合成生物学相关文章
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当前共找到 88 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Modified Tn7 transposon vectors for controlled chromosomal gene expression
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01556-24
PMID:39291982
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研究论文 | 本研究开发了改良的mini-Tn7转座子载体，通过添加诱导型和组成型启动子实现染色体整合基因的差异表达控制 | 在mini-Tn7转座子载体中整合了诱导型(Pcum)和组成型(PcL和Ptac)启动子，首次实现了染色体整合基因的可调控表达 | 目前仅在大肠杆菌K-12菌株MG1655中验证，尚未在其他革兰氏阴性菌中测试 | 开发能够实现染色体整合基因可控表达的转座子载体系统 | 大肠杆菌K-12菌株MG1655及其染色体Tn7位点 | 合成生物学 | NA | Tn7转座子整合、基因克隆、荧光蛋白表达分析 | NA | 基因表达数据、荧光强度数据 | 大肠杆菌K-12菌株MG1655 | Tn7转座子 | 大肠杆菌 | 启动子调控的基因表达系统，包括组成型表达和诱导型表达回路 | 工业生物技术,医学 |
| 42 | 2025-10-05 |
Making Neurobots and Chimerical Ctenophores
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620631
PMID:39554129
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研究论文 | 利用栉水母作为模型构建嵌合动物和神经机器人 | 发现栉水母的自我识别特征和祖神经-免疫结构，首次实现三种栉水母物种的神经机器人和嵌合动物构建 | 未明确说明实验构建的神经机器人和嵌合动物的具体功能特性和长期存活能力 | 探索利用生物材料构建活体机器的可能性 | 栉水母（三种物种）的神经和免疫系统 | 合成生物学 | NA | 生物工程 | NA | 实验数据 | 三种栉水母物种 | NA | 栉水母 | 混合神经系统和完整动物的实验构建 | 生物医学 |
| 43 | 2024-12-18 |
Positions of cysteine residues reveal local clusters and hidden relationships to Sequons and Transmembrane domains in Human proteins
2024-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77056-8
PMID:39468182
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研究论文 | 本文研究了人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 发现了半胱氨酸残基在蛋白质中的频率与长度相关，并且CC间隙的频率可以作为区分具有特殊结构和功能的蛋白质的分类器 | 讨论了计算预测中缺乏的蛋白质结构动力学，但未提供具体的改进方法 | 研究人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 人类蛋白质中的半胱氨酸残基、N-糖基化位点和跨膜结构域 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质序列 | 整个人类蛋白质组 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-12-08 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-Oct-29, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
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研究论文 | 研究了甲烷产生菌Methanosarcina acetivorans在能量保存酶HdrED抑制下的转录响应 | 揭示了甲烷产生菌通过未知机制将甲烷生成与基因调控通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性高效耦合 | NA | 探究细胞如何感知和响应终端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans细胞在HdrED酶缺失下的转录变化 | 代谢网络 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-12-08 |
Combining culture optimization and synthetic biology to improve production and detection of secondary metabolites in Myxococcus xanthus: application to myxoprincomide
2024-Oct-21, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01740-24
PMID:39431896
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研究论文 | 本文介绍了一种名为2PRIM-BOOST的新策略，通过结合底盘菌株工程和生长介质优化，提高Myxococcus xanthus中非核糖体肽合成酶（NRPS）/聚酮合成酶（PKS）次级代谢产物的生产与检测 | 提出了2PRIM-BOOST策略，结合底盘菌株工程和生长介质优化，显著提高了myxoprincomide等次级代谢产物的生产 | NA | 开发一种新策略以提高Myxococcus xanthus中次级代谢产物的生产与检测 | Myxococcus xanthus中的次级代谢产物，特别是myxoprincomide | 合成生物学 | NA | 底盘菌株工程、生长介质优化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-12-05 |
Cofactor recycling strategies for secondary metabolite production in cell-free protein expression systems
2024-Oct, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-024-01234-1
PMID:39618802
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研究论文 | 本文探讨了在无细胞蛋白表达系统中再生辅因子以促进次级代谢产物生产的策略 | 提出了在无细胞蛋白合成系统中再生辅因子的策略，以实现复杂代谢产物的连续生产 | NA | 旨在克服无细胞蛋白合成系统中辅因子再生效率低下的问题，以促进次级代谢产物的生产 | 无细胞蛋白合成系统中的辅因子再生策略 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-12-01 |
The Importance of Biosecurity in Emerging Biotechnologies and Synthetic Biology
2024 Oct-Dec, Avicenna journal of medical biotechnology
DOI:10.18502/ajmb.v16i4.16738
PMID:39606684
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综述 | 本文综述了合成生物学领域的生物安全、生物安保和网络生物安保问题 | 探讨了合成生物学在设计和开发病原性生物武器方面的潜在风险，并提出了标准化和监管的必要性 | 未提供具体的解决方案或技术细节，主要集中在问题识别和政策建议上 | 评估新兴生物技术和合成生物学中的生物安全风险，并提出标准化和监管的建议 | 合成生物学技术及其在生物安全、生物安保和网络生物安保方面的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-11-19 |
Tumor-specific antibodies elicited by engineered bacteria promote bladder cancer immunotherapy
2024-Oct-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620122
PMID:39554157
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研究论文 | 本文研究了通过工程化细菌诱导的肿瘤特异性抗体促进膀胱癌免疫治疗的效果 | 利用合成生物学技术改造益生菌Nissle 1917表达人趋化因子CXCL13，增强肿瘤特异性体液免疫，并与PD-1阻断疗法结合，显著提高治疗效果 | NA | 探索工程化细菌在膀胱癌免疫治疗中的应用 | 膀胱癌及其免疫治疗 | NA | 膀胱癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-11-10 |
Synthetic Biology-Driven Microbial Therapeutics for Disease Treatment
2024-Oct-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2407.07004
PMID:39233526
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综述 | 本文综述了合成生物学驱动的微生物疗法在疾病治疗中的应用 | 利用合成生物学技术，通过基因编码的生物传感器和动态调控工具，设计微生物疗法，实现精准靶向和调控，提高治疗效果和安全性 | NA | 探讨合成生物学驱动的微生物疗法在多种疾病治疗中的创新策略和最新进展 | 微生物疗法在胃肠道疾病、癌症、代谢疾病、感染和其他疾病中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-11-10 |
Omic-driven strategies to unveil microbiome potential for biodegradation of plastics: a review
2024-Oct-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-024-04165-3
PMID:39432094
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综述 | 本文综述了基于组学的策略在揭示微生物群落降解塑料潜力方面的应用 | 本文探讨了组学技术在塑料降解研究中的应用，并讨论了基于组学方法在识别新型塑料降解微生物、酶和代谢途径方面的关键发现、挑战和未来前景 | NA | 探讨组学技术在塑料降解研究中的应用，并讨论未来的发展方向 | 微生物群落与塑料的相互关系，以及参与塑料降解过程的基因和酶的作用 | 生物技术 | NA | 组学技术（基因组学、转录组学和蛋白质组学） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-11-09 |
Elucidating the metabolic roles of isoflavone synthase-mediated protein-protein interactions in yeast
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.24.620109
PMID:39484494
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研究论文 | 本文通过酵母合成生物学方法，研究了大豆来源的异黄酮合酶（GmIFS2）与其他酶在异黄酮代谢中的蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）的代谢作用 | 开发了一种酵母合成生物学方法来阐明异黄酮合酶介导的蛋白质-蛋白质相互作用在异黄酮代谢中的作用，并鉴定了两种新的异黄酮甲基转移酶 | NA | 阐明异黄酮合酶介导的蛋白质-蛋白质相互作用在酵母中的代谢作用 | 大豆来源的异黄酮合酶（GmIFS2）与其他酶在异黄酮代谢中的蛋白质-蛋白质相互作用 | 代谢生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-11-08 |
Microbial Therapeutics in Oncology: A Comprehensive Review of Bacterial Role in Cancer Treatment
2024-Oct, Cureus
DOI:10.7759/cureus.70920
PMID:39502977
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综述 | 本文综述了细菌在癌症治疗中的潜在应用 | 探讨了细菌疗法在癌症治疗中的独特优势，如选择性靶向和定植于肿瘤的缺氧和坏死区域 | 讨论了细菌疗法面临的挑战，如安全性问题、免疫逃避和精确靶向的需求 | 旨在全面回顾细菌在癌症治疗中的作用，并探讨其潜在机制和临床应用 | 细菌疗法在癌症治疗中的应用及其机制 | NA | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-11-07 |
Assessing the transcriptional landscape of Pseudomonas phage 201ϕ2-1: Uncovering the small regulatory details of a giant phage
2024-10, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70037
PMID:39460739
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研究论文 | 研究了巨型噬菌体201ϕ2-1的转录组结构，揭示了其调控机制 | 发现了201ϕ2-1中高度保守的小RNA，并重新分类了其宿主基因组 | NA | 深入理解噬菌体-宿主感染过程及其在噬菌体工程和生物技术应用中的重要性 | 巨型噬菌体201ϕ2-1及其宿主Pseudomonas atacamensis | NA | NA | ONT-cappable-sequencing | NA | RNA序列 | 67个启动子和132个终止子，代表92个转录单元 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-11-04 |
SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences
2024-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582384
PMID:39484537
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研究论文 | 本文提出了一种扩展的SEGUID校验和算法SEGUID v2，用于处理线性、环状、单链和双链的生物序列 | SEGUID v2扩展了原始SEGUID算法，能够处理线性和环状的单链和双链DNA及RNA序列，并使用Base64url编码SHA-1哈希，确保校验和在不同平台和URL中的兼容性 | NA | 开发一种新的校验和算法，以确保合成生物学中DNA片段的数据完整性 | 线性、环状、单链和双链的DNA及RNA序列 | 生物信息学 | NA | SHA-1哈希算法 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-10-30 |
Transcriptomic data reveals an auxiliary detoxification mechanism that alleviates formaldehyde stress in Methylobacterium sp. XJLW
2024-Oct-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10923-w
PMID:39468441
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研究论文 | 研究了Methylobacterium sp. XJLW在甲醛胁迫下的转录组变化，揭示了一种辅助解毒机制 | 发现了RS27765基因簇与代谢旁路基因共同构成的新辅助途径，增强了菌株对甲醛胁迫的耐受性 | 实际应用受到甲醛耐受性等限制 | 探索XJLW菌株在甲醛胁迫下的具体机制 | Methylobacterium sp. XJLW菌株在甲醛处理下的转录组变化 | NA | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 100个可能与甲基转移相关的基因 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-10-30 |
Differential amino acid usage leads to ubiquitous edge effect in proteomes across domains of life that can be explained by amino acid secondary structure propensities
2024-10-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77319-4
PMID:39462053
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研究论文 | 研究分析了5590个物种的蛋白质组，发现氨基酸使用差异导致跨生命域的蛋白质组中普遍存在边缘效应 | 揭示了跨生命域蛋白质组中普遍存在的边缘效应，并提出这种效应源于蛋白质二级结构的约束 | 研究主要集中在氨基酸使用模式上，未深入探讨其对蛋白质功能的具体影响 | 探讨跨生命域的氨基酸使用模式及其潜在机制 | 5590个物种的蛋白质组 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质组数据 | 5590个物种 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-10-29 |
Chemical and Transcriptomic Analyses Provide New Insights into Key Genes for Ginsenoside Biosynthesis in the Rhizome of Panax japonicus C. A. Meyer
2024-Oct-18, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29204936
PMID:39459304
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研究论文 | 本文通过化学和转录组分析，揭示了人参皂苷生物合成途径中的关键基因 | 首次通过转录组测序分析了不同组织中人参皂苷含量的差异，并鉴定了与皂苷含量显著相关的关键基因 | 研究仅限于人参的根茎组织，未涉及其他组织或物种 | 探究人参皂苷生物合成途径中的关键基因及其表达与皂苷含量的关系 | 人参根茎中的五种皂苷及其生物合成相关基因 | NA | NA | HPLC、转录组测序、基因克隆与表达 | NA | 化学成分、基因表达数据 | 三种不同组织中的五种皂苷含量测定 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-10-27 |
Semi-synthesis of a DNA-Tagged Polyketide-Peptide Hybrid Macrocycle Using a Biosynthetically Prepared Fungal Macrolide as a Synthetic Component
2024-Oct-25, Organic letters
IF:4.9Q1
DOI:10.1021/acs.orglett.4c03588
PMID:39415106
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研究论文 | 本文介绍了一种利用基因组挖掘和异源表达系统合成带有DNA标签的多酮肽杂合大环化合物的合成生物学方法 | 该研究展示了合成生物学在扩展构建模块多样性方面的潜力，有助于探索未知的化学空间 | NA | 探索合成生物学在扩展天然产物构建模块多样性方面的应用 | 带有DNA标签的多酮肽杂合大环化合物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、异源表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-10-24 |
No two clones are alike: characterization of heterologous subpopulations in a transgenic cell line of the model diatom Phaeodactylum tricornutum
2024-Oct-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02559-y
PMID:39428506
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研究论文 | 研究了转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中异源亚群的特征 | 揭示了克隆传播培养物中不同亚群之间的遗传和转录组差异 | NA | 研究硅藻表达系统中的异质性，以促进合成生物学应用 | 转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中的异源亚群 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 来自单个外共轭菌落的多个亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-10-24 |
High-Speed Imaging of Giant Unilamellar Vesicle Formation in cDICE
2024-Oct-15, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c04825
PMID:39431092
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研究论文 | 研究使用高速显微镜实时观察cDICE方法中巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程 | 开发了高速显微镜设置，实时可视化GUV形成过程，揭示了复杂的液滴形成机制 | 液滴形成的起源部分仍不清楚，蛋白质对GUV形成的影响机制需进一步研究 | 深入理解cDICE方法中GUV形成的物理原理，并开发更可靠高效的GUV生产方法 | 巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程及其在cDICE方法中的应用 | 生物物理学 | NA | 高速显微镜 | NA | 图像 | 涉及>30 μm大小的液滴和部分15 μm大小的卫星液滴 | NA | NA | NA | NA |