合成生物学相关文章
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当前共找到 93 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-10-30 |
Transcriptomic data reveals an auxiliary detoxification mechanism that alleviates formaldehyde stress in Methylobacterium sp. XJLW
2024-Oct-28, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10923-w
PMID:39468441
|
研究论文 | 研究了Methylobacterium sp. XJLW在甲醛胁迫下的转录组变化，揭示了一种辅助解毒机制 | 发现了RS27765基因簇与代谢旁路基因共同构成的新辅助途径，增强了菌株对甲醛胁迫的耐受性 | 实际应用受到甲醛耐受性等限制 | 探索XJLW菌株在甲醛胁迫下的具体机制 | Methylobacterium sp. XJLW菌株在甲醛处理下的转录组变化 | NA | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 100个可能与甲基转移相关的基因 |
| 42 | 2024-10-30 |
Differential amino acid usage leads to ubiquitous edge effect in proteomes across domains of life that can be explained by amino acid secondary structure propensities
2024-10-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77319-4
PMID:39462053
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研究论文 | 研究分析了5590个物种的蛋白质组，发现氨基酸使用差异导致跨生命域的蛋白质组中普遍存在边缘效应 | 揭示了跨生命域蛋白质组中普遍存在的边缘效应，并提出这种效应源于蛋白质二级结构的约束 | 研究主要集中在氨基酸使用模式上，未深入探讨其对蛋白质功能的具体影响 | 探讨跨生命域的氨基酸使用模式及其潜在机制 | 5590个物种的蛋白质组 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质组数据 | 5590个物种 |
| 43 | 2024-10-29 |
Chemical and Transcriptomic Analyses Provide New Insights into Key Genes for Ginsenoside Biosynthesis in the Rhizome of Panax japonicus C. A. Meyer
2024-Oct-18, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules29204936
PMID:39459304
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研究论文 | 本文通过化学和转录组分析，揭示了人参皂苷生物合成途径中的关键基因 | 首次通过转录组测序分析了不同组织中人参皂苷含量的差异，并鉴定了与皂苷含量显著相关的关键基因 | 研究仅限于人参的根茎组织，未涉及其他组织或物种 | 探究人参皂苷生物合成途径中的关键基因及其表达与皂苷含量的关系 | 人参根茎中的五种皂苷及其生物合成相关基因 | NA | NA | HPLC、转录组测序、基因克隆与表达 | NA | 化学成分、基因表达数据 | 三种不同组织中的五种皂苷含量测定 |
| 44 | 2024-10-29 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cells
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STRAIGHT-IN Dual的平台，能够在人类诱导多能干细胞中同时进行双位点、单拷贝的DNA有效载荷和基因电路的整合 | STRAIGHT-IN Dual平台能够在一周内实现100%效率的双位点、单拷贝DNA整合，且整合过程几乎无疤痕，便于后续细胞修饰的组件回收 | NA | 研究如何在人类诱导多能干细胞中高效整合DNA有效载荷和基因电路，并探讨这些设计特征对细胞编程的影响 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs） | 合成生物学 | NA | DNA整合技术 | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-10-29 |
A digital CRISPR-dCas9-based gene remodeling biocomputer programmed by dietary compounds in mammals
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.002
PMID:39383861
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR-dCas9的基因重塑生物计算机，通过膳食化合物编程，实现哺乳动物基因的条件性内源转录调控 | 提出了基于CRISPR-dCas9的基因重塑生物计算机（REPA），通过膳食化合物编程，实现精确的基因调控 | NA | 开发一种新的基因调控技术，实现精确的基因重塑和转录调控 | CRISPR-dCas9技术、膳食化合物、基因调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas9 | NA | 基因转录数据 | NA |
| 46 | 2024-10-27 |
Semi-synthesis of a DNA-Tagged Polyketide-Peptide Hybrid Macrocycle Using a Biosynthetically Prepared Fungal Macrolide as a Synthetic Component
2024-Oct-25, Organic letters
IF:4.9Q1
DOI:10.1021/acs.orglett.4c03588
PMID:39415106
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用基因组挖掘和异源表达系统合成带有DNA标签的多酮肽杂合大环化合物的合成生物学方法 | 该研究展示了合成生物学在扩展构建模块多样性方面的潜力，有助于探索未知的化学空间 | NA | 探索合成生物学在扩展天然产物构建模块多样性方面的应用 | 带有DNA标签的多酮肽杂合大环化合物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、异源表达系统 | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-10-24 |
No two clones are alike: characterization of heterologous subpopulations in a transgenic cell line of the model diatom Phaeodactylum tricornutum
2024-Oct-21, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02559-y
PMID:39428506
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研究论文 | 研究了转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中异源亚群的特征 | 揭示了克隆传播培养物中不同亚群之间的遗传和转录组差异 | NA | 研究硅藻表达系统中的异质性，以促进合成生物学应用 | 转基因硅藻Phaeodactylum tricornutum中的异源亚群 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 来自单个外共轭菌落的多个亚群 |
| 48 | 2024-10-24 |
High-Speed Imaging of Giant Unilamellar Vesicle Formation in cDICE
2024-Oct-15, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c04825
PMID:39431092
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研究论文 | 研究使用高速显微镜实时观察cDICE方法中巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程 | 开发了高速显微镜设置，实时可视化GUV形成过程，揭示了复杂的液滴形成机制 | 液滴形成的起源部分仍不清楚，蛋白质对GUV形成的影响机制需进一步研究 | 深入理解cDICE方法中GUV形成的物理原理，并开发更可靠高效的GUV生产方法 | 巨型单层囊泡（GUVs）的形成过程及其在cDICE方法中的应用 | 生物物理学 | NA | 高速显微镜 | NA | 图像 | 涉及>30 μm大小的液滴和部分15 μm大小的卫星液滴 |
| 49 | 2024-10-21 |
Intelligent guide RNA: dual toehold switches for modulating luciferase in the presence of trigger RNA
2024-Oct-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06988-8
PMID:39420075
|
研究论文 | 开发了一种智能引导RNA系统，通过双足开关机制在触发RNA存在下调节荧光素酶活性 | 引入了一种新的智能引导RNA系统，结合了RNA感应平台和CRISPR/Cas9功能，实现了对特定触发RNA的识别和基因活性的精确调控 | NA | 开发一种能够根据特定细胞环境条件调节基因活性的智能引导RNA系统 | 智能引导RNA系统及其在特定触发RNA存在下的功能 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | RNA | NA |
| 50 | 2024-10-21 |
Plant synthetic genomics: Big lessons from the little yeast
2024-Oct-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.08.001
PMID:39214084
|
研究论文 | 本文探讨了利用酵母合成基因组学的经验来推动植物合成基因组学的发展 | 利用酵母和苔藓植物的相似性，提出了将酵母合成基因组学的技术应用于植物合成基因组学的新方法 | 植物基因组的复杂性仍然是主要挑战 | 探索将酵母合成基因组学的经验应用于植物合成基因组学的可能性 | 酵母和苔藓植物 Physcomitrium patens | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-10-21 |
Diagnosis and mitigation of the systemic impact of genome reduction in Escherichia coli DGF-298
2024-Oct-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00873-24
PMID:39207109
|
研究论文 | 研究了基因组简化对大肠杆菌DGF-298的影响，并通过重建代谢模型和适应性实验室进化来减轻这些影响 | 通过系统级方法和适应性实验室进化相结合，修复和优化基因组工程菌株 | NA | 研究基因组简化对大肠杆菌DGF-298的系统性影响并提出缓解措施 | 大肠杆菌DGF-298及其基因组简化后的代谢和表达调控 | 系统生物学 | NA | 代谢模型重建、iModulon-based转录组分析、适应性实验室进化 | 代谢模型 | 转录组数据 | 单一菌株DGF-298 |
| 52 | 2024-10-19 |
Biosynthesis of Natural and Unnatural Perylenequinones for Drug Development
2024-Oct-16, ChemMedChem
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/cmdc.202400295
PMID:38943237
|
综述 | 本文综述了天然和非天然苝醌的生物合成途径及其在药物开发中的应用 | 介绍了通过合成生物学策略进行结构修饰和大规模生物生产天然和非天然苝醌的最新进展 | 缺乏高效且成本效益高的方法来获得这些化合物并引入结构多样性和复杂性 | 促进苝醌类化合物在光动力疗法中的研究和应用 | 天然和非天然苝醌及其衍生物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-10-19 |
Transcriptional memory formation: Battles between transcription factors and repressive chromatin
2024-Oct-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.09.008
PMID:39419001
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研究论文 | 本文探讨了转录因子与抑制性染色质在转录记忆形成中的相互作用 | 揭示了转录因子与抑制性染色质在巩固转录记忆中的关键相互作用 | NA | 研究转录记忆的形成机制 | 转录因子与抑制性染色质的相互作用 | NA | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-10-19 |
Templated Pluripotent Stem Cell Differentiation via Substratum-Guided Artificial Signaling
2024-Oct-14, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.4c00885
PMID:39352143
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合细胞工程和生物材料设计的平台，用于在多能干细胞中实现人工信号传导 | 该平台利用可编程生物材料，通过正交信号传导激活多能干细胞中的形态发生素生产，从而在空间受限的方式下启动形态发生程序 | NA | 探索驱动多能干细胞分化的分子机制 | 多能干细胞的分化过程 | 合成生物学 | NA | 人工信号传导 | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-09-30 |
Advances in synthetic biology
2024-Oct, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100197
PMID:39341458
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-10-19 |
De Novo Synthesis of Error-Free Long Oligos
2024-Oct, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70028
PMID:39422193
|
研究论文 | 描述了一种合成长达401个核苷酸的寡核苷酸的方法，并通过聚合捕获法（CBP）分离和克隆测序选择无错误序列 | 提出了通过聚合捕获法（CBP）和克隆测序选择无错误序列的新方法，解决了现有技术无法解决的替换、删除和添加错误问题 | NA | 开发一种合成无错误长寡核苷酸的新方法，适用于蛋白质工程和合成生物学等领域 | 长寡核苷酸的合成、分离和无错误序列的选择 | NA | NA | 聚合捕获法（CBP）、克隆测序 | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-10-18 |
An Effective DNA-Based File Storage System for Practical Archiving and Retrieval of Medical MRI Data
2024-Oct, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301585
PMID:38807543
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA的文件存储系统，用于实际存档和检索医学MRI数据 | 本文提出了一个有效的DNA存储（EDS）方法，包括一种新的分段策略、基于规则的四进制转码方法和索引技术，以解决数据丢失和提高检索效率 | NA | 开发一种有效的基于DNA的医学数据存储系统，以解决长期、高密度数据存档的需求 | 医学MRI数据 | 计算生物学 | NA | DNA存储 | NA | MRI数据 | NA |
| 58 | 2024-10-17 |
Versatility of threose nucleic acids: synthesis, properties, and applications in chemical biology and biomedical advancements
2024-Oct-15, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc04443f
PMID:39318271
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综述 | 本文深入探讨了α-L-苏糖核酸（TNA）的合成、性质及其在化学生物学和生物医学领域的应用 | TNA具有独特的四碳糖骨架，与天然核酸相比，具有更好的空间排列、稳定的Watson-Crick碱基配对、高结合亲和力、生物稳定性和生物相容性 | TNA研究仍面临合成方法的挑战，尤其是大规模合成和酶工程方面的改进 | 探讨TNA的潜在应用及其在化学生物学和生物医学领域的进展 | α-L-苏糖核酸（TNA）及其在分子检测、免疫治疗、基因治疗、合成生物学和分子计算等领域的应用 | 化学生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-10-17 |
A comprehensive risk assessment of microplastics in soil, water, and atmosphere: Implications for human health and environmental safety
2024-Oct-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.117154
PMID:39378647
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研究论文 | 本文对土壤、水和大气中的微塑料进行了全面的风险评估，并探讨了其对人类健康和环境安全的影响 | 提出了基于相关研究进展的微塑料风险评估方法，并建议开发新的评估模型 | 现有的风险评估模型无法很好地评估微塑料的风险 | 评估微塑料在土壤、水和大气中的风险，并提出改进的风险评估方法 | 土壤、水和大气中的微塑料 | 环境科学 | NA | 数据可视化和分析 | NA | 数据集 | 在中国收集了135组土壤、水和大气中的相关数据 |
| 60 | 2024-10-17 |
Modulating bacterial function utilizing A knowledge base of transcriptional regulatory modules
2024-Oct-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae742
PMID:39193902
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于iModulon的工程方法，利用机器学习定义的共调控基因组（iModulons）作为设计部件，用于调节细菌功能 | 本研究提出了一种基于iModulon的工程方法，通过识别不同背景下遗传电路所需的组件，增强了基因组工程，提高了目标选择和模块行为预测的准确性 | NA | 研究旨在通过基于iModulon的方法，系统且可预测地重新编程细胞功能，提供对复杂调控网络的精细和可适应控制 | 细菌细胞功能 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | 基因组数据 | NA |