合成生物学相关文章
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当前共找到 117 篇文献，本页显示第 101 - 117 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-15 |
Expanding the synthetic biology repertoire of a fast-growing cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 11801
2024-Sep, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28740
PMID:38773863
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研究论文 | 研究通过全局转录组分析，鉴定了Synechococcus elongatus PCC 11801中的48个高转录数基因的天然启动子，并利用荧光报告系统对其进行了特性分析。同时，通过基因组数据和蛋白质组分析，识别了534个操纵子，并系统地鉴定了15个表现出下游基因高蛋白表达的基因间区域，用于识别核糖体结合位点（RBSs）。 | 本研究扩展了Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱，包括启动子元件和核糖体结合位点，为加速PCC 11801的生物工程提供了多样化的启动子和RBS序列库。 | NA | 扩展Synechococcus elongatus PCC 11801的合成生物学工具箱，以促进其作为潜在细胞工厂的应用。 | Synechococcus elongatus PCC 11801的天然启动子和核糖体结合位点。 | 合成生物学 | NA | 全局转录组分析，荧光报告系统 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 48个天然启动子，534个操纵子，15个基因间区域 |
| 102 | 2024-08-15 |
Transcriptional upregulation of the myo-inositol biosynthesis pathway is enhanced by NFAT5 in hyperosmotically stressed tilapia cells
2024-Sep-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00187.2024
PMID:38946247
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研究论文 | 本文研究了莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下肌醇生物合成途径的上调，并探讨了NFAT5在此过程中的作用 | 首次证明了NFAT5作为罗非鱼转录因子，参与高渗应激下肌醇生物合成途径的激活 | 除了NFAT5外，还需要其他强渗透应激信号机制来完全激活罗非鱼基因 | 探讨NFAT5在罗非鱼细胞高渗应激下肌醇生物合成途径中的作用 | 莫桑比克罗非鱼细胞在高渗应激下的生理调整 | NA | NA | NA | NA | mRNA | 使用OmB细胞系进行实验 |
| 103 | 2024-08-13 |
AFP: Finding pathways accounting for stoichiometry along with atom group tracking in metabolic network
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.004
PMID:39009230
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研究论文 | 本文提出了一种名为AFP的新方法，通过将原子组追踪融入反应化学计量学，利用混合整数线性规划（MILP）来寻找代谢途径 | AFP方法结合了原子组追踪与反应化学计量学，构建MILP模型以搜索包含原子组交换的反应途径，并能从任意或给定的化合物搜索到目标化合物 | NA | 旨在自动发现合成生物学和代谢工程中代谢途径的初始设计中的新途径 | 代谢途径的自动发现方法 | 代谢工程 | NA | 混合整数线性规划（MILP） | MILP模型 | 代谢途径数据 | NA |
| 104 | 2024-08-13 |
A new synthetic biology system for investigating the biosynthesis of antibiotics and other secondary metabolites in streptomycetes
2024-Sep-10, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.07.007
PMID:39004405
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研究论文 | 本文介绍了一种新的合成生物学表达系统，用于研究链霉菌中抗生素和其他次级代谢产物的生物合成 | 该系统允许将生物合成基因簇（BGCs）重构为单顺反子转录单元，并基于含有强kasOp*启动子、RBS和终止子的质粒 | NA | 开发一种新的合成生物学系统，用于研究链霉菌中次级代谢产物的生物合成 | 链霉菌中的生物合成基因簇（BGCs） | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 基因序列 | 涉及两种已知的生物合成基因簇，用于芳香聚酮类抗生素landomycin和mithramycin的合成 |
| 105 | 2024-08-05 |
Toward a nomenclature consensus for diverse intelligent systems: Call for collaboration
2024-Sep-09, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2024.100658
PMID:39071220
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评论 | 本文探讨了在多学科合作中，对于智能系统命名法的一致性开发的重要性 | 提出了一种社区参与的方法，以达成多样智能系统相关术语的一致性 | 未具体提供在命名法达成一致中可能面临的挑战 | 旨在促进智能系统领域的多学科合作和命名法一致性 | 智能系统的术语和命名法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-05 |
Path to bacteriotherapy: From bacterial engineering to therapeutic perspectives
2024-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.122897
PMID:38971366
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综述 | 本文综述了肿瘤病毒治疗的细菌疗法，包括细菌设计和肿瘤微环境中的复杂相互作用 | 创新性地结合合成生物学和纳米技术对细菌进行改造，提高安全性和肿瘤特异性 | 本文未详细探讨各类细菌治疗的临床试验数据 | 提供对肿瘤细菌治疗的全面理解，促进临床应用 | 聚焦不同的细菌设计及其在肿瘤微环境中的应用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 合成生物学和纳米技术 | NA | 文献数据 | NA |
| 107 | 2024-08-07 |
Microalgae growth-promoting bacteria for cultivation strategies: Recent updates and progress
2024-Sep, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127813
PMID:38917638
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综述 | 本文综述了促进微藻生长的细菌（MGPB）在微藻培养策略中的最新进展和更新 | 探讨了微藻与MGPB共培养策略的潜在应用，包括生物量生产和废水处理 | NA | 旨在提高水-能源-环境纽带中微藻与MGPB共培养的效率和可持续性 | 微藻生长促进细菌（MGPB）及其与微藻的共培养策略 | NA | NA | 合成生物学和代谢网络分析 | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-07 |
Toward biomanufacturing of next-generation bacterial nanocellulose (BNC)-based materials with tailored properties: A review on genetic engineering approaches
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108390
PMID:38823654
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综述 | 本文综述了通过遗传工程方法制造具有定制特性的下一代细菌纳米纤维素（BNC）基材料的进展 | 介绍了通过基因过表达、敲除以及合成生物学和CRISPR/Cas技术调控BNC生物合成的创新方法 | BNC的大规模生产受限于其低产率、微生物菌株的不稳定性及成本问题 | 探讨如何通过遗传工程提高BNC的生产效率和定制其材料特性 | 细菌纳米纤维素（BNC）及其基材料 | 生物技术 | NA | 遗传工程、合成生物学、CRISPR/Cas技术 | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-07 |
The bioproduction of astaxanthin: A comprehensive review on the microbial synthesis and downstream extraction
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108392
PMID:38825214
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综述 | 本文全面综述了虾青素的微生物合成及其下游提取方法 | 介绍了通过合成生物学构建的多种重组微生物宿主用于虾青素生产，以及近年来报道的高效绿色提取方法 | NA | 旨在全面介绍虾青素生产和提取的进展 | 虾青素的微生物合成及提取方法 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-07 |
Cordyceps militaris: A novel mushroom platform for metabolic engineering
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108396
PMID:38906495
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综述 | 本文综述了利用冬虫夏草作为细胞工厂生产高价值化学品和营养素的潜力 | 探讨了冬虫夏草作为新型底盘细胞的深入研究和开发的具体和有前景的机会 | 讨论了在计算生物学、现有DNA元件和基因组编辑方法等领域进一步研究冬虫夏草的挑战和障碍 | 探索冬虫夏草作为细胞工厂生产高价值化学品和营养素的潜力 | 冬虫夏草及其生物活性化合物 | NA | NA | 基因组编辑 | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-07 |
Advancing microbial production through artificial intelligence-aided biology
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108399
PMID:38925317
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综述 | 本文综述了人工智能辅助微生物生产的主要组成部分和最新进展 | 利用人工智能处理、学习和预测大量生物数据，将传统的DBT循环转变为多维的DBTLP工作流程 | 讨论了将新型人工智能技术整合到生物学中的挑战 | 探讨人工智能在微生物生产中的应用及其对合成生物学的影响 | 微生物细胞工厂和合成生物学中的遗传装置 | 机器学习 | NA | 人工智能 | 大型语言模型 | 生物数据 | NA |
| 112 | 2024-08-07 |
Machine learning for the advancement of genome-scale metabolic modeling
2024-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108400
PMID:38944218
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综述 | 本文综述了机器学习（ML）和深度学习（DL）在基因组尺度代谢模型（GEM）构建中的应用及其对生物医学和生物工程领域的潜在影响 | 探讨了多学科工具和策略（如合成生物学、约束基模型、多组学和机器学习）的集成潜力，以超越传统生物学教条探索生化现象 | 多学科方法框架的发展主要独立进行，限制了不同领域生物知识的串联 | 展示如何通过整合实验和计算策略，利用特定条件下的细胞信息推动生物系统知识的扩展，并提升机器学习基础的约束基模型在生物医学和生物工程领域的应用 | 基因组尺度代谢模型（GEM）的构建及其在生物医学和生物工程中的应用 | 系统生物学 | NA | 机器学习（ML），深度学习（DL） | NA | 多组学数据（转录组学、蛋白质组学等） | NA |
| 113 | 2024-08-07 |
A critical review of microplastics in aquatic ecosystems: Degradation mechanisms and removing strategies
2024-Sep, Environmental science and ecotechnology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.ese.2024.100427
PMID:38765892
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综述 | 本文综述了水生生态系统中微塑料的降解机制和去除策略 | 介绍了结合物理化学预处理和微生物降解的新策略，以及膜生物反应器、合成生物学、有机硅基技术、生物膜介导的修复和纳米材料增强策略等创新方法 | NA | 旨在促进微塑料有效去除方法的创新，提升环境和社交福祉 | 水生生态系统中的微塑料 | 环境科学 | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-07 |
SemiSynBio: A new era for neuromorphic computing
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.04.013
PMID:38711551
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研究论文 | 本文概述了神经形态计算的原理，重点介绍了基于DNA计算的合成神经形态计算的进展，并总结了合成神经形态计算的主要挑战和前景 | 提出了一种新的半导体合成生物学（SemiSynBio）技术，利用DNA为基础的生物分子作为逻辑门来构建人工神经网络（ANNs），实现分子级别的神经形态计算 | NA | 探讨神经形态计算在生物计算、DNA存储、信息安全和国家防御中的应用潜力 | 神经形态计算及其在合成生物学中的应用 | 生物计算 | NA | DNA计算 | 人工神经网络（ANNs） | DNA分子 | NA |
| 115 | 2024-08-07 |
Facilitating stable gene integration expression and copy number amplification in Bacillus subtilis through a reversible homologous recombination switch
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.04.010
PMID:38708056
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研究论文 | 本研究开发了一种稳定基因整合表达和拷贝数扩增系统，通过可逆同源重组开关在枯草芽孢杆菌中实现高水平的基因表达 | 利用抑制剂和非天然氨基酸依赖表达系统创建可逆开关，控制关键基因进行同源重组，实现基因扩增和稳定 | NA | 增强微生物细胞工厂中关键酶的持续表达，提高生物生产效率 | 枯草芽孢杆菌中的基因表达和拷贝数扩增 | 合成生物学 | NA | 同源重组 | NA | 基因表达数据 | 110代枯草芽孢杆菌 |
| 116 | 2024-08-07 |
Engineering a non-model yeast Rhodotorula mucilaginosa for terpenoids synthesis
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.04.015
PMID:38690180
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法，改造非模式酵母Rhodotorula mucilaginosa，以生产不同的萜类化合物 | 本研究展示了Rhodotorula mucilaginosa作为直接生物合成多种萜类化合物的平台宿主的潜力 | NA | 通过合成生物学方法，提高非模式酵母Rhodotorula mucilaginosa生产萜类化合物的能力 | Rhodotorula mucilaginosa酵母菌株及其生产萜类化合物的能力 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 生物数据 | 多个工程菌株 |
| 117 | 2024-08-07 |
Environment and synthetic biology
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.03.016
PMID:38616974
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |