合成生物学相关文章
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当前共找到 88 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2024-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576308
PMID:39484520
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研究论文 | 开发了一种基于人类蛋白酶调控细胞因子分泌的合成生物学平台hDIRECT | 首次使用全人类源蛋白质构建正交化细胞因子调控系统，避免非人类源蛋白的免疫原性风险 | 目前仅为概念验证阶段，尚未进行临床验证 | 开发用于细胞疗法的人类源合成生物学调控系统 | 人类细胞因子(IL-2、IL-6、IL-10)和人类蛋白酶 | 合成生物学 | 癌症免疫治疗、肌肉再生 | 蛋白质工程、蛋白酶调控 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 人类细胞 | 蛋白酶调控的细胞因子激活/失活开关 | 医学 |
| 22 | 2025-10-05 |
Session commentaries: synthetic and constructive biology
2024-Oct, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-024-01219-0
PMID:39618793
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评论 | 本文总结了IUPAB2024会议上关于体外合成生物学的专题讨论，重点探讨通过构建体外生物分子系统来理解生命细胞的知识 | 聚焦于体外合成生物学这一新兴分支，强调通过非生命细胞的体外重建来研究生命系统 | NA | 探讨合成生物学中“通过构建来学习”的核心理念及其在体外系统的应用 | 体外生物分子系统 | 合成生物学 | NA | 体外重建技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基础研究 |
| 23 | 2025-10-05 |
Strategies for developing phages into novel antimicrobial tailocins
2024-10, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.03.003
PMID:38580606
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综述 | 本文综述了利用噬菌体作为支架开发新型尾蛋白抗生素的策略 | 提出通过合成生物学方法以具有收缩尾的噬菌体为支架开发尾蛋白，释放其抗菌潜力 | NA | 开发新型尾蛋白抗生素以解决天然尾蛋白多样性有限的问题 | 噬菌体尾部和尾蛋白的结构与功能 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 尾蛋白生物合成途径 | 医药 |
| 24 | 2025-10-05 |
Architectural engineering of Cyborg Bacteria with intracellular hydrogel
2024-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101226
PMID:39328785
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研究论文 | 本研究通过调控不同结构的水凝胶实现半机械细菌的物理和生化特性控制 | 首次展示了通过调控细胞内水凝胶组分（不同光引发剂、分子量PEG-DA、4臂PEG-DA和dsDNA-PEG）来调控半机械细菌功能与结构的新策略 | NA | 探索通过细胞内材料工程控制半机械细菌功能的新方法 | 半机械细菌（Cyborg Bacteria） | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 细胞内PEG基水凝胶架构 | 工业生物技术 |
| 25 | 2025-10-05 |
A robust synthetic biology toolkit to advance carboxysome study and redesign
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617227
PMID:39416180
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研究论文 | 本研究开发并验证了pXpressome工具包，用于稳健表达和改造α-羧酶体 | 开发了首个能够稳定表达完整功能性α-羧酶体的质粒工具包，并发现通过调节顶点和面形成蛋白比例可理性调控羧酶体形态 | NA | 开发合成生物学工具包以促进羧酶体研究和重新设计 | α-羧酶体及其组成蛋白 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、荧光标记、蛋白质纯化 | NA | 蛋白质表达数据、形态学观察数据 | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 大肠杆菌 | 羧酶体合成途径、纳米封装平台 | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 26 | 2025-10-05 |
Lipase activated endocytosis-like behavior of oil-in-water emulsion
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52802-8
PMID:39353937
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研究论文 | 本研究揭示了水包油乳液中脂滴在酶促反应触发下表现出的内吞样行为及其功能应用 | 首次发现脂肪酶触发的人工脂滴内吞样行为，并阐明其由界面张力降低和膜压缩力增加驱动的机制 | NA | 探索人工脂滴的生物物理动态行为及其在合成生物学中的应用 | 水包油乳液脂滴 | 合成生物学 | NA | 酶促反应分析 | NA | 生物物理数据 | NA | NA | NA | 人工脂滴系统 | 工业生物技术,材料 |
| 27 | 2025-10-05 |
Current Technologies in Snake Venom Analysis and Applications
2024-10-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins16110458
PMID:39591213
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综述 | 本文全面探讨了蛇毒研究领域的最新技术进展，重点介绍了蛋白质组学、基因组学、转录组学和生物信息学的整合应用 | 整合合成生物学与多组学方法（统称为毒液组学），深入揭示毒液功能及其治疗潜力 | 毒素功能表征和低成本抗蛇毒血清开发仍面临挑战 | 探索蛇毒分析技术及其生物医学应用 | 蛇毒及其毒素 | 生物信息学 | NA | 蛋白质组学, 基因组学, 转录组学, 生物信息学, 合成生物学, 冷冻电镜, mRNA技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 28 | 2025-10-05 |
Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits
2024-10-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52976-1
PMID:39384772
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研究论文 | 通过重编程大肠杆菌碳储存调控网络，开发了可实现复杂转录后控制的多层遗传电路 | 利用天然Csr网络相互作用构建转录后逻辑门，实现了在三种工业相关细菌中的跨物种移植 | NA | 开发可编程的转录后调控工具以实现复杂细菌调控 | 大肠杆菌碳储存调控网络及其在工业细菌中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA-蛋白质相互作用工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 缓冲门、非门、双向调节器、布尔逻辑门（或门、或非门、与门、与非门）和脉冲发生电路 | 工业生物技术 |
| 29 | 2025-10-05 |
Enhancers: A Focus on Synthetic Biology and Correlated Gene Expression
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00244
PMID:39276360
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综述 | 本文聚焦合成生物学方法研究增强子功能及其与基因表达相关性的机制 | 系统阐述合成生物学方法在解析增强子功能机制中的应用，提出局部环境中多基因与增强子相互作用导致基因表达相关性的新观点 | 主要关注合成报告基因研究方法，未深入讨论天然基因组环境的完整复杂性 | 探讨增强子在基因调控中的作用机制及其与基因表达相关性的关系 | 增强子及其调控的基因表达 | 合成生物学 | NA | 合成报告基因分析，高通量报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | NA | 合成报告基因构建 | 后生动物细胞 | 基因表达调控系统，增强子-报告基因回路 | 基础生物学研究 |
| 30 | 2025-10-05 |
Rational Design of High-Efficiency Synthetic Small Regulatory RNAs and Their Application in Robust Genetic Circuit Performance Through Tight Control of Leaky Gene Expression
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00323
PMID:39294875
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研究论文 | 本研究开发了高效合成小RNA的理性设计策略，并通过其在遗传电路中的应用解决了基因表达泄漏问题 | 通过优化sRNA支架、mRNA结合亲和力、Hfq蛋白表达水平和mRNA二级结构等多个参数，显著提高了合成sRNA的效率 | NA | 开发高效合成小RNA的理性设计策略并应用于遗传电路性能优化 | 合成小RNA和细菌遗传电路 | 合成生物学 | NA | 合成sRNA设计 | 正反馈电路 | NA | NA | 合成sRNA | 细菌 | 正反馈电路，用于控制基因表达泄漏 | 工业生物技术, 代谢工程 |
| 31 | 2025-10-05 |
Modular Cloning Tools for Streptomyces spp. and Application to the De Novo Biosynthesis of Flavokermesic Acid
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00412
PMID:39307986
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研究论文 | 本研究开发了适用于链霉菌的模块化克隆工具，并成功应用于黄酮红酸的全新生物合成 | 开发了首个针对链霉菌的模块化克隆系统，包含适配载体和遗传元件，能够构建完整遗传回路 | NA | 开发适用于链霉菌的合成生物学工具，实现多组分基因簇的从头组装 | 链霉菌及其天然产物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆系统、β-葡萄糖醛酸苷酶报告系统 | NA | NA | NA | MoClo | 链霉菌 | 黄酮红酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 32 | 2025-10-05 |
Efficient Simulation of Viral Transduction and Propagation for Biomanufacturing
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00227
PMID:39315883
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研究论文 | 开发了用于优化病毒转导和扩增生物制造平台的vitraPro软件工具包 | 提出了包含多尺度模型和高效数值技术的软件工具包，可同时模拟两种病毒的感染传播过程 | 模型验证仅限于杆状病毒表达载体系统和甲型流感悬浮培养案例 | 优化基于病毒转导的生物制造平台和病毒扩增过程 | 病毒转导和传播过程 | 合成生物学 | NA | 多尺度建模、数值模拟 | 多尺度模型 | NA | NA | NA | 悬浮培养细胞 | 病毒转导系统、病毒扩增过程 | 工业生物技术 |
| 33 | 2025-10-05 |
An Automated Cell-Free Workflow for Transcription Factor Engineering
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00471
PMID:39373325
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研究论文 | 开发了一种自动化无细胞工作流程用于转录因子工程 | 创建了基于Echo声波液体处理器的通用化无细胞基因表达工作流程，可在48小时内完成数千种转录因子变体的高通量筛选 | NA | 优化自动化无细胞基因表达工作流程以加速合成生物学设计周期 | MerR和CadR转录因子变体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达(CFE) | NA | 生物传感器响应数据 | 127个MerR变体和134个CadR变体，共3682个无细胞反应 | Echo Acoustic Liquid Handler | 无细胞系统 | 转录因子生物传感器，用于汞和镉检测 | 环境监测 |
| 34 | 2025-10-05 |
Characterizing and Engineering Rhamnose-Inducible Regulatory Systems for Dynamic Control of Metabolic Pathways in Streptomyces
2024-10-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00626
PMID:39377938
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研究论文 | 本研究表征并构建了鼠李糖诱导型调控系统，用于在链霉菌中实现代谢途径的动态控制 | 通过生物信息学分析发现鼠李糖代谢途径，构建了无泄漏表达的鼠李糖诱导型调控系统RhaREG1和RhaREG2 | NA | 开发有效的基因诱导系统用于合成生物技术应用 | 链霉菌属及其天然产物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析，电泳迁移率变动分析(EMSA)，多序列比对 | NA | 基因组序列，蛋白质序列，启动子活性数据 | NA | 合成生物学策略 | 链霉菌 | 鼠李糖诱导型调控系统，通过将阻遏蛋白/操作子对RhaR/RhaO与组成型启动子组装构建 | 工业生物技术 |
| 35 | 2025-10-05 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
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研究论文 | 本研究开发了一种木糖诱导且葡萄糖不敏感的基因表达系统IExyl*，并应用于提高Parageobacillus thermoglucosidasius的核黄素产量 | 通过组合xylA5p启动子和XylR调节因子，优化XylR表达强度并降低葡萄糖对木糖摄取的代谢物阻遏，创建了葡萄糖不敏感的木糖诱导表达系统 | NA | 开发适用于Parageobacillus thermoglucosidasius的诱导表达系统 | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542菌株 | 合成生物学 | NA | 启动子工程，代谢工程 | NA | NA | NA | 启动子工程，代谢通路重定向 | Parageobacillus thermoglucosidasius | 木糖诱导表达系统，包含xylA5p启动子和XylR转录调节因子 | 工业生物技术 |
| 36 | 2025-10-05 |
In vivo thrombin activity in the diatom Phaeodactylum tricornutum: biotechnological insights
2024-Oct-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13322-z
PMID:39377797
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研究论文 | 本研究在三角褐指藻中鉴定并验证了具有凝血酶样活性的蛋白酶，推进了硅藻在生物技术中的应用 | 首次在三角褐指藻中发现具有凝血酶样活性的新型蛋白酶，并通过体内实验验证其切割效率 | NA | 探索三角褐指藻中凝血酶样蛋白的存在及其在生物工程中的应用潜力 | 三角褐指藻中的凝血酶样蛋白序列及其功能特性 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟分析、蛋白质结构预测、分子对接、Western blot | NA | 基因组序列、蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | 三角褐指藻 | 凝血酶识别序列LVPRGS的融合蛋白构建 | 工业生物技术 |
| 37 | 2025-10-05 |
Minimisation of metabolic networks defines a new functional class of genes
2024-10-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52816-2
PMID:39482321
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研究论文 | 本研究通过计算机合成生物学流程构建最小代谢网络，定义了一类新的功能基因——网络效率决定因子 | 提出了网络效率决定因子这一新的功能基因类别，并开发了新的计算机合成生物学流程来构建最小代谢网络 | 研究主要基于计算机模拟，需要实验验证 | 通过最小化代谢网络来识别对代谢效率至关重要的基因 | 代谢网络中的基因和蛋白质 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟、生物信息学分析 | NA | 基因组规模代谢模型数据 | NA | 计算机合成生物学流程 | 酵母 | 最小代谢网络设计 | 工业生物技术 |
| 38 | 2025-10-05 |
Engineering Plant Metabolism for Synthesizing Amino Acid Derivatives of Animal Origin Using a Synthetic Modular Approach
2024-Oct-16, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c05719
PMID:39356107
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研究论文 | 本研究利用植物代谢工程合成动物来源的氨基酸衍生物，通过合成模块化方法成功在植物中生产肌酸、肌肽和牛磺酸 | 开发了合成模块化框架，首次在植物中实现多种动物来源氨基酸衍生物的重定向合成，并发现模块整合可显著提高产量并减少对植物代谢的影响 | 牛磺酸模块的引入意外抑制了植物半胱氨酸生物合成，表明外源途径引入可能导致复杂的代谢调整 | 通过合成生物学方法增强植物性饮食的营养价值，实现动物来源必需营养素的可持续生产 | 肌酸、肌肽和牛磺酸等动物来源氨基酸衍生物 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达系统 | NA | 代谢产物定量数据 | NA | 合成模块化框架 | 植物 | 专门设计的合成代谢模块，包括肌酸模块、肌肽模块和牛磺酸模块，通过模块堆叠实现代谢通量重定向 | 农业,食品 |
| 39 | 2025-10-05 |
Translational activation by a synthetic PPR protein elucidates control of psbA translation in Arabidopsis chloroplasts
2024-Oct-03, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koae112
PMID:38593198
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研究论文 | 本研究通过合成PPR蛋白替代HCF173功能，揭示了拟南芥叶绿体中psbA翻译的光调控机制 | 首次证明合成PPR蛋白能够部分替代天然HCF173蛋白的功能激活psbA翻译，但无法实现光响应调控 | 合成PPR蛋白只能部分恢复HCF173功能，且无法实现光响应翻译调控 | 探究叶绿体psbA mRNA翻译的光调控分子机制 | 拟南芥叶绿体psbA mRNA及其翻译调控蛋白HCF173 | 合成生物学 | NA | 合成PPR蛋白设计、体内结合分析、翻译活性检测 | NA | 分子生物学实验数据 | NA | 合成PPR蛋白 | 拟南芥 | 翻译激活系统 | 合成生物学, 基础研究 |
| 40 | 2025-10-05 |
DNA Origami - Lipid Membrane Interactions Controlled by Nanoscale Sterics
2024-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202404720
PMID:39162223
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研究论文 | 本研究探讨了DNA纳米结构与脂质膜相互作用的立体效应控制机制 | 首次系统研究了DNA纳米结构锚点立体环境对膜相互作用的影响，揭示了局部纳米尺度形态比全局囊泡尺寸更关键的作用机制 | 研究仅针对四种特定立体环境，尚未涵盖所有可能的几何构型 | 阐明DNA纳米结构与双层膜相互作用的立体控制原理 | 具有不同立体环境膜锚点的3D DNA纳米结构和不同尺寸的膜囊泡 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | 实验数据 | 四种不同立体环境的DNA纳米结构锚点 | DNA折纸技术 | NA | 膜相互作用控制系统 | 生物传感,诊断,合成生物学 |