合成生物学相关文章
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当前共找到 95 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-11-02 |
Evolution shapes and conserves genomic signatures in viruses
2024-Oct-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07098-1
PMID:39478059
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研究论文 | 研究探讨了2768种真核病毒的基因组特征，揭示了病毒基因组特征的特异性和进化压力 | 首次系统研究了大量真核病毒的基因组特征，发现病毒基因组特征的特异性及其与宿主细胞基因组特征的差异 | 研究主要集中在真核病毒，未涵盖所有病毒类型 | 揭示病毒基因组特征的特异性和进化压力 | 2768种真核病毒 | NA | NA | NA | NA | 基因组数据 | 2768种真核病毒，来自105个病毒科 |
| 22 | 2024-10-30 |
Transcriptomic data reveals an auxiliary detoxification mechanism that alleviates formaldehyde stress in Methylobacterium sp. XJLW
2024-Oct-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10923-w
PMID:39468441
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研究论文 | 研究了Methylobacterium sp. XJLW在甲醛胁迫下的转录组变化，揭示了一种辅助解毒机制 | 发现了RS27765基因簇与代谢旁路基因共同构成的新辅助途径，增强了菌株对甲醛胁迫的耐受性 | 实际应用受到甲醛耐受性等限制 | 探索XJLW菌株在甲醛胁迫下的具体机制 | Methylobacterium sp. XJLW菌株在甲醛处理下的转录组变化 | NA | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 100个可能与甲基转移相关的基因 |
| 23 | 2024-10-30 |
Differential amino acid usage leads to ubiquitous edge effect in proteomes across domains of life that can be explained by amino acid secondary structure propensities
2024-10-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77319-4
PMID:39462053
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研究论文 | 研究分析了5590个物种的蛋白质组，发现氨基酸使用差异导致跨生命域的蛋白质组中普遍存在边缘效应 | 揭示了跨生命域蛋白质组中普遍存在的边缘效应，并提出这种效应源于蛋白质二级结构的约束 | 研究主要集中在氨基酸使用模式上，未深入探讨其对蛋白质功能的具体影响 | 探讨跨生命域的氨基酸使用模式及其潜在机制 | 5590个物种的蛋白质组 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质组数据 | 5590个物种 |
| 24 | 2024-10-29 |
Chemical and Transcriptomic Analyses Provide New Insights into Key Genes for Ginsenoside Biosynthesis in the Rhizome of Panax japonicus C. A. Meyer
2024-Oct-18, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29204936
PMID:39459304
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研究论文 | 本文通过化学和转录组分析，揭示了人参皂苷生物合成途径中的关键基因 | 首次通过转录组测序分析了不同组织中人参皂苷含量的差异，并鉴定了与皂苷含量显著相关的关键基因 | 研究仅限于人参的根茎组织，未涉及其他组织或物种 | 探究人参皂苷生物合成途径中的关键基因及其表达与皂苷含量的关系 | 人参根茎中的五种皂苷及其生物合成相关基因 | NA | NA | HPLC、转录组测序、基因克隆与表达 | NA | 化学成分、基因表达数据 | 三种不同组织中的五种皂苷含量测定 |
| 25 | 2024-10-29 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cells
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STRAIGHT-IN Dual的平台，能够在人类诱导多能干细胞中同时进行双位点、单拷贝的DNA有效载荷和基因电路的整合 | STRAIGHT-IN Dual平台能够在一周内实现100%效率的双位点、单拷贝DNA整合，且整合过程几乎无疤痕，便于后续细胞修饰的组件回收 | NA | 研究如何在人类诱导多能干细胞中高效整合DNA有效载荷和基因电路，并探讨这些设计特征对细胞编程的影响 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs） | 合成生物学 | NA | DNA整合技术 | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-10-29 |
A digital CRISPR-dCas9-based gene remodeling biocomputer programmed by dietary compounds in mammals
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.002
PMID:39383861
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR-dCas9的基因重塑生物计算机，通过膳食化合物编程，实现哺乳动物基因的条件性内源转录调控 | 提出了基于CRISPR-dCas9的基因重塑生物计算机（REPA），通过膳食化合物编程，实现精确的基因调控 | NA | 开发一种新的基因调控技术，实现精确的基因重塑和转录调控 | CRISPR-dCas9技术、膳食化合物、基因调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas9 | NA | 基因转录数据 | NA |
| 27 | 2024-10-27 |
Semi-synthesis of a DNA-Tagged Polyketide-Peptide Hybrid Macrocycle Using a Biosynthetically Prepared Fungal Macrolide as a Synthetic Component
2024-Oct-25, Organic letters
IF:4.9Q1
DOI:10.1021/acs.orglett.4c03588
PMID:39415106
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研究论文 | 本文介绍了一种利用基因组挖掘和异源表达系统合成带有DNA标签的多酮肽杂合大环化合物的合成生物学方法 | 该研究展示了合成生物学在扩展构建模块多样性方面的潜力，有助于探索未知的化学空间 | NA | 探索合成生物学在扩展天然产物构建模块多样性方面的应用 | 带有DNA标签的多酮肽杂合大环化合物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、异源表达系统 | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-10-27 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
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研究论文 | 开发了一种木糖诱导且葡萄糖不敏感的表达系统，用于Parageobacillus thermoglucosidasius | 成功设计了一种木糖诱导且葡萄糖不敏感的表达系统IExyl*，并在Parageobacillus thermoglucosidasius中应用，显著提高了核黄素的产量 | NA | 开发一种多功能且高效的诱导表达机制，用于菌株工程和合成生物技术应用 | Parageobacillus thermoglucosidasius中的xylA5p启动子和其转录调控因子XylR | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542 |
| 29 | 2024-10-26 |
Modified Tn7 transposon vectors for controlled chromosomal gene expression
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01556-24
PMID:39291982
|
研究论文 | 本文介绍了一种改进的Tn7转座子载体，用于控制染色体基因表达 | 通过添加可诱导和组成型启动子，增强了mini-Tn插入载体在染色体基因表达控制中的实用性 | NA | 开发一种高效的系统，用于在限制质粒使用的情况下进行基因补全 | K-12菌株MG1655中的绿色荧光蛋白基因 | NA | NA | 转座子插入 | NA | 基因表达 | K-12菌株MG1655 |
| 30 | 2024-10-26 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
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研究论文 | 本文构建了一个微生物平台，用于高效生产具有强杀菌活性的倍半萜类化合物5-epi-jinkoheremol | 首次构建了一个高效的微生物细胞工厂，用于可持续生产这种抗真菌倍半萜 | 关键酶TPS18的催化活性限制了5-epi-jinkoheremol的进一步产量 | 开发一种可持续生产抗真菌倍半萜的方法 | 微生物平台、倍半萜类化合物5-epi-jinkoheremol | NA | NA | 代谢工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-10-26 |
A robust synthetic biology toolkit to advance carboxysome study and redesign
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617227
PMID:39416180
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研究论文 | 设计并验证了一种名为pXpressome工具包的质粒集，用于在α-羧基体中稳健表达并保持其完整性和功能性 | 开发了一种新的pXpressome工具包，能够更均匀地表达和改善细胞健康，优于先前发表的羧基体表达系统 | NA | 推进羧基体的研究和重新设计 | 羧基体的结构和性能 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-10-25 |
Construction of Whole Cell Bacterial Biosensors as an Alternative Environmental Monitoring Technology to Detect Naphthenic Acids in Oil Sands Process-Affected Water
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00260
PMID:39312753
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法构建了一组用于检测油砂加工废水中环烷酸的细菌生物传感器 | 本文首次利用细菌基因在环烷酸中的诱导表达，构建了用于检测油砂加工废水中环烷酸的生物传感器 | 本文仅测试了三种优先启动子对环烷酸混合物和单一化合物的转录响应，未涵盖所有可能的启动子 | 开发一种替代的环境监测技术，用于检测油砂加工废水中的环烷酸 | 环烷酸在油砂加工废水中的检测 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 基因表达数据 | 多种环烷酸混合物和单一化合物，以及少量油砂加工废水样品 |
| 33 | 2024-10-25 |
An Automated Cell-Free Workflow for Transcription Factor Engineering
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00471
PMID:39373325
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研究论文 | 本文介绍了一种可推广的自动化无细胞基因表达工作流程，用于转录因子工程的定制优化 | 提出了基于Echo声波液体处理器的自动化无细胞基因表达工作流程，显著提高了反应灵活性、控制性和数据获取时间 | NA | 开发和优化代谢途径、遗传系统和工程蛋白的高通量检测方法 | 转录因子MerR和CadR的变体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达（CFE） | NA | 基因表达数据 | 127个MerR变体和134个CadR变体，共3682个独特的CFE反应 |
| 34 | 2024-10-24 |
No two clones are alike: characterization of heterologous subpopulations in a transgenic cell line of the model diatom Phaeodactylum tricornutum
2024-Oct-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02559-y
PMID:39428506
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研究论文 | 研究了转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中异源亚群的特征 | 揭示了克隆传播培养物中不同亚群之间的遗传和转录组差异 | NA | 研究硅藻表达系统中的异质性，以促进合成生物学应用 | 转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中的异源亚群 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 来自单个外共轭菌落的多个亚群 |
| 35 | 2024-10-24 |
High-Speed Imaging of Giant Unilamellar Vesicle Formation in cDICE
2024-Oct-15, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c04825
PMID:39431092
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研究论文 | 研究使用高速显微镜实时观察cDICE方法中巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程 | 开发了高速显微镜设置，实时可视化GUV形成过程，揭示了复杂的液滴形成机制 | 液滴形成的起源部分仍不清楚，蛋白质对GUV形成的影响机制需进一步研究 | 深入理解cDICE方法中GUV形成的物理原理，并开发更可靠高效的GUV生产方法 | 巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程及其在cDICE方法中的应用 | 生物物理学 | NA | 高速显微镜 | NA | 图像 | 涉及>30 μm大小的液滴和部分15 μm大小的卫星液滴 |
| 36 | 2024-10-22 |
Astaxanthin biosynthesis for functional food development and space missions
2024-Oct-20, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2410364
PMID:39428346
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综述 | 本文综述了虾青素的生物合成及其在功能食品开发和太空任务中的应用 | 本文提出了合成生物学和细胞工厂策略在工业化生产天然虾青素中的应用，并探讨了其在太空探索和迁移中的潜在贡献 | NA | 探讨虾青素的生物合成及其在不同领域的应用，特别是太空任务中的潜在应用 | 虾青素的生物合成及其在功能食品和太空任务中的应用 | NA | 心血管疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-10-21 |
Intelligent guide RNA: dual toehold switches for modulating luciferase in the presence of trigger RNA
2024-Oct-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06988-8
PMID:39420075
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研究论文 | 开发了一种智能引导RNA系统，通过双足开关机制在触发RNA存在下调节荧光素酶活性 | 引入了一种新的智能引导RNA系统，结合了RNA感应平台和CRISPR/Cas9功能，实现了对特定触发RNA的识别和基因活性的精确调控 | NA | 开发一种能够根据特定细胞环境条件调节基因活性的智能引导RNA系统 | 智能引导RNA系统及其在特定触发RNA存在下的功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | RNA | NA |
| 38 | 2024-10-21 |
Plant synthetic genomics: Big lessons from the little yeast
2024-Oct-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.08.001
PMID:39214084
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研究论文 | 本文探讨了利用酵母合成基因组学的经验来推动植物合成基因组学的发展 | 利用酵母和苔藓植物的相似性，提出了将酵母合成基因组学的技术应用于植物合成基因组学的新方法 | 植物基因组的复杂性仍然是主要挑战 | 探索将酵母合成基因组学的经验应用于植物合成基因组学的可能性 | 酵母和苔藓植物 Physcomitrium patens | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-10-21 |
Diagnosis and mitigation of the systemic impact of genome reduction in Escherichia coli DGF-298
2024-Oct-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00873-24
PMID:39207109
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研究论文 | 研究了基因组简化对大肠杆菌DGF-298的影响，并通过重建代谢模型和适应性实验室进化来减轻这些影响 | 通过系统级方法和适应性实验室进化相结合，修复和优化基因组工程菌株 | NA | 研究基因组简化对大肠杆菌DGF-298的系统性影响并提出缓解措施 | 大肠杆菌DGF-298及其基因组简化后的代谢和表达调控 | 系统生物学 | NA | 代谢模型重建、iModulon-based转录组分析、适应性实验室进化 | 代谢模型 | 转录组数据 | 单一菌株DGF-298 |
| 40 | 2024-10-20 |
BioTRY: A Comprehensive Knowledge Base for Titer, Rate, and Yield of Biosynthesis
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00347
PMID:39423319
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研究论文 | 本文介绍了BioTRY，一个包含超过5,000种生物化学品和3,800种菌株的综合知识库，涵盖了52,000多个相关的TRY条目 | BioTRY是首个从原始研究中收集生物合成TRY数据的可用数据库 | NA | 评估发酵过程的经济可行性 | 生物合成的产量、速率和产率 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 数据库 | 超过5,000种生物化学品和3,800种菌株，52,000多个TRY条目 |