合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-10-19	Enhancers: A Focus on Synthetic Biology and Correlated Gene Expression 2024-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00244 PMID:39276360	综述	本文综述了增强子在调控后生动物转录中的作用，并探讨了合成生物学在解析增强子功能机制中的应用	本文通过合成报告基因系统量化增强子生物学的动态变化，揭示了增强子在基因组环境和与其他增强子组合中的功能机制	NA	探讨增强子功能机制及其在基因表达调控中的作用	增强子及其在基因组环境中的功能	合成生物学	NA	合成报告基因	NA	基因表达数据	NA
42	2024-10-19	Rational Design of High-Efficiency Synthetic Small Regulatory RNAs and Their Application in Robust Genetic Circuit Performance Through Tight Control of Leaky Gene Expression 2024-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00323 PMID:39294875	研究论文	研究通过优化合成小调控RNA（sRNA）的设计参数，提高其在基因表达调控中的效率，并应用于遗传电路的鲁棒性控制	开发了优化合成sRNA设计参数的策略，有效解决了基因表达泄漏问题，提高了遗传电路的可靠性	NA	研究提高合成sRNA效率的理性设计策略，并验证其在遗传电路中的应用	合成小调控RNA（sRNA）及其在遗传电路中的应用	合成生物学	NA	NA	NA	NA	NA
43	2024-10-19	Modular Cloning Tools for Streptomyces spp. and Application to the De Novo Biosynthesis of Flavokermesic Acid 2024-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00412 PMID:39307986	研究论文	本文介绍了一种用于链霉菌属的模块化克隆工具，并展示了其在合成黄酮霉素酸生物合成途径中的应用	开发了一种模块化系统（MoClo），用于链霉菌属的多组分基因簇的从头组装	目前受限于合成生物学工具的相对匮乏	开发适用于链霉菌属的合成生物学工具，并验证其在异源表达中的应用	链霉菌属的基因簇组装和黄酮霉素酸的生物合成	合成生物学	NA	模块化克隆（MoClo）	NA	基因序列	使用了β-葡萄糖苷酸酶（GusA）报告系统进行功能验证
44	2024-10-19	Efficient Simulation of Viral Transduction and Propagation for Biomanufacturing 2024-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00227 PMID:39315883	研究论文	本文介绍了vitraPro软件工具包，用于模拟病毒转导和传播过程，优化基于转导的生物制造平台和病毒扩增过程	提出了一个多尺度模型和高效的数值技术，能够模拟多达两种病毒的感染和传播过程，并考虑了病毒在裂解期或溶原期的状态	NA	优化基于病毒转导的生物制造平台和病毒扩增过程	病毒转导和传播过程	合成生物学	NA	多尺度模型	NA	NA	NA
45	2024-10-19	Characterizing and Engineering Rhamnose-Inducible Regulatory Systems for Dynamic Control of Metabolic Pathways in Streptomyces 2024-Oct-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00626 PMID:39377938	研究论文	研究通过生物信息学分析和合成生物学策略，构建了鼠李糖诱导的调控系统，用于动态控制链霉菌中的代谢途径	本研究揭示了鼠李糖代谢途径的调控机制，并成功构建了鼠李糖诱导的调控系统，可广泛应用于多种链霉菌属物种	NA	开发有效的基因诱导系统，用于合成生物技术应用中的基因表达精细调控	链霉菌属物种中的鼠李糖代谢途径及其调控机制	合成生物学	NA	电泳迁移率变动分析（EMSA）	NA	序列	多个链霉菌属物种
46	2024-10-19	Biosynthesis of Natural and Unnatural Perylenequinones for Drug Development 2024-Oct-16, ChemMedChem IF:3.6Q2 DOI:10.1002/cmdc.202400295 PMID:38943237	综述	本文综述了天然和非天然苝醌的生物合成途径及其在药物开发中的应用	介绍了通过合成生物学策略进行结构修饰和大规模生物生产天然和非天然苝醌的最新进展	缺乏高效且成本效益高的方法来获得这些化合物并引入结构多样性和复杂性	促进苝醌类化合物在光动力疗法中的研究和应用	天然和非天然苝醌及其衍生物	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
47	2024-10-19	Transcriptional memory formation: Battles between transcription factors and repressive chromatin 2024-Oct-16, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.09.008 PMID:39419001	研究论文	本文探讨了转录因子与抑制性染色质在转录记忆形成中的相互作用	揭示了转录因子与抑制性染色质在巩固转录记忆中的关键相互作用	NA	研究转录记忆的形成机制	转录因子与抑制性染色质的相互作用	NA	NA	合成生物学方法	NA	NA	NA
48	2024-10-19	Templated Pluripotent Stem Cell Differentiation via Substratum-Guided Artificial Signaling 2024-Oct-14, ACS biomaterials science & engineering IF:5.4Q2 DOI:10.1021/acsbiomaterials.4c00885 PMID:39352143	研究论文	本文介绍了一种结合细胞工程和生物材料设计的平台，用于在多能干细胞中实现人工信号传导	该平台利用可编程生物材料，通过正交信号传导激活多能干细胞中的形态发生素生产，从而在空间受限的方式下启动形态发生程序	NA	探索驱动多能干细胞分化的分子机制	多能干细胞的分化过程	合成生物学	NA	人工信号传导	NA	NA	NA
49	2024-10-19	Rewiring native post-transcriptional global regulators to achieve designer, multi-layered genetic circuits 2024-Oct-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52976-1 PMID:39384772	研究论文	本文开发了一种通过重构大肠杆菌的碳储存调节（Csr）网络来实现复杂转录后控制的工程方法	通过重新设计RNA-蛋白质相互作用，创建了一个包含12个BUFFER门的遗传工具箱，并开发了Csr调节的NOT门和多层逻辑电路	NA	开发能够实现多样化调控结果的“拖放”调控工具	大肠杆菌的碳储存调节（Csr）网络	合成生物学	NA	RNA-蛋白质相互作用工程	NA	NA	涉及三种工业相关细菌
50	2024-10-19	DNA Origami - Lipid Membrane Interactions Controlled by Nanoscale Sterics 2024-Oct, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202404720 PMID:39162223	研究论文	研究了DNA纳米结构与双层脂质膜之间的相互作用，特别是纳米尺度几何形状和脂质膜局部形态对这些相互作用的影响	揭示了DNA纳米结构与脂质膜相互作用受锚定环境的立体效应和双层膜局部纳米尺度形态的显著影响，而非通常考虑的囊泡整体大小	NA	探讨DNA纳米结构与双层脂质膜相互作用的机制，特别是立体效应和局部形态的影响	DNA纳米结构与不同大小和局部形态的脂质囊泡的相互作用	生物技术	NA	DNA纳米技术	NA	NA	四种不同立体环境的DNA纳米结构与不同大小和局部形态的脂质囊泡
51	2024-09-30	Advances in synthetic biology 2024-Oct, SLAS technology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.slast.2024.100197 PMID:39341458	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
52	2024-10-19	De Novo Synthesis of Error-Free Long Oligos 2024-Oct, Current protocols DOI:10.1002/cpz1.70028 PMID:39422193	研究论文	描述了一种合成长达401个核苷酸的寡核苷酸的方法，并通过聚合捕获法（CBP）分离和克隆测序选择无错误序列	提出了通过聚合捕获法（CBP）和克隆测序选择无错误序列的新方法，解决了现有技术无法解决的替换、删除和添加错误问题	NA	开发一种合成无错误长寡核苷酸的新方法，适用于蛋白质工程和合成生物学等领域	长寡核苷酸的合成、分离和无错误序列的选择	NA	NA	聚合捕获法（CBP）、克隆测序	NA	NA	NA
53	2024-10-18	An Effective DNA-Based File Storage System for Practical Archiving and Retrieval of Medical MRI Data 2024-Oct, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202301585 PMID:38807543	研究论文	本文提出了一种基于DNA的文件存储系统，用于实际存档和检索医学MRI数据	本文提出了一个有效的DNA存储（EDS）方法，包括一种新的分段策略、基于规则的四进制转码方法和索引技术，以解决数据丢失和提高检索效率	NA	开发一种有效的基于DNA的医学数据存储系统，以解决长期、高密度数据存档的需求	医学MRI数据	计算生物学	NA	DNA存储	NA	MRI数据	NA
54	2024-10-17	Versatility of threose nucleic acids: synthesis, properties, and applications in chemical biology and biomedical advancements 2024-Oct-15, Chemical communications (Cambridge, England) DOI:10.1039/d4cc04443f PMID:39318271	综述	本文深入探讨了α-L-苏糖核酸（TNA）的合成、性质及其在化学生物学和生物医学领域的应用	TNA具有独特的四碳糖骨架，与天然核酸相比，具有更好的空间排列、稳定的Watson-Crick碱基配对、高结合亲和力、生物稳定性和生物相容性	TNA研究仍面临合成方法的挑战，尤其是大规模合成和酶工程方面的改进	探讨TNA的潜在应用及其在化学生物学和生物医学领域的进展	α-L-苏糖核酸（TNA）及其在分子检测、免疫治疗、基因治疗、合成生物学和分子计算等领域的应用	化学生物学	NA	NA	NA	NA	NA
55	2024-10-17	A comprehensive risk assessment of microplastics in soil, water, and atmosphere: Implications for human health and environmental safety 2024-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.117154 PMID:39378647	研究论文	本文对土壤、水和大气中的微塑料进行了全面的风险评估，并探讨了其对人类健康和环境安全的影响	提出了基于相关研究进展的微塑料风险评估方法，并建议开发新的评估模型	现有的风险评估模型无法很好地评估微塑料的风险	评估微塑料在土壤、水和大气中的风险，并提出改进的风险评估方法	土壤、水和大气中的微塑料	环境科学	NA	数据可视化和分析	NA	数据集	在中国收集了135组土壤、水和大气中的相关数据
56	2024-10-17	Modulating bacterial function utilizing A knowledge base of transcriptional regulatory modules 2024-Oct-14, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae742 PMID:39193902	研究论文	本研究介绍了一种基于iModulon的工程方法，利用机器学习定义的共调控基因组（iModulons）作为设计部件，用于调节细菌功能	本研究提出了一种基于iModulon的工程方法，通过识别不同背景下遗传电路所需的组件，增强了基因组工程，提高了目标选择和模块行为预测的准确性	NA	研究旨在通过基于iModulon的方法，系统且可预测地重新编程细胞功能，提供对复杂调控网络的精细和可适应控制	细菌细胞功能	合成生物学	NA	机器学习	NA	基因组数据	NA
57	2024-10-17	Steps Toward Recapitulating Endothelium: A Perspective on the Next Generation of Hemocompatible Coatings 2024-Oct, Macromolecular bioscience IF:4.4Q1 DOI:10.1002/mabi.202400152 PMID:39072925	评论	本文讨论了重现内皮细胞功能的下一代血液相容性涂层的潜力	提出了一种结合自下而上的合成生物学（特别是合成细胞）与被动和生物活性表面涂层的综合方法，以开发能够重现内皮细胞功能的先进生物材料	NA	探讨如何通过先进的涂层技术重现内皮细胞的功能，以提高血液接触医疗设备的血液相容性和性能	内皮细胞及其在血液接触医疗设备中的功能重现	生物材料	NA	合成生物学	NA	NA	NA
58	2024-10-17	Artificial intelligence-based prediction of pathogen emergence and evolution in the world of synthetic biology 2024-10, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.70014 PMID:39364593	综述	本文探讨了人工智能在预测病原体出现和进化中的应用，特别是在合成生物学领域	提出了将生成式AI作为溯因推理的资源，以识别新技术（如合成生物学）带来的关键问题	本文仅限于动物病原体，未涵盖所有病原体类型	探讨人工智能在监测和控制病原体进化中的潜力	病原体的出现和进化，特别是由合成生物学引起的新技术	人工智能	NA	生成式AI	生成式AI	NA	NA
59	2024-10-17	Escherichia coli on colorectal cancer: A two-edged sword 2024-10, Microbial biotechnology IF:4.8Q1 DOI:10.1111/1751-7915.70029 PMID:39400440	综述	本文创新性地提出了大肠杆菌在结直肠癌中的双刃剑理论，探讨了如何利用大肠杆菌的矛盾性质进行结直肠癌的筛查和治疗	提出了大肠杆菌在结直肠癌中的双刃剑理论，并探讨了其在筛查和治疗中的潜在应用	肠道微生物群与结直肠癌之间的关系仍不明确，应用大肠杆菌时应考虑其与其他微生物、宿主和环境因素的相互作用及其自身的变化	探讨大肠杆菌在结直肠癌筛查和治疗中的潜在应用	大肠杆菌及其在结直肠癌中的作用	NA	结直肠癌	NA	NA	NA	NA
60	2024-10-14	Enhancing fatty acid and omega-3 production in Schizochytrium sp. using developed safe-harboring expression system 2024-Oct-10, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13036-024-00447-y PMID:39390586	研究论文	开发了一种安全的转基因表达系统，用于增强Schizochytrium sp.中的脂肪酸和omega-3的生产	成功建立了一种稳健的同源重组系统，并确定了可靠的安全港基因整合位点，显著提高了DHA的生产	NA	开发和应用基因工程工具以增强脂质生产，促进工业生产	Schizochytrium sp.中的脂肪酸和omega-3的生产	合成生物学	NA	同源重组	NA	NA	NA