合成生物学相关文章
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当前共找到 112 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-09-10 |
Hindered intermolecular stacking of anti-parallel telomeric G-quadruplexes
2024-Sep-14, The Journal of chemical physics
IF:3.1Q1
DOI:10.1063/5.0225371
PMID:39248241
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研究论文 | 研究了反平行端粒G四链体在自拥挤条件下的端到端堆叠行为 | 开发了一种高效的粗粒度拟合工具，成功描述了单体和二聚体G四链体的平衡混合物 | NA | 探讨G四链体拓扑结构对其相互作用的影响 | 反平行端粒G四链体的堆叠行为 | NA | NA | 小角X射线散射 | 粗粒度拟合工具 | G四链体结构数据 | 使用序列AG3(T2AG3)3形成的反平行端粒G四链体 |
| 82 | 2024-09-10 |
Transforming drug development with synthetic biology and AI
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.008
PMID:38383215
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学和人工智能在药物开发中的应用，特别是在COVID-19大流行背景下RNA平台药物开发的挑战和解决方案 | 结合合成生物学和人工智能模型，提出了一种新的药物开发方法 | NA | 探索合成生物学和人工智能在药物开发中的应用，解决药物候选物识别的难题 | 药物开发中的RNA平台和药物候选物 | 机器学习 | NA | 合成生物学 | 人工智能模型 | NA | NA |
| 83 | 2024-09-08 |
Genome-wide identification of the phenylalanine ammonia-lyase gene from Epimedium Pubescens Maxim. (Berberidaceae): novel insight into the evolution of the PAL gene family
2024-Sep-04, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-024-05480-z
PMID:39232677
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研究论文 | 本研究全面探索了Epimedium pubescens中的PAL基因家族，揭示了其进化历程和在黄酮醇糖苷、花青素和木质素生物合成中的潜在作用 | 首次全面分析了Epimedium pubescens中的PAL基因家族，揭示了其独特的进化起源和在不同组织中的功能 | 需要进一步实验验证EpPAL2和EpPAL3在花青素生物合成中的作用 | 研究Epimedium pubescens中PAL基因家族的进化及其在黄酮醇糖苷和花青素生物合成中的作用 | Epimedium pubescens中的PAL基因家族及其在植物代谢中的功能 | 分子生物学 | NA | 基因组分析 | NA | 基因序列 | 7个PAL基因（EpPAL1-EpPAL7） |
| 84 | 2024-09-08 |
Understanding the Role of Layered Minerals in the Emergence and Preservation of Proto-Proteins and Detection of Traces of Early Life
2024-Sep-03, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.4c00173
PMID:39141709
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研究论文 | 本文探讨了分层矿物在原生蛋白质的形成和早期生命痕迹的保存中的作用 | 提出了矿物作为环境循环现象信息转录者的观点，并建议了一种识别伪生物标志物的方法 | 实验室实验无法复制所有早期行星的过程和样本 | 深入理解生命起源的化学和地质过程，并探索矿物在其中的作用 | 分层矿物在生命起源和生物标志物保存中的作用 | NA | NA | 分子建模技术 | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-09-08 |
Killer yeasts: expanding frontiers in the age of synthetic biology
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.003
PMID:38575438
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评论 | 本文探讨了合成生物学时代下杀伤性酵母的潜力及其在抗真菌耐药性和食品安全方面的应用 | 本文提出利用合成生物学技术解锁杀伤性酵母系统的全部潜力，并设想重新设计宿主双链RNA真菌病毒作为安全且无感染性的系统来生产设计RNA | 尽管经过数十年的研究，杀伤性酵母的广泛应用仍受到一些限制 | 探讨合成生物学技术在杀伤性酵母系统中的应用潜力 | 杀伤性酵母及其分泌的蛋白质毒素 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-09-08 |
Measuring the economic efficiency of laboratory automation in biotechnology
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.02.001
PMID:38402137
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研究论文 | 本文提出了一种实验价格指数（EPI），用于量化比较实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的时间、成本和样本数量因素，以评估其经济效率 | 本文创新性地提出了实验价格指数（EPI），用于量化实验室自动化的经济效率 | NA | 评估实验室自动化在生物技术项目中的经济效率 | 实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的应用 | 生物技术 | NA | 实验室自动化 | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-09-07 |
Mutagenesis techniques for evolutionary engineering of microbes - exploiting CRISPR-Cas, oligonucleotides, recombinases, and polymerases
2024-Sep, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.02.006
PMID:38493013
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综述 | 本文综述了利用CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶和聚合酶等技术进行微生物进化工程的诱变技术 | 本文总结了进化工程领域中模型微生物的最新发展和方法，特别强调了体内技术在精准发酵代谢途径优化中的应用 | NA | 探讨如何通过体内外方法增加宿主的遗传多样性，特别是体内技术在代谢途径优化中的应用 | 微生物及其在工业环境中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶、聚合酶 | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-09-06 |
Optimizing Promoters and Subcellular Localization for Constitutive Transgene Expression in Marchantia polymorpha
2024-Sep-03, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcae063
PMID:38822700
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研究论文 | 研究优化了苔藓植物Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位，以实现持续的转基因表达 | 发现了新的启动子，这些启动子在所有组织中都能驱动高水平的基因表达，且不会对生长造成负担，并证明了细胞质是异源蛋白表达的最佳亚细胞定位 | NA | 优化Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位，以实现持续的转基因表达 | Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-09-06 |
Advancing CRISPR base editing technology through innovative strategies and ideas
2024-Sep-02, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2699-5
PMID:39231901
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研究论文 | 本文探讨了CRISPR系统中非DSB编辑器BE和PE的发展与创新 | 提出了改进BE和PE开发的创新策略，如替代、组合、适应和调整，并总结了CRISPR技术创新的巧妙思路 | NA | 探讨CRISPR/Cas基因编辑技术的创新及其在各领域的应用前景 | CRISPR系统中的非DSB编辑器BE和PE | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas基因编辑技术 | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-09-06 |
Zero-shot prediction of mutation effects with multimodal deep representation learning guides protein engineering
2024-Sep, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00989-2
PMID:38969803
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ProMEP的多模态深度表示学习方法，用于零样本预测蛋白质突变效应，并指导蛋白质工程 | ProMEP通过多模态深度学习模型，从约1.6亿个蛋白质中全面学习序列和结构上下文，实现了突变效应的零样本预测，显著提高了预测速度和准确性 | NA | 开发一种能够准确预测蛋白质突变效应并指导蛋白质工程的方法 | 蛋白质突变效应的预测和基因编辑酶TnpB和TadA的工程化 | 生物信息学 | NA | 多模态深度表示学习 | 多模态深度学习模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 约1.6亿个蛋白质 |
| 91 | 2024-09-01 |
Engineering immune-evasive allogeneic cellular immunotherapies
2024-Sep, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-024-01022-8
PMID:38658708
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研究论文 | 本文讨论了如何通过赋予同种异体T细胞和自然杀伤（NK）细胞内在的免疫逃避特性，来防止或延迟它们的免疫排斥，从而扩大治疗窗口 | 探讨了利用基因编辑和合成生物学设计基于细胞的精准免疫疗法的前景，超越了编程靶向特异性，需要仔细考虑受体中的先天和适应性反应 | NA | 旨在改善现成的同种异体细胞疗法的持久性，并设计基于细胞的精准免疫疗法 | 同种异体T细胞和NK细胞 | 免疫疗法 | 癌症 | 基因编辑和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-29 |
Posttranscriptional tuning of gene expression over a large dynamic range in synthetic tobacco chloroplast operons
2024-Sep, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16930
PMID:39031552
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研究论文 | 本研究探讨了烟草叶绿体中gfp报告基因的表达，通过使用叶绿体atpH 5' UTR的变体，揭示了内源性烟草PPR10在不同设计背景下与烟草和玉米atpH 5' UTR结合时对报告基因激活的不同水平 | 研究发现了PPR10通过一种独立于其稳定单顺反子转录本的机制激活翻译，并且引入tRNA上游的UTR几乎消除了gfp mRNA和GFP蛋白，这表明tRNA促进了RNA切割和5'外切核酸酶降解，导致PPR10没有足够时间结合和保护gfp RNA | NA | 探索在合成烟草叶绿体操纵子中实现基因表达的转录后调控 | gfp报告基因在烟草叶绿体中的表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | RNA | 不同设计的烟草和玉米atpH 5' UTR变体 |
| 93 | 2024-08-27 |
Exploring genetic codon expansion for unnatural amino acid incorporation in filamentous fungus Aspergillus nidulans
2024-Sep-20, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.018
PMID:39067577
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研究论文 | 本研究在丝状真菌Aspergillus nidulans中开发了遗传密码扩展技术，实现了非天然氨基酸的掺入 | 首次在丝状真菌中成功开发遗传密码扩展技术，为研究真菌蛋白质结构和功能提供了新方法 | NA | 旨在填补丝状真菌在遗传密码扩展技术应用方面的空白 | Aspergillus nidulans中的蛋白质合成 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 蛋白质 | NA |
| 94 | 2024-08-17 |
Synthetic microbial communities: A gateway to understanding resistance, resilience, and functionality in spontaneously fermented food microbiomes
2024-Sep, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2024.114780
PMID:39147468
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综述 | 本文综述了自发发酵食品微生物群落的复杂特性，这些特性有助于抵抗性、恢复力和功能性驱动因素 | 合成微生物群落（SMCs）作为机制洞察和微生物群落战略性重编程的门户，为发酵食品微生物群落提供了细致的理解和控制 | 在实现SMCs的稳定性和可重复性方面存在挑战，主要源于非标准化方法 | 探讨合成微生物群落在自发发酵食品微生物群落中的应用及其优化食品加工的潜力 | 自发发酵食品的微生物群落及其在食品加工中的应用 | 微生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 微生物群落数据 | NA |
| 95 | 2024-08-15 |
Expanding the synthetic biology repertoire of a fast-growing cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 11801
2024-Sep, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28740
PMID:38773863
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研究论文 | 研究通过全局转录组分析，鉴定了Synechococcus elongatus PCC 11801中的48个高转录数基因的天然启动子，并利用荧光报告系统对其进行了特性分析。同时，通过基因组数据和蛋白质组分析，识别了534个操纵子，并系统地鉴定了15个表现出下游基因高蛋白表达的基因间区域，用于识别核糖体结合位点（RBSs）。 | 本研究扩展了Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱，包括启动子元件和核糖体结合位点，为加速PCC 11801的生物工程提供了多样化的启动子和RBS序列库。 | NA | 扩展Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱，以促进其作为潜在细胞工厂的应用。 | Synechococcus elongatus PCC 11801的天然启动子和核糖体结合位点。 | 合成生物学 | NA | 全局转录组分析，荧光报告系统 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 48个天然启动子，534个操纵子，15个基因间区域 |
| 96 | 2024-08-15 |
Transcriptional upregulation of the myo-inositol biosynthesis pathway is enhanced by NFAT5 in hyperosmotically stressed tilapia cells
2024-Sep-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00187.2024
PMID:38946247
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研究论文 | 本文研究了莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下肌醇生物合成途径的上调，并探讨了NFAT5在此过程中的作用 | 首次证明了NFAT5作为罗非鱼转录因子，参与高渗应激下肌醇生物合成途径的激活 | 除了NFAT5外，还需要其他强渗透应激信号机制来完全激活罗非鱼基因 | 探讨NFAT5在罗非鱼细胞高渗应激下肌醇生物合成途径中的作用 | 莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下的生理调整 | NA | NA | NA | NA | mRNA | 使用OmB细胞系进行实验 |
| 97 | 2024-08-13 |
AFP: Finding pathways accounting for stoichiometry along with atom group tracking in metabolic network
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.004
PMID:39009230
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研究论文 | 本文提出了一种名为AFP的新方法，通过将原子组追踪融入反应化学计量学，利用混合整数线性规划（MILP）来寻找代谢途径 | AFP方法结合了原子组追踪与反应化学计量学，构建MILP模型以搜索包含原子组交换的反应途径，并能从任意或给定的化合物搜索到目标化合物 | NA | 旨在自动发现合成生物学和代谢工程中代谢途径的初始设计中的新途径 | 代谢途径的自动发现方法 | 代谢工程 | NA | 混合整数线性规划（MILP） | MILP模型 | 代谢途径数据 | NA |
| 98 | 2024-08-13 |
A new synthetic biology system for investigating the biosynthesis of antibiotics and other secondary metabolites in streptomycetes
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.007
PMID:39004405
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研究论文 | 本文介绍了一种新的合成生物学表达系统，用于研究链霉菌中抗生素和其他次级代谢产物的生物合成 | 该系统允许将生物合成基因簇（BGCs）重构为单顺反子转录单元，并基于含有强kasOp*启动子、RBS和终止子的质粒 | NA | 开发一种新的合成生物学系统，用于研究链霉菌中次级代谢产物的生物合成 | 链霉菌中的生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 基因序列 | 涉及两种已知的生物合成基因簇，用于芳香聚酮类抗生素landomycin和mithramycin的合成 |
| 99 | 2024-08-05 |
Toward a nomenclature consensus for diverse intelligent systems: Call for collaboration
2024-Sep-09, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2024.100658
PMID:39071220
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评论 | 本文探讨了在多学科合作中，对于智能系统命名法的一致性开发的重要性 | 提出了一种社区参与的方法，以达成多样智能系统相关术语的一致性 | 未具体提供在命名法达成一致中可能面临的挑战 | 旨在促进智能系统领域的多学科合作和命名法一致性 | 智能系统的术语和命名法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-05 |
Path to bacteriotherapy: From bacterial engineering to therapeutic perspectives
2024-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.122897
PMID:38971366
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综述 | 本文综述了肿瘤病毒治疗的细菌疗法，包括细菌设计和肿瘤微环境中的复杂相互作用 | 创新性地结合合成生物学和纳米技术对细菌进行改造，提高安全性和肿瘤特异性 | 本文未详细探讨各类细菌治疗的临床试验数据 | 提供对肿瘤细菌治疗的全面理解，促进临床应用 | 聚焦不同的细菌设计及其在肿瘤微环境中的应用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 合成生物学和纳米技术 | NA | 文献数据 | NA |