合成生物学相关文章
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当前共找到 94 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-11-08 |
Microbial Therapeutics in Oncology: A Comprehensive Review of Bacterial Role in Cancer Treatment
2024-Oct, Cureus
DOI:10.7759/cureus.70920
PMID:39502977
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综述 | 本文综述了细菌在癌症治疗中的潜在应用 | 探讨了细菌疗法在癌症治疗中的独特优势，如选择性靶向和定植于肿瘤的缺氧和坏死区域 | 讨论了细菌疗法面临的挑战，如安全性问题、免疫逃避和精确靶向的需求 | 旨在全面回顾细菌在癌症治疗中的作用，并探讨其潜在机制和临床应用 | 细菌疗法在癌症治疗中的应用及其机制 | NA | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-11-07 |
A size filter at the Golgi regulates apical membrane protein sorting
2024-Oct, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01500-0
PMID:39237743
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研究论文 | 研究探讨了高尔基体中的尺寸过滤器如何调控顶膜蛋白的分类 | 首次揭示了高尔基体中的尺寸过滤器对具有小细胞质尾部的顶膜蛋白分类的促进作用 | 研究仅限于Crb3、Ace2和Muc1三种代表性顶膜蛋白，可能无法全面代表所有顶膜蛋白的情况 | 探究顶膜蛋白在高尔基体中的分类机制 | Crb3、Ace2和Muc1三种顶膜蛋白及其细胞质尾部 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | 蛋白质 | 三种代表性顶膜蛋白 |
| 23 | 2024-11-07 |
Assessing the transcriptional landscape of Pseudomonas phage 201ϕ2-1: Uncovering the small regulatory details of a giant phage
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70037
PMID:39460739
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研究论文 | 研究了巨型噬菌体201ϕ2-1的转录组结构，揭示了其调控机制 | 发现了201ϕ2-1中高度保守的小RNA，并重新分类了其宿主基因组 | NA | 深入理解噬菌体-宿主感染过程及其在噬菌体工程和生物技术应用中的重要性 | 巨型噬菌体201ϕ2-1及其宿主Pseudomonas atacamensis | NA | NA | ONT-cappable-sequencing | NA | RNA序列 | 67个启动子和132个终止子，代表92个转录单元 |
| 24 | 2024-11-04 |
Minimisation of metabolic networks defines a new functional class of genes
2024-Oct-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52816-2
PMID:39482321
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研究论文 | 本文设计了一种新的合成生物学管道，用于构建最小代谢网络（MMNs），并定义了一类新的功能基因——网络效率决定因子（NEDs） | 本文提出了一种新的合成生物学方法来构建最小代谢网络，并定义了一类新的功能基因NEDs，这些基因在代谢网络中具有重要作用 | NA | 研究最小代谢网络的构建及其对生物技术和代谢过程效率的影响 | 基因编码的酶和转运蛋白，以及最小代谢网络中的功能基因NEDs | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 基因组规模代谢模型 | NA |
| 25 | 2024-11-04 |
SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582384
PMID:39484537
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的SEGUID校验和算法SEGUID v2，用于处理线性、环状、单链和双链的生物序列 | SEGUID v2扩展了原始SEGUID算法，能够处理线性和环状的单链和双链DNA及RNA序列，并使用Base64url编码SHA-1哈希，确保校验和在不同平台和URL中的兼容性 | NA | 开发一种新的校验和算法，以确保合成生物学中DNA片段的数据完整性 | 线性、环状、单链和双链的DNA及RNA序列 | 生物信息学 | NA | SHA-1哈希算法 | NA | 序列数据 | NA |
| 26 | 2024-11-02 |
Evolution shapes and conserves genomic signatures in viruses
2024-Oct-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07098-1
PMID:39478059
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研究论文 | 研究探讨了2768种真核病毒的基因组特征，揭示了病毒基因组特征的特异性和进化压力 | 首次系统研究了大量真核病毒的基因组特征，发现病毒基因组特征的特异性及其与宿主细胞基因组特征的差异 | 研究主要集中在真核病毒，未涵盖所有病毒类型 | 揭示病毒基因组特征的特异性和进化压力 | 2768种真核病毒 | NA | NA | NA | NA | 基因组数据 | 2768种真核病毒，来自105个病毒科 |
| 27 | 2024-10-30 |
Transcriptomic data reveals an auxiliary detoxification mechanism that alleviates formaldehyde stress in Methylobacterium sp. XJLW
2024-Oct-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10923-w
PMID:39468441
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研究论文 | 研究了Methylobacterium sp. XJLW在甲醛胁迫下的转录组变化，揭示了一种辅助解毒机制 | 发现了RS27765基因簇与代谢旁路基因共同构成的新辅助途径，增强了菌株对甲醛胁迫的耐受性 | 实际应用受到甲醛耐受性等限制 | 探索XJLW菌株在甲醛胁迫下的具体机制 | Methylobacterium sp. XJLW菌株在甲醛处理下的转录组变化 | NA | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 100个可能与甲基转移相关的基因 |
| 28 | 2024-10-30 |
Differential amino acid usage leads to ubiquitous edge effect in proteomes across domains of life that can be explained by amino acid secondary structure propensities
2024-10-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77319-4
PMID:39462053
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研究论文 | 研究分析了5590个物种的蛋白质组，发现氨基酸使用差异导致跨生命域的蛋白质组中普遍存在边缘效应 | 揭示了跨生命域蛋白质组中普遍存在的边缘效应，并提出这种效应源于蛋白质二级结构的约束 | 研究主要集中在氨基酸使用模式上，未深入探讨其对蛋白质功能的具体影响 | 探讨跨生命域的氨基酸使用模式及其潜在机制 | 5590个物种的蛋白质组 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质组数据 | 5590个物种 |
| 29 | 2024-10-29 |
Chemical and Transcriptomic Analyses Provide New Insights into Key Genes for Ginsenoside Biosynthesis in the Rhizome of Panax japonicus C. A. Meyer
2024-Oct-18, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29204936
PMID:39459304
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研究论文 | 本文通过化学和转录组分析，揭示了人参皂苷生物合成途径中的关键基因 | 首次通过转录组测序分析了不同组织中人参皂苷含量的差异，并鉴定了与皂苷含量显著相关的关键基因 | 研究仅限于人参的根茎组织，未涉及其他组织或物种 | 探究人参皂苷生物合成途径中的关键基因及其表达与皂苷含量的关系 | 人参根茎中的五种皂苷及其生物合成相关基因 | NA | NA | HPLC、转录组测序、基因克隆与表达 | NA | 化学成分、基因表达数据 | 三种不同组织中的五种皂苷含量测定 |
| 30 | 2024-10-29 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cells
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STRAIGHT-IN Dual的平台，能够在人类诱导多能干细胞中同时进行双位点、单拷贝的DNA有效载荷和基因电路的整合 | STRAIGHT-IN Dual平台能够在一周内实现100%效率的双位点、单拷贝DNA整合，且整合过程几乎无疤痕，便于后续细胞修饰的组件回收 | NA | 研究如何在人类诱导多能干细胞中高效整合DNA有效载荷和基因电路，并探讨这些设计特征对细胞编程的影响 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs） | 合成生物学 | NA | DNA整合技术 | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-10-29 |
A digital CRISPR-dCas9-based gene remodeling biocomputer programmed by dietary compounds in mammals
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.002
PMID:39383861
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR-dCas9的基因重塑生物计算机，通过膳食化合物编程，实现哺乳动物基因的条件性内源转录调控 | 提出了基于CRISPR-dCas9的基因重塑生物计算机（REPA），通过膳食化合物编程，实现精确的基因调控 | NA | 开发一种新的基因调控技术，实现精确的基因重塑和转录调控 | CRISPR-dCas9技术、膳食化合物、基因调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas9 | NA | 基因转录数据 | NA |
| 32 | 2024-10-27 |
Semi-synthesis of a DNA-Tagged Polyketide-Peptide Hybrid Macrocycle Using a Biosynthetically Prepared Fungal Macrolide as a Synthetic Component
2024-Oct-25, Organic letters
IF:4.9Q1
DOI:10.1021/acs.orglett.4c03588
PMID:39415106
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用基因组挖掘和异源表达系统合成带有DNA标签的多酮肽杂合大环化合物的合成生物学方法 | 该研究展示了合成生物学在扩展构建模块多样性方面的潜力，有助于探索未知的化学空间 | NA | 探索合成生物学在扩展天然产物构建模块多样性方面的应用 | 带有DNA标签的多酮肽杂合大环化合物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、异源表达系统 | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-10-27 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
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研究论文 | 开发了一种木糖诱导且葡萄糖不敏感的表达系统，用于Parageobacillus thermoglucosidasius | 成功设计了一种木糖诱导且葡萄糖不敏感的表达系统IExyl*，并在Parageobacillus thermoglucosidasius中应用，显著提高了核黄素的产量 | NA | 开发一种多功能且高效的诱导表达机制，用于菌株工程和合成生物技术应用 | Parageobacillus thermoglucosidasius中的xylA5p启动子和其转录调控因子XylR | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542 |
| 34 | 2024-10-26 |
A robust synthetic biology toolkit to advance carboxysome study and redesign
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617227
PMID:39416180
|
研究论文 | 设计并验证了一种名为pXpressome工具包的质粒集，用于在α-羧基体中稳健表达并保持其完整性和功能性 | 开发了一种新的pXpressome工具包，能够更均匀地表达和改善细胞健康，优于先前发表的羧基体表达系统 | NA | 推进羧基体的研究和重新设计 | 羧基体的结构和性能 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-10-25 |
Construction of Whole Cell Bacterial Biosensors as an Alternative Environmental Monitoring Technology to Detect Naphthenic Acids in Oil Sands Process-Affected Water
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00260
PMID:39312753
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法构建了一组用于检测油砂加工废水中环烷酸的细菌生物传感器 | 本文首次利用细菌基因在环烷酸中的诱导表达，构建了用于检测油砂加工废水中环烷酸的生物传感器 | 本文仅测试了三种优先启动子对环烷酸混合物和单一化合物的转录响应，未涵盖所有可能的启动子 | 开发一种替代的环境监测技术，用于检测油砂加工废水中的环烷酸 | 环烷酸在油砂加工废水中的检测 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 基因表达数据 | 多种环烷酸混合物和单一化合物，以及少量油砂加工废水样品 |
| 36 | 2024-10-25 |
An Automated Cell-Free Workflow for Transcription Factor Engineering
2024-Oct-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00471
PMID:39373325
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研究论文 | 本文介绍了一种可推广的自动化无细胞基因表达工作流程，用于转录因子工程的定制优化 | 提出了基于Echo声波液体处理器的自动化无细胞基因表达工作流程，显著提高了反应灵活性、控制性和数据获取时间 | NA | 开发和优化代谢途径、遗传系统和工程蛋白的高通量检测方法 | 转录因子MerR和CadR的变体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达（CFE） | NA | 基因表达数据 | 127个MerR变体和134个CadR变体，共3682个独特的CFE反应 |
| 37 | 2024-10-24 |
No two clones are alike: characterization of heterologous subpopulations in a transgenic cell line of the model diatom Phaeodactylum tricornutum
2024-Oct-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02559-y
PMID:39428506
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研究论文 | 研究了转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中异源亚群的特征 | 揭示了克隆传播培养物中不同亚群之间的遗传和转录组差异 | NA | 研究硅藻表达系统中的异质性，以促进合成生物学应用 | 转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中的异源亚群 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 来自单个外共轭菌落的多个亚群 |
| 38 | 2024-10-24 |
High-Speed Imaging of Giant Unilamellar Vesicle Formation in cDICE
2024-Oct-15, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c04825
PMID:39431092
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研究论文 | 研究使用高速显微镜实时观察cDICE方法中巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程 | 开发了高速显微镜设置，实时可视化GUV形成过程，揭示了复杂的液滴形成机制 | 液滴形成的起源部分仍不清楚，蛋白质对GUV形成的影响机制需进一步研究 | 深入理解cDICE方法中GUV形成的物理原理，并开发更可靠高效的GUV生产方法 | 巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程及其在cDICE方法中的应用 | 生物物理学 | NA | 高速显微镜 | NA | 图像 | 涉及>30 μm大小的液滴和部分15 μm大小的卫星液滴 |
| 39 | 2024-10-22 |
Astaxanthin biosynthesis for functional food development and space missions
2024-Oct-20, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2410364
PMID:39428346
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综述 | 本文综述了虾青素的生物合成及其在功能食品开发和太空任务中的应用 | 本文提出了合成生物学和细胞工厂策略在工业化生产天然虾青素中的应用，并探讨了其在太空探索和迁移中的潜在贡献 | NA | 探讨虾青素的生物合成及其在不同领域的应用，特别是太空任务中的潜在应用 | 虾青素的生物合成及其在功能食品和太空任务中的应用 | NA | 心血管疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-10-21 |
Intelligent guide RNA: dual toehold switches for modulating luciferase in the presence of trigger RNA
2024-Oct-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06988-8
PMID:39420075
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研究论文 | 开发了一种智能引导RNA系统，通过双足开关机制在触发RNA存在下调节荧光素酶活性 | 引入了一种新的智能引导RNA系统，结合了RNA感应平台和CRISPR/Cas9功能，实现了对特定触发RNA的识别和基因活性的精确调控 | NA | 开发一种能够根据特定细胞环境条件调节基因活性的智能引导RNA系统 | 智能引导RNA系统及其在特定触发RNA存在下的功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | RNA | NA |