合成生物学相关文章
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当前共找到 113 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-09-26 |
Overexpression of RuBisCO form I and II genes in Rhodopseudomonas palustris TIE-1 augments polyhydroxyalkanoate production heterotrophically and autotrophically
2024-09-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01438-24
PMID:39162566
|
研究论文 | 本研究通过在Rhodopseudomonas palustris TIE-1中过表达RuBisCO I型和II型基因，增强了聚羟基脂肪酸酯（PHA）的异养和自养生产 | 开发了一种噬菌体整合系统，成功将RuBisCO I型和II型基因整合到TIE-1基因组中，显著提高了PHA产量 | NA | 通过基因工程手段提高微生物生产生物塑料的能力 | Rhodopseudomonas palustris TIE-1及其PHA生产能力 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 基因组数据 | 多种代谢突变体和过表达菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-09-20 |
Pangenomic landscapes shape performances of a synthetic genetic circuit across Stutzerimonas species
2024-Sep-17, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00849-24
PMID:39166875
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研究论文 | 研究探讨了基因电路在不同Stutzerimonas物种中的性能差异，揭示了基因组结构和功能对底盘效应的影响 | 通过泛基因组分析和基因表达定量测量，揭示了核心基因组的差异表达是影响基因电路性能的主要因素 | 研究仅限于六个密切相关的非模式细菌宿主，可能无法完全代表所有微生物的情况 | 研究基因组和生理环境如何影响基因电路在不同微生物中的性能，以改进跨多样微生物的生物设计策略 | 六个密切相关的Stutzerimonas物种中的基因电路性能 | 合成生物学 | NA | 泛基因组分析 | NA | 基因表达数据 | 六个密切相关的Stutzerimonas物种 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-09-20 |
CRISPR/Cas9-based genome engineering in the filamentous fungus Rhizopus oryzae and its application to L-lactic acid production
2024-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400309
PMID:39295562
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研究论文 | 开发了一种适用于丝状真菌Rhizopus oryzae的高效CRISPR-Cas9基因编辑系统，并应用于L-乳酸生产 | 首次开发了适用于Rhizopus oryzae的CRISPR-Cas9基因编辑系统，并成功应用于代谢工程调控和合成生物学改造 | NA | 开发适用于Rhizopus oryzae的基因编辑工具，并应用于提高L-乳酸产量 | 丝状真菌Rhizopus oryzae及其基因组编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-09-19 |
Intracellular Construction of Organelle-like Compartments Facilitates Metabolic Flux in Escherichia coli
2024-Sep-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06895
PMID:39230507
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研究论文 | 本文利用Wnt信号通路中的DIX结构域构建了细菌内的合成隔室，以增强代谢通量 | 首次使用DIX结构域及其相互作用基序构建了细菌内的合成隔室，显著增强了代谢通量 | NA | 研究在细菌内构建稳定的合成隔室以增强代谢通量的方法 | 大肠杆菌内的合成隔室及其对代谢通量的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-09-19 |
Engineering Yarrowia lipolytica for Efficient Synthesis of Geranylgeraniol
2024-Sep-18, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c06749
PMID:39241196
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法改造Yarrowia lipolytica，高效合成Geranylgeraniol | 通过表达异源磷酸酶基因、增强前体供应和下调角鲨烯合成途径，实现了Geranylgeraniol的高效合成，创下了摇瓶中Geranylgeraniol产量的新纪录 | NA | 提高Geranylgeraniol的合成效率 | Yarrowia lipolytica | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-09-19 |
RNA exon editing: Splicing the way to treat human diseases
2024-Sep-10, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2024.102311
PMID:39281698
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综述 | 本文综述了RNA外显子编辑作为一种治疗策略，通过诱导合成RNA分子与内源性前mRNA目标之间的剪接，纠正致病突变，恢复功能性mRNA和蛋白质 | 本文介绍了RNA外显子编辑的新进展，包括在临床试验中的首次应用，以及如何利用现代合成生物学、下一代测序和生物信息学的进步，开发新的RNA外显子编辑分子 | NA | 探讨RNA外显子编辑在治疗人类疾病中的应用及其发展历程 | RNA外显子编辑技术及其在治疗遗传性疾病中的应用 | 基因治疗 | 遗传性疾病 | RNA剪接 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-09-19 |
Laws of thought in living cells
2024-Sep-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.08.005
PMID:39241745
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研究论文 | 本文介绍了一种基于三态逻辑的生物计算平台TriLoS，旨在提高生物计算的复杂性 | TriLoS平台提供了一种扩展生物计算复杂性的解决方案，超越了原理验证阶段 | NA | 开发一种能够扩展生物计算复杂性的新型平台 | TriLoS三态逻辑合成平台 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-09-15 |
Improvement and application of vacuum-infiltration system in tomato
2024-Sep, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae197
PMID:39257545
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研究论文 | 本文描述了一种改进的真空渗透系统在番茄果实和叶片中的应用 | 首次报道了在附着番茄果实中进行真空渗透，并成功应用于番茄生物技术研究 | NA | 提高番茄中瞬时表达系统的效率，并应用于番茄生物技术和合成生物学研究 | 番茄果实和叶片 | NA | NA | 真空渗透 | NA | NA | 涉及Micro-Tom番茄和商业品种'Emerald'及'Provence' | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-09-14 |
A precise and sustainable doxycycline-inducible cell line development platform for reliable mammalian cell engineering with gain-of-function mutations
2024-Sep-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.09.004
PMID:39242074
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9技术的Tet-On3G诱导性主细胞系开发平台，用于精确和可持续的哺乳动物细胞工程 | 开发了一种名为ROSE的新平台，通过CRISPR/Cas9介导的位点特异性整合，实现了基因表达的精确调控和长期稳定性 | NA | 建立一种精确和可持续的基因表达调控系统，用于哺乳动物细胞工程 | 哺乳动物细胞系 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-09-11 |
Engineered transcription activator-like effector dimer proteins confer DNA loop-dependent gene repression comparable to Lac repressor
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae656
PMID:39077947
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研究论文 | 本文设计了基于目标序列可编程的转录激活因子样效应物二聚体（TALED）蛋白的抑制系统，并展示了其在DNA环依赖的细菌启动子抑制中的应用 | 本文首次展示了通过共价结合的TALED蛋白实现强效的DNA环依赖的细菌启动子抑制，并验证了DNA环结构显著增强启动子抑制效果 | 本文主要集中在E. coli中的实验验证，未来需进一步研究其在其他生物系统中的适用性 | 设计并验证一种新型的DNA环依赖的基因抑制系统，为合成生物学和治疗应用提供新工具 | 转录激活因子样效应物二聚体（TALED）蛋白及其在DNA环依赖的基因抑制中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA环结构分析 | NA | DNA序列 | E. coli菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-09-11 |
Induction of bacterial expression at the mRNA level by light
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae678
PMID:39126322
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研究论文 | 本文利用光敏受体NmPAL在mRNA水平上诱导细菌表达，通过蓝光触发NmPAL结合破坏cis-抑制的mRNA状态，从而解除翻译起始的阻碍，上调基因表达 | 本文开发了一种名为riboptoregulator的光遗传学电路，能够在mRNA水平上进行基因表达调控，并能与现有基因调控电路结合，实现更精细和严格的基因表达控制 | NA | 开发一种在mRNA水平上进行光遗传学调控的新方法，以提高细菌基因表达的效率和精确性 | 细菌基因表达的调控机制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-09-10 |
Hindered intermolecular stacking of anti-parallel telomeric G-quadruplexes
2024-Sep-14, The Journal of chemical physics
IF:3.1Q1
DOI:10.1063/5.0225371
PMID:39248241
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研究论文 | 研究了反平行端粒G四链体在自拥挤条件下的端到端堆叠行为 | 开发了一种高效的粗粒度拟合工具，成功描述了单体和二聚体G四链体的平衡混合物 | NA | 探讨G四链体拓扑结构对其相互作用的影响 | 反平行端粒G四链体的堆叠行为 | NA | NA | 小角X射线散射 | 粗粒度拟合工具 | G四链体结构数据 | 使用序列AG3(T2AG3)3形成的反平行端粒G四链体 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-09-08 |
Genome-wide identification of the phenylalanine ammonia-lyase gene from Epimedium Pubescens Maxim. (Berberidaceae): novel insight into the evolution of the PAL gene family
2024-Sep-04, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-024-05480-z
PMID:39232677
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研究论文 | 本研究全面探索了Epimedium pubescens中的PAL基因家族，揭示了其进化历程和在黄酮醇糖苷、花青素和木质素生物合成中的潜在作用 | 首次全面分析了Epimedium pubescens中的PAL基因家族，揭示了其独特的进化起源和在不同组织中的功能 | 需要进一步实验验证EpPAL2和EpPAL3在花青素生物合成中的作用 | 研究Epimedium pubescens中PAL基因家族的进化及其在黄酮醇糖苷和花青素生物合成中的作用 | Epimedium pubescens中的PAL基因家族及其在植物代谢中的功能 | 分子生物学 | NA | 基因组分析 | NA | 基因序列 | 7个PAL基因（EpPAL1-EpPAL7） | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-09-06 |
Optimizing Promoters and Subcellular Localization for Constitutive Transgene Expression in Marchantia polymorpha
2024-Sep-03, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcae063
PMID:38822700
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研究论文 | 研究优化了苔藓植物Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位，以实现持续的转基因表达 | 发现了新的启动子，这些启动子在所有组织中都能驱动高水平的基因表达，且不会对生长造成负担，并证明了细胞质是异源蛋白表达的最佳亚细胞定位 | NA | 优化Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位，以实现持续的转基因表达 | Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-09-01 |
Engineering immune-evasive allogeneic cellular immunotherapies
2024-Sep, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-024-01022-8
PMID:38658708
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研究论文 | 本文讨论了如何通过赋予同种异体T细胞和自然杀伤（NK）细胞内在的免疫逃避特性，来防止或延迟它们的免疫排斥，从而扩大治疗窗口 | 探讨了利用基因编辑和合成生物学设计基于细胞的精准免疫疗法的前景，超越了编程靶向特异性，需要仔细考虑受体中的先天和适应性反应 | NA | 旨在改善现成的同种异体细胞疗法的持久性，并设计基于细胞的精准免疫疗法 | 同种异体T细胞和NK细胞 | 免疫疗法 | 癌症 | 基因编辑和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-27 |
Exploring genetic codon expansion for unnatural amino acid incorporation in filamentous fungus Aspergillus nidulans
2024-Sep-20, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.018
PMID:39067577
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研究论文 | 本研究在丝状真菌Aspergillus nidulans中开发了遗传密码扩展技术，实现了非天然氨基酸的掺入 | 首次在丝状真菌中成功开发遗传密码扩展技术，为研究真菌蛋白质结构和功能提供了新方法 | NA | 旨在填补丝状真菌在遗传密码扩展技术应用方面的空白 | Aspergillus nidulans中的蛋白质合成 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-15 |
Expanding the synthetic biology repertoire of a fast-growing cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 11801
2024-Sep, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28740
PMID:38773863
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研究论文 | 研究通过全局转录组分析，鉴定了Synechococcus elongatus PCC 11801中的48个高转录数基因的天然启动子，并利用荧光报告系统对其进行了特性分析。同时，通过基因组数据和蛋白质组分析，识别了534个操纵子，并系统地鉴定了15个表现出下游基因高蛋白表达的基因间区域，用于识别核糖体结合位点（RBSs）。 | 本研究扩展了Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱，包括启动子元件和核糖体结合位点，为加速PCC 11801的生物工程提供了多样化的启动子和RBS序列库。 | NA | 扩展Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱，以促进其作为潜在细胞工厂的应用。 | Synechococcus elongatus PCC 11801的天然启动子和核糖体结合位点。 | 合成生物学 | NA | 全局转录组分析，荧光报告系统 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 48个天然启动子，534个操纵子，15个基因间区域 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-15 |
Transcriptional upregulation of the myo-inositol biosynthesis pathway is enhanced by NFAT5 in hyperosmotically stressed tilapia cells
2024-Sep-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00187.2024
PMID:38946247
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研究论文 | 本文研究了莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下肌醇生物合成途径的上调，并探讨了NFAT5在此过程中的作用 | 首次证明了NFAT5作为罗非鱼转录因子，参与高渗应激下肌醇生物合成途径的激活 | 除了NFAT5外，还需要其他强渗透应激信号机制来完全激活罗非鱼基因 | 探讨NFAT5在罗非鱼细胞高渗应激下肌醇生物合成途径中的作用 | 莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下的生理调整 | NA | NA | NA | NA | mRNA | 使用OmB细胞系进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-13 |
AFP: Finding pathways accounting for stoichiometry along with atom group tracking in metabolic network
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.004
PMID:39009230
|
研究论文 | 本文提出了一种名为AFP的新方法，通过将原子组追踪融入反应化学计量学，利用混合整数线性规划（MILP）来寻找代谢途径 | AFP方法结合了原子组追踪与反应化学计量学，构建MILP模型以搜索包含原子组交换的反应途径，并能从任意或给定的化合物搜索到目标化合物 | NA | 旨在自动发现合成生物学和代谢工程中代谢途径的初始设计中的新途径 | 代谢途径的自动发现方法 | 代谢工程 | NA | 混合整数线性规划（MILP） | MILP模型 | 代谢途径数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-13 |
A new synthetic biology system for investigating the biosynthesis of antibiotics and other secondary metabolites in streptomycetes
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.007
PMID:39004405
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研究论文 | 本文介绍了一种新的合成生物学表达系统，用于研究链霉菌中抗生素和其他次级代谢产物的生物合成 | 该系统允许将生物合成基因簇（BGCs）重构为单顺反子转录单元，并基于含有强kasOp*启动子、RBS和终止子的质粒 | NA | 开发一种新的合成生物学系统，用于研究链霉菌中次级代谢产物的生物合成 | 链霉菌中的生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 基因序列 | 涉及两种已知的生物合成基因簇，用于芳香聚酮类抗生素landomycin和mithramycin的合成 | NA | NA | NA | NA |