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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
|
研究论文 | 本研究开发了一种木糖诱导且葡萄糖不敏感的基因表达系统IExyl*,并应用于提高Parageobacillus thermoglucosidasius的核黄素产量 | 通过组合xylA5p启动子和XylR调节因子,优化XylR表达强度并降低葡萄糖对木糖摄取的代谢物阻遏,创建了葡萄糖不敏感的木糖诱导表达系统 | NA | 开发适用于Parageobacillus thermoglucosidasius的诱导表达系统 | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542菌株 | 合成生物学 | NA | 启动子工程,代谢工程 | NA | NA | NA | 启动子工程,代谢通路重定向 | Parageobacillus thermoglucosidasius | 木糖诱导表达系统,包含xylA5p启动子和XylR转录调节因子 | 工业生物技术 |
| 22 | 2025-10-05 |
In vivo thrombin activity in the diatom Phaeodactylum tricornutum: biotechnological insights
2024-Oct-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13322-z
PMID:39377797
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研究论文 | 本研究在三角褐指藻中鉴定并验证了具有凝血酶样活性的蛋白酶,推进了硅藻在生物技术中的应用 | 首次在三角褐指藻中发现具有凝血酶样活性的新型蛋白酶,并通过体内实验验证其切割效率 | NA | 探索三角褐指藻中凝血酶样蛋白的存在及其在生物工程中的应用潜力 | 三角褐指藻中的凝血酶样蛋白序列及其功能特性 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟分析、蛋白质结构预测、分子对接、Western blot | NA | 基因组序列、蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | 三角褐指藻 | 凝血酶识别序列LVPRGS的融合蛋白构建 | 工业生物技术 |
| 23 | 2025-10-05 |
Minimisation of metabolic networks defines a new functional class of genes
2024-10-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52816-2
PMID:39482321
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研究论文 | 本研究通过计算机合成生物学流程构建最小代谢网络,定义了一类新的功能基因——网络效率决定因子 | 提出了网络效率决定因子这一新的功能基因类别,并开发了新的计算机合成生物学流程来构建最小代谢网络 | 研究主要基于计算机模拟,需要实验验证 | 通过最小化代谢网络来识别对代谢效率至关重要的基因 | 代谢网络中的基因和蛋白质 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟、生物信息学分析 | NA | 基因组规模代谢模型数据 | NA | 计算机合成生物学流程 | 酵母 | 最小代谢网络设计 | 工业生物技术 |
| 24 | 2025-10-05 |
Engineering Plant Metabolism for Synthesizing Amino Acid Derivatives of Animal Origin Using a Synthetic Modular Approach
2024-Oct-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c05719
PMID:39356107
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研究论文 | 本研究利用植物代谢工程合成动物来源的氨基酸衍生物,通过合成模块化方法成功在植物中生产肌酸、肌肽和牛磺酸 | 开发了合成模块化框架,首次在植物中实现多种动物来源氨基酸衍生物的重定向合成,并发现模块整合可显著提高产量并减少对植物代谢的影响 | 牛磺酸模块的引入意外抑制了植物半胱氨酸生物合成,表明外源途径引入可能导致复杂的代谢调整 | 通过合成生物学方法增强植物性饮食的营养价值,实现动物来源必需营养素的可持续生产 | 肌酸、肌肽和牛磺酸等动物来源氨基酸衍生物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达系统 | NA | 代谢产物定量数据 | NA | 合成模块化框架 | 植物 | 专门设计的合成代谢模块,包括肌酸模块、肌肽模块和牛磺酸模块,通过模块堆叠实现代谢通量重定向 | 农业,食品 |
| 25 | 2025-10-05 |
Translational activation by a synthetic PPR protein elucidates control of psbA translation in Arabidopsis chloroplasts
2024-Oct-03, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae112
PMID:38593198
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研究论文 | 本研究通过合成PPR蛋白替代HCF173功能,揭示了拟南芥叶绿体中psbA翻译的光调控机制 | 首次证明合成PPR蛋白能够部分替代天然HCF173蛋白的功能激活psbA翻译,但无法实现光响应调控 | 合成PPR蛋白只能部分恢复HCF173功能,且无法实现光响应翻译调控 | 探究叶绿体psbA mRNA翻译的光调控分子机制 | 拟南芥叶绿体psbA mRNA及其翻译调控蛋白HCF173 | 合成生物学 | NA | 合成PPR蛋白设计、体内结合分析、翻译活性检测 | NA | 分子生物学实验数据 | NA | 合成PPR蛋白 | 拟南芥 | 翻译激活系统 | 合成生物学, 基础研究 |
| 26 | 2025-10-05 |
DNA Origami - Lipid Membrane Interactions Controlled by Nanoscale Sterics
2024-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202404720
PMID:39162223
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研究论文 | 本研究探讨了DNA纳米结构与脂质膜相互作用的立体效应控制机制 | 首次系统研究了DNA纳米结构锚点立体环境对膜相互作用的影响,揭示了局部纳米尺度形态比全局囊泡尺寸更关键的作用机制 | 研究仅针对四种特定立体环境,尚未涵盖所有可能的几何构型 | 阐明DNA纳米结构与双层膜相互作用的立体控制原理 | 具有不同立体环境膜锚点的3D DNA纳米结构和不同尺寸的膜囊泡 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | 实验数据 | 四种不同立体环境的DNA纳米结构锚点 | DNA折纸技术 | NA | 膜相互作用控制系统 | 生物传感,诊断,合成生物学 |
| 27 | 2025-10-05 |
Modified Tn7 transposon vectors for controlled chromosomal gene expression
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01556-24
PMID:39291982
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研究论文 | 本研究开发了改良的mini-Tn7转座子载体,通过添加诱导型和组成型启动子实现染色体整合基因的差异表达控制 | 在mini-Tn7转座子载体中整合了诱导型(Pcum)和组成型(PcL和Ptac)启动子,首次实现了染色体整合基因的可调控表达 | 目前仅在大肠杆菌K-12菌株MG1655中验证,尚未在其他革兰氏阴性菌中测试 | 开发能够实现染色体整合基因可控表达的转座子载体系统 | 大肠杆菌K-12菌株MG1655及其染色体Tn7位点 | 合成生物学 | NA | Tn7转座子整合、基因克隆、荧光蛋白表达分析 | NA | 基因表达数据、荧光强度数据 | 大肠杆菌K-12菌株MG1655 | Tn7转座子 | 大肠杆菌 | 启动子调控的基因表达系统,包括组成型表达和诱导型表达回路 | 工业生物技术,医学 |
| 28 | 2025-10-05 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
|
研究论文 | 本研究构建了高效生产植物源抗真菌倍半萜5-表-jinkoheremol的微生物平台 | 首次构建了可持续生产该抗真菌倍半萜的高效微生物细胞工厂,通过代谢工程和蛋白质工程策略显著提高了产量 | 研究仅在摇瓶培养规模进行,尚未进行大规模发酵验证 | 开发高效生产植物源抗真菌倍半萜5-表-jinkoheremol的微生物平台 | 酿酒酵母工程菌株及其代谢途径 | 合成生物学 | 作物真菌病害 | 代谢工程、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 代谢物产量数据、酶活性数据 | NA | 代谢工程,蛋白质工程 | 酿酒酵母 | 甲羟戊酸途径和甾醇生物合成途径优化,转录因子Hac1和mA writer Ime4调控策略 | 农业,医药 |
| 29 | 2025-10-05 |
Making Neurobots and Chimerical Ctenophores
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620631
PMID:39554129
|
研究论文 | 利用栉水母作为模型构建嵌合动物和神经机器人 | 发现栉水母的自我识别特征和祖神经-免疫结构,首次实现三种栉水母物种的神经机器人和嵌合动物构建 | 未明确说明实验构建的神经机器人和嵌合动物的具体功能特性和长期存活能力 | 探索利用生物材料构建活体机器的可能性 | 栉水母(三种物种)的神经和免疫系统 | 合成生物学 | NA | 生物工程 | NA | 实验数据 | 三种栉水母物种 | NA | 栉水母 | 混合神经系统和完整动物的实验构建 | 生物医学 |
| 30 | 2024-12-18 |
Positions of cysteine residues reveal local clusters and hidden relationships to Sequons and Transmembrane domains in Human proteins
2024-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77056-8
PMID:39468182
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研究论文 | 本文研究了人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 发现了半胱氨酸残基在蛋白质中的频率与长度相关,并且CC间隙的频率可以作为区分具有特殊结构和功能的蛋白质的分类器 | 讨论了计算预测中缺乏的蛋白质结构动力学,但未提供具体的改进方法 | 研究人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 人类蛋白质中的半胱氨酸残基、N-糖基化位点和跨膜结构域 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质序列 | 整个人类蛋白质组 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-12-08 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-Oct-29, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
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研究论文 | 研究了甲烷产生菌Methanosarcina acetivorans在能量保存酶HdrED抑制下的转录响应 | 揭示了甲烷产生菌通过未知机制将甲烷生成与基因调控通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性高效耦合 | NA | 探究细胞如何感知和响应终端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans细胞在HdrED酶缺失下的转录变化 | 代谢网络 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-12-08 |
Combining culture optimization and synthetic biology to improve production and detection of secondary metabolites in Myxococcus xanthus: application to myxoprincomide
2024-Oct-21, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01740-24
PMID:39431896
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为2PRIM-BOOST的新策略,通过结合底盘菌株工程和生长介质优化,提高Myxococcus xanthus中非核糖体肽合成酶(NRPS)/聚酮合成酶(PKS)次级代谢产物的生产与检测 | 提出了2PRIM-BOOST策略,结合底盘菌株工程和生长介质优化,显著提高了myxoprincomide等次级代谢产物的生产 | NA | 开发一种新策略以提高Myxococcus xanthus中次级代谢产物的生产与检测 | Myxococcus xanthus中的次级代谢产物,特别是myxoprincomide | 合成生物学 | NA | 底盘菌株工程、生长介质优化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-12-05 |
Cofactor recycling strategies for secondary metabolite production in cell-free protein expression systems
2024-Oct, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-024-01234-1
PMID:39618802
|
研究论文 | 本文探讨了在无细胞蛋白表达系统中再生辅因子以促进次级代谢产物生产的策略 | 提出了在无细胞蛋白合成系统中再生辅因子的策略,以实现复杂代谢产物的连续生产 | NA | 旨在克服无细胞蛋白合成系统中辅因子再生效率低下的问题,以促进次级代谢产物的生产 | 无细胞蛋白合成系统中的辅因子再生策略 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-11-28 |
Route to Measure Exact Parameters of Bio-Nanostructures Self-Assembly
2024-Oct-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111388
PMID:39595566
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法来确定生物纳米结构自组装机制的关键参数 | 首次实现了对自组装过程中自催化与自抑制参数的精确计算 | NA | 深入理解生物纳米结构的自组装机制 | 生物纳米结构的自组装过程 | 纳米技术 | NA | 数学建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-12-01 |
The Importance of Biosecurity in Emerging Biotechnologies and Synthetic Biology
2024 Oct-Dec, Avicenna journal of medical biotechnology
DOI:10.18502/ajmb.v16i4.16738
PMID:39606684
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综述 | 本文综述了合成生物学领域的生物安全、生物安保和网络生物安保问题 | 探讨了合成生物学在设计和开发病原性生物武器方面的潜在风险,并提出了标准化和监管的必要性 | 未提供具体的解决方案或技术细节,主要集中在问题识别和政策建议上 | 评估新兴生物技术和合成生物学中的生物安全风险,并提出标准化和监管的建议 | 合成生物学技术及其在生物安全、生物安保和网络生物安保方面的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-11-19 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620122
PMID:39554157
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研究论文 | 本文研究了通过工程化细菌诱导的肿瘤特异性抗体促进膀胱癌免疫治疗的效果 | 利用合成生物学技术改造益生菌Nissle 1917表达人趋化因子CXCL13,增强肿瘤特异性体液免疫,并与PD-1阻断疗法结合,显著提高治疗效果 | NA | 探索工程化细菌在膀胱癌免疫治疗中的应用 | 膀胱癌及其免疫治疗 | NA | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-11-10 |
Synthetic Biology-Driven Microbial Therapeutics for Disease Treatment
2024-Oct-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2407.07004
PMID:39233526
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综述 | 本文综述了合成生物学驱动的微生物疗法在疾病治疗中的应用 | 利用合成生物学技术,通过基因编码的生物传感器和动态调控工具,设计微生物疗法,实现精准靶向和调控,提高治疗效果和安全性 | NA | 探讨合成生物学驱动的微生物疗法在多种疾病治疗中的创新策略和最新进展 | 微生物疗法在胃肠道疾病、癌症、代谢疾病、感染和其他疾病中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-11-10 |
Omic-driven strategies to unveil microbiome potential for biodegradation of plastics: a review
2024-Oct-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04165-3
PMID:39432094
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综述 | 本文综述了基于组学的策略在揭示微生物群落降解塑料潜力方面的应用 | 本文探讨了组学技术在塑料降解研究中的应用,并讨论了基于组学方法在识别新型塑料降解微生物、酶和代谢途径方面的关键发现、挑战和未来前景 | NA | 探讨组学技术在塑料降解研究中的应用,并讨论未来的发展方向 | 微生物群落与塑料的相互关系,以及参与塑料降解过程的基因和酶的作用 | 生物技术 | NA | 组学技术(基因组学、转录组学和蛋白质组学) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-11-09 |
Elucidating the metabolic roles of isoflavone synthase-mediated protein-protein interactions in yeast
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620109
PMID:39484494
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研究论文 | 本文通过酵母合成生物学方法,研究了大豆来源的异黄酮合酶(GmIFS2)与其他酶在异黄酮代谢中的蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)的代谢作用 | 开发了一种酵母合成生物学方法来阐明异黄酮合酶介导的蛋白质-蛋白质相互作用在异黄酮代谢中的作用,并鉴定了两种新的异黄酮甲基转移酶 | NA | 阐明异黄酮合酶介导的蛋白质-蛋白质相互作用在酵母中的代谢作用 | 大豆来源的异黄酮合酶(GmIFS2)与其他酶在异黄酮代谢中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 代谢生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-11-08 |
Decoding biology with massively parallel reporter assays and machine learning
2024-Oct-16, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351800.124
PMID:39362779
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综述 | 本文综述了大规模并行报告基因分析(MPRA)与机器学习结合在解码基因表达调控中的应用 | 结合MPRA和机器学习模型,能够量化序列变异对基因表达的影响,并预测训练数据集外的序列 | NA | 探讨MPRA与机器学习在基因表达调控中的应用 | 基因表达调控中的序列变异 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告基因分析(MPRA) | 机器学习模型 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |