本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-11-02 |
Viscosity Regulation of Chemically Simple Condensates
2024-09-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c00623
PMID:39166772
|
研究论文 | 研究了不同长度的聚精氨酸链(R)和柠檬酸(CA)衍生物形成的生物分子凝聚物的粘度和液固转变行为 | 通过调整支架分子的组成,展示了一种简单的方法来调节凝聚物的性质,揭示了分子组成在控制凝聚物粘度和转变动力学中的作用 | NA | 深入理解生物分子凝聚过程,并为未来在合成生物学和疾病治疗领域的应用提供策略 | 不同长度的聚精氨酸链和柠檬酸衍生物形成的生物分子凝聚物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-11-02 |
Peptide-Based Biomimetic Condensates via Liquid-Liquid Phase Separation as Biomedical Delivery Vehicles
2024-09-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c00814
PMID:39178343
|
研究论文 | 本文综述了通过液-液相分离形成的基于肽的仿生凝聚物作为生物医学递送载体的最新进展 | 本文介绍了通过液-液相分离形成的基于肽的仿生凝聚物,这些凝聚物可以模拟生物分子凝聚物的相分离行为和生物物理特性,并具有作为生物医学递送载体的潜力 | NA | 探讨基于肽的仿生凝聚物的设计和构建,以及其在生物医学递送中的应用前景 | 基于肽的仿生凝聚物及其在生物医学递送中的应用 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-10-24 |
CryptKeeper: a negative design tool for reducing unintentional gene expression in bacteria
2024-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.611466
PMID:39282447
|
研究论文 | 介绍了一种名为CryptKeeper的软件工具,用于减少细菌中无意基因表达 | 开发了一种新的软件工具CryptKeeper,能够可视化预测细菌基因表达信号并估计DNA序列可能的翻译负担 | NA | 开发一种工具来减少细菌中无意基因表达,从而避免实验中的遗传不稳定性和信号干扰 | 细菌中的基因表达信号和翻译负担 | 分子生物学 | NA | NA | NA | DNA序列 | 涉及多个已发表的例子,包括真核病毒感染克隆和单个蛋白质 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-10-24 |
Characterization and Degradation of Triphenylmethane Dyes and Their Leuco-Derivatives by Heterologously Expressed Laccase From Coprinus cinerea
2024-Sep, Cell biochemistry and function
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/cbf.4127
PMID:39420654
|
研究论文 | 研究通过合成生物学方法优化了来自Coprinus cinerea的漆酶基因Lcc1,并在Pichia pastoris中异源表达,评估了其对三苯甲烷染料及其无色衍生物的降解能力 | 通过合成生物学方法优化了漆酶基因Lcc1,并在Pichia pastoris中成功表达,展示了其对三苯甲烷染料的高效降解能力 | 研究主要集中在实验室条件下漆酶的表达和降解能力,未涉及实际环境中的应用效果 | 优化漆酶基因的表达,研究其对有机污染物的降解能力,为环境修复提供新方案 | Coprinus cinerea的漆酶基因Lcc1及其对三苯甲烷染料的降解 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-10-20 |
Revolutionizing Molecular Design for Innovative Therapeutic Applications through Artificial Intelligence
2024-Sep-29, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29194626
PMID:39407556
|
综述 | 本文综述了机器学习、人工智能和分子建模在计算蛋白质工程领域的最新进展及其在创新治疗应用中的革命性作用 | 本文介绍了深度学习、强化学习和迁移学习等技术在蛋白质结构预测、结合亲和力优化和酶设计方面的显著改进,以及这些创新如何简化了蛋白质工程流程 | 本文指出计算预测与实验验证之间的差距以及与AI驱动的蛋白质设计相关的伦理问题是当前面临的挑战 | 本文旨在全面概述计算方法在蛋白质工程中的当前状态和未来方向,强调其在创造下一代生物制剂和推进合成生物学方面的变革潜力 | 本文研究对象为计算蛋白质工程中的机器学习、人工智能和分子建模技术及其在生物技术和医学中的应用 | 机器学习 | NA | 深度学习、强化学习、迁移学习 | NA | 蛋白质结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-10-19 |
Identification and Characterization of an R-M System in Paracoccus denitrifican DYTN-1 to Improve the Plasmid Conjugation Transfer Efficiency
2024-Sep-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2402.02041
PMID:39155392
|
研究论文 | 本文研究了Paracoccus denitrifican DYTN-1菌株中的R-M系统,并通过人工改造质粒提高其接合转移效率 | 首次鉴定并表征了DYTN-1菌株中的R-M系统,开发了质粒人工改造方法显著提高了接合转移效率 | NA | 提高DYTN-1菌株的质粒接合转移效率,增强其基因编辑能力 | Paracoccus denitrifican DYTN-1菌株及其R-M系统 | 合成生物学 | NA | 质粒人工改造 | NA | DNA | 1株菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-10-18 |
Leveraging artificial intelligence in vaccine development: A narrative review
2024-09, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2024.106998
PMID:39019262
|
综述 | 本文综述了人工智能在疫苗开发中的应用,重点关注抗原选择、表位预测、佐剂识别和优化策略 | 人工智能算法利用基因组数据、蛋白质结构和免疫系统相互作用,预测抗原表位、评估免疫原性并优先选择抗原进行实验 | 数据异质性、模型可解释性和监管考虑是实现人工智能在疫苗开发中全部潜力的挑战 | 探讨人工智能在疫苗开发中的作用,加速安全有效疫苗的交付 | 抗原选择、表位预测、佐剂识别和优化策略 | 机器学习 | NA | 机器学习和深度学习 | NA | 基因组数据、蛋白质结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-10-09 |
Geometric deep learning of protein-DNA binding specificity
2024-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02372-w
PMID:39103447
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepPBS的几何深度学习模型,用于预测蛋白质-DNA结合特异性 | 提出了DeepPBS模型,能够从蛋白质-DNA结构中预测结合特异性,并提取可解释的蛋白质重原子重要性分数 | NA | 旨在通过几何深度学习模型预测蛋白质-DNA结合特异性,以理解基因调控 | 蛋白质-DNA结合特异性 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 蛋白质-DNA结构 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-10-04 |
Probing the orthogonality and robustness of the mammalian RNA-binding protein Musashi-1 in Escherichia coli
2024-Sep-30, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00448-x
PMID:39350178
|
研究论文 | 研究探讨了哺乳动物RNA结合蛋白Musashi-1在Escherichia coli中的正交性和鲁棒性 | 首次将哺乳动物Musashi蛋白作为翻译调控因子在Escherichia coli中进行功能研究,并揭示了其在转录后调控中的作用 | 研究中发现合成电路在约40代后失去功能,表明其稳定性有限 | 探索RNA识别基序(RRMs)在原核生物中的功能及其在生物技术和医学应用中的潜力 | Musashi-1蛋白及其在Escherichia coli中的表达对转录组和翻译组的影响 | 生物技术 | NA | 高通量RNA测序 | NA | RNA序列 | 约40代Escherichia coli | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-10-02 |
Engineering quorum sensing-based genetic circuits enhances growth and productivity robustness of industrial E. coli at low pH
2024-Sep-28, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02524-9
PMID:39342182
|
研究论文 | 研究通过工程化群体感应基因电路,增强工业E. coli在低pH条件下的生长和生产力稳定性 | 利用Esa型群体感应电路动态调控酸抗性模块(DsrA-Hfq)的表达,实现按需和适量调控 | NA | 增强E. coli在工业发酵中低pH条件下的稳定性和生产力 | 工业E. coli菌株在低pH条件下的生长和生产力 | 合成生物学 | NA | 群体感应电路 | NA | NA | 工业E. coli菌株SCEcL3及其亲本菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-10-01 |
Enzymatic Characterization of SpPAL Genes in S. polyrhiza and Overexpression of the SpPAL3
2024-Sep-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13182607
PMID:39339582
|
研究论文 | 研究了巨型浮萍中的PAL基因,并探讨了SpPAL3基因的过表达对植物生长的影响 | 首次在巨型浮萍中鉴定并克隆了三个PAL基因,并研究了其在植物生长和次生代谢中的作用 | NA | 研究巨型浮萍中PAL基因的功能及其在植物生长和次生代谢中的作用 | 巨型浮萍中的PAL基因及其编码蛋白 | NA | NA | qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-10-01 |
Production of Terpene Trilactones from Cell and Organ Cultures of Ginkgo biloba
2024-Sep-13, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13182575
PMID:39339550
|
综述 | 本文综述了利用银杏细胞和器官培养生产萜三萜内酯的研究策略 | 介绍了通过代谢工程和合成生物学方法进行异源生产萜三萜内酯的创新 | 银杏生长缓慢,成熟期长,且萜三萜内酯的积累受年龄、性别、季节和地理因素影响 | 探讨利用细胞培养技术高效生产银杏中的萜三萜内酯 | 银杏细胞和器官培养中的萜三萜内酯生产 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-09-30 |
Editorial overview: Plant synthetic biology
2024-Sep-27, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103211
PMID:39340896
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-09-26 |
START: A Versatile Platform for Bacterial Ligand Sensing with Programmable Performances
2024-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402029
PMID:39075726
|
研究论文 | 介绍了一种名为START的新型平台,用于配体响应基因调控 | 结合了细菌配体感应系统和合成基因调控开关,实现了多种配体的合成生物传感器 | NA | 开发一种多功能平台,用于细菌配体感应和基因调控 | 细菌配体感应系统和基因调控 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-09-27 |
[Research progress in bacterial cellulose synthase subunit diversity and fiber structure formation]
2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230829
PMID:39319708
|
综述 | 本文综述了细菌纤维素合成酶亚基多样性及其纤维结构形成的最新研究进展 | 详细阐述了细菌纤维素合成机制、合成酶亚基间的相互作用以及菌株结构特征与高度有序纤维结构形成之间的关系 | NA | 总结细菌纤维素生产菌株及其合成酶的差异,探讨细菌纤维素合成与分泌机制 | 细菌纤维素合成酶及其亚基多样性,纤维结构形成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-09-27 |
[Biosafety risks, control, and biocontainment of engineered microalgae]
2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230812
PMID:39319717
|
研究论文 | 本文总结了前沿生物技术在微藻工程中的应用,以及工程微藻逃逸带来的生物安全风险和管理法规,并介绍了针对工程微藻的新型生物遏制技术的进展 | 本文介绍了基于有毒蛋白的kill switch设计和敲除必需基因以构建营养缺陷型菌株等新型生物遏制技术 | NA | 探讨工程微藻的生物安全风险及其控制和管理技术 | 工程微藻及其在自然环境中的生存和扩散 | 生物技术 | NA | 合成生物学和基因编辑技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-09-26 |
From β-Carotene to Retinoids: A Review of Microbial Production of Vitamin A
2024-Sep-25, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06851
PMID:39285668
|
综述 | 本文综述了从β-胡萝卜素到视黄醇的微生物生产维生素A的过程 | 介绍了利用合成生物学通过微生物细胞工厂进行维生素A生物合成的创新方法 | 仍面临挑战,如优化维生素A生物合成的策略和未来发展方向 | 探讨微生物生产维生素A的现状和未来发展方向 | 维生素A的生物合成过程及其在食品、制药和动物饲料行业的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-09-26 |
[Developing a curriculum cluster in "Synthetic Biology" to cultivate inter-disciplinary and innovative talents for biomanufacturing]
2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.230637
PMID:39319741
|
研究论文 | 本文介绍了华东理工大学在合成生物学领域建立的课程集群,旨在培养生物制造领域的跨学科和创新型人才 | 通过整合合成生物学的核心课程和相关学科,利用国内外知名教授的讲座和丰富的资源,提升学生的创新能力 | NA | 培养生物制造领域的跨学科和创新型人才 | 合成生物学课程集群及其对学生创新能力的提升 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-09-26 |
[Design and practice of integrating artificial intelligence into the teaching of "Synthetic Biology" under the background of discipline crossing]
2024-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240317
PMID:39319740
|
研究论文 | 本文探讨了在学科交叉背景下,将人工智能融入合成生物学教学的设计与实践 | 提出了将人工智能与合成生物学教学内容相结合的系统设计,并介绍了在江南大学合成生物学课程中的具体实施路径 | 未详细说明具体的教学效果评估方法 | 探讨如何将人工智能融入合成生物学教学,以培养跨学科高水平人才和促进协同创新 | 合成生物学课程的教学内容和方法 | 合成生物学 | NA | 人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-09-26 |
Y-switch: a spring-loaded synthetic gene switch for robust DNA/RNA signal amplification and detection
2024-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae680
PMID:39149901
|
研究论文 | 介绍了一种名为Y-Switch的新型TMSD级联设计,用于增强DNA/RNA信号的检测和放大 | Y-Switch设计基于一对热力学弹簧加载的DNA模块,能够在无正确触发器的情况下实现高灵敏度和零背景信号 | NA | 开发一种经济且高效的核酸检测方法,用于生物医学诊断 | Zika病毒和严重急性呼吸综合征冠状病毒2的核酸序列 | 合成生物学 | NA | toehold介导的链置换(TMSD) | NA | 核酸序列 | Zika病毒和严重急性呼吸综合征冠状病毒2的核酸序列 | NA | NA | NA | NA |