOI:10.1371/journal.pgen.1011384 PMID:39231196	研究论文	研究利用NgTET酶暂时减少噬菌体DNA修饰，提高CRISPR-Cas系统介导的突变效率，并分析了这些修饰对噬菌体感染的影响	首次利用NgTET酶暂时减少噬菌体DNA修饰，提高CRISPR-Cas系统介导的突变效率，并揭示了这些修饰对噬菌体感染的影响	NA	探索噬菌体感染机制，提高CRISPR-Cas系统介导的突变效率	噬菌体DNA修饰及其对感染机制的影响	NA	NA	CRISPR-Cas系统	NA	DNA	NA
72	2024-09-17	Plants against cancer: towards green Taxol production through pathway discovery and metabolic engineering 2024-Sep, aBIOTECH IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s42994-024-00170-8 PMID:39279861	综述	本文综述了通过途径发现和代谢工程实现绿色紫杉醇生产的进展	利用高通量测序、基因组装配、基因合成、分析技术和合成生物学方法，高效识别和工程化酶及代谢途径，生产天然和新颖的药物候选物	植物来源药物开发的挑战包括获取和培育源物种、代谢物结构复杂性和普遍低丰度	加速药物发现并解决紧迫的人类健康问题	植物天然产物及其在抗癌药物紫杉醇生物合成中的应用	代谢工程	癌症	高通量测序、基因组装配、基因合成、分析技术、合成生物学	NA	基因组数据	NA
73	2024-09-15	Covalent recruitment of polymers and nanoparticles onto glycan-engineered cells enhances gene delivery during short exposure 2024-Sep-09, Chemical science IF:7.6Q1 DOI:10.1039/d4sc03666b PMID:39263661	研究论文	本文展示了通过在细胞表面精确工程化糖基，实现快速共价捕获聚合物/纳米颗粒复合物，从而在短时间内增强基因递送	通过细胞表面糖基的精确工程化，实现快速共价捕获聚合物/纳米颗粒复合物，显著加速基因递送过程	NA	研究通过细胞表面工程化增强非病毒基因递送效率的新方法	细胞表面糖基工程化、聚合物/纳米颗粒复合物、基因递送效率	合成生物学	NA	细胞表面工程化、聚合物/纳米颗粒复合物递送	NA	细胞、聚合物/纳米颗粒复合物	NA
74	2024-09-15	Nucleated synthetic cells with genetically driven intercompartment communication 2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2404790121 PMID:39186653	研究论文	本文介绍了一种创建具有核样隔间的合成细胞的方法，这些隔间能够封装不同的生化混合物，并实现核与细胞质隔间之间的自主化学通信	本文首次实现了合成细胞中核样隔间与细胞质隔间之间的自主化学通信，并通过现场蛋白质表达膜蛋白来实现	本文未详细讨论该技术的实际应用和潜在风险	增强合成细胞的复杂性，实现隔间间的自主信号传递	合成细胞中的核样隔间与细胞质隔间	合成生物学	NA	现场蛋白质表达	NA	生化混合物	NA
75	2024-09-15	Improvement and application of vacuum-infiltration system in tomato 2024-Sep, Horticulture research IF:7.6Q1 DOI:10.1093/hr/uhae197 PMID:39257545	研究论文	本文描述了一种改进的真空渗透系统在番茄果实和叶片中的应用	首次报道了在附着番茄果实中进行真空渗透，并成功应用于番茄生物技术研究	NA	提高番茄中瞬时表达系统的效率，并应用于番茄生物技术和合成生物学研究	番茄果实和叶片	NA	NA	真空渗透	NA	NA	涉及Micro-Tom番茄和商业品种'Emerald'及'Provence'
76	2024-09-14	Advances in metabolic engineering for enhanced acetyl-CoA availability in yeast 2024-Sep-12, Critical reviews in biotechnology IF:8.1Q1 DOI:10.1080/07388551.2024.2399542 PMID:39266266	综述	本文综述了在酵母中提高乙酰辅酶A可用性的代谢工程最新进展	强调了通过增强不同细胞器中的代谢通量、优化前体辅酶A合成、优化底物利用和修改蛋白质乙酰化水平等策略来提高乙酰辅酶A及其衍生物合成效率的新方法	NA	探讨如何通过代谢工程策略提高乙酰辅酶A及其衍生物的合成效率，以创建更有效的微生物细胞工厂	乙酰辅酶A及其衍生物的生物合成途径和代谢工程方法	代谢工程	NA	代谢工程	NA	NA	NA
77	2024-09-14	Customizable gene sensing and response without altering endogenous coding sequences 2024-Sep-12, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01733-y PMID:39266721	研究论文	本文开发了一种在不改变内源基因编码序列的情况下，将基因传感器集成到内源基因中的方法	通过在终止子区域插入单引导RNA来激活下游电路，避免了嵌入传感器对内源基因调控的不可预测影响	NA	解决将基因传感器嵌入内源基因编码序列可能导致的不可预测的基因调控问题	CHO-K1细胞中的细胞应激传感器和执行器	合成生物学	NA	CRISPR-Cas9	NA	基因表达数据	CHO-K1细胞
78	2024-09-14	A precise and sustainable doxycycline-inducible cell line development platform for reliable mammalian cell engineering with gain-of-function mutations 2024-Sep-05, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2024.09.004 PMID:39242074	研究论文	本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9技术的Tet-On3G诱导性主细胞系开发平台，用于精确和可持续的哺乳动物细胞工程	开发了一种名为ROSE的新平台，通过CRISPR/Cas9介导的位点特异性整合，实现了基因表达的精确调控和长期稳定性	NA	建立一种精确和可持续的基因表达调控系统，用于哺乳动物细胞工程	哺乳动物细胞系	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9	NA	基因表达数据	NA
79	2024-09-11	Engineered transcription activator-like effector dimer proteins confer DNA loop-dependent gene repression comparable to Lac repressor 2024-Sep-09, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae656 PMID:39077947	研究论文	本文设计了基于目标序列可编程的转录激活因子样效应物二聚体（TALED）蛋白的抑制系统，并展示了其在DNA环依赖的细菌启动子抑制中的应用	本文首次展示了通过共价结合的TALED蛋白实现强效的DNA环依赖的细菌启动子抑制，并验证了DNA环结构显著增强启动子抑制效果	本文主要集中在E. coli中的实验验证，未来需进一步研究其在其他生物系统中的适用性	设计并验证一种新型的DNA环依赖的基因抑制系统，为合成生物学和治疗应用提供新工具	转录激活因子样效应物二聚体（TALED）蛋白及其在DNA环依赖的基因抑制中的应用	合成生物学	NA	DNA环结构分析	NA	DNA序列	E. coli菌株
80	2024-09-11	Induction of bacterial expression at the mRNA level by light 2024-Sep-09, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae678 PMID:39126322	研究论文	本文利用光敏受体NmPAL在mRNA水平上诱导细菌表达，通过蓝光触发NmPAL结合破坏cis-抑制的mRNA状态，从而解除翻译起始的阻碍，上调基因表达	本文开发了一种名为riboptoregulator的光遗传学电路，能够在mRNA水平上进行基因表达调控，并能与现有基因调控电路结合，实现更精细和严格的基因表达控制	NA	开发一种在mRNA水平上进行光遗传学调控的新方法，以提高细菌基因表达的效率和精确性	细菌基因表达的调控机制	合成生物学	NA	光遗传学	NA	mRNA	NA