合成生物学相关文章
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当前共找到 95 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-12-18 |
Positions of cysteine residues reveal local clusters and hidden relationships to Sequons and Transmembrane domains in Human proteins
2024-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77056-8
PMID:39468182
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研究论文 | 本文研究了人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 发现了半胱氨酸残基在蛋白质中的频率与长度相关，并且CC间隙的频率可以作为区分具有特殊结构和功能的蛋白质的分类器 | 讨论了计算预测中缺乏的蛋白质结构动力学，但未提供具体的改进方法 | 研究人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 人类蛋白质中的半胱氨酸残基、N-糖基化位点和跨膜结构域 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质序列 | 整个人类蛋白质组 |
| 2 | 2024-12-08 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-Oct-29, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
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研究论文 | 研究了甲烷产生菌Methanosarcina acetivorans在能量保存酶HdrED抑制下的转录响应 | 揭示了甲烷产生菌通过未知机制将甲烷生成与基因调控通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性高效耦合 | NA | 探究细胞如何感知和响应终端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans细胞在HdrED酶缺失下的转录变化 | 代谢网络 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3 | 2024-12-08 |
Combining culture optimization and synthetic biology to improve production and detection of secondary metabolites in Myxococcus xanthus: application to myxoprincomide
2024-Oct-21, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01740-24
PMID:39431896
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研究论文 | 本文介绍了一种名为2PRIM-BOOST的新策略，通过结合底盘菌株工程和生长介质优化，提高Myxococcus xanthus中非核糖体肽合成酶（NRPS）/聚酮合成酶（PKS）次级代谢产物的生产与检测 | 提出了2PRIM-BOOST策略，结合底盘菌株工程和生长介质优化，显著提高了myxoprincomide等次级代谢产物的生产 | NA | 开发一种新策略以提高Myxococcus xanthus中次级代谢产物的生产与检测 | Myxococcus xanthus中的次级代谢产物，特别是myxoprincomide | 合成生物学 | NA | 底盘菌株工程、生长介质优化 | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-12-05 |
Session commentaries: synthetic and constructive biology
2024-Oct, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-024-01219-0
PMID:39618793
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评论 | 本文是对2024年IUPAB会议中关于合成生物学和构建生物学领域的五位研究者演讲的评论 | NA | NA | 探讨通过构建体外系统来学习生物学知识 | 体外合成生物学系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-12-05 |
Cofactor recycling strategies for secondary metabolite production in cell-free protein expression systems
2024-Oct, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-024-01234-1
PMID:39618802
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研究论文 | 本文探讨了在无细胞蛋白表达系统中再生辅因子以促进次级代谢产物生产的策略 | 提出了在无细胞蛋白合成系统中再生辅因子的策略，以实现复杂代谢产物的连续生产 | NA | 旨在克服无细胞蛋白合成系统中辅因子再生效率低下的问题，以促进次级代谢产物的生产 | 无细胞蛋白合成系统中的辅因子再生策略 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-11-28 |
Route to Measure Exact Parameters of Bio-Nanostructures Self-Assembly
2024-Oct-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111388
PMID:39595566
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法来确定生物纳米结构自组装机制的关键参数 | 首次实现了对自组装过程中自催化与自抑制参数的精确计算 | NA | 深入理解生物纳米结构的自组装机制 | 生物纳米结构的自组装过程 | 纳米技术 | NA | 数学建模 | NA | NA | NA |
| 7 | 2024-12-01 |
Current Technologies in Snake Venom Analysis and Applications
2024-Oct-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins16110458
PMID:39591213
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综述 | 本文综述了蛇毒研究领域的最新进展，重点介绍了蛋白质组学、基因组学、转录组学和生物信息学的整合应用 | 本文介绍了合成生物学和多组学方法（统称为venomics）在蛇毒研究中的革命性影响，提供了对蛇毒功能及其治疗潜力的更深入理解 | 尽管取得了显著进展，但毒素的功能表征和成本效益型抗蛇毒血清的开发仍然是挑战 | 探讨蛇毒研究的最新技术和应用，强调跨学科合作和新技术的必要性 | 蛇毒及其毒素的分子组成、进化机制和治疗潜力 | 生物信息学 | NA | 蛋白质组学、基因组学、转录组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 8 | 2024-12-01 |
The Importance of Biosecurity in Emerging Biotechnologies and Synthetic Biology
2024 Oct-Dec, Avicenna journal of medical biotechnology
DOI:10.18502/ajmb.v16i4.16738
PMID:39606684
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综述 | 本文综述了合成生物学领域的生物安全、生物安保和网络生物安保问题 | 探讨了合成生物学在设计和开发病原性生物武器方面的潜在风险，并提出了标准化和监管的必要性 | 未提供具体的解决方案或技术细节，主要集中在问题识别和政策建议上 | 评估新兴生物技术和合成生物学中的生物安全风险，并提出标准化和监管的建议 | 合成生物学技术及其在生物安全、生物安保和网络生物安保方面的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-11-26 |
Making Neurobots and Chimerical Ctenophores
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620631
PMID:39554129
|
研究论文 | 本文探讨了利用栉水母（ctenophores）作为模型生物，构建神经机器人和嵌合动物的可能性 | 本文首次揭示了栉水母独特的神经免疫结构，并展示了利用这些结构构建神经机器人和嵌合动物的潜力 | 本文未详细讨论实验过程中遇到的挑战和限制 | 探索利用栉水母的神经免疫系统构建新型生物机器的可能性 | 栉水母的神经免疫系统和相关生物材料 | 生物工程 | NA | NA | NA | NA | 三种栉水母物种 |
| 10 | 2024-11-19 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620122
PMID:39554157
|
研究论文 | 本文研究了通过工程化细菌诱导的肿瘤特异性抗体促进膀胱癌免疫治疗的效果 | 利用合成生物学技术改造益生菌Nissle 1917表达人趋化因子CXCL13，增强肿瘤特异性体液免疫，并与PD-1阻断疗法结合，显著提高治疗效果 | NA | 探索工程化细菌在膀胱癌免疫治疗中的应用 | 膀胱癌及其免疫治疗 | NA | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-11-10 |
Synthetic Biology-Driven Microbial Therapeutics for Disease Treatment
2024-Oct-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2407.07004
PMID:39233526
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综述 | 本文综述了合成生物学驱动的微生物疗法在疾病治疗中的应用 | 利用合成生物学技术，通过基因编码的生物传感器和动态调控工具，设计微生物疗法，实现精准靶向和调控，提高治疗效果和安全性 | NA | 探讨合成生物学驱动的微生物疗法在多种疾病治疗中的创新策略和最新进展 | 微生物疗法在胃肠道疾病、癌症、代谢疾病、感染和其他疾病中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-11-10 |
Omic-driven strategies to unveil microbiome potential for biodegradation of plastics: a review
2024-Oct-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04165-3
PMID:39432094
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综述 | 本文综述了基于组学的策略在揭示微生物群落降解塑料潜力方面的应用 | 本文探讨了组学技术在塑料降解研究中的应用，并讨论了基于组学方法在识别新型塑料降解微生物、酶和代谢途径方面的关键发现、挑战和未来前景 | NA | 探讨组学技术在塑料降解研究中的应用，并讨论未来的发展方向 | 微生物群落与塑料的相互关系，以及参与塑料降解过程的基因和酶的作用 | 生物技术 | NA | 组学技术（基因组学、转录组学和蛋白质组学） | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-11-09 |
Elucidating the metabolic roles of isoflavone synthase-mediated protein-protein interactions in yeast
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620109
PMID:39484494
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研究论文 | 本文通过酵母合成生物学方法，研究了大豆来源的异黄酮合酶（GmIFS2）与其他酶在异黄酮代谢中的蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）的代谢作用 | 开发了一种酵母合成生物学方法来阐明异黄酮合酶介导的蛋白质-蛋白质相互作用在异黄酮代谢中的作用，并鉴定了两种新的异黄酮甲基转移酶 | NA | 阐明异黄酮合酶介导的蛋白质-蛋白质相互作用在酵母中的代谢作用 | 大豆来源的异黄酮合酶（GmIFS2）与其他酶在异黄酮代谢中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 代谢生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-11-08 |
Decoding biology with massively parallel reporter assays and machine learning
2024-Oct-16, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351800.124
PMID:39362779
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综述 | 本文综述了大规模并行报告基因分析（MPRA）与机器学习结合在解码基因表达调控中的应用 | 结合MPRA和机器学习模型，能够量化序列变异对基因表达的影响，并预测训练数据集外的序列 | NA | 探讨MPRA与机器学习在基因表达调控中的应用 | 基因表达调控中的序列变异 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告基因分析（MPRA） | 机器学习模型 | 序列数据 | NA |
| 15 | 2024-11-08 |
Microbial Therapeutics in Oncology: A Comprehensive Review of Bacterial Role in Cancer Treatment
2024-Oct, Cureus
DOI:10.7759/cureus.70920
PMID:39502977
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综述 | 本文综述了细菌在癌症治疗中的潜在应用 | 探讨了细菌疗法在癌症治疗中的独特优势，如选择性靶向和定植于肿瘤的缺氧和坏死区域 | 讨论了细菌疗法面临的挑战，如安全性问题、免疫逃避和精确靶向的需求 | 旨在全面回顾细菌在癌症治疗中的作用，并探讨其潜在机制和临床应用 | 细菌疗法在癌症治疗中的应用及其机制 | NA | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-11-07 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2024-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576308
PMID:39484520
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研究论文 | 开发了一种名为hDIRECT的平台，利用人源蛋白控制细胞因子活性，以支持基于细胞的疗法 | 首次开发了完全使用人源蛋白的细胞因子调控平台，避免了免疫原性风险 | NA | 开发一种安全有效的细胞因子调控平台，以支持基于细胞的疗法 | 人源蛋白、细胞因子（IL-2、IL-6、IL-10）及其调控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-11-07 |
A size filter at the Golgi regulates apical membrane protein sorting
2024-Oct, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01500-0
PMID:39237743
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研究论文 | 研究探讨了高尔基体中的尺寸过滤器如何调控顶膜蛋白的分类 | 首次揭示了高尔基体中的尺寸过滤器对具有小细胞质尾部的顶膜蛋白分类的促进作用 | 研究仅限于Crb3、Ace2和Muc1三种代表性顶膜蛋白，可能无法全面代表所有顶膜蛋白的情况 | 探究顶膜蛋白在高尔基体中的分类机制 | Crb3、Ace2和Muc1三种顶膜蛋白及其细胞质尾部 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | 蛋白质 | 三种代表性顶膜蛋白 |
| 18 | 2024-11-07 |
Assessing the transcriptional landscape of Pseudomonas phage 201ϕ2-1: Uncovering the small regulatory details of a giant phage
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70037
PMID:39460739
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研究论文 | 研究了巨型噬菌体201ϕ2-1的转录组结构，揭示了其调控机制 | 发现了201ϕ2-1中高度保守的小RNA，并重新分类了其宿主基因组 | NA | 深入理解噬菌体-宿主感染过程及其在噬菌体工程和生物技术应用中的重要性 | 巨型噬菌体201ϕ2-1及其宿主Pseudomonas atacamensis | NA | NA | ONT-cappable-sequencing | NA | RNA序列 | 67个启动子和132个终止子，代表92个转录单元 |
| 19 | 2024-11-04 |
Minimisation of metabolic networks defines a new functional class of genes
2024-Oct-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52816-2
PMID:39482321
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研究论文 | 本文设计了一种新的合成生物学管道，用于构建最小代谢网络（MMNs），并定义了一类新的功能基因——网络效率决定因子（NEDs） | 本文提出了一种新的合成生物学方法来构建最小代谢网络，并定义了一类新的功能基因NEDs，这些基因在代谢网络中具有重要作用 | NA | 研究最小代谢网络的构建及其对生物技术和代谢过程效率的影响 | 基因编码的酶和转运蛋白，以及最小代谢网络中的功能基因NEDs | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 基因组规模代谢模型 | NA |
| 20 | 2024-11-04 |
SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582384
PMID:39484537
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的SEGUID校验和算法SEGUID v2，用于处理线性、环状、单链和双链的生物序列 | SEGUID v2扩展了原始SEGUID算法，能够处理线性和环状的单链和双链DNA及RNA序列，并使用Base64url编码SHA-1哈希，确保校验和在不同平台和URL中的兼容性 | NA | 开发一种新的校验和算法，以确保合成生物学中DNA片段的数据完整性 | 线性、环状、单链和双链的DNA及RNA序列 | 生物信息学 | NA | SHA-1哈希算法 | NA | 序列数据 | NA |