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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2024-09-17 |
Plants against cancer: towards green Taxol production through pathway discovery and metabolic engineering
2024-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-024-00170-8
PMID:39279861
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综述 | 本文综述了通过途径发现和代谢工程实现绿色紫杉醇生产的进展 | 利用高通量测序、基因组装配、基因合成、分析技术和合成生物学方法,高效识别和工程化酶及代谢途径,生产天然和新颖的药物候选物 | 植物来源药物开发的挑战包括获取和培育源物种、代谢物结构复杂性和普遍低丰度 | 加速药物发现并解决紧迫的人类健康问题 | 植物天然产物及其在抗癌药物紫杉醇生物合成中的应用 | 代谢工程 | 癌症 | 高通量测序、基因组装配、基因合成、分析技术、合成生物学 | NA | 基因组数据 | NA |
82 | 2024-09-15 |
Covalent recruitment of polymers and nanoparticles onto glycan-engineered cells enhances gene delivery during short exposure
2024-Sep-09, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc03666b
PMID:39263661
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研究论文 | 本文展示了通过在细胞表面精确工程化糖基,实现快速共价捕获聚合物/纳米颗粒复合物,从而在短时间内增强基因递送 | 通过细胞表面糖基的精确工程化,实现快速共价捕获聚合物/纳米颗粒复合物,显著加速基因递送过程 | NA | 研究通过细胞表面工程化增强非病毒基因递送效率的新方法 | 细胞表面糖基工程化、聚合物/纳米颗粒复合物、基因递送效率 | 合成生物学 | NA | 细胞表面工程化、聚合物/纳米颗粒复合物递送 | NA | 细胞、聚合物/纳米颗粒复合物 | NA |
83 | 2024-09-15 |
Nucleated synthetic cells with genetically driven intercompartment communication
2024-Sep-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404790121
PMID:39186653
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研究论文 | 本文介绍了一种创建具有核样隔间的合成细胞的方法,这些隔间能够封装不同的生化混合物,并实现核与细胞质隔间之间的自主化学通信 | 本文首次实现了合成细胞中核样隔间与细胞质隔间之间的自主化学通信,并通过现场蛋白质表达膜蛋白来实现 | 本文未详细讨论该技术的实际应用和潜在风险 | 增强合成细胞的复杂性,实现隔间间的自主信号传递 | 合成细胞中的核样隔间与细胞质隔间 | 合成生物学 | NA | 现场蛋白质表达 | NA | 生化混合物 | NA |
84 | 2024-09-15 |
Improvement and application of vacuum-infiltration system in tomato
2024-Sep, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae197
PMID:39257545
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研究论文 | 本文描述了一种改进的真空渗透系统在番茄果实和叶片中的应用 | 首次报道了在附着番茄果实中进行真空渗透,并成功应用于番茄生物技术研究 | NA | 提高番茄中瞬时表达系统的效率,并应用于番茄生物技术和合成生物学研究 | 番茄果实和叶片 | NA | NA | 真空渗透 | NA | NA | 涉及Micro-Tom番茄和商业品种'Emerald'及'Provence' |
85 | 2024-09-14 |
Advances in metabolic engineering for enhanced acetyl-CoA availability in yeast
2024-Sep-12, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2399542
PMID:39266266
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综述 | 本文综述了在酵母中提高乙酰辅酶A可用性的代谢工程最新进展 | 强调了通过增强不同细胞器中的代谢通量、优化前体辅酶A合成、优化底物利用和修改蛋白质乙酰化水平等策略来提高乙酰辅酶A及其衍生物合成效率的新方法 | NA | 探讨如何通过代谢工程策略提高乙酰辅酶A及其衍生物的合成效率,以创建更有效的微生物细胞工厂 | 乙酰辅酶A及其衍生物的生物合成途径和代谢工程方法 | 代谢工程 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
86 | 2024-09-14 |
A precise and sustainable doxycycline-inducible cell line development platform for reliable mammalian cell engineering with gain-of-function mutations
2024-Sep-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.09.004
PMID:39242074
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9技术的Tet-On3G诱导性主细胞系开发平台,用于精确和可持续的哺乳动物细胞工程 | 开发了一种名为ROSE的新平台,通过CRISPR/Cas9介导的位点特异性整合,实现了基因表达的精确调控和长期稳定性 | NA | 建立一种精确和可持续的基因表达调控系统,用于哺乳动物细胞工程 | 哺乳动物细胞系 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因表达数据 | NA |
87 | 2024-09-11 |
Engineered transcription activator-like effector dimer proteins confer DNA loop-dependent gene repression comparable to Lac repressor
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae656
PMID:39077947
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研究论文 | 本文设计了基于目标序列可编程的转录激活因子样效应物二聚体(TALED)蛋白的抑制系统,并展示了其在DNA环依赖的细菌启动子抑制中的应用 | 本文首次展示了通过共价结合的TALED蛋白实现强效的DNA环依赖的细菌启动子抑制,并验证了DNA环结构显著增强启动子抑制效果 | 本文主要集中在E. coli中的实验验证,未来需进一步研究其在其他生物系统中的适用性 | 设计并验证一种新型的DNA环依赖的基因抑制系统,为合成生物学和治疗应用提供新工具 | 转录激活因子样效应物二聚体(TALED)蛋白及其在DNA环依赖的基因抑制中的应用 | 合成生物学 | NA | DNA环结构分析 | NA | DNA序列 | E. coli菌株 |
88 | 2024-09-11 |
Induction of bacterial expression at the mRNA level by light
2024-Sep-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae678
PMID:39126322
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研究论文 | 本文利用光敏受体NmPAL在mRNA水平上诱导细菌表达,通过蓝光触发NmPAL结合破坏cis-抑制的mRNA状态,从而解除翻译起始的阻碍,上调基因表达 | 本文开发了一种名为riboptoregulator的光遗传学电路,能够在mRNA水平上进行基因表达调控,并能与现有基因调控电路结合,实现更精细和严格的基因表达控制 | NA | 开发一种在mRNA水平上进行光遗传学调控的新方法,以提高细菌基因表达的效率和精确性 | 细菌基因表达的调控机制 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | mRNA | NA |
89 | 2024-09-10 |
Hindered intermolecular stacking of anti-parallel telomeric G-quadruplexes
2024-Sep-14, The Journal of chemical physics
IF:3.1Q1
DOI:10.1063/5.0225371
PMID:39248241
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研究论文 | 研究了反平行端粒G四链体在自拥挤条件下的端到端堆叠行为 | 开发了一种高效的粗粒度拟合工具,成功描述了单体和二聚体G四链体的平衡混合物 | NA | 探讨G四链体拓扑结构对其相互作用的影响 | 反平行端粒G四链体的堆叠行为 | NA | NA | 小角X射线散射 | 粗粒度拟合工具 | G四链体结构数据 | 使用序列AG3(T2AG3)3形成的反平行端粒G四链体 |
90 | 2024-09-10 |
Transforming drug development with synthetic biology and AI
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.008
PMID:38383215
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学和人工智能在药物开发中的应用,特别是在COVID-19大流行背景下RNA平台药物开发的挑战和解决方案 | 结合合成生物学和人工智能模型,提出了一种新的药物开发方法 | NA | 探索合成生物学和人工智能在药物开发中的应用,解决药物候选物识别的难题 | 药物开发中的RNA平台和药物候选物 | 机器学习 | NA | 合成生物学 | 人工智能模型 | NA | NA |
91 | 2024-09-08 |
Genome-wide identification of the phenylalanine ammonia-lyase gene from Epimedium Pubescens Maxim. (Berberidaceae): novel insight into the evolution of the PAL gene family
2024-Sep-04, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-024-05480-z
PMID:39232677
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研究论文 | 本研究全面探索了Epimedium pubescens中的PAL基因家族,揭示了其进化历程和在黄酮醇糖苷、花青素和木质素生物合成中的潜在作用 | 首次全面分析了Epimedium pubescens中的PAL基因家族,揭示了其独特的进化起源和在不同组织中的功能 | 需要进一步实验验证EpPAL2和EpPAL3在花青素生物合成中的作用 | 研究Epimedium pubescens中PAL基因家族的进化及其在黄酮醇糖苷和花青素生物合成中的作用 | Epimedium pubescens中的PAL基因家族及其在植物代谢中的功能 | 分子生物学 | NA | 基因组分析 | NA | 基因序列 | 7个PAL基因(EpPAL1-EpPAL7) |
92 | 2024-09-08 |
Killer yeasts: expanding frontiers in the age of synthetic biology
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.003
PMID:38575438
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评论 | 本文探讨了合成生物学时代下杀伤性酵母的潜力及其在抗真菌耐药性和食品安全方面的应用 | 本文提出利用合成生物学技术解锁杀伤性酵母系统的全部潜力,并设想重新设计宿主双链RNA真菌病毒作为安全且无感染性的系统来生产设计RNA | 尽管经过数十年的研究,杀伤性酵母的广泛应用仍受到一些限制 | 探讨合成生物学技术在杀伤性酵母系统中的应用潜力 | 杀伤性酵母及其分泌的蛋白质毒素 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
93 | 2024-09-08 |
Measuring the economic efficiency of laboratory automation in biotechnology
2024-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.02.001
PMID:38402137
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研究论文 | 本文提出了一种实验价格指数(EPI),用于量化比较实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的时间、成本和样本数量因素,以评估其经济效率 | 本文创新性地提出了实验价格指数(EPI),用于量化实验室自动化的经济效率 | NA | 评估实验室自动化在生物技术项目中的经济效率 | 实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的应用 | 生物技术 | NA | 实验室自动化 | NA | NA | NA |
94 | 2024-09-07 |
Mutagenesis techniques for evolutionary engineering of microbes - exploiting CRISPR-Cas, oligonucleotides, recombinases, and polymerases
2024-Sep, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.02.006
PMID:38493013
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综述 | 本文综述了利用CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶和聚合酶等技术进行微生物进化工程的诱变技术 | 本文总结了进化工程领域中模型微生物的最新发展和方法,特别强调了体内技术在精准发酵代谢途径优化中的应用 | NA | 探讨如何通过体内外方法增加宿主的遗传多样性,特别是体内技术在代谢途径优化中的应用 | 微生物及其在工业环境中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas、寡核苷酸、重组酶、聚合酶 | NA | NA | NA |
95 | 2024-09-06 |
Optimizing Promoters and Subcellular Localization for Constitutive Transgene Expression in Marchantia polymorpha
2024-Sep-03, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcae063
PMID:38822700
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研究论文 | 研究优化了苔藓植物Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位,以实现持续的转基因表达 | 发现了新的启动子,这些启动子在所有组织中都能驱动高水平的基因表达,且不会对生长造成负担,并证明了细胞质是异源蛋白表达的最佳亚细胞定位 | NA | 优化Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位,以实现持续的转基因表达 | Marchantia polymorpha中的启动子和亚细胞定位 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
96 | 2024-09-06 |
Zero-shot prediction of mutation effects with multimodal deep representation learning guides protein engineering
2024-Sep, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-00989-2
PMID:38969803
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ProMEP的多模态深度表示学习方法,用于零样本预测蛋白质突变效应,并指导蛋白质工程 | ProMEP通过多模态深度学习模型,从约1.6亿个蛋白质中全面学习序列和结构上下文,实现了突变效应的零样本预测,显著提高了预测速度和准确性 | NA | 开发一种能够准确预测蛋白质突变效应并指导蛋白质工程的方法 | 蛋白质突变效应的预测和基因编辑酶TnpB和TadA的工程化 | 生物信息学 | NA | 多模态深度表示学习 | 多模态深度学习模型 | 蛋白质序列和结构数据 | 约1.6亿个蛋白质 |
97 | 2024-09-01 |
Engineering immune-evasive allogeneic cellular immunotherapies
2024-Sep, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-024-01022-8
PMID:38658708
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研究论文 | 本文讨论了如何通过赋予同种异体T细胞和自然杀伤(NK)细胞内在的免疫逃避特性,来防止或延迟它们的免疫排斥,从而扩大治疗窗口 | 探讨了利用基因编辑和合成生物学设计基于细胞的精准免疫疗法的前景,超越了编程靶向特异性,需要仔细考虑受体中的先天和适应性反应 | NA | 旨在改善现成的同种异体细胞疗法的持久性,并设计基于细胞的精准免疫疗法 | 同种异体T细胞和NK细胞 | 免疫疗法 | 癌症 | 基因编辑和合成生物学 | NA | NA | NA |
98 | 2024-08-29 |
Posttranscriptional tuning of gene expression over a large dynamic range in synthetic tobacco chloroplast operons
2024-Sep, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16930
PMID:39031552
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研究论文 | 本研究探讨了烟草叶绿体中gfp报告基因的表达,通过使用叶绿体atpH 5' UTR的变体,揭示了内源性烟草PPR10在不同设计背景下与烟草和玉米atpH 5' UTR结合时对报告基因激活的不同水平 | 研究发现了PPR10通过一种独立于其稳定单顺反子转录本的机制激活翻译,并且引入tRNA上游的UTR几乎消除了gfp mRNA和GFP蛋白,这表明tRNA促进了RNA切割和5'外切核酸酶降解,导致PPR10没有足够时间结合和保护gfp RNA | NA | 探索在合成烟草叶绿体操纵子中实现基因表达的转录后调控 | gfp报告基因在烟草叶绿体中的表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | RNA | 不同设计的烟草和玉米atpH 5' UTR变体 |
99 | 2024-08-27 |
Exploring genetic codon expansion for unnatural amino acid incorporation in filamentous fungus Aspergillus nidulans
2024-Sep-20, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.018
PMID:39067577
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研究论文 | 本研究在丝状真菌Aspergillus nidulans中开发了遗传密码扩展技术,实现了非天然氨基酸的掺入 | 首次在丝状真菌中成功开发遗传密码扩展技术,为研究真菌蛋白质结构和功能提供了新方法 | NA | 旨在填补丝状真菌在遗传密码扩展技术应用方面的空白 | Aspergillus nidulans中的蛋白质合成 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展技术 | NA | 蛋白质 | NA |
100 | 2024-08-17 |
Synthetic microbial communities: A gateway to understanding resistance, resilience, and functionality in spontaneously fermented food microbiomes
2024-Sep, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2024.114780
PMID:39147468
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综述 | 本文综述了自发发酵食品微生物群落的复杂特性,这些特性有助于抵抗性、恢复力和功能性驱动因素 | 合成微生物群落(SMCs)作为机制洞察和微生物群落战略性重编程的门户,为发酵食品微生物群落提供了细致的理解和控制 | 在实现SMCs的稳定性和可重复性方面存在挑战,主要源于非标准化方法 | 探讨合成微生物群落在自发发酵食品微生物群落中的应用及其优化食品加工的潜力 | 自发发酵食品的微生物群落及其在食品加工中的应用 | 微生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 微生物群落数据 | NA |